chr1	839741	840250	839788	Y	NA	SAMD11	NA	NA	NA	NA	SAMD11	18010	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	840753	841210	840812	Y	NA	SAMD11	NA	NA	NA	NA	SAMD11	17050	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	855764	856157	855856	Y	NA	SAMD11,NOC2L,KLHL17,PLEKHN1	NA	NA	NA	NA	SAMD11	2103	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr1	856539	856757	856714	Y	NA	SAMD11,NOC2L,KLHL17,PLEKHN1	NA	NA	NA	NA	SAMD11	1503	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	858256	858648	858448	Y	SAMD11	NOC2L,KLHL17,PLEKHN1	NA	NA	NA	NA	SAMD11	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr1	918449	918555	918505	Y	NA	NOC2L,KLHL17,PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN	NA	NA	NA	NA	HES4	14997	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	936652	937138	936860	Y	NA	NOC2L,KLHL17,PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN	C1orf170	K562	ChIA-PET	22265404	HES4	3100	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	945769	946034	945890	Y	CCNL2,ATAD3B	PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	ISG15	769	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	956563	956812	956665	Y	UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN	HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	AGRN	3060	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.503528737185248
chr1	994198	994452	994303	Y	NA	ISG15,AGRN,RP11-465B22.3,RNF223	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	1084	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	1004646	1004986	1004766	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RNF223	2701	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.461510839583787
chr1	1014834	1015095	1014859	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	RNF223	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RNF223	7147	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	1070745	1071151	1070944	Y	NA	C1orf159	NA	NA	NA	NA	C1orf159	21004	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	1265677	1265980	1265829	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,TAS1R3,DVL1,AURKAIP1	NA	NA	NA	NA	TAS1R3	983	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	1283060	1283625	1283139	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,TAS1R3,DVL1,AURKAIP1,CCNL2,RP4-758J18.2	NA	NA	NA	NA	DVL1	330	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.425610668141653
chr1	1286847	1286913	1286880	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,TAS1R3,DVL1,AURKAIP1,CCNL2,RP4-758J18.2	NA	NA	NA	NA	DVL1	4117	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	1294735	1294982	1294877	Y	NA	CPSF3L,GLTPD1,TAS1R3,DVL1,AURKAIP1,CCNL2,RP4-758J18.2,MRPL20	NA	NA	NA	NA	DVL1	12005	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr1	1295535	1296332	1296026	Y	MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8	CPSF3L,GLTPD1,TAS1R3,DVL1,AURKAIP1,CCNL2,RP4-758J18.2,MRPL20	NA	NA	NA	NA	AURKAIP1	12543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.281457820311205
chr1	1343359	1343768	1343546	Y	NA	AURKAIP1,CCNL2,RP4-758J18.2,MRPL20	NA	NA	NA	NA	MRPL20	2666	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	1368471	1368786	1368620	Y	RNF223,DVL1,NADK,LOC441869,TMEM88B,VWA1	CCNL2,RP4-758J18.2,MRPL20,ATAD3B	NA	NA	NA	NA	MRPL20	27778	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	1708824	1709349	1708980	Y	NA	NADK	NA	NA	NA	NA	NADK	547	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.220454688943899
chr1	1772108	1772256	1772158	Y	TMEM88B,ATAD3C,CALML6,PRKCZ	GNB1	NA	NA	NA	NA	GNB1	48239	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	1793829	1793862	1793845	Y	CDK11B,CDK11A	GNB1	NA	NA	NA	NA	GNB1	26633	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	1814762	1815124	1815035	Y	SKI,C1orf86,MIB2	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	GNB1	5371	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	TMEM52	7877	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.444751831456909
chr1	2068660	2068858	2068763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf86	73301	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	2111429	2112079	2111937	Y	NA	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	30080	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	2140151	2140337	2140252	Y	C1orf86	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	1822	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.154567095718296
chr1	2245775	2246116	2245876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	75030	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	2254081	2254230	2254152	Y	HES5	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	66916	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	PANK4,FAM213B	NA	NA	NA	NA	PANK4	21376	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.813201821800367
chr1	2478276	2478817	2478474	Y	SKI,PANK4,TNFRSF14	PANK4,FAM213B	NA	NA	NA	NA	PANK4	22237	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.266159110565059
chr1	2509702	2510198	2509855	Y	SKI,TNFRSF14	FAM213B	NA	NA	NA	NA	FAM213B	5732	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	2574079	2574144	2574101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58149	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	2574343	2574764	2574705	Y	MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58413	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.798669039312453
chr1	3374928	3375314	3374967	Y	NA	ARHGEF16	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	5938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	3398864	3399114	3399029	Y	NA	ARHGEF16	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	29874	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	3420761	3421065	3420920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	51771	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.70049669413412
chr1	3459907	3460197	3460078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF6	65862	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.379750316971083
chr1	3463934	3464260	3464145	Y	ARHGEF16	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF6	61799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.619693354791488
chr1	3728005	3728221	3728113	Y	NA	LRRC47,CEP104,DFFB	NA	NA	NA	NA	LRRC47	16937	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	3817648	3818071	3817969	Y	LRRC47	CEP104,DFFB,C1orf174	NA	NA	NA	NA	C1orf174	2791	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.648638768285769
chr1	6040561	6040806	6040680	Y	NA	KCNAB2,NPHP4	NA	NA	NA	NA	KCNAB2	8720	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	6053603	6054107	6053839	Y	CHD5,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2	KCNAB2,NPHP4	NA	NA	NA	NA	NPHP4	3070	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	6054896	6055025	6054948	Y	TNFRSF25,KCNAB2,KCNAB2	KCNAB2,NPHP4	NA	NA	NA	NA	NPHP4	4363	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	6221566	6221669	6221628	Y	PLEKHG5,CHD5	RNF207,RPL22	NA	NA	NA	NA	RNF207	41866	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	6319998	6320272	6320169	Y	NA	ICMT,HES3,GPR153	NA	NA	NA	NA	GPR153	963	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.185511700771837
chr1	6337854	6338055	6337955	Y	NA	ICMT,HES3,GPR153	GPR153	K562	ChIA-PET	22265404	GPR153	18819	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	6354110	6354322	6354254	Y	ZBTB48,GPR153,ACOT7	GPR153	NA	NA	NA	NA	GPR153	35075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	6451759	6451831	6451795	Y	NA	ACOT7,HES2	NA	NA	NA	NA	ACOT7	620	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	6661008	6661639	6661311	Y	ZBTB48,KLHL21	NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3	NA	NA	NA	NA	PHF13	10106	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	6709089	6709221	6709155	Y	NA	PHF13,KLHL21,THAP3	NA	NA	NA	NA	THAP3	26163	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	6894689	6894717	6894703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	51305	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	6943772	6944262	6943813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	100388	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr1	7177733	7177848	7177794	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	334349	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr1	7289758	7290075	7289881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	446374	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	7327634	7328033	7327873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	484250	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	7359415	7359679	7359556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	469650	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.260700429065805
chr1	7461964	7462325	7462107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	367004	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.27015749368358
chr1	7531062	7531540	7531160	Y	PARK7	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	297789	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.288915693369719
chr1	7540504	7540548	7540528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	288781	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	7609389	7609632	7609504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	219697	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.815775233000583
chr1	7764543	7764931	7764717	Y	PER3	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	64398	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	7843556	7843653	7843585	Y	PER3	VAMP3,PER3	NA	NA	NA	NA	PER3	1176	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	8054249	8054565	8054423	Y	NA	PARK7,ERRFI1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	29803	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	8107848	8108157	8108001	Y	NA	ERRFI1	ERRFI1,RERE,SLC45A1	IMR90	Hi-C	24141950	ERRFI1	23480	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	8137301	8137521	8137361	Y	NA	NA	ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERRFI1	52933	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	8154517	8154933	8154754	Y	VAMP3	NA	ERRFI1,RERE,PARK7,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERRFI1	70149	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	8156648	8157003	8156918	Y	VAMP3	NA	ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERRFI1	72280	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	8157417	8157780	8157543	Y	NA	NA	ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERRFI1	73049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	8181009	8181247	8181098	Y	NA	NA	ERRFI1,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	83410	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	8187209	8187385	8187282	Y	VAMP3	NA	ERRFI1,SLC45A1,RERE	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-7P	77272	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	8198088	8198334	8198235	Y	NA	NA	ERRFI1,SLC45A1,RERE,PARK7	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-7P	66323	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr1	8250099	8250155	8250127	Y	NA	RNU1-7P	ERRFI1,PARK7,RERE,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	14502	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	8254637	8254907	8254798	Y	NA	RNU1-7P	ERRFI1,PARK7,RERE,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	9750	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187893855960214
chr1	8257762	8258040	8257906	Y	NA	RNU1-7P	ERRFI1,RERE,PARK7,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	6617	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.316244878933856
chr1	8262223	8262541	8262360	Y	ERRFI1	RNU1-7P	ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	2116	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.71402324640071
chr1	8264458	8264788	8264713	Y	NA	NA	ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr1	8272041	8272390	8272277	Y	NA	RNU1-7P	ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	7384	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.412190998473223
chr1	8469706	8470061	8470001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-7P	205049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	8571636	8571856	8571737	Y	SLC45A1,RERE	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	303846	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	8686491	8686867	8686745	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	188835	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	8762126	8762475	8762428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	113227	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	8810273	8810466	8810370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	65236	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	8858188	8858497	8858477	Y	NA	RERE	NA	NA	NA	NA	RERE	17205	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	8875055	8875165	8875110	Y	NA	RERE	NA	NA	NA	NA	RERE	537	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	8933581	8933925	8933847	Y	NA	ENO1-IT1,ENO1	NA	NA	NA	NA	ENO1-IT1	2141	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.196967956948873
chr1	8964053	8964236	8964145	Y	ENO1	ENO1-IT1,ENO1	ENO1-AS1,ENO1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ENO1	26745	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr1	8986021	8986139	8986041	Y	NA	ENO1-IT1,ENO1	ENO1-AS1,ENO1,CA6,SLC2A7,SLC2A5	IMR90	Hi-C	24141950	ENO1	48713	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	8999811	9000211	8999889	Y	NA	NA	SLC2A5,SLC2A7	IMR90	Hi-C	24141950	ENO1	62503	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	9222919	9223181	9223073	Y	SPSB1	GPR157,RP3-510D11.2	SLC2A7,SLC25A33,MIR34A,GPR157	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP3-510D11.2	17082	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	9241165	9241560	9241362	Y	NA	RP3-510D11.2	SLC2A7,SLC25A33,GPR157,MIR34A,H6PD,SPSB1,TMEM201	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP3-510D11.2	902	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	9293549	9293739	9293591	Y	H6PD	H6PD	NA	NA	NA	NA	H6PD	715	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	9298798	9298942	9298853	Y	NA	H6PD	NA	NA	NA	NA	H6PD	5964	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	9355493	9355709	9355601	Y	NA	SPSB1	NA	NA	NA	NA	SPSB1	4554	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	9473687	9473864	9473791	Y	NA	NA	H6PD,SPSB1,SLC25A33	IMR90	Hi-C	24141950	SPSB1	122748	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.819773616119104
chr1	9535183	9535425	9535306	Y	NA	NA	SPSB1,H6PD,SLC25A33,TMEM201	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	62116	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr1	9885367	9885695	9885655	Y	NA	CLSTN1	NA	NA	NA	NA	CLSTN1	2783	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr1	9912448	9912800	9912669	Y	KIF1B,CLSTN1	CLSTN1	NA	NA	NA	NA	CLSTN1	29864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	10269964	10270260	10269995	Y	RBP7,PGD,KIF1B	KIF1B	NA	NA	NA	NA	KIF1B	1101	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	10359215	10359483	10359349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF1B	90352	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	10447707	10448369	10448247	Y	NA	PGD,APITD1,APITD1-CORT	NA	NA	NA	NA	PGD	8280	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	10558276	10558621	10558397	Y	NA	PEX14,DFFA	NA	NA	NA	NA	DFFA	27693	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	10816030	10816223	10816138	Y	CASZ1	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	38484	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	10864514	10864918	10864748	Y	NA	CASZ1	PEX14,CASZ1	IMR90	Hi-C	24141950	CASZ1	9807	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	10959985	10960148	10960064	Y	NA	NA	PEX14,CASZ1,C1orf127,TARDBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CASZ1	105278	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	10960432	10960567	10960498	Y	NA	NA	PEX14,CASZ1,C1orf127,TARDBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CASZ1	105725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr1	11122928	11123178	11122962	Y	NA	SRM,EXOSC10	NA	NA	NA	NA	SRM	4847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	11761755	11762049	11761783	Y	PTCHD2,FBXO44,FBXO44,MAD2L2,C1orf187	FBXO44,FBXO2,FBXO6,MAD2L2,AGTRAP	NA	NA	NA	NA	MAD2L2	12048	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	11968510	11969143	11969021	Y	MTHFR,CLCN6,VPS13D,MIIP	RNU5E-1,KIAA2013,PLOD1	NA	NA	NA	NA	RNU5E-1	2301	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr1	12050736	12051137	12050880	Y	NPPA,NPPB,MFN2	MFN2,MIIP	NA	NA	NA	NA	MFN2	12498	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	12193120	12193399	12193251	Y	AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF8,TNFRSF1B	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13D	94725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	12485613	12485784	12485698	Y	PRAMEF1,AADACL4	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	189953	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	12544374	12544691	12544532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	131046	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	12599928	12600179	12600028	Y	DHRS3	NA	DHRS3,VPS13D	K562	ChIA-PET	22265404	DHRS3	75558	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	12609717	12610039	12609907	Y	DHRS3	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	65698	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	12674513	12674729	12674684	Y	NA	DHRS3	NA	NA	NA	NA	DHRS3	1008	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr1	15519488	15519688	15519655	Y	NA	TMEM51	NA	NA	NA	NA	TMEM51	42460	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.24940010243818
chr1	15664307	15664455	15664338	Y	NA	NA	EFHD2,CTRC,CELA2A,CELA2B	IMR90	Hi-C	24141950	EFHD2	69936	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.267428152933953
chr1	15666999	15667145	15667070	Y	NA	NA	CTRC,EFHD2	IMR90	Hi-C	24141950	EFHD2	67246	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	15673118	15673422	15673270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFHD2	60969	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	15738146	15738632	15738365	Y	SPEN,PLEKHM2,EFHD2,CASP9	EFHD2	NA	NA	NA	NA	EFHD2	3755	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	15738661	15738986	15738829	Y	SPEN,PLEKHM2,DDI2,EFHD2,CASP9,CASP9	EFHD2	NA	NA	NA	NA	EFHD2	4270	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	15742467	15743324	15742634	Y	TMEM51,TMEM51,SPEN,PLEKHM2,EFHD2,CASP9	EFHD2	NA	NA	NA	NA	EFHD2	8076	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	15743639	15744318	15744205	Y	NA	EFHD2	NA	NA	NA	NA	EFHD2	9248	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	15786440	15786713	15786642	Y	PLEKHM2,CTRC,CELA2A,CELA2B	NA	NA	NA	NA	NA	EFHD2	52049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.281457820311205
chr1	15827976	15828116	15828046	Y	NA	CASP9,DNAJC16	NA	NA	NA	NA	CASP9	22913	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	15946733	15946892	15946831	Y	EFHD2,CASP9,ZBTB17,SPEN,DDI2	AGMAT,RP4-680D5.2,CHCHD2P6,DDI2	NA	NA	NA	NA	DDI2	4738	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	16007283	16007579	16007390	Y	FHAD1,EFHD2,CASP9,ZBTB17,SPEN,PLEKHM2	PLEKHM2	NA	NA	NA	NA	PLEKHM2	1248	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	16087189	16087372	16087266	Y	EPHA2,FBLIM1	FBLIM1	NA	NA	NA	NA	FBLIM1	6087	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20353975126761
chr1	16125579	16125747	16125670	Y	FBLIM1,FBLIM1,FBLIM1,EPHA2	FBLIM1,RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.8	26977	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.275616175182834
chr1	16158409	16158760	16158690	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.8	5685	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	16175691	16176294	16176100	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.197698106139239
chr1	16176617	16176801	16176705	Y	RSC1A1,C1orf64,SPEN	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3975	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr1	16209325	16209770	16209445	Y	NA	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	36683	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	16212759	16213091	16212941	Y	EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	40117	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	16276028	16276482	16276329	Y	CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17	ZBTB17	NA	NA	NA	NA	ZBTB17	24145	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	16277350	16278224	16277618	Y	CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17	ZBTB17	NA	NA	NA	NA	ZBTB17	22403	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	16339360	16339596	16339414	Y	NA	ZBTB17,HSPB7	NA	NA	NA	NA	HSPB7	4493	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr1	16470181	16470602	16470563	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	9104	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr1	16478939	16479163	16479034	Y	FBLIM1,EPHA2	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	16499761	16499895	16499826	Y	SPEN,EPHA2	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHA2	19179	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.624421887100376
chr1	16500084	16500309	16500220	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHA2	19502	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr1	16502532	16502678	16502612	Y	C1orf64	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHA2	21950	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.270887642873947
chr1	16508402	16508642	16508565	Y	FBLIM1	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	EPHA2	27820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.680852415708204
chr1	16511251	16511623	16511321	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	EPHA2	30669	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	16669074	16669169	16669123	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	7780	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr1	16670445	16670837	16670642	Y	SPEN,C1orf64,FBXO42	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	6112	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr1	16677236	16677843	16677569	Y	ZBTB17,FBXO42	FBXO42	RSG1	IMR90	Hi-C	24141950	FBXO42	287	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	16696032	16696399	16696223	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	19083	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.400507708216482
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	RNU1-1	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-1	12489	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.266159110565059
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	NA	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP13A2	104719	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.73238104739883
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	NA	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	ATP13A2	95640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.60748951436518
chr1	17254357	17254559	17254407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP13A2	81864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	17353741	17353845	17353793	Y	NA	ATP13A2,SDHB	ATP13A2	K562	ChIA-PET	22265404	ATP13A2	17318	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr1	17454855	17455288	17455072	Y	PADI4	NA	PADI2,PADI1,PADI3	IMR90	Hi-C	24141950	SDHB	76190	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	17518130	17518260	17518142	Y	NA	NA	NBPF1,PADI1,PADI2,PADI3	IMR90	Hi-C	24141950	PADI3	55333	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	17518941	17519138	17519054	Y	ATP13A2,PADI3	NA	NBPF1,PADI1,PADI2,PADI3	IMR90	Hi-C	24141950	PADI3	54455	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	17534687	17534794	17534729	Y	NA	PADI3	NA	NA	NA	NA	PADI3	38799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18478155158147
chr1	17557386	17557571	17557478	Y	NA	PADI3	NA	NA	NA	NA	PADI3	16022	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	17746173	17746585	17746297	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	17635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	17767804	17768710	17768126	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	3584	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.04240639170078
chr1	17875004	17875168	17875086	Y	NA	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	10674	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	17896198	17896624	17896362	Y	NA	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	31868	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.335506193730656
chr1	19078001	19078369	19078185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALDH4A1	148906	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	19190435	19190769	19190601	Y	NA	ALDH4A1	NA	NA	NA	NA	ALDH4A1	36506	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	19253034	19253391	19253292	Y	UBR4,IFFO2	ALDH4A1,IFFO2	ALDH4A1	IMR90	Hi-C	24141950	ALDH4A1	25759	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	19277155	19277462	19277361	Y	UBR4,IFFO2	ALDH4A1,IFFO2	NA	NA	NA	NA	IFFO2	3718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	19337577	19337942	19337698	Y	NA	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFFO2	56397	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	19778785	19779174	19779108	Y	NBL1,NBL1,NBL1,NBL1,NBL1	CAPZB	NA	NA	NA	NA	CAPZB	30892	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	19796024	19796128	19796080	Y	NA	CAPZB,RNU4-28P	NA	NA	NA	NA	CAPZB	13938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	20091332	20091506	20091448	Y	PLA2G2A,TMCO4	TMCO4	NA	NA	NA	NA	TMCO4	32932	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.178209757262733
chr1	20111066	20111358	20111348	Y	NA	TMCO4	NA	NA	NA	NA	TMCO4	13080	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	20204786	20204981	20204970	Y	OTUD3	OTUD3	NA	NA	NA	NA	OTUD3	2025	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.515942176632355
chr1	20924301	20924404	20924353	Y	CDA	FAM43B,CDA,PINK1	PINK1	IMR90	Hi-C	24141950	CDA	10860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr1	20930711	20931037	20930891	Y	CDA	CDA,PINK1	PINK1	IMR90	Hi-C	24141950	CDA	17270	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	20993397	20993558	20993485	Y	NA	PINK1,DDOST	NA	NA	NA	NA	DDOST	7397	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr1	21084820	21085159	21084988	Y	NA	HP1BP3	NA	NA	NA	NA	HP1BP3	26657	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	21149682	21149798	21149749	Y	CAMK2N1,EIF4G3	HP1BP3	NA	NA	NA	NA	HP1BP3	37866	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	21194399	21194490	21194445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HP1BP3	82583	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	21284001	21284025	21284019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	114221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	21428050	21428147	21428101	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	29804	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18278236002221
chr1	21476251	21476624	21476546	Y	NA	EIF4G3	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	24753	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	21510856	21510968	21510912	Y	ECE1,ECE1	EIF4G3	EIF4G3,DDOST,KIF17,HP1BP3,SH2D5	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF4G3	9479	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	21558552	21558736	21558644	Y	EIF4G3,ECE1,EIF4G3,ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	57175	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	21588176	21588724	21588522	Y	ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	81273	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.04283749433108
chr1	21588829	21589430	21588896	Y	ECE1,ALPL,EIF4G3,ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	80567	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr1	21611199	21611583	21611510	Y	EIF4G3,ECE1,ALPL,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	58414	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	21643831	21644195	21643955	Y	ECE1,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	25802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	21649091	21649481	21649332	Y	EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	20516	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	21650806	21651685	21651350	Y	EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	18312	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	21655798	21656254	21656078	Y	NA	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	13743	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.549616122435524
chr1	21663991	21664182	21664145	Y	EIF4G3,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	5815	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	21664400	21664833	21664668	Y	EIF4G3,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	5164	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	21670382	21670956	21670695	Y	NA	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	385	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	21724067	21724372	21724186	Y	NA	NBPF3	ECE1,NBPF3,RAP1GAP,ALPL,USP48	IMR90	Hi-C	24141950	NBPF3	40249	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	21931612	21931850	21931825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALPL	97754	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr1	21965161	21965473	21965377	Y	RAP1GAP	NA	NA	NA	NA	NA	ALPL	131303	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.506258077934875
chr1	22076024	22076450	22076245	Y	NA	USP48	RAP1GAP	IMR90	Hi-C	24141950	USP48	31649	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr1	22106565	22106957	22106761	Y	NA	USP48	NA	NA	NA	NA	USP48	1142	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	22231370	22231630	22231560	Y	NA	RP11-26H16.1,HSPG2	NA	NA	NA	NA	RP11-26H16.1	961	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	22366226	22366841	22366516	Y	USP48,ZBTB40	LINC00339,CDC42	CDC42	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42	10279	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	22375194	22375332	22375261	Y	CDC42	LINC00339,CDC42	CDC42	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42	1788	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	22611972	22612241	22612107	Y	WNT4	NA	C1QC,C1QB,EPHA8,C1QA,CDC42,WNT4,ZBTB40	IMR90	Hi-C	24141950	WNT4	143510	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	22829217	22829453	22829426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB40	52873	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	23113356	23113555	23113472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHB2	78024	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	23429944	23430077	23430039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LUZP1	72224	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	23494015	23494642	23494449	Y	NA	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	7659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	23523350	23523682	23523502	Y	LUZP1,HTR1D	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	21049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.212996815885384
chr1	23542417	23542518	23542468	Y	HTR1D	LUZP1	KDM1A,LUZP1	IMR90	Hi-C	24141950	LUZP1	40116	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	23669506	23669991	23669712	Y	NA	HNRNPR,C1orf213,ZNF436	NA	NA	NA	NA	HNRNPR	677	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr1	23748973	23749126	23749052	Y	NA	TCEA3	NA	NA	NA	NA	TCEA3	107	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	23839318	23839630	23839474	Y	HNRNPR,ZNF436	ASAP3,E2F2,ID3	NA	NA	NA	NA	E2F2	16082	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	5.73114869578705
chr1	23882500	23882866	23882600	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	1419	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.390320494408341
chr1	23888678	23889201	23888997	Y	ID3	E2F2,ID3	NA	NA	NA	NA	ID3	4393	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.53972378901192
chr1	23903714	23904323	23904234	Y	ID3	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	19429	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	23912037	23912393	23912293	Y	PNRC2,RPL11	ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	27752	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.794670656193932
chr1	23918101	23918449	23918188	Y	SRSF10,CNR2,E2F2	ID3	E2F2,ID3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ID3	33816	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr1	23961555	23961694	23961621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL11	54575	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.864017739359529
chr1	23977708	23977880	23977794	Y	NA	RPL11	NA	NA	NA	NA	RPL11	38389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	24349340	24349488	24349411	Y	NA	RP11-4M23.7	LYPLA2,SRSF10,MYOM3,PNRC2,SRRM1,HMGCL,IL22RA1,LOC100506963,TCEB3,GALE,FUCA1,CNR2,IL28RA,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-4M23.7	16331	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210997624326124
chr1	24476382	24476609	24476496	Y	PNRC2,GRHL3	MYOM3,IL22RA1	IL22RA1	IMR90	Hi-C	24141950	IL22RA1	8771	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	24518503	24518681	24518625	Y	PNRC2,GRHL3	NA	MYOM3,IL22RA1,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS,C1orf130	IMR90	Hi-C	24141950	IL22RA1	50892	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	24691833	24692082	24691893	Y	PNRC2,GRHL3	NIPAL3	NA	NA	NA	NA	NIPAL3	48202	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227912562002414
chr1	24833128	24833464	24833216	Y	RUNX3,NIPAL3,SRRM1,RCAN3	RCAN3	NA	NA	NA	NA	RCAN3	5741	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	24970685	24970736	24970725	Y	NA	SRRM1	NA	NA	NA	NA	SRRM1	14478	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr1	25051079	25051208	25051162	Y	NA	CLIC4	RUNX3,CLIC4,SRRM1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLIC4	18640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	25344029	25344296	25344110	Y	RUNX3,SYF2,C1orf63	NA	RUNX3	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX3	54417	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.257971088316178
chr1	25348659	25349200	25348944	Y	SRRM1,RUNX3,SYF2,C1orf63	NA	RUNX3,CLIC4	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX3	59047	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.175324486963695
chr1	25357149	25357829	25357484	Y	RUNX3,SYF2,C1orf63	NA	RUNX3,C1orf63,SYF2,CLIC4	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX3	67537	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	25559638	25560067	25559796	Y	RUNX3,SYF2,C1orf63	SYF2	NA	NA	NA	NA	SYF2	2645	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	25566195	25566411	25566257	Y	TMEM57	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9202	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.280344707491722
chr1	25566618	25566670	25566639	Y	NA	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9625	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.426723780961136
chr1	25823926	25824130	25824028	Y	NA	LDLRAP1	LDLRAP1	IMR90	Hi-C	24141950	LDLRAP1	43941	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	25942744	25943208	25942998	Y	EXTL1,MAN1C1	NA	NA	NA	NA	NA	LDLRAP1	74673	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	26184900	26185246	26185071	Y	NA	RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1	NA	NA	NA	NA	RP1-125I3.2	796	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	26201699	26201757	26201716	Y	SEPN1	RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1	NA	NA	NA	NA	RP1-125I3.2	17595	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.139807279150677
chr1	26452850	26453250	26452988	Y	FAM54B,RPS6KA1,HMGN2,CEP85,CD52,PDIK1L	PDIK1L,ZNF593,CNKSR1	NA	NA	NA	NA	PDIK1L	17186	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	26617206	26617304	26617268	Y	SH3BGRL3,RPS6KA1,PIGV,ARID1A,UBXN11,UBXN11	SH3BGRL3,CD52,UBXN11	NA	NA	NA	NA	SH3BGRL3	13539	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	26634832	26635080	26634851	Y	NA	SH3BGRL3,CD52,UBXN11,AIM1L	NA	NA	NA	NA	CD52	7368	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	26642014	26642169	26642069	Y	FAM54B,SH3BGRL3,RPS6KA1,HMGN2,UBXN11,UBXN11,CD52	SH3BGRL3,CD52,UBXN11,AIM1L	NA	NA	NA	NA	CD52	279	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	26678060	26678317	26678200	Y	CNKSR1,AIM1L	CD52,UBXN11,AIM1L	NA	NA	NA	NA	AIM1L	304	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr1	26683687	26684084	26683890	Y	CNKSR1,AIM1L	CD52,UBXN11,AIM1L	NA	NA	NA	NA	AIM1L	5066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.301102098737121
chr1	26827232	26827869	26827508	Y	PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A	RP3-476K8.4,HMGN2	HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HMGN2	30291	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.48717058409101
chr1	26907862	26908015	26907938	Y	SH3BGRL3,UBXN11	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN2	110921	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	26946837	26947249	26947076	Y	CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	73275	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.281457820311205
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.817774424559843
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.30715334288629
chr1	27154485	27154771	27154729	Y	WDTC1,SLC9A1,RPS6KA1,ARID1A,PIGV,ZDHHC18	PIGV,ZDHHC18,SFN	NA	NA	NA	NA	ZDHHC18	3284	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	27154983	27155478	27155098	Y	WDTC1,SLC9A1,RPS6KA1,ARID1A,PIGV,ZDHHC18	PIGV,ZDHHC18,SFN	NA	NA	NA	NA	ZDHHC18	3782	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	27165490	27165816	27165600	Y	NA	ZDHHC18,SFN,GPN2	NA	NA	NA	NA	ZDHHC18	14289	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	27175784	27176273	27175984	Y	C1orf172,AIM1L,ZNF683,RPS6KA1,SFN	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	11360	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	3753	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	5.68852080047677
chr1	27336678	27336931	27336804	Y	NA	RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	NA	NA	NA	NA	FAM46B	396	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	27519342	27519481	27519412	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC9A1	27870	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.313132574555112
chr1	27691785	27692261	27692091	Y	TMEM222,MAP3K6	TMEM222,RP11-4K3__A.5,MAP3K6,GPR3	NA	NA	NA	NA	MAP3K6	402	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.303831439486748
chr1	27772061	27772370	27772216	Y	NA	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	42299	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	27775351	27775365	27775358	Y	GPR3	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	39304	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	27831022	27831314	27831199	Y	NA	WASF2	SYTL1,GPR3,WASF2,AHDC1,FGR	IMR90	Hi-C	24141950	WASF2	16353	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.149108414219042
chr1	27853337	27854089	27853858	Y	NA	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	38668	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	27854575	27854919	27854692	Y	SYTL1,FGR,FGR,FGR,FAM76A,C1orf38	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	39906	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	27869425	27869556	27869494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WASF2	54756	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr1	27871123	27871471	27871363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WASF2	56454	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	27883449	27884140	27883881	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	44802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.196081878209095
chr1	27891553	27891803	27891694	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	37139	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	27907931	27908052	27907995	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	20890	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.225183221252787
chr1	27916292	27916674	27916513	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	12268	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr1	27924204	27924421	27924302	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	4521	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr1	27924687	27925144	27924927	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	3798	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	27926949	27927449	27927117	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	1493	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr1	27986111	27986384	27986268	Y	EYA3,SYTL1,WASF2,XKR8,STX12,FAM76A,C1orf38,FGR,FGR,FGR	IFI6	NA	NA	NA	NA	IFI6	10345	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20353975126761
chr1	28050414	28050762	28050588	Y	NA	STX12	NA	NA	NA	NA	FAM76A	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	28213825	28214033	28213970	Y	SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,EYA3,WASF2,FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,XKR8	RPA2,SMPDL3B	NA	NA	NA	NA	RPA2	25224	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	28238886	28239222	28239086	Y	SESN2,PTAFR,PTAFR,EYA3,FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38	RPA2,SMPDL3B,XKR8	NA	NA	NA	NA	RPA2	35	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	28268335	28268431	28268383	Y	NA	RPA2,SMPDL3B,XKR8	NA	NA	NA	NA	SMPDL3B	8831	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	28305616	28305920	28305789	Y	SESN2,PTAFR,PTAFR,EYA3,FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,XKR8	SMPDL3B,XKR8	NA	NA	NA	NA	XKR8	21643	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	28318645	28318992	28318812	Y	FAM76A	XKR8	NA	NA	NA	NA	XKR8	34672	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	28355043	28355235	28355139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYA3	57972	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	28389248	28389585	28389551	Y	NA	EYA3	NA	NA	NA	NA	EYA3	23622	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	28437697	28438098	28437903	Y	FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,XKR8,SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,DNAJC8,EYA3	EYA3	PTAFR,EYA3,ATPIF1,DNAJC8,LOC653566	IMR90	Hi-C	24141950	EYA3	24490	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	AL353354.1,DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.856559866301015
chr1	28576012	28576248	28576109	Y	STX12,C1orf38,EYA3,PTAFR,PTAFR,GMEB1,SESN2,MED18	DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	7790	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.558570071942637
chr1	28640564	28640739	28640692	Y	C1orf38,XKR8,PTAFR,PTAFR,TAF12,GMEB1,SESN2,MED18	MED18	MED18	MCF7	ChIA-PET	22265404	MED18	12774	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	28813874	28814267	28814011	Y	EYA3	RCC1,SNHG3,SNORA73B	NA	NA	NA	NA	RCC1	16188	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	29214759	29214998	29214903	Y	GMEB1,EPB41	EPB41	NA	NA	NA	NA	EPB41	3156	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	29451057	29451462	29451431	Y	TMEM200B,TMEM200B	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF4	55037	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr1	29503706	29504118	29503928	Y	NA	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2381	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr1	29504261	29504387	29504317	Y	YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2112	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	29513219	29513546	29513454	Y	NA	SRSF4,MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	SRSF4	6720	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	29517304	29517322	29517313	Y	NA	SRSF4,MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	SRSF4	10805	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr1	29563709	29564430	29563877	Y	PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	2681	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.290914884928979
chr1	29564766	29564995	29564881	Y	NA	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	3738	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr1	29565515	29565732	29565598	Y	SRSF4,PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	4487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr1	29565762	29566055	29565979	Y	SRSF4,PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	4734	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr1	31109882	31110078	31109981	Y	NA	NA	PTPRU	IMR90	Hi-C	24141950	LAPTM5	118589	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	31483120	31483355	31483250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PUM1	53483	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	31504221	31504603	31504488	Y	NA	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	32235	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	31517703	31518005	31517854	Y	NA	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	18833	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	31537719	31538012	31537814	Y	LAPTM5,PUM1	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	881	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr1	31625313	31625543	31625426	Y	NA	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	84858	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.369563103162941
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	82443	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.00328612533168
chr1	31628220	31628457	31628359	Y	NA	NA	PUM1,NKAIN1,SERINC2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	81944	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.762960123882159
chr1	31643824	31643962	31643871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKAIN1	66439	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.721984234569888
chr1	31737918	31737951	31737935	Y	NA	NKAIN1,SNRNP40,ZCCHC17	NA	NA	NA	NA	NKAIN1	27517	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr1	31770743	31770927	31770835	Y	NA	SNRNP40,ZCCHC17	NA	NA	NA	NA	ZCCHC17	2901	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	31772172	31772177	31772175	Y	NA	SNRNP40,ZCCHC17	NA	NA	NA	NA	ZCCHC17	4330	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	31904621	31905133	31905124	Y	NA	SERINC2	NA	NA	NA	NA	SERINC2	24209	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	32166698	32166999	32166824	Y	COL16A1	NA	NA	NA	NA	NA	PEF1	58201	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr1	32170830	32171205	32171045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BAI2	57289	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	32180603	32180986	32180867	Y	PEF1,SPOCD1,COL16A1	BAI2	PEF1,COL16A1	IMR90	Hi-C	24141950	BAI2	47508	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	32405536	32405898	32405618	Y	NA	PTP4A2	NA	NA	NA	NA	PTP4A2	2559	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.971228407458654
chr1	32420307	32420572	32420414	Y	TMEM234,PEF1,PTP4A2,PTP4A2	PTP4A2	KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	11850	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.57804098576024
chr1	32421622	32422096	32421696	Y	MARCKSL1,PEF1,PTP4A2,PTP4A2,KHDRBS1	PTP4A2	KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,TMEM39B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	13165	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.24392398588002
chr1	32423598	32423720	32423682	Y	PTP4A2	PTP4A2	SPOCD1,KHDRBS1,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,PTP4A2,TMEM39B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	15141	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr1	32656692	32656709	32656701	Y	ZBTB8A	TXLNA,IQCC,EIF3I,TMEM234,MTMR9LP	NA	NA	NA	NA	IQCC	12527	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	32701561	32701886	32701724	Y	NA	IQCC,EIF3I,TMEM234,MTMR9LP,FAM167B	NA	NA	NA	NA	MTMR9LP	3335	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	32966228	32966602	32966575	Y	FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8A	NA	NA	NA	NA	ZBTB8A	36426	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.351918016296285
chr1	33077721	33078012	33077949	Y	FNDC5	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	36492	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr1	33089029	33089046	33089038	Y	NA	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	25458	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	33094923	33095323	33095277	Y	NA	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	19181	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	33182280	33182513	33182368	Y	KIAA1522	SYNC	SYNC,S100PBP,BSDC1,ZBTB8B,RBBP4,KIAA1522,YARS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SYNC	15083	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr1	33221272	33221671	33221612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNC	54075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	33225056	33225508	33225256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	S100PBP	54860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr1	33225777	33226084	33225890	Y	TMEM54,KIAA1522	NA	NA	NA	NA	NA	S100PBP	54284	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.467855599822819
chr1	33226574	33226719	33226667	Y	TMEM54,KIAA1522	NA	NA	NA	NA	NA	S100PBP	53649	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	33227148	33227387	33227320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	S100PBP	52981	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	33232248	33232565	33232367	Y	NA	S100PBP,YARS	NA	NA	NA	NA	S100PBP	47803	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	33284832	33285123	33284978	Y	NA	S100PBP,YARS	NA	NA	NA	NA	YARS	3078	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	33427851	33428169	33427991	Y	PHC2,RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	117	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	33428474	33429020	33428770	Y	NA	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	188	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	33433896	33434020	33433958	Y	RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	5610	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	33446816	33447482	33446950	Y	RNF19B	RNF19B	RNF19B,AK2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19B	18530	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	33457914	33458607	33458311	Y	RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	29628	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	33463690	33463885	33463767	Y	PHC2,RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	35404	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	33500817	33500865	33500842	Y	NA	AK2,ADC	NA	NA	NA	NA	AK2	43732	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr1	33515825	33516245	33515960	Y	RNF19B	AK2,ADC	AK2,S100PBP,RNF19B,TMEM54,FNDC5,HPCA,ADC	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AK2	28352	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20553894282687
chr1	33564918	33565286	33565197	Y	NA	AK2,ADC	NA	NA	NA	NA	ADC	20213	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	33645848	33646140	33645995	Y	HPCA,PHC2,TRIM62	TRIM62	NA	NA	NA	NA	TRIM62	188	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	33802277	33802571	33802529	Y	NA	AL513327.1	NA	NA	NA	NA	AL513327.1	39302	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	33804092	33804324	33804199	Y	NA	AL513327.1	NA	NA	NA	NA	AL513327.1	41117	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	33829513	33829825	33829684	Y	FNDC5,ZSCAN20	NA	NA	NA	NA	NA	PHC2	64828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	35953903	35954237	35954109	Y	SFPQ,EIF2C3	NA	NA	NA	NA	NA	NCDN	66837	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	36103028	36103196	36103152	Y	NA	PSMB2	TFAP2E	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB2	2249	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr1	36183411	36183689	36183588	Y	C1orf216	C1orf216,CLSPN	NA	NA	NA	NA	C1orf216	338	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.242672378570032
chr1	36397577	36397741	36397665	Y	STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3	NA	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	154735	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	36428229	36428381	36428320	Y	STK40,EIF2C4,THRAP3,EIF2C1,EIF2C3	NA	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	124095	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	36431149	36431388	36431272	Y	STK40,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3	NA	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	121088	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	36555347	36555633	36555606	Y	STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2	ADPRHL2	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	2871	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.204425830007387
chr1	36616485	36616868	36616577	Y	STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	2312	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	36617554	36617914	36617691	Y	STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	1266	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	36721428	36721771	36721600	Y	NA	THRAP3,SH3D21	NA	NA	NA	NA	THRAP3	33411	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	36817040	36817280	36817137	Y	NA	SH3D21,STK40,LSM10	SH3D21,FAM176B	K562	ChIA-PET	22265404	STK40	32217	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	36839449	36839891	36839558	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	9606	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	36840093	36840535	36840445	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	8962	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	36853020	36853462	36853143	Y	NA	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	3523	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	36866636	36866899	36866720	Y	LSM10	STK40,LSM10,OSCP1	NA	NA	NA	NA	LSM10	5143	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.18806767691315
chr1	37937293	37937526	37937471	Y	YRDC,MTF1,C1orf122,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	LINC01137	486	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.625152036290742
chr1	37942874	37943354	37943027	Y	YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	ZC3H12A	4721	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	37944084	37944971	37944382	Y	YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	ZC3H12A	5931	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	38009784	38010404	38010149	Y	SNIP1,MTF1,ZC3H12A	MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,GNL2	MEAF6	IMR90	Hi-C	24141950	SNIP1	7499	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr1	38010731	38010979	38010768	Y	ZC3H12A,MTF1	MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,GNL2	MEAF6	IMR90	Hi-C	24141950	SNIP1	6924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	38285621	38285821	38285720	Y	ZC3H12A,MTF1	MANEAL,C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	YRDC	13764	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr1	38308355	38308564	38308401	Y	ZC3H12A,SNIP1,MTF1	C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	MTF1	14728	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	38312444	38312820	38312535	Y	ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1	C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	MTF1	10472	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	38317043	38317898	38317556	Y	ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1	C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	MTF1	5394	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	38465723	38465839	38465779	Y	MTF1,FHL3	SF3A3,FHL3,UTP11L,POU3F1	NA	NA	NA	NA	FHL3	3439	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	38466019	38466413	38466271	Y	NA	SF3A3,FHL3,UTP11L,POU3F1	NA	NA	NA	NA	FHL3	2865	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	38469574	38470165	38469756	Y	NA	SF3A3,FHL3,UTP11L,POU3F1	NA	NA	NA	NA	FHL3	296	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	38518708	38519047	38518874	Y	NA	FHL3,UTP11L,POU3F1	POU3F1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	POU3F1	8258	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	39357087	39357474	39357146	Y	MACF1,GJA9	RRAGC,RP5-864K19.4,MYCBP	NA	NA	NA	NA	MYCBP	11798	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	39508832	39509204	39509012	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	18842	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	39516193	39516422	39516273	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	26203	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	39629010	39629413	39629213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	84022	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	39633654	39634014	39633702	Y	BMP8A	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	88666	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	39857791	39857995	39857869	Y	NA	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	16156	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	39874208	39874673	39874342	Y	KIAA0754	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	57	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr1	40005546	40005959	40005647	Y	NA	PPIEL,PABPC4	NA	NA	NA	NA	PPIEL	16420	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	40006104	40006751	40006634	Y	MFSD2A,PABPC4	PPIEL,PABPC4	NA	NA	NA	NA	PPIEL	15628	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	40264988	40265120	40265045	Y	NA	BMP8B	HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BMP8B	12455	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.950853979842372
chr1	40283075	40283206	40283146	Y	PABPC4,RLF,MFSD2A	BMP8B	MYCL1	K562	ChIA-PET	22265404	BMP8B	30542	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	40331340	40331501	40331388	Y	PABPC4,PPIE,ZMPSTE24,RLF,PPT1,CAP1,BMP8B,TRIT1,MYCL1	TRIT1	NA	NA	NA	NA	TRIT1	15682	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	40426190	40426638	40426252	Y	MFSD2A	MFSD2A	NA	NA	NA	NA	MFSD2A	7388	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	40561233	40561752	40561648	Y	SMAP2,RLF	NA	NA	NA	NA	NA	PPT1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	40853198	40853308	40853253	Y	NA	SMAP2	NA	NA	NA	NA	SMAP2	44676	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	41343431	41343839	41343651	Y	NA	CITED4	KCNQ4,CTPS,NFYC,CITED4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED4	17413	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr1	41367669	41367867	41367801	Y	NA	CITED4	CITED4,CTPS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED4	41651	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr1	41501440	41501773	41501639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	175422	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	41501908	41501999	41501966	Y	SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	175890	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr1	41564044	41564297	41564171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	141529	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	41622480	41622650	41622563	Y	NA	NA	CTPS,LOC100507178	IMR90	Hi-C	24141950	SCMH1	83176	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	41825927	41826139	41826062	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	333	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	41826642	41826952	41826745	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	1048	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr1	41952015	41952273	41952132	Y	EDN2	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	3671	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	41961925	41962146	41962029	Y	NA	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	13581	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227756632453003
chr1	41962532	41962651	41962593	Y	NA	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	14188	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	41966127	41966464	41966357	Y	NA	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	17783	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	41967378	41967702	41967588	Y	NA	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	19034	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18478155158147
chr1	41981831	41982007	41981926	Y	SLFNL1,SLFNL1	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	33487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	42073844	42074019	42073961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	125500	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	179507	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.38632211128982
chr1	42149945	42149960	42149949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	201601	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	42366364	42366624	42366514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	132972	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	42774668	42774801	42774679	Y	CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3	FOXJ3	NA	NA	NA	NA	FOXJ3	24747	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.438910186328538
chr1	42934748	42935131	42934805	Y	CCDC30,RIMKLA	PPCS,CCDC30,TMSB4XP1	NA	NA	NA	NA	CCDC30	7747	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	43389220	43390772	43390027	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	31758	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.440753448338388
chr1	43402214	43402581	43402425	Y	ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	19949	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	43402778	43403133	43403049	Y	ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	19397	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr1	43405621	43405821	43405630	Y	CCDC30,CCDC23,ERMAP,SZT2,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	16709	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	43406108	43407009	43406836	Y	YBX1,ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	15521	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18478155158147
chr1	43407355	43407700	43407616	Y	YBX1,ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	14830	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr1	43428386	43429108	43428580	Y	CLDN19,CCDC23,ERMAP,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	5666	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	43429290	43429917	43429491	Y	CCDC23,ERMAP,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	6570	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	43432863	43433109	43432938	Y	CCDC30,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	10143	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	43533809	43534205	43534063	Y	NA	NA	FLJ32224,SLC2A1,LOC100129924,C1orf50,CCDC23,ERMAP	IMR90	Hi-C	24141950	WDR65	101615	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	43760174	43760222	43760211	Y	TIE1	EBNA1BP2	C1orf210	K562	ChIA-PET	22265404	EBNA1BP2	25567	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	43839359	43839523	43839441	Y	NA	RP1-92O14.3,CDC20,ELOVL1,MED8,SZT2	NA	NA	NA	NA	ELOVL1	7663	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	43884019	43884040	43884030	Y	ST3GAL3,MPL,SZT2	MED8,SZT2,HYI	NA	NA	NA	NA	SZT2	30466	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	43988888	43989038	43988936	Y	PTPRF	PTPRF	PTPRF	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRF	30	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.283457011870465
chr1	44011575	44011705	44011627	Y	NA	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	22717	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	44150815	44151139	44150977	Y	ST3GAL3,SLC6A9,IPO13	KDM4A,ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	18356	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr1	44162019	44162313	44162287	Y	NA	KDM4A,ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	7182	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	44452990	44453115	44453039	Y	NA	RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24,SLC6A9,RP5-1198O20.4	NA	NA	NA	NA	CCDC24	1916	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	44495684	44496307	44495779	Y	NA	CCDC24,SLC6A9,RP5-1198O20.4	B4GALT2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A9	545	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.08009108155579
chr1	44689979	44690114	44690071	Y	NA	DMAP1	NA	NA	NA	NA	DMAP1	12852	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	44692988	44693156	44693052	Y	ATP6V0B	DMAP1	NA	NA	NA	NA	DMAP1	15861	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	44950888	44951090	44950987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF220	82022	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	44951424	44951733	44951502	Y	TCTEX1D4,PLK3,BTBD19,SLC6A9,RNF220	NA	NA	NA	NA	NA	RNF220	82558	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	45167170	45167180	45167175	Y	NA	TMEM53,RNU5F-1,RNU5D-1,KIF2C	NA	NA	NA	NA	RNU5F-1	18394	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	45192729	45193123	45192925	Y	NA	RNU5F-1,RNU5D-1,KIF2C,RPS8,SNORD55	KIF2C	IMR90	Hi-C	24141950	RNU5D-1	1719	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	45298718	45299070	45298894	Y	NA	PLK3,TCTEX1D4,BTBD19,RNU5E-6P	NA	NA	NA	NA	RNU5E-6P	15049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	45376274	45376331	45376304	Y	NA	CCNB1IP1P1	NA	NA	NA	NA	CCNB1IP1P1	45898	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	45670767	45670868	45670821	Y	PTCH2,ZSWIM5	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM5	99013	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	45746932	45746947	45746939	Y	NA	ZSWIM5,HPDL	ZSWIM5,UROD,HECTD3	IMR90	Hi-C	24141950	ZSWIM5	22934	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	45909846	45909857	45909852	Y	NA	TESK2	NA	NA	NA	NA	TESK2	45015	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	45990749	45991039	45990946	Y	NA	TESK2,MMACHC,CCDC163P,PRDX1,AKR1A1	NA	NA	NA	NA	PRDX1	4030	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	46102450	46102810	46102714	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	12688	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	46111666	46112048	46111975	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	3450	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236483547880411
chr1	46268583	46268737	46268651	Y	NA	MAST2	NA	NA	NA	NA	MAST2	17924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr1	46528388	46528566	46528496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	110179	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	46573980	46574380	46574180	Y	TSPAN1,PIK3R3,PIK3R3	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	64365	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	46575103	46575175	46575140	Y	PIK3R3,PIK3R3	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	63570	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr1	46637172	46637331	46637258	Y	NA	TSPAN1,PIK3R3,POMGNT1	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	1414	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	46955737	46955918	46955906	Y	DMBX1	NA	FAAH,DMBX1,MKNK1	IMR90	Hi-C	24141950	MKNK1	124597	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	46986321	46986408	46986365	Y	DMBX1	NA	NA	NA	NA	NA	MKNK1	94107	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.501529545625988
chr1	46999025	46999241	46999126	Y	ATPAF1-AS1	NA	NA	NA	NA	NA	MKNK1	81274	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	47718105	47718425	47718265	Y	NA	TAL1	TAL1	IMR90	Hi-C	24141950	TAL1	22213	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	47800262	47800514	47800436	Y	NA	STIL,CMPK1	NA	NA	NA	NA	CMPK1	2793	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.442369676268532
chr1	48224075	48224507	48224159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMPK1	426606	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.17859317723647
chr1	48515615	48515747	48515671	Y	SPATA6	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-61P	395861	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	48515939	48516296	48516118	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-61P	395312	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	49397467	49397500	49397484	Y	BEND5	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA6	461622	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	50619908	50620155	50620032	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELAVL4	108222	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	51056997	51057361	51057215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHBP12	186651	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	51083951	51084011	51083988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHBP12	160001	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr1	51097851	51098184	51098018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHBP12	145828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	51102056	51102361	51102067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHBP12	141651	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	51245588	51245972	51245952	Y	NA	PHBP12	NA	NA	NA	NA	PHBP12	1576	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr1	51261727	51261870	51261800	Y	NA	PHBP12	NA	NA	NA	NA	PHBP12	17715	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	51312022	51312165	51312091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHBP12	68010	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	51442122	51442408	51442227	Y	NA	FAF1,CDKN2C	NA	NA	NA	NA	CDKN2C	17705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.241942229379666
chr1	51475380	51475551	51475487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN2C	50963	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	51475745	51476056	51475832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN2C	51328	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr1	51703075	51703494	51703244	Y	OSBPL9	RNF11	NA	NA	NA	NA	RNF11	3132	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	51935246	51935592	51935567	Y	NA	RP11-191G24.1,EPS15	NA	NA	NA	NA	RP11-191G24.1	46389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	51986075	51986410	51986173	Y	NA	RP11-191G24.1,EPS15	NA	NA	NA	NA	EPS15	3075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	51997947	51998232	51998197	Y	NA	RP11-191G24.1,EPS15,OSBPL9	OSBPL9,EPS15	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPS15	14947	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	52033462	52033748	52033585	Y	NA	OSBPL9	OSBPL9,EPS15,NRD1,TTC39A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL9	7103	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr1	52044179	52044304	52044242	Y	NA	OSBPL9	OSBPL9	IMR90	Hi-C	24141950	OSBPL9	3328	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	52173889	52173954	52173921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	133038	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.274886025992467
chr1	52193707	52193852	52193763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRD1	148625	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	52341008	52341095	52341052	Y	CC2D1B,OSBPL9	NRD1	NA	NA	NA	NA	NRD1	1382	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	52885344	52885737	52885540	Y	ZCCHC11	ORC1,PRPF38A	NA	NA	NA	NA	PRPF38A	17108	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	53369161	53369511	53369336	Y	SCP2,ECHDC2	ECHDC2,SCP2	NA	NA	NA	NA	ECHDC2	21373	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	53385696	53386052	53386029	Y	NA	ECHDC2,SCP2	NA	NA	NA	NA	ECHDC2	4832	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	53482500	53482782	53482682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCP2	91599	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	53702100	53702340	53702220	Y	NA	CPT2,C1orf123	NA	NA	NA	NA	MAGOH	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	54261078	54261111	54261098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIPF1	93296	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	54286238	54286401	54286368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIPF1	68006	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	54441729	54442008	54441915	Y	NA	HSPB11,LRRC42,LDLRAD1	NA	NA	NA	NA	LRRC42	31979	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	54700132	54700688	54700499	Y	NA	CYB5RL	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	36423	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr1	54739679	54739787	54739710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	75970	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.311289312545263
chr1	54749325	54749366	54749346	Y	NA	NA	CYB5RL,MRPL37	IMR90	Hi-C	24141950	CYB5RL	85616	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	54765179	54765190	54765186	Y	NA	NA	MRPL37,CYB5RL	IMR90	Hi-C	24141950	CYB5RL	101470	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	54873075	54873515	54873406	Y	SSBP3,SSBP3	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	3637	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.256857975496695
chr1	54953784	54954325	54954090	Y	SSBP3,SSBP3	NA	TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP3	76632	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.739856355516249
chr1	55327144	55327486	55327453	Y	NA	RP11-67L3.5,DHCR24	NA	NA	NA	NA	RP11-67L3.5	23062	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	55411305	55411465	55411371	Y	USP24	TMEM61	DHCR24,TMEM61,BSND,HEATR8-TTC4,USP24,C1orf177,PCSK9,TTC22	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM61	33000	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	55431735	55431939	55431831	Y	NA	TMEM61	TMEM61,HEATR8-TTC4,BSND,PCSK9	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM61	12526	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	55506956	55507037	55506997	Y	NA	PCSK9	NA	NA	NA	NA	PCSK9	3735	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.135808896032157
chr1	55594097	55594408	55594328	Y	NA	NA	PCSK9	IMR90	Hi-C	24141950	USP24	84378	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	55894779	55895033	55894906	Y	NA	NA	PPAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	USP24	215993	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	55909250	55909597	55909489	Y	NA	NA	PPAP2B,PRKAA2	IMR90	Hi-C	24141950	USP24	230464	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	56184456	56184884	56184686	Y	NA	NA	PRKAA2,PPAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	USP24	505670	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr1	56771744	56771759	56771752	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	337215	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	56919158	56919299	56919214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	189675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	57043287	57044160	57043621	Y	PRKAA2,PPAP2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	64814	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	57948146	57948309	57948229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P6	564654	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr1	57961356	57961707	57961532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P6	551256	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	57988271	57988573	57988424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P6	524390	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.543044328116787
chr1	58225769	58226165	58225967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P6	286798	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	59008745	59009101	59008916	Y	NA	DAB1,OMA1,TACSTD2	NA	NA	NA	NA	DAB1	1305	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	59049880	59049917	59049902	Y	NA	DAB1,OMA1,TACSTD2	MYSM1,FGGY,OMA1	IMR90	Hi-C	24141950	TACSTD2	8714	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	59221049	59221462	59221387	Y	NA	JUN	FGGY,HSD52,LOC100131060,JUN,MIR4711	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JUN	26323	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr1	59280364	59280505	59280397	Y	NA	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	32579	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.606046651043352
chr1	59280773	59281281	59281052	Y	FGGY,JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	32988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.622422695541115
chr1	59281510	59281579	59281545	Y	JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	33725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	59281873	59282217	59282125	Y	MYSM1,FGGY,JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	34088	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.458398535205044
chr1	59369049	59370138	59369602	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-794H19.4	113921	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr1	59394323	59394565	59394423	Y	NA	NA	FGGY,JUN,LOC100131060	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP4-794H19.4	89494	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	59395500	59395772	59395634	Y	JUN	NA	FGGY,JUN,LOC100131060	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP4-794H19.4	88287	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208998432766864
chr1	59524373	59524568	59524471	Y	NA	RP4-794H19.4	FGGY,MIR4711,LOC100131060,JUN,HSD52	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-794H19.4	40314	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	59761390	59761720	59761439	Y	NA	FGGY	NA	NA	NA	NA	FGGY	1080	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	59821110	59821407	59821235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	60800	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	59910700	59911009	59910820	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	150390	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr1	60157078	60157331	60157204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HOOK1	121127	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	61522505	61523042	61522705	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	INADL,NFIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFIA	193574	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18278236002221
chr1	61543611	61543877	61543752	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	214680	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146379073469414
chr1	61549054	61549253	61549232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	220123	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.178209757262733
chr1	61579491	61579639	61579512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	250560	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.159295628027183
chr1	61583915	61584228	61583999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	254984	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	61649786	61650305	61649984	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	320855	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	61662774	61662930	61662815	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	333843	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	61707460	61707670	61707565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	378529	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	61918819	61919182	61919004	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	TM2D1	269913	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	62208815	62209373	62208933	Y	NA	TM2D1,INADL	NA	NA	NA	NA	INADL	2666	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	62609116	62609459	62609128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP1	290509	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	62773248	62773553	62773401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP1	126415	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	64127998	64128504	64128154	Y	ROR1	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB3BP	70606	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	65292575	65293034	65292898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAVER2	83797	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	65381647	65381826	65381744	Y	JAK1	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	48361	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	65383044	65383557	65383225	Y	JAK1	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	46630	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	65421731	65422136	65422135	Y	NA	JAK1,RP11-182I10.3	NA	NA	NA	NA	JAK1	8051	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	65639675	65639734	65639705	Y	NA	AK4	NA	NA	NA	NA	AK4	28443	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	65891768	65892129	65891951	Y	NA	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	7498	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr1	65992905	65993110	65992971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEPROT	108635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	66724177	66724356	66724261	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR78	664214	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	66728047	66728190	66728184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR78	660380	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr1	66736293	66736539	66736358	Y	PDE4B,PDE4B	NA	NA	NA	NA	NA	WDR78	652031	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr1	66757072	66757442	66757250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR78	631128	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	66760490	66760861	66760661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR78	627709	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr1	66782459	66782839	66782588	Y	PDE4B	NA	NA	NA	NA	NA	WDR78	605731	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	67374841	67375185	67375111	Y	SGIP1,WDR78	WDR78,MIER1	NA	NA	NA	NA	WDR78	13385	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	67883059	67883215	67883204	Y	NA	SERBP1	NA	NA	NA	NA	SERBP1	10883	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	68027599	68027762	68027652	Y	NA	NA	GADD45A,GNG12,LOC100289178	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GADD45A	120982	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	68215256	68215932	68215330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45A	66512	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	68257383	68257657	68257565	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	39493	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr1	68257818	68258216	68258148	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	38934	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	68314949	68315302	68315127	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	17799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	68321515	68321736	68321554	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	24365	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	68340774	68341128	68340951	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	43624	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	68354536	68354908	68354722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG12	57386	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	68639460	68639856	68639657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLS	56947	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	68663588	68663867	68663728	Y	NA	WLS,RPS7P4	NA	NA	NA	NA	WLS	32936	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	68858132	68858533	68858311	Y	NA	NA	WLS,LOC100289178	IMR90	Hi-C	24141950	DEPDC1	102371	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	68945486	68945782	68945636	Y	NA	DEPDC1	NA	NA	NA	NA	DEPDC1	15122	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr1	68961350	68961555	68961472	Y	NA	DEPDC1	NA	NA	NA	NA	DEPDC1	446	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	70238650	70238794	70238722	Y	LRRC7	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC40	430509	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	70635460	70635702	70635581	Y	NA	LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4	NA	NA	NA	NA	LRRC40	33601	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	70691921	70692281	70691982	Y	ANKRD13C,LRRC40,SRSF11	LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	7215	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	70709017	70709466	70709138	Y	NA	LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	24311	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	70746826	70747040	70746993	Y	ANKRD13C	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	62120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr1	70807938	70808237	70808103	Y	NA	ANKRD13C,HHLA3	NA	NA	NA	NA	ANKRD13C	10180	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	71398250	71398442	71398389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZRANB2	146538	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	72073753	72074154	72073955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZRANB2-AS2	528746	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	72715442	72715840	72715642	Y	NA	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	30577	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	72749220	72749791	72749447	Y	NEGR1	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	2803	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.15727900140902
chr1	72750417	72750888	72750606	Y	NA	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	4000	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	75182913	75182976	75182918	Y	NA	TYW3,CRYZ	NA	NA	NA	NA	TYW3	13860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	76645391	76645540	76645467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD45A	393817	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr1	77165935	77166101	77166017	Y	NA	TPI1P1	ST6GALNAC3	IMR90	Hi-C	24141950	TPI1P1	2461	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr1	77595980	77596376	77595997	Y	NA	RP4-706A16.3	NA	NA	NA	NA	RP4-706A16.3	3212	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr1	77977128	77977445	77977326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	169659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	78026939	78027232	78027062	Y	FAM73A	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	119872	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	78067790	78068312	78068066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	78792	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	78196845	78197195	78197020	Y	NA	ZZZ3,USP33,RP4-706L14.2,FAM73A	NA	NA	NA	NA	USP33	26342	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	78214350	78214750	78214605	Y	NA	USP33,RP4-706L14.2,FAM73A	NA	NA	NA	NA	USP33	8787	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr1	78240205	78240392	78240373	Y	NA	USP33,RP4-706L14.2,FAM73A	USP33,ZZZ3,FAM73A	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-706L14.2	1656	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	78404062	78404594	78404354	Y	NA	FUBP1,DNAJB4	NA	NA	NA	NA	FUBP1	38200	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	78423142	78423521	78423473	Y	NA	FUBP1,DNAJB4	NA	NA	NA	NA	FUBP1	19273	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	114487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.801745565623331
chr1	78957462	78957762	78957688	Y	PTGFR	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44L	125845	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44	102291	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.403967198156476
chr1	80973840	80974001	80973921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-445O10.1	698252	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	81968642	81968976	81968811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	216402	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	84710038	84710507	84710127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	168293	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20353975126761
chr1	84970111	84970722	84970500	Y	NA	RPF1	NA	NA	NA	NA	GNG5	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	84971050	84971209	84971115	Y	MCOLN2,GNG5	RPF1,GNG5	NA	NA	NA	NA	GNG5	802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.0561012344501
chr1	85038681	85038996	85038864	Y	MCOLN2,GNG5,CTBS	CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	518	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	85049005	85049203	85049109	Y	NA	CTBS	RPF1,GNG5	IMR90	Hi-C	24141950	CTBS	10842	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	85143846	85143980	85143979	Y	SAMD13,SAMD13,DNASE2B,DNASE2B,LPAR3,SSX2IP,SSX2IP	RP11-484D4.3,SSX2IP	NA	NA	NA	NA	SSX2IP	10506	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	85643319	85643587	85643547	Y	NA	SYDE2	MIR4423	IMR90	Hi-C	24141950	SYDE2	21142	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.120163000724761
chr1	85667688	85667915	85667906	Y	NA	SYDE2	NA	NA	NA	NA	SYDE2	2959	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr1	85710539	85710684	85710606	Y	NA	SYDE2,C1orf52,BCL10	NA	NA	NA	NA	C1orf52	12671	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	85737728	85738105	85737917	Y	BCL10	C1orf52,BCL10	NA	NA	NA	NA	BCL10	2668	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	85794698	85795078	85794848	Y	CYR61	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	53925	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	85810010	85810182	85810130	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	69237	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	85992810	85993270	85993105	Y	NA	DDAH1	NA	NA	NA	NA	DDAH1	48663	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	86010067	86010444	86010393	Y	NA	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	DDAH1	31489	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	86010493	86010816	86010648	Y	NA	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	DDAH1	31117	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	86077140	86077408	86077190	Y	CYR61	DDAH1,CYR61	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYR61	32696	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	86989178	86989418	86989299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLCA2	101409	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	87239429	87239698	87239491	Y	NA	NA	HS2ST1,SEP15,SH3GLB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SH3GLB1	71170	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	87240012	87240427	87240202	Y	SH3GLB1	NA	HS2ST1,SEP15,SH3GLB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SH3GLB1	71753	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	87691904	87692436	87692089	Y	NA	NA	LOC339524,LMO4	IMR90	Hi-C	24141950	LMO4	99715	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	87799623	87799998	87799801	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	7472	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	87800631	87801610	87800748	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	8480	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.171482033394586
chr1	88694004	88694059	88694042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKN2	453846	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	88716578	88716942	88716762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKN2	430963	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	89167079	89167239	89167155	Y	GTF2B,GBP4,GBP3,GBP2,GBP1	PKN2	NA	NA	NA	NA	PKN2	19174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	89303069	89303193	89303134	Y	GBP4,GBP2,GTF2B	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2B	52434	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	89358212	89358439	89358316	Y	PKN2,CCBL2	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	2585	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.787368712684828
chr1	89466934	89467175	89467138	Y	GTF2B,GBP2,GBP3	CCBL2,RBMXL1,GBP3	NA	NA	NA	NA	RBMXL1	10291	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	89739985	89740544	89740197	Y	GTF2B,GBP3,GBP1,GBP2,LRRC8C,GBP4,GBP5	GBP5	NA	NA	NA	NA	GBP5	3441	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	89887466	89887838	89887537	Y	GBP3,GBP1,GBP2,GBP4,GBP5,LRRC8C,LRRC8B	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC8B	100557	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	89942348	89942369	89942360	Y	NA	LRRC8B	NA	NA	NA	NA	LRRC8B	46026	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	90075464	90075685	90075572	Y	NA	LRRC8C	NA	NA	NA	NA	LRRC8C	20946	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	90137741	90138074	90137909	Y	ZNF326,LRRC8D,GBP4,GBP5,LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C	LRRC8C	NA	NA	NA	NA	LRRC8C	41110	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	90190139	90190909	90190374	Y	GBP5,LRRC8B,LRRC8C,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC8C	93508	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	90274070	90274340	90274210	Y	NA	LRRC8D	GEMIN8P4,ZNF326,LRRC8D	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LRRC8D	10233	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	90309838	90310280	90310072	Y	LRRC8C,ZNF326	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	25265	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	90321378	90321621	90321467	Y	LRRC8C,ZNF326	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	36805	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	90372321	90372729	90372378	Y	LRRC8B,LRRC8C,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	85151	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151837754968669
chr1	90374317	90375036	90374524	Y	LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	82844	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	90376424	90376756	90376561	Y	LRRC8D,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	81124	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.256857975496695
chr1	91472225	91472812	91472773	Y	NA	ZNF644	NA	NA	NA	NA	ZNF644	13017	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	91793812	91793887	91793849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC7	170521	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr1	92164446	92164626	92164554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-91I11.1	100718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	92183243	92183457	92183382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-91I11.1	119515	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	92184014	92184251	92184134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-91I11.1	120286	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	92189033	92189061	92189048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-91I11.1	125305	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	92198149	92198440	92198227	Y	TGFBR3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-91I11.1	134421	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	92202579	92202753	92202666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-91I11.1	138851	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18278236002221
chr1	92218581	92218971	92218958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	150921	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	92725087	92725311	92725273	Y	RPAP2,GLMN	RPAP2,GLMN	NA	NA	NA	NA	RPAP2	37211	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	93270252	93270588	93270467	Y	NA	EVI5,RPL5	EVI5	IMR90	Hi-C	24141950	EVI5	14291	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	93427945	93428408	93428079	Y	MTF2,DR1,FAM69A	FAM69A	NA	NA	NA	NA	FAM69A	2888	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr1	93634565	93634982	93634927	Y	MTF2	CCDC18,TMED5	NA	NA	NA	NA	CCDC18	8494	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	93694062	93694249	93694102	Y	MTF2,CCDC18	TMED5	NA	NA	NA	NA	TMED5	49777	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr1	93806739	93807078	93807070	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	DR1	2367	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	93812976	93813243	93813111	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	RP4-717I23.3	3394	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr1	93914812	93914954	93914881	Y	FNBP1L	FNBP1L	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	3124	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr1	94023703	94024059	94023930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	112015	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	94089710	94089715	94089713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	149285	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	94093325	94093611	94093590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	145389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	94125861	94126246	94126059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	112754	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	94127789	94128026	94127840	Y	GCLM,TMED5,DNTTIP2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	110974	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr1	94128177	94128297	94128262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	110703	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr1	94133922	94134283	94134103	Y	FNBP1L	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	104717	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr1	94145547	94146118	94145739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	92882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.06533126498817
chr1	94158127	94158185	94158167	Y	GCLM,DNTTIP2	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	80815	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr1	94158601	94159338	94158654	Y	GCLM,DNTTIP2,BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	79662	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.98183527565303
chr1	94161111	94161471	94161388	Y	GCLM,DNTTIP2	NA	BCAR3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-488P3.1	77529	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	94167175	94167520	94167394	Y	BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	71480	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr1	94168203	94168325	94168229	Y	NA	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	70675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.31401865329489
chr1	94169341	94169462	94169391	Y	GCLM,DNTTIP2	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	69538	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	94169670	94169961	94169880	Y	GCLM,DNTTIP2	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	69039	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	94224546	94224929	94224684	Y	DNTTIP2	RP11-488P3.1	MIR760,BCAR3,LOC100129046,FNBP1L	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-488P3.1	14071	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.194968765389612
chr1	94244939	94245309	94245199	Y	ARHGAP29,FNBP1L,BCAR3	RP11-488P3.1	BCAR3,MIR760,FNBP1L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	5939	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.326432092741998
chr1	94309612	94309956	94309784	Y	NA	MIR760,BCAR3,DNTTIP2	NA	NA	NA	NA	MIR760	432	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	94332093	94332098	94332096	Y	NA	MIR760,BCAR3,DNTTIP2,GCLM	NA	NA	NA	NA	DNTTIP2	11376	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	94684511	94684818	94684682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP29	53806	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	94996582	94996830	94996792	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	8526	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	95107584	95108052	95107918	Y	F3,SLC44A3,SLC44A3	RP11-86H7.7	F3,ABCD3,SLC44A3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-86H7.7	19844	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	95113814	95114327	95114013	Y	F3	RP11-86H7.7	F3,ABCD3,SLC44A3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-86H7.7	26074	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr1	95179307	95179605	95179478	Y	F3	NA	F3,ABCD3,ALG14	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-86H7.7	91567	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	95221261	95221551	95221307	Y	NA	NA	F3,ABCD3	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01057	62286	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	95249173	95249377	95249275	Y	NA	LINC01057,SLC44A3	ABCD3,F3,ALG14	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01057	34460	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr1	95267524	95267667	95267664	Y	NA	LINC01057,SLC44A3	F3,ABCD3,ABCA4,CNN3,LOC729970,ALG14,SLC44A3	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01057	16170	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	95551114	95551338	95551185	Y	NA	ALG14,TMEM56	ALG14,TMEM56-RWDD3,SLC44A3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ALG14	14613	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	97199537	97199912	97199566	Y	NA	PTBP2	NA	NA	NA	NA	PTBP2	14316	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	97291085	97291340	97291213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTBP2	105864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	97994700	97995088	97995052	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	14169	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	2503	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.38247965772071
chr1	98315619	98315765	98315702	Y	DPYD	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	68840	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	98373500	98373836	98373707	Y	NA	DPYD	NA	NA	NA	NA	DPYD	10769	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	98494244	98494658	98494592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	109639	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18278236002221
chr1	98606055	98606462	98606113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	221450	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	98788970	98789228	98789135	Y	NA	NA	MIR137HG,MIR2682,LOC729987,DPYD	IMR90	Hi-C	24141950	SNX7	336008	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	98789496	98789901	98789701	Y	NA	NA	MIR137HG,MIR2682,LOC729987,DPYD	IMR90	Hi-C	24141950	SNX7	335335	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr1	100138206	100138591	100138311	Y	AGL,AGL,AGL,AGL,PALMD	PALMD	NA	NA	NA	NA	PALMD	28707	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr1	100169951	100170218	100170031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRRS1	59969	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr1	100494312	100494735	100494498	Y	CDC14A,HIAT1	HIAT1	NA	NA	NA	NA	HIAT1	6918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	100502622	100502881	100502754	Y	NA	HIAT1	NA	NA	NA	NA	HIAT1	969	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	100555117	100555459	100555393	Y	NA	SASS6	NA	NA	NA	NA	SASS6	41052	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	100678369	100678762	100678562	Y	NA	DBT	NA	NA	NA	NA	DBT	34628	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr1	100703358	100703606	100703422	Y	NA	DBT,RP11-305E17.6	NA	NA	NA	NA	DBT	9784	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	100828525	100828922	100828611	Y	SASS6	CDC14A	NA	NA	NA	NA	CDC14A	19941	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.164024160336071
chr1	100858865	100858991	100858930	Y	SLC35A3,HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	50281	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.301832247927488
chr1	100859089	100859486	100859291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	50505	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	100859593	100859940	100859621	Y	HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	51009	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr1	101202267	101202571	101202418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXTL2	156983	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr1	101392986	101393260	101393033	Y	S1PR1,SLC30A7,SLC30A7	EXTL2,SLC30A7	NA	NA	NA	NA	SLC30A7	33354	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	101485385	101485713	101485528	Y	NA	RP11-421L21.3,DPH5	NA	NA	NA	NA	RP11-421L21.3	3721	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	101486133	101486158	101486151	Y	NA	RP11-421L21.3,DPH5	NA	NA	NA	NA	RP11-421L21.3	3276	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr1	104585164	104585551	104585358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNPC3	518851	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	108132692	108133060	108132878	Y	NTNG1,NTNG1,VAV3	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT6	535425	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	108231996	108232161	108232053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	509310	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	108695322	108695861	108695595	Y	FAM102B	SLC25A24	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	45610	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	108741685	108742156	108741931	Y	FAM102B	SLC25A24	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	214	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.588748749737947
chr1	108870455	108870699	108870577	Y	NA	NA	SLC25A24	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC25A24	128984	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	109079557	109079899	109079743	Y	NA	FAM102B	NA	NA	NA	NA	FAM102B	20812	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.190240233080725
chr1	109093990	109094406	109094278	Y	NA	FAM102B	HENMT1,FAM102B	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM102B	6305	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	109099158	109099479	109099238	Y	NA	FAM102B	NA	NA	NA	NA	FAM102B	1232	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	109100040	109100237	109100058	Y	PRPF38B,FAM102B	FAM102B	NA	NA	NA	NA	FAM102B	474	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.356263584976056
chr1	109104473	109104583	109104556	Y	PRPF38B,FAM102B	FAM102B	NA	NA	NA	NA	FAM102B	3762	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr1	109127044	109127234	109127073	Y	STXBP3,PRPF38B,FAM102B	FAM102B	NA	NA	NA	NA	FAM102B	26333	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr1	109133637	109134097	109133761	Y	TMEM167B,STXBP3,PRPF38B,FAM102B	FAM102B	NA	NA	NA	NA	FAM102B	32926	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr1	109156863	109156955	109156909	Y	NA	HENMT1	NA	NA	NA	NA	HENMT1	45193	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	109159407	109159722	109159520	Y	NA	HENMT1	NA	NA	NA	NA	HENMT1	42426	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr1	109246671	109246905	109246843	Y	FAM102B,TMEM167B,PRPF38B	HENMT1,PRPF38B,STXBP3	NA	NA	NA	NA	PRPF38B	13726	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	109262615	109262764	109262672	Y	NA	PRPF38B,STXBP3	NA	NA	NA	NA	STXBP3	24532	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	109467804	109468470	109468110	Y	GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	35636	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.265428961374692
chr1	109469350	109469540	109469522	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	34566	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	109499781	109500180	109500079	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	3926	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr1	109515208	109515609	109515409	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	CLCC1	11097	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	109572587	109572654	109572620	Y	NA	WDR47,TAF13	NA	NA	NA	NA	WDR47	10196	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	109784080	109784425	109784202	Y	NA	SARS,CELSR2,PSRC1	CELSR2	IMR90	Hi-C	24141950	CELSR2	6216	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	109913179	109913623	109913457	Y	SORT1	SORT1	NA	NA	NA	NA	SORT1	24950	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	110160052	110160461	110160231	Y	GNAI3,FAM40A,AMPD2,AMPD2,AMPD2	AMPD2,GSTM4,GSTM2	NA	NA	NA	NA	AMPD2	3326	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	110334849	110335164	110334977	Y	NA	EPS8L3	CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPS8L3	30200	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	110363861	110364229	110364029	Y	GNAI3,AMPD2	NA	CSF1,AHCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	EPS8L3	59212	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr1	110364881	110365302	110365225	Y	GNAI3,AMPD2,CSF1	NA	CSF1,AHCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	EPS8L3	60232	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.277615366742094
chr1	110366477	110366702	110366587	Y	GSTM2,CSF1	NA	CSF1,AHCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	EPS8L3	61828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.373178522652346
chr1	110406868	110407271	110407021	Y	GNAI3,CSF1	CSF1	CSF1,GSTM2,GSTM4,GNAI3,AHCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	CSF1	43593	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr1	110420039	110420145	110420092	Y	UBL4B	CSF1	CSF1,AHCYL1,EPS8L3,GNAI3,CYB561D1,ATXN7L2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CSF1	30719	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.231755015571524
chr1	110438276	110438910	110438607	Y	NA	CSF1	CSF1,EPS8L3,SORT1,PSMA5,GSTM3,GNAI3,GSTM4,AHCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	CSF1	11954	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	110778589	110778756	110778673	Y	NA	KCNC4	NA	NA	NA	NA	KCNC4	26624	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	110879130	110879445	110879277	Y	CSF1	RBM15,LAMTOR5-AS1	NA	NA	NA	NA	RBM15	2	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr1	110895542	110895785	110895664	Y	NA	RBM15,LAMTOR5-AS1	NA	NA	NA	NA	RBM15	16414	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	110927812	110928210	110927883	Y	CD53,FAM40A,RBM15	RBM15,LAMTOR5-AS1	NA	NA	NA	NA	LAMTOR5-AS1	4371	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	111178912	111179243	111179089	Y	RBM15,CD53	NA	KCNA2	K562	ChIA-PET	22265404	CD53	234532	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	111981832	111982198	111982008	Y	NA	OVGP1,ATP5F1,WDR77	NA	NA	NA	NA	ATP5F1	7288	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	111996023	111996307	111996190	Y	NA	OVGP1,ATP5F1,WDR77	NA	NA	NA	NA	WDR77	6025	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	112050044	112050594	112050328	Y	C1orf183,C1orf183,CEPT1,DRAM2,RAP1A,C1orf162,ADORA3	RAP1A	NA	NA	NA	NA	RAP1A	32246	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	112135698	112135869	112135721	Y	C1orf183,DENND2D,RAP1A	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1A	52858	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	112143517	112143622	112143594	Y	CEPT1,CHI3L2	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1A	60677	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	112163412	112163797	112163622	Y	C1orf183,C1orf183,C1orf162,RAP1A	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1A	80572	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr1	112163826	112164071	112163877	Y	C1orf183,C1orf183,C1orf162,RAP1A	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1A	80986	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	112196411	112196803	112196596	Y	C1orf183,RAP1A	NA	NA	NA	NA	NA	DDX20	99064	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	112276731	112276883	112276807	Y	C1orf162,RAP1A,C1orf183,C1orf183	DDX20,FAM212B	NA	NA	NA	NA	DDX20	18984	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	112918897	112919196	112919049	Y	NA	CTTNBP2NL	WNT2B,ST7L,DDX20	IMR90	Hi-C	24141950	CTTNBP2NL	17607	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	112942216	112942335	112942276	Y	CTTNBP2NL	CTTNBP2NL	NA	NA	NA	NA	CTTNBP2NL	5413	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	113014906	113015158	113015047	Y	CAPZA1	WNT2B	NA	NA	NA	NA	WNT2B	7743	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	113072370	113072489	113072380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WNT2B	65207	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr1	113086746	113087141	113086830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPZA1	72654	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	113394964	113395159	113395070	Y	NA	NA	FAM19A3,PPM1J	IMR90	Hi-C	24141950	SLC16A1-AS1	101878	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	113468568	113468671	113468620	Y	NA	SLC16A1-AS1,SLC16A1	NA	NA	NA	NA	SLC16A1-AS1	28366	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	113525578	113525919	113525789	Y	NA	SLC16A1-AS1,SLC16A1	SLC16A1,AKR7A2P1,LRIG2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC16A1	27943	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	113683682	113683919	113683753	Y	NA	RP11-389O22.4	NA	NA	NA	NA	RP11-389O22.4	25697	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	113684444	113684648	113684532	Y	NA	RP11-389O22.4	NA	NA	NA	NA	RP11-389O22.4	24968	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	113932415	113932748	113932683	Y	NA	MAGI3	NA	NA	NA	NA	MAGI3	1044	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr1	114236415	114236760	114236542	Y	MAGI3	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF1	63351	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr1	114326143	114326379	114326237	Y	HIPK1,HIPK1,HIPK1,AP4B1,PHTF1,RSBN1,PTPN22	PHTF1,RP5-1073O3.2,RSBN1	NA	NA	NA	NA	PHTF1	26032	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	114477404	114477721	114477665	Y	RSBN1,HIPK1,HIPK1,HIPK1	DCLRE1B,AP4B1,HIPK1	NA	NA	NA	NA	HIPK1	7590	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	114997819	114998047	114997990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM33	53734	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	115025085	115025405	115025244	Y	BCAS2,TRIM33	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	26376	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	115046601	115046805	115046703	Y	NA	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	4976	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr1	115052481	115052766	115052572	Y	BCAS2,TRIM33	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	700	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.38247965772071
chr1	115605190	115605611	115605404	Y	BCAS2,SIKE1	NA	NA	NA	NA	NA	SIKE1	283884	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr1	115732772	115733197	115732900	Y	NGF	NA	NGF	IMR90	Hi-C	24141950	SIKE1	411466	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	116038305	116038519	116038336	Y	NA	NA	NGF,TSPAN2	IMR90	Hi-C	24141950	VANGL1	144055	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	116039640	116039989	116039911	Y	NA	NA	NGF,TSPAN2	IMR90	Hi-C	24141950	VANGL1	142585	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	116088478	116088732	116088606	Y	NA	NA	NGF,VANGL1,SYCP1	IMR90	Hi-C	24141950	VANGL1	93842	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	116520279	116520650	116520380	Y	ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,SLC22A15	SLC22A15	NA	NA	NA	NA	SLC22A15	3160	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	116918925	116919548	116919274	Y	SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	5635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr1	117047053	117047428	117047164	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58	NAP1L4P1	NA	NA	NA	NA	NAP1L4P1	27286	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr1	117051576	117051921	117051802	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	NAP1L4P1	NA	NA	NA	NA	NAP1L4P1	22793	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	117074509	117074935	117074769	Y	NA	CD58	NA	NA	NA	NA	NAP1L4P1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	117082797	117083071	117083005	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58	NAP1L4P1,CD58	NA	NA	NA	NA	NAP1L4P1	8083	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	117100772	117101124	117100940	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	NAP1L4P1,CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	10537	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr1	117110819	117111247	117111136	Y	NA	NAP1L4P1,CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	414	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	117111804	117112156	117112090	Y	TTF2,CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	NAP1L4P1,CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	143	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	117112460	117112738	117112567	Y	TTF2,CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	NAP1L4P1,CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr1	117132073	117132239	117132154	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	20412	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	117256857	117256976	117256917	Y	NA	IGSF3	CD101,TTF2	IMR90	Hi-C	24141950	IGSF3	48482	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	117610144	117610413	117610279	Y	NA	RP11-27K13.3,TTF2	VTCN1,TRIM45	IMR90	Hi-C	24141950	TTF2	9219	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	118153815	118153988	118153913	Y	FAM46C	FAM46C	NA	NA	NA	NA	FAM46C	7259	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	118415993	118416217	118416147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDAP2	54036	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	119506251	119506502	119506377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-418J17.1	174517	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	119668351	119668628	119668490	Y	WARS2	RP11-418J17.1,WARS2	NA	NA	NA	NA	RP11-418J17.1	12391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	120275491	120275880	120275569	Y	ADAM30	HMGCS2	NA	NA	NA	NA	HMGCS2	33648	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	144009977	144010738	144010098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF8	134070	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	144533627	144534178	144533764	Y	PDE4DIP	RNU1-59P	PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNU1-59P	1589	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr1	144927217	144927550	144927432	Y	PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10	RNU2-38P	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	15122	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	145012331	145013054	145012678	Y	NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	69659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	145092450	145092883	145092733	Y	SEC22B,PDE4DIP	SEC22B	NBPF9,LOC653513,PDE4DIP,NOTCH2NL,SEC22B,LOC728875,NBPF10	IMR90	Hi-C	24141950	SEC22B	1337	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	145106553	145106772	145106662	Y	NA	SEC22B	NA	NA	NA	NA	SEC22B	12333	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	145113904	145114998	145114671	Y	PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NBPF10,NOTCH2NL	SEC22B	NA	NA	NA	NA	SEC22B	19684	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.319321405244734
chr1	145437595	145437817	145437681	Y	CD160,TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A	TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L	NA	NA	NA	NA	TXNIP	1126	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	145455122	145455741	145455465	Y	PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,CD160,TXNIP	TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L,RBM8A	NA	NA	NA	NA	POLR3GL	12647	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.299102907177861
chr1	145526651	145526817	145526757	Y	NA	RBM8A,RP11-315I20.1,GNRHR2,PEX11B,ANKRD35,PIAS3	NA	NA	NA	NA	PEX11B	12399	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	145640932	145641287	145641091	Y	NBPF10	POLR3C,RNF115	NA	NA	NA	NA	RNF115	31896	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	147080043	147080251	147080097	Y	PRKAB2,CHD1L,BCL9	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	60367	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18478155158147
chr1	147775754	147775884	147775851	Y	NBPF14	RNU1-120P,RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	29002	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	147790636	147790862	147790749	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	14024	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.30405892991108
chr1	148000699	148000802	148000795	Y	NA	RNVU1-13	NA	NA	NA	NA	RNVU1-13	8553	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	149138053	149138113	149138087	Y	NA	PFN1P12	NA	NA	NA	NA	PFN1P12	25398	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	149215297	149215704	149215586	Y	NA	RNVU1-17	NA	NA	NA	NA	RNVU1-17	23028	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	149816287	149817606	149817166	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2BC	2733	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	149820361	149820952	149820609	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2AA4	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	149821015	149821647	149821349	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2AA4	372	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr1	149910900	149911536	149911461	Y	NA	SF3B4,MTMR11	NA	NA	NA	NA	MTMR11	4109	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.128351022973642
chr1	149931955	149932255	149932237	Y	NA	SF3B4,MTMR11,OTUD7B	MTMR11,SF3B4	IMR90	Hi-C	24141950	MTMR11	25164	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	149981648	149981889	149981683	Y	ANP32E,OTUD7B	OTUD7B	NA	NA	NA	NA	OTUD7B	1023	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200810410517982
chr1	150159099	150159241	150159135	Y	PRPF3,MCL1,PLEKHO1	ANP32E,RNU2-17P	HIST2H2AC,HIST2H2BE,HIST2H2AB	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ANP32E	47263	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	150185878	150186128	150186012	Y	HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E	ANP32E,RNU2-17P	NA	NA	NA	NA	ANP32E	20376	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.27905823006392
chr1	150577042	150577503	150577391	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	22585	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.257971088316178
chr1	150585815	150586394	150586132	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,FAM63A,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	13694	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr1	150592182	150592667	150592572	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	7421	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	150949569	150950014	150949933	Y	ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A	CERS2,ANXA9,FAM63A,PRUNE	NA	NA	NA	NA	ANXA9	2479	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.19206606003167
chr1	151166314	151166527	151166421	Y	NA	SEMA6C,SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	VPS72	517	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.262699620625065
chr1	151168297	151168505	151168391	Y	BNIPL,TUFT1,SCNM1	SCNM1,LYSMD1,VPS72	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr1	151168916	151169086	151168995	Y	NA	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	491	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	151172142	151172526	151172243	Y	FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	3717	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.196967956948873
chr1	151172620	151173197	151172669	Y	TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	4195	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.218455497384639
chr1	151184646	151184728	151184696	Y	NA	LYSMD1,VPS72,PIP5K1A,PSMD4	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	16221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	151249767	151250096	151249960	Y	FAM63A,CDC42SE1,RFX5,PI4KB,PI4KB,TNFAIP8L2,ZNF687	PSMD4,ZNF687,RP11-126K1.2,PI4KB	NA	NA	NA	NA	ZNF687	1998	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	151255796	151256115	151256047	Y	NA	PSMD4,ZNF687,RP11-126K1.2,PI4KB	NA	NA	NA	NA	RP11-126K1.2	3391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	151284018	151284391	151284246	Y	FAM63A,CDC42SE1,TNFAIP8L2,ZNF687,RFX5,PI4KB,PI4KB	ZNF687,RP11-126K1.2,PI4KB,RP11-126K1.6,RFX5	NA	NA	NA	NA	PI4KB	13800	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	151344220	151344519	151344431	Y	NA	PI4KB,RP11-126K1.6,RFX5,SELENBP1,PSMB4	NA	NA	NA	NA	SELENBP1	1011	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr1	151422102	151422465	151422287	Y	NA	POGZ	NA	NA	NA	NA	POGZ	7476	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	151580936	151581099	151580976	Y	NA	SNX27,RP11-404E16.1	RIIAD1,CELF3	IMR90	Hi-C	24141950	SNX27	1442	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	151809390	151809745	151809546	Y	RORC,C2CD4D	RP11-98D18.9,TDRKH,RORC,THEM5	NA	NA	NA	NA	RORC	7042	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208268283576497
chr1	151868154	151868386	151868273	Y	NA	THEM5,THEM4	NA	NA	NA	NA	THEM4	11898	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr1	151877533	151877895	151877666	Y	THEM4	THEM4	NA	NA	NA	NA	THEM4	2389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	151916920	151917624	151917271	Y	NA	THEM4,S100A10,NBPF18P	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	36636	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	151918166	151918684	151918434	Y	NA	THEM4,S100A10,NBPF18P	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	37882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.422378212281365
chr1	151918898	151919222	151919024	Y	S100A10	THEM4,S100A10,NBPF18P	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	38614	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	151960875	151961433	151961102	Y	S100A11,S100A10	S100A10,NBPF18P	NA	NA	NA	NA	S100A10	3433	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.241942229379666
chr1	151961675	151962369	151962069	Y	S100A11,S100A10	S100A10,NBPF18P	NA	NA	NA	NA	S100A10	2497	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr1	151962641	151962839	151962740	Y	NA	S100A10,NBPF18P	NA	NA	NA	NA	S100A10	2027	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	152001678	152001977	152001894	Y	S100A10,S100A11	S100A10,NBPF18P,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	16406	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	152006910	152007460	152006991	Y	SNX27,S100A11	S100A10,NBPF18P,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	10923	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr1	152007615	152008057	152007721	Y	THEM4	S100A10,NBPF18P,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	10326	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.531971035568867
chr1	152022022	152022514	152022379	Y	SNX27,S100A10,S100A11	S100A11	THEM4	MCF7	ChIA-PET	22265404	S100A11	3639	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.44708077351852
chr1	152140379	152140745	152140485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCHH	55823	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	153095466	153095607	153095484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	S100A9	232723	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	153488459	153488748	153488622	Y	PGLYRP4,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14	BX470102.3,S100A6,S100A3,S100A4,S100A2	NA	NA	NA	NA	BX470102.3	15331	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.278345515932461
chr1	153510895	153511054	153510975	Y	NA	BX470102.3,S100A6,S100A3,S100A4,S100A2	NA	NA	NA	NA	S100A6	4175	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.400351778667072
chr1	153541018	153541368	153541269	Y	PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13	BX470102.3,S100A6,S100A3,S100A4,S100A2,S100A16,S100A14	NA	NA	NA	NA	S100A2	2652	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.517941368191616
chr1	153549643	153549828	153549736	Y	PGLYRP3,S100A7L2	BX470102.3,S100A6,S100A3,S100A4,S100A2,S100A16,S100A14,S100A1	S100A14,S100A13,S100A16,CHTOP,S100A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	S100A2	11277	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	153583449	153583810	153583692	Y	PGLYRP3,PGLYRP4,S100A7A,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13	S100A2,S100A14,S100A1,CHTOP,S100A13,SNAPIN	NA	NA	NA	NA	S100A16	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.516445291743017
chr1	153584539	153584862	153584750	Y	NA	S100A2,S100A16,S100A14,S100A1,CHTOP,S100A13,SNAPIN	NA	NA	NA	NA	S100A16	918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.467125450632453
chr1	153670755	153671012	153670885	Y	S100A9,S100A12	SNAPIN,ILF2,NPR1,INTS3	NA	NA	NA	NA	NPR1	21642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.670282238270945
chr1	153671679	153672046	153671861	Y	NA	SNAPIN,ILF2,NPR1,INTS3	NA	NA	NA	NA	NPR1	22566	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.239212888630038
chr1	153704694	153704943	153704839	Y	NA	INTS3,SLC27A3	NA	NA	NA	NA	INTS3	6151	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18278236002221
chr1	153818420	153818667	153818544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC27A3	73590	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	153853385	153853782	153853590	Y	NA	GATAD2B	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	39669	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr1	153936554	153936861	153936642	Y	UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4	GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CREB3L4	1149	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.20225327383981
chr1	154154606	154155027	154154830	Y	SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	10097	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr1	154166147	154166533	154166338	Y	NUP210L,TDRD10,CHRNB2,C1orf189	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	1023	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	154299137	154299452	154299353	Y	UBAP2L,ATP8B2,IL6R	NA	NA	NA	NA	NA	HAX1	56150	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	154380711	154381076	154380883	Y	NA	IL6R	SHE	IMR90	Hi-C	24141950	IL6R	5042	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	154405619	154406249	154405788	Y	UBAP2L,C1orf43,UBAP2L,IL6R,ADAR	IL6R	NA	NA	NA	NA	IL6R	29950	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	154577703	154577929	154577737	Y	NA	UBE2Q1,ADAR	NA	NA	NA	NA	ADAR	20546	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	154579303	154579782	154579555	Y	UBAP2L,IL6R,SHC1,ADAR,ADAR	UBE2Q1,ADAR	NA	NA	NA	NA	ADAR	18693	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	154582047	154582244	154582145	Y	UBAP2L,ATP8B2,PBXIP1,ADAR,ADAR	ADAR	NA	NA	NA	NA	ADAR	16231	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	154587281	154587469	154587375	Y	NA	ADAR	NA	NA	NA	NA	ADAR	11006	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	154699087	154699216	154699140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAR	100612	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	154972628	154972915	154972668	Y	CLK2,DPM3,DPM3,PYGO2,FLAD1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	212	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	154973036	154973200	154973120	Y	CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.216456305825379
chr1	154973335	154973935	154973656	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	208	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.705799446083964
chr1	154977099	154977253	154977190	Y	ADAR,ADAR,ZBTB7B,DCST1	PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	3972	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	154978035	154978657	154978307	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B,DCST1	PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	4908	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	154979104	154979305	154979208	Y	ADAR,ADAR,MTX1,PBXIP1,SHC1,ZBTB7B,DCST1	PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	5977	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	155052572	155053010	155052866	Y	NA	ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1	NA	NA	NA	NA	EFNA3	18348	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	155064132	155064186	155064153	Y	NA	ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3	NA	NA	NA	NA	EFNA3	29908	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	155064813	155064992	155064903	Y	NA	ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3	NA	NA	NA	NA	EFNA3	30589	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	155097183	155097419	155097260	Y	NA	EFNA1,SLC50A1,DPM3,KRTCAP2	NA	NA	NA	NA	EFNA1	517	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.304944552306231
chr1	155098409	155098801	155098460	Y	PKLR,PKLR,EFNA4,EFNA1	EFNA1,SLC50A1,DPM3,KRTCAP2	NA	NA	NA	NA	EFNA1	473	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.174594337773329
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	KRTCAP2,MUC1,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA	NA	NA	NA	NA	MIR92B	1215	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.37902062412534
chr1	155469100	155469412	155469293	Y	MTX1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2	NA	NA	NA	NA	NA	ASH1L-AS1	60409	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	155496665	155497012	155496914	Y	DCST1,HCN3,YY1AP1,ASH1L	ASH1L-AS1,ASH1L	NA	NA	NA	NA	ASH1L-AS1	32809	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	155535083	155535193	155535176	Y	HCN3	ASH1L-AS1,ASH1L	NA	NA	NA	NA	ASH1L	4485	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	155703696	155704096	155703788	Y	NA	DAP3,YY1AP1	NA	NA	NA	NA	YY1AP1	46905	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	155904830	155905033	155904931	Y	NA	RIT1,KIAA0907	NA	NA	NA	NA	KIAA0907	2639	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	155945743	155946196	155946108	Y	C1orf182,ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	RXFP4,KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	28665	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	155946363	155946660	155946476	Y	ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	RXFP4,KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	28201	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.301832247927488
chr1	156073854	156074351	156074085	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	MEX3A,LMNA,SEMA4A	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	23490	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr1	156074715	156075305	156075042	Y	YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	MEX3A,LMNA,SEMA4A	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	24351	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.693996004345678
chr1	156089405	156089622	156089466	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,ARHGEF2,LMNA	MEX3A,LMNA,SEMA4A	NA	NA	NA	NA	SEMA4A	25535	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	156095033	156095181	156095051	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA	MEX3A,LMNA,SEMA4A	NA	NA	NA	NA	SEMA4A	19976	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.793940507003565
chr1	156103413	156103690	156103594	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,LMNA	SEMA4A	NA	NA	NA	NA	SEMA4A	11467	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr1	156134935	156135401	156135063	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2	SEMA4A,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PMF1	NA	NA	NA	NA	SEMA4A	19778	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	156249668	156250061	156249953	Y	NA	BGLAP,PAQR6,SMG5,TMEM79,C1orf85	NA	NA	NA	NA	SMG5	559	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	156405790	156406311	156406022	Y	NA	NA	RHBG,C1orf182,C1orf61,CCT3,TTC24,MEF2D,IQGAP3,BCAN,APOA1BP,GPATCH4,HAPLN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MEF2D	62309	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	156426931	156427503	156427197	Y	ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	41117	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.18660737853242
chr1	156468556	156468776	156468632	Y	MEF2D	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2D	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	156472693	156472952	156472780	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4073	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.83124776369966
chr1	156473111	156473378	156473326	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4491	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.746811113464101
chr1	156474686	156475018	156474923	Y	SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.58622900800912
chr1	156478154	156478558	156478328	Y	NA	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	9534	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	156480721	156480806	156480764	Y	NA	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	12101	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146379073469414
chr1	156629760	156630406	156629967	Y	PAQR6,PAQR6,C1orf182,CCT3,ISG20L2,GPATCH4,HAPLN2	RP11-284F21.7,NES,CRABP2	NA	NA	NA	NA	RP11-284F21.7	544	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.923368864728826
chr1	156634807	156635020	156634939	Y	NES	RP11-284F21.7,NES,CRABP2	NA	NA	NA	NA	RP11-284F21.7	5591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	156718467	156719136	156718868	Y	C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	65	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr1	156719450	156719815	156719708	Y	ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	1048	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	156774360	156774606	156774510	Y	C1orf61	HDGF,SH2D2A	NA	NA	NA	NA	SH2D2A	10048	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	157030350	157030742	157030546	Y	NA	ARHGEF11,KRT8P45	NA	NA	NA	NA	KRT8P45	10307	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	157106691	157107326	157106962	Y	RRNAD1,ETV3,ETV3	ETV3	NA	NA	NA	NA	ETV3	425	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	157964633	157965029	157964831	Y	OR10T2	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	3570	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr1	157966753	157967127	157966789	Y	NA	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	5690	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	157989414	157989935	157989469	Y	KIRREL	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	28351	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	158119500	158119689	158119553	Y	NA	ELL2P1	LOC646268,KIRREL,AIM2	IMR90	Hi-C	24141950	ELL2P1	25856	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr1	158146699	158147069	158146946	Y	NA	ELL2P1	NA	NA	NA	NA	ELL2P1	1154	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.580177763859949
chr1	158147244	158147839	158147743	Y	NA	ELL2P1	NA	NA	NA	NA	ELL2P1	1699	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	158970513	158970716	158970581	Y	AIM2,IFI16	IFI16	NA	NA	NA	NA	IFI16	2755	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	158983439	158983572	158983497	Y	NA	IFI16	NA	NA	NA	NA	IFI16	15681	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	158994687	158995148	158994758	Y	OR6P1,OR10X1,OR10Z1,OR6K3,OR6N1,OR6N2,MNDA,IFI16,FCER1A	IFI16	NA	NA	NA	NA	IFI16	26929	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	159142876	159143043	159143018	Y	OR10J5,OR6K3,OR6N1,OR6N2,FCER1A,CADM3,CADM3,DARC	NA	NA	NA	NA	NA	IFI16	175118	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	159829428	159829783	159829606	Y	OR10J5,KCNJ9	C1orf204,CCDC19	NA	NA	NA	NA	C1orf204	6291	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr1	159851477	159851987	159851825	Y	SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2	C1orf204,CCDC19,TAGLN2	NA	NA	NA	NA	CCDC19	15966	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.535933640619523
chr1	159852272	159852569	159852526	Y	SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2	C1orf204,CCDC19,TAGLN2	NA	NA	NA	NA	CCDC19	15384	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.164024160336071
chr1	159859603	159860031	159859945	Y	SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2	C1orf204,CCDC19,TAGLN2	C1orf204,SLAMF8	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC19	7922	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.334620114990879
chr1	159880076	159880706	159880437	Y	FCRL6,DCAF8,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2	NA	NA	NA	NA	CCDC19	12123	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	159887185	159887340	159887284	Y	NA	CCDC19,TAGLN2	NA	NA	NA	NA	TAGLN2	6182	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	159892447	159892988	159892803	Y	NCSTN,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2	NA	NA	NA	NA	TAGLN2	534	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	160182240	160182579	160182410	Y	NA	PEA15,RP11-574F21.2	NA	NA	NA	NA	PEA15	9113	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	160203977	160204039	160204035	Y	NA	PEA15,RP11-574F21.2,DCAF8	NA	NA	NA	NA	RP11-574F21.2	25495	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	160230168	160230604	160230300	Y	NA	RP11-574F21.2,DCAF8,PEX19	NA	NA	NA	NA	RP11-574F21.2	634	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	160332348	160332525	160332392	Y	SLAMF7,IGSF9,NHLH1,VANGL2	SUMO1P3,NCSTN,COPA,NHLH1	NA	NA	NA	NA	NHLH1	2332	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr1	160345693	160345986	160345917	Y	NA	NCSTN,COPA,NHLH1	NA	NA	NA	NA	NHLH1	10836	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	160639828	160639998	160639908	Y	NA	SLAMF1,CD48	NA	NA	NA	NA	SLAMF1	24743	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.299102907177861
chr1	160696081	160696317	160696161	Y	CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7	CD48,SLAMF7	NA	NA	NA	NA	SLAMF7	10720	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	160972513	160972848	160972620	Y	SLAMF7,USF1,ARHGAP30	F11R,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	16290	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	160982920	160983992	160983766	Y	CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30	F11R,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	5146	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	161329163	161329482	161329254	Y	FCRLB,ATF6,CD244,FCER1G	SDHC	NA	NA	NA	NA	SDHC	47116	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	NA	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	77619	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.809203438681846
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	NA	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	87026	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.1547766947391
chr1	161582212	161582506	161582417	Y	HSPA6,FCGR3A	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP12	135042	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104864290978615
chr1	161847357	161847565	161847361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF6	113273	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	162539981	162540420	162539994	Y	C1orf226,UHMK1,HSD17B7,UAP1	UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	10658	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	162659800	162660152	162659976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDR2	60637	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	162666168	162666338	162666209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDR2	67005	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.145265960649932
chr1	162954567	162954830	162954669	Y	RGS4,RGS4,RGS4,RGS4	NA	RGS4,RGS5,C1orf110	IMR90	Hi-C	24141950	NUF2	279536	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	164580985	164581415	164581219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	58164	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr1	164717528	164717907	164717706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	194707	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.855446753481531
chr1	164734934	164735098	164735029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	212113	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	165797615	165798367	165798308	Y	UCK2	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	2623	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.221184838134266
chr1	165823413	165823808	165823568	Y	NA	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	28421	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	166828089	166828463	166828188	Y	POU2F1,POGK	POGK,TADA1	NA	NA	NA	NA	TADA1	15101	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	167191021	167191933	167191618	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	2955	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.08085700881402
chr1	167416859	167417570	167417161	Y	POU2F1,RCSD1,CD247	NA	NA	NA	NA	NA	CREG1	103434	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	167683554	167683813	167683605	Y	POU2F1,CREG1	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	4616	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.1996972976985
chr1	167730247	167730494	167730371	Y	NA	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	41818	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	168149052	168149361	168149233	Y	NA	GPR161,TIPRL,RPL34P1,SFT2D2	NA	NA	NA	NA	TIPRL	2881	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.185511700771837
chr1	168338134	168338331	168338175	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	89856	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	168446219	168446589	168446402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XCL1	97122	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	169443033	169443373	169443298	Y	NA	SLC19A2,AL021068.1	NA	NA	NA	NA	SLC19A2	9868	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	169452813	169453010	169452905	Y	NA	SLC19A2,AL021068.1	NA	NA	NA	NA	SLC19A2	231	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	169464285	169464545	169464529	Y	BLZF1,SLC19A2	SLC19A2,AL021068.1	NA	NA	NA	NA	AL021068.1	10905	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	169834996	169835276	169835168	Y	NA	SCYL3	NA	NA	NA	NA	SCYL3	26132	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr1	170042588	170042670	170042627	Y	C1orf112	KIFAP3	NA	NA	NA	NA	KIFAP3	9679	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	171473011	171473311	171473138	Y	NA	PRRC2C	NA	NA	NA	NA	PRRC2C	20360	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr1	171652961	171653360	171653094	Y	NA	PFN1P1	NA	NA	NA	NA	PFN1P1	14882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	171712214	171712716	171712399	Y	FMO4,PRRC2C	VAMP4,METTL13	NA	NA	NA	NA	VAMP4	2827	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	172291507	172291926	172291559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	119304	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	172327558	172328156	172327708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	83074	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.232485164761891
chr1	172418117	172418641	172418353	Y	NA	PIGC	NA	NA	NA	NA	PIGC	6887	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	172466564	172466703	172466653	Y	NA	NA	DNM3,DARS2,CENPL,C1orf9,C1orf105,FASLG	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIGC	55334	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	172900674	172900969	172900756	Y	TNFSF18	NA	TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,DARS2,CENPL,ZBTB37,GAS5	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	117134	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	172972573	172972790	172972603	Y	PRDX6	TNFSF18	NA	NA	NA	NA	TNFSF18	45313	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	173091914	173092434	173092232	Y	NA	NA	TNFSF4,LOC100506023	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	73811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	173328578	173328674	173328661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	115731	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	173382392	173382663	173382522	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	61742	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	173398914	173399297	173399234	Y	NA	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	45108	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr1	173447359	173447668	173447399	Y	PRDX6	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	2954	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.271444427456
chr1	173909740	173909938	173909924	Y	RC3H1,ZBTB37	NA	NA	NA	NA	NA	GAS5	73720	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr1	173958715	173958784	173958750	Y	NA	RC3H1,RP11-160H22.3	NA	NA	NA	NA	RC3H1	30651	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	173984193	173984403	173984298	Y	GPR52,ZBTB37,RC3H1	RC3H1,RP11-160H22.3	NA	NA	NA	NA	RC3H1	5032	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	174132741	174133010	174132876	Y	NA	RABGAP1L	NA	NA	NA	NA	RABGAP1L	6193	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	174937322	174937525	174937409	Y	KIAA0040,KIAA0040	CACYBP	NA	NA	NA	NA	CACYBP	28775	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	174974831	174975127	174974979	Y	NA	CACYBP,MRPS14	NA	NA	NA	NA	CACYBP	8531	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	175145439	175145838	175145619	Y	KIAA0040,KIAA0040	KIAA0040	NA	NA	NA	NA	KIAA0040	14297	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	176079011	176079503	176079162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFWD2	95126	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	176601179	176601401	176601333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-195C7.1	426395	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	177131482	177131884	177131596	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-568K15.1	873201	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	177151173	177151362	177151277	Y	ASTN1,FAM5B	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-568K15.1	853723	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	178298668	178299096	178298877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf220	210791	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	178378072	178378430	178378251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf220	131457	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	178995927	178996290	178996175	Y	AXDND1,RALGPS2,TOR3A	FAM20B	NA	NA	NA	NA	FAM20B	2988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr1	179098871	179099008	179098957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	50359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	179110934	179111289	179111201	Y	AXDND1,SOAT1,TOR3A,ABL2	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	62422	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	179115539	179115872	179115703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	67027	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	179144823	179145001	179144950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABL2	51818	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	179153644	179153909	179153868	Y	NA	ABL2	NA	NA	NA	NA	ABL2	42910	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	179290775	179290979	179290800	Y	NA	SOAT1	NA	NA	NA	NA	SOAT1	29850	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	179296885	179297079	179297006	Y	AXDND1,TOR3A,ABL2,SOAT1	SOAT1	NA	NA	NA	NA	SOAT1	35960	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	180200315	180200683	180200497	Y	LHX4	LHX4	NA	NA	NA	NA	LHX4	2894	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	180200686	180200867	180200752	Y	NA	LHX4	NA	NA	NA	NA	LHX4	3265	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	180237101	180237317	180237140	Y	NA	LHX4	NA	NA	NA	NA	LHX4	39680	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	180249791	180250006	180249913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHX4	52370	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr1	180250812	180250948	180250921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHX4	53391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	180371123	180371295	180371283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD6	98794	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	180403880	180403893	180403887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD6	66196	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	180921044	180921090	180921069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX6	68957	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr1	181074349	181074924	181074645	Y	XPR1,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	18711	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	181081690	181081905	181081806	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	26052	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	181082184	181082367	181082268	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	26546	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	181096103	181096331	181096188	Y	NA	IER5	KIAA1614,IER5,STX6	IMR90	Hi-C	24141950	IER5	40465	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr1	181104473	181105818	181105427	Y	STX6,MR1,IER5	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48835	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	181122099	181122260	181122227	Y	NA	NA	STX6,KIAA1614,MR1,XPR1,ACBD6,IER5	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	66461	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	181998739	181999134	181998891	Y	GLUL,GLUL	NA	ZNF648	MCF7	ChIA-PET	22265404	GLUL	360207	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	182228543	182228906	182228715	Y	RNASEL,GLUL,GLUL	NA	GLUL	K562	ChIA-PET	22265404	GLUL	130435	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	182585205	182585710	182585424	Y	NA	RNASEL,RGS16	NA	NA	NA	NA	RGS16	13662	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.148378265028675
chr1	182854499	182854851	182854644	Y	NA	DHX9	NA	NA	NA	NA	DHX9	47995	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	183178797	183178927	183178861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAMC1	188202	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	183239968	183240242	183240112	Y	LAMC1	NA	LAMC2	IMR90	Hi-C	24141950	SMG7	199109	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	183241451	183241867	183241650	Y	LAMC1	NA	LAMC2	IMR90	Hi-C	24141950	SMG7	197484	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	183248987	183249454	183249212	Y	NCF2,NCF2,ARPC5,LAMC1	NA	NA	NA	NA	NA	SMG7	189897	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr1	183578502	183578873	183578650	Y	NCF2,NCF2,ARPC5	NCF2,ARPC5	NA	NA	NA	NA	NCF2	20491	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	183579279	183579568	183579440	Y	NA	NCF2,ARPC5	NA	NA	NA	NA	NCF2	21268	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	183594812	183595033	183594923	Y	NA	NCF2,ARPC5	NA	NA	NA	NA	ARPC5	7859	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr1	183743084	183743343	183743214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARPC5	140192	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	183836661	183836955	183836765	Y	RGL1,GLT25D2	NA	NA	NA	NA	NA	TSEN15	181856	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	184033703	184034036	184033838	Y	NA	TSEN15	NA	NA	NA	NA	TSEN15	14892	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr1	184700299	184700688	184700567	Y	NA	EDEM3	NA	NA	NA	NA	EDEM3	21359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	184810330	184810429	184810414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	88283	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	185109809	185110137	185110116	Y	IVNS1ABP	TRMT1L,SWT1	NA	NA	NA	NA	TRMT1L	14067	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	185129185	185129369	185129253	Y	NA	TRMT1L,SWT1	NA	NA	NA	NA	SWT1	4973	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	185264835	185265233	185265202	Y	NA	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	19228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	185298342	185298619	185298496	Y	FAM129A,RNF2,TRMT1L,SWT1,TRMT1L,SWT1,IVNS1ABP	IVNS1ABP	IVNS1ABP	MCF7	ChIA-PET	22265404	IVNS1ABP	13881	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	185615541	185615870	185615591	Y	NA	NA	SWT1,LOC100288079,IVNS1ABP	IMR90	Hi-C	24141950	HMCN1	85813	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	186587444	186588060	186587743	Y	PTGS2,PLA2G4A,C1orf27	NA	PLA2G4A	IMR90	Hi-C	24141950	PTGS2	59499	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr1	186612873	186613046	186612917	Y	PTGS2,PLA2G4A	PTGS2	NA	NA	NA	NA	PTGS2	34513	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	186799738	186800031	186799804	Y	PTGS2,PLA2G4A	PLA2G4A	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	3653	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr1	186818021	186818219	186818132	Y	PTGS2,PLA2G4A	PLA2G4A	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	21936	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	186851648	186851759	186851704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	55563	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	186892657	186892915	186892791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	96572	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	186935248	186935528	186935344	Y	PTGS2,PLA2G4A	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	139163	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr1	186936898	186937303	186937025	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	140813	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	186970666	186971051	186970863	Y	PTGS2,PLA2G4A	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	174581	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	186975833	186976078	186975958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	179748	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	192216449	192216576	192216513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS1	326281	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	192446152	192446393	192446247	Y	RGS2,RGS1	NA	UCHL5,RGS1,RGS13,RGS2,TROVE2,GLRX2	IMR90	Hi-C	24141950	RGS1	96464	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	192485848	192486563	192486155	Y	RGS2,RGS1	NA	RGS1	IMR90	Hi-C	24141950	RGS1	56294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	192521878	192522349	192522267	Y	RGS1	RGS1	RGS1	IMR90	Hi-C	24141950	RGS1	20508	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	192578246	192578789	192578443	Y	TROVE2,TROVE2,RGS1,RGS2	RGS1	UCHL5	IMR90	Hi-C	24141950	RGS1	35389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	192776947	192777226	192777096	Y	TROVE2,TROVE2,CDC73,RGS1,RGS2	RGS2	NA	NA	NA	NA	RGS2	778	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	192915458	192915787	192915575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP126	72343	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	192924608	192924823	192924716	Y	NA	NA	RGS2	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP126	81493	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	193073509	193073815	193073644	Y	NA	TROVE2,UCHL5,GLRX2,CDC73	NA	NA	NA	NA	GLRX2	265	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr1	193080839	193080969	193080896	Y	NA	GLRX2,CDC73	NA	NA	NA	NA	GLRX2	7595	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.349188675546657
chr1	193583968	193584211	193584008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC73	494821	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	193726401	193726456	193726429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC73	637254	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	196376822	196377173	196376907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFH	241835	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	196378121	196378217	196378169	Y	CFHR3,KCNT2	NA	NA	NA	NA	NA	CFH	240791	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	196379497	196379989	196379846	Y	CFHR3,KCNT2,CFH	NA	NA	NA	NA	NA	CFH	239019	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	196687933	196688159	196688046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFH	68925	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	197747792	197747875	197747834	Y	NA	DENND1B	NA	NA	NA	NA	DENND1B	4966	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	197908297	197908430	197908355	Y	NA	C1orf53,LHX9	NA	NA	NA	NA	LHX9	29260	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr1	198087299	198087585	198087454	Y	NEK7	NEK7	PTPRC,NEK7,C1orf53,LHX9	IMR90	Hi-C	24141950	NEK7	36508	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr1	198090244	198090551	198090353	Y	NA	NEK7	PTPRC,NEK7,C1orf53,LHX9	IMR90	Hi-C	24141950	NEK7	33542	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.241942229379666
chr1	198124316	198124670	198124458	Y	C1orf53,NEK7	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	223	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.767688656191047
chr1	198127475	198127965	198127580	Y	NA	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	3382	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	198128112	198128944	198128293	Y	PTPRC,DENND1B	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	4019	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.11576421891822
chr1	198237796	198237952	198237874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	113703	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	198625518	198626374	198625745	Y	PTPRC	PTPRC	NA	NA	NA	NA	PTPRC	19717	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr1	198650930	198651643	198651116	Y	PTPRC	PTPRC	NA	NA	NA	NA	PTPRC	45129	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.606046651043352
chr1	198744833	198745259	198744926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRC	139032	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	198903935	198904934	198904858	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	MIR181A1HG	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	199711776	199712042	199711895	Y	NA	NA	NR5A2,C1orf98	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-104D3.2	357507	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	200379777	200379959	200379899	Y	NA	ZNF281	NA	NA	NA	NA	ZNF281	2593	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	200622357	200622464	200622411	Y	NA	KIF14,DDX59	NA	NA	NA	NA	DDX59	14633	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	200715755	200716027	200715890	Y	NA	CAMSAP2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP2	9069	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	200783735	200784105	200783920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMSAP2	77049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	200865457	200866265	200866098	Y	TMEM9,IGFN1,C1orf106,C1orf106	NA	NA	NA	NA	NA	KIF21B	124563	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	200990087	200990628	200990489	Y	NA	KIF21B	NA	NA	NA	NA	KIF21B	200	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	201139670	201140154	201139905	Y	NA	TMEM9,IGFN1	KIF21B,IGFN1,LAD1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM9	968	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.240326001449521
chr1	201236006	201236165	201236054	Y	LAD1,C1orf106,PKP1	NA	NA	NA	NA	NA	IGFN1	78053	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.202809602077243
chr1	201244405	201244769	201244526	Y	PKP1	NA	PKP1,TMEM9,LAD1,TNNI1,IGFN1,TNNT2	IMR90	Hi-C	24141950	IGFN1	86452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.281457820311205
chr1	201246115	201246382	201246194	Y	PKP1	NA	PKP1,TMEM9,LAD1,TNNI1,IGFN1,TNNT2	IMR90	Hi-C	24141950	IGFN1	88162	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	201277004	201277220	201277102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNNT2	67670	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208998432766864
chr1	201277329	201277484	201277406	Y	PKP1	NA	NA	NA	NA	NA	TNNT2	67406	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	201280694	201280963	201280829	Y	LAD1,C1orf106,PKP1	NA	NA	NA	NA	NA	TNNT2	63927	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	201295169	201295564	201295367	Y	PKP1	TNNT2	NA	NA	NA	NA	TNNT2	49326	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	201431088	201431253	201431176	Y	NA	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	PHLDA3	5112	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr1	201449602	201449822	201449716	Y	LAD1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	PHLDA3	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA3	13237	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20553894282687
chr1	201463619	201463933	201463776	Y	LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	RP11-134G8.7	10436	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	201472589	201472996	201472808	Y	LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	RP11-134G8.7	1373	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr1	201508517	201509575	201509484	Y	NA	RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	CSRP1	31933	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	201613549	201613726	201613638	Y	NA	NA	NAV1,CSRP1,RPS10P7,IPO9	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CSRP1	136965	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	201619383	201619798	201619705	Y	SHISA4,GPR37L1,NAV1	NA	NA	NA	NA	NA	CSRP1	142799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	201682596	201682901	201682784	Y	ARL8A	NA	NA	NA	NA	NA	IPO9	113368	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.254128634747068
chr1	201683757	201684240	201683949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPO9	112029	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.399238665847589
chr1	201717535	201717792	201717621	Y	NA	NA	IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	IPO9	78477	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	201768733	201769083	201768901	Y	NA	IPO9,IPO9-AS1	IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	IPO9	27186	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	201987611	201988279	201987793	Y	ELF3,LGR6	RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	10130	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20553894282687
chr1	201992149	201992501	201992334	Y	NA	RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	14668	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr1	202003479	202003610	202003599	Y	NA	ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	25998	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	202003884	202004146	202004054	Y	NA	ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	26403	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr1	202027341	202027750	202027511	Y	NA	RP11-465N4.4	RNPEP,ELF3,NAV1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-465N4.4	49860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.171482033394586
chr1	202075010	202075191	202075097	Y	PPP1R12B,ELF3,LGR6	ARL8A	RNPEP,LGR6,NAV1,ELF3,ARL8A,GPR37L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARL8A	36678	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.96649987514977
chr1	202077636	202077876	202077756	Y	ELF3,LGR6	ARL8A	NAV1,ARL8A,GPR37L1	MCF7	ChIA-PET	22265404	ARL8A	33993	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	202249421	202249522	202249480	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2T	59586	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	202737599	202737762	202737681	Y	NA	RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6	NA	NA	NA	NA	RP11-480I12.2	3053	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	202872285	202872308	202872297	Y	NA	RP11-480I12.5,RABIF,HNRNPA1P59,KLHL12	RABIF	MCF7	ChIA-PET	22265404	HNRNPA1P59	6632	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	203247243	203247485	203247301	Y	RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2	LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	LINC01136	24952	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	203296328	203297068	203296686	Y	LAX1,RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2	LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	23709	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.411425071214991
chr1	203297101	203297334	203297256	Y	LAX1,TMEM183A,TMEM183B,BTG2	LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	24482	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.1996972976985
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	111155	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.80835405069918
chr1	203489584	203489741	203489635	Y	BTG2	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	103948	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	203491011	203491485	203491466	Y	PPFIA4,SNRPE	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	102204	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr1	203506114	203506504	203506389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	87185	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.198081069768355
chr1	203561987	203562359	203562082	Y	BTG2,ZC3H11A	ATP2B4	ATP2B4,OPTC,PRELP,FMOD,LAX1	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B4	31330	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	203598711	203598999	203598777	Y	BTG2	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	5022	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	203624863	203625211	203625050	Y	BTG2	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	31174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr1	203789427	203789442	203789436	Y	NA	ZC3H11A,SNRPE	NA	NA	NA	NA	ZC3H11A	26645	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	203794311	203794511	203794411	Y	NA	ZC3H11A,SNRPE	NA	NA	NA	NA	ZC3H11A	31529	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	203869829	203870180	203870005	Y	ETNK2	SNRPE,HSPE1P6	SNRPE,REN,LINC00303,SOX13,ETNK2,PLEKHA6,LOC127841,PPP1R15B,GOLT1A	IMR90	Hi-C	24141950	HSPE1P6	967	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr1	204043987	204044379	204044133	Y	NA	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	3744	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	204044571	204044810	204044641	Y	NA	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	4328	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr1	204049581	204049822	204049645	Y	LAX1,PIK3C2B,SOX13	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	9338	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	204053773	204053963	204053834	Y	NA	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	13530	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	204073791	204074252	204073934	Y	LAX1,PPP1R15B,SOX13	SOX13,ETNK2	NA	NA	NA	NA	SOX13	33548	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	204098794	204099127	204098964	Y	NA	ETNK2	NA	NA	NA	NA	ETNK2	20180	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	204238647	204239007	204238820	Y	GOLT1A,PLEKHA6	NA	NA	NA	NA	NA	ETNK2	119340	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	204255998	204256379	204256352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	122540	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	204289566	204289863	204289752	Y	SOX13,PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	89056	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr1	204317952	204318184	204318134	Y	ETNK2,PIK3C2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	60735	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	204349568	204349875	204349782	Y	NA	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	29044	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	204358316	204358342	204358328	Y	NA	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	20577	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210997624326124
chr1	204363456	204363666	204363499	Y	NA	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	15253	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr1	204386444	204387188	204386898	Y	PPP1R15B	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	7525	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.4362170799914
chr1	204387566	204387645	204387629	Y	PPP1R15B	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	8647	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	204388302	204388627	204388415	Y	NA	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	9383	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.16711902965591
chr1	204395183	204395520	204395303	Y	NA	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	16264	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	204422279	204422591	204422449	Y	NA	PPP1R15B,PIK3C2B	NA	NA	NA	NA	PIK3C2B	39261	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	204430759	204431008	204430941	Y	SOX13,PIK3C2B	PIK3C2B	NA	NA	NA	NA	PIK3C2B	30844	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	204476628	204477018	204476840	Y	NA	PIK3C2B,MDM4	MDM4,PPP1R15B,PIK3C2B	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	MDM4	6493	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	204531285	204531644	204531490	Y	MDM4	MDM4	NA	NA	NA	NA	MDM4	47774	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	204800476	204800571	204800524	Y	PLEKHA6,PIK3C2B,LRRN2,TMCC2,NFASC,CNTN2,NFASC	NA	NA	NA	NA	NA	CNTN2	209754	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	205090261	205090406	205090392	Y	NA	RBBP5	CNTN2	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP5	1118	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	205173095	205173476	205173227	Y	CNTN2,RBBP5,CDK18	DSTYK,TMCC2	NA	NA	NA	NA	DSTYK	5251	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	205179753	205180065	205179802	Y	NA	DSTYK,TMCC2	NA	NA	NA	NA	DSTYK	1026	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	205253892	205254222	205253971	Y	NUAK2	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	34661	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	205263599	205264019	205263855	Y	NA	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	24864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.304944552306231
chr1	205267691	205267999	205267801	Y	NA	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	20884	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr1	205270500	205270865	205270692	Y	NA	NUAK2,SNRPGP10	NA	NA	NA	NA	NUAK2	18018	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	205283024	205283394	205283339	Y	RBBP5,NUAK2	NUAK2,SNRPGP10	NA	NA	NA	NA	NUAK2	5489	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	205288770	205288915	205288818	Y	TMEM81,RBBP5,NUAK2	SNRPGP10	NA	NA	NA	NA	NUAK2	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.198081069768355
chr1	205410224	205410578	205410325	Y	DSTYK,TMCC2	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	12504	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	205475126	205475451	205475289	Y	NA	CDK18	NA	NA	NA	NA	CDK18	3403	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	205512470	205512827	205512691	Y	NA	CDK18,RNU2-19P	NA	NA	NA	NA	RNU2-19P	21017	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr1	205709805	205710150	205710085	Y	NA	NUCKS1,RAB7L1	NA	NA	NA	NA	NUCKS1	7254	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	206642854	206643037	206642964	Y	RASSF5,MAPKAPK2,RASSF5,IKBKE	IKBKE,RASSF5	NA	NA	NA	NA	IKBKE	1063	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	206645493	206645691	206645553	Y	RASSF5,MAPKAPK2,IKBKE,RASSF5	IKBKE,RASSF5	NA	NA	NA	NA	IKBKE	3702	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	206688246	206688461	206688320	Y	RASSF5,MAPKAPK2,RASSF5	IKBKE,RASSF5,RP11-534L20.4	NA	NA	NA	NA	RASSF5	9367	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.366833762413314
chr1	206736469	206736632	206736474	Y	NA	RP11-534L20.4,EIF2D	NA	NA	NA	NA	RP11-534L20.4	36221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	206751685	206751882	206751743	Y	IKBKE,RASSF5,IL19,MAPKAPK2,FAIM3,FAIM3,RASSF5	EIF2D	NA	NA	NA	NA	EIF2D	32022	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	206859136	206859493	206859328	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	2847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	206859748	206860259	206859963	Y	IKBKE,RASSF5,FAIM3,FAIM3,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	3459	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr1	206861410	206861458	206861434	Y	NA	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	5121	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	206892674	206892943	206892811	Y	NA	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	36385	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	206897147	206897463	206897235	Y	RASSF5,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	40858	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.322589639172887
chr1	206916099	206916418	206916260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	59810	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	207063537	207063710	207063660	Y	RASSF5,DYRK3,MAPKAPK2,CD55,IL24	IL20,IL24,RP11-564A8.4,FAIM3	NA	NA	NA	NA	IL24	5078	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr1	207064076	207064429	207064213	Y	NA	IL20,IL24,RP11-564A8.4,FAIM3	NA	NA	NA	NA	IL24	4359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.229025674821897
chr1	207064869	207064994	207064935	Y	NA	IL20,IL24,RP11-564A8.4,FAIM3	NA	NA	NA	NA	IL24	3794	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	207069223	207069337	207069332	Y	NA	IL20,IL24,RP11-564A8.4,FAIM3	NA	NA	NA	NA	IL24	435	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr1	207079196	207079569	207079501	Y	NA	IL20,IL24,RP11-564A8.4,FAIM3	NA	NA	NA	NA	RP11-564A8.4	232	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	207265739	207265906	207265769	Y	NA	PFKFB2,YOD1,C4BPB,C4BPA	NA	NA	NA	NA	C4BPB	5552	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.867130043738272
chr1	207413364	207413503	207413411	Y	IL19,CD55	NA	CD55	MCF7	ChIA-PET	22265404	CD55	79350	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.301102098737121
chr1	207414217	207414394	207414309	Y	CD55	NA	CD55	MCF7	ChIA-PET	22265404	CD55	78459	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.14092039197016
chr1	207489914	207490291	207489981	Y	CR1,CD46,CD55	CD55	CD55,YOD1,PFKFB2,CR2,CR1	IMR90	Hi-C	24141950	CD55	2562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.411808034844107
chr1	207509006	207509478	207509176	Y	CR1,CD46,CD55	CD55	NA	NA	NA	NA	CD55	16153	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr1	207585605	207585767	207585684	Y	CR2	CR2	C4BPA,PFKFB2,C4BPB	IMR90	Hi-C	24141950	CR2	39808	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	207589572	207589691	207589631	Y	NA	CR2	PFKFB2,C4BPA,C4BPB	IMR90	Hi-C	24141950	CR2	35884	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	207921430	207921703	207921565	Y	CR1L	CD46	CR1L	IMR90	Hi-C	24141950	CD46	1699	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	208028503	208028730	208028615	Y	NA	C1orf132	NA	NA	NA	NA	C1orf132	11765	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	208029774	208030104	208029939	Y	NA	C1orf132	NA	NA	NA	NA	C1orf132	10391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	208136912	208137268	208137107	Y	NA	NA	CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf132	96417	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr1	208357514	208358085	208357775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	57580	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	208381145	208381344	208381321	Y	NA	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	34321	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	208388887	208389573	208389450	Y	NA	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	26092	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr1	208412497	208412696	208412591	Y	PLXNA2	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	2969	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	208415648	208415868	208415811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	208418631	208418859	208418806	Y	PLXNA2	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	2966	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	209571959	209572357	209572220	Y	LAMB3	NA	MIR205HG	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATP5G2P1	132391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	209578512	209578819	209578654	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,HSD11B1,LOC642587	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P1	138944	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	209590107	209590333	209590233	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	NA	MIR205HG	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5G2P1	150539	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	209798058	209798744	209798639	Y	NA	LAMB3	NA	NA	NA	NA	LAMB3	25067	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	209806744	209806957	209806914	Y	G0S2,LAMB3	LAMB3	NA	NA	NA	NA	LAMB3	16854	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	209820544	209820823	209820626	Y	G0S2,LAMB3	LAMB3	CAMK1G	IMR90	Hi-C	24141950	LAMB3	2988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	209822403	209823008	209822758	Y	TRAF3IP3,G0S2,LAMB3	LAMB3	CAMK1G	IMR90	Hi-C	24141950	LAMB3	803	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	209844059	209844533	209844246	Y	NA	LAMB3	CAMK1G,HSD11B1	IMR90	Hi-C	24141950	LAMB3	20248	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	210425971	210426288	210426079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU5A-8P	119323	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	211035320	211035533	211035504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-543B16.1	309286	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.312402425364746
chr1	211500826	211501119	211501083	Y	TRAF5,TRAF5	TRAF5	NA	NA	NA	NA	TRAF5	2869	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	211590216	211590571	211590445	Y	NA	LINC00467	NA	NA	NA	NA	LINC00467	36071	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	211688648	211688771	211688711	Y	NA	NA	NEK2,RCOR3,TRAF5,LINC00467,RD3,SLC30A1,INTS7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC30A1	61313	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.346076371167914
chr1	211753366	211753524	211753445	Y	TRAF5	SLC30A1	NA	NA	NA	NA	SLC30A1	3282	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	211754949	211755173	211755061	Y	NA	SLC30A1	NA	NA	NA	NA	SLC30A1	4865	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	211786767	211786829	211786805	Y	NA	SLC30A1,RP11-354K1.1	SLC30A1,NEK2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-354K1.1	24208	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.120163000724761
chr1	211823764	211823781	211823773	Y	NA	RP11-354K1.1,NEK2,RP11-122M14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-354K1.1	12727	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	211837893	211837920	211837910	Y	NA	RP11-354K1.1,NEK2,RP11-122M14.1	NA	NA	NA	NA	NEK2	9040	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr1	211950086	211950249	211950170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	51865	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	211988342	211989080	211989063	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,LPGAT1	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	13034	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	212102475	212102639	212102508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	100361	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.369563103162941
chr1	212113260	212113497	212113379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTS7	93387	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	212256975	212257253	212257095	Y	DTL,INTS7	RPL21P28	NA	NA	NA	NA	RPL21P28	33604	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr1	212261904	212262125	212262011	Y	PPP2R5A	RPL21P28	NA	NA	NA	NA	RPL21P28	38533	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	212291571	212291809	212291658	Y	PPP2R5A	NA	NA	NA	NA	NA	RPL21P28	68200	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	212311960	212312104	212312056	Y	PPP2R5A	NA	PPP2R5A,NENF,DTL,TMEM206	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL21P28	88589	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr1	212458080	212458253	212458113	Y	INTS7,PPP2R5A,PPP2R5A	PPP2R5A,RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	PPP2R5A	1201	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr1	212484976	212485048	212485012	Y	NA	PPP2R5A,RP11-384C4.3	TMEM206	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-384C4.3	4116	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	212513330	212513719	212513465	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,TMEM206,TMEM206	RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	RP11-384C4.3	32470	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	212661846	212662402	212662104	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NA	ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	57617	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.561802527802926
chr1	212769584	212769966	212769788	Y	ANGEL2,PPP2R5A,ATF3,ATF3,ATF3	ATF3	NA	NA	NA	NA	ATF3	32908	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	214512112	214512120	214512117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD2	59667	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	214614555	214614760	214614639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	109032	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	214620076	214620672	214620502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	103120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	215691115	215691317	215691220	Y	NA	KCTD3	KCNK2,CENPF,SMYD2,PTPN14	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD3	47418	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	215741534	215741966	215741880	Y	KCTD3	KCTD3	NA	NA	NA	NA	KCTD3	2799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.135808896032157
chr1	216774004	216774285	216774188	Y	ESRRG,ESRRG	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	1028139	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr1	218375582	218375888	218375735	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRP15	80741	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	218654144	218654396	218654237	Y	NA	NA	TGFB2,LOC728463,LOC643723	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TGFB2	136567	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	218758903	218759111	218758977	Y	NA	NA	TGFB2	IMR90	Hi-C	24141950	TGFB2	241326	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	219262446	219262621	219262479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPLAL1	82565	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	219955751	219955972	219955860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPRS	262028	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	220189685	220189943	220189814	Y	NA	EPRS	NA	NA	NA	NA	EPRS	28057	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	220393912	220394294	220394186	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	30618	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	220399770	220399931	220399853	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	24981	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	220427006	220427444	220427299	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	2094	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192969573830352
chr1	220671702	220671851	220671777	Y	MARK1	MARK1	MARK1	IMR90	Hi-C	24141950	MARK1	27717	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	221048646	221048850	221048821	Y	NA	HLX	NA	NA	NA	NA	HLX	849	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	221209079	221209530	221209425	Y	HLX	NA	NA	NA	NA	NA	HLX	159380	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr1	221482496	221482661	221482579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP10	430857	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	221567491	221567844	221567649	Y	NA	NA	C1orf140,HLX	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	345674	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.320973411242743
chr1	221612801	221613016	221612980	Y	DUSP10,DUSP10	NA	C1orf140,HLX,MIA3	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	300502	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	221613404	221613745	221613476	Y	NA	NA	C1orf140,HLX,MIA3	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	299773	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	221614030	221614267	221614237	Y	DUSP10	NA	C1orf140,HLX,MIA3	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	299251	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	221882292	221882723	221882499	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	30795	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	221913881	221914483	221914426	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	363	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	2531	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.738396057135515
chr1	222142763	222142919	222142838	Y	NA	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	229245	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	222144602	222144957	222144787	Y	NA	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	231084	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	222164724	222164904	222164771	Y	DUSP10	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	251206	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	222461432	222461724	222461569	Y	NA	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	HHIPL2	257721	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	222638782	222639204	222638963	Y	NA	NA	DUSP10,MIA3,AIDA,BROX	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HHIPL2	80241	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr1	222814663	222814910	222814786	Y	NA	MIA3	NA	NA	NA	NA	MIA3	25235	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	223901276	223901546	223901311	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	13981	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	223903033	223903347	223903117	Y	TP53BP2,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	15738	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	223914239	223914747	223914523	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	26944	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	223925260	223925580	223925340	Y	NA	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	37965	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	223964690	223965055	223964731	Y	TP53BP2,FBXO28	NA	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	66619	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	224014874	224015267	224015181	Y	CAPN2,FBXO28,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	16407	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	224019430	224020596	224019827	Y	FBXO28,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	11078	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	224032316	224032686	224032418	Y	CAPN2,FBXO28,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.14918088304402
chr1	224528791	224528972	224528907	Y	NA	NVL,CNIH4	FBXO28,DEGS1,NVL,CNIH4,WDR26	IMR90	Hi-C	24141950	NVL	12702	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	224598124	224598418	224598271	Y	WDR26	WDR26	NA	NA	NA	NA	WDR26	24317	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	224633276	224633598	224633406	Y	NA	WDR26	WDR26,FBXO28,CNIH4	IMR90	Hi-C	24141950	WDR26	10541	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	225613143	225613456	225613257	Y	LBR,LBR	LBR,RP11-496N12.6	NA	NA	NA	NA	LBR	1171	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	225780677	225780772	225780725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENAH	58072	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	225954708	225954967	225954837	Y	NA	SRP9,EPHX1	ENAH	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SRP9	8564	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	226005413	226005573	226005512	Y	NA	SRP9,EPHX1	NA	NA	NA	NA	EPHX1	9619	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.159295628027183
chr1	226063760	226064118	226063778	Y	NA	TMEM63A,LEFTY1,PYCR2	NA	NA	NA	NA	TMEM63A	3951	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr1	226288544	226288864	226288784	Y	C1orf55,H3F3A	H3F3A	C1orf55,H3F3A,ACBD3	IMR90	Hi-C	24141950	H3F3A	40992	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	226297611	226298113	226297674	Y	NA	NA	ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	H3F3A	50059	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.25124336444803
chr1	226315308	226315548	226315420	Y	PARP1	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56883	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	226315631	226315825	226315781	Y	PARP1,LIN9,PYCR2	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56606	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.649751881105252
chr1	226361229	226361382	226361305	Y	NA	ACBD3	NA	NA	NA	NA	ACBD3	11049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	226404092	226404450	226404271	Y	NA	ACBD3	NA	NA	NA	NA	ACBD3	31661	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	226435130	226435332	226435236	Y	PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A	NA	NA	NA	NA	NA	LIN9	60238	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	226890865	226891416	226891300	Y	ITPKB	ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB	33608	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.640450746036888
chr1	227002760	227003096	227002965	Y	NA	NA	ITPKB,C1orf95	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PSEN2	52789	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	227751865	227752213	227752044	Y	ZNF678	ZNF678	NA	NA	NA	NA	ZNF678	2621	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	228273480	228273740	228273633	Y	ARF1,ARF1	ARF1,C1orf35,MRPL55	NA	NA	NA	NA	ARF1	5119	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	228350789	228351109	228350864	Y	JMJD4	GUK1,IBA57,OBSCN,C1orf145	NA	NA	NA	NA	IBA57	407	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.19006686847241
chr1	228398942	228399222	228399120	Y	TRIM17,GJC2	IBA57,OBSCN,C1orf145	NA	NA	NA	NA	C1orf145	143	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	228678228	228678435	228678266	Y	NA	HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	RNF187	5466	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	228782602	228782886	228782775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	85938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.880046598296041
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84925	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	8.60363144637648
chr1	228783962	228784250	228784107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84574	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.155836138087189
chr1	229326926	229327085	229327016	Y	RHOU	NA	RHOU	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	77690	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	229335784	229335916	229335795	Y	RHOU,C1orf96	NA	RHOU,NUP133,RAB4A	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	68859	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.421995248652249
chr1	229357329	229357959	229357668	Y	RAB4A	RP5-1061H20.4,RAB4A	RHOU,C1orf96	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	46816	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	229365571	229365974	229365758	Y	RHOU,SPHAR,C1orf96	RP5-1061H20.4,RAB4A	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	38801	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	229366402	229366798	229366551	Y	C1orf96	RP5-1061H20.4,RAB4A	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	37977	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	229388898	229389111	229388968	Y	URB2,TAF5L,NUP133,RAB4A,C1orf96	RP5-1061H20.4,RAB4A	RHOU,NUP133,ABCB10	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	15664	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20553894282687
chr1	229409656	229409997	229409713	Y	RAB4A	RP5-1061H20.4,RAB4A	NA	NA	NA	NA	RAB4A	4834	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	229473732	229474385	229474330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB4A	68910	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr1	230061007	230061186	230061097	Y	ACTA1	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	130350	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	230203814	230204638	230204330	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	12278	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	230220164	230220401	230220223	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	28628	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	230220475	230220731	230220560	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	28939	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	230240540	230240902	230240735	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	49004	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210997624326124
chr1	230241590	230241986	230241849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	50054	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.120163000724761
chr1	230248068	230248475	230248108	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	56532	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	230249347	230250007	230249645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	57811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.293644225678606
chr1	230561990	230562633	230562303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG2	213602	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	230595195	230595532	230595329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG2	180703	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	230889321	230889962	230889601	Y	NA	AGT	NA	NA	NA	NA	AGT	41278	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	231038131	231038454	231038293	Y	COG2,TTC13,GNPAT,C1orf131	C1orf198	NA	NA	NA	NA	C1orf198	34796	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr1	231083969	231084208	231084171	Y	NA	TTC13,ARV1	NA	NA	NA	NA	TTC13	28413	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	231113054	231113423	231113208	Y	EXOC8,C1orf124,TTC13	TTC13,ARV1	NA	NA	NA	NA	ARV1	327	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	231347338	231347496	231347363	Y	C1orf124	C1orf131,GNPAT	NA	NA	NA	NA	C1orf131	27437	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr1	232735038	232735290	232735230	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	230643	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.429836085339879
chr1	233249275	233249581	233249334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTPCR	164924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr1	233472763	233473058	233472911	Y	NA	RPS7P3,PCNXL2	NA	NA	NA	NA	PCNXL2	43304	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	233750790	233751092	233750957	Y	KCNK1	KCNK1	NA	NA	NA	NA	KCNK1	3040	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr1	233763606	233763782	233763694	Y	NA	KCNK1	NA	NA	NA	NA	KCNK1	15856	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	233809261	233809638	233809364	Y	KCNK1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNK1	61511	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	234163168	234163347	234163228	Y	SLC35F3	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.2	327405	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	234250535	234250574	234250556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.2	240178	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	234275805	234276023	234275906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.2	214729	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.977956131326804
chr1	234639993	234640263	234640100	Y	NA	TARBP1	LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TARBP1	27144	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	234658291	234658851	234658374	Y	NA	TARBP1	NA	NA	NA	NA	TARBP1	45442	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	234659231	234659760	234659519	Y	IRF2BP2	TARBP1	NA	NA	NA	NA	TARBP1	46382	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.554727618373527
chr1	234669721	234669929	234669823	Y	NA	NA	LOC100506795	K562	ChIA-PET	22265404	TARBP1	56872	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	234737347	234737653	234737498	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	5618	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	234738546	234738834	234738624	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4437	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr1	234746093	234747674	234747395	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	2822	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr1	234748100	234748931	234748566	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4829	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.474080208580305
chr1	234792654	234793437	234793098	Y	NA	IRF2BP2,RP4-781K5.4	IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-781K5.4	12619	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr1	234793934	234794239	234794125	Y	NA	RP4-781K5.4	IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-781K5.4	13899	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr1	234858843	234859287	234859154	Y	NA	LINC01132	NA	NA	NA	NA	LINC01132	1054	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr1	234987212	234987644	234987394	Y	IRF2BP2	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01132	129423	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	235097868	235098070	235097979	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	192181	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr1	235106929	235107153	235107059	Y	TARBP1,IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	183098	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	235110834	235111403	235111103	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	178848	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	235114050	235115068	235114636	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	175183	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	235122652	235122939	235122843	Y	NA	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	167312	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	235133014	235133422	235133155	Y	NA	NA	LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	156829	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr1	235134086	235134438	235134232	Y	NA	NA	LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	155813	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	235242252	235242564	235242410	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	TOMM20	IRF2BP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TOMM20	47687	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	235246558	235246857	235246620	Y	ARID4B,ARID4B	TOMM20	IRF2BP2	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TOMM20	43394	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.164024160336071
chr1	235460869	235461278	235461096	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	GGPS1,ARID4B	NA	NA	NA	NA	GGPS1	27387	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr1	235484403	235484795	235484782	Y	NA	GGPS1,ARID4B,TBCE	NA	NA	NA	NA	GGPS1	3870	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	235668656	235669018	235668830	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	B3GALNT2	NA	NA	NA	NA	B3GALNT2	2875	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.259587316246322
chr1	236026992	236027471	236027217	Y	GPR137B,LYST	LYST	NA	NA	NA	NA	LYST	17469	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	236080566	236081247	236080933	Y	LYST,GPR137B	LYST	B3GALNT2,LYST,NID1	IMR90	Hi-C	24141950	LYST	35626	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	236135691	236135959	236135881	Y	GPR137B	NA	LYST	IMR90	Hi-C	24141950	LYST	90751	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	236162583	236163199	236162893	Y	GPR137B	NA	NA	NA	NA	NA	LYST	117643	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	236431064	236431243	236431072	Y	LGALS8,ERO1LB	ERO1LB	NA	NA	NA	NA	ERO1LB	12076	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.379750316971083
chr1	236764383	236764568	236764551	Y	NA	HEATR1	NA	NA	NA	NA	HEATR1	1236	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	237007861	237008154	237008008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTR	51251	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	237029172	237029469	237029246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTR	72562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	237509665	237509877	237509771	Y	RYR2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL35P1	367028	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	237634251	237634535	237634324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL35P1	491614	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	8.65666032069122
chr1	240306165	240306375	240306208	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	25080	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr1	240306412	240306787	240306695	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	24668	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	240306890	240307603	240307416	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23852	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.344077179608654
chr1	240307621	240308162	240308005	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23293	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.312402425364746
chr1	240308207	240308537	240308375	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.221184838134266
chr1	240308546	240308862	240308776	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22593	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.296373566428234
chr1	240433849	240434175	240434014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	102394	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr1	240476321	240476487	240476382	Y	GREM2	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	144866	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	241320009	241320104	241320058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-435F13.2	159915	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	241775803	241776227	241776010	Y	KMO	CHML	NA	NA	NA	NA	CHML	21005	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	241781298	241781471	241781421	Y	NA	CHML	NA	NA	NA	NA	CHML	15761	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr1	241790752	241791037	241791008	Y	NA	CHML,OPN3	NA	NA	NA	NA	CHML	6195	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr1	241804319	241804678	241804577	Y	NA	CHML,OPN3	NA	NA	NA	NA	CHML	7087	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.29965969175991
chr1	242054721	242054907	242054820	Y	KMO	EXO1	NA	NA	NA	NA	EXO1	45452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	242108255	242108348	242108324	Y	NA	NA	EXO1	IMR90	Hi-C	24141950	EXO1	98986	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr1	243431437	243431793	243431509	Y	NA	CEP170,SDCCAG8	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	14117	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr1	243451071	243451374	243451087	Y	CEP170,SDCCAG8	CEP170,SDCCAG8	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	33751	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	243641103	243641443	243641320	Y	CEP170,SDCCAG8,AKT3,AKT3	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	223783	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	244210956	244211944	244211575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	198575	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr1	244215508	244215901	244215527	Y	AKT3,ZNF238,ZNF238	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	203127	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	244462616	244463099	244462949	Y	AKT3,AKT3,ADSS	NA	AKT3,SDCCAG8,LOC339529,C1orf100,ADSS	IMR90	Hi-C	24141950	ADSS	150337	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.123778420214165
chr1	244466323	244466598	244466461	Y	NA	NA	AKT3,SDCCAG8,LOC339529,C1orf100,ADSS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ADSS	146838	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr1	244512430	244512879	244512496	Y	ADSS	NA	C1orf100,ADSS,AKT3	IMR90	Hi-C	24141950	ADSS	100557	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr1	244613820	244614139	244614120	Y	NA	ADSS,C1orf101	NA	NA	NA	NA	ADSS	384	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.356263584976056
chr1	245082176	245082355	245082237	Y	EFCAB2	EFCAB2	SMYD3,EFCAB2,C1orf101,HNRNPU,PPPDE1,COX20	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EFCAB2	48652	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	245971113	245971386	245971357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	697228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr1	246061196	246061440	246061372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	607174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr1	246297322	246297388	246297355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	371226	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	246436053	246436378	246436216	Y	SMYD3,SMYD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	232236	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	246538507	246538660	246538597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	129954	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr1	246730569	246731007	246730621	Y	AHCTF1,CNST	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	2823	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr1	246743297	246743408	246743371	Y	CNST	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	15551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	246763574	246763751	246763579	Y	NA	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	35828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr1	246862505	246862699	246862612	Y	SCCPDH	SCCPDH	NA	NA	NA	NA	SCCPDH	22650	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr1	247035132	247035504	247035470	Y	CNST,ZNF669,AHCTF1	NA	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	57776	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.418152795083139
chr1	247206107	247206337	247206222	Y	NA	ZNF695,ZNF670	NA	NA	NA	NA	ZNF670	33776	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr1	247297966	247298129	247298007	Y	NA	ZNF669	NA	NA	NA	NA	ZNF669	32292	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	247315116	247315371	247315289	Y	OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669	ZNF669,MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	47991	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr1	247326566	247327229	247326989	Y	NA	MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	36133	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr1	247507326	247507475	247507401	Y	NA	ZNF496	ZNF670-ZNF695,AHCTF1,ZNF669,ZNF496	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF496	14178	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr1	247524183	247524555	247524546	Y	NLRP3,NLRP3	ZNF496	ZNF496,AHCTF1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF496	31035	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	179287	179666	179475	Y	NA	ZMYND11	NA	NA	NA	NA	ZMYND11	882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	354662	355000	354689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYND11	176257	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	587865	588161	588097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2C	145522	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	958233	958518	958406	Y	NA	LARP4B	DIP2C,GTPBP4,LARP4B	IMR90	Hi-C	24141950	LARP4B	17046	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	975785	976368	976035	Y	NA	LARP4B	DIP2C,LARP4B,GTPBP4,IDI1,IDI2-AS1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LARP4B	221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr10	1335739	1336079	1335908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR37	242261	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	2256285	2256680	2256409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFKP	849845	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.343347030418287
chr10	3028046	3028193	3028123	Y	NA	NA	LINC00200	IMR90	Hi-C	24141950	PFKP	78332	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.357376697795539
chr10	3088088	3088382	3088199	Y	NA	PFKP	PFKP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFKP	18143	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr10	3137708	3138098	3138049	Y	NA	PFKP	NA	NA	NA	NA	PFKP	31183	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	3145163	3145536	3145437	Y	PFKP	PFKP	NA	NA	NA	NA	PFKP	38638	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	3216614	3216797	3216708	Y	NA	PITRM1	NA	NA	NA	NA	PITRM1	3611	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104864290978615
chr10	3509617	3509911	3509759	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	296614	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	3510310	3510716	3510597	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	297307	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	3511181	3511689	3511507	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	298178	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	3524547	3524820	3524727	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	300653	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	3598970	3599136	3599051	Y	KLF6	NA	NA	NA	NA	NA	KLF6	226337	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr10	3797195	3797502	3797389	Y	KLF6	KLF6	NA	NA	NA	NA	KLF6	27971	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	3853393	3854169	3853583	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	27920	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	4386754	4387085	4386858	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	102650	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	4394953	4395258	4395067	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	110849	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	4396174	4396330	4396296	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	112070	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr10	4705159	4705783	4705486	Y	NA	LINC00704	NA	NA	NA	NA	LINC00704	12563	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	4775719	4776039	4775944	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001	MCF7	ChIA-PET	22265404	LINC00704	57373	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	4891874	4892173	4892030	Y	NA	AKR1C1	NA	NA	NA	NA	AKR1C1	40623	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	4983862	4984222	4983900	Y	NA	NA	tAKR,AKR1C2,AKR1C3,UCN3,NET1,TUBAL3	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1C1	51066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	4989909	4990226	4990068	Y	AKR1C3,AKR1C1	NA	tAKR,AKR1C2,AKR1C3,UCN3,NET1,TUBAL3	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1C1	57113	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr10	5064109	5064385	5064247	Y	NA	AKR1C2,AKR1C3	AKR1C3	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1C2	5886	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	5113786	5114179	5114065	Y	AKR1C1,AKR1C2,AKR1C3	AKR1C3	NA	NA	NA	NA	AKR1C3	38240	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.24940010243818
chr10	5333644	5334212	5333929	Y	NA	NA	AKR1E2,tAKR	IMR90	Hi-C	24141950	TUBAL3	110581	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.294374374868973
chr10	5334474	5334640	5334544	Y	NA	NA	AKR1E2,tAKR	IMR90	Hi-C	24141950	TUBAL3	110153	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	5577499	5577735	5577573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-336A10.7	87159	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	5587810	5588190	5587923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-336A10.7	76704	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.267428152933953
chr10	5588881	5589169	5589084	Y	NET1,CALML3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-336A10.7	75725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.242672378570032
chr10	5590010	5590295	5590293	Y	NET1,CALML3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-336A10.7	74599	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr10	5590507	5590769	5590638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-336A10.7	74125	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	5590959	5591270	5591035	Y	NET1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-336A10.7	73624	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.313862723745479
chr10	5596279	5596669	5596478	Y	NA	NA	NET1,ASB13	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-336A10.7	68225	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	5638863	5639270	5639216	Y	NET1,CALML3	RP11-336A10.7	NET1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-336A10.7	25624	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	5783071	5783414	5783247	Y	NA	NA	GDI2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM208B	58270	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr10	6013642	6013801	6013714	Y	PFKFB3,PFKFB3,IL15RA	RP11-536K7.3,IL15RA	NA	NA	NA	NA	IL15RA	4349	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	6017924	6018316	6018090	Y	RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3,IL15RA	RP11-536K7.3	NA	NA	NA	NA	IL15RA	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr10	6206285	6206560	6206485	Y	NA	PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	21404	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr10	6281305	6281494	6281382	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	96424	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	6333794	6333936	6333889	Y	PFKFB3,PRKCQ	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	148913	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	6443408	6443712	6443449	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKCQ	176551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr10	6503496	6503541	6503519	Y	PRKCQ	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCQ	116722	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	6600320	6600578	6600409	Y	RBM17,RBM17,PRKCQ	PRKCQ	NA	NA	NA	NA	PRKCQ	19685	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	6764164	6764384	6764289	Y	NA	RP11-554I8.2	LOC100507127,SFMBT2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-554I8.2	12960	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr10	7285969	7286078	7285998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	165372	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	7356268	7356516	7356367	Y	SFMBT2,SFMBT2	NA	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	94934	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr10	7362038	7362350	7362337	Y	SFMBT2,SFMBT2	NA	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	89100	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	7452405	7452746	7452437	Y	NA	SFMBT2	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	955	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.360836187735533
chr10	8662161	8662543	8662250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF3	803694	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr10	11652835	11653073	11652954	Y	CELF2,USP6NL	USP6NL	NA	NA	NA	NA	USP6NL	1082	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	11737081	11737223	11737138	Y	NA	ECHDC3	USP6NL	IMR90	Hi-C	24141950	ECHDC3	45142	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	11835953	11836243	11836176	Y	C10orf47	NA	NA	NA	NA	NA	ECHDC3	53588	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	11917828	11918087	11917940	Y	C10orf47	NA	NA	NA	NA	NA	ECHDC3	135463	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr10	11924114	11924319	11924232	Y	C10orf47	NA	NA	NA	NA	NA	ECHDC3	141749	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr10	11940492	11940889	11940732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UPF2	142280	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	11983561	11983569	11983563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UPF2	99600	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	12002775	12003103	12002939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UPF2	80066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	12375218	12375432	12375325	Y	CAMK1D	CAMK1D	CAMK1D,OPTN,CCDC3,CDC123	IMR90	Hi-C	24141950	CAMK1D	14049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	12490797	12491318	12490959	Y	SEC61A2,CAMK1D	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK1D	101316	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	12751328	12751588	12751334	Y	CAMK1D	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK1D	361847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr10	12762455	12762628	12762543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK1D	372974	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr10	13142941	13143287	13143115	Y	NA	OPTN	NA	NA	NA	NA	OPTN	3492	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr10	13388296	13388525	13388411	Y	NA	PHYH	NA	NA	NA	NA	SEPHS1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	13390886	13391219	13391148	Y	NA	PHYH,SEPHS1	NA	NA	NA	NA	SEPHS1	2589	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236483547880411
chr10	13884147	13884173	13884160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	257220	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	14594148	14594360	14594257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM107B	220536	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	14601403	14601956	14601622	Y	DCLRE1C	NA	NA	NA	NA	NA	FAM107B	212940	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	14602319	14602604	14602483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM107B	212292	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	14605482	14605831	14605731	Y	HSPA14,DCLRE1C	NA	NA	NA	NA	NA	FAM107B	209065	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	14624029	14624329	14624184	Y	DCLRE1C	NA	NA	NA	NA	NA	FAM107B	190567	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr10	14641847	14641963	14641950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM107B	172933	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr10	15157630	15158203	15157954	Y	NA	ACBD7,RPP38	NA	NA	NA	NA	RPP38	20451	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	15158719	15159034	15158939	Y	NA	ACBD7,RPP38,NMT2	NA	NA	NA	NA	RPP38	21540	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	15178441	15178844	15178745	Y	NA	ACBD7,RPP38,NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	29848	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	16481463	16481634	16481561	Y	NA	PTER,RNU2-18P	NA	NA	NA	NA	PTER	4521	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr10	17569630	17569764	17569656	Y	VIM	NA	PTPLA	IMR90	Hi-C	24141950	PTPLA	87612	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr10	17755362	17755412	17755398	Y	SLC39A12	NA	NA	NA	NA	NA	STAM	71238	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	18860767	18861138	18861132	Y	NA	RP11-499P20.2	NA	NA	NA	NA	RP11-499P20.2	28187	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	20134637	20134650	20134644	Y	PLXDC2	NA	NA	NA	NA	NA	ARL5B	1188303	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	21317807	21317920	21317859	Y	C10orf113	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	143196	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	21809167	21809536	21809441	Y	C10orf114,C10orf140	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	11558	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	21816029	21816444	21816223	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	4650	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.395049026717228
chr10	21824374	21824606	21824490	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	3280	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	21991974	21992366	21992143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT10	170880	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	22026318	22026683	22026671	Y	EBLN1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	193389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	22046684	22046874	22046779	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	173198	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	22201596	22201935	22201928	Y	EBLN1	RN7SKP37	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	18137	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	22242936	22243341	22243231	Y	NA	RN7SKP37,DNAJC1	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	22864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	22519481	22519667	22519580	Y	BMI1,EBLN1	NA	COMMD3-BMI1,PIP4K2A,ARMC3,DNAJC1,LOC100499489	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COMMD3	83236	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.124891533033648
chr10	22535612	22535856	22535691	Y	NA	NA	ARMC3,LOC100130992	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COMMD3	67047	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr10	22628998	22629520	22629110	Y	EBLN1	COMMD3,BMI1	NA	NA	NA	NA	BMI1	20858	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	22629825	22629981	22629966	Y	DNAJC1	COMMD3,BMI1	NA	NA	NA	NA	BMI1	21685	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr10	22630393	22630515	22630474	Y	NA	COMMD3,BMI1	NA	NA	NA	NA	BMI1	22253	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	22658531	22658793	22658663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	50391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	22817226	22817294	22817260	Y	EBLN1	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	184190	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	22904639	22904845	22904818	Y	PIP4K2A	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	96639	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	22907073	22907416	22907362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	94068	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	22932460	22932672	22932594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	68812	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	22961361	22961802	22961720	Y	NA	PIP4K2A	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	39682	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	23721651	23721890	23721808	Y	OTUD1	OTUD1	OTUD1	MCF7	ChIA-PET	22265404	OTUD1	4308	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20353975126761
chr10	24740338	24740618	24740546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	269979	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	24746901	24747210	24747047	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	263387	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr10	24772710	24773084	24772822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	237513	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	24925603	24925785	24925693	Y	ARHGAP21	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	84812	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	24996902	24997348	24997071	Y	NA	ARHGAP21	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	13249	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	25240272	25240935	25240716	Y	ARHGAP21,THNSL1,GPR158,PRTFDC1	PRTFDC1	NA	NA	NA	NA	PRTFDC1	739	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.266159110565059
chr10	25348919	25349256	25349121	Y	NA	ENKUR,THNSL1	ARHGAP21,PRTFDC1,ENKUR,THNSL1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THNSL1	45332	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	26775274	26775560	26775412	Y	APBB1IP,PDSS1,ABI1	NA	NA	NA	NA	NA	PDSS1	209028	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr10	26775885	26776759	26776046	Y	APBB1IP,ABI1	NA	NA	NA	NA	NA	PDSS1	207829	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	27354652	27354729	27354695	Y	NA	ANKRD26	NA	NA	NA	NA	ANKRD26	32692	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr10	27531769	27532240	27532024	Y	ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5	ACBD5	NA	NA	NA	NA	ACBD5	2710	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.964309427578667
chr10	28366743	28367106	28366855	Y	ARMC4	NA	NA	NA	NA	NA	ARMC4	80766	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	28725980	28726021	28726001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WAC	93401	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	29280500	29280692	29280596	Y	NA	NA	LYZL1,BAMBI,LOC100507605	IMR90	Hi-C	24141950	BAMBI	316229	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	29420684	29421072	29420878	Y	NA	NA	BAMBI,LYZL1,LOC100507605,WAC	IMR90	Hi-C	24141950	PTCHD3P1	275259	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	29493243	29493378	29493326	Y	NA	NA	BAMBI,LOC100507605,LYZL1	IMR90	Hi-C	24141950	PTCHD3P1	202953	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	29546571	29546627	29546599	Y	NA	NA	BAMBI,LYZL1,LOC100507605,WAC	IMR90	Hi-C	24141950	PTCHD3P1	149704	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	29907407	29907668	29907538	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	211076	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	29944854	29945090	29945003	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	248523	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	29970673	29971027	29970896	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	274342	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	29977181	29977518	29977482	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	280850	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	30073207	30073608	30073571	Y	SVIL	NA	SVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA1462	328815	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr10	30092989	30093361	30093263	Y	SVIL	NA	SVIL,KIAA1462,MIR604	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA1462	309062	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr10	30096449	30096548	30096521	Y	NA	NA	SVIL,KIAA1462	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA1462	305875	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr10	30441068	30441357	30441150	Y	NA	KIAA1462	MTPAP,KIAA1462	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1462	38645	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	30711320	30711474	30711381	Y	MAP3K8	MTPAP,MAP3K8	MAP3K8	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP3K8	9392	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.586402372617435
chr10	30720407	30720642	30720475	Y	MAP3K8	MAP3K8	NA	NA	NA	NA	MAP3K8	224	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.180053019272583
chr10	30742798	30743130	30743073	Y	NA	MAP3K8	NA	NA	NA	NA	MAP3K8	21932	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	30994223	30994518	30994467	Y	NA	NA	ZEB1,ARHGAP12,ZEB1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K8	273357	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	31015875	31016223	31016049	Y	NA	NA	ZEB1,ARHGAP12,ZEB1-AS1,KIF5B,ZNF438,ERGIC3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,19890323	MAP3K8	295009	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr10	31892273	31892723	31892643	Y	NA	NA	ZEB1	IMR90	Hi-C	24141950	ZEB1-AS1	284897	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.397778367466855
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.427836893780619
chr10	32100174	32100489	32100483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP12	115253	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	32218329	32218518	32218508	Y	NA	ARHGAP12	NA	NA	NA	NA	ARHGAP12	2587	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	32316515	32316560	32316538	Y	NA	KIF5B	NA	NA	NA	NA	KIF5B	26799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	32438322	32438553	32438446	Y	NA	RPS4XP11	KIF5B,ARHGAP12,EPC1	IMR90	Hi-C	24141950	RPS4XP11	48101	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	32626420	32626786	32626539	Y	NA	EPC1	NA	NA	NA	NA	EPC1	38940	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	32735821	32736068	32735865	Y	NA	CCDC7	C10orf68	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCDC7	2753	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.779754910076903
chr10	33250851	33251304	33251058	Y	NA	RP11-462L8.1,ITGB1	NA	NA	NA	NA	RP11-462L8.1	5078	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.266159110565059
chr10	33269452	33269916	33269602	Y	C10orf68	RP11-462L8.1,ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	22804	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.693613040716562
chr10	33272272	33272613	33272373	Y	ITGB1,ITGB1,ITGB1	RP11-462L8.1,ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	20107	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr10	33291145	33291309	33291227	Y	NA	RP11-462L8.1,ITGB1	ITGB1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	1411	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	33299093	33299340	33299217	Y	NA	ITGB1	ITGB1,C10orf68,PARD3	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	6373	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	33403327	33403662	33403511	Y	NA	NA	ITGB1,NRP1,PARD3	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	110607	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	33422989	33423776	33423207	Y	NA	NA	ITGB1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	130269	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr10	33547800	33548221	33548104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	74969	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	33562254	33562552	33562425	Y	ITGB1,ITGB1,NRP1	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	60638	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr10	33625950	33626342	33626167	Y	NA	NRP1	NA	NA	NA	NA	NRP1	2760	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	35102675	35103059	35102787	Y	NA	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	422	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	35424812	35424825	35424819	Y	CCNY	CUL2,CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	11093	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	35425292	35425645	35425387	Y	CUL2,CUL2,CCNY,CREM,CREM	CUL2,CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	11573	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	35438214	35438795	35438573	Y	CREM,CREM	CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	24495	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	35717658	35717859	35717796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	183705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	38264185	38264489	38264470	Y	ZNF37A,ZNF248,ZNF25	ZNF25,ZNF33A	NA	NA	NA	NA	ZNF25	624	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	38325428	38325718	38325598	Y	ZNF25,ZNF37A	ZNF33A	NA	NA	NA	NA	ZNF33A	27850	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	43249715	43249807	43249770	Y	NA	BMS1	NA	NA	NA	NA	BMS1	26442	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	43422233	43422523	43422379	Y	NA	NA	RET	IMR90	Hi-C	24141950	BMS1	145984	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	43761301	43761565	43761418	Y	RASGEF1A	NA	NA	NA	NA	NA	FXYD4	103525	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	43905259	43905708	43905446	Y	HNRNPF,HNRNPF,HNRNPF	FXYD4,HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	HNRNPF	2645	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr10	43950893	43951349	43951098	Y	NA	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-517P14.2	36707	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.39833515204891
chr10	44255352	44255616	44255516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF32	113048	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	44359364	44359693	44359433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF32	217060	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	44363607	44363971	44363643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF32	221303	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	45422762	45423156	45422846	Y	ALOX5	RASSF4,C10orf10	NA	NA	NA	NA	RASSF4	29699	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	45445885	45445945	45445917	Y	RASSF4	RASSF4,C10orf10	NA	NA	NA	NA	RASSF4	6910	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	45461456	45461865	45461640	Y	OR13A1,ALOX5	RASSF4,C10orf10	NA	NA	NA	NA	RASSF4	8601	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	45927566	45927962	45927775	Y	FAM21C,ANUBL1,ALOX5	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX5	59905	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	47031609	47031850	47031726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM21C	810961	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.599474856724615
chr10	47034323	47034345	47034334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM21C	813675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	47057375	47057652	47057526	Y	NA	NA	GPRIN2,ZNF488,LOC643650,SYT15,ANTXRL	IMR90	Hi-C	24141950	FAM21C	836727	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.47169850973655
chr10	47080536	47081217	47080878	Y	GPRIN2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM21C	859888	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	47092943	47093271	47093193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM21C	872295	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	47093518	47093811	47093665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM21C	872870	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr10	47129494	47129670	47129546	Y	SYT15,PPYR1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM21C	908846	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	47137749	47138065	47137950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM21C	917101	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.317861106864
chr10	47149103	47149407	47149372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM21C	928455	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr10	47655672	47656071	47655889	Y	NA	NA	AGAP7	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-463P17.1	674126	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255971896756917
chr10	48323344	48323752	48323648	Y	NA	RP11-463P17.1,ZNF488	SYT15,GPRIN2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-463P17.1	6445	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	48392377	48392594	48392484	Y	ZNF488,RBP3	ZNF488	NA	NA	NA	NA	ZNF488	39353	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	48482238	48482583	48482338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF488	129214	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr10	48591812	48592143	48591972	Y	ZNF488	NA	SYT15	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF488	238788	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	49598208	49598504	49598305	Y	NA	NA	MAPK8,ARHGAP22	IMR90	Hi-C	24141950	MAPK8	85510	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	50776206	50776746	50776485	Y	PGBD3,ERCC6,CHAT,SLC18A3	PGBD3,ERCC6	NA	NA	NA	NA	ERCC6	30622	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.400507708216482
chr10	50787572	50787883	50787845	Y	NA	PGBD3,ERCC6	NA	NA	NA	NA	ERCC6	41988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	51488946	51489392	51489137	Y	NCOA4,NCOA4,NCOA4	RP11-109G10.2	NA	NA	NA	NA	RP11-109G10.2	41180	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.265428961374692
chr10	52037840	52038115	52037944	Y	SGMS1	ASAH2,DYNC1I2P1	SGMS1	IMR90	Hi-C	24141950	DYNC1I2P1	15102	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	52079574	52079882	52079666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	56836	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr10	52083052	52083210	52083101	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	60314	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	52092316	52092324	52092320	Y	FAM21A,SGMS1	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	69578	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	52167205	52167434	52167402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	144467	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	52261858	52262194	52262143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	120729	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr10	52270106	52270351	52270231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	112572	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	52385542	52385659	52385602	Y	NA	SGMS1	NA	NA	NA	NA	SGMS1	2619	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr10	54078280	54078480	54078433	Y	NA	DKK1	NA	NA	NA	NA	DKK1	6224	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	54078781	54079176	54078966	Y	NA	DKK1	NA	NA	NA	NA	DKK1	6725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr10	54203068	54203427	54203228	Y	NA	RP11-346D6.6	LOC100506939,DKK1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-346D6.6	24866	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.169865805464441
chr10	54203502	54203868	54203680	Y	DKK1	RP11-346D6.6	LOC100506939,DKK1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-346D6.6	24425	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	54211545	54211936	54211751	Y	NA	RP11-346D6.6	LOC100506939,DKK1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-346D6.6	16357	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	54212412	54212659	54212464	Y	NA	RP11-346D6.6	LOC100506939,DKK1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-346D6.6	15634	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	54246557	54246950	54246727	Y	DKK1	RP11-346D6.6	DKK1,LOC100506939,PRKG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-346D6.6	18264	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr10	59096410	59096633	59096523	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPMK	929061	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	61632760	61633170	61633000	Y	NA	CCDC6	NA	NA	NA	NA	CCDC6	31244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	61860000	61860017	61860008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC6	195586	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	62174641	62174784	62174750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK1	361305	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	63225634	63225799	63225694	Y	ARID5B	NA	ARID5B,TMEM26	IMR90	Hi-C	24141950	RHOBTB1	466436	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	63540272	63540417	63540346	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTKN2	486049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	63571912	63572045	63571979	Y	TMEM26	NA	ARID5B,C10orf107,RHOBTB1	IMR90	Hi-C	24141950	RTKN2	454421	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	63596779	63597177	63597154	Y	NA	NA	RHOBTB1,C10orf107,ARID5B	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RTKN2	429289	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr10	63658924	63659147	63659031	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	RTKN2	367319	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.185511700771837
chr10	63663540	63663817	63663641	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	RTKN2	362649	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.431452313270024
chr10	63702592	63703184	63702855	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	RTKN2	323282	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr10	63736420	63736602	63736437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTKN2	289864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	63752119	63752912	63752632	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	RTKN2	273554	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr10	63842469	63842743	63842551	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	RTKN2	183723	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	64024468	64024613	64024559	Y	ARID5B	RTKN2	NA	NA	NA	NA	RTKN2	1853	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	65078433	65078736	65078637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	106321	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	65125268	65125651	65125502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	59406	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	65196810	65197156	65196994	Y	NA	PRELID1P3,JMJD1C	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	11753	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	65269177	65269730	65269542	Y	NA	JMJD1C,REEP3	REEP3,JMJD1C,LOC84989	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	REEP3	9393	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr10	65274637	65275000	65274913	Y	NA	REEP3	JMJD1C,REEP3	IMR90	Hi-C	24141950	REEP3	4123	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	65282188	65282459	65282345	Y	JMJD1C,JMJD1C	REEP3	NA	NA	NA	NA	REEP3	3065	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	65388414	65388608	65388512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	109291	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.281457820311205
chr10	65460115	65460254	65460185	Y	NA	NA	JMJD1C	IMR90	Hi-C	24141950	REEP3	180992	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	65467084	65467405	65467282	Y	JMJD1C	NA	JMJD1C,NRBF2,REEP3,ZNF365	IMR90	Hi-C	24141950	REEP3	187961	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr10	65930110	65930546	65930307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-170M17.2	269105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.306560780236375
chr10	67154801	67155033	67154934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA2P3	571472	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	69523880	69524330	69524240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	71594	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	69550767	69550960	69550901	Y	NA	DNAJC12	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	44964	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.14092039197016
chr10	69578155	69578433	69578238	Y	NA	DNAJC12	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	17491	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	69579652	69579872	69579788	Y	DNAJC12	DNAJC12	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	16052	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.266159110565059
chr10	69582490	69582752	69582621	Y	DNAJC12	DNAJC12	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	13172	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	DNAJC12,SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJC12	13236	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.11781707994887
chr10	69778500	69778679	69778642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERC4	54426	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	69796463	69796828	69796573	Y	HERC4	HERC4	NA	NA	NA	NA	HERC4	36277	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	69854882	69855277	69855187	Y	HERC4	HERC4,MYPN	ATOH7,HNRNPH3,PBLD,MYPN,HERC4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYPN	8635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.636991256096894
chr10	69856894	69857171	69856968	Y	NA	HERC4,MYPN	MYPN,HERC4,PBLD,HNRNPH3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYPN	6741	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.349535861107908
chr10	69900271	69900394	69900274	Y	MYPN	MYPN	NA	NA	NA	NA	MYPN	36359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	69913307	69913725	69913572	Y	SIRT1,PBLD,HNRNPH3	MYPN	NA	NA	NA	NA	MYPN	49395	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.27015749368358
chr10	69947860	69948185	69948022	Y	RUFY2,RUFY2,MYPN	NA	NA	NA	NA	NA	MYPN	83948	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151837754968669
chr10	70088080	70088572	70088236	Y	SIRT1,PBLD,HNRNPH3	HNRNPH3,PBLD	NA	NA	NA	NA	HNRNPH3	359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr10	70735854	70735920	70735884	Y	CCAR1,SUPV3L1,DDX50,DDX21	DDX21,KIAA1279	KIAA1279	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1279	10567	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr10	70782889	70783013	70782952	Y	NA	KIAA1279	NA	NA	NA	NA	KIAA1279	36402	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	70821151	70821852	70821361	Y	DDX21,VPS26A,SRGN	SRGN	KIAA1279,DDX21,SRGN,VPS26A,SUPV3L1	IMR90	Hi-C	24141950	SRGN	24010	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr10	70846057	70846170	70846083	Y	NA	SRGN,VPS26A	NA	NA	NA	NA	SRGN	195	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr10	70884620	70884824	70884718	Y	DDX21,SUPV3L1,SRGN	SRGN,VPS26A	NA	NA	NA	NA	VPS26A	3352	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.218455497384639
chr10	70976966	70977432	70977124	Y	DDX21,SRGN,VPS26A	SUPV3L1,HKDC1,RP11-227H15.4	NA	NA	NA	NA	HKDC1	627	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.333159816610145
chr10	71198445	71198595	71198514	Y	NA	TSPAN15	HKDC1,TSPAN15,C10orf35,HK1,TACR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSPAN15	10634	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr10	71239136	71239503	71239234	Y	NA	TSPAN15	NA	NA	NA	NA	TSPAN15	29907	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	71675422	71675425	71675424	Y	H2AFY2	NA	NA	NA	NA	NA	COL13A1	115778	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	71840822	71841222	71841056	Y	NA	AIFM2	NA	NA	NA	NA	AIFM2	49468	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	71928097	71928630	71928606	Y	NA	AIFM2,TYSND1,CALM2P2	TYSND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAR1A	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr10	72027304	72027694	72027415	Y	NA	PPA1	NA	NA	NA	NA	PPA1	35637	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	72165059	72165574	72165379	Y	NA	LRRC20,EIF4EBP2	NA	NA	NA	NA	EIF4EBP2	2924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr10	72218739	72219166	72218841	Y	NA	NA	KIAA1274,SGPL1,EIF4EBP2,ADAMTS14,NODAL,C10orf27	IMR90	Hi-C	24141950	EIF4EBP2	56604	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	72973788	72974249	72973953	Y	UNC5B	UNC5B,UNC5B-AS1	NA	NA	NA	NA	UNC5B-AS1	1736	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	73124315	73124355	73124335	Y	NA	SLC29A3	NA	NA	NA	NA	SLC29A3	47300	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	73357359	73357803	73357564	Y	C10orf105	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf54	173452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	73526437	73526878	73526654	Y	CDH23,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	4377	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr10	73526896	73527242	73527133	Y	CDH23,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	4013	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	73529949	73530323	73530195	Y	NA	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	932	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	73531831	73532355	73532130	Y	C10orf105,CDH23,PSAP,C10orf54	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	576	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	73605642	73606023	73605974	Y	DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	NA	NA	NA	NA	PSAP	3103	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	73620184	73620641	73620392	Y	DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PSAP	11058	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.212996815885384
chr10	73627974	73628371	73628194	Y	DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	C10orf54,CDH23,PSAP,SPOCK2,DNAJB12,CHST3,ASCC1,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	PSAP	18848	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr10	73649730	73650267	73649949	Y	DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	DNAJB12,PSAP,CHST3,CDH23,ASCC1,SPOCK2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PSAP	40604	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	73725868	73726411	73726297	Y	C10orf105,CHST3	CHST3	NA	NA	NA	NA	CHST3	3745	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	73734357	73734754	73734458	Y	NA	CHST3	NA	NA	NA	NA	CHST3	12234	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	73735695	73736076	73735808	Y	NA	CHST3	NA	NA	NA	NA	CHST3	13572	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr10	73744363	73744592	73744410	Y	NA	CHST3	NA	NA	NA	NA	CHST3	22240	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr10	73840531	73840743	73840590	Y	ASCC1,ASCC1,SPOCK2	NA	NA	NA	NA	NA	CHST3	118408	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	73946489	73946835	73946688	Y	NA	ANAPC16,ASCC1	NA	NA	NA	NA	ANAPC16	26952	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	73954988	73955333	73955161	Y	NA	ANAPC16,ASCC1	NA	NA	NA	NA	ANAPC16	18454	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr10	73986513	73986881	73986533	Y	C10orf105,C10orf54,CDH23,CDH23	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	NA	NA	NA	NA	ASCC1	11621	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	74014911	74015029	74015003	Y	NA	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	16649	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.576562344370545
chr10	74016969	74017226	74017050	Y	C10orf54,PSAP,DNAJB12,DDIT4	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	14452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr10	74019515	74019657	74019544	Y	NA	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	DNAJB12	K562	ChIA-PET	22265404	DDIT4	12021	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.380863429790566
chr10	74020239	74021717	74020385	Y	C10orf54,PSAP,DNAJB12,DDIT4	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	DNAJB12	K562	ChIA-PET	22265404	DDIT4	9961	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.1376347229831
chr10	74032298	74032943	74032475	Y	NA	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	620	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.67386741016269
chr10	74076833	74077036	74076912	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	35952	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.486996763138074
chr10	74078612	74078870	74078849	Y	PSAP,DDIT4,CBARA1,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	34118	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	74079380	74080359	74079580	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	32629	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.801589636073919
chr10	74080430	74080993	74080646	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	31995	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.998593371090657
chr10	74081865	74082262	74082021	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	30726	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	74082335	74082540	74082412	Y	DDIT4	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	30448	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	74085147	74085316	74085305	Y	NA	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	27672	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.949393681461637
chr10	74091661	74092150	74091920	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	20838	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.37684761161314
chr10	74289425	74289733	74289722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICU1	94166	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	74436264	74436425	74436399	Y	CCDC109A,ASCC1,ASCC1	HMGN2P34,MCU	MICU1,OIT3,PLA2G12B,MCU	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MCU	13464	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr10	74453097	74453245	74453141	Y	CCDC109A	MCU	NA	NA	NA	NA	MCU	3208	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.190240233080725
chr10	74925047	74925060	74925055	Y	ANXA7,ECD	FAM149B1,ECD	NA	NA	NA	NA	FAM149B1	864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr10	74990824	74990933	74990931	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	DNAJC9	15687	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	75004761	75005017	75004932	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	DNAJC9	1603	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	75022023	75022098	75022060	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	RP11-152N13.5	11474	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.174594337773329
chr10	75179357	75179732	75179545	Y	ZMYND17	ANXA7,RP11-345K20.2	NA	NA	NA	NA	RP11-345K20.2	722	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	75221740	75221926	75221833	Y	NA	ANXA7,RP11-345K20.2,RP11-137L10.6,PPP3CB	NA	NA	NA	NA	RP11-137L10.6	31357	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	75337715	75337998	75337857	Y	CAMK2G,C10orf55,TTC18,PPP3CB,USP54	USP54	NA	NA	NA	NA	USP54	45713	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	75386298	75386455	75386385	Y	NA	USP54	NA	NA	NA	NA	USP54	2587	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr10	75639469	75639705	75639592	Y	FUT11,NDST2	CAMK2G	VCL,CAMK2G,NDST2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	CAMK2G	7126	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	75648556	75649146	75648996	Y	ANXA7,NDST2	CAMK2G	SEC24C,FUT11,LOC100507331,CAMK2G,NDST2,KIAA0913,VCL,PLAU,C10orf55,AP3M1,ADK	IMR90	Hi-C	24141950	CAMK2G	16213	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.415423454333511
chr10	75653245	75653472	75653359	Y	NA	CAMK2G	NA	NA	NA	NA	CAMK2G	20902	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr10	75666465	75666800	75666554	Y	ANXA7,NDST2	CAMK2G	NA	NA	NA	NA	CAMK2G	34122	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr10	75716399	75716797	75716501	Y	FUT11,NDST2	VCL	CAMK2G,PLAU,C10orf55,VCL,AP3M1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	VCL	39075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	75725888	75726135	75726026	Y	NA	VCL	CAMK2G,AP3M1,VCL,NDST2,C10orf55,PLAU,ADK	IMR90	Hi-C	24141950	VCL	29737	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr10	75768391	75768772	75768419	Y	NA	VCL	NA	NA	NA	NA	VCL	12519	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	75887856	75888019	75887938	Y	NA	AP3M1,ADK	NA	NA	NA	NA	AP3M1	20802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	75931649	75931916	75931783	Y	NA	AP3M1,ADK	NA	NA	NA	NA	ADK	22689	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr10	75987927	75988078	75987990	Y	KIAA0913,NDST2,CAMK2G,ADK	NA	NA	NA	NA	NA	ADK	78967	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	76985148	76985510	76985329	Y	NA	VDAC2,COMTD1,HMGA1P5	NA	NA	NA	NA	COMTD1	8278	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	77165098	77165501	77165301	Y	C10orf11	ZNF503	NA	NA	NA	NA	ZNF503	5434	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	77290134	77290404	77290261	Y	SAMD8	NA	C10orf11	IMR90	Hi-C	24141950	C10orf11	68594	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	77548245	77548262	77548254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf11	189247	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	79006844	79007202	79006984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	677176	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	79670022	79670276	79670149	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	14102	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.773913264948533
chr10	79731077	79731252	79731165	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	46699	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr10	80015725	80016226	80016048	Y	RPS24	NA	NA	NA	NA	NA	RPS24	224207	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr10	80122259	80122477	80122368	Y	NA	NA	LOC283050,ZMIZ1,LOC100132987	IMR90	Hi-C	24141950	RPS24	330741	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	80166856	80166996	80166943	Y	NA	NA	LOC283050,ZMIZ1,RPS24,LOC100132987	IMR90	Hi-C	24141950	RPS24	375338	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	80732492	80734123	80733460	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	92669	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.605890721493941
chr10	80734291	80734943	80734463	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	91849	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr10	80737664	80737999	80737882	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	88793	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.739856355516249
chr10	80830818	80831199	80831077	Y	ZMIZ1	ZMIZ1	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	4026	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	80911539	80911799	80911619	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	84747	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.246670761688553
chr10	80912242	80912363	80912303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	85450	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr10	80925867	80926207	80926136	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	99075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	80990068	80990387	80990161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	114838	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	81001444	81002226	81001825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	102999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr10	81033900	81034354	81034135	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	70871	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	81042130	81042560	81042322	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	62665	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr10	81071549	81071690	81071644	Y	ZMIZ1,ZCCHC24,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	33535	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18478155158147
chr10	81080868	81081434	81081104	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	23791	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	81085771	81086240	81085963	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	18985	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	81088418	81088982	81088641	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	16243	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr10	81091409	81091966	81091732	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	13259	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	81248199	81248547	81248259	Y	NA	ZCCHC24,EIF5AL1	ZCCHC24,PPIF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EIF5AL1	21810	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr10	81946319	81946704	81946639	Y	ANXA11	ANXA11	NA	NA	NA	NA	ANXA11	16624	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	81956011	81956585	81956252	Y	ANXA11	ANXA11,EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	6743	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	81959510	81960003	81959818	Y	TSPAN14,SH2D4B,ANXA11	ANXA11,EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	3325	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	81960969	81961796	81961521	Y	SH2D4B,ANXA11	ANXA11,EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	1532	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	81962798	81963579	81963388	Y	SH2D4B,ANXA11	EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	82169935	82170184	82170082	Y	NA	FAM213A,TSPAN14	NA	NA	NA	NA	FAM213A	4350	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	82214819	82214901	82214871	Y	TSPAN14	FAM213A,TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	2897	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	82215085	82215437	82215324	Y	TSPAN14,SH2D4B	FAM213A,TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	3163	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	82237584	82237869	82237663	Y	TSPAN14	TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	25662	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr10	82258642	82258780	82258737	Y	TSPAN14	TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	46720	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr10	82509932	82510235	82510106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	298010	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	83263081	83263396	83263238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	1051159	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr10	85324845	85324972	85324948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN2P8	514213	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	85609014	85609374	85609152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN2P8	229811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.878394592298031
chr10	86089822	86090305	86090054	Y	FAM190B	NA	NA	NA	NA	NA	GHITM	192626	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	88160011	88160294	88160175	Y	NA	GRID1	WAPAL	MCF7	ChIA-PET	22265404	GRID1	35761	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	88160347	88160841	88160714	Y	OPN4,GRID1	GRID1	WAPAL	MCF7	ChIA-PET	22265404	GRID1	36097	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	LDB3,BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.979799393336652
chr10	88471302	88471860	88471725	Y	LDB3,LDB3,LDB3	LDB3,BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	42547	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr10	88517208	88517667	88517486	Y	GLUD1,BMPR1A	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	2801	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.362105230104426
chr10	88804079	88804159	88804119	Y	NA	FAM35A,GLUD1	NA	NA	NA	NA	FAM35A	47759	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	88866849	88867228	88867039	Y	NA	FAM35A,GLUD1	NA	NA	NA	NA	GLUD1	14226	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr10	89500062	89500398	89500217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFL1P1	75287	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	89508472	89508835	89508628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFL1P1	66850	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr10	89519838	89520126	89519981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFL1P1	55559	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	89602886	89603081	89603056	Y	NA	CFL1P1,ATAD1,PTEN	NA	NA	NA	NA	ATAD1	3786	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr10	89864117	89864277	89864218	Y	NA	NA	PTEN,KLLN,RNLS	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-380G5.3	160858	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	89912666	89913039	89912909	Y	NA	NA	KLLN,PTEN,RNLS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-380G5.3	209407	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr10	90495559	90495751	90495657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAMBPL1	141740	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	90643265	90643581	90643488	Y	LIPK,FAS,STAMBPL1	STAMBPL1	ACTA2	IMR90	Hi-C	24141950	STAMBPL1	5774	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	90657069	90657527	90657362	Y	NA	STAMBPL1	NA	NA	NA	NA	STAMBPL1	19578	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr10	90689067	90689322	90689158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAMBPL1	51576	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	90711253	90711764	90711560	Y	LIPF,CH25H,ACTA2	FAS	NA	NA	NA	NA	FAS	36650	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	90753757	90754132	90754032	Y	NA	FAS	NA	NA	NA	NA	FAS	5343	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr10	91173615	91173677	91173627	Y	NA	IFIT1,LIPA,IFIT5	NA	NA	NA	NA	IFIT5	1272	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	91462035	91462111	91462091	Y	NA	KIF20B	NA	NA	NA	NA	KIF20B	2668	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	92690903	92691268	92691118	Y	NA	ANKRD1	ANKRD1,PCGF5	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD1	11870	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.346806520358281
chr10	92921990	92922253	92922075	Y	HECTD2	NA	ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PCGF5	55655	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.179322870082216
chr10	92928766	92928934	92928784	Y	NA	PCGF5	RPP30	IMR90	Hi-C	24141950	PCGF5	48974	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	92974122	92974225	92974155	Y	NA	PCGF5	NA	NA	NA	NA	PCGF5	3683	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	92975258	92975295	92975277	Y	NA	PCGF5	NA	NA	NA	NA	PCGF5	2613	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	93241945	93242217	93242081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HECTD2	73849	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	93254153	93254526	93254340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HECTD2	86057	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr10	93300438	93300742	93300617	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	90069	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.239212888630038
chr10	93301292	93301692	93301492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	89119	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr10	93364636	93364917	93364795	Y	NA	PPP1R3C	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	25894	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr10	93367671	93367850	93367762	Y	PPP1R3C	PPP1R3C	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	22961	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	93373148	93373298	93373228	Y	NA	PPP1R3C	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	17513	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	93373465	93373915	93373562	Y	PPP1R3C	PPP1R3C	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	16896	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.986910080833917
chr10	93432082	93432315	93432239	Y	NA	PPP1R3C	LOC100188947,HECTD2,TNKS2,RPP30,PPP1R3C	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1R3C	41271	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr10	93697836	93698042	93697939	Y	NA	FGFBP3,BTAF1	NA	NA	NA	NA	BTAF1	16310	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr10	93924948	93925271	93925064	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB3	123573	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	93991232	93991452	93991342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB3	57392	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.45076729753822
chr10	94353992	94354203	94354151	Y	MARCH5	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	2949	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr10	94367821	94367909	94367865	Y	CYP26C1,KIF11	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	16778	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	94516915	94517155	94517045	Y	HHEX,EXOC6	NA	EXOC6,KIF11,HHEX	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HHEX	70970	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr10	94520397	94520594	94520523	Y	NA	NA	EXOC6,HHEX	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EXOC6	68341	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr10	94608884	94609046	94608952	Y	NA	EXOC6	NA	NA	NA	NA	EXOC6	19949	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr10	95196959	95197603	95197264	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42471	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	95218561	95218998	95218660	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	21076	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr10	95222493	95222944	95222696	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	17130	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	95223953	95224101	95224023	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	15973	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr10	95224699	95224811	95224754	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	15263	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr10	95225325	95225770	95225711	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	14304	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.354647357045912
chr10	95226262	95226423	95226291	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	13651	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr10	95228207	95228553	95228471	Y	MYOF,CEP55,CEP55	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	11521	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.393935913897745
chr10	95675431	95675709	95675545	Y	NA	SLC35G1	NA	NA	NA	NA	SLC35G1	23701	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr10	95902105	95902214	95902160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCE1	150359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	97120063	97120328	97120194	Y	SORBS1	NA	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	71282	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	97239155	97239567	97239500	Y	SORBS1,SORBS1	NA	NA	NA	NA	NA	SORBS1	79604	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr10	97809134	97809259	97809196	Y	NA	CCNJ,ENTPD1-AS1	NA	NA	NA	NA	CCNJ	7983	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	98308552	98308827	98308687	Y	LCOR,C10orf12,ZNF518A,PIK3AP1,TM9SF3	NPM1P26,TM9SF3	NA	NA	NA	NA	NPM1P26	9115	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	98332019	98332237	98332217	Y	NA	NPM1P26,TM9SF3	NA	NA	NA	NA	TM9SF3	12972	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	99173709	99174019	99173866	Y	FRAT1,ZFYVE27,RRP12	RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16	PGAM1,RRP12,ZDHHC16,EXOSC1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PGAM1	9898	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	99334341	99334704	99334523	Y	NA	ANKRD2,HOGA1,PI4K2A	NA	NA	NA	NA	ANKRD2	4143	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr10	99449337	99449738	99449607	Y	C10orf28,RRP12,PI4K2A	AVPI1,MARVELD1,ZFYVE27	NA	NA	NA	NA	AVPI1	4257	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.421995248652249
chr10	99497485	99497673	99497579	Y	NA	MARVELD1,ZFYVE27	NA	NA	NA	NA	ZFYVE27	2607	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr10	100074404	100074582	100074525	Y	C10orf28,HPS1	NA	LOXL4,C10orf28,PYROXD2,HPS1,HPSE2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PYROXD2	98359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	100153138	100153356	100153248	Y	NA	PYROXD2	NA	NA	NA	NA	PYROXD2	19585	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	100153906	100154210	100154161	Y	NA	PYROXD2	NA	NA	NA	NA	PYROXD2	18731	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	101300631	101300706	101300670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A28	77660	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	101381465	101381554	101381515	Y	NA	SLC25A28,ENTPD7	NA	NA	NA	NA	SLC25A28	3099	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr10	101425049	101425416	101425233	Y	NA	SLC25A28,ENTPD7,CUTC	NA	NA	NA	NA	ENTPD7	7786	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr10	101475394	101475766	101475528	Y	NA	CUTC,COX15	NA	NA	NA	NA	COX15	14091	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.196967956948873
chr10	101537826	101537964	101537919	Y	ABCC2	COX15,ABCC2	NA	NA	NA	NA	ABCC2	2525	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.262699620625065
chr10	101539519	101539906	101539726	Y	NA	COX15,ABCC2	NA	NA	NA	NA	ABCC2	583	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.147265152209192
chr10	101543856	101543953	101543936	Y	COX15,ABCC2	ABCC2	NA	NA	NA	NA	ABCC2	3367	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.647908619095402
chr10	101666342	101666477	101666411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNMBP	101199	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	101736797	101737134	101736959	Y	BLOC1S2,BLOC1S2,DNMBP	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	30542	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr10	101765990	101766360	101766233	Y	NA	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	1316	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr10	101767938	101768201	101768028	Y	NA	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	101780024	101780319	101780173	Y	CUTC,WNT8B	DNMBP	DNMBP	MCF7	ChIA-PET	22265404	DNMBP	12348	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	101944283	101944461	101944347	Y	DNMBP,CWF19L1,CHUK,BLOC1S2,BLOC1S2,ERLIN1,ERLIN1	ERLIN1,CHUK,RP11-316M21.6	NA	NA	NA	NA	ERLIN1	1630	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	102030171	102030375	102030254	Y	SEC31B	CHUK,RP11-316M21.6,SNORA12,CWF19L1,BLOC1S2	NA	NA	NA	NA	CWF19L1	4734	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	102067493	102067821	102067631	Y	DNMBP,ERLIN1,ERLIN1,BLOC1S2,BLOC1S2	CWF19L1,BLOC1S2,SCD	NA	NA	NA	NA	BLOC1S2	23024	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr10	102130336	102130669	102130535	Y	NA	SCD,AL139819.1,LINC00263	NA	NA	NA	NA	LINC00263	703	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.27200075569343
chr10	102130783	102131327	102130955	Y	CWF19L1	SCD,AL139819.1,LINC00263	NA	NA	NA	NA	LINC00263	45	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr10	102284617	102284981	102284927	Y	NA	HIF1AN,SEC31B,NDUFB8	NA	NA	NA	NA	HIF1AN	1848	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr10	102284995	102285353	102285150	Y	NA	HIF1AN,SEC31B,NDUFB8	NA	NA	NA	NA	HIF1AN	1476	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr10	102792815	102793017	102792917	Y	NA	C10orf2,MRPL43,LZTS2,PDZD7,SFXN3,KAZALD1	NA	NA	NA	NA	SFXN3	3824	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.401237857406849
chr10	103124623	103124787	103124739	Y	FBXW4	BTRC	DPCD,POLL	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	12803	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	103124787	103125187	103124970	Y	NA	BTRC	DPCD,POLL	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	12967	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.230641902752041
chr10	103453403	103453880	103453587	Y	LDB1,BTRC,MGEA5	FBXW4	NA	NA	NA	NA	FBXW4	351	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr10	103656859	103657173	103657045	Y	NA	NA	MGEA5,LOC100289509,KCNIP2	IMR90	Hi-C	24141950	MGEA5	80163	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	103708018	103708327	103708173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf76	105623	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	103807032	103807259	103807146	Y	NA	C10orf76,HPS6	NA	NA	NA	NA	C10orf76	6691	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	103876632	103876931	103876782	Y	NA	LDB1,PPRC1,NOLC1	NA	NA	NA	NA	LDB1	1279	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	103877464	103877788	103877718	Y	MGEA5,TMEM180,SUFU,PSD,FBXL15,C10orf76,LDB1	LDB1,PPRC1,NOLC1	NA	NA	NA	NA	LDB1	422	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.972497449827549
chr10	104472705	104472855	104472743	Y	NA	ARL3,SFXN2	NA	NA	NA	NA	SFXN2	410	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	104473144	104473537	104473339	Y	NA	ARL3,SFXN2	NA	NA	NA	NA	SFXN2	849	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	104504643	104504897	104504711	Y	NA	ARL3,SFXN2	NA	NA	NA	NA	SFXN2	32348	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	104683249	104683568	104683410	Y	NA	CNNM2	NA	NA	NA	NA	CNNM2	7199	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr10	104769429	104769711	104769602	Y	INA	NA	NT5C2	IMR90	Hi-C	24141950	CNNM2	93379	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	104780741	104781119	104780930	Y	LOC729020,PDCD11	NA	NA	NA	NA	NA	CNNM2	104691	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr10	104838794	104839158	104838851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT5C2	111898	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr10	104909684	104910071	104909878	Y	NA	NT5C2	NA	NA	NA	NA	NT5C2	40985	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	104953975	104954222	104954115	Y	C10orf26,C10orf32,NT5C2	NT5C2	NA	NA	NA	NA	NT5C2	2919	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	104956992	104957240	104957082	Y	C10orf32,NT5C2	NT5C2	NA	NA	NA	NA	NT5C2	5936	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr10	104990991	104991184	104991120	Y	NA	NT5C2,INA	SFXN2,C10orf32-AS3MT,CYP17A1,NT5C2,CNNM2,LOC729020	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NT5C2	39935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr10	105000216	105000261	105000251	Y	NA	NT5C2,INA	INA,PCGF6,NT5C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INA	34659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	105001224	105001453	105001331	Y	C10orf32,NT5C2	INA	INA,PCGF6,NT5C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INA	33467	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.164024160336071
chr10	105001544	105001968	105001663	Y	C10orf32,NT5C2	INA	INA,PCGF6,NT5C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INA	32952	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr10	105014349	105014646	105014389	Y	NA	INA	NA	NA	NA	NA	INA	20274	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	105208274	105208534	105208404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD11	53869	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr10	105302775	105302952	105302862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD11	148370	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	105419490	105419843	105419666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	193458	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	105650011	105650288	105650237	Y	GSTO2,GSTO1,MEIR5,MEIR5,COL17A1,SLK	SH3PXD2A,OBFC1	SH3PXD2A	IMR90	Hi-C	24141950	OBFC1	25675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.592747132856467
chr10	105654409	105654593	105654518	Y	NA	SH3PXD2A,OBFC1	NA	NA	NA	NA	OBFC1	21370	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	105667994	105668449	105668210	Y	GSTO1,GSTO1,SLK	OBFC1	NA	NA	NA	NA	OBFC1	7514	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.241942229379666
chr10	105725440	105725838	105725745	Y	NA	OBFC1,SLK	NA	NA	NA	NA	SLK	481	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	106020526	106021193	106020581	Y	SLK,MEIR5,MEIR5,ITPRIP,CCDC147,GSTO1,GSTO1	WDR96,GSTO1,MIR4482-1,GSTO2	NA	NA	NA	NA	MIR4482-1	4984	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	106094943	106095283	106095247	Y	NA	ITPRIP	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	879	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	106096287	106096870	106096611	Y	SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147	ITPRIP	ITPRIP,GSTO1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ITPRIP	125	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	106109390	106109845	106109501	Y	SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147	ITPRIP	ITPRIP	K562	ChIA-PET	22265404	ITPRIP	13228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	108239646	108239791	108239719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWHAZP5	795566	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	109306918	109307188	109307036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWHAZP5	1862838	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	111981639	111982026	111981734	Y	ADD3,MXI1,MXI1	MXI1	SMNDC1	IMR90	Hi-C	24141950	MXI1	16276	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	112116359	112116685	112116467	Y	DUSP5,MXI1	NA	SMC3,DUSP5,SMNDC1,RBM20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMNDC1	53650	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	112155518	112156031	112155808	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	92809	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	112158460	112158738	112158533	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	95751	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr10	112159079	112159451	112159258	Y	NA	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	96145	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	112168008	112168205	112168118	Y	DUSP5	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	87391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	112170161	112170538	112170357	Y	DUSP5	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	85058	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr10	112174147	112174523	112174256	Y	SMC3,DUSP5	NA	DUSP5,SMC3,SMNDC1	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	81073	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.450940662146529
chr10	112174673	112174737	112174702	Y	NA	NA	SMC3,DUSP5,SMNDC1	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	80859	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr10	112186754	112186909	112186851	Y	SHOC2,DUSP5,BBIP1,BBIP1	NA	SMNDC1,DUSP5,SMC3	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	68687	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr10	112207134	112207519	112207380	Y	NA	DUSP5	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	48077	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	112215418	112215452	112215427	Y	NA	DUSP5	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	40144	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr10	112220227	112220521	112220467	Y	SMC3,DUSP5	DUSP5	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	35075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.372292443912568
chr10	112261043	112261328	112261185	Y	SHOC2,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	5447	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	112290201	112290297	112290249	Y	NA	DUSP5,SMC3	NA	NA	NA	NA	DUSP5	34605	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.185511700771837
chr10	112432258	112432673	112432308	Y	PDCD4	NA	PDCD4,LOC282997	IMR90	Hi-C	24141950	SMC3	106809	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr10	112533972	112534336	112534061	Y	PDCD4	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD4	95229	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr10	112617518	112617573	112617534	Y	ADRA2A,PDCD4	PDCD4,PDCD4-AS1	NA	NA	NA	NA	PDCD4	11992	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	112670931	112671385	112671330	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	5647	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr10	113639834	113639959	113639897	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAM	333176	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	113852369	113852641	113852488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAM	120494	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.61752079862391
chr10	113855611	113855893	113855723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAM	117242	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.62084270202346
chr10	114031765	114032053	114031942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAM	58630	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	114109921	114110133	114110011	Y	NA	ACSL5	NA	NA	NA	NA	ACSL5	21643	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18093909801236
chr10	114139786	114140040	114139910	Y	VTI1A,ACSL5,ACSL5	ACSL5	NA	NA	NA	NA	ACSL5	8010	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	114531236	114531374	114531260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	176635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	114707857	114707918	114707888	Y	NA	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	91	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	114718173	114718547	114718195	Y	NA	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	10164	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	114816164	114816362	114816263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	108155	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20353975126761
chr10	114818562	114818849	114818630	Y	HABP2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	110553	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.218455497384639
chr10	114823270	114823456	114823363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	115261	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr10	114847181	114847492	114847280	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	139172	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr10	114853789	114854299	114853993	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	145780	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	114859283	114859636	114859547	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	151274	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	115022033	115022434	115022235	Y	NA	NA	VTI1A	IMR90	Hi-C	24141950	TCF7L2	314024	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	115070178	115070533	115070251	Y	TCF7L2	NA	VTI1A	IMR90	Hi-C	24141950	TCF7L2	362169	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	115923622	115923898	115923760	Y	C10orf81	MIR2110,C10orf118	NA	NA	NA	NA	MIR2110	8040	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	116080506	116080782	116080645	Y	AFAP1L2	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf118	148527	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210997624326124
chr10	116255200	116255589	116255576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABLIM1	187173	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr10	116561110	116561522	116561275	Y	NA	FAM160B1	AFAP1L2,ABLIM1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM160B1	17981	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	116582671	116583074	116582920	Y	NA	FAM160B1	NA	NA	NA	NA	FAM160B1	3168	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.147265152209192
chr10	116726934	116727115	116726983	Y	NA	TRUB1	NA	NA	NA	NA	TRUB1	30982	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	117021659	117021668	117021663	Y	ATRNL1	NA	NA	NA	NA	NA	TRUB1	325707	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	118154890	118154986	118154939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA12A	345099	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr10	118714609	118714623	118714617	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1598	169474	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	118894357	118894681	118894572	Y	VAX1	KIAA1598	NA	NA	NA	NA	KIAA1598	10260	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	118922718	118922822	118922754	Y	VAX1	KIAA1598	NA	NA	NA	NA	KIAA1598	38621	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	119046334	119046783	119046648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD8	86195	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	119069713	119069747	119069730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD8	63231	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	120692616	120692979	120692798	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NANOS1	94249	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	120850460	120850786	120850708	Y	NA	EIF3A,FAM45A	EIF3A,PRDX3,SFXN4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM45A	10812	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	121030438	121030814	121030688	Y	GRK5	NA	NA	NA	NA	NA	GRK5	65337	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.499913317695843
chr10	121031141	121031480	121031339	Y	GRK5	NA	NA	NA	NA	NA	GRK5	66040	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	121045137	121045528	121045521	Y	GRK5	NA	NA	NA	NA	NA	GRK5	80036	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	121065390	121065964	121065436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRK5	100289	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.09377356337179
chr10	121075171	121075335	121075278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRK5	110070	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr10	121154195	121154697	121154651	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS10	145523	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	121249100	121249168	121249139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS10	51052	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr10	121412148	121412380	121412196	Y	BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	3266	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr10	121415317	121415432	121415359	Y	GRK5,BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	6435	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	121417930	121418047	121417978	Y	BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	9048	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr10	121544240	121544543	121544312	Y	NA	NA	MCMBP	IMR90	Hi-C	24141950	MCMBP	105525	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.239212888630038
chr10	121655971	121656303	121656057	Y	NA	MCMBP,SEC23IP	NA	NA	NA	NA	SEC23IP	5748	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	121682284	121682432	121682358	Y	NA	MCMBP,SEC23IP	NA	NA	NA	NA	SEC23IP	32061	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	121829686	121829950	121829715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACAP2	74465	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr10	123027203	123027438	123027321	Y	NA	NA	FGFR2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-159H3.1	135966	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	123526019	123526096	123526058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATE1-AS1	159731	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	123626359	123626403	123626376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATE1-AS1	59424	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	123873239	123873409	123873290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	126550	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.77864179725742
chr10	123900074	123900243	123900143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	153385	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr10	123900798	123900950	123900924	Y	TACC2	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	154109	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr10	124067478	124067825	124067684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA1	64387	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr10	124133234	124133500	124133290	Y	NA	PLEKHA1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA1	1022	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	124613518	124613778	124613722	Y	NA	FAM24B,RP11-564D11.3	NA	NA	NA	NA	FAM24B	23379	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	124636899	124637143	124637021	Y	NA	FAM24B,RP11-564D11.3	NA	NA	NA	NA	FAM24B	14	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	125730230	125730378	125730329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST15	120828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	125754916	125755682	125755196	Y	CHST15	NA	NA	NA	NA	NA	CHST15	95524	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.318591256054367
chr10	126212520	126212862	126212532	Y	NA	RPS10P18	NA	NA	NA	NA	RPS10P18	35373	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	126330634	126331273	126330949	Y	FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	99565	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	126349618	126349650	126349637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	81188	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	126359464	126359807	126359742	Y	ZRANB1,FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	71031	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	126429723	126430192	126430042	Y	FAM53B	FAM53B,METTL10	NA	NA	NA	NA	FAM53B	646	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	126445536	126445891	126445571	Y	ZRANB1	FAM53B,METTL10,FAM175B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	14698	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	126712433	126712623	126712473	Y	NA	NA	ZRANB1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-298J20.4	108721	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr10	126749212	126749581	126749525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTBP2	98158	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	126797219	126797324	126797258	Y	NA	NA	ZRANB1	IMR90	Hi-C	24141950	CTBP2	50415	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	126837951	126838191	126838020	Y	NA	CTBP2,MRPS21P6	NA	NA	NA	NA	CTBP2	9548	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	127432481	127432807	127432790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UROS	77010	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr10	127535706	127535819	127535763	Y	MMP21	UROS,BCCIP,RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	BCCIP	25591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	127574091	127574564	127574346	Y	NA	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	RNU2-42P	2683	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	127576052	127576450	127576389	Y	NA	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	RNU2-42P	797	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	127577281	127577575	127577428	Y	NA	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	RNU2-42P	34	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr10	127583558	127583978	127583747	Y	MMP21	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	FANK1	450	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr10	127591696	127592016	127591824	Y	NA	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	FANK1	8588	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	127821927	127822394	127822178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANK1	238819	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	128075178	128075883	128075417	Y	ADAM12	ADAM12,LINC00601	NA	NA	NA	NA	ADAM12	154	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	128258462	128258762	128258558	Y	NA	NA	FANK1,DHX32,ADAM12	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00601	150014	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	128592998	128593177	128593088	Y	NA	DOCK1	NA	NA	NA	NA	DOCK1	1020	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr10	129718681	129718836	129718759	Y	PTPRE,PTPRE	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	203813	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	129721316	129721687	129721518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	200962	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr10	129787766	129788203	129788000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	134446	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	129799058	129799270	129799164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	123379	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	129948422	129948582	129948473	Y	NA	MKI67	FAM196A,DOCK1,CLRN3,PTPRE,MKI67,GLRX3	IMR90	Hi-C	24141950	MKI67	25773	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	131164300	131164553	131164427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMT	98895	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	131436691	131436981	131436883	Y	MGMT	NA	NA	NA	NA	NA	MGMT	173243	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr10	132429890	132430021	132429956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLRX3	497227	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr10	133251588	133251750	133251630	Y	NA	NA	TCERG1L	IMR90	Hi-C	24141950	BNIP3	541685	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	133454610	133454819	133454663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BNIP3	338616	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	133742915	133743140	133742982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BNIP3	50295	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	133776164	133776302	133776237	Y	NA	BNIP3	NA	NA	NA	NA	BNIP3	17133	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	133793049	133793425	133793362	Y	NA	BNIP3	PPP2R2D	IMR90	Hi-C	24141950	BNIP3	10	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	133794080	133794414	133794353	Y	NA	BNIP3	PPP2R2D	IMR90	Hi-C	24141950	BNIP3	645	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	133879247	133879524	133879406	Y	NA	NA	BNIP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BNIP3	85812	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.286916501810459
chr10	134122010	134122092	134122081	Y	NA	STK32C,LRRC27	DPYSL4	IMR90	Hi-C	24141950	STK32C	21259	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.791175388186074
chr10	134124952	134125064	134125008	Y	NA	STK32C,LRRC27	DPYSL4,LRRC27,STK32C	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STK32C	18287	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr10	134208745	134209013	134208865	Y	NA	PWWP2B,RP11-432J24.2,C10orf91	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	73	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	134221496	134221692	134221620	Y	PWWP2B	PWWP2B,RP11-432J24.2,C10orf91	NA	NA	NA	NA	RP11-432J24.2	8895	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr10	134234707	134235257	134234764	Y	STK32C,PWWP2B	PWWP2B,RP11-432J24.2,C10orf91	C10orf91	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-432J24.2	4120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.400507708216482
chr10	134260341	134260546	134260485	Y	C10orf91	RP11-432J24.2,C10orf91	NA	NA	NA	NA	C10orf91	4510	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.67979297236011
chr10	134266616	134267060	134266753	Y	LRRC27,LRRC27,PWWP2B,INPP5A,C10orf92	RP11-432J24.2,C10orf91	NA	NA	NA	NA	C10orf91	10785	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr10	134330832	134331178	134331005	Y	NA	RP11-432J24.5,INPP5A	INPP5A,ADAM8,C10orf91	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-432J24.5	1137	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.301102098737121
chr10	134349556	134349919	134349753	Y	JAKMIP3,NKX6-2,C10orf92,INPP5A	RP11-432J24.5,INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	232	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	134368659	134369026	134368959	Y	PWWP2B,INPP5A	RP11-432J24.5,INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	19335	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr10	135072735	135073128	135072895	Y	TUBGCP2,ADAM8	ZNF511	NA	NA	NA	NA	ZNF511	46851	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr10	135074691	135075148	135074934	Y	TUBGCP2,ADAM8	ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ZNF511	44831	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.660095024462804
chr11	269337	269903	269511	Y	TMEM80,TALDO1,SIGIRR,DEAF1,IFITM2,IFITM1,ATHL1	PSMD13,SIRT3,RP11-326C3.2,ATHL1,IFITM2,IFITM1	NA	NA	NA	NA	RP11-326C3.2	15402	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	353403	353830	353519	Y	CEND1,B4GALNT4	IFITM2,IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3	SIRT3,RIC8A,SCGB1C1,ODF3,BET1L,PSMD13,NLRP6,ATHL1,IFITM1,SIGIRR,ANO9,PKP3,IFITM2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	B4GALNT4	13966	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	11072	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.8491019932425
chr11	364521	364678	364634	Y	NA	IFITM3,B4GALNT4,PKP3	ANO9,SIGIRR,B4GALNT4	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	3118	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr11	589256	589485	589371	Y	SIGIRR	RP11-496I9.1,RASSF7,C11orf35,MIR210HG,PHRF1,IRF7	NA	NA	NA	NA	PHRF1	14770	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	629192	629570	629436	Y	IRF7,IRF7,SCT,DRD4	IRF7	NA	NA	NA	NA	IRF7	15193	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	926738	926879	926801	Y	BRSK2,CEND1,AP2A2	CHID1,AP2A2	NA	NA	NA	NA	AP2A2	3844	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr11	1039894	1040259	1040094	Y	MUC6	MUC2	AP2A2	IMR90	Hi-C	24141950	MUC2	32616	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	1053255	1053594	1053287	Y	NA	MUC2	MUC5B,MOB2,AP2A2	IMR90	Hi-C	24141950	MUC2	19281	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	1073369	1073545	1073512	Y	DRD4,EFCAB4A	MUC2	NA	NA	NA	NA	MUC2	494	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.862748696990636
chr11	1144773	1145129	1144879	Y	NA	MUC5AC	MUC5B	MCF7	ChIA-PET	22265404	MUC5AC	4451	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	1147842	1148157	1148045	Y	NA	MUC5AC	MUC5B	MCF7	ChIA-PET	22265404	MUC5AC	1423	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.346806520358281
chr11	1228821	1229012	1228909	Y	NA	NA	MUC5B,TOLLIP,MOB2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MUC5AC	79241	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	1241085	1241212	1241149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOLLIP	87672	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	1328544	1328761	1328705	Y	DUSP8,TOLLIP,BRSK2	TOLLIP	NA	NA	NA	NA	TOLLIP	123	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	1357863	1358286	1357997	Y	TOLLIP,BRSK2	TOLLIP	TOLLIP,LOC255512	K562	ChIA-PET	22265404	TOLLIP	28979	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr11	1404202	1404317	1404259	Y	IFITM10,DUSP8	BRSK2	TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BRSK2	4812	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.190240233080725
chr11	1404403	1404794	1404637	Y	DUSP8,BRSK2	BRSK2	TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BRSK2	4335	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr11	1568333	1568421	1568379	Y	BRSK2,KRTAP5-3,DUSP8	DUSP8	NA	NA	NA	NA	DUSP8	22729	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	1569740	1569888	1569766	Y	TNNT3,TNNI2,TNNI2,DUSP8	DUSP8	NA	NA	NA	NA	DUSP8	21262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.693421784704722
chr11	1595832	1596187	1595959	Y	NA	DUSP8	NA	NA	NA	NA	DUSP8	4682	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	1768025	1768222	1768084	Y	IFITM10	RP11-295K3.1,CTSD,RPL36AP39	NA	NA	NA	NA	RP11-295K3.1	10059	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	1773349	1773482	1773395	Y	IFITM10	RP11-295K3.1,CTSD,RPL36AP39,AC139143.2	NA	NA	NA	NA	RP11-295K3.1	4799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	1793842	1794035	1793938	Y	TOLLIP,TNNI2,LSP1,CTSD,MOB2	RP11-295K3.1,CTSD,RPL36AP39,AC139143.2	MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2-AS1,INS-IGF2,IGF2	IMR90,MCF7,K562,H1ESC	Hi-C,3C,ChIA-PET,5C	24141950,19890323,22265404,22955621	CTSD	10620	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr11	1794819	1794975	1794880	Y	NA	RP11-295K3.1,CTSD,RPL36AP39,AC139143.2	MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2-AS1,INS-IGF2,IGF2,KRTAP5-5,KRTAP5-6,FAM99B	IMR90,MCF7,K562,H1ESC	Hi-C,3C,ChIA-PET,5C	24141950,19890323,22265404,22955621	CTSD	11597	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.40341086991904
chr11	1804182	1804577	1804353	Y	TOLLIP,TNNI2,LSP1	RP11-295K3.1,CTSD,RPL36AP39,AC139143.2	MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2,IGF2-AS1,INS-IGF2,KRTAP5-4,SYT8	IMR90,GM12878,H1ESC,HELA,K562,MCF7	Hi-C,5C,ChIA-PET	24141950,22955621,22265404	RPL36AP39	7206	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr11	1879618	1879880	1879749	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC139143.2	56293	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	1989837	1990190	1989954	Y	IGF2,TSSC4,TH,IGF2,IGF2	MRPL23,H19	NA	NA	NA	NA	MRPL23	23329	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	2008416	2008795	2008568	Y	NA	MRPL23,H19	NA	NA	NA	NA	H19	11905	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.344963258348431
chr11	2009660	2010154	2009976	Y	IGF2,IGF2,SYT8	MRPL23,H19	NA	NA	NA	NA	H19	10546	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr11	2238005	2238048	2238027	Y	NA	NA	KCNQ1	IMR90	Hi-C	24141950	IGF2	69172	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	2504772	2505160	2504942	Y	KCNQ1	KCNQ1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1	40858	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	2790402	2790588	2790507	Y	CDKN1C	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN1C	114523	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr11	2790945	2791119	2791011	Y	CDKN1C	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN1C	113992	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.292375183309713
chr11	2799950	2800256	2800114	Y	KCNQ1,CDKN1C	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN1C	104855	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr11	2847272	2847432	2847347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN1C	57679	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr11	2847671	2847794	2847733	Y	CDKN1C	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN1C	57317	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	2913617	2913951	2913751	Y	NA	CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	SLC22A18	5000	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.439640335518905
chr11	2919958	2920393	2920124	Y	KCNQ1	CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	SLC22A18	1007	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.710910942021968
chr11	2933631	2934118	2933874	Y	NA	CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	PHLDA2	14567	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr11	2951529	2951649	2951619	Y	KCNQ1,PHLDA2	CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	PHLDA2	2844	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr11	2988914	2989223	2989024	Y	MRGPRG,SLC22A18	PHLDA2,NAP1L4	NA	NA	NA	NA	NAP1L4	22384	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	3077664	3078057	3077925	Y	NA	RNU1-91P,CARS	NAP1L4	K562	ChIA-PET	22265404	CARS	821	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	3090855	3091125	3090991	Y	NA	RNU1-91P,CARS	NA	NA	NA	NA	CARS	14012	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr11	3443739	3443990	3443855	Y	NA	ZNF195	NA	NA	NA	NA	ZNF195	45291	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr11	3742975	3743362	3743342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP2	73592	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr11	3792611	3792742	3792677	Y	STIM1,RHOG,NUP98	PGAP2,NUP98	NA	NA	NA	NA	PGAP2	24212	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr11	3831146	3831197	3831172	Y	NA	PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1,MIR4687	NA	NA	NA	NA	NUP98	14124	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	3833340	3833454	3833393	Y	RRM1,NUP98,PGAP2,PGAP2,RHOG	PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1,MIR4687	NA	NA	NA	NA	NUP98	16318	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr11	3860220	3860837	3860518	Y	NA	PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1,MIR4687	NA	NA	NA	NA	RHOG	7	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	3880869	3881074	3880973	Y	NA	RHOG,STIM1,MIR4687	NA	NA	NA	NA	MIR4687	5577	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	4129900	4130200	4130091	Y	OR52M1,OR52K2,OR52K1,C11orf40,OR52I1	RRM1	NA	NA	NA	NA	RRM1	15963	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	4232015	4232345	4232181	Y	OR52M1,OR52K2,OR52K1,OR51D1,C11orf40,OR52I1	NA	OR52M1,TRIM68,OR52I1	IMR90	Hi-C	24141950	RRM1	118078	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr11	4413870	4414271	4414071	Y	OR52K2,TRIM21	TRIM21	NA	NA	NA	NA	TRIM21	944	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	4485531	4485899	4485569	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM21	72605	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	5301836	5302123	5301938	Y	HBB,HBD,HBG1,HBG2	NA	HBG1,HBG2	IMR90	Hi-C	24141950	OR51B5	60686	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	6224718	6224948	6224898	Y	TPP1,FAM160A2	FAM160A2	NA	NA	NA	NA	FAM160A2	28993	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr11	6240600	6240982	6240757	Y	TPP1,FAM160A2	FAM160A2	NA	NA	NA	NA	FAM160A2	12959	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	6489893	6490567	6490471	Y	OR56A4,OR56A1,OR56B4,OR52W1,OR2AG1,OR2AG2,OR10A5,OR10A4,OR10A2,OR6A2,DCHS1	TRIM3,ARFIP2	NA	NA	NA	NA	TRIM3	3122	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	6523174	6523531	6523244	Y	OR2D2	TRIM3,ARFIP2	NA	NA	NA	NA	ARFIP2	22508	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	6564206	6564247	6564227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRP8	58603	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	6699628	6699937	6699850	Y	OR52W1,OR10A4,OR10A2,OR6A2,OR2AG1,OR2AG2	MRPL17	NA	NA	NA	NA	MRPL17	2695	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	8607763	8607778	8607771	Y	ASCL3,STK33	STK33	NA	NA	NA	NA	STK33	6058	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	8723535	8723638	8723587	Y	STK33	RPL27A	NA	NA	NA	NA	RPL27A	21577	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	8889520	8889803	8889779	Y	ST5	ST5,AKIP1	NA	NA	NA	NA	ST5	40695	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	8935621	8935992	8935713	Y	RPL27A	ST5,AKIP1,TMEM9B-AS1,TMEM9B	NA	NA	NA	NA	AKIP1	4935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	8944739	8945112	8945060	Y	ASCL3	ST5,AKIP1,TMEM9B-AS1,TMEM9B	NA	NA	NA	NA	AKIP1	14053	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr11	8973817	8973979	8973898	Y	NA	ST5,AKIP1,TMEM9B-AS1,TMEM9B,NRIP3	C11orf16	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM9B-AS1	10243	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	8988846	8989081	8988967	Y	ZNF143,DENND5A,TMEM9B,NRIP3	TMEM9B-AS1,TMEM9B,NRIP3	NA	NA	NA	NA	TMEM9B	4288	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	9060824	9061053	9060961	Y	ZNF143,RPL27A,TMEM9B,NRIP3,DENND5A	NRIP3	NA	NA	NA	NA	NRIP3	37228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	9250767	9251109	9250945	Y	NA	DENND5A	NA	NA	NA	NA	DENND5A	33828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	9310546	9310889	9310715	Y	ZNF143,NRIP3,DENND5A,TMEM41B	DENND5A,TMEM41B	NA	NA	NA	NA	TMEM41B	23438	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	9385760	9386326	9386092	Y	ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7	IPO7	ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPO7	17843	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.943552036333268
chr11	9422844	9423055	9422950	Y	NRIP3,IPO7	IPO7,SNORA23	NA	NA	NA	NA	IPO7	18675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr11	9587499	9588027	9587720	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1	ZNF143,LOC644656	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	WEE1	5201	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr11	9590279	9590748	9590469	Y	WEE1,WEE1	WEE1	LOC644656,ZNF143	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	WEE1	2480	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr11	9635436	9636077	9635827	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1,SWAP70	WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WEE1	42208	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.522286936871387
chr11	9639557	9639822	9639717	Y	WEE1	WEE1,SWAP70	LOC283104,LOC440028,SBF2,SWAP70,ZNF143	IMR90	Hi-C	24141950	SWAP70	43802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr11	9686542	9686911	9686729	Y	ZNF143,SWAP70	SWAP70	NA	NA	NA	NA	SWAP70	2918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	9781782	9782109	9781859	Y	NA	SBF2-AS1	NA	NA	NA	NA	SBF2-AS1	3943	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	10246954	10247167	10247061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SBF2	66587	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	10323282	10323617	10323398	Y	NA	SBF2,RP11-351I24.1,ADM,AMPD3	NA	NA	NA	NA	RP11-351I24.1	31	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	10347188	10347587	10347388	Y	ADM	SBF2,RP11-351I24.1,ADM,AMPD3	NA	NA	NA	NA	AMPD3	19328	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	10373282	10373523	10373408	Y	ADM,AMPD3	ADM,AMPD3	SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104	IMR90	Hi-C	24141950	AMPD3	45422	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	10373632	10373924	10373723	Y	NA	ADM,AMPD3	SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104	IMR90	Hi-C	24141950	AMPD3	45772	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	10510755	10511001	10510868	Y	ZBED5	MTRNR2L8,RNF141,MRVI1-AS1	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L8	17722	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr11	10549004	10549441	10549205	Y	AMPD3,AMPD3,MRVI1,MRVI1,RNF141	MTRNR2L8,RNF141,MRVI1-AS1	NA	NA	NA	NA	RNF141	11336	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	10921943	10922208	10922068	Y	AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,EIF4G2,ZBED5	ZBED5,CTD-2003C8.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2003C8.2	3074	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr11	11774218	11774366	11774292	Y	NA	NA	GALNTL4	IMR90	Hi-C	24141950	USP47	86604	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr11	11998818	11999068	11999003	Y	MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	114475	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr11	12013824	12014110	12014066	Y	DKK3,DKK3,DKK3	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	99433	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	12065635	12065803	12065720	Y	NA	MICAL2	DKK3,MICAL2,USP47,CTR9,MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	47740	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	12101706	12102070	12101803	Y	DKK3,DKK3,PARVA,MICALCL,MICAL2	MICAL2	MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	11473	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	12111660	12111980	12111765	Y	NA	MICAL2	MICAL2,TEAD1,MICALCL,DKK3,USP47	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MICAL2	1563	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	12186762	12187077	12186920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	73219	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	12188567	12188982	12188726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	75024	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.332776852981029
chr11	12197316	12197738	12197633	Y	MICAL2,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	83773	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr11	12199343	12199732	12199431	Y	NA	NA	MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	85800	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	12309352	12309734	12309588	Y	TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	PARVA	86998	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr11	12697923	12698543	12698251	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	3954	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.478425777260077
chr11	12698857	12698926	12698896	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	4888	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.447481172206536
chr11	12701917	12702070	12702017	Y	TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	7948	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.38632211128982
chr11	12772830	12773175	12773002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	78861	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr11	12821812	12822118	12821851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	127843	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	12824175	12824668	12824395	Y	TEAD1	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	130206	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	12884715	12885004	12884787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	190746	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr11	13238046	13238305	13238120	Y	NA	NA	ARNTL,BTBD10,LOC100506305	IMR90	Hi-C	24141950	ARNTL	57894	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	13283262	13283494	13283392	Y	NA	ARNTL	ARNTL	IMR90	Hi-C	24141950	ARNTL	12705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr11	13299973	13300299	13300022	Y	FAR1,ARNTL	ARNTL	NA	NA	NA	NA	ARNTL	3774	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	13359856	13360227	13360061	Y	ARNTL	NA	NA	NA	NA	NA	ARNTL	63657	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.241942229379666
chr11	13373049	13373395	13373164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARNTL	76850	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	14354673	14355035	14354941	Y	NA	RRAS2	NA	NA	NA	NA	RRAS2	29017	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	14563953	14564333	14564143	Y	NA	COPB1,PSMA1	NA	NA	NA	NA	PSMA1	24063	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	14600110	14600431	14600207	Y	CYP2R1,PSMA1,PDE3B	NA	NA	NA	NA	NA	PSMA1	60220	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	14785995	14786323	14786008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE3B	122726	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	14874249	14874576	14874405	Y	CYP2R1	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	37222	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr11	14910529	14910668	14910599	Y	NA	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	1130	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	16762334	16762684	16762509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf58	129655	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	16819555	16819819	16819584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-466H18.1	174741	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	16945489	16945781	16945647	Y	NA	RP11-466H18.1	NA	NA	NA	NA	RP11-466H18.1	48779	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	17099866	17100401	17100030	Y	NA	SNORD14A,RPS13	NA	NA	NA	NA	RPS13	2532	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr11	17183931	17184277	17184104	Y	NA	PIK3C2A,NUCB2	NA	NA	NA	NA	PIK3C2A	43253	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	17230717	17231092	17230803	Y	NA	PIK3C2A,NUCB2	NA	NA	NA	NA	NUCB2	3017	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	17307346	17307410	17307378	Y	NA	NA	B7H6	IMR90	Hi-C	24141950	NUCB2	79646	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	17374298	17375700	17374969	Y	RPS13,B7H6	KCNJ11	NA	NA	NA	NA	KCNJ11	33178	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.546886781685897
chr11	18404883	18405218	18405078	Y	LDHA	LDHA,AC084117.3,LDHC	NA	NA	NA	NA	LDHA	8717	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr11	18405328	18405801	18405464	Y	HPS5,TSG101,SPTY2D1	LDHA,AC084117.3,LDHC	NA	NA	NA	NA	LDHA	8134	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr11	18426412	18426598	18426470	Y	NA	LDHA,AC084117.3,LDHC	NA	NA	NA	NA	AC084117.3	1256	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr11	18546072	18546398	18546234	Y	SPTY2D1,TSG101	RP11-613F22.5,TSG101	NA	NA	NA	NA	TSG101	381	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	18649925	18650050	18650045	Y	NA	UEVLD,SPTY2D1	NA	NA	NA	NA	SPTY2D1	4288	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr11	19649981	19650160	19650072	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	279710	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	19701731	19702025	19701818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	331460	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr11	19957110	19957424	19957380	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	425807	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	19968611	19968779	19968666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	414452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	20016658	20016921	20016770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	366310	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr11	20134058	20134420	20134284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	248811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	20618541	20618661	20618593	Y	NA	RP11-701I24.1	NA	NA	NA	NA	RP11-701I24.1	24809	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	26003639	26003950	26003795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2507G9.1	204720	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	27023421	27023808	27023612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC34	359607	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	27350498	27350718	27350608	Y	BDNF	CCDC34	NA	NA	NA	NA	CCDC34	32697	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	27419147	27419279	27419213	Y	NA	CCDC34	NA	NA	NA	NA	CCDC34	35732	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	27725050	27725226	27725138	Y	NA	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	16379	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	27739901	27740316	27740092	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	1289	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.544540404565385
chr11	27740535	27740662	27740569	Y	NA	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	943	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	27955713	27956134	27955920	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	RP11-1033A18.1	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1033A18.1	45133	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	27956455	27956618	27956527	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	RP11-1033A18.1	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1033A18.1	45875	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr11	28063321	28063497	28063482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL15	64298	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.225913370443154
chr11	28128920	28129110	28128941	Y	METTL15	METTL15,KIF18A	NA	NA	NA	NA	KIF18A	1065	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.145265960649932
chr11	28132530	28132826	28132694	Y	NA	METTL15,KIF18A	NA	NA	NA	NA	KIF18A	4675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr11	28588177	28588553	28588410	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	460322	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	28764751	28764902	28764829	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF,KIF18A,METTL15	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	636896	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	28792909	28793103	28792913	Y	NA	NA	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	665054	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	28853592	28853798	28853653	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	725737	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	28855204	28855664	28855372	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	727349	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	28857853	28858464	28857991	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	729998	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	29141601	29141895	29141706	Y	NA	NA	BDNF,BDNF-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	1013746	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	29321986	29322293	29322123	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	1194131	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	31489332	31489346	31489341	Y	NA	IMMP1L,ELP4	NA	NA	NA	NA	IMMP1L	39846	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	31630096	31630156	31630127	Y	PAX6	NA	NA	NA	NA	NA	ELP4	100799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	31693471	31693827	31693649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCN1	138112	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	32109882	32110285	32110029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAX6	272373	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	32728667	32728946	32728768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRRG4	120543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	32913428	32913828	32913453	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	704	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr11	32915475	32916456	32915913	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	2751	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.17530705190479
chr11	33096691	33097088	33096864	Y	NA	TCP11L1	NA	NA	NA	NA	TCP11L1	37728	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr11	33146392	33146678	33146610	Y	NA	CSTF3	NA	NA	NA	NA	CSTF3	35239	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	33181656	33182005	33181958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSTF3	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	33200855	33201201	33201029	Y	HIPK3	CSTF3	NA	NA	NA	NA	CSTF3	18938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr11	33313001	33313236	33313097	Y	NA	HIPK3	NA	NA	NA	NA	HIPK3	36783	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	33342450	33342853	33342574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK3	66232	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	33713598	33714029	33713919	Y	CD59	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	41962	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	33742880	33743486	33743237	Y	NA	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	12505	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	33778086	33778269	33778178	Y	FBXO3	CD59,FBXO3	NA	NA	NA	NA	FBXO3	15820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	34084271	34084310	34084291	Y	NA	CAPRIN1,NAT10	NA	NA	NA	NA	CAPRIN1	13041	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	34265315	34265482	34265399	Y	ABTB2	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-145M24.1	90068	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	34272631	34272979	34272746	Y	LMO2,LMO2,ABTB2	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-145M24.1	82571	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr11	34356172	34356320	34356246	Y	NA	RP1-145M24.1,ABTB2	NA	NA	NA	NA	RP1-145M24.1	622	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	34393112	34393337	34393189	Y	ABTB2	RP1-145M24.1,ABTB2	ABTB2,ELF5,NAT10,CAT	IMR90	Hi-C	24141950	ABTB2	15557	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.164407123965187
chr11	34426692	34426969	34426750	Y	ABTB2	ABTB2,CAT	ABTB2,NAT10,CAT	IMR90	Hi-C	24141950	CAT	31503	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	34622320	34622551	34622432	Y	ELF5,ELF5,EHF,EHF	NA	APIP,EHF,SLC1A2,ELF5,CD44	IMR90	Hi-C	24141950	CAT	163848	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	34661390	34661585	34661450	Y	ABTB2,ELF5,ELF5,EHF,EHF	NA	NA	NA	NA	NA	CAT	202918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	34676467	34676782	34676555	Y	ABTB2,ELF5,ELF5,CD44,EHF	NA	NA	NA	NA	NA	CAT	217995	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	34706877	34707176	34707110	Y	ABTB2,EHF	NA	NA	NA	NA	NA	PDHX	228200	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	34919844	34920223	34920054	Y	ELF5,EHF	PDHX,APIP	NA	NA	NA	NA	PDHX	15153	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	34931457	34931889	34931828	Y	NA	PDHX,APIP	NA	NA	NA	NA	PDHX	3487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr11	35029453	35029465	35029458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APIP	93407	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr11	35052236	35052689	35052493	Y	CD44	NA	SLC1A2,CD44,PDHX	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-607I7.1	104890	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.190240233080725
chr11	35053542	35053729	35053593	Y	CD44	NA	CD44,SLC1A2,PDHX	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-607I7.1	103850	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr11	35099118	35099616	35099383	Y	CD44	NA	CD44,PDHX,APIP,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-607I7.1	57963	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	35103874	35105511	35104330	Y	CD44	NA	CD44,PDHX,APIP,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-607I7.1	52068	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.767688656191047
chr11	35109319	35109885	35109545	Y	CD44	RP4-607I7.1,CD44	CD44,PDHX,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-607I7.1	47694	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	35180596	35180888	35180668	Y	CD44	RP4-607I7.1,CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	22179	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	35204984	35205337	35205050	Y	CD44	RP4-607I7.1,CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	46567	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	35296640	35296760	35296715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD44	138223	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	35297997	35298240	35298173	Y	CD44,SLC1A2,SLC1A2	NA	NA	NA	NA	NA	CD44	139580	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr11	35358493	35359078	35358891	Y	CD44	NA	NA	NA	NA	NA	SLC1A2	80532	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	35575444	35575679	35575584	Y	PAMR1,FJX1	NA	PAMR1,TRIM44,LDLRAD3,FJX1	IMR90	Hi-C	24141950	FJX1	62056	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	35880819	35881135	35880959	Y	NA	NA	FJX1,LDLRAD3,PRR5L,COMMD9,TRIM44,PAMR1	IMR90	Hi-C	24141950	LDLRAD3	82396	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	36442519	36442687	36442604	Y	COMMD9,PRR5L,PRR5L,TRAF6	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF6	87135	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	36521882	36522155	36522112	Y	NA	TRAF6	NA	NA	NA	NA	TRAF6	7667	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	38210456	38210607	38210524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf74	1596405	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	43569506	43569887	43569721	Y	C11orf96	HSD17B12	NA	NA	NA	NA	HSD17B12	6099	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	44239965	44240168	44240067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT2	124866	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	44326982	44327326	44327154	Y	ALX4	NA	NA	NA	NA	NA	EXT2	211883	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	44547557	44547712	44547661	Y	NA	CD82	EXT2,CHST1,ACCS,CD82,TSPAN18	IMR90	Hi-C	24141950	CD82	36265	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	45029715	45029834	45029778	Y	NA	NA	TP53I11,TSPAN18,PRDM11,LOC221122	IMR90	Hi-C	24141950	TP53I11	58875	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	45067583	45067753	45067679	Y	CD82	NA	SYT13,LOC221122,TP53I11,PRDM11,TSPAN18,CHST1	IMR90	Hi-C	24141950	TP53I11	96743	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	45201958	45202605	45202216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	231118	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.47698337028287
chr11	45255111	45255224	45255172	Y	CHST1,SYT13	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	284271	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	46022978	46023304	46023145	Y	NA	NA	GYLTL1B,MAPK8IP1,C11orf94,PEX16	IMR90	Hi-C	24141950	PEX16	84615	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	46058881	46059222	46059206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF21A	81763	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	46077131	46077462	46077208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF21A	63523	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	46135373	46135563	46135504	Y	PHF21A,AMBRA1	PHF21A	NA	NA	NA	NA	PHF21A	5422	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr11	46143609	46143973	46143928	Y	NA	PHF21A	NA	NA	NA	NA	PHF21A	2624	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.402506899775743
chr11	46258702	46259233	46258865	Y	DGKZ	NA	PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DGKZ	93222	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.9831212967362
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	NA	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DGKZ	87257	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.79103780164562
chr11	46270167	46270467	46270346	Y	CREB3L1	NA	CREB3L1,PHF21A,DGKZ	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DGKZ	81988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	46385171	46385493	46385285	Y	NA	DGKZ	NA	NA	NA	NA	DGKZ	32716	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	46412719	46412930	46412758	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKZ	60264	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	46444740	46444848	46444831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKZ	92285	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	46619183	46619437	46619308	Y	NA	AMBRA1,ATG13,HARBI1	AMBRA1	K562	ChIA-PET	22265404	AMBRA1	5508	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr11	46963806	46964041	46963934	Y	NA	LRP4,C11orf49	NA	NA	NA	NA	C11orf49	7566	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	47100313	47100604	47100460	Y	MADD,MADD,LRP4	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGAP2	96072	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr11	47108178	47108230	47108204	Y	HARBI1	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGAP2	88446	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	47173206	47173550	47173416	Y	NA	ARFGAP2,PACSIN3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP2	23126	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	47208524	47208884	47208580	Y	PACSIN3,PACSIN3,NR1H3	ARFGAP2,PACSIN3,DDB2	NA	NA	NA	NA	PACSIN3	2530	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.523173015611165
chr11	47215723	47215949	47215852	Y	NA	ARFGAP2,PACSIN3,DDB2	PACSIN3	MCF7	ChIA-PET	22265404	PACSIN3	9729	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr11	47226153	47226377	47226265	Y	NA	ARFGAP2,PACSIN3,DDB2,NR1H3,ACP2	DDB2,PACSIN3	MCF7	ChIA-PET	22265404	DDB2	8116	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	47252770	47253009	47252890	Y	NA	PACSIN3,DDB2,NR1H3,ACP2,MADD	NA	NA	NA	NA	NR1H3	14842	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	47395886	47396392	47396204	Y	MADD,FNBP4,CELF1,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1	SLC39A13,PSMC3	MYBPC3	IMR90	Hi-C	24141950	SLC39A13	30291	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	47414965	47416043	47415133	Y	MADD,MADD,MADD,FNBP4,CELF1,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1	SLC39A13,PSMC3	SPI1,SLC39A13	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC39A13	10640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	47421735	47422128	47421819	Y	MADD,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1	SLC39A13,PSMC3	SLC39A13	IMR90	Hi-C	24141950	SLC39A13	4555	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	47573563	47574025	47573747	Y	NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1	NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4	NA	NA	NA	NA	NDUFS3	10863	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.268541265753436
chr11	47787265	47787534	47787400	Y	SPI1,CELF1,CELF1,CELF1,PTPRJ,FNBP4	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	270	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	47789923	47790126	47789984	Y	NA	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	2928	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.36593024861463
chr11	47799022	47799247	47799135	Y	NA	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	12027	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	47867685	47867881	47867783	Y	OR4X1	NUP160	NA	NA	NA	NA	NUP160	226	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr11	47891173	47891544	47891408	Y	OR4C45,OR4B1,OR4C3,OR4X2,OR4S1	NUP160,RP11-793I11.1	PTPRJ,FNBP4	IMR90	Hi-C	24141950	NUP160	23066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.496070864126733
chr11	47939528	47939960	47939626	Y	OR4B1,OR4S1,NUP160	RP11-793I11.1	PTPRJ,NUP160	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-793I11.1	14369	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.83747237245715
chr11	47965488	47965599	47965552	Y	NA	RP11-793I11.1,PTPRJ	PTPRJ	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRJ	34514	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr11	47968538	47968912	47968651	Y	CELF1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	RP11-793I11.1,PTPRJ	PTPRJ	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPRJ	31201	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr11	48028073	48028508	48028179	Y	CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	PTPRJ	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	27960	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	48041550	48042058	48041874	Y	CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	PTPRJ	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	41437	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	48163334	48163507	48163430	Y	OR4C45,OR4B1,OR4X2,OR4S1,FNBP4,PTPRJ	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	163221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	57044676	57044864	57044770	Y	UBE2L6,SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3	TNKS1BP1	NA	NA	NA	NA	TNKS1BP1	45562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	57045764	57045851	57045815	Y	NA	TNKS1BP1	NA	NA	NA	NA	TNKS1BP1	44575	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr11	57242995	57243389	57243187	Y	OR5AK2,SSRP1,BTBD18,UBE2L6	SLC43A3,RTN4RL2	NA	NA	NA	NA	RTN4RL2	16973	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.244671570129293
chr11	57269501	57269878	57269690	Y	NA	RTN4RL2,TIMM10	RTN4RL2	IMR90	Hi-C	24141950	TIMM10	26398	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.333159816610145
chr11	57546018	57546724	57546105	Y	MED19,C11orf31	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	27303	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.149108414219042
chr11	58340867	58341571	58341167	Y	OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN	LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF	NA	NA	NA	NA	LPXN	2122	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr11	59323878	59323962	59323920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBP	57655	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr11	59537612	59537828	59537719	Y	PATL1,STX3	MRPL16	NA	NA	NA	NA	MRPL16	38517	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	60929738	60929978	60929839	Y	NA	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	2649	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	61074897	61075402	61075197	Y	CD6	DAK,DDB1	NA	NA	NA	NA	DAK	23280	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	61146248	61146454	61146376	Y	SLC15A3,VPS37C,DAGLA,CYBASC3,TMEM138,CYBASC3,SDHAF2,CPSF7,CPSF7	DAK,DDB1,TMEM138,TMEM216,CPSF7,SDHAF2	NA	NA	NA	NA	TMEM216	10705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	61266317	61266637	61266368	Y	LRRC10B	NA	NA	NA	NA	NA	SDHAF2	70803	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	61319246	61319400	61319342	Y	NA	SYT7	NA	NA	NA	NA	SYT7	27220	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.34645933479703
chr11	61456345	61456647	61456520	Y	CYBASC3,CPSF7,CPSF7,SDHAF2,FTH1,DAGLA	DAGLA	NA	NA	NA	NA	DAGLA	10440	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172595146214068
chr11	61463458	61463769	61463630	Y	CYBASC3,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,SDHAF2,FTH1,DAGLA	DAGLA	NA	NA	NA	NA	DAGLA	17553	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	61467819	61468013	61467906	Y	CYBASC3,SDHAF2,FTH1,DAGLA	DAGLA	NA	NA	NA	NA	DAGLA	21914	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr11	61523945	61524112	61524089	Y	INCENP,DAK,C11orf9	FEN1,TMEM258	NA	NA	NA	NA	FEN1	33997	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr11	61565191	61565522	61565357	Y	NA	FEN1,TMEM258,FADS1	NA	NA	NA	NA	TMEM258	6917	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.197698106139239
chr11	61627935	61628213	61628074	Y	NA	FADS1,FADS3	NA	NA	NA	NA	FADS3	29310	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	61738760	61739751	61739487	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	5628	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.369563103162941
chr11	61739990	61740514	61740301	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	6858	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.709294714091823
chr11	61742606	61743000	61742909	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	9474	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	61746281	61746413	61746325	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	13149	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr11	61780516	61780626	61780618	Y	NA	FTH1	FADS1,BEST1,FTH1,FADS3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	47384	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.760613746761648
chr11	61781118	61781313	61781282	Y	DAGLA,FTH1	FTH1	FADS1,BEST1,FTH1,FADS3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	47986	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.26150304708115
chr11	61792928	61793609	61793204	Y	DAGLA,FTH1	NA	FADS3,FADS2,FTH1,BEST1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	59796	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.32370275199237
chr11	61880097	61880151	61880125	Y	FADS2,FADS3,RAB3IL1	INCENP	FEN1,C11orf10,FADS3,BEST1,RAB3IL1,FADS2,DKFZP434K028,C11orf9,FADS1,FTH1,INCENP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INCENP	9294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208268283576497
chr11	62264935	62265137	62265063	Y	WDR74,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3	RP11-864I4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	46334	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	62272728	62273223	62272788	Y	ROM1	RP11-864I4.4,AHNAK	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	38248	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	62310227	62311393	62310863	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	78	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	62311446	62311797	62311501	Y	WDR74,STX5,NXF1,AHNAK	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr11	62312037	62312397	62312245	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	566	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.31586191530474
chr11	62320979	62321244	62321106	Y	NA	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	463	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.470584940572446
chr11	62321348	62321821	62321541	Y	NA	RP11-864I4.4,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr11	62413039	62413428	62413234	Y	NA	MTA2,ROM1,EML3,B3GAT3,GANAB,INTS5,METTL12,SNORA57,C11orf83,C11orf48,UBXN1,LRRN4CL	NA	NA	NA	NA	GANAB	935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	62441871	62442205	62442039	Y	NXF1	GANAB,INTS5,METTL12,SNORA57,C11orf83,C11orf48,UBXN1,LRRN4CL,BSCL2	NA	NA	NA	NA	UBXN1	2362	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	62588127	62588383	62588260	Y	NA	TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	STX5	9177	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	62624183	62624258	62624224	Y	NA	STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	SLC3A2	2665	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr11	62625165	62625549	62625272	Y	TUT1,METTL12,HNRNPUL2,SLC3A2	STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	SLC3A2	3647	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.601665304295715
chr11	63298876	63299223	63298998	Y	OTUB1,MARK2,RARRES3	RARRES3,HRASLS2	NA	NA	NA	NA	RARRES3	3058	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.259587316246322
chr11	63321382	63321591	63321464	Y	RARRES3,OTUB1	RARRES3,HRASLS2	NA	NA	NA	NA	HRASLS2	7264	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	63328335	63328557	63328446	Y	NA	RARRES3,HRASLS2	NA	NA	NA	NA	HRASLS2	298	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.155836138087189
chr11	63366734	63367020	63366890	Y	NA	HRASLS2,PLA2G16	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	15335	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	63639638	63639903	63639715	Y	NA	MARK2,RCOR2	NA	NA	NA	NA	MARK2	35238	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr11	63685258	63686079	63685609	Y	NA	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	2942	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.5175584045625
chr11	63705603	63705837	63705685	Y	NA	RCOR2,NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	NAA40	1172	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20353975126761
chr11	63744435	63744483	63744459	Y	KCNK4	NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	AP000721.4	4343	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr11	63775286	63775368	63775342	Y	KCNK4	COX8A,AP000721.4,OTUB1,RP11-21A7A.2	NA	NA	NA	NA	OTUB1	23961	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	63777072	63777136	63777104	Y	NA	COX8A,AP000721.4,OTUB1,RP11-21A7A.2	NA	NA	NA	NA	RP11-21A7A.2	24306	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	63795964	63796221	63796065	Y	NA	OTUB1,RP11-21A7A.2	NA	NA	NA	NA	RP11-21A7A.2	5221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	63822776	63822835	63822807	Y	NA	RP11-21A7A.2	NA	NA	NA	NA	RP11-21A7A.2	21334	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	63846659	63847077	63846694	Y	NA	RP11-21A7A.2	NA	NA	NA	NA	RP11-21A7A.2	45217	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	63858567	63858836	63858756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-21A7A.2	57125	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.657245532231631
chr11	63949132	63949273	63949224	Y	NA	MACROD1,STIP1,FERMT3,NUDT22,TRPT1,DNAJC4	NA	NA	NA	NA	STIP1	1471	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr11	64102702	64102834	64102750	Y	NA	ESRRA,TRMT112,PRDX5,CCDC88B,RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	CCDC88B	2861	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.736013901947139
chr11	64125464	64125650	64125510	Y	MARK2,NUDT22,FKBP2,PPP1R14B,PLCB3,BAD,ESRRA,TRMT112,PRDX5,CDC42BPG,RPS6KA4	TRMT112,PRDX5,CCDC88B,RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	RPS6KA4	844	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.534317412689378
chr11	64140304	64140795	64140552	Y	RCOR2,NAA40,GPR137,KCNK4,NRXN2,NRXN2,CDC42BPG	CCDC88B,RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	RPS6KA4	15684	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	64427372	64427588	64427564	Y	BATF2	NA	NA	NA	NA	NA	PYGM	98181	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	64625998	64626454	64626155	Y	CDC42EP2,RASGRP2,SF1,SF1,FAU,BATF2,EHD1	MEN1,CDC42BPG,EHD1	NA	NA	NA	NA	CDC42BPG	15957	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	65058176	65058598	65058417	Y	EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	21691	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr11	65059026	65059409	65059335	Y	EHD1,BATF2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	20880	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.356263584976056
chr11	65059737	65059988	65059827	Y	EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	20301	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.868363308039302
chr11	65075657	65076292	65075967	Y	EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2,TIGD3	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	3997	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.147265152209192
chr11	65083603	65083722	65083697	Y	NA	CDC42EP2,DPF2,TIGD3	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	3314	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	65121352	65121551	65121543	Y	NA	CDC42EP2,DPF2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8	NA	NA	NA	NA	TIGD3	1114	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	65151984	65152145	65152131	Y	NA	TIGD3,SLC25A45,NEAT1	NA	NA	NA	NA	FRMD8	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	SLC25A45,FRMD8,NEAT1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.39664827593309
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	SLC25A45,FRMD8,NEAT1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	5.55517843304667
chr11	65238917	65239096	65239037	Y	CDC42EP2,RELA,EHBP1L1,DKFZp761E198	MALAT1	TIGD3	K562	ChIA-PET	22265404	MALAT1	24137	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.620076318420604
chr11	65239550	65239870	65239751	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	MALAT1	TIGD3,SCYL1	K562	ChIA-PET	22265404	MALAT1	23363	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.74489720326858
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	9.91186212401438
chr11	65246279	65246484	65246387	Y	SCYL1,LTBP3,EFEMP2	MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	16749	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.653020115033406
chr11	65248969	65249218	65249208	Y	SNX32	MALAT1,SCYL1	FRMD8,SLC25A45,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	14015	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.421265099461882
chr11	65249962	65250245	65250146	Y	NA	MALAT1,SCYL1	FRMD8,SLC25A45,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	12988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.285803388990976
chr11	65252951	65253044	65253026	Y	NA	MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	10189	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.921681532268385
chr11	65254949	65255610	65255242	Y	NA	MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	7623	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.573102854430551
chr11	65256318	65257363	65256982	Y	NA	MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612,POLA2,DPF2,SLC25A45,TIGD3,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	5870	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.19423907254387
chr11	65257502	65257849	65257676	Y	NA	MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	5384	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr11	65259217	65259522	65259389	Y	NA	MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	3711	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.977225982136439
chr11	65259637	65259913	65259840	Y	SNX32,EFEMP2,DRAP1,C11orf68	MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	3320	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.235370435060929
chr11	65259930	65260851	65260542	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	2382	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.510100531503985
chr11	65261229	65261625	65261527	Y	CDC42EP2	MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	1608	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.64149366701532
chr11	65261988	65262329	65262152	Y	FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198	MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	904	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	65263684	65264604	65263856	Y	SNX32	MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	451	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	5.64008703810598
chr11	65273934	65274467	65274182	Y	NA	MALAT1,SCYL1,LTBP3	LTBP3,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	10701	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.359375889354799
chr11	65323331	65323567	65323509	Y	FOSL1	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1	NA	NA	NA	NA	LTBP3	834	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	65328084	65328375	65328271	Y	NA	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1	NA	NA	NA	NA	LTBP3	3683	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	65333490	65333816	65333671	Y	SLC25A45,SIPA1,SIPA1,EIF1AD,CTSW,PCNXL3	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3	NA	NA	NA	NA	SSSCA1	2085	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	65379476	65379605	65379541	Y	FAU,CAPN1,RNASEH2C,EFEMP2,CCDC85B,C11orf68,FAM89B,MAP3K11	SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	MAP3K11	1248	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	65419981	65420225	65420142	Y	CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	8340	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.379750316971083
chr11	65420425	65420654	65420491	Y	TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	7911	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.739126206325882
chr11	65492459	65492791	65492625	Y	NA	KAT5,RNASEH2C	RNASEH2C	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RNASEH2C	6041	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	65537213	65537543	65537499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNASEH2C	50795	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr11	65581703	65581968	65581801	Y	CDC42EP2,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,DKFZp761E198	MUS81,CFL1	NA	NA	NA	NA	MUS81	40629	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.47988607564081
chr11	65679250	65679576	65679373	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,RNASEH2C,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,RAB1B,KLC2,KLC2,KLC2,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1	FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	5012	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	65683105	65683625	65683322	Y	NA	FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	963	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.194968765389612
chr11	65739201	65739551	65739464	Y	NA	SART1,BANF1,EIF1AD	NA	NA	NA	NA	SART1	12041	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	65782974	65783337	65783107	Y	FOSL1	BANF1,EIF1AD,CATSPER1,SF3B2	NA	NA	NA	NA	CATSPER1	8651	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.14074702736185
chr11	65849089	65849462	65849117	Y	KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,SIPA1,RELA,DKFZp761E198,CTSW,PACS1	SF3B2,PACS1	NA	NA	NA	NA	PACS1	13255	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	65903912	65904457	65904250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PACS1	68078	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	66047866	66048291	66048031	Y	NA	KLC2,RAB1B,YIF1A,RP11-867G23.13	NA	NA	NA	NA	YIF1A	6350	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	66093813	66094193	66094103	Y	NA	YIF1A,RP11-867G23.13,RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8,SLC29A2	NA	NA	NA	NA	RIN1	8118	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr11	66094685	66094783	66094735	Y	CFL1,FIBP,DRAP1,YIF1A,CD248	YIF1A,RP11-867G23.13,RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8,SLC29A2	NA	NA	NA	NA	RIN1	7528	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.176210565703473
chr11	66118604	66119022	66118907	Y	NA	RP11-867G23.13,RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8,SLC29A2,RNU1-84P	NA	NA	NA	NA	RP11-867G23.8	5183	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	66374477	66374855	66374526	Y	NA	CTSF,CCS,CCDC87,RNU4-39P,RBM14,RBM14-RBM4,RBM4	RBM14-RBM4	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-39P	5706	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	66487767	66487982	66487867	Y	NA	RBM4B,C11orf80	NA	NA	NA	NA	C11orf80	21940	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr11	66494345	66494720	66494567	Y	NA	C11orf80	C11orf80	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	C11orf80	15202	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr11	66494780	66495327	66494982	Y	SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2	C11orf80	C11orf80	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	C11orf80	14595	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.982528734086282
chr11	66511038	66511198	66511076	Y	KLC2,KLC2,KLC2,CNIH2,RBM4B,SPTBN2	C11orf80	NA	NA	NA	NA	C11orf80	1116	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr11	66659730	66659912	66659812	Y	CLCF1,RBM4	LRFN4	NA	NA	NA	NA	LRFN4	37612	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr11	66687548	66687652	66687598	Y	CARNS1	PC	NA	NA	NA	NA	PC	36195	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	66717584	66717809	66717709	Y	CLCF1,ADRBK1	PC,C11orf86	NA	NA	NA	NA	PC	6038	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr11	66738286	66738892	66738415	Y	POLD4,CLCF1,CLCF1,KDM2A,ADRBK1	PC,C11orf86,SYT12	PC,SYT12,RHOD	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C11orf86	1856	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.246670761688553
chr11	66801218	66801427	66801323	Y	SYT12,SYT12	SYT12,RHOD	NA	NA	NA	NA	RHOD	20862	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	66844888	66845141	66844944	Y	RHOD	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	22599	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.331160625050885
chr11	66845381	66845631	66845497	Y	TMEM134,SSH3,RHOD	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	23092	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.484770537499109
chr11	66845907	66846062	66845990	Y	PITPNM1,CLCF1,CLCF1,RBM4,KDM2A,ADRBK1,RHOD	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	23618	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.754772101633278
chr11	66849173	66849303	66849226	Y	NA	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	26884	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr11	67028976	67029390	67029158	Y	NA	ADRBK1,ANKRD13D,SSH3	NA	NA	NA	NA	ADRBK1	2491	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	67037275	67037527	67037373	Y	TBC1D10C,RAD9A,PITPNM1,KDM2A,ADRBK1,ANKRD13D	ADRBK1,ANKRD13D,SSH3	NA	NA	NA	NA	ADRBK1	5394	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr11	67105994	67106296	67106145	Y	NA	SSH3,POLD4,AP003419.11	NA	NA	NA	NA	POLD4	16147	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr11	67121988	67122388	67122127	Y	POLD4,CLCF1	POLD4,AP003419.11,RAD9A	NA	NA	NA	NA	POLD4	55	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	67138301	67138677	67138619	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	378	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	67138852	67139479	67139267	Y	NA	POLD4,RAD9A,CARNS1,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr11	67139742	67140272	67140082	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	687	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.83724579472207
chr11	67146992	67147327	67147282	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA,RPS6KB2	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	7937	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.434181654019651
chr11	67253659	67253853	67253760	Y	PTPRCAP,NUDT8,AIP	CORO1B,TMEM134,AIP,PITPNM1,CDK2AP2	NA	NA	NA	NA	AIP	5147	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.241942229379666
chr11	67270751	67271055	67270865	Y	NA	TMEM134,AIP,PITPNM1,CDK2AP2	NA	NA	NA	NA	PITPNM1	679	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr11	67827034	67827402	67827396	Y	PPP6R3,ACY3,SUV420H1,CHKA	NDUFS8,TCIRG1	NA	NA	NA	NA	TCIRG1	22551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	67895703	67896078	67896017	Y	CHKA	CHKA	CHKA,SUV420H1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHKA	8792	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	68121765	68121884	68121804	Y	ALDH3B1,C11orf24	LRP5	NA	NA	NA	NA	LRP5	43688	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	68238826	68238975	68238901	Y	TCIRG1,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,IGHMBP2,PPP6R3	PPP6R3	NA	NA	NA	NA	PPP6R3	12640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr11	68608164	68608616	68608368	Y	NA	CPT1A	NA	NA	NA	NA	CPT1A	1262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.180053019272583
chr11	68611298	68611611	68611498	Y	NA	CPT1A	NA	NA	NA	NA	CPT1A	1420	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.332776852981029
chr11	68714020	68714198	68714127	Y	NA	MRPL21,IGHMBP2	NA	NA	NA	NA	IGHMBP2	44710	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	68722813	68723020	68722901	Y	TPCN2	NA	NA	NA	NA	NA	IGHMBP2	53503	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	68775199	68775469	68775336	Y	NA	TPCN2	MRGPRD	IMR90	Hi-C	24141950	TPCN2	38896	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	68776292	68776545	68776410	Y	MRGPRF	TPCN2	MRGPRD	IMR90	Hi-C	24141950	TPCN2	37820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr11	68778534	68778789	68778694	Y	MRGPRF	TPCN2	NA	NA	NA	NA	TPCN2	35576	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr11	68819125	68819319	68819197	Y	MRGPRD,TPCN2	TPCN2	NA	NA	NA	NA	TPCN2	4760	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	68823741	68823941	68823814	Y	IGHMBP2,TPCN2	TPCN2	NA	NA	NA	NA	TPCN2	9376	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	68829234	68829348	68829304	Y	NA	TPCN2	NA	NA	NA	NA	TPCN2	14869	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	69069179	69069344	69069260	Y	TPCN2	MYEOV	NA	NA	NA	NA	IFITM9P	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	69069522	69069665	69069598	Y	TPCN2	MYEOV,IFITM9P	NA	NA	NA	NA	IFITM9P	248	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	69235389	69235576	69235517	Y	NA	NA	MYEOV,ORAOV1,CCND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFITM9P	166115	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr11	69251942	69252241	69252024	Y	NA	NA	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFITM9P	182668	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	69451342	69451588	69451394	Y	NA	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	2267	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.1996972976985
chr11	69453520	69454472	69453912	Y	NA	ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.159295628027183
chr11	69639961	69640299	69640038	Y	NA	NA	FGF3	K562	ChIA-PET	22265404	FGF19	122551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.408695730465364
chr11	69794643	69794820	69794756	Y	FADD,ANO1	RP11-626H12.1	ANO1,ORAOV1,FGF4,FADD	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-626H12.1	35162	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr11	69795546	69795838	69795683	Y	ANO1	RP11-626H12.1	ANO1,ORAOV1,FGF4,FADD	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-626H12.1	34144	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	70079442	70079825	70079633	Y	ANO1,CTTN,FADD,PPFIA1	FADD,PPFIA1	FADD,PPFIA1,ORAOV1,ANO1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FADD	32173	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	70162610	70162835	70162663	Y	PPFIA1	PPFIA1	NA	NA	NA	NA	PPFIA1	47804	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	70245269	70246141	70245676	Y	ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN	CTTN,AP000487.5	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	2675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.45493904526505
chr11	71493756	71493898	71493829	Y	NA	FAM86C1	NA	NA	NA	NA	FAM86C1	2658	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	71650610	71650763	71650692	Y	NA	RP11-849H4.2,RNF121	NUMA1,IL18BP	IMR90	Hi-C	24141950	RNF121	12863	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr11	71704625	71704847	71704670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF121	66878	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	71769812	71769929	71769891	Y	NA	LRTOMT,NUMA1,LAMTOR1	NA	NA	NA	NA	LRTOMT	19453	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	71936800	71937067	71937009	Y	INPPL1	FOLR1,INPPL1	NA	NA	NA	NA	INPPL1	4055	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	71990969	71991411	71991180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPPL1	58224	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	72003135	72003262	72003223	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPPL1	70390	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	72068743	72068761	72068752	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLPB	74931	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	72194831	72195144	72194991	Y	ARAP1,IL18BP,IL18BP	NA	PDE2A,ARAP1,NUMA1,CLPB	IMR90	Hi-C	24141950	CLPB	51139	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	72348117	72348448	72348274	Y	NA	PDE2A	NA	NA	NA	NA	PDE2A	35187	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	72381210	72381586	72381345	Y	NA	PDE2A	NA	NA	NA	NA	PDE2A	2049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	72426186	72426236	72426211	Y	ATG16L2,ARAP1	PDE2A	NA	NA	NA	NA	PDE2A	42551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	72449101	72449742	72449392	Y	P2RY2,P2RY2,FCHSD2,ATG16L2,PDE2A,ARAP1,ARAP1	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP1	52902	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	72452508	72452870	72452656	Y	STARD10,ATG16L2,ARAP1	ARAP1,STARD10	NA	NA	NA	NA	ARAP1	49774	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	72854261	72854849	72854638	Y	PDE2A,ARAP1,ATG16L2,RELT,RELT,FCHSD2	FCHSD2	NA	NA	NA	NA	FCHSD2	2955	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	72909664	72909952	72909864	Y	RELT,RELT,P2RY2,P2RY2	P2RY2	FCHSD2,ATG16L2,P2RY6,ARAP1,RELT	IMR90	Hi-C	24141950	P2RY2	17391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	72968455	72968625	72968568	Y	NA	P2RY2,ARHGEF17	P2RY6	MCF7	ChIA-PET	22265404	P2RY2	41112	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	73036125	73036359	73036193	Y	NA	ARHGEF17,RELT	NA	NA	NA	NA	ARHGEF17	18791	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	73088357	73088912	73088439	Y	NA	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	3048	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.51371595099339
chr11	73490242	73490316	73490279	Y	NA	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	6045	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr11	73490470	73490918	73490608	Y	UCP2	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	5443	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.720212077090332
chr11	73729347	73729733	73729506	Y	NA	UCP2	NA	NA	NA	NA	UCP2	36995	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	73736954	73737107	73737038	Y	NA	UCP2	NA	NA	NA	NA	UCP2	44602	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	73860209	73860535	73860372	Y	C2CD3	PPME1,C2CD3	NA	NA	NA	NA	PPME1	19609	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	73989657	73990002	73989928	Y	NA	NA	PPME1	IMR90	Hi-C	24141950	C2CD3	109402	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	74314500	74314859	74314680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLD3	111604	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	74382761	74383066	74382912	Y	NA	NA	POLD3,CHRDL2,RNF169	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-864N7.2	72093	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	74465903	74466299	74466070	Y	POLD3,RNF169	RP11-864N7.2,RNF169	XRRA1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF169	7990	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.529744809929902
chr11	74534779	74535147	74534795	Y	XRRA1,RNF169	NA	NA	NA	NA	NA	RNF169	76866	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	74565092	74565468	74565281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRRA1	92777	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr11	74608675	74608873	74608772	Y	NA	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	49372	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	74609863	74609988	74609926	Y	NA	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	48257	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	74857404	74857707	74857556	Y	SLCO2B1	NA	NA	NA	NA	NA	NEU3	160225	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	75060567	75060771	75060596	Y	NA	ARRB1,RPS3	NA	NA	NA	NA	ARRB1	102	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	75061558	75062072	75061823	Y	NA	ARRB1,RPS3	NA	NA	NA	NA	ARRB1	685	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	75248214	75248465	75248264	Y	UVRAG	GDPD5,SERPINH1	GDPD5,RPS3,KLHL35,SERPINH1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GDPD5	13266	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.423994440211509
chr11	75265416	75265853	75265464	Y	SERPINH1	GDPD5,SERPINH1	RPS3,GDPD5,KLHL35	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINH1	5248	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	75491254	75491442	75491286	Y	UVRAG,DGAT2	DGAT2,UVRAG,RP11-535A19.2	NA	NA	NA	NA	DGAT2	22697	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	75537561	75537829	75537710	Y	ARRB1,DGAT2,UVRAG	UVRAG,RP11-535A19.2	NA	NA	NA	NA	RP11-535A19.2	13110	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	75538796	75538953	75538875	Y	NA	UVRAG,RP11-535A19.2	NA	NA	NA	NA	RP11-535A19.2	14345	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	75883349	75883640	75883491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIR	206375	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	75919893	75920246	75919996	Y	WNT11	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIR	169769	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.64373687136857
chr11	75920696	75920900	75920748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIR	169115	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.497914126136583
chr11	75945169	75945568	75945242	Y	NA	NA	C11orf30,MAP6,UVRAG,WNT11,PRKRIR,GUCY2E,DGAT2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKRIR	144447	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.612235481732973
chr11	75946013	75946323	75946187	Y	NA	NA	C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKRIR	143692	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.260700429065805
chr11	75946917	75947052	75946991	Y	NA	NA	C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKRIR	142963	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr11	76389498	76389665	76389572	Y	ACER3	LRRC32	NA	NA	NA	NA	LRRC32	9707	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	76463883	76464042	76463970	Y	NA	RP11-21L23.4,TSKU,RP11-21L23.3	ACER3,TSKU,B3GNT6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-21L23.4	13225	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.990369570773911
chr11	76480789	76480971	76480905	Y	NA	RP11-21L23.4,TSKU,RP11-21L23.3	B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-21L23.4	3522	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.75019995521843
chr11	76510532	76510646	76510589	Y	NA	RP11-21L23.4,TSKU,RP11-21L23.3	NA	NA	NA	NA	RP11-21L23.3	18426	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr11	76534548	76534939	76534880	Y	GDPD4	TSKU,RP11-21L23.3,ACER3	ACER3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACER3	34972	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	76802149	76802401	76802277	Y	NA	CAPN5	NA	NA	NA	NA	CAPN5	26170	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	77271215	77271363	77271291	Y	NA	NA	MYO7A,GDPD4,CAPN5,PAK1,AQP11	IMR90	Hi-C	24141950	CLNS1A	75487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	77445522	77445800	77445629	Y	NA	FTH1P16	NA	NA	NA	NA	FTH1P16	1451	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	77696711	77696891	77696801	Y	NA	INTS4	C11orf67,RSF1	IMR90	Hi-C	24141950	INTS4	6833	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr11	77751153	77751354	77751183	Y	NA	INTS4,NDUFC2-KCTD14,NDUFC2	NA	NA	NA	NA	NDUFC2-KCTD14	37557	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.860905434980785
chr11	77762280	77762565	77762352	Y	NA	NDUFC2-KCTD14,NDUFC2	NA	NA	NA	NA	NDUFC2-KCTD14	26346	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr11	77837663	77837947	77837805	Y	NA	NDUFC2-KCTD14,NDUFC2,ALG8,KCTD21-AS1	NA	NA	NA	NA	ALG8	10759	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	77960482	77960781	77960725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	62614	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	78001305	78001608	78001428	Y	GAB2,GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	103437	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	78051625	78051814	78051807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	75580	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	78091808	78092073	78091933	Y	GAB2,GAB2	GAB2	NA	NA	NA	NA	GAB2	35321	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	78777919	78778268	78778094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	494000	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	79794635	79795000	79794859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	1510716	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr11	80411023	80411358	80411196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-742N3.1	1987213	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr11	82610096	82610395	82610239	Y	PCF11,ANKRD42,RAB30	C11orf82	NA	NA	NA	NA	C11orf82	1079	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	82781050	82781223	82781203	Y	NA	RAB30	NA	NA	NA	NA	RAB30	85	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	82805889	82806270	82806080	Y	NA	RAB30	NA	NA	NA	NA	RAB30	24924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	83066489	83066617	83066521	Y	NA	NA	DLG2	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC90B	71039	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	83278002	83278167	83278160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP003026.1	111746	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.317130957673633
chr11	83291402	83291636	83291613	Y	DLG2	NA	NA	NA	NA	NA	AP003026.1	125146	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	83312125	83312420	83312330	Y	DLG2	NA	NA	NA	NA	NA	AP003026.1	145869	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr11	85046447	85046583	85046515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM126B	291046	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	85047149	85047448	85047300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM126B	290181	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	85702937	85703343	85703240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PICALM	75581	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	85757330	85757451	85757391	Y	NA	PICALM	NA	NA	NA	NA	PICALM	21473	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	85802534	85802824	85802626	Y	NA	PICALM	PICALM	IMR90	Hi-C	24141950	PICALM	23610	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	85862564	85862776	85862631	Y	NA	NA	PICALM,EED,CCDC83	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PICALM	83640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	85873395	85873578	85873505	Y	PICALM,PICALM	NA	PICALM,EED,CCDC83	IMR90	Hi-C	24141950	EED	80008	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr11	85874366	85874506	85874420	Y	PICALM,PICALM	NA	PICALM,EED,CCDC83	IMR90	Hi-C	24141950	EED	79080	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr11	85884942	85885680	85885222	Y	NA	NA	PICALM,CCDC83,EED,C11orf73	IMR90	Hi-C	24141950	EED	67906	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.350804903476802
chr11	85887618	85887919	85887680	Y	PICALM,PICALM	NA	PICALM,CCDC83,EED,C11orf73	IMR90	Hi-C	24141950	EED	65667	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr11	85888378	85888509	85888438	Y	PICALM,PICALM	NA	PICALM,CCDC83,EED,C11orf73	IMR90	Hi-C	24141950	EED	65077	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	85894125	85894474	85894278	Y	PICALM,PICALM	NA	PICALM,EED,C11orf73,CCDC83,SYTL2	IMR90	Hi-C	24141950	EED	59112	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.460397726764304
chr11	85913184	85913318	85913234	Y	PICALM,PICALM	EED	PICALM,CCDC83,EED	IMR90	Hi-C	24141950	EED	40268	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	85929463	85929753	85929608	Y	NA	EED	PICALM,CCDC83,EED,SYTL2	IMR90	Hi-C	24141950	EED	23833	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	86178922	86179317	86178974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf73	167669	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	86185128	86185335	86185247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf73	173875	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	86195168	86195425	86195393	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf73	183915	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	86262463	86262643	86262563	Y	FZD4	NA	NA	NA	NA	NA	PRSS23	237458	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	86355497	86355659	86355578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRSS23	144442	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	86447030	86447398	86447213	Y	NA	NA	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	52703	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.414537375593734
chr11	86451588	86451883	86451813	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	48218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	86454484	86454767	86454607	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	45334	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.313132574555112
chr11	86454778	86455149	86454967	Y	PRSS23	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	44952	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.237213697070778
chr11	86514557	86514754	86514624	Y	NA	PRSS23	NA	NA	NA	NA	PRSS23	14456	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr11	86514780	86515120	86515008	Y	NA	PRSS23	NA	NA	NA	NA	PRSS23	14679	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	86527382	86527750	86527626	Y	FZD4,PRSS23	PRSS23	NA	NA	NA	NA	PRSS23	27281	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	86631607	86631965	86631913	Y	ME3,ME3,ME3,TMEM135,FZD4	FZD4,RP11-736K20.6	ME3	IMR90	Hi-C	24141950	FZD4	32468	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	86664236	86664677	86664307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FZD4,RP11-736K20.6	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	88041244	88041443	88041379	Y	NA	CTSC	NA	NA	NA	NA	CTSC	27512	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	88071526	88071793	88071707	Y	NA	CTSC	NA	NA	NA	NA	CTSC	2571	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.641180895227254
chr11	88288248	88288652	88288406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTSC	219293	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	89114362	89114730	89114405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHORDC1	839802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	92083144	92083535	92083339	Y	FAT3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC36A4	845595	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	93343191	93343552	93343372	Y	NA	KIAA1731	NA	NA	NA	NA	KIAA1731	49253	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	93446176	93446355	93446266	Y	NA	SCARNA9,SNORD5,C11orf54	NA	NA	NA	NA	SCARNA9	6324	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr11	93863761	93864262	93864073	Y	MED17,FUT4,PANX1	PANX1	NA	NA	NA	NA	PANX1	3667	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	94480491	94481212	94480556	Y	AMOTL1	AMOTL1	AMOTL1,PIWIL4	IMR90	Hi-C	24141950	AMOTL1	42894	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.124891533033648
chr11	95525355	95525734	95525518	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	3782	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr11	95557234	95557451	95557366	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	35661	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210997624326124
chr11	95610217	95610530	95610374	Y	NA	MTMR2	NA	NA	NA	NA	MTMR2	45949	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	95976157	95976737	95976478	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	97607	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr11	95982466	95982894	95982863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	91450	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	95990308	95990455	95990418	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	83889	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	95995362	95995593	95995538	Y	FAM76B,MAML2	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	78751	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	96040167	96040456	96040282	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	33888	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	96047326	96047750	96047695	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	26594	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr11	97538549	97538882	97538714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JRKL	1417396	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	98114746	98115057	98114904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JRKL	1993593	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	102042993	102043398	102043047	Y	C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1	63801	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.313132574555112
chr11	102176886	102177264	102177169	Y	NA	BIRC3,BIRC2	MMP7,BIRC2,BIRC3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BIRC3	8951	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr11	102177495	102177798	102177653	Y	BIRC3	BIRC3,BIRC2	MMP7,BIRC2,BIRC3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BIRC3	8417	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr11	102189237	102189699	102189428	Y	TMEM123,BIRC3,BIRC2	BIRC3,BIRC2	NA	NA	NA	NA	BIRC3	3022	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr11	102189714	102190108	102189945	Y	BIRC3,BIRC2	BIRC3,BIRC2	NA	NA	NA	NA	BIRC3	3499	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	102216514	102216961	102216815	Y	TMEM123,BIRC3,BIRC2	BIRC3,BIRC2	NA	NA	NA	NA	BIRC2	572	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	102297400	102297813	102297636	Y	BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123	TMEM123	BIRC2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM123	41302	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	102678364	102678503	102678434	Y	NA	MMP1,MMP3	NA	NA	NA	NA	MMP1	11473	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	102867069	102867245	102867157	Y	NA	NA	MMP13,DCUN1D5,MMP3	IMR90	Hi-C	24141950	DCUN1D5	93699	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	102956908	102957200	102957055	Y	NA	DCUN1D5,DYNC2H1	NA	NA	NA	NA	DCUN1D5	3744	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	104838372	104838510	104838471	Y	CARD17,CASP5,CARD16,CASP4,CASP4	CASP4	NA	NA	NA	NA	CASP4	209	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr11	104903346	104903498	104903407	Y	CASP4,CASP4,CASP5,CARD17,CARD16	CASP1P2	NA	NA	NA	NA	CASP1P2	36770	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	104917614	104917898	104917725	Y	NA	CASP1P2	NA	NA	NA	NA	CASP1P2	22370	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr11	105034928	105035383	105035092	Y	CASP4,CASP4,CASP5,CARD16,CARD17	NA	NA	NA	NA	NA	CARD16,CASP1	64770	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	105115100	105115515	105115329	Y	CASP4,CASP5,CARD16,CARD17	NA	GRIA4	IMR90	Hi-C	24141950	CARD16,CASP1	144942	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	107727726	107727971	107727842	Y	NA	RP11-832N8.1	NA	NA	NA	NA	RP11-832N8.1	49175	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	107966906	107967320	107967120	Y	NA	ACAT1	ACAT1	IMR90	Hi-C	24141950	ACAT1	22923	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	108600247	108600616	108600285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX10	66495	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	109965770	109966113	109965869	Y	RDX,FDX1,ZC3H12C	ZC3H12C	NA	NA	NA	NA	ZC3H12C	3683	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	110182497	110182806	110182740	Y	NA	RDX,RP11-347E10.1	RDX,FDX1	IMR90	Hi-C	24141950	RDX	17050	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	110228106	110228348	110228289	Y	ZC3H12C,FDX1,RDX	RP11-347E10.1	RDX	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-347E10.1	4251	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	110251327	110251472	110251332	Y	RDX	RP11-347E10.1,FDX1	NA	NA	NA	NA	RP11-347E10.1	27472	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	111195136	111195460	111195333	Y	C11orf93	NA	NA	NA	NA	NA	POU2AF1	128895	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	111560054	111560414	111560322	Y	NA	NA	PPP2R1B	IMR90	Hi-C	24141950	PPP2R1B	74737	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	111664556	111665052	111664796	Y	SIK2,BCO2	PPP2R1B	NA	NA	NA	NA	PPP2R1B	29405	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	111824557	111824693	111824689	Y	NA	CRYAB	NA	NA	NA	NA	CRYAB	32111	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	111929773	111930099	111929899	Y	DIXDC1	DLAT,C11orf57,PIH1D2,TIMM8B,SDHD	NA	NA	NA	NA	C11orf57	12711	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr11	111990973	111991528	111991378	Y	IL18	C11orf57,PIH1D2,TIMM8B,SDHD,IL18	NA	NA	NA	NA	SDHD	35346	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	112028082	112028533	112028265	Y	IL18	IL18	NA	NA	NA	NA	IL18	4307	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	112752270	112752453	112752335	Y	NCAM1	NA	NA	NA	NA	NA	TTC12	430798	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	113055291	113055738	113055452	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC12	127513	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr11	113059055	113059658	113059425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC12	123593	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	113568428	113568782	113568613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZW10	73751	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	113945404	113945849	113945581	Y	ZBTB16,ZBTB16	NA	NA	NA	NA	NA	NNMT	180660	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr11	113999597	113999969	113999698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NNMT	126540	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	114152118	114152374	114152253	Y	ZBTB16,NNMT	NNMT	NNMT	IMR90	Hi-C	24141950	NNMT	25609	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr11	114162155	114162496	114162247	Y	NA	NNMT	NA	NA	NA	NA	NNMT	35646	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.217725348194272
chr11	114162667	114162750	114162694	Y	NA	NNMT	NA	NA	NA	NA	NNMT	36158	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	114162916	114163328	114163238	Y	NA	NNMT	NA	NA	NA	NA	NNMT	36407	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.497914126136583
chr11	114312879	114313299	114312892	Y	NA	RBM7,C11orf71,REXO2	NA	NA	NA	NA	REXO2	4771	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	116462532	116462616	116462574	Y	NA	NA	FAM55B	IMR90	Hi-C	24141950	BUD13	179088	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	116722234	116722744	116722542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF259	65468	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	116867531	116867975	116867966	Y	NA	AP000936.1	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	36792	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	116884410	116884712	116884644	Y	NA	AP000936.1	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	20055	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	116909494	116909823	116909659	Y	NA	AP000936.1	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	4727	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	117015877	117016035	117015996	Y	SIK3,PAFAH1B2	SIK3,PAFAH1B2,SIDT2	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B2	2894	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	117016262	117016599	117016456	Y	NA	SIK3,PAFAH1B2,SIDT2	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B2	3279	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	117687155	117687422	117687274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPZL3	433643	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	118146006	118146232	118146062	Y	FXYD6,MPZL2	MPZL3,MPZL2	MPZL2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MPZL2	12755	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.305674701496598
chr11	118148186	118148361	118148275	Y	MPZL2	MPZL3,MPZL2	MPZL2,LOC100526771,TMPRSS4,SCN4B,SCN2B,MPZL3,CD3E,AMICA1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MPZL2	14935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr11	118493108	118493651	118493460	Y	NA	PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	17953	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	118493849	118494041	118493911	Y	NA	PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	18694	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr11	118663387	118663780	118663691	Y	NA	DDX6	NA	NA	NA	NA	DDX6	3529	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	118747459	118747842	118747737	Y	MLL,VPS11,RPS25,CXCR5,CCDC84,CBL,DDX6	MIR4492,UPK2,BCL9L	CXCR5	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4492	31575	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	118782911	118783378	118783221	Y	SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	3494	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.46783862110854
chr11	118784118	118784508	118784405	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	4701	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	118785112	118785368	118785332	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	5695	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	118786339	118786473	118786384	Y	NA	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	6922	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	118788249	118788453	118788294	Y	MLL,PHLDB1,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	5420	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.163294011145704
chr11	118790377	118790895	118790660	Y	NA	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	2978	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.616233864851494
chr11	118791529	118792348	118792152	Y	PHLDB1,BCL9L	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	1525	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.818887537379326
chr11	118793665	118793922	118793750	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.318017036413411
chr11	118794621	118795305	118795013	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	304	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.147265152209192
chr11	118799839	118800231	118800031	Y	C2CD2L	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5522	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr11	118800245	118800827	118800413	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5928	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.362991308844204
chr11	118800879	118801266	118801161	Y	MLL,DDX6,VPS11,CBL,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	6562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	119124696	119124715	119124706	Y	NA	CBL	NA	NA	NA	NA	CBL	49944	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr11	119239128	119239276	119239217	Y	NA	MCAM,RNF26,USP2-AS1	NA	NA	NA	NA	USP2-AS1	11212	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	119239478	119239727	119239579	Y	ABCG4,C1QTNF5,USP2	MCAM,RNF26,USP2-AS1	NA	NA	NA	NA	USP2-AS1	10761	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	119241226	119241377	119241346	Y	NA	RNF26,USP2-AS1	NA	NA	NA	NA	USP2-AS1	9111	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20169648925776
chr11	119341099	119341491	119341199	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP2-AS1	90611	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	119554350	119554716	119554654	Y	TRIM29,PVRL1	PVRL1	NA	NA	NA	NA	PVRL1	43078	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	119626512	119626655	119626589	Y	USP2	PVRL1	LOC100499227,PVRL1,TRIM29	IMR90	Hi-C	24141950	PVRL1	28718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	120089762	120089841	120089801	Y	NA	TRIM29,OAF,POU2F3	NA	NA	NA	NA	OAF	10287	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	120302835	120303154	120303088	Y	OAF,ARHGEF12	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF12	97048	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	120895811	120895984	120895886	Y	GRIK4,TBCEL,TBCEL,TECTA	TBCEL	NA	NA	NA	NA	TBCEL	3030	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	121107211	121107513	121107369	Y	SC5DL,SC5DL	NA	SORL1	IMR90	Hi-C	24141950	SORL1	213399	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr11	121337416	121337512	121337466	Y	NA	SORL1	NA	NA	NA	NA	SORL1	16504	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	122049218	122049681	122049522	Y	NA	MIRLET7A2,MIR100	NA	NA	NA	NA	MIR100	28202	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	122100877	122101142	122101009	Y	NA	NA	MIR100HG,MIR125B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR100	79861	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	122177708	122178168	122177914	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-820L6.1	113411	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	122292534	122292605	122292585	Y	NA	RP11-820L6.1	SORL1,MIR100HG	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-820L6.1	955	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.93046211716719
chr11	122311334	122311672	122311591	Y	NA	RP11-820L6.1	SC5DL,MIR100HG,MIR125B1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-820L6.1	19755	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.128351022973642
chr11	122312513	122312743	122312628	Y	NA	RP11-820L6.1	SC5DL,MIR100HG,MIR125B1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-820L6.1	20934	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.260700429065805
chr11	122586167	122586342	122586202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	61784	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	122888881	122889273	122889127	Y	NA	RPL34P23,SNORD14D,SNORD14C,HSPA8	NA	NA	NA	NA	RPL34P23	15302	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	122936469	122936659	122936561	Y	NA	RPL34P23,SNORD14D,SNORD14C,HSPA8	NA	NA	NA	NA	HSPA8	4531	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.289298656998835
chr11	122949899	122950101	122950094	Y	CLMP	RPL34P23,SNORD14D,SNORD14C,HSPA8	NA	NA	NA	NA	HSPA8	17961	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	122989373	122989577	122989478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA8	57435	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	123015903	123016112	123016008	Y	NA	CLMP	NA	NA	NA	NA	CLMP	47877	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr11	123293400	123293723	123293427	Y	NA	AP000783.1,LINC01059	CLMP	IMR90	Hi-C	24141950	AP000783.1	5335	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	123327975	123328380	123328056	Y	NA	AP000783.1,LINC01059	CLMP,HSPA8	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01059	4869	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	123335007	123335161	123335084	Y	NA	AP000783.1,LINC01059	CLMP,HSPA8,MIR4493	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01059	11901	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	123343327	123343490	123343416	Y	BSX	AP000783.1,LINC01059	HSPA8,CLMP,MIR4493	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01059	20221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.469698861832669
chr11	123345048	123345386	123345163	Y	NA	AP000783.1,LINC01059	CLMP,MIR4493	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01059	21942	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	123352361	123352657	123352509	Y	OR8D4,OR6M1	LINC01059	CLMP	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01059	29255	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	123353850	123354009	123353930	Y	NA	LINC01059	CLMP	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01059	30744	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	123468998	123469339	123469251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCN3B	54613	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr11	123471620	123471812	123471715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCN3B	52140	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	123666846	123667064	123666955	Y	OR6T1,OR6M1	RNU1-21P	NA	NA	NA	NA	RNU1-21P	34211	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	123950495	123950749	123950645	Y	VWA5A	VWA5A	VWA5A,OR8G1,OR8D2	IMR90	Hi-C	24141950	VWA5A	33320	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr11	123984777	123984974	123984888	Y	VWA5A	VWA5A	NA	NA	NA	NA	VWA5A	708	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.173481224953846
chr11	123992941	123993165	123993025	Y	NA	VWA5A	NA	NA	NA	NA	VWA5A	8872	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	124111920	124112038	124111963	Y	TMEM225,SPA17	NA	NA	NA	NA	NA	VWA5A	127851	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr11	124146082	124146472	124146192	Y	VWA5A,OR8G2,OR8B12,TBRG1,OR8G5	NA	NA	NA	NA	NA	VWA5A	162013	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	124391253	124391530	124391392	Y	OR10G7,OR8G2,OR8G1,OR8D1,OR8D2,OR8B8,OR8B12,OR8A1	NA	NA	NA	NA	NA	TBRG1	99202	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	124552795	124553089	124552942	Y	OR8B4,C11orf61	SPA17,SIAE	NA	NA	NA	NA	SIAE	10514	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr11	124638889	124639135	124639012	Y	NA	NRGN,RP11-677M14.2,RP11-677M14.3,ESAM	NA	NA	NA	NA	ESAM	8703	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	124668888	124669222	124669022	Y	NA	RP11-677M14.3,ESAM	NA	NA	NA	NA	ESAM	38702	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	125937888	125938141	125938004	Y	NA	CDON	NA	NA	NA	NA	CDON	6658	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	125983623	125983738	125983673	Y	CDON	NA	HYLS1	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	52393	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.430566234530246
chr11	125985079	125985242	125985162	Y	CDON,ST3GAL4	NA	HYLS1	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	53849	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr11	125985923	125986168	125986013	Y	NA	NA	HYLS1	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	54693	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr11	126029421	126029682	126029619	Y	NA	FAM118B,RPUSD4	HYLS1,CDON	IMR90	Hi-C	24141950	FAM118B	49627	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	126084365	126084425	126084397	Y	NA	FAM118B,RPUSD4	NA	NA	NA	NA	RPUSD4	4778	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr11	126180283	126180636	126180409	Y	NA	FOXRED1,SRPR,TIRAP,DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4	NA	NA	NA	NA	RP11-712L6.5	8070	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	126191145	126191518	126191332	Y	NA	TIRAP,DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4	NA	NA	NA	NA	RP11-712L6.5	18932	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	126209269	126209556	126209430	Y	NA	DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	13979	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr11	126210041	126210184	126210131	Y	NA	DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	13351	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20553894282687
chr11	126337982	126338153	126338089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	114447	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr11	126554448	126554559	126554501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	330913	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	128335578	128335794	128335665	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	119659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	128341794	128342415	128342241	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	113038	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	128346619	128346923	128346838	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	108530	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	128366966	128367159	128367092	Y	ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	88294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	128367325	128367539	128367441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	87914	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr11	128376891	128377234	128377096	Y	ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	78219	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.145265960649932
chr11	128377315	128377487	128377422	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	77966	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	128579282	128579748	128579400	Y	FLI1,FLI1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	123829	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	128927593	128927968	128927781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP32	219251	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	129282439	129282677	129282511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP32	135220	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	129507501	129507545	129507523	Y	BARX2,NFRKB	NA	BARX2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM45B	176169	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	129601384	129601709	129601599	Y	NFRKB	NA	BARX2,ARHGAP32	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM45B	82005	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	129716429	129716681	129716540	Y	TMEM45B	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	TMEM45B	32715	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr11	129717042	129717234	129717138	Y	ST14,TMEM45B	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	TMEM45B	33328	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	129723853	129724184	129723902	Y	NFRKB	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	39301	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr11	129730176	129730501	129730339	Y	TMEM45B	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	32984	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	129731747	129732130	129731880	Y	ST14,NFRKB,TMEM45B	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	31355	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.557073995494039
chr11	129871629	129871941	129871631	Y	NA	PRDM10,TCEB2P2	NA	NA	NA	NA	PRDM10	899	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr11	130036262	130036668	130036368	Y	PRDM10	NA	NA	NA	NA	NA	APLP2	98530	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	130392180	130392594	130392285	Y	NA	NA	SNX19,ADAMTS15	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS15	75311	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	131211751	131211940	131211820	Y	NA	NA	NTM	IMR90	Hi-C	24141950	SNX19	427347	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr11	131300322	131300556	131300481	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	515918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.120163000724761
chr11	132774283	132774643	132774625	Y	OPCML	NA	NA	NA	NA	NA	OPCML	625771	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr11	134124453	134124658	134124640	Y	NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2	VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8	NA	NA	NA	NA	ACAD8	3064	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr11	134509789	134510106	134509920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B3GAT1	229977	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr11	134708086	134708460	134708277	Y	NA	NA	LOC283177	IMR90	Hi-C	24141950	B3GAT1	428274	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	398927	399098	399013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC77	97341	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	680187	680377	680237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-218M22.1	57680	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.405966389715736
chr12	685193	685500	685436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-218M22.1	52557	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr12	775890	776284	776001	Y	NA	RP11-218M22.1,NINJ2	NINJ2,CCDC77,B4GALNT3,WNK1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NINJ2	4945	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	860254	860664	860544	Y	RAD52,NINJ2,WNK1	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	495	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.446212129837642
chr12	864034	864343	864158	Y	CCDC77,KDM5A	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	4275	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	905489	905920	905534	Y	NA	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	45730	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	1026879	1027238	1027070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	69981	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr12	1029926	1030313	1030120	Y	WNK1	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	66906	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	1314182	1314497	1314340	Y	NA	NA	LOC100292680	IMR90	Hi-C	24141950	ERC1	216507	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	1584094	1584332	1584168	Y	NA	NA	LOC100292680	IMR90	Hi-C	24141950	FBXL14	116999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	1643252	1643620	1643470	Y	NA	NA	ERC1,LOC100292680,FBXL14	IMR90	Hi-C	24141950	FBXL14	57711	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	1714275	1714637	1714592	Y	NA	FBXL14	FBXL14,RAD52,ERC1,WNT5B,WNK1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FBXL14	12944	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr12	1769649	1770205	1769686	Y	NA	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	25535	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227026483262636
chr12	1770869	1771337	1771069	Y	LRTM2,ADIPOR2	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	24403	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.819773616119104
chr12	2103073	2103532	2103387	Y	FBXL14	DCP1B,RP5-1096D14.6	NA	NA	NA	NA	DCP1B	8169	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	2893281	2893436	2893294	Y	NRIP2	CBX3P4,FKBP4,ITFG2,RP4-816N1.6	NRIP2,CACNA1C,FKBP4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CBX3P4	8025	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	3216295	3216423	3216359	Y	NA	TSPAN9	NA	NA	NA	NA	TSPAN9	31774	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	4140182	4140815	4140542	Y	CCND2,PARP11	NA	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	C12orf5	287556	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	4380607	4381576	4381205	Y	PARP11,CCND2	C12orf5	NA	NA	NA	NA	C12orf5	46795	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	4666420	4666590	4666540	Y	NA	C12orf4,RAD51AP1,DYRK4	NA	NA	NA	NA	DYRK4	2780	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	4758958	4759134	4759102	Y	NA	AKAP3,NDUFA9	NA	NA	NA	NA	NDUFA9	2697	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	4770172	4770413	4770176	Y	NA	AKAP3,NDUFA9	NA	NA	NA	NA	NDUFA9	13911	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	5915509	5915755	5915702	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	391126	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr12	6187612	6187773	6187703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	119108	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	6193943	6194225	6194059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	112656	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	6202352	6202551	6202452	Y	CD9,ANO2	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	104330	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr12	6304942	6305291	6305114	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	1590	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	6387822	6388153	6388049	Y	NA	NA	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFRSF1A	61127	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	6389072	6389528	6389363	Y	CD9,PLEKHG6,PLEKHG6	NA	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFRSF1A	59752	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	6403662	6404056	6403860	Y	PLEKHG6,PLEKHG6,PLEKHG6	TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF1A	45224	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	6404239	6404667	6404531	Y	NA	TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF1A	44613	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	6432315	6432644	6432443	Y	NA	TNFRSF1A,LTBR	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	16636	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	6444583	6445131	6444861	Y	CD4,CD4,TNFRSF1A	TNFRSF1A,LTBR	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	4149	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr12	6445143	6445640	6445507	Y	VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A	TNFRSF1A,LTBR	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	3640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.38247965772071
chr12	6454526	6454970	6454793	Y	CD4,CD4,TNFRSF1A	TNFRSF1A,LTBR	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	5246	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr12	6455086	6455266	6455191	Y	ZNF384,ZNF384,VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A	TNFRSF1A,LTBR	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	5806	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.149994492958819
chr12	6539566	6540029	6539921	Y	NA	RP1-102E24.9,TAPBPL,VAMP1	NA	NA	NA	NA	RP1-102E24.9	5635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.63187976015889
chr12	6586836	6587095	6586846	Y	PLEKHG6,PLEKHG6,TPI1,TPI1	RP1-102E24.9,TAPBPL,VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10	NA	NA	NA	NA	VAMP1	8683	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	6616640	6616858	6616680	Y	NA	VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH	NA	NA	NA	NA	SCARNA10	530	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.159295628027183
chr12	6713710	6714101	6713905	Y	PTPN6,ZNF384,LPAR5,CHD4	NOP2,CHD4,LPAR5	NA	NA	NA	NA	CHD4	541	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	6717352	6717716	6717682	Y	SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP	NOP2,CHD4,LPAR5	NA	NA	NA	NA	CHD4	2710	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr12	6721904	6722326	6722186	Y	GPR162,ENO2,C12orf53	NOP2,CHD4,LPAR5,ING4	NA	NA	NA	NA	CHD4	7262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr12	6873427	6873901	6873603	Y	C12orf53,ENO2,CLSTN3,ATN1,PTMS,GPR162	COPS7A,PTMS,MLF2	LEPREL2,CDCA3,TPI1,CD4,GPR162,SPSB2,GNB3,USP5	IMR90	Hi-C	24141950	MLF2	740	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.564375939003142
chr12	6962211	6962407	6962304	Y	GAPDH,COPS7A,COPS7A,COPS7A,COPS7A,LEPREL2,USP5,USP5,TPI1,TPI1	CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2	NA	NA	NA	NA	USP5	2919	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	7000184	7000641	7000294	Y	PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6	CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57	NA	NA	NA	NA	SPSB2	3662	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.763343087511275
chr12	7034730	7034838	7034794	Y	ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1	SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,SCARNA12,PHB2	NA	NA	NA	NA	ATN1	3104	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.13652161016362
chr12	7100414	7100432	7100423	Y	NA	RNU7-1,EMG1,SCARNA12,PHB2,C1S,LPCAT3	NA	NA	NA	NA	C1S	6063	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	7104040	7104360	7104246	Y	NA	EMG1,SCARNA12,PHB2,C1S,LPCAT3	NA	NA	NA	NA	C1S	9689	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	7592182	7592797	7592685	Y	PEX5,NANOG	RP11-157G21.2,CD163L1	NA	NA	NA	NA	RP11-157G21.2	1596	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	8013004	8013217	8013212	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A3	73654	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	8112195	8112747	8112462	Y	NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3	K562	ChIA-PET	22265404	SLC2A3	25324	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.25324255600729
chr12	8123169	8123746	8123395	Y	CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC2A3	36298	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.41598023891556
chr12	8147722	8148111	8148026	Y	NA	FOXJ2	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	35188	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	8179132	8179551	8179335	Y	NA	FOXJ2	PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	3748	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.995828252273164
chr12	8813796	8814159	8813977	Y	MFAP5	RP11-438L7.3,MFAP5,RIMKLB	NA	NA	NA	NA	MFAP5	312	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	8840377	8840836	8840579	Y	RIMKLB	MFAP5,RIMKLB	RIMKLB	MCF7	ChIA-PET	22265404	RIMKLB	8181	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.243941420938926
chr12	9106762	9106960	9106872	Y	KLRG1	PHC1,M6PR	M6PR	MCF7	ChIA-PET	22265404	M6PR	6211	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	9308932	9309318	9309073	Y	KLRB1,M6PR,KLRG1,PZP	A2M	NA	NA	NA	NA	A2M	42107	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.302215211556604
chr12	9803369	9803672	9803507	Y	KLRF1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69,KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D	RP11-705C15.4	NA	NA	NA	NA	RP11-705C15.4	4764	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	9986583	9986922	9986755	Y	NA	CLEC2B	NA	NA	NA	NA	CLEC2B	33813	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.173481224953846
chr12	10306018	10306454	10306037	Y	NA	OLR1	NA	NA	NA	NA	OLR1	16283	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	10458129	10458269	10458205	Y	KLRC3,KLRC4-KLRK1,KLRC1,KLRK1,KLRC4,KLRC2,KLRC1,KLRF1,KLRD1,KLRD1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	56099	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	10514396	10514426	10514411	Y	NA	RP11-277P12.20,KLRK1,KLRC4-KLRK1	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	28	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr12	10515405	10515669	10515567	Y	NA	RP11-277P12.20,KLRK1,KLRC4-KLRK1	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	1037	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.10246470073133
chr12	10517487	10517775	10517755	Y	NA	RP11-277P12.20,KLRK1,KLRC4-KLRK1	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	3119	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.660095024462804
chr12	10522688	10522877	10522783	Y	KLRD1,KLRD1,KLRC3,KLRC4-KLRK1,KLRK1,KLRC4,KLRC2	RP11-277P12.20,KLRK1,KLRC4-KLRK1	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	8320	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr12	10538589	10538605	10538596	Y	KLRC4-KLRK1,KLRK1,KLRC4	RP11-277P12.20,KLRK1,KLRC4-KLRK1	NA	NA	NA	NA	KLRK1	3868	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr12	10547253	10547637	10547463	Y	KLRD1,KLRD1,KLRK1,KLRC3,KLRC4-KLRK1,KLRC4,KLRC2	RP11-277P12.20,KLRK1,KLRC4-KLRK1,KLRC2	NA	NA	NA	NA	KLRK1	4780	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.58963528482235
chr12	10869298	10869573	10869459	Y	NA	STYK1	NA	NA	NA	NA	STYK1	44381	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.190240233080725
chr12	11043114	11043456	11043318	Y	TAS2R7,TAS2R8,TAS2R31,TAS2R20,TAS2R14,TAS2R13	NA	NA	NA	NA	NA	STYK1	218197	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	11221356	11221421	11221389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAS2R14	100751	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	11486966	11487331	11487130	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAS2R14	164794	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	11864651	11864937	11864724	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	63863	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	11933482	11933754	11933622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	132694	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	11986979	11987463	11987102	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	186191	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	12164191	12164556	12164498	Y	NA	BCL2L14	ETV6,LOC338817,CDKN1B	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2L14	36222	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	12408234	12408471	12408413	Y	NA	LRP6	NA	NA	NA	NA	LRP6	9475	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18093909801236
chr12	12609505	12609975	12609758	Y	BCL2L14,DUSP16	NA	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	101492	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	12711175	12711335	12711320	Y	NA	DUSP16	NA	NA	NA	NA	DUSP16	1982	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	12766295	12766634	12766503	Y	DUSP16,CREBL2	CREBL2	NA	NA	NA	NA	CREBL2	3534	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	12872470	12873013	12872652	Y	MANSC1,LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B,APOLD1	CDKN1B	NA	NA	NA	NA	CDKN1B	6478	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr12	12883612	12883681	12883638	Y	APOLD1	CDKN1B	NA	NA	NA	NA	CDKN1B	17620	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr12	12911881	12912260	12911941	Y	NA	CDKN1B	NA	NA	NA	NA	CDKN1B	45889	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr12	12956264	12956405	12956396	Y	GPRC5A,DDX47	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	7845	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.363721458034571
chr12	12957478	12957757	12957559	Y	GPRC5A	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	6493	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr12	12960939	12961466	12961074	Y	NA	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	2784	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.237213697070778
chr12	12991466	12991515	12991491	Y	NA	DDX47,RPL13AP20	NA	NA	NA	NA	DDX47	27216	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr12	13025126	13025347	13025203	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	RPL13AP20	1086	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.72935819055935
chr12	13034551	13034650	13034602	Y	DDX47,GPRC5A	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	7066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.611505332542607
chr12	13049170	13049423	13049295	Y	DUSP16	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	7454	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr12	13050548	13050563	13050554	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	8832	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.391050643598707
chr12	13056884	13057235	13057060	Y	GPRC5A	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	MIR614	9528	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	13075067	13075388	13075228	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	RP11-392P7.6	3272	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr12	13124934	13124993	13124963	Y	NA	RP11-392P7.6,HTR7P1,HEBP1	GPRC5D	IMR90	Hi-C	24141950	HTR7P1	25819	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	13253893	13254547	13254171	Y	CDKN1B,EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	58675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.640833709666003
chr12	13255105	13255488	13255167	Y	EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	59887	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr12	13325962	13326157	13326075	Y	EMP1	EMP1	HTR7P1,EMP1,HEBP1,KIAA1467,GSG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EMP1	21493	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	13331850	13332340	13332007	Y	NA	EMP1	EMP1,KIAA1467	IMR90	Hi-C	24141950	EMP1	15310	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr12	13332644	13332915	13332868	Y	NA	EMP1	EMP1,KIAA1467	IMR90	Hi-C	24141950	EMP1	14735	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.139807279150677
chr12	13359236	13359687	13359415	Y	EMP1	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	11586	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	13376138	13376415	13376269	Y	HEBP1	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	28488	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr12	14410616	14411017	14410842	Y	PLBD1	NA	ATF7IP	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL30P11	105420	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr12	15315937	15316391	15316153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERG	183218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200810410517982
chr12	15409824	15410065	15409954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERG	89544	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	15899366	15899730	15899546	Y	PTPRO	NA	NA	NA	NA	NA	EPS8	133533	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr12	15910995	15911177	15911085	Y	NA	NA	PTPRO	IMR90	Hi-C	24141950	EPS8	122086	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	16553699	16554214	16553898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	55623	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.425610668141653
chr12	16554253	16554721	16554664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	56177	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.351535052667168
chr12	17520560	17520632	17520596	Y	NA	RP11-871F6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-871F6.2	30701	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	18511225	18511610	18511392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	769038	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr12	19048962	19049238	19049131	Y	NA	NA	PIK3C2G	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHA5	231410	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr12	19260911	19261231	19261176	Y	NA	PLEKHA5	PIK3C2G	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHA5	19417	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr12	19291558	19291779	19291581	Y	AEBP2,PLEKHA5	PLEKHA5	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	10910	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	19566135	19566181	19566158	Y	NA	AEBP2,EEF1A1P4	NA	NA	NA	NA	AEBP2	11156	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210997624326124
chr12	19914510	19914683	19914597	Y	NA	RNU1-146P	PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-146P	39141	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr12	19932429	19932596	19932501	Y	NA	NA	PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-146P	57060	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.83835845119693
chr12	20004635	20004650	20004642	Y	NA	NA	PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-405A12.1	87805	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	20039612	20040013	20039813	Y	NA	NA	PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-405A12.1	52442	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.467855599822819
chr12	20047049	20047293	20047237	Y	NA	RP11-405A12.1	PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-405A12.1	45162	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	20047799	20048015	20047920	Y	NA	RP11-405A12.1	PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-405A12.1	44440	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.368832953972574
chr12	20061866	20062155	20061952	Y	NA	RP11-405A12.1	PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-405A12.1	30300	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166753501085698
chr12	20069508	20069793	20069676	Y	PDE3A	RP11-405A12.1	LOC100506393,PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-405A12.1	22662	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.755885214452761
chr12	20076637	20076989	20076813	Y	PDE3A	RP11-405A12.1	NA	NA	NA	NA	RP11-405A12.1	15466	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	20099675	20099840	20099742	Y	PDE3A	RP11-405A12.1	LOC100506393,PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-405A12.1	7220	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.52049734433293
chr12	20124309	20124606	20124452	Y	PDE3A	RP11-405A12.1	PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-405A12.1	31854	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.50643189888781
chr12	20365637	20365979	20365748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE3A	154200	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.13928672898111
chr12	20543386	20543422	20543406	Y	NA	PDE3A,RP11-284H19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-284H19.1	22190	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255971896756917
chr12	20732540	20732626	20732597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-284H19.1	211344	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr12	20746479	20746810	20746645	Y	LST-3TM12	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-284H19.1	225283	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr12	20780077	20780376	20780084	Y	LST-3TM12,PDE3A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-284H19.1	258881	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.357376697795539
chr12	20959036	20959191	20959158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-284H19.1	437840	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	20975224	20975562	20975349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-284H19.1	454028	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.847605916793903
chr12	21666002	21666378	21666190	Y	NA	RECQL,GOLT1B	NA	NA	NA	NA	GOLT1B	13287	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	22428776	22428931	22428867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMAS	231668	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	22779557	22779668	22779574	Y	NA	ETNK1	NA	NA	NA	NA	ETNK1	3548	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	24673435	24673806	24673663	Y	SOX5	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-662I13.1	444632	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	25402760	25403150	25403054	Y	LRMP,CASC1,KRAS	KRAS	NA	NA	NA	NA	KRAS	890	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	RNU4-67P	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-67P	15955	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.28328364726215
chr12	25539458	25539791	25539651	Y	NA	RNU4-67P	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-67P	15571	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	25611028	25611430	25611226	Y	NA	NA	RASSF8,LOC100506451,IFLTD1,MIR4302	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-67P	55666	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	25768042	25768407	25768182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-67P	212680	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr12	26267263	26267811	26267415	Y	NA	BHLHE41,RP11-283G6.3	NA	NA	NA	NA	BHLHE41	8249	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	26427494	26428032	26427844	Y	NA	NA	SSPN,BHLHE41,ITPR2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-283G6.3	149944	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	27430817	27431042	27430895	Y	NA	STK38L	NA	NA	NA	NA	STK38L	35916	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	27484254	27484540	27484416	Y	FGFR1OP2,STK38L	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	467	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	27593588	27593602	27593594	Y	C12orf71	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	80762	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	27678028	27678417	27678221	Y	C12orf71	PPFIBP1	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	3664	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	27702695	27702969	27702865	Y	NA	PPFIBP1	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	28331	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	28176067	28176342	28176190	Y	PTHLH,PTHLH	NA	PTHLH	IMR90	Hi-C	24141950	PTHLH	52429	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	28179755	28179885	28179817	Y	PTHLH,PTHLH	NA	PTHLH	IMR90	Hi-C	24141950	PTHLH	56117	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	28501330	28501622	28501413	Y	NA	RNU4-54P	NA	NA	NA	NA	RNU4-54P	30934	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	29489399	29489493	29489486	Y	NA	ERGIC2	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	42629	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	29581721	29581917	29581813	Y	NA	ERGIC2	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	49599	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr12	29844514	29844723	29844664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC1	90969	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	29859887	29860252	29860216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC1	75440	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	29903685	29903894	29903854	Y	NA	TMTC1	NA	NA	NA	NA	TMTC1	31798	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	30945631	30945953	30945771	Y	NA	CAPRIN2,RP11-77I22.2,LINC00941	NA	NA	NA	NA	LINC00941	24	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.291645034119346
chr12	30949517	30949896	30949519	Y	CAPRIN2	CAPRIN2,RP11-77I22.2,LINC00941	NA	NA	NA	NA	LINC00941	3540	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.283074048241349
chr12	31464460	31464546	31464537	Y	NA	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	13446	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	31602301	31602617	31602553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM60A	124309	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	31671759	31672031	31671827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND5B-AS1	68826	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.411808034844107
chr12	31886733	31886952	31886810	Y	NA	AMN1,RP11-467L13.5	C12orf35	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AMN1	6625	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr12	31899631	31900083	31899901	Y	AMN1,H3F3C	AMN1,RP11-467L13.5,H3F3C	METTL20,AMN1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-467L13.5	5568	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.24940010243818
chr12	31902136	31902566	31902240	Y	C12orf35,AMN1,H3F3C	AMN1,RP11-467L13.5,H3F3C	AMN1	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-467L13.5	3085	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr12	32263319	32263494	32263407	Y	NA	BICD1	NA	NA	NA	NA	BICD1	5550	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	32380941	32381343	32381040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BICD1	123172	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	32543557	32543792	32543676	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BICD1	285788	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr12	38493611	38493806	38493706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALG10B	214574	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr12	38780295	38780779	38780600	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALG10B	71915	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	39094852	39095225	39095039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	204007	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	39104065	39104215	39104143	Y	CPNE8	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	195017	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.381749508530343
chr12	39436965	39437093	39437022	Y	CPNE8	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	137733	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.224297142513009
chr12	39800065	39800203	39800134	Y	NA	KIF21A	NA	NA	NA	NA	KIF21A	34989	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	39808802	39808894	39808882	Y	NA	KIF21A	NA	NA	NA	NA	KIF21A	26298	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	40250890	40251201	40251046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL30P13	209191	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	40382618	40382994	40382971	Y	LRRK2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL30P13	77398	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	40467954	40468269	40468112	Y	NA	RPL30P13,SLC2A13	NA	NA	NA	NA	RPL30P13	7562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	42537125	42537342	42537234	Y	NA	GXYLT1	NA	NA	NA	NA	GXYLT1	444	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	42598855	42599145	42599001	Y	YAF2,YAF2,YAF2	YAF2,PPHLN1	NA	NA	NA	NA	YAF2	31006	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr12	42825856	42826146	42826103	Y	YAF2,YAF2,YAF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCRB1	107936	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.530474959120269
chr12	45626822	45627300	45627014	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	18998	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	45654086	45654401	45654190	Y	NA	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	46262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.167136464714814
chr12	45703000	45703363	45703138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	95176	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	45799443	45799701	45799572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	191619	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	45820263	45820702	45820515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	212439	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr12	46380247	46380714	46380477	Y	SCAF11	SCAF11	NA	NA	NA	NA	SCAF11	3189	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	46381876	46382270	46382256	Y	SLC38A2,SCAF11	SCAF11	NA	NA	NA	NA	SCAF11	1633	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr12	46614251	46614418	46614333	Y	NA	SLC38A1	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	47382	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr12	46636369	46636708	46636589	Y	SCAF11,SLC38A1	SLC38A1	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	25092	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr12	46786554	46786766	46786571	Y	NA	SLC38A2,RP11-96H19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	11092	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr12	46824163	46824471	46824386	Y	NA	RP11-96H19.1	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	48701	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.961807120908746
chr12	46825426	46825886	46825665	Y	NA	RP11-96H19.1	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	49964	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.219568610204122
chr12	46844808	46845174	46844835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	69346	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	46866769	46866797	46866784	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	91307	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	46867492	46867759	46867536	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	92030	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.247783874508036
chr12	46886273	46886657	46886465	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	110811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr12	46887386	46887956	46887679	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	111924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20553894282687
chr12	46888080	46888552	46888358	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	112618	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.535969418687388
chr12	46917975	46918280	46918143	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	142513	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	46942703	46943018	46942760	Y	NA	NA	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	167241	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	46943558	46944140	46943794	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	168096	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.852214297621243
chr12	46949913	46950236	46950181	Y	NA	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	174451	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	46951455	46951753	46951519	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	175993	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182052210831843
chr12	46953166	46953383	46953275	Y	NA	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	177704	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	46956686	46956942	46956800	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	181224	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.148378265028675
chr12	47057089	47057400	47057270	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	281627	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.155836138087189
chr12	47058276	47058667	47058611	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	282814	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	47058808	47059020	47058972	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	283346	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr12	47474423	47475249	47474825	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	2689	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.19083279573064
chr12	47476610	47477096	47476829	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	4876	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	47583701	47583845	47583774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	111967	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	47608427	47608826	47608720	Y	FAM113B	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	136693	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	47612205	47612473	47612375	Y	FAM113B	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	140471	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	47670448	47670925	47670783	Y	NA	NA	AMIGO2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AMIGO2	198714	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr12	47701468	47701752	47701723	Y	NA	NA	AMIGO2,MIR4698,LOC100233209,FAM113B	IMR90	Hi-C	24141950	AMIGO2	229734	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	48076459	48076736	48076534	Y	NA	RPAP3,RP1-197B17.3	NA	NA	NA	NA	RPAP3	21108	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr12	48100473	48100834	48100653	Y	VDR,ASB8	RPAP3,RP1-197B17.3,SLC48A1	NA	NA	NA	NA	RP1-197B17.3	2605	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	48195468	48195540	48195504	Y	ASB8	SLC48A1,RAPGEF3,HDAC7	NA	NA	NA	NA	HDAC7	29375	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	48202856	48203019	48202950	Y	VDR,ASB8	RAPGEF3,HDAC7	NA	NA	NA	NA	HDAC7	21896	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	48282882	48283045	48282955	Y	ZNF641,ZNF641,ASB8,VDR	NA	NA	NA	NA	NA	VDR	51786	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	48395275	48395444	48395393	Y	COL2A1	TMEM106C	TMEM106C	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM106C	39923	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.292375183309713
chr12	48415389	48415421	48415405	Y	OR10AD1	NA	COL2A1,TMEM106C,SENP1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM106C	60037	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	48815092	48815327	48815161	Y	PFKM,C12orf68,ZNF641	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF641	71895	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	49198499	49198542	49198521	Y	LALBA	ADCY6,CACNB3,DDX23	NA	NA	NA	NA	CACNB3	7035	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	49370069	49370445	49370342	Y	NA	ARF3,DDN,PRKAG1	NA	NA	NA	NA	DDN	20647	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	49452736	49452852	49452791	Y	NA	PRKAG1,RHEBL1,LMBR1L	NA	NA	NA	NA	RHEBL1	8956	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	49628278	49628526	49628405	Y	LMBR1L,TUBA1A	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	47171	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.39423034267685
chr12	49641026	49641246	49641136	Y	NA	PRPH	RHEBL1,TUBA1C,TUBA1A,LMBR1L,DHH,MLL2,TUBA1B,SPATS2,MCRS1,FAM186B,PRPH	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRPH	43789	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr12	49866902	49867154	49867028	Y	PRPF40B,PRPF40B	NA	NA	NA	NA	NA	KCNH3	63786	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr12	49972592	49972801	49972676	Y	NA	KCNH3,MCRS1,PRPF40B	MCRS1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PRPF40B	12591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr12	50019907	50020190	50020017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF40B	59906	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	50221084	50221421	50221231	Y	NCKAP5L	NCKAP5L,BCDIN3D	NA	NA	NA	NA	NCKAP5L	551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	50324888	50325278	50324924	Y	FMNL3,NCKAP5L	RP11-469H8.6	LOC100286844,BCDIN3D,FAIM2,LOC283332,AQP2,AQP5,AQP6,ACCN2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-469H8.6	29429	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	50339326	50339779	50339533	Y	NA	RP11-469H8.6	AQP2,TMBIM6,LOC100286844,NCKAP5L,BCDIN3D,RACGAP1,FMNL3,KCNH3,MCRS1,LOC283332,FAIM2,AQP5,ACCN2,SMARCD1,COX14,CERS5,GPD1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-469H8.6	14928	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.239212888630038
chr12	50460197	50460562	50460363	Y	NA	RACGAP1,SMARCD1,GPD1	NA	NA	NA	NA	SMARCD1	16193	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	50507967	50508334	50508141	Y	NA	SMARCD1,GPD1	NA	NA	NA	NA	GPD1	12365	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	50784153	50784384	50784269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARP4	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	50899744	50900179	50899947	Y	DIP2B	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	2976	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	50900445	50901076	50900765	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	3677	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	50931365	50931732	50931390	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	34597	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	51035200	51035582	51035391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF1	119911	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	51177941	51178161	51178051	Y	POU6F1,FAM186A,LARP4,DIP2B,HIGD1C	ATF1	TMPRSS12	IMR90	Hi-C	24141950	ATF1	22448	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	51180627	51180997	51180727	Y	SMAGP	ATF1	TMPRSS12	IMR90	Hi-C	24141950	ATF1	25134	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.858176094231158
chr12	51322260	51322312	51322286	Y	DIP2B	METTL7A	NA	NA	NA	NA	METTL7A	7005	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	51327584	51327783	51327682	Y	NA	METTL7A	NA	NA	NA	NA	METTL7A	12329	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr12	51534048	51534251	51534150	Y	POU6F1	RP11-416A17.1,TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	30675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	51536826	51537135	51537116	Y	CSRNP2	RP11-416A17.1,TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	27791	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr12	51551925	51552239	51552062	Y	NA	TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	12687	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	51608031	51608240	51608135	Y	BIN2	TFCP2,POU6F1,DAZAP2	NA	NA	NA	NA	POU6F1	1237	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	51720540	51720949	51720738	Y	SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,DAZAP2,GALNT6	NA	NA	NA	NA	NA	SMAGP	57866	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.176210565703473
chr12	51765347	51765619	51765517	Y	FIGNL2,GALNT6	NA	BIN2,CELA1	IMR90	Hi-C	24141950	SMAGP	102673	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	51787794	51788248	51788116	Y	SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,CSRNP2,DAZAP2,GALNT6	NA	NA	NA	NA	NA	SMAGP	125120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	52242460	52242886	52242778	Y	SLC4A8,ANKRD33	NA	SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ACVR1B	100565	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	52418719	52418897	52418793	Y	NR4A1,ACVRL1,GRASP,NR4A1	GRASP,NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	4103	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	52419301	52419935	52419633	Y	NR4A1,GRASP,NR4A1	GRASP,NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	4685	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr12	52426547	52427164	52426822	Y	NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP	GRASP,NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11931	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	52457778	52458372	52458110	Y	NA	NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	C12orf44	2658	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.363721458034571
chr12	52539319	52539712	52539621	Y	KRT84,KRT80,KRT6A,KRT5	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	44072	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.30327511124932
chr12	52540237	52540565	52540533	Y	NA	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	43219	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.317130957673633
chr12	52540964	52541526	52541224	Y	KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	42258	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	10.8130839520419
chr12	52542210	52542726	52542513	Y	KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	41058	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	6.67040375878637
chr12	52543416	52543547	52543482	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	40237	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166753501085698
chr12	52545730	52546132	52545994	Y	KRT6A,C12orf44	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	37652	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.491725295446962
chr12	52557711	52558022	52557822	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	25762	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.412694113583884
chr12	52571070	52571435	52571234	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	12349	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr12	52582905	52583052	52582979	Y	ACVR1B,NR4A1	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	732	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	52583620	52584080	52583828	Y	NA	KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.147265152209192
chr12	52584709	52584955	52584807	Y	C12orf44,KRT80,KRT7	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	925	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr12	52588987	52589174	52589068	Y	ACVR1B,NR4A1	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	5203	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	52591671	52592071	52591819	Y	GRASP,NR4A1	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	7887	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr12	52592399	52592846	52592466	Y	ACVR1B,ACVR1B,GRASP,NR4A1	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	8615	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr12	52594001	52594417	52594311	Y	NA	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	10217	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr12	52596776	52597514	52597151	Y	NR4A1	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	12992	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.975382720126587
chr12	52597722	52597879	52597816	Y	KRT71	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	13938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	52609215	52609817	52609526	Y	NA	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT7	14487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.176210565703473
chr12	52624014	52624394	52624158	Y	KRT7	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT7	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.467125450632453
chr12	52624687	52625139	52624914	Y	KRT7	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT7	383	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.483154309568965
chr12	52629756	52630207	52629959	Y	NA	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT7	5452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	52674043	52674518	52674247	Y	NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80	KRT7,KRT83	NA	NA	NA	NA	KRT83	38664	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.77050744447993
chr12	52674655	52675081	52674843	Y	C12orf44,KRT80,KRT7	KRT83	NA	NA	NA	NA	KRT83	38101	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.24230775794988
chr12	52916140	52916794	52916224	Y	KRT76,KRT1,KRT75,KRT6B,KRT6C,KRT6A,KRT5	KRT5	NA	NA	NA	NA	KRT5	3669	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	52950129	52950435	52950283	Y	KRT82	KRT5	NA	NA	NA	NA	KRT5	37658	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	53229080	53229305	53229193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	111350	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	53265042	53265518	53265316	Y	PFDN5,KRT2	NA	KRT6B,KRT2,KRT75,LOC283404,LOC283403,KRT84,KRT85,KRT80,KRT18,KRT8,EIF4B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRT18	75137	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr12	53266859	53267080	53267047	Y	NA	NA	KRT18,KRT8,LOC283403,KRT80,EIF4B,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT18	73575	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	53267781	53268340	53268093	Y	PFDN5	NA	KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT18	72315	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.5040855217673
chr12	53270322	53270511	53270351	Y	RARG,KRT84,KRT6C,KRT6A,KRT5,KRT2,KRT1,KRT76,KRT3,KRT4,KRT78	NA	EIF4B,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT18	70144	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr12	53273269	53273433	53273418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	67222	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	53284889	53285178	53285173	Y	ZNF740,SP1,KRT8,KRT18,KRT18	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	55477	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	53288883	53289427	53289224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	51228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr12	53301815	53302147	53302072	Y	KRT1,KRT76,KRT8	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	38508	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.246670761688553
chr12	53312254	53312405	53312393	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	28250	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	53318665	53319069	53319016	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	21586	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.479155926450444
chr12	53336677	53336830	53336786	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	3825	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr12	53339346	53339557	53339459	Y	EIF4B,KRT8,KRT18,KRT18	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	1098	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	53365695	53366044	53365885	Y	NA	KRT18,KRT8,EIF4B	NA	NA	NA	NA	KRT8	23957	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.250130251628547
chr12	53370058	53370275	53370187	Y	NA	KRT18,KRT8,EIF4B	KRT8,EIF4B,KRT18,KRT85,KRT84,KRT75,KRT6B	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF4B	27667	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr12	53445016	53445392	53445120	Y	IGFBP6,C12orf10,TENC1,TENC1,TENC1,SPRYD3	EIF4B,TENC1,RP11-983P16.4,SPRYD3,IGFBP6	NA	NA	NA	NA	RP11-983P16.4	830	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr12	53610849	53611063	53610958	Y	NA	ZNF740,CSAD,ITGB7,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	ITGB7	11758	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	53611077	53612140	53611274	Y	PRR13,PFDN5	ZNF740,CSAD,ITGB7,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	ITGB7	11986	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr12	53615195	53615822	53615501	Y	CSAD,SP1,PRR13,PFDN5	ZNF740,CSAD,ITGB7,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	8942	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr12	53765037	53765535	53765115	Y	CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13	AAAS,SP1	SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP1	6425	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.766072428260902
chr12	53890170	53890360	53890251	Y	MFSD5	MAP3K12,TARBP2,NPFF	NA	NA	NA	NA	MAP3K12	1487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	53955466	53955638	53955506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPFF	56044	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	54017367	54017528	54017445	Y	NA	ATF7,RP11-972K6.1	NA	NA	NA	NA	ATF7	671	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	54090300	54090537	54090319	Y	NA	ATP5G2,CALCOCO1	NA	NA	NA	NA	ATP5G2	21108	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	54198975	54199124	54199050	Y	NA	SNORD81	HOXC12,HOXC13,SMUG1,HOTAIR,HOXC11,HOXC8,HOXC9,MIR196A2,HOXC10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORD81	15886	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	54372759	54373189	54372957	Y	HOXC13,HOXC12,HOXC11,HOXC10	HOXC13,HOXC13-AS,HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8	NA	NA	NA	NA	HOXC10	3660	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.29531412308014
chr12	54384983	54385161	54385072	Y	TARBP2,ATP5G2,HOXC8,HOXC6,HOXC4,HOXC9	HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5	NA	NA	NA	NA	HOXC9	1518	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	54391907	54392298	54392098	Y	ATP5G2,HOXC8,HOXC6,HOXC4,HOXC12,HOXC10,HOXC9	HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5	NA	NA	NA	NA	HOXC-AS1	113	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	54400493	54400742	54400596	Y	HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC6,HOXC4	HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC8	90	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	54411861	54412590	54411908	Y	COPZ1,ATP5G2,HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5,HOXC4	HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC8	11029	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.539045944998266
chr12	54413422	54413659	54413446	Y	ATP5G2,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5	HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	10978	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	54415475	54415883	54415632	Y	NA	HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	8754	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	54416528	54417002	54416575	Y	NA	HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	7635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	54610828	54611089	54611007	Y	NA	SMUG1	NA	NA	NA	NA	SMUG1	30050	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.280344707491722
chr12	54698103	54698502	54698288	Y	NFE2,NFE2	CBX5,HNRNPA1,NFE2,COPZ1	NA	NA	NA	NA	COPZ1	5117	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr12	54700865	54701198	54701063	Y	NCKAP1L,NFE2,NFE2,ZNF385A	CBX5,HNRNPA1,NFE2,COPZ1	COPZ1,CBX5,HNRNPA1,NFE2,ITGA5,ZNF385A	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	COPZ1	7879	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr12	54752421	54752649	54752549	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	ZNF385A	NA	NA	NA	NA	ZNF385A	30433	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.206269092017237
chr12	54752671	54753884	54753119	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	ZNF385A	NA	NA	NA	NA	ZNF385A	29198	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.3129592099468
chr12	54777021	54777369	54777117	Y	NA	ZNF385A,ITGA5	NA	NA	NA	NA	ZNF385A	5713	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr12	54804400	54804529	54804465	Y	GPR84,ZNF385A,NCKAP1L,ITGA5	ZNF385A,ITGA5	NA	NA	NA	NA	ITGA5	6715	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	54810296	54811355	54811225	Y	GPR84,ZNF385A,NCKAP1L,ITGA5	ZNF385A	ZNF385A	IMR90	Hi-C	24141950	ITGA5	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr12	54814164	54814540	54814466	Y	GPR84	ZNF385A,ITGA5	ZNF385A	IMR90	Hi-C	24141950	ITGA5	2920	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	56132069	56132385	56132308	Y	OR6C4,OR10P1,SMARCC2,IKZF4	BLOC1S1,RP11-644F5.10,RP11-644F5.11,CD63,GDF11	NA	NA	NA	NA	GDF11	2679	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20553894282687
chr12	56147551	56147694	56147624	Y	NA	BLOC1S1,RP11-644F5.10,RP11-644F5.11,CD63,GDF11	NA	NA	NA	NA	GDF11	12487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208268283576497
chr12	56150085	56150369	56150213	Y	OR6C6,IKZF4	BLOC1S1,RP11-644F5.10,RP11-644F5.11,CD63,GDF11	NA	NA	NA	NA	GDF11	15021	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	56193144	56193361	56193252	Y	OR6C3,OR6C75	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14	NA	NA	NA	NA	SARNP	16179	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	56218960	56219310	56218990	Y	OR6C3,OR6C65,OR6C2,OR6C4,OR10P1,IKZF4	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14,RNU1-69P	NA	NA	NA	NA	TMEM198B	2219	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.266159110565059
chr12	56219844	56220081	56219962	Y	OR6C3	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14,RNU1-69P	NA	NA	NA	NA	TMEM198B	1448	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.171482033394586
chr12	56294124	56294208	56294164	Y	NA	RNU1-69P,DGKA,WIBG	NA	NA	NA	NA	DGKA	24895	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	56614575	56614693	56614609	Y	NA	SMARCC2,RP11-977G19.5,RNF41,ANKRD52,COQ10A	NA	NA	NA	NA	RNF41	858	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	56690284	56690436	56690361	Y	NA	ANKRD52,COQ10A,RP11-977G19.11,CS,RP11-977G19.10,CNPY2,PAN2,IL23A	NA	NA	NA	NA	RP11-977G19.11	1490	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	56914338	56914532	56914358	Y	NA	RP11-153M3.1,RBMS2	NA	NA	NA	NA	RBMS2	625	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr12	57026164	57026397	57026368	Y	NA	BAZ2A,SNORD59A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	2203	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,SNORD59A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.87008733125685
chr12	57073427	57073817	57073648	Y	NA	BAZ2A,SNORD59A,ATP5B,PTGES3,NACA	NA	NA	NA	NA	PTGES3	6342	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr12	57077806	57078249	57078184	Y	COQ10A,PAN2,PAN2	BAZ2A,SNORD59A,ATP5B,PTGES3,NACA	NA	NA	NA	NA	PTGES3	1910	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	57079143	57079532	57079338	Y	NA	SNORD59A,ATP5B,PTGES3,NACA	NA	NA	NA	NA	PTGES3	627	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	57458942	57459239	57459094	Y	NA	TMEM194A,NAB2	TAC3,ZBTB39,MYO1A,GPR182	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM194A	20607	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	57462088	57462242	57462164	Y	R3HDM2,MBD6,ARHGAP9,ARHGAP9,ARHGAP9,BAZ2A,STAT6,STAT6	TMEM194A,NAB2	TAC3,ZBTB39,MYO1A,GPR182	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM194A	17604	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	57494239	57494362	57494284	Y	MBD6,STAT6	TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	NAB2	13562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr12	57520981	57521279	57521090	Y	NA	TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	LRP1	705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr12	57751585	57751906	57751872	Y	R3HDM2	NA	INHBC	IMR90	Hi-C	24141950	R3HDM2	70882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	57764553	57764898	57764725	Y	NA	NA	INHBC,R3HDM2,ARHGAP9	IMR90	Hi-C	24141950	R3HDM2	57890	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	57812894	57812946	57812929	Y	NA	R3HDM2,INHBE,GLI1	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	9842	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	57813803	57814254	57814252	Y	NA	R3HDM2,INHBE,GLI1	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	8534	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.230641902752041
chr12	57822292	57822475	57822384	Y	NA	R3HDM2,INHBE,GLI1,MARS	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	313	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	57855378	57855667	57855523	Y	NA	R3HDM2,INHBE,GLI1,MARS	NA	NA	NA	NA	GLI1	3460	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr12	57986482	57986782	57986634	Y	R3HDM2,AGAP2,KIF5A,DTX3,B4GALNT1,ARHGEF25	DCTN2,PIP4K2C,B4GALNT1	NA	NA	NA	NA	PIP4K2C	3525	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	58238225	58238735	58238639	Y	AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,XRCC6BP1,CTDSP2	NA	NA	NA	NA	NA	CTDSP2	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr12	58259163	58259391	58259220	Y	TSPAN31,CDK4,METTL21B,CTDSP2	CTDSP2	CTDSP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	CTDSP2	20641	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.175324486963695
chr12	58281637	58282038	58281777	Y	CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM	CTDSP2,RP11-620J15.3	CTDSP2,TSFM,AVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTDSP2	43115	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	58337769	58337952	58337777	Y	NA	RP11-620J15.3,XRCC6BP1	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	4445	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	58349067	58349080	58349075	Y	XRCC6BP1	RP11-620J15.3,XRCC6BP1	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	15743	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	58683353	58683702	58683528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	350029	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	58819259	58819609	58819396	Y	LRIG3,LRIG3	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	485935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr12	59300729	59300915	59300862	Y	LRIG3,LRIG3	LRIG3	NA	NA	NA	NA	LRIG3	11388	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	59995567	59995830	59995598	Y	NA	SLC16A7	NA	NA	NA	NA	SLC16A7	7719	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	62608712	62608913	62608868	Y	C12orf61,USP15	USP15	NA	NA	NA	NA	USP15	43206	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	62644447	62644716	62644645	Y	C12orf61,USP15	USP15,FAM19A2	USP15	MCF7	ChIA-PET	22265404	USP15	7403	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	62650628	62651393	62650813	Y	C12orf61,USP15	USP15,FAM19A2	NA	NA	NA	NA	USP15	726	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	62658681	62658957	62658715	Y	C12orf61,USP15	USP15,FAM19A2	NA	NA	NA	NA	USP15	6562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	62772980	62773240	62773147	Y	MON2,USP15	NA	NA	NA	NA	NA	MON2	85357	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	62796049	62796447	62796072	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MON2	62150	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr12	62983522	62983540	62983531	Y	NA	RP11-631N16.2,C12orf61,MIRLET7I	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	10992	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	62998747	62999127	62998791	Y	NA	RP11-631N16.2,C12orf61,MIRLET7I	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	3281	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	63096065	63096306	63096205	Y	USP15,C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	100599	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	63118880	63119001	63118911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	123414	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr12	63133542	63133622	63133582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	138076	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	63179567	63180349	63179723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1H	146468	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	63241617	63241757	63241688	Y	C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1H	85060	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	63304430	63304640	63304492	Y	PPM1H	PPM1H	NA	NA	NA	NA	PPM1H	22177	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	64311746	64312216	64311964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	75673	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.280344707491722
chr12	64312639	64312950	64312683	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	76566	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr12	64386107	64386411	64386216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	150034	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	64401221	64401399	64401310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	165148	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	64482177	64482504	64482346	Y	SRGAP1,TBK1,C12orf66	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	131572	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.330047512231402
chr12	64544712	64545066	64544890	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	69010	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr12	64546689	64546709	64546700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	67367	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	64574864	64574988	64574911	Y	NA	C12orf66,RPS11P6	NA	NA	NA	NA	C12orf66	39088	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	64955008	64955199	64955103	Y	C12orf66,TBK1,RASSF3	RASSF3	RASSF3,GNS,MIR548Z	IMR90	Hi-C	24141950	RASSF3	47094	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	65012959	65013250	65013088	Y	TBK1,RASSF3,GNS	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	10666	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	65015023	65015259	65015145	Y	TBK1,RASSF3	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	12730	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	65026482	65026674	65026578	Y	NA	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	24189	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	65037414	65037710	65037562	Y	NA	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	35121	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	65063507	65064284	65063678	Y	C12orf66,TBK1,RASSF3,LEMD3	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF3	61214	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr12	65065216	65065277	65065242	Y	LEMD3	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF3	62923	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.124891533033648
chr12	65074143	65074354	65074186	Y	RASSF3,LEMD3	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF3	71850	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.159295628027183
chr12	65997532	65998101	65997899	Y	HMGA2	RP11-221N13.3	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	2883	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	66237933	66238219	66238043	Y	HMGA2	HMGA2	NA	NA	NA	NA	HMGA2	22022	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	66628292	66629290	66628922	Y	TMBIM4,IRAK3,HELB	IRAK3,RBMS1P1	NA	NA	NA	NA	RBMS1P1	1278	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr12	68705071	68705359	68705215	Y	IL22	MDM1	NA	NA	NA	NA	MDM1	18802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr12	68758917	68759565	68759229	Y	IFNG,RAP1B	MDM1	RAP1B,NUP107,LOC100507250	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MDM1	34756	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr12	69019747	69019936	69019838	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	14837	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,RPL7P42,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.22904356622542
chr12	69122207	69122406	69122269	Y	NA	RPL7P42,NUP107,SLC35E3	NA	NA	NA	NA	SLC35E3	15480	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	69163885	69164101	69163897	Y	SLC35E3	SLC35E3,MDM2	NA	NA	NA	NA	SLC35E3	25999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr12	69180946	69181662	69181342	Y	NA	SLC35E3,MDM2	SLC35E3	IMR90	Hi-C	24141950	MDM2	18294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	69227269	69227544	69227345	Y	SLC35E3	MDM2	NA	NA	NA	NA	MDM2	27313	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	69305634	69305702	69305668	Y	RAP1B,LYZ,CPM,CPM	NA	NA	NA	NA	NA	CPM	57648	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	69312043	69312322	69312251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPM	51028	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	69401246	69401453	69401353	Y	RAP1B,SLC35E3,MDM2,CPM,LYZ,CPM	CPM	CPM	IMR90	Hi-C	24141950	CPM	37896	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.281457820311205
chr12	69402346	69402644	69402509	Y	RAP1B,SLC35E3,CPM,LYZ,CPM	CPM	CPM	IMR90	Hi-C	24141950	CPM	38996	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.379750316971083
chr12	69403025	69403359	69403177	Y	NUP107,SLC35E3,MDM2,YEATS4,FRS2,CPSF6	CPM	CPM	IMR90	Hi-C	24141950	CPM	39675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	69418832	69418872	69418851	Y	NUP107,SLC35E3,MDM2,YEATS4,FRS2,CPSF6	NA	CPM	IMR90	Hi-C	24141950	CPM	55482	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr12	69446892	69447106	69446965	Y	RAP1B,LYZ,CPM	NA	CPM,MDM2	IMR90	Hi-C	24141950	CPM	83542	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	69453304	69453583	69453490	Y	RAP1B,CPM,LYZ,CPM	NA	MDM2,CPM	IMR90	Hi-C	24141950	CPM	89954	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	69458795	69459104	69458950	Y	NA	NA	CPM	IMR90	Hi-C	24141950	CPM	95445	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr12	69460304	69460567	69460397	Y	RAP1B,LYZ,CPM	NA	CPM	IMR90	Hi-C	24141950	CPM	96954	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20553894282687
chr12	69462130	69462730	69462407	Y	RAP1B,LYZ,CPM	NA	CPM	IMR90	Hi-C	24141950	CPM	98780	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.19752474153092
chr12	69634325	69634686	69634559	Y	SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6	CPSF6	NA	NA	NA	NA	CPSF6	3008	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr12	69686526	69686874	69686654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYZ	53247	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	69797421	69797731	69797518	Y	NA	YEATS4	NA	NA	NA	NA	YEATS4	45938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	69868200	69868446	69868430	Y	CPSF6,YEATS4,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2	FRS2	NA	NA	NA	NA	FRS2	6071	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	70382625	70382986	70382644	Y	CCT2,CCT2,RAB3IP	NA	CNOT2,KCNMB4,PTPRB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNOT2	251788	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	70388549	70388859	70388715	Y	CCT2,CCT2,RAB3IP	NA	PTPRB	IMR90	Hi-C	24141950	CNOT2	245915	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr12	70634012	70634396	70634290	Y	RAB3IP,KCNMB4,CNOT2,CNOT2,CNOT2	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	CNOT2	378	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	70650618	70650832	70650694	Y	NA	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	RP11-611E13.2	15478	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	70937766	70937789	70937778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-588H23.3	77906	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	70940880	70941156	70941028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-588H23.3	81020	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	71039604	71039990	71039715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-588H23.3	179744	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	71055637	71055848	71055742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-588H23.3	195777	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	71127373	71127661	71127517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-588H23.3	267513	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr12	71770650	71771010	71770955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN8	62668	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	72165791	72165958	72165868	Y	NA	RAB21	NA	NA	NA	NA	RAB21	19137	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	72691947	72692219	72692098	Y	TPH2,TRHDE	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D15	460460	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	74668744	74669132	74668938	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-81H3.2	125183	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	75902459	75902855	75902619	Y	KRR1	GLIPR1,KRR1	NA	NA	NA	NA	KRR1	561	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	76034915	76034997	76034960	Y	NA	NA	PHLDA1	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	131499	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	76052717	76052819	76052768	Y	PHLDA1	NA	PHLDA1,NAP1L1,OSBPL8	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	149301	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	76119368	76119573	76119471	Y	NA	NA	PHLDA1,OSBPL8,NAP1L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRR1	215952	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	76337836	76338217	76338130	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PHLDA1	87495	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	76338350	76338647	76338468	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PHLDA1	87065	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	76347823	76348161	76347983	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	77551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	76371613	76372127	76371872	Y	NA	NA	OSBPL8,PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	53585	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.124891533033648
chr12	76414095	76414311	76414227	Y	NA	PHLDA1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	11401	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	76685255	76685355	76685300	Y	NA	NA	NAP1L1,OSBPL8	IMR90	Hi-C	24141950	BBS10	54867	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	76751627	76751939	76751780	Y	NA	BBS10	NA	NA	NA	NA	BBS10	11405	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	76949947	76950382	76950258	Y	ZDHHC17,OSBPL8	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	1207	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr12	76982645	76982853	76982748	Y	OSBPL8	OSBPL8	OSBPL8,ZDHHC17	IMR90	Hi-C	24141950	OSBPL8	31056	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	77425555	77425931	77425698	Y	OSBPL8	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	31429	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	77426192	77426447	77426357	Y	OSBPL8	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	30913	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	77456593	77456922	77456786	Y	E2F7	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	438	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.382862621349826
chr12	79817950	79818263	79818028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	264614	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	80032366	80032529	80032417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	50348	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	80085577	80085980	80085873	Y	NA	PAWR	NA	NA	NA	NA	PAWR	2700	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	80098707	80098999	80098853	Y	NA	PAWR	SYT1,PPP1R12A,PAWR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAWR	15830	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	81171843	81172335	81171905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRQ	374069	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr12	81405150	81405419	81405285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRQ	607376	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	82155346	82155393	82155380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC59	595191	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr12	82203982	82204364	82204153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC59	546220	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	82362285	82362429	82362357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC59	388155	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	85344886	85345065	85345044	Y	NA	SLC6A15	NA	NA	NA	NA	SLC6A15	39492	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.464970329523781
chr12	85389492	85389695	85389594	Y	NA	TSPAN19,LRRIQ1	NA	NA	NA	NA	TSPAN19	38360	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.492072481008213
chr12	85674653	85675022	85674864	Y	ALX1	ALX1	NA	NA	NA	NA	ALX1	2768	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.442752639897648
chr12	88526600	88526872	88526736	Y	NA	CEP290,TMTC3	NA	NA	NA	NA	CEP290	7121	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr12	88531496	88531830	88531623	Y	NA	CEP290,TMTC3	NA	NA	NA	NA	CEP290	2163	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	88968059	88968366	88968242	Y	NA	KITLG	NA	NA	NA	NA	KITLG	4262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	89520522	89520961	89520666	Y	DUSP6	NA	POC1B,DUSP6	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP6	224087	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	89727563	89727887	89727725	Y	ATP2B1,DUSP6	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	17161	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	89747699	89748479	89748073	Y	NA	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	2651	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18278236002221
chr12	89856198	89856331	89856264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POC1B	61470	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	89910622	89910739	89910701	Y	NA	POC1B,GALNT4,POC1B-GALNT4	NA	NA	NA	NA	POC1B	7062	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	89978345	89978700	89978451	Y	ATP2B1	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT4,POC1B-GALNT4	60306	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	90065963	90066366	90066126	Y	NA	ATP2B1	ATP2B1,LOC338758	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2B1	34711	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	90091098	90091469	90091453	Y	NA	ATP2B1	ATP2B1,LOC338758	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2B1	9608	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	90162772	90163253	90163116	Y	DUSP6,POC1B,ATP2B1	NA	LOC338758,C12orf37	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ATP2B1	61695	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	90345013	90345239	90345184	Y	POC1B,ATP2B1	NA	LOC338758	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-654D12.2	70571	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	90484866	90485476	90485213	Y	ATP2B1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-654D12.2	210424	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr12	91972476	91973067	91972734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCN	397576	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	92172749	92173207	92172879	Y	BTG1	NA	LOC256021	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C12orf79	361483	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr12	92436632	92436991	92436801	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	97699	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	92469930	92470196	92470132	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	64494	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	92490612	92490822	92490679	Y	NA	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	43868	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	92517978	92518398	92518142	Y	BTG1	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	16292	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	92941921	92942046	92942003	Y	EEA1,BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	EEA1	379061	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	92995849	92996628	92996444	Y	EEA1,BTG1	NA	LOC256021	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EEA1	324479	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr12	93277124	93277496	93277306	Y	NA	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	43611	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.291645034119346
chr12	93305938	93306210	93306048	Y	CLLU1OS	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	14897	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	93321551	93321826	93321626	Y	EEA1	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	444	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr12	93709037	93709216	93709174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT4	60443	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr12	93890331	93890756	93890540	Y	NA	MRPL42	NA	NA	NA	NA	MRPL42	31067	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr12	94135673	94136306	94136137	Y	NUDT4,SOCS2	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	66522	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	94179016	94179409	94179114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	109865	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.24940010243818
chr12	94201755	94201874	94201816	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	132604	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	94312014	94312280	94312201	Y	SOCS2	NA	SOCS2,LOC144481,CRADD	IMR90	Hi-C	24141950	CRADD	242863	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	94316416	94316795	94316598	Y	SOCS2	NA	CRADD,SOCS2,MRPL42	IMR90	Hi-C	24141950	CRADD	247265	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	94428471	94428481	94428476	Y	NA	NA	CRADD	IMR90	Hi-C	24141950	CRADD	359320	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	94495978	94496358	94496187	Y	NA	NA	CRADD,LOC144481,SOCS2,MRPL42,UBE2N	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RBMS2P1	320387	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	94678246	94678308	94678278	Y	PLXNC1,TMCC3	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	138437	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr12	94681590	94681805	94681698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	134940	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	94696122	94696451	94696433	Y	PLXNC1,TMCC3	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	120294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	94773845	94774167	94774046	Y	PLXNC1,TMCC3	RBMS2P1	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	42578	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	94817703	94818348	94818256	Y	NA	RBMS2P1,CCDC41	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	958	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.356263584976056
chr12	95492031	95492186	95492111	Y	NA	NR2C1	NA	NA	NA	NA	NR2C1	26552	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	95594660	95595399	95595279	Y	FGD6	FGD6,VEZT	NA	NA	NA	NA	FGD6	13859	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18478155158147
chr12	95609786	95609977	95609896	Y	FGD6	FGD6,VEZT	NA	NA	NA	NA	VEZT	264	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr12	95680646	95681018	95680718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEZT	71124	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.398508516657222
chr12	95840387	95840581	95840484	Y	METAP2	METAP2	VEZT,FGD6	IMR90	Hi-C	24141950	METAP2	24715	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	96027120	96027372	96027186	Y	LTA4H	NA	NTN4	IMR90	Hi-C	24141950	NTN4	155558	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr12	96027575	96027687	96027629	Y	NA	NA	NTN4	IMR90	Hi-C	24141950	NTN4	155243	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr12	96047992	96048216	96048102	Y	METAP2,LTA4H	NA	NA	NA	NA	NA	NTN4	134714	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.143649732719787
chr12	96589359	96589977	96589479	Y	LTA4H,ELK3	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	3199	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	96593675	96593812	96593739	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	7515	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	96613519	96613922	96613765	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	27359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	96635574	96636027	96635766	Y	CDK17	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	49414	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	96649758	96650321	96650168	Y	ELK3,CDK17	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	63598	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr12	96650909	96650966	96650937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	64749	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	96773991	96774080	96774036	Y	NA	CDK17,RN7SKP11	NA	NA	NA	NA	CDK17	18258	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	96810217	96810461	96810410	Y	LTA4H,ELK3	CDK17,RN7SKP11	CDK17,ELK3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RN7SKP11	8803	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr12	96813963	96814102	96814033	Y	NA	CDK17,RN7SKP11	CDK17,ELK3,LTA4H	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP11	5162	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	96839212	96840356	96839676	Y	NEDD1,NEDD1,CDK17	CDK17,RN7SKP11	CDK17	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP11	19948	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.190240233080725
chr12	96842223	96842407	96842329	Y	NA	CDK17,RN7SKP11	CDK17	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP11	22959	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	97962496	97962841	97962674	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD1	663495	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	98793447	98793582	98793503	Y	NA	RNU4-41P	NA	NA	NA	NA	RNU4-41P	16234	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr12	98934224	98934627	98934333	Y	NA	TMPO,TMPO-AS1	NA	NA	NA	NA	TMPO-AS1	26024	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	99021055	99021169	99021113	Y	NA	SLC25A3,SNORA53,IKBIP,APAF1	NA	NA	NA	NA	IKBIP	15722	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr12	99043983	99044295	99044139	Y	NA	IKBIP,APAF1	NA	NA	NA	NA	APAF1	7064	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	99103586	99103986	99103782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	66667	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.263429769815432
chr12	100518805	100519127	100519119	Y	NA	UHRF1BP1L	NA	NA	NA	NA	UHRF1BP1L	15499	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	101692271	101692665	101692300	Y	NA	UTP20	NA	NA	NA	NA	UTP20	20384	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr12	102186333	102186570	102186556	Y	NA	GNPTAB	NA	NA	NA	NA	GNPTAB	36146	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	102187051	102187461	102187342	Y	DRAM1,GNPTAB	GNPTAB	NA	NA	NA	NA	GNPTAB	35255	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	102220478	102220758	102220699	Y	NA	GNPTAB,DRAM1	NA	NA	NA	NA	GNPTAB	1958	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	102283097	102283236	102283152	Y	NA	DRAM1	NA	NA	NA	NA	DRAM1	13968	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	102285250	102285626	102285359	Y	DRAM1	DRAM1	NA	NA	NA	NA	DRAM1	16121	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr12	102329942	102330412	102330197	Y	DRAM1	NA	NA	NA	NA	NA	DRAM1	60813	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182052210831843
chr12	102909608	102909974	102909790	Y	PAH	NA	NA	NA	NA	NA	NUP37	397706	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	104252933	104253121	104253026	Y	NA	NT5DC3	NA	NA	NA	NA	NT5DC3	19958	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	104301376	104301628	104301530	Y	NA	HSP90B1	NA	NA	NA	NA	HSP90B1	20257	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	104613052	104613575	104613267	Y	CHST11,TXNRD1,TXNRD1	TXNRD1,RPL18AP3	NA	NA	NA	NA	TXNRD1	5495	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr12	104613868	104614024	104613970	Y	CHST11,TXNRD1,TXNRD1	TXNRD1,RPL18AP3	NA	NA	NA	NA	TXNRD1	6311	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr12	104658660	104659046	104658853	Y	NA	RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3	NA	NA	NA	NA	RPL18AP3	1604	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.229755824012263
chr12	104671230	104671489	104671317	Y	TXNRD1	RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3	NA	NA	NA	NA	RP11-818F20.5	1011	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.207155170757014
chr12	104675995	104676292	104676137	Y	GLT8D2,TXNRD1	RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3	NA	NA	NA	NA	RP11-818F20.5	3495	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200810410517982
chr12	104693849	104694220	104693862	Y	NA	RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3	NA	NA	NA	NA	EID3	1297	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr12	104997803	104998291	104998125	Y	TXNRD1,TXNRD1,CHST11	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	150730	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	105037664	105038031	105037900	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	190591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	105812004	105812354	105812179	Y	NA	NA	NUAK1,CKAP4,C12orf75,TCP11L2,POLR3B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	APPL2	183988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	105837759	105838125	105838029	Y	NA	NA	NUAK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	APPL2	209743	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.78064098881668
chr12	105839455	105839823	105839639	Y	NA	NA	NUAK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	APPL2	211439	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr12	106381323	106381559	106381463	Y	NA	NA	NUAK1,C12orf75	IMR90	Hi-C	24141950	TCP11L2	312148	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	106621316	106621679	106621542	Y	TCP11L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCP11L2	72028	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	106642668	106643242	106642944	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCP11L2	50465	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	106682328	106682503	106682422	Y	NA	TCP11L2,CKAP4	CKAP4,NUAK1,TCP11L2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TCP11L2	11204	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	106694592	106694855	106694698	Y	NA	TCP11L2,CKAP4	NA	NA	NA	NA	TCP11L2	885	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr12	107363542	107363991	107363752	Y	NA	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	14953	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	107377522	107377900	107377585	Y	RFX4,RIC8B,MTERFD3	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	1044	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr12	108103294	108103307	108103300	Y	PRDM4	PWP1,PRDM4	NA	NA	NA	NA	PWP1	25785	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr12	108511265	108511472	108511371	Y	NA	WSCD2	NA	NA	NA	NA	WSCD2	9776	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr12	108520922	108521230	108521111	Y	NA	WSCD2	WSCD2	K562	ChIA-PET	22265404	WSCD2	18	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	108877904	108878160	108878033	Y	SSH1,SELPLG,SELPLG	FICD	NA	NA	NA	NA	FICD	28802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	109023569	109024011	109023688	Y	SSH1,SELPLG,SELPLG	RP11-689B22.2,SELPLG	NA	NA	NA	NA	SELPLG	1724	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.278345515932461
chr12	109030971	109031245	109031128	Y	NA	RP11-689B22.2,SELPLG	NA	NA	NA	NA	SELPLG	5236	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	109032155	109032517	109032383	Y	NA	RP11-689B22.2,SELPLG	ISCU,TMEM119,SELPLG	IMR90	Hi-C	24141950	SELPLG	6420	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	109037814	109037911	109037861	Y	SSH1,SELPLG	RP11-689B22.2,SELPLG	NA	NA	NA	NA	SELPLG	12079	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	109058635	109058851	109058743	Y	NA	RP11-689B22.2,SELPLG	NA	NA	NA	NA	SELPLG	32900	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	109209396	109209677	109209591	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	39689	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	109227089	109227462	109227320	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	21904	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	109232143	109232504	109232328	Y	FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	16862	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.417266716343361
chr12	109248007	109248657	109248411	Y	SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	709	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	109249958	109250678	109250397	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	592	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.437641143959645
chr12	109570576	109570747	109570637	Y	ACACB	ALKBH2,UNG,RP11-968O1.5	NA	NA	NA	NA	RP11-968O1.5	23553	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr12	109900993	109901418	109901152	Y	KCTD10	UBE3B,KCTD10	NA	NA	NA	NA	UBE3B	11789	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	110540205	110540443	110540322	Y	NA	C12orf76,IFT81	ANKRD13A,C12orf76,IFT81,ATP2A2,ANAPC7,ARPC3,GPN3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFT81	19697	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr12	110618684	110618848	110618757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFT81	58544	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	110704832	110705217	110705054	Y	PPTC7	ATP2A2	ANKRD13A,ATP2A2,C12orf76,GIT2,IFT81	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2A2	11344	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	110707461	110707714	110707625	Y	NA	ATP2A2	ANKRD13A,ATP2A2,C12orf76,GIT2,IFT81	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2A2	8847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr12	110750652	110751139	110750939	Y	NA	ATP2A2	NA	NA	NA	NA	ATP2A2	34091	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	110867136	110867499	110867318	Y	NA	ANAPC7,HMGA1P3,ARPC3,RPL31P49,GPN3	NA	NA	NA	NA	HMGA1P3	1049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr12	110931784	110931990	110931887	Y	NA	ARPC3,RPL31P49,GPN3,VPS29	NA	NA	NA	NA	VPS29	5932	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	111016111	111016444	111016311	Y	PPTC7,ARPC3	PPTC7,TCTN1	NA	NA	NA	NA	PPTC7	2681	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	111019873	111020249	111019900	Y	MYL2,ATP2A2,PPTC7	PPTC7,TCTN1	RAD9B	IMR90	Hi-C	24141950	PPTC7	748	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.123778420214165
chr12	111028698	111029042	111028796	Y	ARPC3,PPTC7,HVCN1	PPTC7,TCTN1	PPTC7,GPN3,FAM216A,VPS29,RAD9B,PPP1CC,TCTN1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPTC7	9573	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	111494792	111495250	111495130	Y	PPTC7,SH2B3,CUX2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM109A	309675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	111842634	111842962	111842759	Y	NA	FAM109A,SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	111868510	111869152	111868792	Y	ALDH2,SH2B3	SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	26758	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	112018937	112019235	112019073	Y	NA	ATXN2	NA	NA	NA	NA	ATXN2	16245	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.220454688943899
chr12	112341708	112342051	112341878	Y	ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK5	63926	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.315131766114373
chr12	112529504	112529724	112529616	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	15102	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.289801772109496
chr12	112534496	112534670	112534605	Y	ALDH2,TRAFD1	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	10156	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	112545862	112545946	112545885	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	1036	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr12	112554455	112554606	112554536	Y	ALDH2,TRAFD1	NAA25,TRAFD1	TRAFD1,NAA25	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TRAFD1	6699	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.298372757987494
chr12	112759768	112760224	112759930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN11	93931	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.266159110565059
chr12	112920682	112921011	112920993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6	66040	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr12	113417741	113417850	113417751	Y	NA	OAS3,OAS2	NA	NA	NA	NA	OAS2	3541	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	113644189	113644365	113644286	Y	NA	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	TPCN1	12490	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.350804903476802
chr12	113652796	113652994	113652903	Y	OAS1,OAS3,OAS2,SLC24A6,SDSL,TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	TPCN1	3861	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	113660919	113661318	113661188	Y	TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	4020	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.189510083890358
chr12	113667617	113667862	113667654	Y	DTX1,IQCD,TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	10718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr12	113670739	113671157	113670856	Y	NA	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	13840	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	113798034	113798144	113798106	Y	SLC24A6,PLBD2,SDSL,SDS	PLBD2	SDS,SDSL	IMR90	Hi-C	24141950	PLBD2	3663	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	115791856	115792156	115792052	Y	NA	NA	TBX3	IMR90	Hi-C	24141950	UBA52P7	236632	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr12	115889491	115890073	115889778	Y	NA	NA	TBX3	IMR90	Hi-C	24141950	UBA52P7	138715	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	116362516	116362609	116362584	Y	MED13L	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P7	333728	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	116530359	116530538	116530483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	182605	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr12	116872040	116872309	116872217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00173	96918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	117173952	117174265	117174216	Y	MED13L,MAP1LC3B2	C12orf49	NA	NA	NA	NA	RNFT2	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	118466445	118466738	118466629	Y	NA	RFC5,WSB2	NA	NA	NA	NA	RFC5	17052	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	118632324	118632442	118632383	Y	NA	RPS2P5	PEBP1	IMR90	Hi-C	24141950	RPS2P5	49435	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	119618645	119618705	119618687	Y	HSPB8	HSPB8	NA	NA	NA	NA	HSPB8	4198	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	119632995	119633391	119633197	Y	TMEM233	HSPB8	NA	NA	NA	NA	HSPB8	18548	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	120141173	120141195	120141185	Y	NA	PRKAB1	NA	NA	NA	NA	PRKAB1	37615	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	120179533	120179605	120179597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAB1	75975	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	120426531	120426889	120426594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CIT	113436	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	120451614	120452059	120451867	Y	CCDC64	NA	NA	NA	NA	NA	RAB35	101247	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	120453080	120453507	120453184	Y	CCDC64	NA	NA	NA	NA	NA	RAB35	99799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	120524802	120525368	120525019	Y	CCDC64	RAB35	NA	NA	NA	NA	RAB35	27938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	120639993	120640274	120640078	Y	NA	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	2899	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.465856408263559
chr12	120668258	120668871	120668569	Y	RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	31164	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr12	120669025	120669761	120669334	Y	RAB35,RNF10,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	31813	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	120672500	120673016	120672699	Y	PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	28558	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr12	120700086	120700381	120700233	Y	RAB35,PXN,PXN	PXN,NME2P1,RNU4-2,RNU4-1	NA	NA	NA	NA	PXN	1193	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	120728531	120728703	120728617	Y	NA	PXN,NME2P1,RNU4-2,RNU4-1	PXN,GCN1L1,LOC100506649,RPLP0,RAB35,SIRT4,CCDC64,DYNLL1,SRSF9,RNF10,COX6A1,PLA2G1B,MSI1,LOC100506668,COQ5,TRIAP1,GATC	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-1	337	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	120956227	120956384	120956265	Y	COQ5	RNF10,COQ5	NA	NA	NA	NA	RNF10	12899	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr12	120967554	120967708	120967668	Y	NA	RNF10,COQ5,POP5	NA	NA	NA	NA	RNF10	1575	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	121268399	121268878	121268839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPL3	71296	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	121282265	121283301	121283112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPL3	56873	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	121310801	121311113	121311060	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	29061	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	121322345	121322363	121322358	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	17811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr12	121471797	121472025	121471886	Y	P2RX4,CAMKK2,OASL	C12orf43,OASL	NA	NA	NA	NA	OASL	3020	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr12	121498035	121498283	121498257	Y	P2RX4,CAMKK2,P2RX7,OASL	C12orf43,OASL	SPPL3,C12orf43,LOC100506668,DYNLL1,MLEC,HNF1A,P2RX7,P2RX4,CAMKK2,RNF10,POP5,CABP1,UNC119B,ACADS,HNF1A-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	OASL	22990	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr12	121533843	121533975	121533917	Y	NA	NA	ACADS,UNC119B,P2RX4,POP5,CABP1,MLEC,SPPL3,C12orf43,OASL,P2RX7,CAMKK2	IMR90	Hi-C	24141950	OASL	58798	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	121581639	121581946	121581768	Y	P2RX4,CAMKK2,OASL,P2RX7	NA	NA	NA	NA	NA	P2RX4	63714	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	121725097	121725322	121725221	Y	OASL,P2RX7,ORAI1,P2RX4,CAMKK2	CAMKK2	NA	NA	NA	NA	CAMKK2	8789	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	121838748	121839039	121838846	Y	SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	2904	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.260700429065805
chr12	121839154	121839422	121839290	Y	C12orf43,RHOF,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	3310	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	121841505	121841570	121841538	Y	NA	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	5661	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	121864200	121864449	121864234	Y	NA	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	28356	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr12	121866033	121866226	121866130	Y	NA	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	30189	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	121888305	121888670	121888535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF34	52461	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	121951651	121951880	121951735	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-941N14.1	64817	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	121976471	121976819	121976719	Y	NA	RP13-941N14.1,KDM2B	NA	NA	NA	NA	RP13-941N14.1	39878	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.263429769815432
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.975609754206291
chr12	122028609	122028883	122028798	Y	RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	KDM2B	K562	ChIA-PET	22265404	KDM2B	11689	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.291645034119346
chr12	122067749	122067897	122067832	Y	ORAI1	ORAI1,MORN3	NA	NA	NA	NA	ORAI1	5294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr12	122086492	122086728	122086610	Y	KDM2B,SETD1B,ORAI1	ORAI1,MORN3	NA	NA	NA	NA	MORN3	21809	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr12	122124782	122125118	122124936	Y	P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3	MORN3,TMEM120B	MORN3,LOC338799,SETD1B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	MORN3	16245	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.429836085339879
chr12	122155083	122155323	122155204	Y	NA	MORN3,TMEM120B	NA	NA	NA	NA	TMEM120B	6425	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr12	122224293	122224471	122224351	Y	CAMKK2,KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF	RHOF,AC084018.1,SETD1B	NA	NA	NA	NA	RHOF	14838	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.239943037820405
chr12	122225058	122225273	122225168	Y	KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF	RHOF,AC084018.1,SETD1B	NA	NA	NA	NA	RHOF	14036	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	122227473	122227629	122227504	Y	CAMKK2,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF	RHOF,AC084018.1,SETD1B	NA	NA	NA	NA	RHOF	11680	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	122227826	122228273	122227974	Y	CAMKK2,KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF	RHOF,AC084018.1,SETD1B	NA	NA	NA	NA	RHOF	11036	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	122229588	122230472	122229850	Y	KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF	RHOF,AC084018.1,SETD1B	NA	NA	NA	NA	RHOF	8837	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.325318979922515
chr12	122462187	122462386	122462358	Y	BCL7A	BCL7A,AC156455.1	NA	NA	NA	NA	BCL7A	6859	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	122462417	122462775	122462615	Y	BCL7A	BCL7A,AC156455.1	NA	NA	NA	NA	BCL7A	7089	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	122517490	122517922	122517629	Y	RSRC2,KDM2B,SETD1B,MLXIP	AC156455.1,MLXIP	NA	NA	NA	NA	MLXIP	2862	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	122518432	122518585	122518507	Y	MLXIP	AC156455.1,MLXIP	NA	NA	NA	NA	MLXIP	3804	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	122897459	122897572	122897541	Y	NA	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	7607	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.72108072077121
chr12	123320749	123321200	123320858	Y	NA	HIP1R	NA	NA	NA	NA	HIP1R	3749	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.216456305825379
chr12	123583230	123583584	123583407	Y	NA	PITPNM2	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	48978	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	123627472	123627989	123627683	Y	C12orf65,C12orf65,C12orf65	PITPNM2	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	4573	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	123636095	123636496	123636485	Y	NA	PITPNM2	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	3533	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	123930588	123930862	123930771	Y	RILPL2	RILPL2,SNRNP35	SNRNP35,SBNO1,SETD8,RILPL1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SNRNP35	9326	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.395779175907595
chr12	124009741	124009949	124009845	Y	NA	RILPL1	NA	NA	NA	NA	RILPL1	6316	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	124108091	124108301	124108196	Y	NA	TMED2,DDX55,EIF2B1,GTF2H3,TCTN2	NA	NA	NA	NA	EIF2B1	8012	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr12	124198913	124199092	124199012	Y	ATP6V0A2	TCTN2,ATP6V0A2	NA	NA	NA	NA	ATP6V0A2	4048	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	124486134	124486345	124486231	Y	NA	ZNF664,CCDC92	NA	NA	NA	NA	CCDC92	30756	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	124823049	124823325	124823212	Y	FAM101A	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC92	367671	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	124866398	124866679	124866460	Y	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC92	411020	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr12	124907545	124908050	124907792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC92	452167	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.897691685162698
chr12	124942584	124942823	124942638	Y	UBC,NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	422391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	124951666	124951729	124951686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	413485	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	125003619	125003834	125003727	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	361380	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	125026162	125026505	125026332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	338709	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	125027797	125027993	125027883	Y	UBC,NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	337221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	125030582	125031087	125030838	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	334127	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	313839	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.24740091087892
chr12	125052829	125053041	125052928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	312173	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	125110562	125110683	125110642	Y	UBC,NCOR2	NA	NCOR2	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	254531	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr12	125110878	125111184	125111029	Y	UBC,NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	254030	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.650637959845029
chr12	125117108	125117622	125117163	Y	NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	247592	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.780988174377932
chr12	125117895	125118180	125118038	Y	NA	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	247034	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.720750970268858
chr12	125149282	125149430	125149311	Y	UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A,SCARB1	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	215784	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	125165952	125166242	125166057	Y	UBC,NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A,SCARB1	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	198972	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr12	125166598	125166935	125166767	Y	NA	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	198279	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr12	125169582	125169721	125169665	Y	UBC,NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	195493	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr12	125179424	125179850	125179505	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A,SCARB1	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	185364	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr12	125185875	125186011	125185947	Y	NA	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	179203	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr12	125188436	125188747	125188585	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	176467	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	125197556	125198099	125197767	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	167115	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr12	125204801	125205082	125204928	Y	UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	160132	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	125288540	125288810	125288726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	76404	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	125331273	125331577	125331425	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	33637	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	125332280	125332520	125332389	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	32694	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	125346086	125346324	125346188	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	18890	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr12	125347630	125347766	125347649	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	17448	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr12	125389117	125389584	125389422	Y	NCOR2,UBC	SCARB1,UBC,RPL22P19	NA	NA	NA	NA	UBC	10330	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	125395122	125395522	125395138	Y	NA	SCARB1,UBC,RPL22P19	NA	NA	NA	NA	UBC	4392	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	125400956	125401141	125401046	Y	UBC	SCARB1,UBC,RPL22P19	NA	NA	NA	NA	UBC	1042	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.197698106139239
chr12	125403508	125403991	125403767	Y	UBC	SCARB1,UBC,RPL22P19	NCOR2,SCARB1,UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	3594	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	125404545	125404922	125404790	Y	UBC	SCARB1,UBC,RPL22P19	NCOR2,SCARB1,UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	4631	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr12	125412421	125412524	125412468	Y	NA	SCARB1,UBC,RPL22P19	NA	NA	NA	NA	RPL22P19	5917	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr12	125424077	125424667	125424516	Y	NA	UBC,RPL22P19,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22P19	5636	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.378134089040938
chr12	125425237	125425455	125425374	Y	NA	UBC,RPL22P19,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22P19	6796	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210997624326124
chr12	125479851	125480155	125479863	Y	NA	DHX37,BRI3BP	NA	NA	NA	NA	BRI3BP	3605	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr12	125550830	125551017	125550923	Y	NA	AACS	NA	NA	NA	NA	AACS	2905	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr12	125565000	125565015	125565008	Y	AACS	AACS	NA	NA	NA	NA	AACS	17075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	125581977	125582373	125582099	Y	TMEM132B	AACS	NA	NA	NA	NA	AACS	34052	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	127567979	127568114	127568034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	80558	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.163294011145704
chr12	127610420	127610860	127610670	Y	NA	AC079949.1	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	37812	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	127910118	127910304	127910194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	261446	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	129305431	129305689	129305549	Y	SLC15A4,GLT1D1	SLC15A4	NA	NA	NA	NA	SLC15A4	839	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	129415293	129415562	129415333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC15A4	108765	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	129871586	129871714	129871650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC15A4	565058	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	130610556	130610854	130610701	Y	RIMBP2	FZD10-AS1,FZD10	NA	NA	NA	NA	FZD10-AS1	33947	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.469854791382079
chr12	130624608	130625033	130624823	Y	RIMBP2	FZD10-AS1,FZD10	NA	NA	NA	NA	FZD10-AS1	19768	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.423994440211509
chr12	130947882	130948028	130947955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FZD10	302878	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	131272601	131272867	131272734	Y	NA	STX2	NA	NA	NA	NA	STX2	48944	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	131405313	131405624	131405469	Y	RIMBP2,GPR133	NA	NA	NA	NA	NA	RAN	50889	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr12	131510828	131511048	131510920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAN	156404	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.296373566428234
chr12	131702988	131703123	131703024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAN	348564	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.196967956948873
chr12	131706292	131706484	131706406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAN	351868	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr12	131707348	131707723	131707417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAN	352924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr12	132203397	132203510	132203472	Y	ULK1	SFSWAP	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	9771	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	132221686	132221872	132221813	Y	NOC4L	SFSWAP	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	28060	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.225183221252787
chr12	132232542	132232780	132232661	Y	DDX51	SFSWAP	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	38916	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	132315038	132315239	132315115	Y	MMP17	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	4100	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr12	132345340	132345736	132345589	Y	SFSWAP,ULK1	MMP17,ULK1	NA	NA	NA	NA	ULK1	31460	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.04594979870983
chr12	132349078	132349283	132349182	Y	NA	MMP17,ULK1	NA	NA	NA	NA	ULK1	27913	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr12	132356836	132357024	132356894	Y	SFSWAP,ULK1	MMP17,ULK1	NA	NA	NA	NA	ULK1	20172	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr12	132368164	132368433	132368235	Y	NA	ULK1,PUS1	SFSWAP,ULK1,EP400,PUS1	IMR90	Hi-C	24141950	ULK1	8763	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr12	132861217	132861370	132861294	Y	P2RX2,GALNT9	RP13-895J2.2	NA	NA	NA	NA	RP13-895J2.2	11240	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	132903795	132904258	132904060	Y	GALNT9	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-895J2.2	53818	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255971896756917
chr12	132904307	132904701	132904477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-895J2.2	54330	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.635722213728
chr12	132970087	132970237	132970177	Y	CHFR,ANKLE2,FBRSL1	NA	GALNT9,LOC100130238,P2RX2,POLE,DDX51,NOC4L,LOC100507055,FBRSL1,EP400NL	IMR90	Hi-C	24141950	MUC8	78489	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.405966389715736
chr12	132970628	132971029	132970787	Y	CHFR,ANKLE2,FBRSL1	NA	GALNT9,LOC100130238,P2RX2,POLE,DDX51,NOC4L,LOC100507055,FBRSL1,EP400NL	IMR90	Hi-C	24141950	MUC8	77697	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr12	133029955	133030417	133030330	Y	NA	MUC8,FBRSL1	LOC100507055,FBRSL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MUC8	18309	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr12	133069115	133069562	133069360	Y	ZNF26,FBRSL1	MUC8,FBRSL1	NA	NA	NA	NA	FBRSL1	4978	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr12	133602699	133602978	133602704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF140	51446	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr12	133688468	133688629	133688567	Y	NA	ZNF140,ZNF891,ZNF10,ZNF268	NA	NA	NA	NA	ZNF891	16430	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr12	133701272	133701384	133701332	Y	ZNF605,ZNF605,ZNF26,ZNF84,ZNF84,ZNF268,ZNF268,ZNF10	ZNF140,ZNF891,ZNF10,ZNF268	NA	NA	NA	NA	ZNF891	3675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	20137811	20138146	20137910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH8	67642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr13	20546038	20546426	20546233	Y	NA	ZMYM2	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	15228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	20555489	20555876	20555683	Y	NA	ZMYM2	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	24679	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	20644269	20644474	20644387	Y	ZMYM2,ZMYM2,ZMYM2	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	113459	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr13	20744892	20745400	20745185	Y	PSPC1	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	214082	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	20748931	20749662	20749408	Y	PSPC1,ZMYM5	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	218121	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	21400254	21400509	21400379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT2	54157	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr13	21405905	21405971	21405953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT2	59808	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	21607254	21607660	21607524	Y	NA	RNU4-9P,LATS2	NA	NA	NA	NA	RNU4-9P	3146	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr13	21632492	21632727	21632640	Y	NA	RNU4-9P,LATS2	NA	NA	NA	NA	LATS2	959	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	21748962	21749145	21749040	Y	NA	SAP18,SKA3,MRP63	NA	NA	NA	NA	MRP63	178	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	22000564	22000681	22000573	Y	NA	ZDHHC20	NA	NA	NA	NA	ZDHHC20	30828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr13	22135396	22135683	22135678	Y	EFHA1	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P10	65471	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	22583629	22583981	22583861	Y	EFHA1	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P10	382475	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	23471356	23471597	23471410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTH1P7	202643	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	24133122	24133556	24133337	Y	NA	NA	MIPEP,TNFRSF19	IMR90	Hi-C	24141950	SACS	127281	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.653750264223772
chr13	24289001	24289462	24289192	Y	PCOTH	NA	NA	NA	NA	NA	C1QTNF9B-AS1	171566	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	24697003	24697328	24697264	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90	Hi-C	24141950	MIPEP	235445	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172595146214068
chr13	24722927	24723324	24723037	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIPEP	261369	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	24854044	24854200	24854080	Y	PARP4	NA	NA	NA	NA	NA	PARP4	230748	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr13	25485313	25485583	25485398	Y	PARP4,PABPC3,NUPL1,MTMR6	CENPJ	NA	NA	NA	NA	CENPJ	9435	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	25880585	25880813	25880618	Y	MTMR6,NUPL1	MTMR6,NUPL1	NA	NA	NA	NA	NUPL1	6923	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	26760531	26760858	26760712	Y	WASF3	RNF6	WASF3,RNF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF6	33933	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr13	27557231	27557465	27557334	Y	USP12,RPL21,RASL11A	NA	RASL11A,USP12,RPL21,MTIF3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP12	186568	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.27015749368358
chr13	27808177	27808245	27808213	Y	NA	RPL21,SNORD102,RASL11A	USP12,RPL21	IMR90	Hi-C	24141950	RPL21	15201	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	28010544	28010826	28010685	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	MTIF3	11913	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	28025291	28025563	28025486	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	MTIF3	2552	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.291645034119346
chr13	28167075	28167372	28167253	Y	NA	LNX2,POLR1D	NA	NA	NA	NA	LNX2	25169	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	28725313	28725682	28725498	Y	PAN3	PAN3-AS1,PAN3	NA	NA	NA	NA	PAN3	14670	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr13	29290769	29291025	29290846	Y	POMP	NA	NA	NA	NA	NA	POMP	59528	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	29327742	29327905	29327792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POMP	96501	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr13	30407984	30408178	30408116	Y	UBL3	UBL3	NA	NA	NA	NA	UBL3	14643	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	30415465	30415864	30415857	Y	NA	UBL3	NA	NA	NA	NA	UBL3	6957	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.139807279150677
chr13	30717135	30717194	30717166	Y	NA	NA	UBL3,KATNAL1,HMGB1,USPL1,ALOX5AP,LINC00426,TEX26-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	PRDX2P1	151090	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	30969684	30969817	30969776	Y	USPL1	LINC01058,UBE2L5P	LINC00426,KATNAL1,USPL1,UBL3,HMGB1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01058	24557	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr13	30982567	30982782	30982669	Y	NA	LINC01058,UBE2L5P	KATNAL1,LINC00426,USPL1,UBL3,HMGB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01058	11592	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	31483566	31483936	31483755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPH1	250589	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	31783730	31783901	31783816	Y	NA	HSPH1,B3GALTL	NA	NA	NA	NA	B3GALTL	11657	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	32620673	32620873	32620777	Y	N4BP2L2,N4BP2L2,N4BP2L1,BRCA2,FRY	FRY	NA	NA	NA	NA	FRY	17236	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr13	32664585	32664831	32664706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRY	61148	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	32780608	32781010	32780825	Y	FRY,ZAR1L	NA	NA	NA	NA	NA	BRCA2	106601	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	32956405	32956487	32956432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRCA2	68794	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	33728009	33728149	33728045	Y	STARD13	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	194618	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	33733192	33733538	33733525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	189229	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	33778763	33779029	33778994	Y	STARD13,STARD13	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	143738	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	33822427	33822802	33822649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	99965	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	33825211	33825616	33825598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	97151	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	33841256	33841381	33841376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	81386	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	33858244	33858802	33858357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	63965	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	34069113	34069239	34069161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	146346	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	34116442	34117241	34116673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	193675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.833959213045767
chr13	34216569	34217156	34216982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	173030	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr13	34217614	34217741	34217660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	172445	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	34253090	34253722	34253494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	136464	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.929522368956017
chr13	34729958	34730262	34730146	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	339772	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	34730516	34730744	34730573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	340330	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	34731212	34731445	34731362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	341026	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	34914782	34915013	34914898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	524596	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	35817825	35818146	35817986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBEA	303401	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	35887010	35887329	35887304	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBEA	372586	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	36918283	36918673	36918579	Y	NA	CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2,SPG20	NA	NA	NA	NA	SPG20	23644	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr13	38740377	38740756	38740564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UFM1	181230	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	39326204	39326315	39326228	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PROSER1	283937	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	40690248	40690533	40690364	Y	NA	NA	FOXO1	IMR90	Hi-C	24141950	COG6	462484	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr13	41229483	41229797	41229615	Y	NA	FOXO1	NA	NA	NA	NA	FOXO1	8937	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	41581586	41581700	41581679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WBP4	51710	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr13	41586512	41586699	41586606	Y	NA	WBP4,ELF1	NA	NA	NA	NA	WBP4	46711	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	41651625	41651882	41651685	Y	NA	WBP4,ELF1	NA	NA	NA	NA	ELF1	18049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr13	41825625	41825697	41825634	Y	KBTBD7,NAA16	MTRF1	NA	NA	NA	NA	MTRF1	10045	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	42162855	42163294	42163201	Y	C13orf15,DGKH	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	279514	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr13	42231052	42231244	42231148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	347711	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	42280247	42280717	42280439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKH	331459	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	42370920	42370928	42370925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKH	241248	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	42453037	42453433	42453235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKH	158743	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	42646001	42646399	42646206	Y	NA	DGKH	NA	NA	NA	NA	DGKH	33825	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr13	42967379	42967658	42967522	Y	TNFSF11,DGKH	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	123090	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	43294593	43294957	43294764	Y	NA	NA	ENOX1	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJC15	300382	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.278728479561577
chr13	43378134	43378246	43378162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	217093	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	43382131	43382356	43382244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	212983	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210997624326124
chr13	43394813	43394889	43394876	Y	NA	NA	CCDC122,LACC1	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJC15	200450	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	43451555	43451845	43451701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	143494	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr13	43467454	43467751	43467677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	127588	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	43632661	43632965	43632672	Y	NA	DNAJC15	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	37322	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.273616983623574
chr13	43656094	43656342	43656191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	60755	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	43727960	43728297	43728107	Y	NA	NA	ENOX1,DNAJC15,CCDC122,LACC1	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJC15	132621	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.543427291745903
chr13	43866757	43867095	43866777	Y	ENOX1,ENOX1	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	271418	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	44115188	44115336	44115262	Y	ENOX1,ENOX1	NA	NA	NA	NA	NA	ENOX1	243708	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	44165760	44165919	44165882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENOX1	193125	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	44329047	44329228	44329222	Y	NA	ENOX1	NA	NA	NA	NA	ENOX1	29816	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	44446151	44446617	44446342	Y	NA	LACC1,CCDC122	NA	NA	NA	NA	LACC1	4803	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	44542732	44543742	44543446	Y	SERP2	DGKZP1	SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	DGKZP1	2172	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.212996815885384
chr13	44811516	44811943	44811701	Y	NA	NA	TSC22D1,SERP2,NUFIP1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DGKZP1	270956	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr13	44833229	44833563	44833337	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	SERP2,LINC00284,TSC22D1,NUFIP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DGKZP1	292669	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr13	44842198	44842383	44842274	Y	NA	NA	SERP2,TSC22D1,NUFIP1,LINC00284	IMR90	Hi-C	24141950	DGKZP1	301638	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr13	44845135	44845603	44845341	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	SERP2,TSC22D1,NUFIP1,LINC00284	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	303680	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr13	44846792	44847050	44846982	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	SERP2,NUFIP1,TSC22D1	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	302233	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr13	44848357	44848873	44848719	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	SERP2,NUFIP1,TSC22D1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	300410	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr13	44875300	44875802	44875641	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	TSC22D1,SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	273481	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.469854791382079
chr13	44880536	44881091	44880742	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	TSC22D1,LACC1,SERP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	268192	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.7540956219143
chr13	44882133	44882330	44882202	Y	NA	NA	TSC22D1,LACC1,SERP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	266953	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.590747941297207
chr13	44884974	44885381	44885134	Y	CCDC122,TSC22D1	NA	TSC22D1,LACC1,SERP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	263902	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.605160572303575
chr13	44887042	44887399	44887172	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	TSC22D1,SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	261884	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr13	45030393	45030697	45030548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSC22D1	118586	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	45194278	45194532	45194405	Y	NA	TSC22D1	NUFIP1,TSC22D1,LINC00330	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	44995	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	45268219	45268248	45268234	Y	NA	NA	KIAA1704,NUFIP1,TSC22D1,TSC22D1-AS1,LINC00330	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	118936	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	45288309	45288506	45288432	Y	KCTD4	NA	NUFIP1,TSC22D1,TSC22D1-AS1,SERP2,LINC00330	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	139026	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	45492137	45492940	45492235	Y	TSC22D1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP1	68678	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.271617792064313
chr13	45496701	45496835	45496770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP1	64783	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	45548667	45548813	45548740	Y	NA	NUFIP1	NA	NA	NA	NA	NUFIP1	12805	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	45745052	45745233	45745142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2F2	52402	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr13	45928010	45928281	45928087	Y	NA	TPT1-AS1,TPT1	NA	NA	NA	NA	TPT1	14505	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr13	45941510	45941762	45941695	Y	COG3,TPT1	TPT1-AS1,TPT1,SLC25A30	NA	NA	NA	NA	TPT1	28005	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.194968765389612
chr13	47128078	47128394	47128310	Y	LCP1,C13orf18,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	2775	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr13	47128564	47128952	47128887	Y	LCP1,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	3261	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.322589639172887
chr13	47369610	47369907	47369759	Y	NA	ESD	NA	NA	NA	NA	ESD	243	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	48073971	48074167	48074083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAP1L4P3	261428	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.310403233805485
chr13	48464437	48464519	48464469	Y	NA	NA	HTR2A	IMR90	Hi-C	24141950	SUCLA2-AS1	109006	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	48526121	48526135	48526130	Y	MED4,SUCLA2	SUCLA2-AS1	NA	NA	NA	NA	SUCLA2-AS1	47390	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr13	49305362	49305702	49305475	Y	ITM2B,RB1,LPAR6,RCBTB2,FNDC3A	PSME2P2	NA	NA	NA	NA	PSME2P2	37562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr13	49324068	49324506	49324074	Y	NA	PSME2P2	MED4	IMR90	Hi-C	24141950	PSME2P2	18758	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr13	49357309	49357845	49357559	Y	NA	PSME2P2	ITM2B,CDADC1,FNDC3A,MLNR	IMR90	Hi-C	24141950	PSME2P2	14045	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr13	49365956	49366344	49366103	Y	RB1,RCBTB2,FNDC3A	PSME2P2	FNDC3A,MLNR	IMR90	Hi-C	24141950	PSME2P2	22692	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	49470564	49470768	49470657	Y	RCBTB2,FNDC3A	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	77280	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr13	49563041	49563333	49563220	Y	RCBTB2,CYSLTR2,SETDB2,SETDB2,CDADC1,FNDC3A	FNDC3A	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	14993	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr13	49569007	49569270	49569139	Y	NA	FNDC3A	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	20959	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	49601050	49601794	49601184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	53002	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	49761885	49761908	49761899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDADC1	58139	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr13	50209681	50209984	50209832	Y	SETDB2,ARL11	NA	NA	NA	NA	NA	RCBTB1	51962	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	50216185	50216584	50216280	Y	CAB39L,SETDB2,SETDB2,PHF11,PHF11,ARL11	EBPL	NA	NA	NA	NA	EBPL	47027	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.189510083890358
chr13	50217217	50217337	50217325	Y	SETDB2,SETDB2,PHF11,PHF11,ARL11	EBPL	NA	NA	NA	NA	EBPL	46274	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	50534396	50534668	50534593	Y	NA	SPRYD7,TRIM13,MIR3613	NA	NA	NA	NA	SPRYD7	25770	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	50559366	50559533	50559450	Y	NA	TRIM13,MIR3613	NA	NA	NA	NA	TRIM13	8491	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	50597476	50597810	50597661	Y	RCBTB1,TRIM13	TRIM13,MIR3613,MIR16-1	NA	NA	NA	NA	MIR16-1	23387	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	50602874	50603059	50603020	Y	NA	TRIM13,MIR3613,MIR16-1	NA	NA	NA	NA	MIR16-1	18138	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	50675373	50675756	50675618	Y	NA	DLEU1,DLEU2	NA	NA	NA	NA	DLEU1	21066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr13	52009334	52009441	52009388	Y	NA	RPS4XP16,INTS6	NA	NA	NA	NA	RPS4XP16	16859	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	52108681	52108727	52108704	Y	INTS6	WDFY2	MIR4703,WDFY2,DHRS12	IMR90	Hi-C	24141950	WDFY2	47917	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr13	52218923	52219366	52219003	Y	WDFY2,DHRS12,DHRS12	NA	NA	NA	NA	NA	WDFY2	62279	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	52303239	52303556	52303323	Y	WDFY2	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS12	72737	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	52319871	52320068	52319946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS12	56225	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	52376068	52376210	52376139	Y	INTS6,WDFY2,DHRS12,DHRS12	DHRS12,RP11-327P2.5	NA	NA	NA	NA	DHRS12	83	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr13	53190916	53191040	53191000	Y	NA	HNRNPA1L2,MRPS31P4,SUGT1	NA	NA	NA	NA	MRPS31P4	1223	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr13	53336765	53337066	53336916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	111921	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	54187301	54187338	54187320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	962457	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	55208577	55208909	55208656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	1983733	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	56150088	56150466	56150451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	2925244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	60338539	60338813	60338676	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	397308	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	60580804	60581154	60581101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	154967	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr13	60679231	60679569	60679243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	56552	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr13	60736273	60736548	60736444	Y	NA	DIAPH3	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	152	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr13	61913756	61914115	61913935	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRD3	945165	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr13	63021628	63021960	63021792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OR7E104P	1387206	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr13	64563606	64563820	64563696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	84324	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr13	64623751	64624068	64623941	Y	NA	LINC00355	NA	NA	NA	NA	LINC00355	24076	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	67204176	67204298	67204237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	2556032	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	67442728	67443117	67443041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	2794584	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	67461334	67461726	67461614	Y	PCDH9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	2813190	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr13	67464284	67464840	67464525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	2816140	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	67577193	67577519	67577513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	2929049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	67674730	67675228	67675034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	3026586	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	17.8988373868655
chr13	67686217	67686397	67686363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	3038073	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172595146214068
chr13	67722025	67722418	67722226	Y	PCDH9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	3073881	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr13	67730122	67730387	67730193	Y	PCDH9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	3081978	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr13	69260181	69260548	69260436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	2986651	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	70523555	70523686	70523621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	1723513	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.09938817442046
chr13	72206339	72206570	72206525	Y	DACH1	H3F3BP1	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	40629	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	72419778	72420070	72419973	Y	DACH1	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	172579	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr13	73768530	73768732	73768575	Y	NA	RNU4-10P	NA	NA	NA	NA	RNU4-10P	4865	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.41273034799637
chr13	73909414	73909609	73909563	Y	NA	NA	PIBF1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-10P	145749	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.290914884928979
chr13	73942793	73943059	73942972	Y	KLF5	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-10P	179128	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr13	73985614	73985783	73985667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-10P	221949	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	74508678	74508943	74508854	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	197451	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr13	74550144	74550303	74550225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	156091	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	74708897	74709334	74709161	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	2503	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.333159816610145
chr13	74709487	74710034	74709735	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	3093	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.441866561157871
chr13	75882191	75882614	75882549	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	171636	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	75904010	75904233	75904150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	150017	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	75965393	75965547	75965541	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	88703	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	75966064	75966537	75966363	Y	TBC1D4	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	87713	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	76080337	76080543	76080459	Y	NA	TBC1D4,COMMD6,UCHL3	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	26087	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr13	76279211	76279429	76279239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	86641	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.406349353344853
chr13	76279599	76280073	76279764	Y	LMO7	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	87029	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.354647357045912
chr13	76289938	76289995	76289967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	97368	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr13	76290964	76291186	76291007	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	98394	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.139807279150677
chr13	76336754	76337033	76336914	Y	COMMD6,LMO7	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	144184	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.234484356321151
chr13	77898193	77898346	77898226	Y	NA	MYCBP2	NA	NA	NA	NA	MYCBP2	839	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	77899332	77899971	77899636	Y	KCTD12,FBXL3,MYCBP2	MYCBP2	NA	NA	NA	NA	MYCBP2	147	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr13	79232403	79232753	79232546	Y	NA	RNF219	NA	NA	NA	NA	RNF219	1089	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr13	80122895	80122985	80122937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDFIP2	69608	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	80510902	80511186	80511006	Y	NA	NA	SPRY2	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY2	401900	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	80611072	80611300	80611181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	301786	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	85779521	85779874	85779724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4500HG	2541640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	87776313	87776722	87776395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4500HG	544792	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr13	88259012	88259340	88259160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4500HG	62174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr13	88345046	88345403	88345227	Y	NA	MIR4500HG	NA	NA	NA	NA	MIR4500HG	23532	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.761499825501424
chr13	88383188	88383252	88383222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4500HG	61674	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.385591962099453
chr13	88384592	88384886	88384741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4500HG	63078	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.650290774283778
chr13	88466706	88467088	88466903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4500HG	145192	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.619849284340899
chr13	90053531	90053928	90053634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4500HG	1732017	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr13	90167002	90167321	90167160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	1830753	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	90486324	90486483	90486404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	1511591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	91580553	91580648	91580601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	417426	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	92294972	92294984	92294978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPC5	246043	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.252129443187807
chr13	92871734	92872145	92872019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC3P	161637	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr13	92874267	92874578	92874398	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC3P	164170	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr13	92900985	92901044	92901015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC3P	190888	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr13	92927934	92928164	92928120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC3P	217837	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	92940642	92941183	92940919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC3P	230545	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	93001340	93001722	93001531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC3P	291243	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr13	93083293	93083662	93083475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC3P	373196	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.63772140528726
chr13	93096966	93097333	93097096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC3P	386869	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.189510083890358
chr13	93361116	93361155	93361136	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC3P	651019	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	95201580	95202169	95201893	Y	NA	TGDS,GPR180	NA	NA	NA	NA	TGDS	44342	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	95749553	95749872	95749713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC4	201815	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	95931058	95931197	95931128	Y	ABCC4	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	20490	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	95932787	95933077	95933010	Y	NA	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	18610	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr13	95951518	95951672	95951596	Y	ABCC4	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	15	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	96498991	96499334	96499248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	171598	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	96517437	96517518	96517478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGGT2	186218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr13	97879082	97879401	97879140	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	7394	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr13	97908706	97909024	97908751	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	37018	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.174594337773329
chr13	97912286	97912462	97912389	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	40598	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.228642711192781
chr13	99121203	99121258	99121231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	106936	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr13	99128638	99129073	99128919	Y	STK24	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	99121	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	99169761	99169891	99169826	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	58303	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	99223213	99223429	99223417	Y	STK24	STK24	NA	NA	NA	NA	STK24	4765	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	99278853	99278891	99278872	Y	NA	CALM2P4	STK24,FARP1	IMR90	Hi-C	24141950	CALM2P4	12602	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	99655287	99655290	99655289	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBAC2-AS1	195674	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	99874246	99874352	99874282	Y	NA	UBAC2-AS1,UBAC2,H2AFZP3	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	8234	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	99934075	99934613	99934350	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	68063	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	99957911	99958107	99958020	Y	DOCK9,CLYBL,GPR18,GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	91899	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	99974545	99974749	99974637	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	108533	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	100010340	100010660	100010510	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR183,CLYBL	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	141011	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr13	100013491	100013836	100013585	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	137835	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	100077871	100078176	100078098	Y	GPR183	NA	MIR548AN,UBAC2,DOCK9,UBAC2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	TM9SF2	73495	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	100154383	100154610	100154487	Y	GPR183	TM9SF2	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	2712	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr13	100630794	100630989	100630800	Y	NA	ZIC5,ZIC2	NA	NA	NA	NA	ZIC2	1037	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	100644149	100644384	100644267	Y	ZIC5,ZIC2	ZIC5,ZIC2	NA	NA	NA	NA	ZIC2	12123	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	100738422	100738621	100738542	Y	NA	PCCA	NA	NA	NA	NA	PCCA	648	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr13	100928465	100928851	100928516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL15P18	127119	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	102143126	102143433	102143292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NALCN	76283	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr13	102403781	102404089	102404035	Y	NALCN	NA	NA	NA	NA	NA	NALCN	336938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr13	103244790	103245125	103245073	Y	ERCC5,TPP2	TPP2	TPP2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TPP2	2228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	103249969	103250343	103250155	Y	ERCC5,TPP2	TPP2	NA	NA	NA	NA	TPP2	2616	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	103752669	103752951	103752813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCC5	257475	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	104371816	104371919	104371873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCC5	876622	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr13	107078443	107078580	107078574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	139932	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	107188808	107188962	107188940	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	29550	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	107222796	107223196	107222998	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	4284	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr13	107448247	107448283	107448269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G1P5	134462	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	108918601	108918948	108918826	Y	TNFSF13B,LIG4,ABHD13	LIG4,ABHD13,TNFSF13B	NA	NA	NA	NA	TNFSF13B	17013	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	109568044	109568430	109568179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO16	321544	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.750426532953506
chr13	109572126	109572187	109572157	Y	MYO16,MYO16	NA	NA	NA	NA	NA	MYO16	325626	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr13	109576446	109576812	109576641	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO16	329946	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	109597213	109597584	109597276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO16	350713	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	109807507	109807975	109807755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO16	561007	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr13	109808669	109809037	109808800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO16	562169	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr13	109847392	109847697	109847628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL162497.1	557918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	109852673	109853050	109852860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL162497.1	552565	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	109895773	109895899	109895836	Y	NA	NA	MYO16,IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	509716	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	109909294	109909814	109909611	Y	NA	NA	MYO16,IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	495801	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr13	109921804	109922211	109922051	Y	NA	NA	IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	483404	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.26341233475653
chr13	110042212	110042565	110042393	Y	IRS2	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	363050	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr13	110132729	110132862	110132798	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	272753	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.284187161060831
chr13	110138208	110138554	110138379	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	267061	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	110147333	110147690	110147511	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	257925	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.358262776535316
chr13	110274718	110274736	110274728	Y	IRS2	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	130879	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	110352571	110352699	110352636	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	52916	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	110359460	110359633	110359542	Y	IRS2	AL162497.1	MYO16,IRS2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AL162497.1	45982	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	110401088	110401398	110401243	Y	NA	AL162497.1,IRS2	NA	NA	NA	NA	AL162497.1	4217	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	110426988	110427362	110427201	Y	NA	AL162497.1,IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	9553	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	110439676	110440079	110439929	Y	IRS2	AL162497.1,IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	2761	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.179322870082216
chr13	110669788	110670084	110669997	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	232873	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	111064452	111064750	111064655	Y	RAB20	COL4A2-AS2	NA	NA	NA	NA	COL4A2-AS2	48884	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	111176913	111177121	111177092	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	RAB20	NA	NA	NA	NA	RAB20	34959	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr13	111212967	111213224	111213111	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	RAB20	COL4A2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RAB20	887	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	111410023	111410076	111410050	Y	NA	ING1,CARS2	CARS2,LINC00346,ING1,COL4A2	IMR90	Hi-C	24141950	CARS2	46073	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr13	111526935	111527249	111527195	Y	RAB20	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	LINC00346	6773	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	111544033	111544176	111544105	Y	ING1,ING1	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	21240	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr13	111560939	111561133	111561094	Y	NA	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	4283	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.37573449879366
chr13	111595123	111595236	111595180	Y	NA	ANKRD10	ANKRD10,ARHGEF7	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	29707	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	111609846	111610157	111610005	Y	RAB20,ANKRD10	ANKRD10	ARHGEF7,ANKRD10	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	44430	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr13	113179985	113180373	113180107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP3	60108	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr13	113294900	113294930	113294914	Y	C13orf35	ATP11A	NA	NA	NA	NA	ATP11A	47713	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	113377120	113377559	113377252	Y	NA	ATP11A	NA	NA	NA	NA	ATP11A	34477	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	113514166	113514374	113514224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11A	171523	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	113549464	113549664	113549543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11A	206821	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	113585588	113585716	113585676	Y	CUL4A,CUL4A	NA	C13orf35,ATP11A,MCF2L	GM12878,HELA,K562,H1ESC	5C	22955621	F10	189412	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.380863429790566
chr13	113597069	113597276	113597160	Y	MCF2L	NA	MCF2L,MCF2L-AS1,F10,F7,CUL4A	H1ESC,HELA,K562,IMR90,MCF7	5C,Hi-C,ChIA-PET	22955621,24141950,22265404	F10	177852	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	113677034	113677374	113677296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	F10	97754	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.299485870806977
chr13	113704885	113705219	113705051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	F10	69909	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	113806516	113806910	113806731	Y	ATP11A,CUL4A	F10	PROZ	IMR90	Hi-C	24141950	F10	31388	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr13	113808289	113808746	113808533	Y	NA	F10	PROZ	IMR90	Hi-C	24141950	F10	33161	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	113828673	113828834	113828768	Y	ATP11A,DCUN1D2,CUL4A	CUL4A,PCID2	NA	NA	NA	NA	CUL4A	31718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	114064803	114065029	114064948	Y	NA	GRTP1	NA	NA	NA	NA	GRTP1	48357	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr13	114065698	114065892	114065794	Y	MCF2L,ADPRHL1	GRTP1	NA	NA	NA	NA	GRTP1	49252	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.189510083890358
chr13	114080351	114080489	114080411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-16P	50904	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.62647474813103
chr13	114119812	114119949	114119881	Y	NA	RNU1-16P,DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	RNU1-16P	11444	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr13	114124603	114124675	114124639	Y	NA	RNU1-16P,DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	RNU1-16P	6718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	114127046	114127213	114127130	Y	GRTP1,DCUN1D2	RNU1-16P,DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	RNU1-16P	4180	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr13	114147699	114148153	114147800	Y	F7,F10,PROZ,GRTP1	RNU1-16P,DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	TMCO3	4389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.528128581999758
chr13	114301802	114302224	114301872	Y	GAS6	NA	NA	NA	NA	NA	TFDP1	64789	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	114445132	114445240	114445183	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	GAS6	119806	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr13	114459608	114459701	114459670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAS6	105345	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187893855960214
chr13	114830489	114831626	114831334	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	64460	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.04914647650225
chr13	114834440	114834743	114834634	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	61343	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr13	114864762	114865011	114864824	Y	RASA3	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	31075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr13	114884280	114884926	114884814	Y	NA	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	11160	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr13	114927536	114927629	114927597	Y	RASA3	RASA3	RASA3,CDC16,FLJ44054,ATP4B,CHAMP1	IMR90	Hi-C	24141950	RASA3	31450	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr13	115046177	115046319	115046229	Y	RASA3	CDC16,UPF3A,CHAMP1	NA	NA	NA	NA	UPF3A	1118	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr13	115078776	115079079	115078928	Y	NA	UPF3A,CHAMP1	NA	NA	NA	NA	CHAMP1	788	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	20516120	20516206	20516163	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC5	255947	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	20803011	20803143	20803077	Y	NA	TTC5,CCNB1IP1,PARP2,RPPH1	NA	NA	NA	NA	CCNB1IP1	3540	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	21150605	21151121	21150987	Y	TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	269	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.629533383038379
chr14	21151333	21151694	21151411	Y	NA	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	997	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr14	21439863	21440073	21439999	Y	NA	METTL17,RP11-84C10.4,SLC39A2	NA	NA	NA	NA	METTL17	15856	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr14	21564675	21565076	21564876	Y	NA	ARHGEF40,NDRG2,ZNF219	NA	NA	NA	NA	ZNF219	5805	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	21577986	21578258	21578000	Y	NA	ARHGEF40,NDRG2,ZNF219	NA	NA	NA	NA	ZNF219	7105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.536316604248639
chr14	21660147	21660368	21660311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	75285	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	21684818	21685080	21685024	Y	OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	50573	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr14	22080552	22080764	22080649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL3	103035	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	23056506	23056666	23056661	Y	REM2	DAD1,ABHD4	NA	NA	NA	NA	DAD1	331	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	23083172	23083436	23083304	Y	NA	DAD1,ABHD4	NA	NA	NA	NA	ABHD4	18026	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.189510083890358
chr14	23158454	23158656	23158578	Y	SLC7A7	CTD-2555K7.1	DAD1,OXA1L,SLC7A7,ABHD4,REM2,LRP10	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2555K7.1	3088	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	23357263	23357473	23357436	Y	NA	LRP10,REM2,RBM23,PRMT5-AS1,PRMT5,RP11-298I3.1	NA	NA	NA	NA	REM2	6889	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	23449151	23449315	23449234	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB	MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	536	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208268283576497
chr14	23449757	23450231	23450060	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB	MIR4707,HAUS4,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.12087571485623
chr14	23466494	23466910	23466688	Y	CDH24,C14orf93	MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93,PSMB5	NA	NA	NA	NA	C14orf93	10465	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr14	23554726	23554907	23554813	Y	SLC7A7,RBM23,ACIN1	CDH24,C14orf119,ACIN1	NA	NA	NA	NA	C14orf119	7067	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	23584186	23584501	23584299	Y	C14orf119	C14orf119,ACIN1	NA	NA	NA	NA	ACIN1	21363	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr14	23611395	23611621	23611510	Y	SLC7A8	C14orf119,ACIN1,SLC7A8	NA	NA	NA	NA	SLC7A8	39262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.433451504829284
chr14	24008139	24008541	24008214	Y	DHRS4L2,DHRS4L2,SLC22A17,SLC22A17,CMTM5,ZFHX2,JPH4	THTPA,ZFHX2,AP1G2	NA	NA	NA	NA	THTPA	14675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	24454112	24454320	24454216	Y	DHRS4L2,DHRS4L2	DHRS4,DHRS4L2	NA	NA	NA	NA	DHRS4L2	16964	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	24481106	24481351	24481229	Y	NA	DHRS4L2,LRRC16B	NA	NA	NA	NA	LRRC16B	37855	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	24712544	24712898	24712739	Y	DHRS4L1,DCAF11,DCAF11,PSME1,RNF31,IRF9,RIPK3,LTB4R,KHNYN,CIDEB,TINF2	TM9SF1,CHMP4A,MDP1,NEDD8-MDP1,GMPR2,NEDD8,TINF2,TGM1,RABGGTA	NA	NA	NA	NA	TINF2	2664	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	24755187	24755313	24755250	Y	DHRS4L1	TINF2,TGM1,RABGGTA,DHRS1,LTB4R	NA	NA	NA	NA	DHRS1	11726	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr14	27311220	27311475	27311345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN2P6	1576678	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr14	31055388	31055443	31055417	Y	NA	G2E3,SCFD1	NA	NA	NA	NA	G2E3	29059	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr14	31165114	31165442	31165278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCFD1	75796	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	31360303	31360625	31360494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-829H16.2	71678	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr14	31478440	31478826	31478753	Y	NA	AP4S1,STRN3	NA	NA	NA	NA	AP4S1	13486	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr14	31698850	31699225	31699035	Y	STRN3	HECTD1	AP4S1,HECTD1,STRN3,HEATR5A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HECTD1	23840	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.239212888630038
chr14	31732842	31733131	31732940	Y	NA	NA	AP4S1,HEATR5A,HECTD1,STRN3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HECTD1	57832	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	32597823	32598061	32597946	Y	NUBPL	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP5-AS1	53824	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr14	32670916	32671247	32671221	Y	NA	NA	NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP5-AS1	126917	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	32672212	32672871	32672506	Y	ARHGAP5	NA	NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP5-AS1	128213	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr14	32941850	32942320	32942112	Y	NA	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	9686	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.621692546350748
chr14	32976944	32977104	32977024	Y	NA	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	24938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	32979007	32979394	32979291	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	27001	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.499183168505477
chr14	33402784	33403168	33402896	Y	NPAS3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	450778	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	34407631	34407737	34407684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSSA	521825	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr14	34504920	34505230	34505078	Y	NA	NA	EGLN3	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	424332	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr14	34529400	34529785	34529476	Y	EGLN3	NA	EGLN3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	399777	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr14	34801443	34801630	34801553	Y	NA	NA	SPTSSA	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	127932	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr14	34966252	34966485	34966304	Y	NA	SPTSSA,EGLN3,EAPP	NA	NA	NA	NA	EGLN3	36272	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.472584132131707
chr14	35084533	35084797	35084665	Y	EAPP	RPS19P3,SNX6	NA	NA	NA	NA	SNX6	12592	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr14	35090811	35090907	35090859	Y	NA	SNX6	NA	NA	NA	NA	SNX6	6482	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr14	35120187	35120582	35120411	Y	SNX6,SNX6	SNX6	SNX6,BAZ1A,CFL2,PPP2R3C	IMR90	Hi-C	24141950	SNX6	22798	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.120163000724761
chr14	35250371	35250766	35250653	Y	SRP54,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	NA	CFL2	68342	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr14	35325148	35325514	35325424	Y	PSMA6,PPP2R3C,BAZ1A	RP11-73E17.2,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	RP11-73E17.2	16035	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	35562791	35563105	35562948	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	PPP2R3C	26618	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	35575000	35575033	35575017	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	PPP2R3C	14690	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	35625298	35625573	35625393	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	35543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr14	35628271	35628433	35628369	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	38516	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr14	35755529	35755685	35755573	Y	BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,NFKBIA,PSMA6	PSMA6	NA	NA	NA	NA	PSMA6	9690	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	35802308	35802726	35802409	Y	BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	53549	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr14	35805683	35806194	35806003	Y	BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	50081	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.218455497384639
chr14	35810635	35811251	35810911	Y	BAZ1A,FAM177A1,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1	PPP2R3C,KIAA0391,PSMA6,NFKBIA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-561B11.1	45024	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.61880727605171
chr14	35825324	35825456	35825405	Y	BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	PSMA6,SNX6,PPP2R3C,KIAA0391,NFKBIA	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-561B11.1	30819	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.294374374868973
chr14	35834310	35835208	35834855	Y	BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	PSMA6,SNX6,PPP2R3C,KIAA0391,NFKBIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-561B11.1	21067	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr14	35839188	35839529	35839227	Y	NA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NFKBIA	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-561B11.1	16746	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	35854902	35855043	35854959	Y	NA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	1232	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.254858783937435
chr14	35869907	35870271	35870165	Y	FAM177A1,PPP2R3C,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NFKBIA	1684	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	35875800	35875964	35875882	Y	SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NFKBIA	3845	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	36277376	36277519	36277444	Y	NFKBIA,RALGAPA1	RALGAPA1,NUTF2P2,BRMS1L	NA	NA	NA	NA	RALGAPA1	866	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	36977511	36977654	36977606	Y	MBIP,SFTA3,NKX2-1,NKX2-1	NA	NA	NA	NA	NA	PAX9	147119	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	37445830	37445969	37445900	Y	NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A21	194102	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr14	37785804	37785829	37785809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPOL1	120686	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr14	38067310	38067714	38067659	Y	NA	RP11-356O9.2,TTC6,FOXA1	NA	NA	NA	NA	FOXA1	65	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	39559553	39559840	39559693	Y	NA	SEC23A,GEMIN2	NA	NA	NA	NA	SEC23A	17010	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.1996972976985
chr14	39637578	39637824	39637713	Y	NA	PNN	NA	NA	NA	NA	TRAPPC6B	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	39737909	39738305	39738022	Y	NA	CTAGE5	NA	NA	NA	NA	CTAGE5	5421	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	39954969	39955272	39955039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	55265	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	39958924	39958943	39958934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	59220	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr14	44437752	44437871	44437812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	926627	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	45483090	45483569	45483224	Y	NA	KLHL28	NA	NA	NA	NA	KLHL28	25956	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr14	45505148	45505421	45505276	Y	NA	KLHL28,PRPF39	NA	NA	NA	NA	KLHL28	4104	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	45518258	45518310	45518284	Y	PRPF39	KLHL28,PRPF39	NA	NA	NA	NA	KLHL28	8733	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	45554390	45554749	45554468	Y	NA	KLHL28,PRPF39,FKBP3,FANCM	NA	NA	NA	NA	PRPF39	3088	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr14	45592379	45592731	45592576	Y	PRPF39	PRPF39,FKBP3,FANCM	NA	NA	NA	NA	FKBP3	9791	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	45714299	45714525	45714379	Y	NA	MIS18BP1	NA	NA	NA	NA	MIS18BP1	6218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr14	45721298	45721397	45721336	Y	KLHL28,PRPF39,FANCM,MIS18BP1	MIS18BP1	NA	NA	NA	NA	MIS18BP1	555	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr14	45723245	45723364	45723320	Y	NA	MIS18BP1	NA	NA	NA	NA	MIS18BP1	2502	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr14	47526400	47526720	47526539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL13AP2	141587	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr14	48109739	48110114	48110083	Y	MDGA2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL13AP2	441432	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	49000423	49000807	49000609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SL1	1050490	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	50237132	50237443	50237218	Y	KLHDC2	KLHDC2	NA	NA	NA	NA	KLHDC2	4806	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	50256678	50256775	50256761	Y	NA	KLHDC2	NA	NA	NA	NA	KLHDC2	24352	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	50328432	50328642	50328440	Y	METTL21D,ARF6,RPL36AL,DNAAF2	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	10511	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.229025674821897
chr14	50328882	50329315	50329091	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	10961	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.159295628027183
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.05881314014083
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.33298645200183
chr14	50374574	50374717	50374657	Y	RPL36AL,MGAT2,C14orf182,C14orf183,ARF6	ARF6	NA	NA	NA	NA	ARF6	16764	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	50465888	50466432	50466066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARF6	108078	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.252129443187807
chr14	50467375	50468846	50468075	Y	RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D	NA	NA	NA	NA	NA	ARF6	109565	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.28724625231281
chr14	50475850	50475934	50475889	Y	ARF6,C14orf182	NA	NA	NA	NA	NA	ARF6	118040	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.244671570129293
chr14	50527611	50528257	50527921	Y	RPL36AL,ARF6,C14orf182	NA	NA	NA	NA	NA	SOS2	168019	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210997624326124
chr14	50528497	50528810	50528555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOS2	167466	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	50648447	50648735	50648723	Y	NA	SOS2	NA	NA	NA	NA	SOS2	47541	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr14	50799629	50799645	50799635	Y	NA	ATP5S,L2HGDH	NA	NA	NA	NA	L2HGDH	22363	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr14	50926261	50926342	50926322	Y	MAP4K5,ATL1,ATL1,CDKL1	CDKL1	NA	NA	NA	NA	CDKL1	45082	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr14	50988191	50988449	50988343	Y	NA	MAP4K5	NA	NA	NA	NA	MAP4K5	37395	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	51136928	51137372	51137340	Y	NA	SAV1	NA	NA	NA	NA	SAV1	3879	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr14	51142431	51142560	51142495	Y	NA	SAV1	ATL1,SAV1,CDKL1,NIN,PYGL	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAV1	9382	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	51144322	51144826	51144405	Y	NA	SAV1	ATL1,SAV1,NIN	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAV1	11273	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr14	51286113	51286196	51286155	Y	PYGL,NIN	NIN	NA	NA	NA	NA	NIN	9643	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	51410207	51410388	51410282	Y	NIN,PYGL	PYGL	NA	NA	NA	NA	PYGL	753	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.301832247927488
chr14	51434779	51434836	51434798	Y	NA	PYGL	NA	NA	NA	NA	PYGL	25325	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	51830897	51831022	51831007	Y	TRIM9	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	122796	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	52104818	52105424	52105148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	151000	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	52110768	52111053	52110947	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	156950	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	52119936	52120349	52120008	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	166118	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	52145900	52146294	52146052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG2	144619	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	52163680	52163849	52163765	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	GNG2	127064	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	52544712	52544946	52544828	Y	NA	NID2	NID2,C14orf166,TXNDC16	IMR90	Hi-C	24141950	NID2	11000	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr14	52547300	52547782	52547649	Y	NA	NID2	NID2,C14orf166,TXNDC16	IMR90	Hi-C	24141950	NID2	13588	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.53541309044996
chr14	52584121	52584359	52584179	Y	NA	NA	NID2,C14orf166	IMR90	Hi-C	24141950	NID2	50409	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.180053019272583
chr14	52622606	52622722	52622664	Y	NA	NA	C14orf166,NID2,PTGDR	IMR90	Hi-C	24141950	NID2	88894	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr14	53020677	53020806	53020735	Y	PTGDR,TXNDC16,GPR137C	TXNDC16,GPR137C	NA	NA	NA	NA	GPR137C	2811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	53257268	53257587	53257438	Y	NA	GNPNAT1	NA	NA	NA	NA	GNPNAT1	882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr14	53294197	53294464	53294329	Y	NA	GNPNAT1	FERMT2	IMR90	Hi-C	24141950	GNPNAT1	37811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.223184029693526
chr14	53302326	53302477	53302407	Y	NA	GNPNAT1	NA	NA	NA	NA	GNPNAT1	45940	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.562185491432042
chr14	53399403	53399746	53399574	Y	NA	FERMT2	NA	NA	NA	NA	FERMT2	17407	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	53416335	53416646	53416599	Y	GPR137C	FERMT2	NA	NA	NA	NA	FERMT2	507	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.206269092017237
chr14	54649490	54649642	54649566	Y	NA	NA	BMP4	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN3	211925	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	54899909	54900051	54899977	Y	NA	CDKN3	NA	NA	NA	NA	CDKN3	38342	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr14	54954614	54954684	54954648	Y	NA	GMFB,CGRRF1	NA	NA	NA	NA	GMFB	700	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.333889965800512
chr14	55116749	55117607	55117330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	84934	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	55152891	55153126	55153104	Y	SAMD4A	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	121076	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr14	55439267	55439511	55439438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDHD1	52312	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr14	55541499	55541595	55541574	Y	NA	WDHD1,SOCS4,MAPK1IP1L,LGALS3	NA	NA	NA	NA	MAPK1IP1L	25150	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr14	55544307	55544654	55544518	Y	NA	MAPK1IP1L,LGALS3	NA	NA	NA	NA	MAPK1IP1L	27958	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.943552036333268
chr14	55569033	55569319	55569207	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	19509	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	18652	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.2226277014561
chr14	55574465	55575376	55574639	Y	GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3	LGALS3	MAPK1IP1L	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	13452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.171864997023702
chr14	55584452	55585250	55584591	Y	GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3	LGALS3	MAPK1IP1L,SOCS4,LGALS3,DLGAP5	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	3578	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr14	55589429	55589640	55589507	Y	NA	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,WDHD1,MAPK1IP1L	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	601	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr14	55589903	55590059	55589993	Y	GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,WDHD1,MAPK1IP1L	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	1075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	55593915	55594674	55594041	Y	GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3	LGALS3	NA	NA	NA	NA	LGALS3	5087	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr14	55596570	55597156	55596587	Y	NA	LGALS3	NA	NA	NA	NA	LGALS3	7742	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr14	55765939	55766288	55766115	Y	GCH1	FBXO34,RP11-665C16.6	NA	NA	NA	NA	RP11-665C16.6	29146	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	55921336	55921695	55921412	Y	NA	ATG14	NA	NA	NA	NA	ATG14	44760	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr14	56047594	56047945	56047904	Y	NA	KTN1,KTN1-AS1	NA	NA	NA	NA	KTN1-AS1	2766	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.399777559026116
chr14	56274024	56274269	56274148	Y	NA	RPL13AP3,LINC00520	NA	NA	NA	NA	LINC00520	12618	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	56677019	56677095	56677057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PELI2	94487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	57047832	57047974	57047932	Y	PELI2,C14orf101	NA	NA	NA	NA	NA	PELI2	465300	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr14	57264055	57264245	57264231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC5	469481	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	57725682	57725794	57725735	Y	NA	EXOC5	NA	NA	NA	NA	EXOC5	7932	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	58449709	58450271	58450031	Y	NA	NA	C14orf37	IMR90	Hi-C	24141950	UBA52P3	155726	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	58748134	58748542	58748422	Y	ARID4A	PSMA3,RP11-349A22.5,C14orf37,ARID4A	NA	NA	NA	NA	RP11-349A22.5	14310	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr14	59002332	59002438	59002384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM9	110000	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	59221069	59221139	59221083	Y	NA	RP11-112J1.1	DACT1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-112J1.1	38233	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	59565112	59565514	59565267	Y	NA	NA	KIAA0586,DACT1	IMR90	Hi-C	24141950	DAAM1	87850	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	59861080	59861273	59861260	Y	DAAM1,RTN1	NA	DAAM1	IMR90	Hi-C	24141950	JKAMP	87888	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	59908838	59908842	59908840	Y	NA	JKAMP	NA	NA	NA	NA	JKAMP	40319	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	59949393	59949731	59949550	Y	C14orf149	JKAMP	NA	NA	NA	NA	JKAMP	232	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr14	60618583	60618767	60618659	Y	PPM1A,C14orf135,DHRS7	DHRS7	NA	NA	NA	NA	DHRS7	15807	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr14	60679186	60679974	60679676	Y	NA	DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2	NA	NA	NA	NA	PPM1A	30496	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.528128581999758
chr14	61188145	61188381	61188263	Y	NA	SIX4,MNAT1	NA	NA	NA	NA	SIX4	685	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	61456427	61456721	61456474	Y	SLC38A6	RP11-193F5.4,SLC38A6,TRMT5	NA	NA	NA	NA	TRMT5	10351	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	61570265	61570959	61570637	Y	SLC38A6	NA	NA	NA	NA	NA	TRMT5	124189	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr14	61904242	61904399	61904321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	130859	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	61938268	61939375	61939158	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	95883	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.512829872253612
chr14	61946856	61947374	61946994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	87884	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr14	61960014	61960497	61960231	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	74761	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr14	61969529	61970113	61969734	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	65145	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	61978357	61978646	61978426	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	56612	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.594207431237201
chr14	61978878	61979019	61978952	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	56239	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.780258025187565
chr14	61979288	61979588	61979394	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	55670	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.175324486963695
chr14	61980898	61981080	61981008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	54178	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr14	61985151	61985397	61985317	Y	HIF1A	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	49861	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	61993253	61993443	61993274	Y	NA	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	41815	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr14	61993702	61994099	61993768	Y	NA	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	41159	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.124891533033648
chr14	62025043	62025333	62025150	Y	NA	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	9925	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr14	62026213	62026731	62026533	Y	NA	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	8527	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr14	62032593	62032996	62032785	Y	HIF1A	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	2262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.819773616119104
chr14	62040859	62041355	62041035	Y	NA	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	5601	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.260700429065805
chr14	62052395	62052634	62052478	Y	NA	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	17137	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr14	62052734	62053075	62053015	Y	SYT16	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	17476	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.372292443912568
chr14	62058743	62058958	62058799	Y	HIF1A	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	23485	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr14	62061169	62061631	62061310	Y	HIF1A	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	25911	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	62069550	62069793	62069672	Y	NA	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	34292	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	62115448	62115553	62115501	Y	PRKCH,SYT16	HIF1A,HIF1A-AS1	NA	NA	NA	NA	HIF1A	44678	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr14	62157799	62158071	62157921	Y	HIF1A	HIF1A,HIF1A-AS1,RP11-618G20.1	NA	NA	NA	NA	HIF1A	2160	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	62219407	62219640	62219496	Y	HIF1A,SNAPC1	RP11-618G20.1,SNAPC1	NA	NA	NA	NA	SNAPC1	7435	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	62298450	62298645	62298529	Y	NA	COX4I1P1	PRKCH,FLJ22447,HIF1A-AS2,HIF1A,SNAPC1	IMR90	Hi-C	24141950	COX4I1P1	1363	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	63159002	63159168	63159087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNH5	407587	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	63236531	63236843	63236687	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNH5	329912	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	63983921	63984319	63984190	Y	NA	PPP2R5E	NA	NA	NA	NA	PPP2R5E	23773	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	64109095	64109326	64109156	Y	SYNE2,WDR89,WDR89	HSPE1P2,WDR89	NA	NA	NA	NA	WDR89	2516	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.301988177476899
chr14	64170371	64170528	64170450	Y	NA	SGPP1	NA	NA	NA	NA	SGPP1	22229	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr14	64185455	64185764	64185678	Y	PPP2R5E,SYNE2,WDR89,WDR89,SGPP1	SGPP1,RP11-804M7.2	NA	NA	NA	NA	SGPP1	6993	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr14	64320785	64320937	64320842	Y	PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2	SYNE2	NA	NA	NA	NA	SYNE2	3102	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.313132574555112
chr14	64403874	64404095	64403883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE2	86191	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	64912318	64912487	64912430	Y	ESR2,ZBTB25,ZBTB1,AKAP5	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB1	55943	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr14	64968114	64968655	64968380	Y	ZBTB25,ZBTB1	ZBTB25,HSPA2,PPP1R36	NA	NA	NA	NA	ZBTB1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.677392925768209
chr14	64975156	64975343	64975202	Y	NA	ZBTB1,ZBTB25,HSPA2,PPP1R36	NA	NA	NA	NA	ZBTB25	5225	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	64976158	64976191	64976175	Y	ZBTB25,ZBTB1	ZBTB1,ZBTB25,HSPA2,PPP1R36	NA	NA	NA	NA	ZBTB25	6227	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	65006188	65006351	65006244	Y	NA	ZBTB1,ZBTB25,HSPA2,PPP1R36	NA	NA	NA	NA	HSPA2	5565	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.1996972976985
chr14	65115289	65115345	65115316	Y	NA	NA	ZBTB25,ZBTB1,SPTB,PLEKHG3,CHURC1-FNTB,MTHFD1,PPP1R36,HSPA2	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHG3	53475	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	65172114	65172865	65172414	Y	SYNE2,ZBTB1,MAX,CHURC1,PLEKHG3	PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	3294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	65224783	65224915	65224850	Y	ZBTB1,PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	55963	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	65229015	65229197	65229106	Y	SPTB,PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	60195	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr14	65229595	65229717	65229658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	60775	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.218455497384639
chr14	65469693	65469823	65469758	Y	NA	RAB15	NA	NA	NA	NA	RAB15	32199	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	65641048	65641253	65641171	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90	Hi-C	24141950	MAX	73635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr14	65705887	65706189	65706012	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAX	138474	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	65746592	65747003	65746788	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90	Hi-C	24141950	FUT8	128307	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr14	66126309	66126626	66126333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	250999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.326588022291408
chr14	66511264	66511273	66511269	Y	GPHN	NA	NA	NA	NA	NA	GPHN	460852	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	66856568	66856818	66856763	Y	GPHN	NA	NA	NA	NA	NA	GPHN	115307	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	66912712	66912753	66912717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPHN	59372	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr14	67416708	67417057	67416792	Y	GPHN	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	288769	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	67728313	67728625	67728469	Y	NA	MPP5	NA	NA	NA	NA	MPP5	22487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	67763359	67763655	67763501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	57533	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	67809024	67809296	67809169	Y	RDH12,MPP5,PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	15418	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr14	68161499	68161767	68161616	Y	PLEK2	VTI1B,RDH11,RDH12	NA	NA	NA	NA	RDH11	968	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.556691031864922
chr14	68408350	68408505	68408421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	123854	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	68431145	68431760	68431180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	146649	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr14	68456427	68456429	68456428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	171931	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	68555311	68555805	68555391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	270815	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr14	68604521	68604895	68604639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	282018	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr14	68607037	68607479	68607161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	279434	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr14	68613334	68613955	68613742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	272958	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	68658646	68658820	68658748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	228093	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	68712620	68712855	68712738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	174058	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr14	68835621	68835756	68835701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	51157	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	68925660	68925982	68925837	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	38747	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.143649732719787
chr14	69014304	69014714	69014453	Y	ACTN1	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	127391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.507371190754358
chr14	69014972	69015327	69015083	Y	ACTN1	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	128059	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.25324255600729
chr14	69065409	69066172	69065453	Y	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	178496	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr14	69149155	69149350	69149272	Y	ZFP36L1,DCAF5	NA	RAD51B,ZFP36L1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP36L1	111840	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	69171999	69172408	69172198	Y	NA	NA	ZFP36L1,RAD51B	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP36L1	88782	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr14	69281323	69281785	69281441	Y	DCAF5	ZFP36L1	RAD51B,ZFYVE26	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L1	20133	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	69417780	69418181	69417964	Y	NA	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	25976	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	69424468	69424783	69424642	Y	NA	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	19374	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	69576488	69576915	69576681	Y	NA	DCAF5	NA	NA	NA	NA	DCAF5	40952	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	69598076	69598493	69598218	Y	NA	DCAF5	NA	NA	NA	NA	DCAF5	19374	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	69618210	69618757	69618360	Y	NA	DCAF5,EXD2	NA	NA	NA	NA	DCAF5	343	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.254128634747068
chr14	69867695	69867997	69867846	Y	NA	SLC39A9,ERH	NA	NA	NA	NA	ERH	4351	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr14	69913588	69913836	69913761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERH	50244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	70020113	70020453	70020282	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0247	55860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.195351729018728
chr14	70079600	70080000	70079702	Y	NA	KIAA0247	NA	NA	NA	NA	KIAA0247	3287	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	70099072	70099485	70099117	Y	DCAF5,SRSF5,SRSF5,KIAA0247	KIAA0247	NA	NA	NA	NA	KIAA0247	22759	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	70168752	70169016	70168820	Y	SLC8A3,KIAA0247,SRSF5,SRSF5	SRSF5	NA	NA	NA	NA	SRSF5	22601	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	70447892	70448065	70447949	Y	SMOC1	NA	NA	NA	NA	NA	SMOC1	129044	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr14	70464665	70464959	70464731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMOC1	145817	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.603317310293725
chr14	70465984	70466470	70466191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMOC1	147136	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.180053019272583
chr14	70803999	70804244	70804143	Y	NA	COX16	NA	NA	NA	NA	COX16	20204	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr14	70844763	70845165	70845114	Y	NA	COX16,SYNJ2BP-COX16,SYNJ2BP	NA	NA	NA	NA	COX16	20315	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	71164534	71164679	71164625	Y	MED6	NA	NA	NA	NA	NA	TTC9	58030	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151837754968669
chr14	71797093	71797681	71797289	Y	PCNX	SIPA1L1,RP1-261D10.2	SIPA1L1,LOC145474	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-261D10.2	10562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr14	71811948	71812060	71812004	Y	NA	SIPA1L1,RP1-261D10.2	SIPA1L1	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-261D10.2	25417	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	71870372	71870659	71870456	Y	PCNX,SIPA1L1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	83841	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr14	72021176	72021324	72021237	Y	SIPA1L1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	234645	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	73585185	73585324	73585255	Y	NA	PSEN1	NA	NA	NA	NA	PSEN1	15802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	73824884	73825148	73825019	Y	ZFYVE1,ZFYVE1,RBM25,PSEN1,NUMB	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-240K6.3	101981	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr14	73919503	73919783	73919743	Y	NA	RP1-240K6.3,NUMB,C14orf169	NA	NA	NA	NA	RP1-240K6.3	7346	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	74207610	74207866	74207660	Y	C14orf43	PNMA1,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	PNMA1	28482	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	74208106	74208498	74208298	Y	C14orf43	PNMA1,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	PNMA1	28978	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	74224982	74225468	74225101	Y	NA	PNMA1,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1021I20.1	26595	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	74252099	74252503	74252342	Y	NA	RP5-1021I20.1,RP5-1021I20.2	NA	NA	NA	NA	RP5-1021I20.1	36	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.488612991068219
chr14	74949377	74949710	74949544	Y	NA	MIR4709,ISCA2,NPC2	NA	NA	NA	NA	MIR4709	4470	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr14	75038441	75039020	75038725	Y	NPC2,DLST	NA	NA	NA	NA	NA	NPC2	79561	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	75492523	75492557	75492545	Y	NA	EIF2B2,MLH3,ACYP1	NA	NA	NA	NA	MLH3	23678	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	75521336	75521721	75521672	Y	MLH3,ACYP1	MLH3,ACYP1	NA	NA	NA	NA	MLH3	5101	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.241212080189299
chr14	75592667	75593037	75593004	Y	NA	RP11-950C14.7,NEK9,TMED10	NA	NA	NA	NA	NEK9	620	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	75607767	75608156	75607957	Y	FOS	RP11-950C14.7,NEK9,TMED10	NEK9	IMR90	Hi-C	24141950	NEK9	15720	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	75649674	75650038	75649826	Y	FOS	TMED10	TMED10,LOC731223,FOS,RPS6KL1,NEK9	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TMED10	8340	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166753501085698
chr14	75688633	75689211	75688968	Y	DLST,FOS	TMED10,RP11-293M10.2	PGF,NEK9,TMED10,FOS,LOC731223,BATF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-293M10.2	34903	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	75697272	75697400	75697329	Y	NA	RP11-293M10.2,FOS	TMED10,NEK9,LOC731223,ZC2HC1C,FOS,BATF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-293M10.2	26714	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr14	75761897	75762132	75762064	Y	FOS,JDP2,JDP2,JDP2,FLVCR2,FLVCR2	RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5	NA	NA	NA	NA	RP11-293M10.5	2790	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.235370435060929
chr14	75765697	75765964	75765861	Y	FOS,JDP2,JDP2,JDP2,JDP2,FLVCR2,FLVCR2	RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5	NA	NA	NA	NA	RP11-293M10.5	6590	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr14	75920164	75920191	75920178	Y	JDP2	JDP2	NA	NA	NA	NA	JDP2	27745	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.175324486963695
chr14	76027371	76027398	76027385	Y	NA	BATF,FLVCR2,RP11-507E23.1	NA	NA	NA	NA	FLVCR2	15562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr14	76234838	76235006	76234846	Y	NA	NA	TGFB3,IFT43	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf1	109306	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.149994492958819
chr14	76513976	76514095	76514005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB3	66642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr14	76843326	76843356	76843341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-187O7.1	256648	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	77384574	77384777	77384608	Y	IRF2BPL	RP11-488C13.1,RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	33481	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr14	77384980	77385465	77385224	Y	VASH1	RP11-488C13.1,RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	33887	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr14	77422240	77422571	77422458	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,KIAA1737	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	1410	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.239212888630038
chr14	77423763	77424258	77424192	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	RP11-7F17.1	IRF2BPL,KIAA1737	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr14	77425025	77425260	77425132	Y	C14orf166B,IRF2BPL	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	1044	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	77427398	77427552	77427469	Y	C14orf166B,IRF2BPL	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	3417	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	77428060	77428442	77428341	Y	NA	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	4079	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr14	77431067	77431579	77431238	Y	NA	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.1	1447	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr14	77495718	77495873	77495815	Y	NA	IRF2BPL,RP11-7F17.3	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	2684	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL,RP11-7F17.3	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.03038827681611
chr14	77640033	77640278	77640160	Y	NA	NA	C14orf166B,ZDHHC22,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,TMEM63C,NGB,MIR1260A,TMED8	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-7F17.3	99346	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	78196199	78196534	78196363	Y	NA	ALKBH1,SLIRP,C14orf178,SNW1	NA	NA	NA	NA	SLIRP	23785	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr14	79886057	79886209	79886119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIO2	965891	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	80062928	80063212	80063068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIO2	788888	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr14	81375179	81375565	81375372	Y	STON2,CEP128	CEP128	NA	NA	NA	NA	CEP128	48296	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	SNORA79,DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.02494839467044
chr14	81867255	81867616	81867435	Y	GTF2A1,GTF2A1,STON2	STON2	NA	NA	NA	NA	STON2	33193	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	81867886	81868104	81867969	Y	GTF2A1,GTF2A1	STON2	NA	NA	NA	NA	STON2	32705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	86066316	86066619	86066414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2341M24.1	332435	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	88472465	88473193	88472806	Y	GALC,GALC,GPR65	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA7	376075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	88884161	88884478	88884321	Y	NA	SPATA7	NA	NA	NA	NA	SPATA7	34893	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr14	89466992	89467193	89467101	Y	FOXN3	NA	EFCAB11,FOXN3,PRO1768,EML5,TTC8,LOC400236,TDP1	IMR90	Hi-C	24141950	TTC8	178495	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	89671493	89671906	89671673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC8	382996	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	89739645	89739700	89739695	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	343793	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	89770346	89770725	89770409	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	312768	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	89772713	89772723	89772718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	310770	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	89881748	89882141	89882044	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	201352	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr14	89887223	89887427	89887324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	196066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	90055887	90056088	90056076	Y	NA	FOXN3	NA	NA	NA	NA	FOXN3	27405	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	90083286	90083622	90083526	Y	TDP1,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	90168731	90169025	90168878	Y	NA	NA	FOXN3,LOC400236,PRO1768,EFCAB11	IMR90	Hi-C	24141950	FOXN3	85238	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr14	90761350	90761506	90761428	Y	NA	PSMC1	NA	NA	NA	NA	PSMC1	40511	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr14	91134460	91134696	91134603	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7B	146127	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr14	91393752	91394149	91393951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-3035D6.2	101280	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr14	91423143	91423331	91423289	Y	RPS6KA5,CCDC88C	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	101649	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr14	91454457	91454803	91454684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	70177	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	91511263	91511534	91511399	Y	NA	RPS6KA5	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	13446	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	91697855	91698086	91698043	Y	C14orf159,SMEK1,GPR68	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	172875	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	91730791	91731194	91731191	Y	NA	NA	GPR68	K562	ChIA-PET	22265404	CCDC88C	150994	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	91759632	91759894	91759768	Y	RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	122294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	91814664	91814951	91814783	Y	RPS6KA5,C14orf159,SMEK1,CCDC88C	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	67237	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	91827435	91827790	91827659	Y	RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	54398	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr14	91926776	91927002	91926960	Y	NA	CCDC88C,SMEK1	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	44588	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	92572132	92572295	92572249	Y	CATSPERB,SLC24A4,SLC24A4,RIN3,ATXN3	ATXN3,NDUFB1,CPSF2	NA	NA	NA	NA	ATXN3	1167	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.352804095036062
chr14	92574762	92574984	92574843	Y	NA	ATXN3,NDUFB1,CPSF2	NA	NA	NA	NA	ATXN3	3797	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	93035062	93035389	93035185	Y	RIN3	NA	NA	NA	NA	NA	LGMN	177658	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	93119846	93119961	93119893	Y	ITPK1,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	NA	NA	NA	NA	NA	LGMN	93086	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	93192576	93192808	93192662	Y	MOAP1,C14orf142,C14orf109,C14orf109,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	LGMN	NA	NA	NA	NA	LGMN	20239	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr14	93193771	93194035	93193928	Y	MOAP1,C14orf109,C14orf109,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	LGMN	NA	NA	NA	NA	LGMN	19012	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	93509801	93510236	93510094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPK1	70429	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.653367300594656
chr14	93510584	93510744	93510686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPK1	69921	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	93635981	93636377	93636218	Y	NA	MOAP1,RP11-371E8.4,UBR7,C14orf142	NA	NA	NA	NA	MOAP1	12896	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	93776910	93777138	93777024	Y	PRIMA1	BTBD7	NA	NA	NA	NA	BTBD7	20300	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	95064751	95064770	95064761	Y	SERPINA10,SERPINA10,SERPINA6,SERPINA1,SERPINA11,SERPINA12,SERPINA4,SERPINA5,SERPINA3	SERPINA3	NA	NA	NA	NA	SERPINA3	11944	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	95066800	95067322	95067074	Y	SERPINA10,SERPINA10,SERPINA6,SERPINA1,SERPINA11,SERPINA4,SERPINA5,SERPINA3	SERPINA3	NA	NA	NA	NA	SERPINA3	9392	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr14	95513227	95513493	95513361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DICER1	108854	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.241942229379666
chr14	95522849	95523085	95522967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DICER1	99262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	96739430	96739734	96739582	Y	NA	BDKRB1	NA	NA	NA	NA	BDKRB1	19269	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr14	97282222	97282363	97282293	Y	NA	VRK1	NA	NA	NA	NA	VRK1	20581	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	505578	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.69030948032598
chr14	99657940	99658586	99658223	Y	C14orf177,BCL11B	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	286630	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	99726837	99727734	99727584	Y	BCL11B	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	217482	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	99934490	99934508	99934499	Y	EML1	SETD3,CCNK	NA	NA	NA	NA	SETD3	10708	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr14	100040610	100041006	100040947	Y	SETD3,CCDC85C	CCDC85C,RP11-543C4.1	NA	NA	NA	NA	CCDC85C	27357	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr14	100068632	100068970	100068687	Y	NA	CCDC85C	NA	NA	NA	NA	RP11-543C4.1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr14	100071651	100072022	100071781	Y	NA	CCDC85C,RP11-543C4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-543C4.1	2758	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr14	100196933	100197043	100196991	Y	NA	EML1	NA	NA	NA	NA	EML1	4987	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr14	100497913	100498157	100498035	Y	NA	NA	EVL,YY1,DEGS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YY1	204478	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	100659173	100659604	100659490	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4	DEGS2,YY1,EVL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YY1	43031	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.217725348194272
chr14	100751761	100751840	100751790	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29	NA	NA	NA	NA	SLC25A29	19044	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.247783874508036
chr14	100874667	100875097	100874987	Y	WARS,WARS,WDR25,WDR25	RP11-638I2.10,WDR25,WARS,RP11-362L22.1	NA	NA	NA	NA	RP11-362L22.1	3731	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.7538860228935
chr14	100882790	100883112	100882951	Y	NA	WDR25,WARS,RP11-362L22.1	BEGAIN	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-362L22.1	11854	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.185511700771837
chr14	100883887	100884104	100884057	Y	BEGAIN	WDR25,WARS,RP11-362L22.1	NA	NA	NA	NA	RP11-362L22.1	12951	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.70128051279588
chr14	100889838	100890227	100890041	Y	BEGAIN	WDR25,WARS,RP11-362L22.1	BEGAIN	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-362L22.1	18902	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	100899876	100900012	100899943	Y	WARS,WARS	RP11-362L22.1	NA	NA	NA	NA	RP11-362L22.1	28940	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	100901180	100901603	100901493	Y	WARS,WARS	RP11-362L22.1	NA	NA	NA	NA	RP11-362L22.1	30244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr14	100905618	100905757	100905695	Y	BEGAIN	RP11-362L22.1	BEGAIN	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-362L22.1	34682	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.526285319989908
chr14	100906618	100906904	100906684	Y	NA	RP11-362L22.1	BEGAIN	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-362L22.1	35682	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.330047512231402
chr14	101020509	101020866	101020628	Y	WARS,WARS,WDR25,WDR25,BEGAIN	BEGAIN	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	30884	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.447481172206536
chr14	101023349	101023562	101023455	Y	BEGAIN	BEGAIN	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	28188	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.237213697070778
chr14	101024059	101024421	101024266	Y	WARS,WARS,WDR25,WDR25	BEGAIN	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	27329	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr14	101029795	101030067	101029931	Y	NA	BEGAIN	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	21683	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	101049817	101049857	101049837	Y	DLK1,BEGAIN	BEGAIN	WDR25,MEG3,BEGAIN	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BEGAIN	1893	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	101159258	101159870	101159708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEG3	83877	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.25268622776986
chr14	101454914	101455185	101454975	Y	DLK1,RTL1	SNORD114-19	NA	NA	NA	NA	SNORD114-19	14100	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	102089844	102089938	102089891	Y	NA	NA	MEG8,LINC00523,MIR381,MIR376C,MIR654,MIR1185-1,MIR539,MIR376B,MIR495,MIR889,MIR1185-2,MIR300,MIR376A2,MIR376A1,MIR655,MIR487B	IMR90	Hi-C	24141950	DIO3	64156	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	102277268	102277494	102277347	Y	PPP2R5C,WDR20,DYNC1H1,PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	51133	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	102292259	102292630	102292392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	66124	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	102340393	102340589	102340458	Y	PPP2R5C,WDR20,DYNC1H1,PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	88276	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	102396001	102396203	102396103	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	32662	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.01310917486429
chr14	102415545	102415736	102415629	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13129	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr14	102530459	102530762	102530662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR20	73078	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	102554875	102555215	102555129	Y	HSP90AA1	WDR20,HSP90AA1	NA	NA	NA	NA	WDR20	48625	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	102780583	102780765	102780709	Y	NA	MOK,ZNF839,CINP,TECPR2	MOK,DYNC1H1,HSP90AA1,WDR20,ZNF839	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF839	949	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr14	102819515	102819720	102819663	Y	WDR20,TRAF3,RCOR1,TECPR2,CINP,CINP	MOK,ZNF839,CINP,TECPR2	NA	NA	NA	NA	CINP	7533	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	102971480	102971658	102971568	Y	NA	ANKRD9,CTD-2555C10.3	NA	NA	NA	NA	ANKRD9	2478	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr14	102977207	102977381	102977329	Y	AMN	ANKRD9,CTD-2555C10.3	NA	NA	NA	NA	ANKRD9	3071	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	102991046	102991386	102991124	Y	NA	ANKRD9,CTD-2555C10.3	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	16910	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.00874480683094
chr14	102991831	102991939	102991900	Y	NA	ANKRD9,CTD-2555C10.3	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2555C10.3	17652	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.914223659209872
chr14	102993844	102994139	102994010	Y	TRAF3,RCOR1	ANKRD9,CTD-2555C10.3	RCOR1,TECPR2,ANKRD9,CDC42BPB,MIR4309,TRAF3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CTD-2555C10.3	15452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.658095832903544
chr14	102997284	102997579	102997375	Y	TRAF3,RCOR1	ANKRD9,CTD-2555C10.3	MIR4309,RCOR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2555C10.3	12012	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.06333207342891
chr14	103251609	103251698	103251662	Y	NA	TRAF3	NA	NA	NA	NA	TRAF3	9796	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	103266656	103267057	103266785	Y	NA	TRAF3	CDC42BPB,AMN	IMR90	Hi-C	24141950	TRAF3	24843	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	103537585	103537989	103537775	Y	NA	CDC42BPB,TNFAIP2	CDC42BPB,EIF5	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42BPB	15786	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.921525602718974
chr14	103539359	103539722	103539623	Y	NA	CDC42BPB,TNFAIP2	CDC42BPB,EIF5	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42BPB	17560	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.536316604248639
chr14	103540554	103540738	103540645	Y	NA	CDC42BPB,TNFAIP2	CDC42BPB,EIF5	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42BPB	18755	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.545773668866414
chr14	103541337	103541574	103541446	Y	NA	CDC42BPB,TNFAIP2	CDC42BPB,EIF5	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42BPB	19538	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.46968142677376
chr14	103557952	103558007	103557980	Y	NA	CDC42BPB,TNFAIP2	CDC42BPB,EXOC3L4,TNFAIP2,EIF5,LOC100131366,MARK3	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TNFAIP2	29772	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr14	103575159	103575514	103575439	Y	MARK3,BAG5,BAG5,TRAF3,EIF5,EIF5,TNFAIP2	TNFAIP2	NA	NA	NA	NA	TNFAIP2	12265	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr14	103577206	103577606	103577492	Y	C14orf153	TNFAIP2	NA	NA	NA	NA	TNFAIP2	10173	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.393049835157968
chr14	103577820	103578081	103577991	Y	MARK3,BAG5,BAG5,TRAF3,EIF5,EIF5,TNFAIP2	TNFAIP2	NA	NA	NA	NA	TNFAIP2	9698	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr14	103584331	103584767	103584436	Y	MARK3,BAG5,BAG5,TRAF3,EIF5,EIF5,TNFAIP2	TNFAIP2	NA	NA	NA	NA	TNFAIP2	3012	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	103672017	103672095	103672056	Y	NA	NA	LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP2	84238	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr14	103672309	103672597	103672449	Y	EXOC3L4	NA	LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP2	84530	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr14	103673427	103673966	103673589	Y	CDC42BPB	NA	LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP2	85648	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.59102955279836
chr14	103675395	103675682	103675539	Y	NA	NA	LOC100131366,EXOC3L4,EIF5,CDC42BPB,MARK3,RCOR1,TNFAIP2	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP2	87616	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	103726827	103727460	103727139	Y	MARK3,TRAF3,TNFAIP2,EIF5,EIF5	NA	EIF5,CDC42BPB,EXOC3L4,TNFAIP2,LOC100131366	IMR90	Hi-C	24141950	EIF5	70421	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr14	103828242	103828602	103828384	Y	TNFAIP2,EIF5,EIF5,MARK3	EIF5,MARK3	NA	NA	NA	NA	MARK3	21127	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.331160625050885
chr14	103867345	103867626	103867486	Y	NA	MARK3	NA	NA	NA	NA	MARK3	17616	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	103889614	103889901	103889771	Y	TNFAIP2,EIF5,EIF5,MARK3	MARK3	NA	NA	NA	NA	MARK3	39885	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	103929089	103929460	103929098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKB	57988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	103954462	103954719	103954539	Y	MARK3,KLC1	CKB,TRMT61A	NA	NA	NA	NA	CKB	32729	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr14	104567152	104567615	104567473	Y	NA	KIF26A	NA	NA	NA	NA	KIF26A	35445	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	104583053	104583460	104583371	Y	NA	KIF26A	NA	NA	NA	NA	KIF26A	19600	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	104616017	104616378	104616259	Y	NA	KIF26A	NA	NA	NA	NA	KIF26A	12957	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr14	104763034	104763369	104763107	Y	TMEM179	NA	NA	NA	NA	NA	KIF26A	159974	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.903533330291068
chr14	104766695	104767088	104766699	Y	TMEM179	NA	NA	NA	NA	NA	KIF26A	163635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.285073239800609
chr14	105144100	105144955	105144117	Y	GPR132,AKT1	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	RP11-982M15.6	528	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.234484356321151
chr14	105148231	105148612	105148591	Y	INF2	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	RP11-982M15.6	2748	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.322589639172887
chr14	105154013	105154712	105154273	Y	ADSSL1	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	INF2	70	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.300216019997344
chr14	105191285	105191466	105191451	Y	NA	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1,SIVA1	NA	NA	NA	NA	ADSSL1	2762	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.212996815885384
chr14	105198821	105199110	105199005	Y	C14orf180,ADSSL1	INF2,ADSSL1,SIVA1	NA	NA	NA	NA	ADSSL1	10298	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.467855599822819
chr14	105290315	105290696	105290451	Y	GPR132	AKT1,RPS26P49	NA	NA	NA	NA	RPS26P49	4812	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	105327046	105327788	105327205	Y	NA	RPS26P49	NA	NA	NA	NA	RPS26P49	31538	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.503755771264953
chr14	105330138	105330246	105330192	Y	NA	RPS26P49	NA	NA	NA	NA	RPS26P49	34630	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr14	105433766	105434012	105433864	Y	KIAA0284,JAG2,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	8682	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr14	105434041	105434308	105434245	Y	NA	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	8386	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.293644225678606
chr14	105434660	105434907	105434734	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	7787	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208268283576497
chr14	105435117	105435479	105435281	Y	KIAA0284	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	7215	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	105438668	105438757	105438725	Y	KIAA0284,JAG2,CDCA4,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	AHNAK2	3937	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.624421887100376
chr14	105439556	105439771	105439692	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	2923	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.412694113583884
chr14	105440243	105440515	105440379	Y	NA	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	2179	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	105493379	105493756	105493698	Y	NA	C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	7894	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr14	105554572	105554923	105554752	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1,AHNAK2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	69087	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	105557924	105558306	105558075	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1,JAG2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	72439	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr14	105625647	105625988	105625853	Y	NA	JAG2,NUDT14	NA	NA	NA	NA	JAG2	7173	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr14	105630127	105630455	105630291	Y	NA	JAG2,NUDT14	NA	NA	NA	NA	JAG2	2706	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	105660348	105660502	105660414	Y	CRIP2,JAG2,NUDT14	JAG2,NUDT14	NA	NA	NA	NA	NUDT14	14688	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr14	105947921	105948133	105948082	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	3403	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.256857975496695
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	2511	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.921022487608313
chr14	105949862	105949973	105949911	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	1563	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr14	107252931	107253417	107253022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGHV3-23	529198	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	21905791	21906130	21906013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-603B24.2	637959	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.278728479561577
chr15	25564293	25564526	25564383	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	117602	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr15	25565589	25566847	25566046	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	115281	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr15	25586903	25587047	25586976	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	95081	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	25595443	25596209	25595953	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	85919	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	25604152	25604594	25604190	Y	SNURF,SNRPN,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	77534	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	25625771	25626455	25625879	Y	SNURF,SNRPN	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	55673	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	25634776	25635000	25634877	Y	SNURF,SNRPN	UBE3A	NA	NA	NA	NA	UBE3A	47128	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	25642287	25642724	25642425	Y	UBE3A	UBE3A	NA	NA	NA	NA	UBE3A	39404	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	25748610	25748872	25748744	Y	NA	NA	LOC100128714	IMR90	Hi-C	24141950	UBE3A	66482	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	25811823	25812139	25811960	Y	NA	NA	LOC100128714	IMR90	Hi-C	24141950	UBE3A	129695	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.124891533033648
chr15	26189125	26189384	26189256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	506997	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	26359333	26359715	26359530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	677205	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	27014024	27014086	27014055	Y	GABRB3,GABRB3,GABRA5,GABRA5	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	1331896	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	27333003	27333354	27333179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL41P2	1225444	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	27901122	27901398	27901260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL41P2	657400	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr15	28339947	28339987	28339948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL41P2	218811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr15	28342283	28342646	28342468	Y	OCA2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL41P2	216152	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	29526240	29526874	29526776	Y	NA	NDNL2	NA	NA	NA	NA	NDNL2	33159	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr15	30022522	30022814	30022806	Y	FAM189A1	NA	NA	NA	NA	NA	TJP1	236254	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr15	31215782	31215951	31215851	Y	FAN1,FAN1,MTMR10	FAN1	NA	NA	NA	NA	FAN1	21727	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	31406091	31406308	31406200	Y	MTMR10	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-16E12.1	99915	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	31617195	31617521	31617244	Y	MTMR10,KLF13	KLF13	NA	NA	NA	NA	KLF13	137	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	31680805	31681075	31680940	Y	MTMR10	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	63747	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	31690304	31690476	31690390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	73246	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	31757580	31757887	31757714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	140522	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	31799647	31800074	31799955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	182589	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	33162710	33163027	33162926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	257365	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	33418806	33419006	33418854	Y	NA	NA	FMN1,SCG5,ARHGAP11A,GREM1	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP11A	513461	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	34290038	34290177	34290053	Y	NA	AVEN	NA	NA	NA	NA	AVEN	39200	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	34421770	34422050	34421910	Y	NA	PGBD4	NA	NA	NA	NA	PGBD4	29496	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	34625973	34627107	34626354	Y	NA	SLC12A6,NOP10,LPCAT4	NA	NA	NA	NA	SLC12A6	1154	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	34807090	34807442	34807248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOLGA8A,GOLGA8B	71262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	35014105	35014549	35014217	Y	NA	NA	AQR,GJD2	IMR90	Hi-C	24141950	ACTC1	71791	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.246670761688553
chr15	35384953	35385239	35385081	Y	NA	RP11-323I15.2	ATPBD4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-323I15.2	2271	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr15	35590731	35591134	35590845	Y	NA	RP11-150L8.4	ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-150L8.4	1090	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.198081069768355
chr15	35788754	35789006	35788880	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-150L8.4	199113	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	36502579	36502898	36502738	Y	NA	RP11-184D12.1	NA	NA	NA	NA	RP11-184D12.1	39560	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr15	36720333	36720777	36720654	Y	NA	NA	ATPBD4,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	C15orf41	149035	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	37175924	37176266	37175984	Y	C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1P1	67264	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	37278170	37278456	37278428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-128A17.1	111084	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	37656383	37656399	37656391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS2	264879	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	38546643	38547172	38546943	Y	NA	SPRED1	NA	NA	NA	NA	SPRED1	4116	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	38750000	38750177	38750089	Y	NA	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	5672	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	38751078	38751316	38751209	Y	NA	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	6750	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr15	38784019	38784367	38784201	Y	RASGRP1	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	39691	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	39371433	39371559	39371496	Y	NA	NA	C15orf53	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	499721	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	40164744	40164978	40164948	Y	NA	GPR176	NA	NA	NA	NA	GPR176	46115	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	40179429	40179904	40179805	Y	NA	GPR176,EIF2AK4	FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR176	31189	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	40192845	40193084	40192965	Y	NA	GPR176,EIF2AK4	NA	NA	NA	NA	GPR176	18009	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr15	40361212	40361596	40361446	Y	NA	SRP14,BMF	NA	NA	NA	NA	SRP14	31823	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr15	40391032	40391342	40391133	Y	PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	7751	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr15	40395466	40395787	40395613	Y	NA	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	3306	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	40397040	40397227	40397203	Y	BUB1B,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	1866	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr15	40397293	40397725	40397605	Y	PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	1368	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	40601054	40601299	40601247	Y	BMF,BMF,C15orf57,BAHD1,PLCB2	ANKRD63,PLCB2,C15orf52,DISP2	PAK6	K562	ChIA-PET	22265404	PLCB2	2918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.4968010133171
chr15	40730551	40730903	40730713	Y	NA	IVD,BAHD1,CHST14	NA	NA	NA	NA	BAHD1	631	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	40803808	40804249	40803896	Y	NA	CHST14	NA	NA	NA	NA	CHST14	42648	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.198081069768355
chr15	41139695	41139794	41139738	Y	NA	ZFYVE19,DNAJC17,RHOV,VPS18	NA	NA	NA	NA	RHOV	24693	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	41158071	41158384	41158228	Y	RHOV	RHOV,VPS18	NA	NA	NA	NA	RHOV	6103	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.510100531503985
chr15	41220555	41220912	41220794	Y	NUSAP1,DLL4	VPS18,DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	DLL4	1017	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	41233721	41234461	41233781	Y	C15orf57,VPS18	VPS18,DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	CHAC1	8699	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182052210831843
chr15	41254301	41254691	41254494	Y	NA	DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	CHAC1	11141	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.17365595385684
chr15	41264604	41264924	41264664	Y	NA	DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	CHAC1	21444	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr15	41581854	41582095	41581909	Y	NA	OIP5-AS1,OIP5,NUSAP1	NA	NA	NA	NA	OIP5-AS1	7666	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr15	41741039	41741403	41741222	Y	NA	NDUFAF1,RTF1,ITPKA	NA	NA	NA	NA	ITPKA	42188	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr15	41852021	41852342	41852130	Y	MAPKBP1,JMJD7,ITPKA,TYRO3	RPAP1,TYRO3	NA	NA	NA	NA	TYRO3	4148	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	41920606	41920652	41920629	Y	NA	MGA	TYRO3,MAPKBP1,MGA	IMR90	Hi-C	24141950	MGA	9184	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	41953918	41954236	41954127	Y	EHD4,MGA	MGA	MAPKBP1	IMR90	Hi-C	24141950	MGA	42496	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.405966389715736
chr15	42226071	42226526	42226165	Y	EHD4	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	36250	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	42228791	42229215	42228969	Y	MGA,JMJD7,TMEM87A,EHD4	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	33561	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	42232566	42232958	42232887	Y	EHD4	EHD4	SPTBN5	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	29818	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	42327713	42327843	42327787	Y	MAPKBP1,PLA2G4B	NA	EHD4	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	64937	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr15	42349424	42349982	42349743	Y	MGA,JMJD7,EHD4,VPS39,TMEM87A,SNAP23	NA	PLA2G4E	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	86648	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.155836138087189
chr15	42547123	42547182	42547153	Y	NA	VPS39,GANC,TMEM87A	NA	NA	NA	NA	GANC	16249	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	42549506	42549513	42549508	Y	PLA2G4E	GANC,TMEM87A	NA	NA	NA	NA	GANC	13918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	42723209	42723609	42723409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNAP23	57822	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	42814906	42815063	42814960	Y	NA	SNAP23,LRRC57,HAUS2	NA	NA	NA	NA	LRRC57	23937	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr15	42833928	42834273	42834101	Y	NA	LRRC57,HAUS2,STARD9	NA	NA	NA	NA	LRRC57	4727	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	43081091	43081306	43081168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDAN1	53767	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	43152474	43152861	43152772	Y	STARD9,TTBK2	NA	NA	NA	NA	NA	TTBK2	58146	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	43200953	43201247	43201100	Y	NA	TTBK2	NA	NA	NA	NA	TTBK2	9760	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	43321563	43321622	43321602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBR1	74689	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	43415014	43415563	43415337	Y	NA	UBR1,RPS3AP47,TMEM62	NA	NA	NA	NA	TMEM62	1537	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.167136464714814
chr15	43757406	43757566	43757505	Y	NA	TP53BP1	NA	NA	NA	NA	TP53BP1	43360	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	44073726	44074107	44073917	Y	NA	PDIA3,CATSPER2P1,SERF2,ELL3,MFAP1,WDR76	NA	NA	NA	NA	ELL3	5985	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	44181815	44182145	44181980	Y	NA	PIN4P1	NA	NA	NA	NA	PIN4P1	15373	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	44837233	44837387	44837300	Y	CTDSPL2,PATL2	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	9978	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	44838663	44839045	44838853	Y	NA	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	11408	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr15	44869897	44870156	44869963	Y	NA	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	42642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr15	44954800	44955080	44954968	Y	CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11	SPG11,PATL2,B2M	NA	NA	NA	NA	SPG11	924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.616964014041861
chr15	45004703	45005017	45004887	Y	CASC4,CTDSPL2,SPG11,PATL2,B2M,TRIM69	PATL2,B2M,TRIM69	NA	NA	NA	NA	B2M	3028	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr15	45005185	45005759	45005376	Y	CTDSPL2,SPG11,PATL2,B2M,TRIM69	PATL2,B2M,TRIM69	NA	NA	NA	NA	B2M	3510	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr15	45076532	45076874	45076594	Y	B2M	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM69	57346	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr15	45737363	45738279	45737765	Y	SQRDL,PLDN,SPATA5L1,C15orf48	GATM,SPATA5L1,RP11-519G16.3	NA	NA	NA	NA	RP11-519G16.3	346	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	45746745	45747578	45747238	Y	SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN	RP11-519G16.3	NA	NA	NA	NA	RP11-519G16.3	8120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr15	45748469	45749175	45748989	Y	SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN	RP11-519G16.3	NA	NA	NA	NA	RP11-519G16.3	9844	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.644676163235113
chr15	45806628	45806688	45806658	Y	NA	SLC30A4	NA	NA	NA	NA	SLC30A4	6317	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	45930863	45931040	45930963	Y	C15orf48,PLDN,SQRDL	SQRDL	NA	NA	NA	NA	SQRDL	9517	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	48104672	48105061	48104769	Y	NA	NA	SEMA6D	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2270N23.1	83540	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.66964153661984
chr15	49087141	49087279	49087204	Y	NA	CEP152	NA	NA	NA	NA	CEP152	14064	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	49160709	49161101	49160898	Y	NA	EID1	NA	NA	NA	NA	EID1	6982	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	49163848	49164006	49163956	Y	NA	EID1	NA	NA	NA	NA	EID1	4077	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	49268018	49268116	49268067	Y	NA	SHC4	NA	NA	NA	NA	SHC4	14377	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	49598906	49599159	49599033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF7	114134	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	49785048	49785439	49785238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF7	71755	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	49939997	49940334	49940166	Y	NA	DTWD1	NA	NA	NA	NA	DTWD1	28820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	49967299	49967495	49967408	Y	FGF7,DTWD1	NA	GALK2,C15orf33,ATP8B4,DTWD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DTWD1	56122	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	50140337	50140734	50140509	Y	FGF7,DTWD1	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2647E9.1	55894	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.310403233805485
chr15	50201915	50201939	50201930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2647E9.1	117472	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	50335306	50335619	50335473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC27A2	136774	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	50408630	50408976	50408933	Y	USP8,HDC,GABPB1,ATP8B4	NA	NA	NA	NA	NA	SLC27A2	63417	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr15	50426655	50427246	50427087	Y	USP8,GABPB1	SLC27A2,ATP8B4	ATP8B4,GALK2,GABPB1,SHC4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC27A2	45147	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr15	50427574	50427814	50427745	Y	NA	SLC27A2,ATP8B4	ATP8B4,GALK2,GABPB1,SHC4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC27A2	44579	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.225913370443154
chr15	50429549	50429984	50429688	Y	USP8,GABPB1	SLC27A2,ATP8B4	ATP8B4,GALK2,GABPB1,SHC4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC27A2	42409	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.30765645799696
chr15	50475759	50476090	50475833	Y	SLC27A2	SLC27A2,ATP8B4	NA	NA	NA	NA	ATP8B4	2745	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.418152795083139
chr15	50633863	50634132	50634006	Y	ATP8B4,HDC,USP8,GABPB1	GABPB1-AS1,GABPB1	NA	NA	NA	NA	GABPB1-AS1	11393	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	50634288	50634665	50634477	Y	NA	GABPB1-AS1,GABPB1	NA	NA	NA	NA	GABPB1-AS1	10860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	50876708	50877085	50876843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPM7	99927	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	50995097	50995499	50995351	Y	SPPL2A	TRPM7	NA	NA	NA	NA	TRPM7	18085	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.222297950953749
chr15	51169242	51169420	51169339	Y	USP8,TRPM7,SPPL2A	AP4E1	TRPM7,USP50,SPPL2A,AP4E1,ASB18	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404,19890323	AP4E1	29449	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	51172834	51173079	51172965	Y	USP8,TRPM7,SPPL2A	AP4E1	TRPM7,SPPL2A,USP50,ASB18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,19890323,22265404	AP4E1	25790	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	51173397	51173629	51173520	Y	USP8,SPPL2A	AP4E1	TRPM7,SPPL2A,USP50,ASB18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,19890323,22265404	AP4E1	25240	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	51212270	51212627	51212449	Y	NA	AP4E1	NA	NA	NA	NA	AP4E1	13401	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	51909690	51910017	51909879	Y	NA	DMXL2	NA	NA	NA	NA	DMXL2	3013	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	52024012	52024470	52024199	Y	TMOD3,MAPK6,DMXL2,LYSMD2	TMOD2,LYSMD2	NA	NA	NA	NA	TMOD2	17288	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	52120789	52121195	52120954	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	964	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.237213697070778
chr15	52122599	52122915	52122757	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	2774	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	52135746	52136104	52135949	Y	DMXL2,MAPK6,TMOD3	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	15921	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	52148809	52148818	52148812	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	28984	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	52153526	52153874	52153708	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	33701	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr15	52228372	52228625	52228515	Y	NA	MAPK6,LEO1	NA	NA	NA	NA	MAPK6	13678	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr15	52235970	52236006	52235989	Y	DMXL2,MAPK6	MAPK6,LEO1	NA	NA	NA	NA	MAPK6	6297	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr15	52273738	52273979	52273778	Y	NA	MAPK6,LEO1	MAPK6,GNB5,MYO5C,BCL2L10	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	LEO1	11735	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr15	52385766	52385957	52385877	Y	DMXL2,MAPK6	CTD-2184D3.1,CTD-2184D3.5	NA	NA	NA	NA	CTD-2184D3.1	274	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.483884458759331
chr15	52395777	52396019	52395882	Y	DMXL2,TMOD3,MAPK6	CTD-2184D3.1,CTD-2184D3.5	NA	NA	NA	NA	CTD-2184D3.5	5057	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227026483262636
chr15	52545063	52545254	52545150	Y	MAPK6	MYO5C	NA	NA	NA	NA	MYO5C	40741	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	52580530	52580869	52580787	Y	ARPP19,MYO5C	MYO5C	NA	NA	NA	NA	MYO5C	5126	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr15	52581885	52582216	52582049	Y	NA	MYO5C	NA	NA	NA	NA	MYO5C	3779	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	52775985	52776386	52776074	Y	NA	MYO5A	NA	NA	NA	NA	MYO5A	42861	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	55487983	55488563	55488357	Y	RAB27A,PIGB,RSL24D1	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	55574844	55574949	55574897	Y	NA	PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1	NA	NA	NA	NA	PIGB	34209	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	55928441	55928509	55928475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRTG	104779	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	56029665	56029817	56029741	Y	NA	PRTG	NA	NA	NA	NA	PRTG	3471	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	56127522	56127639	56127539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRTG	94234	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr15	56162319	56162688	56162565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4	121256	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr15	56331775	56332089	56331933	Y	NA	NEDD4	NEDD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEDD4	47831	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	56332751	56332969	56332911	Y	NA	NEDD4	NEDD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEDD4	48807	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.68707702446569
chr15	56341448	56341541	56341527	Y	NA	NA	NEDD4	IMR90	Hi-C	24141950	NEDD4	57504	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	56419675	56420043	56419859	Y	RFX7	NA	NA	NA	NA	NA	RFX7	113440	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	56452441	56452566	56452504	Y	RFX7	NA	NA	NA	NA	NA	RFX7	80917	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	56475345	56475479	56475412	Y	RFX7	NA	NA	NA	NA	NA	RFX7	58004	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	56513902	56514185	56514176	Y	NA	RFX7,TEX9	NA	NA	NA	NA	RFX7	19298	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	56717939	56718122	56718071	Y	RFX7,ZNF280D,MNS1,TEX9	NA	NA	NA	NA	NA	TEX9	183732	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	57261737	57262096	57261746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF12	52916	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	57323913	57324233	57324065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF12	115092	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr15	57844002	57844282	57844063	Y	NA	GCOM1,MYZAP,POLR2M	NA	NA	NA	NA	GCOM1	37824	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	57920264	57920408	57920336	Y	NA	GCOM1,MYZAP,POLR2M	NA	NA	NA	NA	POLR2M	38033	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	58621992	58622651	58622224	Y	ADAM10,AQP9	NA	LIPC,ADAM10,FAM63B	IMR90	Hi-C	24141950	ADAM10	417526	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	58732356	58732646	58732550	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	307531	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	58884938	58885321	58885256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	154856	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	58939079	58939427	58939418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	100750	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr15	59019191	59019406	59019394	Y	NA	ADAM10,FAM63B	NA	NA	NA	NA	ADAM10	20771	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr15	59158498	59158653	59158597	Y	ADAM10,RNF111,SLTM	RNF111	NA	NA	NA	NA	RNF111	3124	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr15	59226674	59226915	59226795	Y	NA	SLTM	FAM63B	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLTM	2822	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr15	59469464	59469853	59469728	Y	ADAM10,RNF111	NA	NA	NA	NA	NA	CCNB2	74187	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	59469975	59470287	59470131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNB2	74698	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr15	59492312	59492582	59492437	Y	BNIP2,ADAM10,RNF111	NA	NA	NA	NA	NA	CCNB2	97035	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	59530226	59530327	59530289	Y	BNIP2,ADAM10,SLTM,RNF111	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	132565	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	59536723	59536869	59536795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	126023	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr15	59566542	59566544	59566543	Y	MYO1E	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	96348	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	59576201	59576407	59576333	Y	GCNT3,MYO1E	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	86485	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.20736522612244
chr15	59587320	59587393	59587357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	75499	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr15	59592534	59592835	59592690	Y	BNIP2,RNF111,MYO1E	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	70057	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.419265907902622
chr15	59646072	59646468	59646249	Y	NA	FAM81A,MYO1E	NA	NA	NA	NA	FAM81A	16424	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	59666396	59666611	59666505	Y	NA	FAM81A,MYO1E,RP11-356M20.1	NA	NA	NA	NA	MYO1E	3297	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr15	59848106	59848258	59848124	Y	GCNT3	RP11-112N19.2,GCNT3	NA	NA	NA	NA	RP11-112N19.2	4814	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr15	59862569	59862935	59862765	Y	NA	RP11-112N19.2,GCNT3	NA	NA	NA	NA	RP11-112N19.2	19277	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.212996815885384
chr15	60699729	60699909	60699819	Y	NA	ANXA2	NA	NA	NA	NA	ANXA2	6647	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr15	60700608	60701055	60700809	Y	NA	ANXA2	NA	NA	NA	NA	ANXA2	7526	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr15	60818402	60818756	60818740	Y	RORA	NARG2,RP11-219B17.1	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	49025	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	60881604	60881753	60881652	Y	RORA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	112227	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	62215780	62216024	62215899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	134648	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	62405210	62405473	62405223	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2CD4B	50009	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	62411576	62411892	62411783	Y	NA	C2CD4B	NA	NA	NA	NA	C2CD4B	43590	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	62430374	62430555	62430466	Y	NA	C2CD4B	NA	NA	NA	NA	C2CD4B	24927	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	62499952	62500233	62500097	Y	NA	C2CD4B	NA	NA	NA	NA	C2CD4B	44470	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr15	62896766	62896914	62896838	Y	NA	NA	TLN2	IMR90	Hi-C	24141950	TLN2	216041	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr15	63432131	63432432	63432186	Y	USP3,RAB8B,LACTB	LACTB,RPS27L,RAB8B	NA	NA	NA	NA	RPS27L	15788	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr15	63550855	63551251	63551053	Y	NA	NA	APH1B	IMR90	Hi-C	24141950	RAB8B	71187	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	63663812	63664001	63663921	Y	LACTB,RAB8B	CA12	NA	NA	NA	NA	CA12	8359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	63664402	63664810	63664706	Y	LACTB,CA12	CA12	NA	NA	NA	NA	CA12	7550	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	63794488	63794915	63794759	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP3	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	63795379	63795825	63795543	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	586	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.423264291021142
chr15	63871063	63871418	63871089	Y	NA	USP3-AS1	NA	NA	NA	NA	USP3-AS1	20370	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	63894930	63894962	63894946	Y	FBXL22	USP3-AS1	NA	NA	NA	NA	USP3-AS1	3142	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	64188807	64189333	64189164	Y	USP3,HERC1	NA	NA	NA	NA	NA	HERC1	64666	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr15	64288096	64288290	64288164	Y	HERC1	NA	NA	NA	NA	NA	DAPK2	73942	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	64385169	64385477	64385384	Y	NA	DAPK2,FAM96A,SNX1	NA	NA	NA	NA	SNX1	847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.308404042246225
chr15	64397616	64397971	64397713	Y	SNX1	DAPK2,FAM96A,SNX1	NA	NA	NA	NA	SNX1	13294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	64538820	64539298	64539122	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIB	85416	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	64654607	64654901	64654754	Y	PIF1,KIAA0101	CSNK1G1,KIAA0101,TRIP4	CSNK1G1	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1G1	8165	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.202426638448127
chr15	64722485	64722825	64722650	Y	NA	KIAA0101,TRIP4,ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	28116	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	64753700	64753985	64753784	Y	PLEKHO2	ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	2759	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.425454738592242
chr15	64754012	64754177	64754162	Y	NA	ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	3071	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	64920832	64921228	64921023	Y	ZNF609,OAZ2	RP11-330L19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-330L19.1	37654	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr15	64932987	64933351	64933169	Y	PLEKHO2	RP11-330L19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-330L19.1	49809	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	65027953	65028147	65028050	Y	NA	OAZ2,RBPMS2	NA	NA	NA	NA	OAZ2	34473	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	65127928	65128208	65128016	Y	NA	PIF1,AC069368.3,PLEKHO2	PIF1	K562	ChIA-PET	22265404	AC069368.3	3874	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	65148759	65148948	65148850	Y	NA	PIF1,AC069368.3,PLEKHO2	NA	NA	NA	NA	PLEKHO2	16671	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	65165332	65165600	65165447	Y	OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21	PIF1,AC069368.3,PLEKHO2	NA	NA	NA	NA	PLEKHO2	33244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	65186654	65187183	65187027	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHO2	54566	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.01858483507783
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.681426635349159
chr15	65596266	65596532	65596409	Y	NA	RNU5A-1,PARP16	PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP16	5310	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.348075562727175
chr15	65596702	65597188	65596889	Y	DENND4A	RNU5A-1,PARP16	PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP16	5746	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.52539924125013
chr15	65823475	65823857	65823545	Y	IGDCC4	DPP8,PTPLAD1	NA	NA	NA	NA	PTPLAD1	2719	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.34061768966866
chr15	65841762	65842141	65841952	Y	PARP16	DPP8,PTPLAD1	NA	NA	NA	NA	PTPLAD1	21006	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	65951559	65951691	65951625	Y	NA	SLC24A1	NA	NA	NA	NA	SLC24A1	49855	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	66060795	66060948	66060877	Y	NA	RAB11A,DENND4A	NA	NA	NA	NA	DENND4A	21683	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr15	66162838	66163256	66163114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80207	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.341347838859027
chr15	66163349	66163534	66163463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr15	66177095	66177419	66177152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	94464	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	66707547	66707736	66707571	Y	MAP2K1	TIPIN,MAP2K1	RPL4,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K1	30392	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr15	66764584	66765048	66764851	Y	NA	SNAPC5,SNORD18A,ZWILCH,RPL4	NA	NA	NA	NA	SNAPC5	23103	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	66965990	66966192	66966090	Y	MAP2K1	SMAD6	SMAD6	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	26374	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr15	66993287	66993569	66993487	Y	MAP2K1,SMAD6	SMAD6	NA	NA	NA	NA	SMAD6	721	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.5736596390126
chr15	67095524	67095803	67095671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD6	102958	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.634609100908517
chr15	67134448	67134928	67134631	Y	NA	NA	SMAD6,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	141882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.50719782614604
chr15	67175645	67176118	67175872	Y	NA	NA	IQCH,SMAD6,LOC100506686,SMAD3	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD3	177983	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	67341124	67341334	67341261	Y	NA	SMAD3	SMAD3,IQCH,LOC100506686,AAGAB	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD3	12767	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr15	67348530	67348587	67348559	Y	NA	SMAD3	SMAD3,IQCH,LOC100506686,AAGAB	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD3	5514	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	67373443	67373710	67373534	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	19342	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	67393197	67393867	67393527	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	39096	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	67399103	67399775	67399548	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	45002	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr15	67409139	67409556	67409296	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	55038	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	67413336	67413759	67413492	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	59235	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	67436996	67437215	67437119	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	82895	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	67442347	67443164	67443030	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	79620	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr15	67488498	67488886	67488594	Y	SMAD3	RPS24P16	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	33898	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr15	67490281	67490446	67490307	Y	SMAD3	RPS24P16	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	32338	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	67516633	67516865	67516859	Y	NA	RPS24P16,IQCH,AAGAB	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	5919	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	67716264	67716618	67716446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C15orf61	94788	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	67867550	67867820	67867663	Y	NA	MAP2K5	NA	NA	NA	NA	MAP2K5	34503	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	67982881	67982892	67982887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2K5	149834	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	68132387	68132778	68132514	Y	PIAS1	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	211739	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr15	68176779	68177152	68176934	Y	NA	NA	PIAS1,CLN6,C15orf61,LOC100506686,CALML4	IMR90	Hi-C	24141950	PIAS1	167365	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	68238127	68238678	68238396	Y	NA	NA	PIAS1,CALML4,CLN6,C15orf61,LOC100506686	IMR90	Hi-C	24141950	PIAS1	105839	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	68265864	68265976	68265920	Y	NA	NA	PIAS1,LOC100506686,C15orf61,IQCH	IMR90	Hi-C	24141950	PIAS1	78541	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	68441418	68441688	68441529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	96901	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr15	68564194	68564543	68564236	Y	NA	CLN6,FEM1B	FEM1B,CLN6,ANP32A,CORO2B,ITGA11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FEM1B	3598	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	68589122	68589626	68589166	Y	ITGA11	CLN6,FEM1B	NA	NA	NA	NA	FEM1B	20981	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	69114506	69114876	69114758	Y	NA	SPESP1,ANP32A	NA	NA	NA	NA	ANP32A	3270	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr15	69385602	69385765	69385704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLCE	65158	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr15	69453904	69454158	69454121	Y	GLCE	GLCE	NA	NA	NA	NA	GLCE	2981	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	69490173	69490404	69490203	Y	NA	GLCE	NA	NA	NA	NA	GLCE	39250	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr15	69650842	69650990	69650924	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF23	53595	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr15	69724089	69724530	69724231	Y	NA	KIF23,RP11-253M7.1,RPLP1	NA	NA	NA	NA	RPLP1	18593	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.135808896032157
chr15	70052375	70052953	70052736	Y	TLE3	NA	TLE3,LOC145837,C15orf50	IMR90	Hi-C	24141950	RPLP1	309252	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	70289516	70289879	70289625	Y	NA	NA	LOC145837	IMR90	Hi-C	24141950	TLE3	98636	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.0338303316972
chr15	70391261	70391735	70391557	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	2746	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.03221410376706
chr15	70392397	70392607	70392502	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	70679327	70679587	70679457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLE3	290812	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	70766954	70767165	70766993	Y	TLE3	NA	C15orf50,KIF23,LOC145837,TLE3	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	286767	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	70767457	70767783	70767604	Y	TLE3	NA	C15orf50,KIF23,LOC145837,TLE3	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	286149	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255241747566551
chr15	70787270	70787553	70787302	Y	TLE3	NA	TLE3,KIF23,LOC145837,C15orf50,UACA,RPLP1	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	266379	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.147265152209192
chr15	70797214	70797333	70797235	Y	TLE3	NA	TLE3,KIF23,RPLP1	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	256599	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	70800143	70800820	70800577	Y	NA	NA	KIF23,RPLP1,TLE3	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	253112	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208268283576497
chr15	71084406	71084742	71084644	Y	UACA,LARP6	UACA	UACA,LARP6,LRRC49	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	30474	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	71126164	71126470	71126369	Y	NA	LRRC49,LARP6	NA	NA	NA	NA	LRRC49	17108	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr15	71149072	71149436	71149201	Y	LARP6	LRRC49,LARP6,THAP10	NA	NA	NA	NA	LARP6	4574	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr15	71385768	71386181	71385996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	202644	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr15	71409431	71409745	71409525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	226307	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr15	71571390	71571701	71571551	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	388266	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr15	71984997	71985280	71985139	Y	SENP8	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	419319	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr15	72133892	72134113	72134003	Y	NA	NA	NR2E3	IMR90	Hi-C	24141950	SENP8	270486	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	72198564	72199008	72198773	Y	PARP6,MYO9A,CELF6,CELF6,CELF6	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	205591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	72213908	72214290	72214099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	190309	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	72518614	72519346	72519221	Y	ARIH1,PKM2	GRAMD2	NA	NA	NA	NA	GRAMD2	30488	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr15	72520083	72520441	72520217	Y	ARIH1,PKM2,PARP6,CELF6,CELF6,CELF6	GRAMD2	NA	NA	NA	NA	GRAMD2	31957	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr15	72617371	72617435	72617389	Y	MYO9A,SENP8,PARP6,CELF6,CELF6,CELF6	CELF6,HEXA	NA	NA	NA	NA	CELF6	6901	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	72666496	72666825	72666661	Y	NA	RP11-106M3.1	NA	NA	NA	NA	HEXA	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	72824073	72824405	72824125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARIH1	59406	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr15	72832767	72832969	72832868	Y	PKM2,CELF6,CELF6,ADPGK,ARIH1	NA	NA	NA	NA	NA	ARIH1	68100	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr15	73035188	73035310	73035249	Y	NA	ADPGK	NA	NA	NA	NA	ADPGK	40877	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	73939698	73939908	73939794	Y	NA	NPTN,CD276	C15orf60	IMR90	Hi-C	24141950	NPTN	15223	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.36756391160368
chr15	74226590	74227025	74226821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STOML1	57938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	74249257	74249448	74249278	Y	NA	STOML1,PML	NA	NA	NA	NA	STOML1	35515	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr15	74343707	74344076	74343754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PML	58693	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	74412993	74413248	74413104	Y	STRA6,CCDC33,C15orf59,TBC1D21	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-60L3.1	79798	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr15	74492868	74493054	74492979	Y	NA	STRA6	NA	NA	NA	NA	RP11-60L3.1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	74493587	74493665	74493592	Y	CCDC33,ISLR	RP11-60L3.1,STRA6	NA	NA	NA	NA	RP11-60L3.1	541	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	74666695	74666987	74666837	Y	CLK3,ARID3B	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	57821	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166753501085698
chr15	74677413	74677899	74677622	Y	SEMA7A,SEMA7A,CSK,CLK3,ARID3B	SEMA7A	SEMA7A	K562	ChIA-PET	22265404	SEMA7A	46909	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr15	74681899	74682338	74682078	Y	SEMA7A,SEMA7A,CLK3,ARID3B	SEMA7A	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	42470	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	74689389	74689592	74689450	Y	SEMA7A,SEMA7A	SEMA7A	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	35216	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	74693719	74694069	74694004	Y	NA	SEMA7A	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	30739	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	74801015	74801389	74801202	Y	NA	UBL7,ARID3B	NA	NA	NA	NA	ARID3B	30129	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	74834290	74834419	74834369	Y	ULK3,CSK,CLK3,ARID3B	ARID3B	NA	NA	NA	NA	ARID3B	2772	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	74908840	74909023	74908946	Y	NA	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	19999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr15	74930641	74931010	74930809	Y	ARID3B,CSK	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	41800	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr15	75018665	75019349	75018947	Y	SCAMP2,C15orf39,CYP1A1	EDC3,CYP1A1,CYP1A2	NA	NA	NA	NA	CYP1A1	2714	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.685807982096796
chr15	75075558	75076065	75075775	Y	ARID3B,CLK3,CLK3,SCAMP2,C15orf39,CSK	CYP1A2,CSK	NA	NA	NA	NA	CSK	3160	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	75250602	75250974	75250783	Y	RPP25	COX5A,SCAMP5,RPP25	NA	NA	NA	NA	RPP25	2797	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr15	75339281	75339878	75339595	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,SCAMP2,C15orf39	PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	25385	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	75384189	75384549	75384318	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,C15orf39	NA	NA	NA	NA	NA	PPCDC	70293	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr15	75398506	75398605	75398540	Y	MAN2C1,CLK3,C15orf39	NA	C15orf39	MCF7	ChIA-PET	22265404	PPCDC	84610	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	75445545	75445830	75445694	Y	SIN3A,SIN3A,CSK,C15orf39	C15orf39	PPCDC,C15orf39	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C15orf39	40154	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	75449127	75449383	75449255	Y	NA	C15orf39	PPCDC,SCAMP5	IMR90	Hi-C	24141950	C15orf39	36601	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	75460054	75460405	75460311	Y	NA	C15orf39	SCAMP5,PPCDC,C15orf39	IMR90	Hi-C	24141950	C15orf39	25579	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	75742568	75742962	75742713	Y	NA	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	3221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.195351729018728
chr15	75744907	75745094	75744993	Y	C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1089	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.407965581274997
chr15	75745296	75745530	75745399	Y	PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	653	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	75746315	75746749	75746512	Y	PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	132	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.383592770540193
chr15	75747348	75747533	75747407	Y	RPP25,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1165	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.500296281324959
chr15	75867013	75867354	75867182	Y	C15orf39,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,UBE2Q2,ODF3L1	PTPN9,SNUPN	NA	NA	NA	NA	PTPN9	2276	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	75886318	75886335	75886327	Y	NA	PTPN9,SNUPN	NA	NA	NA	NA	PTPN9	16688	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	75959061	75959441	75959310	Y	SNX33	SNUPN,SNX33,IMP3,CSPG4	NA	NA	NA	NA	IMP3	20014	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.415267524784101
chr15	76050803	76051078	76050853	Y	NA	CSPG4,ODF3L1,DNM1P35	NA	NA	NA	NA	DNM1P35	21839	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.604047459484092
chr15	76218014	76218024	76218019	Y	NA	FBXO22	NA	NA	NA	NA	FBXO22	23814	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr15	76455838	76456047	76455943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C15orf27	105660	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.497914126136583
chr15	76639120	76639380	76639270	Y	NA	ETFA,ISL2	NA	NA	NA	NA	ISL2	12055	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.379750316971083
chr15	76658083	76658321	76658202	Y	NA	ISL2	NA	NA	NA	NA	ISL2	31018	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	77055500	77055901	77055892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAPER	139884	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	77340153	77340443	77340173	Y	PSTPIP1	TSPAN3	NA	NA	NA	NA	TSPAN3	33883	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	77711297	77711794	77711478	Y	NA	PEAK1,HMG20A	NA	NA	NA	NA	HMG20A	543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	77739736	77739821	77739778	Y	NA	PEAK1,HMG20A	NA	NA	NA	NA	HMG20A	28982	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	78031317	78031646	78031484	Y	LINGO1	NA	NA	NA	NA	NA	HMG20A	320563	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	78286845	78286973	78286909	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	81093	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	78356048	78356390	78356219	Y	NA	TBC1D2B,SNORA63	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	11676	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	78362503	78362904	78362579	Y	IREB2,DNAJA4,DNAJA4,DNAJA4,TBC1D2B	TBC1D2B,SNORA63	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	5162	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	78364826	78365348	78365071	Y	DNAJA4,DNAJA4,TBC1D2B	TBC1D2B,SNORA63	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	2718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	78667581	78667654	78667595	Y	NA	NA	CRABP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IREB2	60119	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr15	79152508	79152900	79152703	Y	IREB2	RPL21P116	MORF4L1,ADAMTS7	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RPL21P116	1171	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr15	79280826	79281229	79281127	Y	CTSH	NA	NA	NA	NA	NA	RPL21P116	126755	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	79635470	79635474	79635472	Y	NA	TMED3	NA	NA	NA	NA	TMED3	34066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	80211506	80211893	80211588	Y	NA	MTHFS,C15ORF37,ST20,BCL2A1	NA	NA	NA	NA	C15ORF37	1614	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr15	80211933	80212232	80212185	Y	NA	MTHFS,C15ORF37,ST20,BCL2A1	NA	NA	NA	NA	C15ORF37	1275	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.258857167055955
chr15	80453068	80453275	80453180	Y	BCL2A1,ZFAND6	FAH	NA	NA	NA	NA	FAH	10236	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	80828578	80828783	80828681	Y	ZFAND6	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	240901	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	80880322	80880600	80880404	Y	ARNT2	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	189084	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	80881213	80881527	80881378	Y	MESDC1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	188157	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr15	81277111	81277444	81277389	Y	STARD5,MESDC1	MESDC2,MESDC1	NA	NA	NA	NA	MESDC2	2775	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr15	81317366	81317544	81317456	Y	STARD5,MESDC1	MESDC2,MESDC1	NA	NA	NA	NA	MESDC1	26071	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	82302959	82303245	82303102	Y	NA	MEX3B	NA	NA	NA	NA	MEX3B	33237	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr15	82339167	82339811	82339478	Y	MEX3B	MEX3B	NA	NA	NA	NA	MEX3B	2685	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.237943846261145
chr15	83376680	83377056	83376874	Y	NA	RP11-752G15.4,AP3B2,RP11-752G15.6	NA	NA	NA	NA	AP3B2	14	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	83412156	83412209	83412183	Y	NA	AP3B2,RP11-752G15.6	NA	NA	NA	NA	RP11-752G15.6	5107	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	83479679	83480264	83480017	Y	WHAMM	WHAMM	HOMER2	IMR90	Hi-C	24141950	WHAMM	3299	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	83680959	83681167	83681099	Y	NA	HOMER2,FAM103A1,C15orf40	NA	NA	NA	NA	C15orf40	2566	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr15	83681404	83681605	83681512	Y	NA	HOMER2,FAM103A1,C15orf40	NA	NA	NA	NA	C15orf40	3011	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	83683180	83683566	83683373	Y	NA	HOMER2,FAM103A1,C15orf40	NA	NA	NA	NA	C15orf40	4787	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	83712711	83713060	83712967	Y	NA	C15orf40,BTBD1	C15orf40	IMR90	Hi-C	24141950	BTBD1	21046	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	83722004	83722168	83722109	Y	NA	C15orf40,BTBD1	NA	NA	NA	NA	BTBD1	11938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	83731534	83731663	83731576	Y	WHAMM,BTBD1	BTBD1	NA	NA	NA	NA	BTBD1	2443	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	83777211	83777631	83777545	Y	NA	BTBD1	NA	NA	NA	NA	BTBD1	43105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	83815089	83815145	83815117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	59625	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	83817881	83818018	83817954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	56752	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr15	83847712	83847957	83847821	Y	NA	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	26813	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	83857531	83857848	83857643	Y	AP3B2,HDGFRP3	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	16922	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr15	83862328	83862648	83862488	Y	NA	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	12122	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	83869308	83869629	83869461	Y	SH3GL3	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	5141	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr15	83954950	83955303	83955151	Y	BNC1	NA	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	80180	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr15	84048302	84048583	84048506	Y	BNC1	NA	SH3GL3,BNC1	IMR90	Hi-C	24141950	HDGFRP3	173532	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr15	85131508	85131753	85131631	Y	PDE8A	ZSCAN2	NA	NA	NA	NA	ZSCAN2	10464	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	85290443	85290837	85290532	Y	PDE8A,ZNF592	SEC11A,ZNF592	NA	NA	NA	NA	ZNF592	577	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr15	85361646	85361991	85361963	Y	ALPK3	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF592	71780	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	85455479	85455863	85455740	Y	SLC28A1	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	65808	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.427453930151503
chr15	85458286	85458507	85458420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	63164	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.1996972976985
chr15	85516737	85517139	85516966	Y	NA	PDE8A	ALPK3,PDE8A	IMR90	Hi-C	24141950	PDE8A	4532	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	85547085	85547484	85547285	Y	NA	PDE8A	NA	NA	NA	NA	PDE8A	25414	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr15	85566958	85567254	85567106	Y	NA	PDE8A	NA	NA	NA	NA	PDE8A	45287	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	85628969	85629268	85629119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	107298	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr15	85645018	85645768	85645040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	123347	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.282343899050982
chr15	85662697	85662918	85662803	Y	PDE8A	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	141026	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	85861581	85861931	85861753	Y	PDE8A,AKAP13	NA	AKAP13	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP13	59871	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.303831439486748
chr15	85874454	85874742	85874552	Y	NA	AKAP13	AKAP13	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP13	47060	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr15	85886798	85887001	85886900	Y	NA	AKAP13	AKAP13	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP13	34801	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	85887676	85888027	85887852	Y	NA	AKAP13	AKAP13	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP13	33775	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr15	85890027	85890200	85890120	Y	AKAP13	AKAP13	AKAP13	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP13	31602	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.202809602077243
chr15	85956762	85957097	85956878	Y	AKAP13,PDE8A	AKAP13	NA	NA	NA	NA	AKAP13	34960	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	86088256	86088945	86088625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP13	166454	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	86111518	86111581	86111550	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP13	189716	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	86166895	86167159	86167083	Y	AKAP13	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	169102	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	86192682	86192944	86192801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	143317	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	86247990	86248195	86248102	Y	AKAP13	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	88066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	86267591	86267810	86267701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	68451	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	86315137	86315409	86315289	Y	KLHL25	KLHL25	NA	NA	NA	NA	KLHL25	20852	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	89014009	89014390	89014200	Y	NA	MRPL46,MRPS11	NA	NA	NA	NA	MRPS11	5325	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.173481224953846
chr15	89532902	89533939	89533555	Y	NA	NA	MFGE8,ABHD2	IMR90	Hi-C	24141950	MFGE8	78260	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146379073469414
chr15	89648424	89648609	89648517	Y	NA	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	ABHD2	19734	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	89664635	89664981	89664666	Y	NA	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	HMGB1P8	12745	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	89795623	89795958	89795791	Y	NA	FANCI	NA	NA	NA	NA	FANCI	10443	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	89856537	89857272	89856853	Y	NA	POLG	NA	NA	NA	NA	POLG	18820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.159295628027183
chr15	89878895	89879173	89879043	Y	NA	POLG	NA	NA	NA	NA	POLG	2803	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr15	90005846	90006063	90005954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLG	129754	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	90056616	90056810	90056708	Y	RHCG	NA	NA	NA	NA	NA	KIF7	139872	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	90418263	90418454	90418325	Y	NA	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	17120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr15	90419728	90419914	90419806	Y	ZNF710,SEMA4B,ANPEP,AP3S2	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	15660	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	90441878	90442278	90442169	Y	C15orf38	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	6304	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	90456787	90457058	90456927	Y	NA	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	C15orf38	2599	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	90578762	90579351	90578884	Y	ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	36138	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	90581471	90581912	90581727	Y	AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	38847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	90590510	90590767	90590581	Y	ZNF710	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	47886	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	90649995	90650276	90650136	Y	NA	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	6259	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	90669829	90670140	90669985	Y	NA	IDH2,SEMA4B	IQGAP1,IDH2,MESP1,SEMA4B,C15orf58,CIB1,NGRN,TTLL13,ZNF710,C15orf38-AP3S2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IDH2	26093	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	90701535	90701765	90701609	Y	ZNF710,SEMA4B,IQGAP1,CIB1	SEMA4B	IDH2,ZNF710,C15orf58,TTLL13,NGRN,SEMA4B,IQGAP1,CIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEMA4B	71	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.259970279875438
chr15	90708840	90709227	90709106	Y	NA	SEMA4B	CIB1,C15orf58,SEMA4B,ZNF710,IDH2,TTLL13,NGRN	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEMA4B	7004	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr15	90754464	90755447	90755260	Y	SEMA4B,SEMA4B,CIB1	CIB1	NA	NA	NA	NA	CIB1	19832	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.346806520358281
chr15	90938187	90938493	90938325	Y	NA	ZNF774,IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	8737	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	90944087	90944636	90944284	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	14637	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr15	90945502	90945781	90945680	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	16052	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	90951105	90951410	90951208	Y	FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	21655	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	90956663	90957019	90956743	Y	NA	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	27213	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.456052158084533
chr15	90957340	90957730	90957416	Y	FES,ZNF710,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	27890	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr15	90958026	90958305	90958134	Y	ZNF710,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	28576	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr15	91107423	91107655	91107549	Y	UNC45A,FES,FES,FES,CIB1,C15orf58,IQGAP1,CRTC3	CRTC3	NA	NA	NA	NA	CRTC3	36266	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	91114363	91114916	91114453	Y	UNC45A,FES,FES,FES,CIB1,IQGAP1	CRTC3	NA	NA	NA	NA	CRTC3	43206	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.342233917598804
chr15	91131539	91131872	91131812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRTC3	60382	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	91190174	91190180	91190177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	68192	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr15	91191799	91192162	91191976	Y	UNC45A,FES,FES,FES,C15orf58,IQGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	66210	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.155836138087189
chr15	91208661	91208996	91208948	Y	NA	RP11-387D10.2,BLM	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	49376	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.377020976221455
chr15	91331328	91331736	91331526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BLM	72770	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	91412875	91413318	91412960	Y	IQGAP1,FURIN,UNC45A,FES,FES,FES	FURIN,MAN2A2	NA	NA	NA	NA	FURIN	3053	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr15	91417545	91417844	91417693	Y	NA	FURIN,MAN2A2	NA	NA	NA	NA	FURIN	7723	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr15	91541068	91541209	91541180	Y	NA	RCCD1,PRC1,VPS33B,AC068831.10	NA	NA	NA	NA	PRC1	4209	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	92400491	92400865	92400640	Y	SLCO3A1	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	5566	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	92404418	92404854	92404606	Y	SLCO3A1	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	9493	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	92486040	92486252	92486096	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	91115	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr15	92486330	92486707	92486433	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	91405	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr15	92491615	92492039	92491744	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	96690	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	92509194	92509613	92509420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	114269	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr15	93344993	93345488	93345070	Y	CHD2	ASB9P1	NA	NA	NA	NA	ASB9P1	8116	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.522286936871387
chr15	93347056	93347810	93347183	Y	CHD2	ASB9P1	NA	NA	NA	NA	ASB9P1	10179	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr15	93354824	93354998	93354897	Y	CHD2	ASB9P1	NA	NA	NA	NA	ASB9P1	17947	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr15	93356811	93357105	93356909	Y	CHD2	ASB9P1	NA	NA	NA	NA	ASB9P1	19934	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	ASB9P1	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	ASB9P1	26620	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.63993065221195
chr15	93374780	93375598	93375185	Y	NA	ASB9P1,CHD2	CHD2,LOC100507217,ASB9P1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ASB9P1	37903	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.0609856963084
chr15	93376360	93376528	93376444	Y	NA	ASB9P1,CHD2	LOC100507217,CHD2,ASB9P1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ASB9P1	39483	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	93388455	93388698	93388628	Y	NA	CHD2	CHD2,LOC100507217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CHD2	35828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	93425040	93425223	93425112	Y	C15orf32	CHD2,MIR3175	NA	NA	NA	NA	CHD2	514	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	93458042	93458417	93458141	Y	NA	CHD2,MIR3175	NA	NA	NA	NA	MIR3175	12413	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	93520042	93520437	93520098	Y	CHD2	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3175	74413	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr15	93611936	93612095	93612013	Y	RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3175	166307	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	94739822	94739990	94739899	Y	NA	MCTP2	NA	NA	NA	NA	MCTP2	32777	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr15	94746622	94746847	94746732	Y	NA	MCTP2	NA	NA	NA	NA	MCTP2	25920	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.401237857406849
chr15	94850045	94850297	94850155	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTP2	77278	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr15	96867031	96867104	96867071	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469	NA	NA	NA	NA	NR2F2	63	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	96871345	96871608	96871517	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	2755	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	96884042	96884481	96884402	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469	NA	NA	NA	NA	MIR1469	9552	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309673084615119
chr15	96886247	96886633	96886548	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469	NA	NA	NA	NA	MIR1469	11757	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	96890448	96891058	96890571	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469	NA	NA	NA	NA	MIR1469	15958	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	96900187	96900329	96900243	Y	NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469	NA	NA	NA	NA	MIR1469	25697	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.478425777260077
chr15	96900508	96900866	96900583	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469	NA	NA	NA	NA	MIR1469	26018	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.237213697070778
chr15	98047383	98047776	98047510	Y	ARRDC4	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2544M6.2	597165	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr15	98698078	98698430	98698265	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2544M6.2	53137	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	99193577	99194531	99194069	Y	IGF1R	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	3377	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236483547880411
chr15	99259262	99259477	99259337	Y	SYNM	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	69062	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr15	99270923	99271213	99270975	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	80723	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.299102907177861
chr15	99318481	99318879	99318554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	115885	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	99318917	99319236	99319025	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	115528	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	99342514	99342944	99342658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	91820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	99366453	99366700	99366460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	68064	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	99394435	99394579	99394453	Y	NA	RP11-654A16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	40185	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr15	99394824	99395158	99395067	Y	NA	RP11-654A16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	39606	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr15	99395486	99396002	99395689	Y	IGF1R	RP11-654A16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	38762	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.03570937177492
chr15	99396507	99396665	99396608	Y	NA	RP11-654A16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	38099	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr15	99397047	99397167	99397105	Y	NA	RP11-654A16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	37597	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.551232350365668
chr15	99399661	99400083	99399913	Y	NA	RP11-654A16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	34681	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	99401021	99401241	99401076	Y	NA	RP11-654A16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	33523	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	99403545	99404056	99403701	Y	NA	RP11-654A16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	30708	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.139807279150677
chr15	99408611	99408985	99408683	Y	NA	RP11-654A16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	25779	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.919335155147877
chr15	99409255	99409515	99409377	Y	NA	RP11-654A16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	25249	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.576562344370545
chr15	99409834	99409977	99409865	Y	NA	RP11-654A16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	24787	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr15	99416036	99416369	99416103	Y	IGF1R	RP11-654A16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	18395	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.511369573872879
chr15	99444571	99445210	99444854	Y	NA	RP11-654A16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	9807	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.65847879653266
chr15	99450086	99450215	99450157	Y	IGF1R	RP11-654A16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-654A16.1	15322	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.326432092741998
chr15	99559007	99559192	99559062	Y	NA	PGPEP1L	PGPEP1L	MCF7	ChIA-PET	22265404	PGPEP1L	9983	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.11270558401087
chr15	99561438	99561561	99561500	Y	NA	PGPEP1L	PGPEP1L,IGF1R	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PGPEP1L	12414	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	99661093	99661479	99661184	Y	NA	SYNM	NA	NA	NA	NA	SYNM	24673	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr15	99665380	99665686	99665571	Y	NA	SYNM	NA	NA	NA	NA	SYNM	28960	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.01762765180775
chr15	99708218	99708283	99708249	Y	NA	NA	SYNM	IMR90	Hi-C	24141950	SYNM	71798	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	99823818	99824190	99823994	Y	MEF2A,MEF2A	TTC23,LRRC28,HSP90B2P	NA	NA	NA	NA	HSP90B2P	27981	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr15	99856918	99857221	99857070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90B2P	61081	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	99864304	99864757	99864539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90B2P	68467	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	99965380	99965718	99965580	Y	MEF2A,MEF2A	MEF2A	LRRC28,MEF2A,LYSMD4	IMR90	Hi-C	24141950	MEF2A	49652	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr15	99975346	99975780	99975666	Y	NA	MEF2A	LRRC28,LYSMD4,MEF2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MEF2A	39590	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr15	99995215	99995527	99995307	Y	MEF2A,MEF2A	MEF2A	MEF2A,LRRC28	IMR90	Hi-C	24141950	MEF2A	19843	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr15	100216338	100216615	100216373	Y	MEF2A,MEF2A	NA	NA	NA	NA	NA	LYSMD4	55151	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	101253659	101254026	101253922	Y	ALDH1A3	RP11-66B24.5	ALDH1A3,LRRK1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-66B24.5	428	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr15	101261253	101261648	101261594	Y	NA	RP11-66B24.5	ALDH1A3,LRRK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-66B24.5	6799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	101261855	101262549	101262221	Y	NA	RP11-66B24.5	ALDH1A3,LRRK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-66B24.5	7401	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.557960074233816
chr15	101462538	101462736	101462613	Y	NA	ALDH1A3,LRRK1	NA	NA	NA	NA	LRRK1	5118	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr15	101546574	101546638	101546606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRK1	89154	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	101667290	101667533	101667378	Y	NA	NA	CHSY1,SELS,LRRK1	IMR90	Hi-C	24141950	CHSY1	122604	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	101667775	101667985	101667844	Y	CHSY1	NA	CHSY1,SELS,LRRK1	IMR90	Hi-C	24141950	CHSY1	122152	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr15	101790495	101790968	101790609	Y	NA	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	CHSY1	358	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	101834172	101834455	101834316	Y	TM2D3,TARSL2,SNRPA1	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	SNRPA1	685	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146379073469414
chr15	101860934	101861170	101861021	Y	CHSY1,TM2D3	SNRPA1	NA	NA	NA	NA	SNRPA1	27447	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr15	101945887	101945918	101945891	Y	OR4F6,OR4F15,PCSK6	NA	NA	NA	NA	NA	SNRPA1	112400	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr15	101979646	101980007	101979833	Y	PCSK6	NA	NA	NA	NA	NA	PCSK6	83398	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr15	101999244	101999620	101999441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCSK6	63785	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	121563	121849	121614	Y	TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	RHBDF1	2505	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr16	163381	163878	163678	Y	NA	RHBDF1,MPG,NPRL3	NA	NA	NA	NA	NPRL3	22981	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	369599	369830	369715	Y	NA	AXIN1,MRPL28	NA	NA	NA	NA	AXIN1	30843	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	575519	575832	575766	Y	NHLRC4	PIGQ	NA	NA	NA	NA	PIGQ	39163	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr16	578748	579156	578911	Y	LUC7L	PIGQ	NA	NA	NA	NA	PIGQ	35839	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.79006227536659
chr16	615969	616302	616108	Y	RGS11,NHLRC4	PIGQ,RAB40C	NA	NA	NA	NA	PIGQ	974	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	729341	729555	729445	Y	NA	C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,FBXL16,METRN,FAM173A,HAGHL	NA	NA	NA	NA	STUB1	1117	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208268283576497
chr16	858833	859023	858927	Y	RHBDL1,FBXL16,SOX8	CHTF18,RPUSD1	NA	NA	NA	NA	RPUSD1	22436	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.243055342199149
chr16	1052842	1052973	1052908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSTR5	67783	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	1132307	1132794	1132674	Y	RAB40C,RAB40C,WDR90,CACNA1H,SSTR5	SSTR5	NA	NA	NA	NA	SSTR5	11551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.04829663217496
chr16	1133120	1133226	1133175	Y	RAB40C,RAB40C,FAM195A,WDR90,CACNA1H,SSTR5	SSTR5	NA	NA	NA	NA	SSTR5	12364	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.244671570129293
chr16	1166792	1167154	1166886	Y	NA	SSTR5	CACNA1H,RPUSD1,CHTF18,GNG13,PRR25,LMF1,SOX8	IMR90	Hi-C	24141950	SSTR5	46036	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	1232339	1232689	1232437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSTR5	111583	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	1381826	1382192	1381930	Y	UNKL,SPSB3,MAPK8IP3,EME2,BAIAP3,BAIAP3	UBE2I,BAIAP3,GNPTG	NA	NA	NA	NA	BAIAP3	224	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr16	1519780	1519909	1519802	Y	SEPX1,MAPK8IP3,CLCN7	C16orf91,CLCN7,TELO2	NA	NA	NA	NA	CLCN7	3672	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	1979729	1980160	1979842	Y	TSC2,MLST8,DNASE1L2,C16orf79,ABCA3,CCDC154,NME3,NUBP2,TBL3,RNF151	NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3	NUBP2,FAHD1,IGFALS,C16orf73,HS3ST6,MAPK8IP3,SPSB3,EME2,NME3,MRPS34,HAGH,LINC00254	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB10	27349	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	2006829	2006953	2006860	Y	C16orf79,RNF151	NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3	NA	NA	NA	NA	NDUFB10	556	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	2057211	2057401	2057386	Y	NA	NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,NPW,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598	423	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr16	2057818	2059084	2058234	Y	TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598	SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598,NPW	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr16	2065446	2065768	2065545	Y	NA	TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,NPW,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	RAB26	MCF7	ChIA-PET	22265404	NPW	7519	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.383592770540193
chr16	2518541	2518691	2518640	Y	RAB26,E4F1,CCNF,C16orf59,TBC1D24,NTN3	CCNF,C16orf59,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2	NA	NA	NA	NA	TBC1D24	4456	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.520670708941243
chr16	2518760	2519270	2519088	Y	RAB26,E4F1,SRRM2,C16orf59,TBC1D24,NTN3	CCNF,C16orf59,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2	NA	NA	NA	NA	TBC1D24	3877	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.260700429065805
chr16	2557760	2557909	2557835	Y	SRRM2,PDPK1,CEMP1	C16orf59,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1	NA	NA	NA	NA	ATP6V0C	3962	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	2582505	2583298	2582685	Y	RAB26,E4F1,SRRM2,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,CEMP1,PDPK1	ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1	NA	NA	NA	NA	PDPK1	2667	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	2657653	2657823	2657765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERVK13-1	63622	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	2844544	2844902	2844723	Y	MEFV,ATP6V0C,ATP6V0C,PDPK1,SRRM2	SRRM2,TCEB2,PRSS21,ZG16B	PRSS41	K562	ChIA-PET	22265404	TCEB2	19246	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr16	2845811	2846048	2845884	Y	OR1F1,ZNF200,ZNF200,ZNF200,MEFV,ATP6V0C,ATP6V0C,PDPK1,SRRM2	SRRM2,TCEB2,PRSS21,ZG16B	NA	NA	NA	NA	PRSS21	19116	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.755155065262394
chr16	2885761	2886144	2885824	Y	NA	PRSS21,ZG16B,PRSS22,FLYWCH2	NA	NA	NA	NA	ZG16B	7591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.505754962824214
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	ZG16B,PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRSS22	11760	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.61406130868392
chr16	2924940	2925188	2925019	Y	NA	ZG16B,PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,FLYWCH1,PRSS41,PRSS33,TCEB2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21,FLYWCH2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FLYWCH2	5999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	2955389	2955781	2955669	Y	NA	PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1	NA	NA	NA	NA	FLYWCH1	4157	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr16	3053798	3054225	3053960	Y	NA	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1,MMP25	NA	NA	NA	NA	TNFRSF12A	12221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.530857922749385
chr16	3156056	3156304	3156227	Y	PAQR4,OR2C1,CLUAP1,OR1F1	IL32,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	4257	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.238099775810556
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	IL32,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.901881324293058
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.47369724495119
chr16	3207486	3207903	3207712	Y	SRRM2,ZNF75A,ZNF597,ZNF200,ZNF200,ZNF200,NLRC3,MEFV	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	29708	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	3237977	3238591	3238121	Y	NA	ZNF200	ZNF200	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF200	45630	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr16	3512084	3512361	3512129	Y	OR1F1,TIGD7,OR2C1,CLUAP1	ZNF597,NAA60,LA16c-306E5.1,CLUAP1	NA	NA	NA	NA	NAA60	20473	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	3628962	3629267	3629135	Y	NA	SLX4	NA	NA	NA	NA	SLX4	30332	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	3730332	3730635	3730484	Y	NA	TRAP1	NA	NA	NA	NA	TRAP1	34963	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	3796349	3796366	3796358	Y	NA	TRAP1	NA	NA	NA	NA	TRAP1	30751	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	3908512	3908774	3908643	Y	NA	CREBBP	NA	NA	NA	NA	CREBBP	19953	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	3996199	3996445	3996330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREBBP	67472	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr16	4010667	4011135	4010934	Y	CORO7	NA	NA	NA	NA	NA	CREBBP	81940	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr16	4063476	4063638	4063556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	100548	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18478155158147
chr16	4102835	4103049	4102865	Y	CORO7	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	61137	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.124891533033648
chr16	4186619	4186736	4186682	Y	NA	ADCY9	CREBBP,ADCY9,SRL,TRAP1,CORO7-PAM16,PAM16	IMR90	Hi-C	24141950	ADCY9	22433	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.602778417115198
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRL	55999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.822502956868731
chr16	4262475	4262771	4262673	Y	SRL	SRL	NA	NA	NA	NA	SRL	27310	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	4264073	4264474	4264297	Y	SRL	SRL	NA	NA	NA	NA	SRL	25607	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	SRL,TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.32982093449632
chr16	4343991	4344084	4344046	Y	NA	TFAP4	CREBBP,ADCY9,SRL,VASN,GLIS2,PAM16,CORO7-PAM16,TRAP1,TFAP4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	22915	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr16	4349200	4349352	4349284	Y	NA	TFAP4	ADCY9,TFAP4,CREBBP,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	28124	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.583673031867808
chr16	4357393	4358110	4357824	Y	CORO7	TFAP4,PAM16	ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	36317	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.424724589401876
chr16	4424244	4424335	4424249	Y	CREBBP,UBN1,UBN1,MGRN1,CORO7,GLIS2	PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3	NA	NA	NA	NA	VASN	4395	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	4427155	4427449	4427262	Y	NA	PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3	NA	NA	NA	NA	VASN	7306	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	4582537	4582680	4582608	Y	NA	NMRAL1	HMOX2,NMRAL1	IMR90	Hi-C	24141950	NMRAL1	38773	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	4587360	4587817	4587427	Y	HMOX2,PPL,C16orf5,C16orf5	NMRAL1	NA	NA	NA	NA	NMRAL1	43596	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.586402372617435
chr16	4818680	4818913	4818758	Y	C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI	C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI	NA	NA	NA	NA	ZNF500	3055	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.444368867827792
chr16	4985283	4985359	4985321	Y	NA	SEC14L5,PPL	NA	NA	NA	NA	SEC14L5	20959	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr16	4993356	4993730	4993477	Y	PPL	SEC14L5,PPL	UBN1,GLYR1,PPL,ROGDI,NUDT16L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEC14L5	12588	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.206269092017237
chr16	6353433	6353832	6353638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	1207624	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	8035197	8035214	8035207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	678326	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	8041589	8041898	8041750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	671642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	8932650	8933046	8932848	Y	NA	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	27820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	8939360	8939674	8939516	Y	USP7	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	21192	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr16	9055639	9056008	9055791	Y	C16orf72,USP7	USP7	NA	NA	NA	NA	USP7	363	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	9147014	9147397	9147240	Y	ABAT	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	36108	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	9162231	9162510	9162397	Y	NA	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	20995	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.169865805464441
chr16	9171086	9171431	9171335	Y	C16orf72,USP7	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	12074	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr16	9221431	9221974	9221622	Y	USP7,C16orf72	C16orf72	NA	NA	NA	NA	C16orf72	37926	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	9277609	9277994	9277792	Y	NA	NA	ATF7IP2	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf72	94104	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr16	10710369	10710537	10710438	Y	NA	EMP2	NA	NA	NA	NA	EMP2	37814	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr16	10710964	10711341	10711185	Y	EMP2	EMP2	NA	NA	NA	NA	EMP2	38409	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.598205814355722
chr16	10713350	10713596	10713516	Y	NUBP1	EMP2	NA	NA	NA	NA	EMP2	40795	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.46022436215599
chr16	10746944	10747196	10747087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMP2	74389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.02456452309127
chr16	10759043	10759292	10759209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUBP1	76351	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr16	10885820	10885991	10885909	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUBP1	50177	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	10922717	10923252	10923012	Y	NUBP1,SOCS1,CIITA	CIITA	CIITA	IMR90	Hi-C	24141950	CIITA	45803	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.239212888630038
chr16	10926179	10926902	10926382	Y	NA	CIITA	CIITA	IMR90	Hi-C	24141950	CIITA	42153	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	10956294	10956664	10956435	Y	NUBP1,CIITA	CIITA	CIITA	IMR90	Hi-C	24141950	CIITA	12391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr16	10965041	10965252	10965110	Y	NUBP1,SOCS1,CIITA	CIITA	NA	NA	NA	NA	CIITA	3803	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	11059393	11059782	11059502	Y	CIITA,SOCS1,CLEC16A	DEXI,CLEC16A	NA	NA	NA	NA	CLEC16A	23048	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	11155783	11156117	11155981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC16A	119438	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr16	11188261	11188580	11188312	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC16A	151916	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	11336726	11336842	11336760	Y	LITAF,LITAF	RMI2,SOCS1,PRM2	NA	NA	NA	NA	RMI2	4634	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	11473379	11473565	11473516	Y	ZC3H7A,TXNDC11,SNN,LITAF,LITAF,CLEC16A,SOCS1	NA	NA	NA	NA	NA	PRM2	105042	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	11590987	11591512	11591296	Y	NA	NA	SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	136725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr16	11591931	11591962	11591945	Y	NA	NA	SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	136275	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr16	11644813	11645143	11645061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	83094	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr16	11656662	11657039	11656990	Y	ZC3H7A,TXNDC11,LITAF,LITAF	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	71198	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	11662178	11662507	11662365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	65730	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	11670817	11671132	11670939	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,SNN,LITAF,LITAF	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	57105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	11677764	11678427	11678146	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,SNN,LITAF,LITAF	LITAF	NA	NA	NA	NA	LITAF	49810	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	11691003	11692063	11691252	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF	LITAF	MCF7	ChIA-PET	22265404	LITAF	36174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	11702109	11702428	11702257	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF	LITAF,TXNDC11,SNN,CLEC16A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LITAF	25809	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	11705983	11706695	11706338	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF	LITAF,TXNDC11,SNN,CLEC16A,RSL1D1,BCAR4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LITAF	21542	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.221184838134266
chr16	11707277	11708060	11707802	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF	TXNDC11,CLEC16A,LITAF,RSL1D1,BCAR4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LITAF	20177	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr16	11709603	11709900	11709765	Y	RUNDC2A	LITAF	TXNDC11,CLEC16A,LITAF,RSL1D1,BCAR4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LITAF	18337	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	11713232	11713400	11713276	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF,SNN	TXNDC11,CLEC16A,LITAF,RSL1D1,BCAR4	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	14837	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr16	11734091	11734770	11734262	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF,SNN	TXNDC11,SNN,CLEC16A,LITAF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LITAF	5854	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.12254561225776
chr16	11890330	11890418	11890367	Y	LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A	ZC3H7A	NA	NA	NA	NA	ZC3H7A	1207	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.387208190029597
chr16	11968147	11968344	11968329	Y	ZC3H7A	RSL1D1,GSPT1	RSL1D1	IMR90	Hi-C	24141950	RSL1D1	24705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.311133382995852
chr16	12008398	12008797	12008598	Y	NA	GSPT1,TNFRSF17	NA	NA	NA	NA	GSPT1	459	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.427453930151503
chr16	12071486	12071797	12071761	Y	NA	TNFRSF17,RP11-166B2.1,SNX29	NA	NA	NA	NA	SNX29	2892	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	12623440	12623621	12623531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPPED1	272253	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr16	14051699	14052037	14051838	Y	NA	ERCC4,RPS26P52	NA	NA	NA	NA	RPS26P52	37163	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr16	14097024	14097356	14097296	Y	NA	NA	MKL2,ERCC4,MIR193B	IMR90	Hi-C	24141950	MKL2	65822	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	14379572	14379808	14379698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	216394	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr16	14396583	14397514	14397260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	233405	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	14397958	14398068	14398015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	234780	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr16	14402100	14402342	14402181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	238922	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.371562294722201
chr16	14423320	14423633	14423477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	260142	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	14423689	14423899	14423743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	260511	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.135808896032157
chr16	14424623	14424858	14424825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	261445	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	14472258	14472411	14472327	Y	NA	NA	PARN,MIR365A,MIR193B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARN	252174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.230641902752041
chr16	14529113	14529156	14529135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARN	195429	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	14599774	14599935	14599866	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARN	124650	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	14621757	14621928	14621847	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARN	102657	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	15069619	15069687	15069631	Y	PDXDC1	PDXDC1	NA	NA	NA	NA	PDXDC1	3171	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	15085192	15085402	15085309	Y	C16orf45	PDXDC1	NTAN1	IMR90	Hi-C	24141950	PDXDC1	18744	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr16	15576237	15576428	15576343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C16orf45	50085	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.288915693369719
chr16	15583408	15583655	15583541	Y	NDE1,C16orf45	NA	KIAA0430	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf45	57256	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.47708608670551
chr16	15617016	15617455	15617336	Y	NDE1,KIAA0430	NA	NA	NA	NA	NA	C16orf45	90864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr16	15670640	15671032	15670885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0430	63991	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.169865805464441
chr16	15684514	15685137	15684868	Y	NDE1,NDE1,KIAA0430	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	KIAA0430	49886	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr16	15738027	15738375	15738313	Y	NA	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	2903	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	15766632	15767024	15766843	Y	KIAA0430,NDE1,NDE1	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	31508	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.706948336971311
chr16	15769690	15769796	15769712	Y	NA	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	34566	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.139807279150677
chr16	16115976	16116215	16116101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	74542	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	16198084	16198445	16198250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOMO3	125907	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr16	17463561	17463824	17463658	Y	XYLT1	NA	NA	NA	NA	NA	NOMO3	1139209	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	17485561	17485736	17485646	Y	XYLT1	NA	NA	NA	NA	NA	NOMO3	1161209	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	18811720	18812078	18811899	Y	SMG1,COQ7,COQ7	RPS15A,ARL6IP1	NA	NA	NA	NA	ARL6IP1	720	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	19103583	19103758	19103655	Y	NA	COQ7,ITPRIPL2	NA	NA	NA	NA	ITPRIPL2	19496	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr16	19106464	19106699	19106563	Y	NA	COQ7,ITPRIPL2	NA	NA	NA	NA	ITPRIPL2	16555	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr16	19532119	19532450	19532314	Y	CCP110	RNU4-46P,GDE1,CCP110,C16orf62	NA	NA	NA	NA	GDE1	652	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr16	19714468	19714843	19714656	Y	NA	IQCK	NA	NA	NA	NA	IQCK	10935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr16	20877631	20877934	20877768	Y	NA	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	LYRM1	31256	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	20913163	20913441	20913303	Y	CRYM,DCUN1D3,LYRM1	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	3457	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr16	20915885	20916169	20915941	Y	CRYM,DCUN1D3,LYRM1	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	6179	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	21313038	21313456	21313158	Y	NA	CRYM-AS1	NA	NA	NA	NA	CRYM-AS1	2868	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr16	21566198	21566360	21566279	Y	DNAH3	SLC7A5P2,CTD-2547E10.2,METTL9	METTL9,IGSF6	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2547E10.2	36433	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	21622558	21622759	21622643	Y	CRYM,IGSF6,METTL9	METTL9	NA	NA	NA	NA	METTL9	16019	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr16	22020044	22020453	22020259	Y	OTOA,VWA3A	C16orf52	VWA3A	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf52	3085	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	22046502	22046742	22046619	Y	NA	C16orf52	NA	NA	NA	NA	C16orf52	29543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr16	22202596	22202946	22202679	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	12657	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.194238616199245
chr16	22207042	22207397	22207176	Y	NA	EEF2K	POLR3E,EEF2K,C16orf52	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	8206	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr16	22211037	22211162	22211126	Y	NA	EEF2K	POLR3E,EEF2K	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	EEF2K	4441	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.139807279150677
chr16	22229382	22229580	22229448	Y	NA	EEF2K	NA	NA	NA	NA	EEF2K	13779	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	22406960	22407340	22407096	Y	NA	CDR2,RRN3P3	POLR3E,CDR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDR2	39146	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	22933536	22933775	22933574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP31	224816	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr16	23309711	23310080	23309897	Y	NA	NA	SCNN1B	MCF7	ChIA-PET	22265404	USP31	151120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	23431856	23432257	23432204	Y	USP31,COG7	COG7	SCNN1B	IMR90	Hi-C	24141950	COG7	30244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	23455511	23455803	23455657	Y	SCNN1G	COG7	NA	NA	NA	NA	COG7	6698	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	23463654	23463771	23463713	Y	NA	COG7	NA	NA	NA	NA	COG7	1153	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	23518606	23518950	23518778	Y	GGA2	GGA2,UBFD1,EARS2	NA	NA	NA	NA	GGA2	12366	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	23531974	23532033	23532005	Y	NA	GGA2,UBFD1,EARS2	NA	NA	NA	NA	GGA2	658	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr16	23693851	23693869	23693860	Y	NA	PALB2,DCTN5,PLK1	NA	NA	NA	NA	PLK1	6874	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	24263992	24264018	24264005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA1	78850	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	24284906	24285056	24284981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA1	57812	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr16	24363109	24363426	24363114	Y	CACNG3	SNORA1	NA	NA	NA	NA	SNORA1	20241	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	24538501	24538703	24538598	Y	RBBP6	RBBP6	NA	NA	NA	NA	RBBP6	8311	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	24855986	24856230	24856033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNRC6A	116970	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	25005690	25005854	25005767	Y	NA	ARHGAP17	NA	NA	NA	NA	ARHGAP17	19133	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr16	25025498	25025977	25025718	Y	NA	ARHGAP17	NA	NA	NA	NA	ARHGAP17	511	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr16	25060889	25061147	25061001	Y	NA	ARHGAP17	NA	NA	NA	NA	ARHGAP17	35902	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	25069852	25070174	25070015	Y	NA	ARHGAP17	NA	NA	NA	NA	ARHGAP17	44865	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.337888348919033
chr16	25430499	25430826	25430663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZKSCAN2	163247	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr16	27149778	27150235	27150058	Y	NA	NA	HS3ST4,ZKSCAN2,AQP8	IMR90	Hi-C	24141950	NSMCE1	127880	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	27240450	27240772	27240769	Y	NA	NSMCE1	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	37343	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	27264305	27264607	27264422	Y	NA	NSMCE1	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	13508	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	27326906	27327374	27327287	Y	KIAA0556,IL4R	NSMCE1,IL4R	NA	NA	NA	NA	IL4R	3917	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	27329776	27330351	27329940	Y	JMJD5,JMJD5,KIAA0556,IL21R,IL4R	IL4R	NA	NA	NA	NA	IL4R	6787	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	27338285	27338559	27338369	Y	KIAA0556,IL4R	IL4R	NA	NA	NA	NA	IL4R	15296	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.176210565703473
chr16	27533512	27533805	27533694	Y	JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	25429	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr16	27541388	27541697	27541538	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	17537	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	27546889	27546978	27546937	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	12256	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr16	27577101	27577365	27577280	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	KIAA0556	17647	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr16	27620703	27620731	27620720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0556	61249	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr16	28108728	28108802	28108745	Y	APOBR,XPO6	NA	NA	NA	NA	NA	XPO6	112439	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	28153289	28153624	28153397	Y	SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6	NA	NA	NA	NA	NA	XPO6	67617	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	28186234	28186473	28186328	Y	SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6	XPO6	NA	NA	NA	NA	XPO6	34768	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr16	28496890	28497119	28497100	Y	NA	APOBR,CLN3	NA	NA	NA	NA	APOBR	6851	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	28629445	28629457	28629451	Y	SBK1,IL27	SULT1A2,SULT1A1	NA	NA	NA	NA	SULT1A1	3489	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	28839972	28840187	28840086	Y	CCDC101,LAT,LAT,SH2B1,SH2B1,SH2B1,NFATC2IP	ATXN2L,TUFM,SH2B1	NA	NA	NA	NA	ATXN2L	7616	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr16	28860977	28861369	28861174	Y	NA	ATXN2L,TUFM,SH2B1	NA	NA	NA	NA	SH2B1	5056	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	29168403	29168702	29168538	Y	SPNS1	NA	RRN3P2	IMR90	Hi-C	24141950	SPNS1	184861	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	29836551	29836761	29836656	Y	NA	KIF22,MAZ,MVP,CDIPT	NA	NA	NA	NA	MVP	6836	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.194968765389612
chr16	29954900	29955228	29955066	Y	NA	SEZ6L2,ASPHD1,KCTD13,TMEM219,TAOK2,INO80E	MVP,KCTD13,ZG16,PRRT2,MAZ,KIF22,C16orf54,LOC440356,ASPHD1,SEZ6L2,CDIPT,TMEM219,TAOK2,HIRIP3,INO80E,ALDOA	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM219	4694	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	30427925	30428543	30428281	Y	HIRIP3,ZNF48	TBC1D10B,ZNF48,SEPT1,ZNF771,SNORA42,DCTPP1,SEPHS2	NA	NA	NA	NA	SNORA42	537	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr16	30545067	30545182	30545127	Y	ZNF764	ZNF768,AC002310.12,ZNF747,ZNF764,AC002310.7,ZNF688,ZNF785	NA	NA	NA	NA	ZNF747	894	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.180053019272583
chr16	30579441	30579843	30579693	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,SEPT1,ITGAL,STX4,ZNF689	ZNF768,AC002310.12,ZNF747,ZNF764,AC002310.7,ZNF688,ZNF785	NA	NA	NA	NA	AC002310.7	1728	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.86250468419665
chr16	30726552	30726958	30726731	Y	ZNF668,ZNF646,STX4,MYST1,FUS	SRCAP,PHKG2,RNF40,C16orf93	RNF40,PHKG2,C16orf93	IMR90	Hi-C	24141950	SRCAP	19022	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	30825606	30826012	30825883	Y	NA	ZNF629	ZNF629,RNF40,MIR4519	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF629	29083	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.229755824012263
chr16	30876491	30876606	30876548	Y	NA	MIR4519,BCL7C	NA	NA	NA	NA	MIR4519	8038	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr16	30885980	30886229	30886174	Y	ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668	MIR4519,BCL7C,FBXL19,FBXL19-AS1	NA	NA	NA	NA	MIR4519	1336	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.714909325140488
chr16	30927821	30927845	30927833	Y	NA	MIR4519,BCL7C,FBXL19,FBXL19-AS1,ORAI3,SETD1A	NA	NA	NA	NA	FBXL19	4531	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr16	31125100	31125333	31125167	Y	STX4,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS	ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8,PRSS8,PRSS36	NA	NA	NA	NA	KAT8	25	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	31129616	31130225	31129940	Y	ARMC5,STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS	ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8,PRSS8,PRSS36	NA	NA	NA	NA	KAT8	4541	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	31888684	31889219	31888998	Y	ARMC5,ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	5605	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	31891820	31892363	31891972	Y	ARMC5,ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	8741	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	31905713	31906088	31906002	Y	ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	22634	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.286916501810459
chr16	33952235	33952334	33952272	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2069156	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	34377841	34378195	34377988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2494762	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	34956727	34956933	34956830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	3073648	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr16	46792369	46792477	46792422	Y	MYLK3	NA	MYLK3,C16orf87	IMR90	Hi-C	24141950	ORC6	70814	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr16	46823783	46824029	46823881	Y	NA	C16orf87	NA	NA	NA	NA	C16orf87	39294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.244671570129293
chr16	46863838	46864241	46863904	Y	NA	C16orf87	NA	NA	NA	NA	C16orf87	515	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr16	46920520	46920743	46920636	Y	NA	GPT2	NA	NA	NA	NA	GPT2	4230	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	47175603	47175949	47175815	Y	NETO2	NA	NA	NA	NA	NA	NETO2	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	47454284	47454574	47454519	Y	NA	PHKB,ITFG1	NA	NA	NA	NA	PHKB	38460	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	48373783	48374217	48374017	Y	LONP2,N4BP1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	LONP2	97576	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr16	48400459	48400723	48400564	Y	LONP2,N4BP1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	79590	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.198811218958722
chr16	48417730	48418013	48418003	Y	N4BP1,SIAH1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	62300	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	48545095	48545474	48545284	Y	SIAH1	NA	SIAH1,MIR548AE2,N4BP1	IMR90	Hi-C	24141950	SIAH1	64782	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	48592202	48592453	48592359	Y	SIAH1,N4BP1	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	59606	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	48593216	48593689	48593553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	58370	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr16	48657602	48657960	48657802	Y	SIAH1,N4BP1	N4BP1	ABCC11,SIAH1,MIR548AE2,N4BP1	IMR90	Hi-C	24141950	N4BP1	5543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	50101332	50101352	50101341	Y	NA	HEATR3	NA	NA	NA	NA	HEATR3	3480	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr16	50313130	50313496	50313255	Y	NA	ADCY7	NA	NA	NA	NA	ADCY7	35082	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	51670868	51671078	51670973	Y	NA	HNRNPA1P48	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P48	6589	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	51795949	51796284	51796182	Y	NA	NA	SALL1,CYLD,LOC388276	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPA1P48	118282	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	51806959	51807182	51807071	Y	NA	NA	SALL1	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPA1P48	129292	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr16	51946818	51947082	51946950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P48	269151	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	52854151	52854308	52854232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-297L17.6	166935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr16	53086726	53087108	53087065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD9	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.220454688943899
chr16	53089565	53089820	53089729	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	2620	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	53134908	53135206	53135001	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	47963	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr16	53165497	53165808	53165602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD9	78552	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr16	53517834	53518098	53518006	Y	NA	AKTIP	NA	NA	NA	NA	AKTIP	18225	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	53810167	53810347	53810243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTO	74292	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr16	53946175	53946412	53946271	Y	RBL2,AKTIP	NA	NA	NA	NA	NA	FTO	210300	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr16	53947888	53947948	53947918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTO	212013	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	54114585	54114959	54114772	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-324D17.1	187699	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172595146214068
chr16	55119645	55120042	55119844	Y	NA	NA	FTO	IMR90	Hi-C	24141950	IRX5	156871	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	55869661	55869957	55869814	Y	NA	CES1	NA	NA	NA	NA	CES1	4412	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	55870128	55870546	55870373	Y	NA	CES1	NA	NA	NA	NA	CES1	4879	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	56352339	56352494	56352417	Y	MT3,CES5A,GNAO1,BBS2	NA	NA	NA	NA	NA	AMFR	104956	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	56585977	56586211	56586034	Y	MT3,GNAO1,BBS2	BBS2,MT4	AMFR,NUDT21,MT1B,BBS2,MT2A,MT3,MT1A,MT1JP,MT1DP,MT1M,MT1H,MT1X,MT1IP,MT1G,NUP93	IMR90	Hi-C	24141950	MT4	10750	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	56640479	56640669	56640573	Y	NA	MT4,MT2A,MT1E,MT1A,MT1F	NA	NA	NA	NA	MT2A	368	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr16	56641054	56641530	56641359	Y	MT2A,MT1E	MT4,MT2A,MT1E,MT1A,MT1F	NA	NA	NA	NA	MT2A	943	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr16	56644047	56644457	56644379	Y	NLRC5,HERPUD1	MT4,MT2A,MT1E,MT1A,MT1F	NA	NA	NA	NA	MT2A	3936	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr16	56882732	56883304	56883026	Y	NA	SLC12A3	MIR138-2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC12A3	13815	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.274886025992467
chr16	56944688	56944705	56944692	Y	HERPUD1	SLC12A3,HERPUD1	NA	NA	NA	NA	HERPUD1	19255	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	57034523	57034824	57034736	Y	NLRC5	NLRC5	NA	NA	NA	NA	NLRC5	13126	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	57125471	57125887	57125617	Y	NA	CPNE2	NA	NA	NA	NA	CPNE2	1022	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr16	57294233	57294672	57294611	Y	CPNE2,GPR56	ARL2BP,PLLP	NA	NA	NA	NA	ARL2BP	17223	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	57302834	57302977	57302910	Y	NA	ARL2BP,PLLP	NA	NA	NA	NA	PLLP	13622	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr16	57338123	57338348	57338237	Y	NA	PLLP	NLRC5,CPNE2,PLLP,CIAPIN1,FAM192A,RSPRY1,ARL2BP,COQ9,CX3CL1,CCL22,POLR2C,GPR114,CCDC102A	IMR90	Hi-C	24141950	PLLP	21524	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	57422451	57422745	57422598	Y	CCL17	CCL22,CX3CL1	NA	NA	NA	NA	CX3CL1	18081	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	57488914	57489209	57489062	Y	NA	COQ9,CIAPIN1,POLR2C,DOK4	NA	NA	NA	NA	POLR2C	5090	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr16	57510567	57510918	57510632	Y	NA	COQ9,CIAPIN1,POLR2C,DOK4	NA	NA	NA	NA	DOK4	8321	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	57654867	57655271	57654917	Y	NA	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	12303	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr16	57655846	57656393	57655974	Y	FAM192A,COQ9,CIAPIN1,GPR56	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	13282	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.281457820311205
chr16	57657206	57657412	57657318	Y	NA	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	14642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	57701111	57701632	57701437	Y	FAM192A,ZNF319,C16orf57,GPR97	CCDC135	NA	NA	NA	NA	CCDC135	25073	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.196967956948873
chr16	57717053	57717380	57717096	Y	FAM192A,ZNF319,GPR97	CCDC135	NA	NA	NA	NA	CCDC135	9325	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.222297950953749
chr16	57841964	57842337	57842236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIFC3	52620	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.07301617212639
chr16	57927623	57928192	57928041	Y	GPR97,ZNF319	KIFC3	NA	NA	NA	NA	KIFC3	32666	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	58061325	58061443	58061395	Y	NA	MMP15	NA	NA	NA	NA	MMP15	3855	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr16	58555953	58556233	58556187	Y	NA	SETD6	NA	NA	NA	NA	SETD6	8570	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.308559971795636
chr16	58766614	58766832	58766704	Y	NA	SLC38A7,RP11-410D17.2,GOT2	NA	NA	NA	NA	GOT2	353	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr16	60706684	60707081	60706883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOT2	1940423	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	66165018	66165370	66165247	Y	NA	NA	LOC283867,CDH11	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00920	275057	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	66416297	66416567	66416426	Y	CDH5	LINC00920	NA	NA	NA	NA	LINC00920	23860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr16	66440915	66440994	66440955	Y	CMTM3,CMTM3	LINC00920	NA	NA	NA	NA	LINC00920	488	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr16	66587187	66587393	66587288	Y	NA	TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1,CMTM3	NA	NA	NA	NA	CKLF-CMTM1	2697	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	66619876	66620093	66620023	Y	CKLF	TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1,CMTM3	NA	NA	NA	NA	CMTM3	15684	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	66709355	66709374	66709366	Y	DYNC1LI2	CMTM4	NA	NA	NA	NA	CMTM4	19236	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr16	66719308	66719396	66719350	Y	NA	CMTM4	NA	NA	NA	NA	CMTM4	9214	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr16	66784501	66784840	66784671	Y	NA	DYNC1LI2	NA	NA	NA	NA	DYNC1LI2	800	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr16	66906996	66907469	66907329	Y	SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2	NAE1,PDP2	NA	NA	NA	NA	NAE1	1837	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.942282993964374
chr16	67345616	67346198	67345888	Y	RRAD,CBFB,FAM65A,FHOD1,PLEKHG4	PLEKHG4	NA	NA	NA	NA	PLEKHG4	36203	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	67538327	67538734	67538468	Y	NA	ATP6V0D1,FAM65A	AGRP,TSNAXIP1,GFOD2,RANBP10,PSKH1,CTCF,RLTPR,CTRL	IMR90	Hi-C	24141950	FAM65A	11587	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.266159110565059
chr16	67561753	67561884	67561820	Y	HSF4,SLC9A5,TPPP3,FAM65A	ATP6V0D1,FAM65A,CTCF	NA	NA	NA	NA	FAM65A	11432	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.147265152209192
chr16	67597304	67597932	67597899	Y	THAP11,RLTPR,ACD	FAM65A,CTCF	NA	NA	NA	NA	CTCF	2994	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.9330355283674
chr16	67687517	67687714	67687560	Y	HSF4,KIAA0895L,SLC9A5,TSNAXIP1,PARD6A	RLTPR,ACD,PARD6A,C16orf86	NA	NA	NA	NA	ACD	4999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr16	67794099	67794447	67794264	Y	CTCF,GFOD2,DPEP2,RANBP10	GFOD2,RANBP10,TSNAXIP1	NA	NA	NA	NA	GFOD2	42775	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	67867011	67867153	67867060	Y	TPPP3,CENPT	RANBP10,TSNAXIP1,THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4	NA	NA	NA	NA	THAP11	7060	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	67892470	67892795	67892734	Y	RLTPR,ACD,NFATC3,EDC4,THAP11	THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,PSKH1	NA	NA	NA	NA	EDC4	12131	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	67993555	67993691	67993621	Y	NA	PSMB10,LCAT,SLC12A4	NA	NA	NA	NA	SLC12A4	7813	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.308559971795636
chr16	68029500	68029744	68029642	Y	PSMB10,DPEP2,DDX28	SLC12A4,DDX28	NA	NA	NA	NA	DDX28	26026	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	68268995	68269119	68269015	Y	NA	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	886	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210997624326124
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	1343	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.01507213201106
chr16	68281428	68281510	68281462	Y	NA	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	PLA2G15	4221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	68320188	68320357	68320233	Y	RANBP10,THAP11,EDC4,PSMB10,DPEP2,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P	NA	NA	NA	NA	SLC7A6OS	22492	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr16	68320405	68320913	68320608	Y	ZFP90,SMPD3	PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P	NA	NA	NA	NA	SLC7A6OS	21936	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	68503731	68504029	68503905	Y	NA	NA	PRMT7,SMPD3	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP90	57964	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	68765918	68766309	68765994	Y	NA	NA	CDH3,CDH1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-36P	198500	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr16	69060339	69060481	69060445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAS3	76986	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr16	69121214	69121414	69121257	Y	NA	HAS3,CHTF8,CIRH1A	HAS3	IMR90	Hi-C	24141950	HAS3	16053	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	69225511	69225823	69225667	Y	HAS3	SNTB2	NA	NA	NA	NA	SNTB2	6479	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	69345968	69346332	69346034	Y	NA	VPS4A,PDF,NIP7,COG8	NA	NA	NA	NA	VPS4A	2709	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr16	69351854	69351929	69351891	Y	NA	VPS4A,PDF,NIP7,COG8	NA	NA	NA	NA	VPS4A	8595	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.143649732719787
chr16	69432325	69432475	69432421	Y	TERF2	TERF2,CYB5B	NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TERF2	7999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	69442470	69442627	69442557	Y	NA	TERF2,CYB5B	NFAT5,CYB5B	IMR90	Hi-C	24141950	TERF2	1996	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.145265960649932
chr16	69444205	69444538	69444372	Y	NA	TERF2,CYB5B	NFAT5,CYB5B,TERF2,COG8,NIP7,TMED6,MIR1538,NQO1,WWP2,NOB1	IMR90	Hi-C	24141950	TERF2	3731	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr16	69477830	69478460	69477879	Y	NA	TERF2,CYB5B	NA	NA	NA	NA	CYB5B	21402	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr16	69506405	69506529	69506498	Y	NA	CYB5B	NA	NA	NA	NA	CYB5B	49977	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr16	69516681	69516730	69516706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB5B	60253	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	69556739	69556897	69556827	Y	HAS3,TERF2	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2	IMR90	Hi-C	24141950	NFAT5	40100	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr16	69563572	69563696	69563627	Y	NA	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	33301	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.329317363041035
chr16	69564577	69564882	69564731	Y	WWP2	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	32115	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.286186352620092
chr16	69601109	69601332	69601245	Y	WWP2	NFAT5	NA	NA	NA	NA	NFAT5	4112	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	69603393	69603628	69603450	Y	NA	NFAT5	NA	NA	NA	NA	NFAT5	6396	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	69751128	69751528	69751345	Y	PDF,TERF2,NQO1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NQO1	7326	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr16	69761641	69762033	69761837	Y	NA	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NQO1	2787	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr16	69777344	69777472	69777408	Y	NA	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NOB1	9371	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	69790083	69790481	69790284	Y	NA	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NOB1	3240	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.450210512956163
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.26497580590453
chr16	69865358	69865753	69865556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWP2	71149	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	70356792	70356812	70356803	Y	NA	AARS,DDX19B,DDX19A	NA	NA	NA	NA	DDX19A	21920	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	70424558	70424975	70424714	Y	NA	DDX19A,ST3GAL2	NA	NA	NA	NA	DDX19A	45826	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	70461908	70462625	70462132	Y	ST3GAL2	ST3GAL2,FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	8515	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	70464772	70465160	70465031	Y	ST3GAL2	ST3GAL2,FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	5980	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	70564094	70564236	70564165	Y	NA	COG4,SF3B3,SNORD111B	NA	NA	NA	NA	SNORD111B	2682	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr16	70725776	70726100	70725941	Y	MTSS1L	MTSS1L	MTSS1L	MCF7	ChIA-PET	22265404	MTSS1L	7807	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr16	70727989	70728270	70728171	Y	NA	MTSS1L	MTSS1L	MCF7	ChIA-PET	22265404	MTSS1L	10020	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	70769740	70769941	70769843	Y	NA	NA	MTSS1L,IL34	IMR90	Hi-C	24141950	MTSS1L	51771	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	71734305	71734386	71734346	Y	PHLPP2	PHLPP2	NA	NA	NA	NA	PHLPP2	22218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	71931018	71931097	71931057	Y	DHX38,ATXN1L,KIAA0174	ZNF821	NA	NA	NA	NA	ZNF821	3779	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	332828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.433451504829284
chr16	72671878	72672163	72672013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	419434	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.128351022973642
chr16	72882732	72883050	72882991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	208547	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	72897745	72898023	72897884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	193574	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	72958517	72958769	72958627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	132828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	72966138	72966319	72966212	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	125278	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr16	72981236	72981554	72981364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	110043	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	73023566	73023933	73023728	Y	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	67664	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	73076128	73076469	73076445	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	15128	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	73084736	73084892	73084798	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	6705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr16	73088640	73089206	73088991	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	2391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr16	73090044	73090191	73090091	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	1406	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr16	73099840	73099940	73099875	Y	ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	8243	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	73102477	73102709	73102578	Y	ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	10880	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr16	73102955	73103191	73103082	Y	ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	11358	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.439640335518905
chr16	73104505	73104770	73104567	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	12908	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.773183115758166
chr16	73158236	73158440	73158308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	66639	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.21739605403655
chr16	73175958	73176260	73176058	Y	NA	NA	ZFHX3,LOC100506172	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	84361	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	73185769	73185903	73185836	Y	NA	NA	ZFHX3,LOC100506172	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	94172	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	73206454	73206866	73206668	Y	NA	NA	ZFHX3,HPR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFHX3	114857	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.411808034844107
chr16	73210679	73210897	73210788	Y	ZFHX3	NA	ZFHX3,HPR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFHX3	119082	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	74353064	74353398	74353241	Y	FA2H	PSMD7,RP11-252A24.2	NA	NA	NA	NA	PSMD7	24391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr16	74356396	74356719	74356558	Y	NA	PSMD7,RP11-252A24.2	NA	NA	NA	NA	PSMD7	27723	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr16	74545615	74545910	74545763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLG1	93102	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	74610751	74610842	74610827	Y	NA	GLG1	NA	NA	NA	NA	GLG1	28170	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	74672577	74672957	74672890	Y	NA	GLG1,RFWD3	NA	NA	NA	NA	RFWD3	25822	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr16	74701397	74701877	74701440	Y	RFWD3	RFWD3,MLKL	NA	NA	NA	NA	RFWD3	2618	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.393779984348334
chr16	74702224	74702291	74702259	Y	NA	RFWD3,MLKL	NA	NA	NA	NA	RFWD3	3445	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr16	74772099	74772485	74772392	Y	NA	MLKL,FA2H	NA	NA	NA	NA	FA2H	34244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr16	74774732	74775110	74775064	Y	FA2H	MLKL,FA2H	NA	NA	NA	NA	FA2H	31619	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.65086545026936
chr16	74777612	74777799	74777727	Y	NA	MLKL,FA2H	NA	NA	NA	NA	FA2H	28930	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.88896476973529
chr16	74991657	74991945	74991906	Y	NA	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	ZNRF1	38983	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	75034413	75034614	75034514	Y	FA2H,ZFP1,BCAR1,BCAR1,ZNRF1	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	WDR59	2342	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	75278988	75279894	75279594	Y	CHST6,FA2H,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	20057	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.194968765389612
chr16	75283958	75284369	75284078	Y	NA	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	15582	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	75288221	75288577	75288338	Y	NA	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	11374	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	75294692	75295061	75294835	Y	TERF2IP,BCAR1,BCAR1	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	4890	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	75410566	75410863	75410755	Y	BCAR1	NA	NA	NA	NA	NA	CFDP1	54520	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.67819508743893
chr16	75411958	75412267	75412159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFDP1	53116	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr16	75483148	75483204	75483176	Y	NA	CFDP1,TMEM170A	NA	NA	NA	NA	TMEM170A	14191	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	75594050	75594208	75594144	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2	CHST5,TMEM231	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GABARAPL2	4041	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	75618166	75618518	75618190	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2,ADAT1	NA	NA	NA	NA	GABARAPL2	19917	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	75628076	75628219	75628207	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2,ADAT1	NA	NA	NA	NA	ADAT1	26979	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	75636745	75636762	75636754	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2,ADAT1,TERF2IP,KARS	NA	NA	NA	NA	ADAT1	18436	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr16	76269107	76269317	76269211	Y	NA	RPL18P13	NA	NA	NA	NA	RPL18P13	1586	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr16	78564720	78564924	78564822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	433410	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	78830248	78830546	78830432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	698938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	78832287	78832508	78832373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	700977	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr16	78908280	78908607	78908407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	776970	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	79414931	79415415	79415101	Y	MAF	NA	WWOX	IMR90	Hi-C	24141950	WWOX	1283621	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	80060890	80061347	80061153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYL2	774879	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	80648932	80649251	80648956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYL2	186975	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr16	80694679	80694985	80694832	Y	CDYL2	NA	NA	NA	NA	NA	CDYL2	141241	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	80710391	80710578	80710565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYL2	125648	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr16	80838768	80839127	80839024	Y	CENPN,C16orf61,ATMIN,CDYL2	CDYL2	NA	NA	NA	NA	CDYL2	2542	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.787942932325784
chr16	80965900	80966145	80965922	Y	NA	NA	CMC2	IMR90	Hi-C	24141950	CENPN	71958	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.823616069688213
chr16	80971971	80972227	80972105	Y	CENPN	NA	NA	NA	NA	NA	CENPN	65876	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.31099625280003
chr16	81026963	81027197	81027054	Y	NA	CENPN,ATMIN	NA	NA	NA	NA	CENPN	10906	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr16	81038389	81038511	81038494	Y	NA	CENPN,ATMIN	NA	NA	NA	NA	CENPN	286	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.212996815885384
chr16	81434776	81434850	81434813	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	41925	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	81436864	81437191	81437044	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	39584	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr16	81512608	81512902	81512703	Y	PLCG2,CMIP,CMIP	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	35833	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	81514966	81515415	81515191	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	38191	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	81560583	81561027	81560837	Y	PLCG2,CMIP,CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	CMIP	83808	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	81649296	81649780	81649593	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	120922	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	81659842	81660553	81660320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	110149	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr16	81693209	81693442	81693326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	77260	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	81701284	81701528	81701406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	69174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	81763852	81764387	81764185	Y	NA	PLCG2	NA	NA	NA	NA	PLCG2	6315	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr16	81871176	81871311	81871248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	100474	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	81875278	81875726	81875461	Y	PLCG2	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	104576	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	82218616	82218871	82218675	Y	MPHOSPH6	MPHOSPH6	HSD17B2	IMR90	Hi-C	24141950	MPHOSPH6	16785	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	82661526	82661961	82661896	Y	CDH13	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	3118	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201540559708349
chr16	82663331	82663687	82663514	Y	NA	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	4923	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr16	82689057	82689347	82689181	Y	NA	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	30649	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	82693893	82694152	82693974	Y	NA	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	35485	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	82733427	82733620	82733554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH13	75019	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr16	83953538	83953937	83953606	Y	NA	MLYCD,OSGIN1,NECAB2	NA	NA	NA	NA	MLYCD	22807	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	83988181	83988500	83988282	Y	NA	OSGIN1,NECAB2	NA	NA	NA	NA	OSGIN1	8294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr16	84208911	84209121	84208992	Y	OSGIN1,COTL1,HSDL1,TAF1C	HSDL1,TAF1C	NA	NA	NA	NA	TAF1C	9548	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.280344707491722
chr16	84424110	84424272	84424217	Y	NECAB2	NA	NA	NA	NA	NA	WFDC1	97858	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	84631583	84631836	84631712	Y	ZDHHC7,KIAA0513,KLHL36,CRISPLD2,COTL1	COTL1,KLHL36	NA	NA	NA	NA	COTL1	17847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	84633541	84633938	84633771	Y	NA	COTL1,KLHL36	NA	NA	NA	NA	COTL1	15745	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	84682643	84682972	84682859	Y	NA	COTL1,KLHL36,USP10	NA	NA	NA	NA	KLHL36	2512	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	84704578	84704887	84704734	Y	NA	KLHL36,USP10	NA	NA	NA	NA	KLHL36	24447	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	85020713	85021068	85020917	Y	NA	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	22073	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	85038009	85038299	85038256	Y	NA	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	4842	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr16	85062384	85062545	85062427	Y	ZDHHC7,KIAA0513	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	3009	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.33637483741153
chr16	85497347	85497685	85497518	Y	KIAA0182,GINS2	NA	KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	223994	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	85548685	85548970	85548791	Y	NA	NA	KIAA0182	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	172709	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.428722972520397
chr16	85557334	85557622	85557547	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	164057	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	85558121	85558453	85558347	Y	KIAA0182,KIAA0182	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	163226	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr16	85569070	85569366	85569223	Y	KIAA0182,KIAA0182,GINS2,COX4NB	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	152313	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	85586399	85586765	85586561	Y	KIAA0182,KIAA0182,GINS2	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134914	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	85586938	85587370	85587020	Y	NA	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134309	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.537046753439006
chr16	85600571	85600865	85600718	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	120814	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	85603305	85603679	85603564	Y	KIAA0182	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	118000	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	85604470	85605423	85604746	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	116256	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr16	85606114	85606473	85606294	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	115206	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr16	85608106	85608214	85608158	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	113465	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	85623714	85624085	85623926	Y	NA	NA	LOC727710,LOC400548,LINC00311,KIAA0182,C16orf74	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	97594	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	85650361	85650613	85650432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GINS2	71066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	85734545	85734806	85734797	Y	NA	GINS2,C16orf74	GINS2	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	12866	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	85751381	85751721	85751674	Y	NA	GINS2,C16orf74	NA	NA	NA	NA	GINS2	29702	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	85758517	85758802	85758746	Y	NA	GINS2,C16orf74	GINS2,KIAA0182	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf74	23933	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr16	85780154	85780247	85780189	Y	NA	C16orf74,COX4I1	GINS2	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf74	2488	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr16	85783425	85783755	85783547	Y	NA	C16orf74,COX4I1	NA	NA	NA	NA	C16orf74	690	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	85783855	85783992	85783913	Y	NA	C16orf74,COX4I1	NA	NA	NA	NA	C16orf74	1120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.324049937553621
chr16	85878522	85878578	85878550	Y	NA	COX4I1,RP11-568J23.1	LOC400550,COX4NB,IRF8,FLJ30679,MTHFSD,LOC146513,LOC732275,FOXF1,COX4I1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-568J23.1	30380	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	85950196	85950424	85950316	Y	COX4I1,IRF8	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-568J23.1	102054	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	85995905	85996102	85996008	Y	NA	NA	IRF8,COX4NB,MTHFSD,COX4I1,FLJ30679,FOXC2,LOC400550	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-568J23.1	147763	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	86108709	86108885	86108797	Y	NA	NA	LOC400550,LOC732275,FOXF1,MTHFSD,FLJ30679,LOC146513	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-568J23.1	260567	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr16	86312346	86312714	86312528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXF1	229419	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.951201165403623
chr16	86374799	86375066	86374872	Y	IRF8	NA	NA	NA	NA	NA	FOXF1	167067	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr16	86377089	86377400	86377245	Y	NA	NA	LOC146513	IMR90	Hi-C	24141950	FOXF1	164733	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.299833056368228
chr16	86417419	86417805	86417701	Y	NA	NA	LOC400550,LOC732275,LOC146513	IMR90	Hi-C	24141950	FOXF1	124328	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.636452362918367
chr16	86421149	86421325	86421222	Y	FOXF1,FOXC2	NA	LOC400550,LOC732275,LOC146513,FOXF1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXF1	120808	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.27198332063453
chr16	86499961	86500190	86500098	Y	FOXF1	FOXF1	NA	NA	NA	NA	FOXF1	41943	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.72492317434032
chr16	86587305	86587716	86587504	Y	NA	FOXF1,MTHFSD,FOXC2	NA	NA	NA	NA	MTHFSD	464	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr16	86609499	86609840	86609550	Y	FOXC2	MTHFSD,FOXC2	NA	NA	NA	NA	FOXC2	10642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.324588830732148
chr16	86619952	86620235	86620073	Y	FOXC2	MTHFSD,FOXC2	NA	NA	NA	NA	FOXC2	21095	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	86698129	86698417	86698281	Y	NA	NA	FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,FOXC2,C16orf95,FBXO31	IMR90	Hi-C	24141950	FOXC2	99272	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.228642711192781
chr16	86698644	86698785	86698699	Y	FOXL1	NA	FOXL1,C16orf95,MTHFSD,FLJ30679,FOXC2	IMR90	Hi-C	24141950	FOXC2	99787	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr16	86775121	86775409	86775225	Y	NA	NA	FOXC2,FOXL1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXC2	176264	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	86795224	86795595	86795410	Y	NA	NA	FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,C16orf95,FOXC2,FBXO31	IMR90	Hi-C	24141950	FOXC2	196367	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.169865805464441
chr16	86855510	86855797	86855532	Y	NA	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679	IMR90	Hi-C	24141950	FOXC2	256653	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.128351022973642
chr16	86964858	86965748	86965178	Y	NA	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	FOXC2	366001	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr16	86985410	86985767	86985608	Y	FOXC2,FOXL1	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	FOXC2	386553	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr16	87421939	87422407	87422148	Y	NA	MAP1LC3B,FBXO31	NA	NA	NA	NA	FBXO31	1341	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr16	87428114	87428209	87428177	Y	NA	MAP1LC3B,FBXO31	NA	NA	NA	NA	FBXO31	4366	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr16	87756631	87757179	87757021	Y	KLHDC4	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	40419	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	87773499	87773902	87773849	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	23696	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr16	87774219	87774566	87774531	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	23032	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	87780321	87780693	87780507	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	16905	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	87810498	87810587	87810524	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	12900	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr16	87811524	87811882	87811665	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	13926	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.825615261247473
chr16	87812654	87813065	87812978	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	15056	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.15166439036035
chr16	87823236	87823449	87823367	Y	FBXO31,CA5A	KLHDC4	JPH3,KLHDC4,ZCCHC14,SLC7A5,CA5A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	25638	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr16	87823592	87823837	87823720	Y	NA	KLHDC4	JPH3,KLHDC4,ZCCHC14,SLC7A5,CA5A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	25994	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.413807226403367
chr16	87839693	87840050	87839856	Y	SLC7A5	KLHDC4	SLC7A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLHDC4	42095	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.588401564176696
chr16	87840547	87840941	87840913	Y	SLC7A5	KLHDC4	SLC7A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLHDC4	42949	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.770297845459128
chr16	87870717	87871153	87871035	Y	NA	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	29941	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	87875229	87875683	87875262	Y	CA5A	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	25411	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	87886258	87886670	87886593	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	14424	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.189510083890358
chr16	87888208	87888468	87888297	Y	KLHDC4,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	12626	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.189510083890358
chr16	87889826	87890140	87890011	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	10954	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr16	87901718	87902209	87902044	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,KLHDC4,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	624	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr16	87904170	87904524	87904347	Y	FBXO31	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	3076	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr16	87988913	87989737	87989395	Y	ZCCHC14,BANP,BANP,BANP	BANP	NA	NA	NA	NA	BANP	8063	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	88063556	88063600	88063578	Y	BANP,BANP,BANP	NA	NA	NA	NA	NA	BANP	82706	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	88365536	88366092	88365805	Y	ZNF469	NA	BANP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM1	151633	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr16	88366840	88367234	88367013	Y	BANP,BANP,ZC3H18,CYBA	NA	BANP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM1	150491	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	88450186	88450490	88450462	Y	NA	NA	CA5A,SLC7A5,BANP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM1	67235	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	88520905	88521327	88521137	Y	ZC3H18,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,ZFPM1	ZFPM1	NA	NA	NA	NA	ZFPM1	3180	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr16	88555955	88556054	88556005	Y	NA	ZFPM1	NA	NA	NA	NA	ZFPM1	38230	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	88557943	88558427	88558193	Y	FAM38A,CBFA2T3,ZFPM1	ZFPM1	NA	NA	NA	NA	ZFPM1	40218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr16	88683643	88683946	88683795	Y	NA	ZC3H18,CYBA,MVD	NA	NA	NA	NA	CYBA	31614	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr16	88837093	88837695	88837443	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	11924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr16	88919657	88920044	88919827	Y	SNAI3,RNF166,RNF166,CBFA2T3	APRT,TRAPPC2L,GALNS	NA	NA	NA	NA	TRAPPC2L	584	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	88991704	88992157	88991819	Y	NA	NA	TRAPPC2L,GALNS	MCF7	ChIA-PET	22265404	GALNS	70326	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	89313669	89314138	89313993	Y	ZNF276,ZNF778	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	31551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.324588830732148
chr16	89370103	89370259	89370211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	87985	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr16	89380978	89381130	89380989	Y	ZNF276,ZNF276,SPATA2L,ANKRD11,ZNF778	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	98860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	89392350	89392997	89392648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	110232	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	89406185	89406252	89406205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	124067	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	89410388	89410772	89410415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	128270	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	89468980	89469266	89469225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	85703	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr16	89474257	89474602	89474526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	80367	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr16	89475542	89475927	89475838	Y	CBFA2T3,ACSF3,ZNF778,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,ANKRD11	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	79042	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.955462360669714
chr16	89557852	89558189	89558050	Y	NA	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	2527	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr16	89564919	89565211	89565067	Y	NA	ANKRD11,SPG7	ANKRD11,SPG7	IMR90	Hi-C	24141950	SPG7	9594	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr16	89568763	89569125	89568979	Y	NA	ANKRD11,SPG7	ANKRD11,SPG7,LOC100287036,RPL13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SPG7	13438	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.204425830007387
chr16	89571786	89572109	89572034	Y	ACSF3,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	16461	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.620423503981855
chr16	89573610	89573931	89573734	Y	NA	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	18285	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	89579992	89580270	89580045	Y	ACSF3,ZNF778,DBNDD1,ZNF276,SPG7	ANKRD11,SPG7,RPL13,SNORD68	NA	NA	NA	NA	SPG7	24667	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr16	89683162	89683271	89683207	Y	DPEP1,C16orf55	CPNE7,CHMP1A	NA	NA	NA	NA	CHMP1A	38982	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	89796817	89796910	89796864	Y	NA	SPATA2L,ZNF276	NA	NA	NA	NA	ZNF276	12009	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr16	89893816	89894170	89893993	Y	SPIRE2	FANCA,SPIRE2,TCF25	NA	NA	NA	NA	SPIRE2	11229	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.176210565703473
chr16	89904172	89904600	89904272	Y	MC1R,SPIRE2	FANCA,SPIRE2,TCF25	NA	NA	NA	NA	SPIRE2	21585	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr16	89992380	89992810	89992683	Y	NA	MC1R,AC092143.1,TUBB3,DEF8,CENPBD1,AFG3L1P	NA	NA	NA	NA	TUBB3	6580	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr16	90088262	90088277	90088270	Y	PRDM7	GAS8,DBNDD1	NA	NA	NA	NA	DBNDD1	3726	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr16	90143699	90144065	90143926	Y	C16orf55,SPATA2L,ZNF276,C16orf7,ZNF276,TCF25	NA	LOC100130015,GAS8	MCF7	ChIA-PET	22265404	DBNDD1	59163	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr17	200517	200885	200707	Y	RPH3AL	NA	NA	NA	NA	NA	C17orf97	57233	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	209872	210104	209987	Y	VPS53	C17orf97	NA	NA	NA	NA	C17orf97	48014	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	473610	473838	473725	Y	FAM101B	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	84949	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	505873	506062	505986	Y	VPS53	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	52725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	508147	508415	508281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	50372	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	574639	574965	574941	Y	NA	RPS4XP17,VPS53	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	15852	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	594616	594984	594846	Y	NA	RPS4XP17,VPS53,FAM57A	NA	NA	NA	NA	VPS53	27973	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	597415	597783	597745	Y	NA	RPS4XP17,VPS53,FAM57A	NA	NA	NA	NA	VPS53	25174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	654300	654699	654470	Y	NA	VPS53,FAM57A,DBIL5P,GEMIN4,RNMTL1,GLOD4	NA	NA	NA	NA	DBIL5P	400	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr17	693293	693510	693390	Y	RNMTL1	DBIL5P,GEMIN4,RNMTL1,GLOD4	NA	NA	NA	NA	GLOD4	9712	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	698193	698349	698271	Y	NA	DBIL5P,GEMIN4,RNMTL1,GLOD4	NA	NA	NA	NA	GLOD4	14612	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	990722	991295	990801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM22	92365	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr17	1011015	1011228	1011147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM22	112658	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	1014015	1014933	1014151	Y	PITPNA,CRK,ABR	NA	NA	NA	NA	NA	ABR	115382	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr17	1171565	1171808	1171610	Y	WDR81,PITPNA,ABR,ABR	ABR	NA	NA	NA	NA	ABR	41250	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.660825173653171
chr17	1358484	1358816	1358590	Y	NA	CRK,MYO1C	NA	NA	NA	NA	CRK	5640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	1390195	1390341	1390268	Y	MYO1C,MYO1C,MYO1C	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	3765	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.424724589401876
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.643180086786515
chr17	1466992	1467380	1467296	Y	RILP	INPP5K,PITPNA-AS1,PITPNA	NA	NA	NA	NA	PITPNA	2882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	1521068	1521369	1521308	Y	CRK,WDR81,HIC1,PITPNA,SLC43A2,SCARF1	SLC43A2,RILP	NA	NA	NA	NA	SLC43A2	8811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	1523946	1524301	1524043	Y	NA	SLC43A2,RILP	NA	NA	NA	NA	SLC43A2	5879	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	1585953	1586309	1586247	Y	NA	RILP,TLCD2,WDR81,MIR22HG	NA	NA	NA	NA	PRPF8	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	1620806	1621089	1620895	Y	PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81	PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG,SERPINF1	NA	NA	NA	NA	MIR22HG	2338	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	1241	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.819043466928736
chr17	1970904	1971232	1971070	Y	HIC1	DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	15456	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	1973596	1973991	1973873	Y	NA	DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	18148	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	1979194	1979509	1979218	Y	NA	DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	23746	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	2084621	2084734	2084671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRR	119943	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	2087949	2088276	2088112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRR	116401	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	2291927	2292298	2292113	Y	NA	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	10114	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	2300026	2300553	2300288	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	1859	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.560916449063148
chr17	2302108	2302510	2302261	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	NA	NA	NA	NA	NA	MNT	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.541045136557527
chr17	2305266	2305571	2305415	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	2854	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.289645842560086
chr17	2307434	2307709	2307574	Y	NA	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	5022	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	2610688	2611037	2610862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP2	67313	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	2614073	2614260	2614119	Y	KIAA0664	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP2	64090	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	2626418	2626796	2626607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP2	51554	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	2627139	2627523	2627311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP2	50827	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.95050725062575
chr17	2627618	2628097	2628087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP2	50253	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.283457011870465
chr17	2863545	2863659	2863602	Y	OR3A2,OR1G1	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP2	185195	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208268283576497
chr17	3504662	3504760	3504711	Y	NA	SHPK,CTNS	TRPV3	IMR90	Hi-C	24141950	SHPK	32856	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	3534813	3534835	3534825	Y	OR1A2,OR1A1,OR3A2,OR1E1,OR1E2	SHPK,CTNS,TAX1BP3	TRPV1	IMR90	Hi-C	24141950	SHPK	2781	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	3791085	3791371	3791288	Y	OR1E2,ZZEF1,P2RX1	C17orf85,CAMKK1,P2RX1	NA	NA	NA	NA	CAMKK1	4814	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	3791812	3792145	3792008	Y	GSG2	C17orf85,CAMKK1,P2RX1	NA	NA	NA	NA	CAMKK1	4040	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.795400805384299
chr17	4064613	4064785	4064717	Y	NA	ZZEF1,CYB5D2	NA	NA	NA	NA	CYB5D2	20151	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.730938184077
chr17	4065011	4065373	4065306	Y	NA	ZZEF1,CYB5D2	NA	NA	NA	NA	CYB5D2	20549	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	4125491	4125809	4125534	Y	NA	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	39465	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr17	4205148	4205753	4205440	Y	P2RX1,ATP2A3,ZZEF1,ZMYND15,ZMYND15,SMTNL2,SMTNL2,ARRB2,UBE2G1	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	39874	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	4244674	4245003	4244975	Y	NA	UBE2G1	NA	NA	NA	NA	UBE2G1	22920	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	4437372	4437692	4437444	Y	NA	SPNS2,MYBBP1A	NA	NA	NA	NA	MYBBP1A	19234	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	4669663	4670012	4669759	Y	SPAG7,MINK1,C17orf87,C17orf107,ARRB2,CXCL16,ZMYND15,ZMYND15	MED11,CXCL16,ZMYND15,PSMB6,PLD2	NA	NA	NA	NA	PSMB6	27427	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	4737531	4737755	4737558	Y	PLD2,MINK1	PSMB6,PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	MINK1	2848	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.175324486963695
chr17	4753672	4753828	4753714	Y	UBE2G1,ARRB2,CXCL16,ZMYND15,ZMYND15,MINK1,RNF167,C17orf107	PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	MINK1	18989	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	4812526	4812616	4812571	Y	SMTNL2,ZNF232,KIF1C	RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1	NA	NA	NA	NA	RNF167	28687	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	4839784	4839936	4839857	Y	C17orf107	RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1,SPAG7,CAMTA2	NA	NA	NA	NA	RNF167	1367	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr17	4934963	4935218	4935186	Y	NA	CAMTA2,INCA1,KIF1C	NA	NA	NA	NA	KIF1C	35720	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr17	6082341	6082630	6082487	Y	WSCD1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM64A	263105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	6375097	6375395	6375262	Y	WSCD1,AIPL1	FAM64A	NA	NA	NA	NA	FAM64A	29362	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.175324486963695
chr17	6396224	6396493	6396421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM64A	50489	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	6399359	6399733	6399545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM64A	53624	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	6470839	6471155	6470959	Y	PITPNM3,TXNDC17	PITPNM3	PITPNM3	IMR90	Hi-C	24141950	PITPNM3	13025	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	6541812	6541912	6541862	Y	NA	TXNDC17,KIAA0753,MED31,C17orf100	NA	NA	NA	NA	TXNDC17	166	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	6542489	6542952	6542608	Y	NA	TXNDC17,KIAA0753,MED31,C17orf100	NA	NA	NA	NA	KIAA0753	242	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	6771162	6771276	6771219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC027763.2	142392	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.306943743865492
chr17	6897797	6898308	6898020	Y	NA	AC027763.2,RNASEK,C17orf49,MIR497HG,SLC16A13	NA	NA	NA	NA	AC027763.2	15360	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	6938707	6938851	6938779	Y	NA	AC027763.2,RNASEK,C17orf49,MIR497HG,SLC16A13	NA	NA	NA	NA	SLC16A13	1313	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	7381310	7382154	7381844	Y	KCTD11,TNK1,SOX15,KDM6B,ZBTB4,ZBTB4	TMEM102,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	ZBTB4	3428	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr17	7389589	7389989	7389739	Y	C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A	ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	POLR2A	3904	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr17	7737438	7738736	7737971	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	2486	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.499183168505477
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	608	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.740239319145364
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4115	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.47006439040288
chr17	7745915	7746944	7746139	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4693	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.275616175182834
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	5769	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.12723927444884
chr17	7781804	7782205	7782005	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1	NA	NA	NA	NA	CHD3	3919	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	7790181	7790340	7790322	Y	POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,CNTROB,TRAPPC1	NA	NA	NA	NA	LSMD1	3625	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.267428152933953
chr17	8029074	8029494	8029268	Y	NA	ALOX12B,HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	HES7	3664	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	8029634	8030116	8029995	Y	NA	ALOX12B,HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	HES7	4224	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.47220162484721
chr17	8041932	8042438	8042328	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	15386	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr17	8056609	8057167	8057155	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	657	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	8057335	8058055	8057702	Y	KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59	HES7,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.286916501810459
chr17	8090038	8090540	8090163	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	1024	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.634992064537633
chr17	8090795	8091158	8090849	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	406	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	8103328	8103700	8103595	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1	NA	NA	NA	NA	AURKB	8218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.985796968014435
chr17	8268468	8268891	8268818	Y	SPDYE4,MFSD6L,CCDC42,CNTROB,ODF4	KRBA2,RPL26,NDEL1	NA	NA	NA	NA	KRBA2	9138	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	8824079	8824459	8824269	Y	NDEL1,PIK3R5,PIK3R5	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R6	55085	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	8838354	8838934	8838685	Y	NDEL1,PIK3R5,PIK3R5	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R6	69360	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	9155924	9156306	9156115	Y	PIK3R5	NA	NA	NA	NA	NA	STX8	321602	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr17	9258278	9258564	9258422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX8	219344	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	9549792	9549873	9549833	Y	NA	USP43	NA	NA	NA	NA	USP43	3777	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	9688019	9688182	9688075	Y	NA	DHRS7C,GLP2R	NA	NA	NA	NA	DHRS7C	4432	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.62638620854183
chr17	9720284	9720569	9720567	Y	GAS7	DHRS7C,GLP2R	USP43,GLP2R	IMR90	Hi-C	24141950	GLP2R	2954	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	9731829	9732213	9732092	Y	NA	DHRS7C,GLP2R	NA	NA	NA	NA	GLP2R	8306	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.19806363470945
chr17	9741106	9741641	9741382	Y	NA	DHRS7C,GLP2R	RCVRN,GAS7	IMR90	Hi-C	24141950	GLP2R	17583	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.48424998732954
chr17	9772002	9772101	9772006	Y	NA	GLP2R	NA	NA	NA	NA	GLP2R	48479	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	9797524	9797769	9797647	Y	RCVRN	NA	NA	NA	NA	NA	GLP2R	74001	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr17	9875435	9875567	9875515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLP2R	151912	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	10053386	10053763	10053585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	106316	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	10581804	10582199	10582113	Y	MYH4	SCO1	NA	NA	NA	NA	SCO1	17493	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr17	11266931	11267244	11267127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL15P21	504152	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr17	11928413	11928725	11928507	Y	NA	ZNF18,MAP2K4	NA	NA	NA	NA	MAP2K4	6272	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	14105008	14105251	14105153	Y	COX10,HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	NA	COX10	134195	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	15363919	15364293	15364237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA74	111040	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	15393997	15394379	15394217	Y	PMP22,FAM18B2	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA74	80954	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	15860629	15861165	15860792	Y	ADORA2B,ZSWIM7,TTC19	ADORA2B,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	14398	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr17	15862469	15862773	15862614	Y	ADORA2B,ZSWIM7,TTC19	ADORA2B,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	16238	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	15895023	15895192	15895111	Y	NA	ADORA2B,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	TTC19	5502	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	15923170	15923610	15923287	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	22139	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	15925215	15925448	15925362	Y	ZNF286A,NCOR1	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	24184	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	15925706	15925935	15925791	Y	FAM18B2,PIGL,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	24675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	15959345	15959465	15959410	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	58314	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr17	16189250	16189597	16189494	Y	NCOR1,TRPV2	NA	NA	NA	NA	NA	CENPV	65373	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.630263532228746
chr17	16191035	16191327	16191109	Y	TRPV2	NA	CENPV	IMR90	Hi-C	24141950	CENPV	63643	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	16249780	16250130	16249956	Y	CENPV	CENPV,UBB	NA	NA	NA	NA	CENPV	4840	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr17	16355497	16355695	16355534	Y	TTC19,PIGL	TRPV2,FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	37772	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	16375722	16375971	16375775	Y	TTC19,ZSWIM7,NCOR1,PIGL,ZNF624,ZNF287,CENPV	FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	17496	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	16438910	16439232	16439111	Y	NA	FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	45443	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.997983373381838
chr17	16796690	16796969	16796791	Y	CCDC144A,COPS3	NA	NA	NA	NA	NA	MPRIP	146890	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	16893867	16894139	16894047	Y	NA	MPRIP	MPRIP,FLCN	IMR90	Hi-C	24141950	MPRIP	49720	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	16924574	16924970	16924629	Y	NA	MPRIP	FLCN,MPRIP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MPRIP	18889	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328048320672142
chr17	17163211	17163219	17163215	Y	NA	FLCN,COPS3,NT5M	NA	NA	NA	NA	COPS3	19388	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	17348587	17348892	17348689	Y	NA	MED9,RASD1	MED9,PEMT	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MED9	29408	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	17397062	17397447	17397255	Y	NA	MED9,RASD1	NA	NA	NA	NA	RASD1	262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	17439265	17439511	17439439	Y	NA	RASD1	NA	NA	NA	NA	RASD1	41556	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	17484274	17484547	17484424	Y	NA	PEMT	NA	NA	NA	NA	PEMT	8475	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	17493657	17493822	17493814	Y	RASD1,SREBF1,PEMT,PEMT	PEMT	NA	NA	NA	NA	PEMT	635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	17597479	17598220	17598134	Y	ALKBH5,FLCN,COPS3	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	14692	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.52140085813161
chr17	17628792	17629315	17629145	Y	NA	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	46005	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	17641556	17641857	17641643	Y	MYO15A	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	58769	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	17644687	17645051	17644950	Y	TOM1L2,LRRC48,LLGL1	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	61900	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.665936669591175
chr17	17725605	17725781	17725666	Y	NA	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	12544	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	17743258	17743857	17743527	Y	SMCR8	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	4933	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.53287500571217
chr17	17817256	17817562	17817444	Y	SREBF1	NA	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	56174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	17838975	17839310	17839078	Y	SMCR8	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	34426	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	17847220	17847305	17847263	Y	NA	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	26431	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	17861466	17861608	17861562	Y	SMCR8	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	12128	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr17	17862888	17863023	17862956	Y	NA	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	10713	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	18153652	18153819	18153756	Y	NA	LLGL1,FLII	NA	NA	NA	NA	FLII	6411	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr17	18242712	18242812	18242762	Y	FBXW10,SHMT1	TOP3A,SMCR8,SHMT1,EVPLL	NA	NA	NA	NA	SHMT1	22044	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	18820621	18820763	18820720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPSAP2	79223	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	19141562	19141875	19141665	Y	RNF112,EPN2	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD3D	127613	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr17	19273192	19273452	19273316	Y	FAM83G,MAPK7,MAPK7	MAPK7,B9D1	NA	NA	NA	NA	MAPK7	5582	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	19398359	19398685	19398615	Y	NA	SLC47A1	SLC47A2,B9D1,EPN2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC47A1	1661	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	19411188	19411542	19411351	Y	NA	SLC47A1	EPN2,SLC47A2,B9D1,ALDH3A2,ALDH3A1,ULK2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC47A1	14490	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr17	19656390	19656618	19656531	Y	MAPK7,MAPK7	ALDH3A1	NA	NA	NA	NA	ALDH3A1	6134	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.805205055563324
chr17	19834604	19834673	19834639	Y	NA	AKAP10	NA	NA	NA	NA	AKAP10	44983	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	19913206	19913926	19913276	Y	ULK2,AKAP10	AKAP10,SPECC1	NA	NA	NA	NA	SPECC1	2549	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr17	20012372	20012672	20012482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPECC1	101715	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	20057823	20057990	20057893	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPECC1	147166	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	20204150	20204477	20204216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS3P2	285894	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	20688064	20688832	20688343	Y	NA	OLA1P2,SCDP1	NA	NA	NA	NA	SCDP1	2106	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.501529545625988
chr17	20690369	20690534	20690439	Y	NA	OLA1P2,SCDP1	NA	NA	NA	NA	SCDP1	4411	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	20943914	20944165	20944106	Y	NA	USP22	NA	NA	NA	NA	USP22	908	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr17	21002403	21002809	21002523	Y	KCNJ18	DHRS7B	USP22,C17orf103	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DHRS7B	21868	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.243941420938926
chr17	21179100	21179414	21179208	Y	CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP2K3	6570	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.793330509294743
chr17	21188812	21189500	21189174	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	2828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	21189600	21190105	21189864	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	3616	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.465856408263559
chr17	21272298	21272502	21272399	Y	KCNJ18	KCNJ12	C17orf51,KCNJ12	IMR90	Hi-C	24141950	KCNJ12	5007	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	21314266	21314623	21314560	Y	NA	KCNJ12	NA	NA	NA	NA	KCNJ12	36757	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.33921106075932
chr17	21908682	21908761	21908685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C17orf51	432960	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	25409900	25410125	25410078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208977	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.260700429065805
chr17	25410571	25410806	25410743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208296	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr17	25416172	25416581	25416426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	202521	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr17	25620233	25620423	25620280	Y	NA	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	1131	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr17	25659360	25659787	25659571	Y	LGALS9,WSB1	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40258	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	25659975	25660361	25659997	Y	NA	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40873	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.234484356321151
chr17	25676124	25676302	25676192	Y	LGALS9,WSB1	NA	KSR1	IMR90	Hi-C	24141950	WSB1	57022	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	25680204	25680481	25680340	Y	LGALS9,WSB1	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61102	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.06661819876059
chr17	25707009	25707412	25707348	Y	NA	NA	KSR1	IMR90	Hi-C	24141950	KSR1	74258	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr17	25793795	25793989	25793936	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	12125	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	25794670	25794745	25794710	Y	NA	KSR1	TBC1D3P5,KSR1	IMR90	Hi-C	24141950	KSR1	13000	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	25805507	25805777	25805623	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	23837	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	25816130	25816488	25816250	Y	WSB1,LGALS9	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	34460	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	25821729	25821988	25821800	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	40059	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr17	25981784	25982180	25981982	Y	NA	LGALS9	NA	NA	NA	NA	LGALS9	26960	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	26216019	26216352	26216295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLK	150411	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	26307415	26307616	26307516	Y	TNFAIP1	NA	C17orf108	IMR90	Hi-C	24141950	NLK	59147	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	26368091	26368384	26368254	Y	NA	NLK	NA	NA	NA	NA	NLK	1328	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	26458610	26458889	26458687	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLK	91847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	26718724	26718918	26718801	Y	FOXN1,C17orf63,SEBOX,SARM1	POLDIP2,TMEM199,SARM1,CTB-96E2.2,VTN,SLC46A1	NA	NA	NA	NA	SLC46A1	13297	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	26734916	26735044	26734980	Y	NA	SARM1,CTB-96E2.2,VTN,SLC46A1	NA	NA	NA	NA	SLC46A1	2701	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	26929593	26929935	26929764	Y	TIAF1,PHF12,FLOT2,UNC119	PIGS,ALDOC,SPAG5-AS1,SPAG5,KIAA0100	NA	NA	NA	NA	SPAG5	5296	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	27072804	27073286	27072989	Y	TRAF4	PROCA1,RAB34,RPL23A,SNORD42B,SNORD42A,SNORD4B,NEK8,TLCD1,TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	3802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr17	27104790	27105049	27104918	Y	SEBOX	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	35788	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	27116093	27116114	27116106	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	47091	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.263429769815432
chr17	27118575	27118718	27118697	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	49573	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	27129097	27129445	27129306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERAL1	50511	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	27138672	27138846	27138777	Y	NA	ERAL1	NA	NA	NA	NA	ERAL1	41110	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	27220048	27220212	27220121	Y	NA	ERAL1,FLOT2,DHRS13	NA	NA	NA	NA	FLOT2	2485	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	27273335	27273648	27273499	Y	PHF12	DHRS13,PHF12	NA	NA	NA	NA	PHF12	3141	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	27429797	27430178	27430111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO18A	75252	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	27466057	27466305	27466181	Y	NA	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	39125	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	27475765	27476166	27476073	Y	NEK8,PHF12	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	29264	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr17	27482450	27482602	27482543	Y	NA	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	22828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.632992872978373
chr17	27506307	27506816	27506504	Y	TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	877	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.18149588259441
chr17	27530741	27530989	27530946	Y	NA	MYO18A	MYO18A,TAOK1,NUFIP2	IMR90	Hi-C	24141950	MYO18A	25311	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr17	27619094	27619880	27619581	Y	TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr17	27814311	27814661	27814484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I13	76409	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	27824938	27824945	27824941	Y	TIAF1,MYO18A,TAOK1,EFCAB5,ANKRD13B	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I13	66125	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	27890961	27891203	27891032	Y	SSH2,ABHD15	ABHD15,ANKRD13B,GIT1	NA	NA	NA	NA	TP53I13	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr17	27918115	27918172	27918144	Y	GIT1,ANKRD13B	TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	GIT1	900	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.339504576849177
chr17	27918652	27918967	27918817	Y	GIT1,EFCAB5,ANKRD13B	TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	GIT1	105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.296373566428234
chr17	27919265	27919579	27919303	Y	NA	TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	GIT1	193	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.557960074233816
chr17	27966112	27966641	27966332	Y	NA	GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	CORO6	18187	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr17	28037853	28038223	28038205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	89928	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr17	28070496	28070746	28070685	Y	SSH2,EFCAB5	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	122571	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	28210608	28210734	28210655	Y	NA	SSH2	NA	NA	NA	NA	SSH2	44560	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	28258246	28258478	28258304	Y	NA	SSH2	NA	NA	NA	NA	SSH2	2952	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr17	28672650	28672985	28672901	Y	NSRP1,CPD,CPD	CPD	NSRP1,TMIGD1,GOSR1,CPD,EFCAB5,MIR3184,SLC6A4,BLMH	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CPD	30938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	28928053	28928382	28928251	Y	NA	KRT17P3,SMURF2P1	NA	NA	NA	NA	SMURF2P1	2239	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	29210096	29210162	29210129	Y	NA	TEFM	NA	NA	NA	NA	TEFM	21676	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	29212303	29212381	29212342	Y	OMG,NF1,C17orf42	TEFM	NA	NA	NA	NA	TEFM	19457	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	29423002	29423667	29423241	Y	NA	NF1	NA	NA	NA	NA	NF1	3057	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	29596751	29597032	29596911	Y	NA	EVI2B,EVI2A	NA	NA	NA	NA	EVI2B	42098	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	29876692	29877391	29877039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	160050	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.802475714813698
chr17	29892134	29892258	29892202	Y	EVI2A	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	175492	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	30724674	30725107	30724769	Y	RHOT1	C17orf75,ZNF207,PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	44172	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	30726822	30727202	30727012	Y	NA	PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	42077	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	30778136	30778420	30778202	Y	ZNF207	PSMD11,CDK5R1	NA	NA	NA	NA	PSMD11	8857	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	32365538	32365912	32365713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCL2	214392	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr17	32579434	32580053	32579676	Y	CCL8,CCL7	CCL2	NA	NA	NA	NA	CCL2	251	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	32936342	32936566	32936435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF830	349983	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	33300552	33300861	33300820	Y	NA	ZNF830,LIG3,CCT6B	NA	NA	NA	NA	LIG3	4652	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr17	33349623	33350064	33349994	Y	SLFN5,SLFN12L,CCT6B,ZNF830,RFFL	LIG3,CCT6B	NA	NA	NA	NA	CCT6B	43526	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	33414530	33415581	33415167	Y	SLFN5,ZNF830,RFFL	RFFL,RAD51D	NA	NA	NA	NA	RFFL	192	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	33572314	33572864	33572356	Y	NA	SLFN5	NA	NA	NA	NA	SLFN5	4259	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.189510083890358
chr17	33577736	33577912	33577824	Y	ZNF830,RFFL,SLFN5	SLFN5	NA	NA	NA	NA	SLFN5	9681	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	33786708	33787098	33786905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLFN11	87988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	33787408	33787803	33787736	Y	ZNF830,SLFN5,CCL5,SLFN12L	NA	NA	NA	NA	NA	SLFN11	88688	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr17	33867743	33868178	33867841	Y	RFFL,SLFN5,SLFN11,CCL5,CCL23	AP2B1,PEX12	NA	NA	NA	NA	AP2B1	34887	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	33923571	33923796	33923685	Y	NA	AP2B1,PEX12	NA	NA	NA	NA	PEX12	19689	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	34045470	34045815	34045642	Y	NA	NA	RASL10B	IMR90	Hi-C	24141950	MMP28	74896	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	34445033	34445052	34445044	Y	LYZL6	CCL3	NA	NA	NA	NA	CCL3	29518	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	34871446	34871455	34871448	Y	NA	ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2	NA	NA	NA	NA	PIGW	17392	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr17	34875469	34875747	34875679	Y	NA	ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2	NA	NA	NA	NA	PIGW	13100	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr17	34948982	34949076	34949029	Y	DHRS11	DHRS11,MRM1	NA	NA	NA	NA	DHRS11	2754	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr17	35208602	35208822	35208707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	95353	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	35446954	35447324	35447190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	142779	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	35519679	35519723	35519693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	215504	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr17	35520107	35520138	35520123	Y	ACACA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	215932	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr17	35608489	35608691	35608590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACACA	156218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	35682301	35682446	35682421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACACA	82463	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	35741498	35741507	35741502	Y	NA	ACACA,TADA2A	NA	NA	NA	NA	ACACA	23402	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	36412216	36412471	36412263	Y	NA	RP11-1407O15.2,MRPL45	NA	NA	NA	NA	RP11-1407O15.2	7387	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.952470207772517
chr17	36480536	36480738	36480637	Y	NA	MRPL45,SOCS7	NA	NA	NA	NA	SOCS7	25373	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr17	36571646	36572076	36571709	Y	C17orf96	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	10586	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.717135550779453
chr17	36585417	36585600	36585486	Y	ARHGAP23	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	2755	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr17	36610879	36611283	36611138	Y	NA	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	28217	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr17	36859229	36859333	36859332	Y	NA	C17orf96,MLLT6,CISD3,PCGF2,PSMB3	NA	NA	NA	NA	MLLT6	462	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	36859613	36860666	36860145	Y	NA	C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3	NA	NA	NA	NA	MLLT6	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.17515112235538
chr17	36907984	36908100	36908042	Y	NA	MLLT6,CISD3,PCGF2,PSMB3,PIP4K2B	NA	NA	NA	NA	PSMB3	995	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	37010933	37011093	37011014	Y	FBXO47,C17orf98	CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1	NA	NA	NA	NA	RPS20P35	1366	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr17	37024501	37024874	37024707	Y	NA	CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1	NA	NA	NA	NA	LASP1	389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr17	37027781	37027987	37027914	Y	FBXO47,CWC25	CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1	NA	NA	NA	NA	LASP1	3669	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.252129443187807
chr17	37366071	37366159	37366135	Y	STAC2	CACNB1,RPL19	NA	NA	NA	NA	RPL19	11535	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.3094997200068
chr17	37558786	37559227	37559071	Y	NA	FBXL20,MED1	NA	NA	NA	NA	FBXL20	2010	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.170751884204219
chr17	37661852	37662117	37661985	Y	STAC2,FBXL20,MED1,CDK12	CDK12	NA	NA	NA	NA	CDK12	46088	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	37896808	37897181	37897022	Y	GRB7,GRB7,GRB7,GRB7	PGAP3,MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	4628	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr17	37910411	37911394	37910787	Y	FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	18231	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.240326001449521
chr17	38225703	38226086	38225816	Y	PPP1R1B,TCAP,THRA,THRA,NR1D1	THRA,MED24,NR1D1	NA	NA	NA	NA	MED24	10235	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	38226807	38227182	38226872	Y	NA	THRA,MED24,NR1D1,MSL1	NA	NA	NA	NA	MED24	11339	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	38227405	38227627	38227516	Y	GSDMB	THRA,MED24,NR1D1,MSL1	NA	NA	NA	NA	MED24	11937	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.285073239800609
chr17	38227745	38227903	38227871	Y	NEUROD2,THRA	THRA,MED24,NR1D1,MSL1	NA	NA	NA	NA	MED24	12277	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.418152795083139
chr17	38229285	38229466	38229392	Y	GSDMB	THRA,MED24,NR1D1,MSL1	NA	NA	NA	NA	MED24	13817	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.284187161060831
chr17	38254249	38254664	38254597	Y	GRB7,WIPF2,RARA,RARA,NR1D1	THRA,MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	314	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr17	38263980	38264229	38263993	Y	RARA,RARA,MSL1	MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	9002	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	38463315	38463694	38463488	Y	RARA	CDC6	NA	NA	NA	NA	RARA	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	38467869	38468243	38468028	Y	NA	CDC6,RARA,GJD3	NA	NA	NA	NA	RARA	4425	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	38468655	38468865	38468706	Y	IKZF3,CCR7	CDC6,RARA,GJD3	NA	NA	NA	NA	RARA	5211	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	38470934	38471197	38471090	Y	IKZF3,WIPF2,RARA,RARA	CDC6,RARA,GJD3	NA	NA	NA	NA	RARA	7490	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	38514847	38514935	38514891	Y	NA	GJD3	NA	NA	NA	NA	GJD3	3132	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	38646848	38646954	38646881	Y	KRT222,THRA,RAPGEFL1	IGFBP4,TNS4	NA	NA	NA	NA	TNS4	8895	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr17	38648531	38648872	38648707	Y	KRT10,MSL1,TNS4	TNS4	NA	NA	NA	NA	TNS4	6977	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr17	38655848	38656036	38655907	Y	GJD3,IGFBP4,TNS4	NA	NA	NA	NA	NA	TNS4	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.956468590891039
chr17	38656717	38656888	38656754	Y	KRT24,KRT10,TNS4	TNS4	NA	NA	NA	NA	TNS4	868	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	38666550	38666883	38666717	Y	TNS4	TNS4	CDC6,TOP2A,IGFBP4,TNS4,CCR7,KRT42P	IMR90	Hi-C	24141950	TNS4	10701	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	38674878	38675250	38674921	Y	TMEM99,TMEM99,TMEM99,CDC6,TOP2A,TNS4	TNS4,CCR7	IGFBP4,KRT42P,CCR7,RARA,GJD3,TOP2A,TNS4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS4	19029	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr17	38677736	38678132	38678052	Y	KRT24,TNS4	TNS4,CCR7	IGFBP4,KRT42P,CCR7,TOP2A,TNS4,RAPGEFL1,WIPF2,CDC6,RARA,GJD3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS4	21887	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	38689625	38689996	38689764	Y	NA	TNS4,CCR7	NA	NA	NA	NA	CCR7	29728	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	38705273	38706158	38705806	Y	GJD3,IGFBP4	TNS4,CCR7	NA	NA	NA	NA	CCR7	13566	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.368832953972574
chr17	38707495	38707811	38707586	Y	KRTAP1-5,GJD3,IGFBP4	CCR7	NA	NA	NA	NA	CCR7	11913	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	39003172	39003257	39003186	Y	KRTAP2-1,KRT10	TMEM99,KRT10,KRT20	NA	NA	NA	NA	KRT10	26325	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.67737549070931
chr17	39010500	39010808	39010654	Y	NA	TMEM99,KRT10,KRT20	NA	NA	NA	NA	KRT20	28671	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr17	39536188	39536609	39536415	Y	NA	KRT34	NA	NA	NA	NA	KRT34	46	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	39653134	39653351	39653234	Y	NA	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT13	6606	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.221184838134266
chr17	39667444	39667684	39667594	Y	NA	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT13	7487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr17	39682585	39682843	39682821	Y	JUP,KRTAP4-11,KRT19	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	25	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	39683248	39683750	39683386	Y	NA	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	688	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	39685394	39685532	39685463	Y	KRTAP2-1,KRTAP2-2,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	2834	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	39686458	39686891	39686666	Y	KRT19	KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	3898	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.396509325097961
chr17	39703962	39704520	39704217	Y	NA	KRT13,KRT15,KRT19,KRT14	NA	NA	NA	NA	KRT19	21402	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr17	39782029	39782271	39782148	Y	JUP,KRT36,KRT13,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17	KRT14,KRT16,KRT17	NA	NA	NA	NA	KRT17	2935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.212996815885384
chr17	39802138	39802335	39802276	Y	NKIRAS2,NKIRAS2,DHX58,EIF1	KRT16,KRT17,EIF1	KRT19,KRT15	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT17	23044	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr17	39807728	39808143	39807934	Y	JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17	KRT16,KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT17	28634	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.12901052397834
chr17	39810156	39810822	39810530	Y	JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17	KRT16,KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KRT17	31062	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.643910235976881
chr17	39811785	39812247	39811996	Y	JUP,KRT37,KRT15,KRT19,KRT14,KRT16,KRT17	KRT16,KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	30890	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr17	39822130	39822941	39822323	Y	NA	KRT17,EIF1,GAST	KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	20196	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.265428961374692
chr17	39823354	39823685	39823437	Y	NA	KRT17,EIF1,GAST	KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	19452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	39949116	39949497	39949168	Y	KRT14,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	7933	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.73478063764611
chr17	39949517	39949745	39949566	Y	KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	8334	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.10011832361083
chr17	39956975	39957353	39957171	Y	KRT15,KRT19,KRT14,KRT16,KRT17,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	LEPREL4	9503	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr17	40163251	40163440	40163343	Y	NA	CNP,NKIRAS2,DNAJC7	NA	NA	NA	NA	NKIRAS2	1851	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	40201052	40201290	40201078	Y	CNP	NKIRAS2,DNAJC7	HSPB9,KAT2A	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJC7	29658	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	40418689	40419364	40419075	Y	EZH1,KLHL11,DNAJC7,NKIRAS2,DNAJC7,DHX58,RAB5C,STAT3,STAT3,STAT5B,STAT5A	STAT5B,STAT5A	GHDC,HCRT,KCNH4,RAB5C	IMR90	Hi-C	24141950	STAT5B	7361	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	40438296	40438586	40438441	Y	STAT5A	STAT5B,STAT5A	NA	NA	NA	NA	STAT5A	731	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	40539110	40539537	40539349	Y	NA	STAT3,PTRF	NA	NA	NA	NA	STAT3	524	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr17	40573451	40573881	40573544	Y	AOC3,GHDC,PLEKHH3,NAGLU,PTRF	STAT3,ATP6V0A1	NA	NA	NA	NA	PTRF	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr17	40670495	40670831	40670653	Y	WNK4,RAB5C,PTRF	AC067852.1,NAGLU,COASY,MLX	NA	NA	NA	NA	AC067852.1	905	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	40671173	40671319	40671240	Y	PTRF	AC067852.1,NAGLU,COASY,MLX	NA	NA	NA	NA	AC067852.1	417	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	40689876	40689925	40689901	Y	NA	AC067852.1,NAGLU,COASY,MLX,PSMC3IP	NA	NA	NA	NA	NAGLU	3686	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	40816292	40816343	40816318	Y	NA	TUBG2,PLEKHH3,CNTNAP1	NA	NA	NA	NA	TUBG2	6969	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	40942176	40942529	40942199	Y	NA	EZH1,VPS25,PSME3,BECN1	NA	NA	NA	NA	VPS25	18722	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	41173099	41173334	41173293	Y	NAGLU,VAT1	RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1	NA	NA	NA	NA	VAT1	1806	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	41233585	41233852	41233719	Y	BRCA1	BRCA1,NBR2	NA	NA	NA	NA	BRCA1	41648	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	41324260	41324525	41324381	Y	TMEM106A	BRCA1,NBR2,NBR1	NA	NA	NA	NA	NBR1	3762	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	41410079	41410140	41410127	Y	NA	NA	IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARL4D	64187	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	41421158	41421352	41421255	Y	NA	NA	NBR1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4D	52975	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	41441650	41441788	41441734	Y	NA	ARL4D	NA	NA	NA	NA	ARL4D	32539	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	41500242	41500532	41500387	Y	NA	ARL4D	NA	NA	NA	NA	ARL4D	25915	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	41685770	41686110	41685943	Y	TMEM106A,DHX8,DUSP3	ETV4	DHX8,MEOX1,SOST	IMR90	Hi-C	24141950	ETV4	30782	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	41686923	41687254	41687162	Y	NA	ETV4	DHX8,MEOX1,SOST	IMR90	Hi-C	24141950	ETV4	31935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	41796772	41797488	41797204	Y	TMUB2,TMEM106A,DHX8,DUSP3	SOST	LOC100130581,MPP3,DUSP3,DHX8,ETV4,MEOX1,C17orf105,SOST,CD300LG,HDAC5	IMR90	Hi-C	24141950	SOST	36668	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104864290978615
chr17	41827198	41827473	41827372	Y	NA	SOST,DUSP3	NA	NA	NA	NA	SOST	6683	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	42101631	42102033	42102001	Y	C17orf105,CD300LG,LSM12	PYY,TMEM101,LSM12,G6PC3	NA	NA	NA	NA	TMEM101	2317	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr17	42173050	42173151	42173101	Y	TMEM101,G6PC3	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25919	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.185667630321248
chr17	42173326	42173627	42173470	Y	NA	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25443	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.394666063088112
chr17	42174643	42174888	42174769	Y	NA	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	24182	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	42215472	42215904	42215679	Y	C17orf53	HDAC5,C17orf53,TMUB2	C17orf53	MCF7	ChIA-PET	22265404	C17orf53	1370	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.216456305825379
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.21155440890818
chr17	42357085	42357361	42357237	Y	TMUB2,TMUB2,GPATCH8,GRN	SLC25A39	SLC4A1,RUNDC3A,UBTF,SLC25A39	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A39	42877	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	42404001	42404290	42404282	Y	C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39	SLC25A39,GRN,FAM171A2	NA	NA	NA	NA	SLC25A39	3763	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.928253326587123
chr17	42619291	42619496	42619449	Y	NA	GPATCH8,FZD2	GPATCH8,FZD2,C17orf104,CCDC43,DBF4B,ITGA2B	IMR90	Hi-C	24141950	FZD2	13429	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	42620579	42620851	42620665	Y	GJC1,FZD2	GPATCH8,FZD2	GPATCH8,FZD2,C17orf104,CCDC43,DBF4B,ITGA2B	IMR90	Hi-C	24141950	FZD2	12074	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr17	42620927	42621257	42621090	Y	FZD2	GPATCH8,FZD2	GPATCH8,FZD2,ITGA2B,DBF4B,C17orf104,CCDC43	IMR90	Hi-C	24141950	FZD2	11668	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	42624253	42624886	42624582	Y	TMUB2,TMUB2,GRN	GPATCH8,FZD2	GPATCH8,FZD2,ITGA2B,DBF4B,C17orf104,CCDC43	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FZD2	8039	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr17	42634020	42634172	42634095	Y	TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2	FZD2	NA	NA	NA	NA	FZD2	1095	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr17	42706147	42706421	42706320	Y	NA	NA	GPATCH8,C17orf104,RUNDC3A,CCDC43,DBF4B,ITGA2B,FZD2	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC43	58726	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr17	42797981	42798248	42798116	Y	CCDC43	CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-1072C15.1	2016	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.507527120303767
chr17	42872286	42872458	42872432	Y	FMNL1,GRN	GJC1	NA	NA	NA	NA	GJC1	33726	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr17	43018379	43018606	43018493	Y	NA	CCDC103,EFTUD2,FAM187A,GFAP,KIF18B,C1QL1	NA	NA	NA	NA	KIF18B	4476	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr17	43200086	43200194	43200154	Y	NA	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2	NA	NA	NA	NA	ACBD4	7773	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.717482736340705
chr17	43201428	43201633	43201517	Y	NA	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2	NA	NA	NA	NA	ACBD4	6334	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.301832247927488
chr17	43249989	43250354	43250021	Y	ADAM11,HIGD1B,GFAP,DCAKD	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2,FMNL1	NA	NA	NA	NA	HEXIM2	13922	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.670665201900062
chr17	43253543	43253622	43253574	Y	NA	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2,FMNL1	NA	NA	NA	NA	HEXIM2	17476	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.22700904820373
chr17	43301681	43302194	43301892	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	4870	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	43302645	43302970	43302880	Y	NA	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	5834	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.640450746036888
chr17	43303050	43303852	43303644	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	6239	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.399238665847589
chr17	43304336	43305039	43304628	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	7525	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.24940010243818
chr17	43305165	43306978	43306453	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	8354	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.85044259648631
chr17	43309202	43309383	43309263	Y	MAP3K14,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	12391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr17	43385085	43385291	43385153	Y	HEXIM1,FMNL1,PLEKHM1,MAP3K14,ARHGAP27	MAP3K14	LOC100133991,FMNL1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K14	7123	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	43398309	43398621	43398414	Y	NA	MAP3K14	LOC100133991,FMNL1,MAP3K14,TEX34,ARHGAP27	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K14	5895	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	43449108	43449433	43449167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K14	56694	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.244671570129293
chr17	43660811	43661173	43660906	Y	ACBD4,FMNL1,PLEKHM1	RPS26P8	NA	NA	NA	NA	RPS26P8	22736	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	43951029	43951274	43951198	Y	NA	MAPT	NA	NA	NA	NA	MAPT	18474	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	44113965	44114105	44114069	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	144217	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	44131950	44132178	44132002	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	162202	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	44155479	44155559	44155517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	185731	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	44213270	44213366	44213318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	243522	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	44232468	44232502	44232485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	262720	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	44240473	44240874	44240856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	270725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr17	44261899	44262225	44262045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	292151	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	44341762	44341942	44341850	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	MAPT,KANSL1,KANSL1-AS1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAPT	372014	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	44342171	44342447	44342244	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	MAPT,KANSL1,KANSL1-AS1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAPT	372423	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MAPT	374423	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.738587313147354
chr17	44848199	44848613	44848371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	50666	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.09707712376238
chr17	44849895	44850213	44850158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	52362	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	45021726	45021957	45021796	Y	NA	GOSR2	NA	NA	NA	NA	GOSR2	23243	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	45144155	45144236	45144196	Y	NA	NA	NPEPPS	IMR90	Hi-C	24141950	CDC27	120552	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	45317390	45317724	45317566	Y	TBKBP1	NA	NA	NA	NA	NA	CDC27	52602	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	45515544	45515843	45515768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	82465	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	45609469	45609601	45609554	Y	NA	NPEPPS	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	11161	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.341347838859027
chr17	45725037	45725352	45725118	Y	SP2	KPNB1	NA	NA	NA	NA	KPNB1	195	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	45980057	45980402	45980230	Y	NA	SP6,SP2,AC003665.1,PNPO	NA	NA	NA	NA	SP2	8541	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr17	45983662	45984115	45983847	Y	CDK5RAP3	SP2,AC003665.1,PNPO,PRR15L	PNPO	IMR90	Hi-C	24141950	SP2	12146	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	46101351	46101579	46101379	Y	NA	COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	11813	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	46102426	46102830	46102617	Y	NA	COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	10562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.799902303613481
chr17	46168455	46168716	46168586	Y	NA	NFE2L1,CBX1,SNX11	NA	NA	NA	NA	CBX1	8167	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	46226881	46226967	46226912	Y	TBX21,OSBPL7,LRRC46,SKAP1	CBX1,SNX11	SNX11	IMR90	Hi-C	24141950	SNX11	48162	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	46289129	46289412	46289274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX11	110410	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.313288504104523
chr17	46510529	46510724	46510608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HOXB2	110717	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	46662223	46662405	46662377	Y	NA	HOXB2,HOXB4,HOXB5,HOXB6,HOXB8,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB4	6750	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	46664992	46665342	46665097	Y	NA	HOXB2,HOXB4,HOXB5,HOXB6,HOXB8,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB5	3981	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	46680378	46680812	46680678	Y	NA	HOXB4,HOXB5,HOXB6,HOXB8,HOXB7,RP11-357H14.17	NA	NA	NA	NA	HOXB6	24	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr17	47017432	47017466	47017449	Y	NA	ATP5G1,UBE2Z,SNF8,RNU1-42P	NA	NA	NA	NA	SNF8	3013	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	47081081	47081234	47081133	Y	NA	IGF2BP1	NA	NA	NA	NA	IGF2BP1	8307	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	47081384	47081547	47081466	Y	NA	IGF2BP1	NA	NA	NA	NA	IGF2BP1	8610	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	47099859	47100181	47099940	Y	PRAC,IGF2BP1	IGF2BP1	NA	NA	NA	NA	IGF2BP1	27085	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	PHOSPHO1	NA	NA	NA	NA	PHOSPHO1	35619	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.05749042830054
chr17	47337469	47337918	47337568	Y	CALCOCO2,UBE2Z	PHOSPHO1	NA	NA	NA	NA	PHOSPHO1	31341	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	47425065	47425127	47425096	Y	MYST2,ZNF652,ZNF652	ZNF652	NA	NA	NA	NA	ZNF652	12708	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	47467973	47468124	47468044	Y	ABI3,PHOSPHO1,ZNF652,ZNF652,SPOP,MYST2,FAM117A	ZNF652,PHB,AC004797.1	NA	NA	NA	NA	PHB	22122	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.641336824776664
chr17	47468290	47468719	47468487	Y	ZNF652,ZNF652	ZNF652,PHB,AC004797.1	NA	NA	NA	NA	PHB	21527	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr17	47586040	47586243	47586212	Y	NA	NGFR	NA	NA	NA	NA	NGFR	15385	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.124891533033648
chr17	47647130	47647802	47647650	Y	NA	NXPH3	ZNF652,NGFR,SPOP,SLC35B1,NXPH3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NXPH3	3418	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.229755824012263
chr17	48105016	48105270	48105136	Y	XYLT2,LRRC59,ITGA3	DLX3,ITGA3	LOC284080,ITGA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	ITGA3	26062	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.194968765389612
chr17	48139711	48140314	48140012	Y	XYLT2,LRRC59,EPN3,ITGA3	ITGA3,PDK2	NA	NA	NA	NA	ITGA3	8379	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166753501085698
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	PPP1R9B,SGCA,COL1A1	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.357376697795539
chr17	48255388	48256117	48255676	Y	NA	PPP1R9B,SGCA,COL1A1	NA	NA	NA	NA	SGCA	15813	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr17	48367346	48367814	48367643	Y	PPP1R9B	TMEM92	NA	NA	NA	NA	TMEM92	20579	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.1791495054739
chr17	48504874	48504976	48504927	Y	NA	LRRC59,ACSF2,RSAD1	NA	NA	NA	NA	ACSF2	3355	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr17	48716257	48716537	48716480	Y	NA	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	6119	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	48716691	48717083	48716761	Y	CHAD,SPAG9	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	6553	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	48726648	48726741	48726695	Y	NA	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	16510	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr17	48870441	48870661	48870502	Y	NA	NA	TOB1,LINC00483,LOC400604,CACNA1G,SPAG9,WFIKKN2,ANKRD40	IMR90	Hi-C	24141950	TOB1	72678	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	48908408	48908498	48908454	Y	NA	TOB1	TOB1,LOC400604,SPAG9,LINC00483	IMR90	Hi-C	24141950	TOB1	34841	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	48942663	48943085	48943016	Y	NA	TOB1	NA	NA	NA	NA	TOB1	254	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.533587263499012
chr17	48996377	48996488	48996474	Y	RSAD1	RP11-700H6.1	LOC400604,TOB1,WFIKKN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-700H6.1	23586	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	48996944	48997365	48997235	Y	UTP18,RSAD1,TOB1	RP11-700H6.1	LOC400604,TOB1,WFIKKN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-700H6.1	22709	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr17	48998350	48998465	48998408	Y	CHAD	RP11-700H6.1	LOC400604,TOB1,WFIKKN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-700H6.1	21609	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	49008376	49008926	49008868	Y	NA	RP11-700H6.1	WFIKKN2,TOB1,LOC400604,LINC00483,ANKRD40,SPAG9	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-700H6.1	11148	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.218455497384639
chr17	49027288	49027482	49027366	Y	NA	RP11-700H6.1	NA	NA	NA	NA	RP11-700H6.1	7214	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.411808034844107
chr17	49028088	49028439	49028211	Y	NA	RP11-700H6.1	NA	NA	NA	NA	RP11-700H6.1	8014	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.290914884928979
chr17	49031638	49031879	49031784	Y	NA	RP11-700H6.1	NA	NA	NA	NA	RP11-700H6.1	11564	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	49182545	49182921	49182907	Y	NA	SPAG9,NME1,NME1-NME2,NME2	NA	NA	NA	NA	SPAG9	13305	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	53006732	53007120	53006925	Y	NA	TOM1L1,STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	TOM1L1	31984	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	53017345	53017570	53017451	Y	TOM1L1	TOM1L1,STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	STXBP4	26518	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.149108414219042
chr17	53034991	53035170	53035032	Y	NA	STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	STXBP4	8918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr17	53315618	53315983	53315841	Y	HLF	HLF	STXBP4,HLF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HLF	24390	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr17	53394900	53394943	53394922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLF	54527	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	53497202	53497618	53497598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMD	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	54263832	54264049	54263912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOG	405011	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.372292443912568
chr17	54669912	54670125	54669969	Y	NA	NOG	NA	NA	NA	NA	NOG	852	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.159295628027183
chr17	54857525	54857918	54857805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKE	51542	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	54864431	54864801	54864568	Y	TRIM25,SCPEP1	DGKE,C17orf67	NA	NA	NA	NA	DGKE	44659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr17	54876339	54876519	54876454	Y	DGKE	DGKE,C17orf67	NA	NA	NA	NA	DGKE	32941	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	54987224	54987877	54987630	Y	SCPEP1,TRIM25	TRIM25,COIL	NA	NA	NA	NA	TRIM25	1522	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	54993018	54993544	54993286	Y	SCPEP1,TRIM25	TRIM25,COIL	DGKE	MCF7	ChIA-PET	22265404	TRIM25	3619	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr17	55288386	55288469	55288428	Y	NA	MSI2	MSI2	IMR90	Hi-C	24141950	MSI2	42743	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208268283576497
chr17	55292764	55293032	55292916	Y	NA	MSI2	MSI2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MSI2	38180	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.294530304418384
chr17	55501996	55502706	55502262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	170784	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr17	55504815	55504992	55504904	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	173603	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	55540558	55540950	55540705	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	209346	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	55740175	55740776	55740501	Y	MSI2,MSI2,DYNLL2	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	184641	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	55741402	55741415	55741409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	184002	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	55749375	55749748	55749439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	175669	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	55977135	55977456	55977362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	51718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	56023350	56023692	56023525	Y	NA	CUEDC1,VEZF1	CUEDC1,VEZF1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	6992	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	56064193	56064677	56064258	Y	NA	CUEDC1,VEZF1,SRSF1	NA	NA	NA	NA	VEZF1	573	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	56161643	56161969	56161895	Y	VEZF1,MTMR4	DYNLL2	NA	NA	NA	NA	DYNLL2	2867	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	56426877	56426962	56426920	Y	MTMR4,SUPT4H1	MIR142,SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	1492	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	56428194	56428499	56428372	Y	VEZF1,MTMR4,SUPT4H1	MIR142	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr17	56587640	56587744	56587729	Y	PPM1E,DYNLL2,MKS1,SEPT4,MTMR4	MTMR4	NA	NA	NA	NA	MTMR4	5522	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	56736656	56737064	56736885	Y	MTMR4,SEPT4,SEPT4,PPM1E	RNU1-60P,RNU1-85P,RAD51C	SEPT4,C17orf47	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	1990	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr17	57200500	57200626	57200599	Y	GDPD1	AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	TRIM37	18218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	57231102	57231481	57231293	Y	C17orf71	AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	PRR11	242	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr17	57231530	57231848	57231723	Y	NA	AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	PRR11	670	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.445481980647275
chr17	57409690	57409997	57409875	Y	YPEL2	YPEL2	NA	NA	NA	NA	YPEL2	2640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	57500537	57500993	57500672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YPEL2	93487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	57698412	57698732	57698592	Y	YPEL2,RNFT1,VMP1	CLTC	NA	NA	NA	NA	CLTC	3193	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	57831888	57832338	57832062	Y	VMP1,RNFT1	VMP1,PTRH2	NA	NA	NA	NA	PTRH2	48901	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.384861812909086
chr17	57833423	57834077	57833636	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTRH2	50436	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	57841314	57841767	57841379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTRH2	58327	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	57847286	57847866	57847541	Y	YPEL2,RNFT1	NA	NA	NA	NA	NA	PTRH2	64299	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	57860256	57860659	57860446	Y	DHX40,VMP1,CA4	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	55968	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.417266716343361
chr17	57861698	57862055	57862024	Y	RNFT1	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	54572	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.539428908627382
chr17	57862470	57862813	57862554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	53814	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	57863159	57864676	57863979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	51951	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.06867060344662
chr17	57881973	57882438	57882250	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	34189	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr17	57882537	57882682	57882623	Y	YPEL2,VMP1,RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	33945	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.19149184039072
chr17	57902814	57903248	57902913	Y	YPEL2,VMP1,RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	13379	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	57904186	57904344	57904253	Y	VMP1,CA4	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	12283	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	57905350	57905555	57905420	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	11072	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.272886834433207
chr17	57906379	57907270	57906882	Y	RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	9357	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.699993579023459
chr17	57907420	57907736	57907558	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	8891	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr17	57908316	57908645	57908515	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	7982	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr17	57922999	57923843	57923122	Y	PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	6372	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.155836138087189
chr17	57930626	57931026	57930760	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	13999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.22629633407227
chr17	57932450	57932798	57932624	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	15823	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr17	57932982	57933345	57933242	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	16355	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.494454636196589
chr17	57952277	57952457	57952367	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	TUBD1	15847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	57962596	57962816	57962625	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	TUBD1	5488	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr17	57966021	57966396	57966241	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	TUBD1	1908	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	58212242	58212405	58212344	Y	NA	CA4	C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CA4	12892	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.348805711917541
chr17	58678620	58678973	58678714	Y	PPM1D	PPM1D	NA	NA	NA	NA	PPM1D	3076	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	58804933	58805128	58805031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAS3	52119	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	59213347	59213460	59213422	Y	TBX4,TBX2	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	261797	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	59327837	59328038	59327938	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	147219	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.284187161060831
chr17	59328360	59328558	59328442	Y	NACA2	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	146699	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200810410517982
chr17	59329573	59329874	59329791	Y	NACA2	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	145383	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.471698053391929
chr17	59939507	59939855	59939761	Y	BRIP1	BRIP1	NA	NA	NA	NA	BRIP1	625	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.176210565703473
chr17	59956289	59956463	59956377	Y	NA	BRIP1,INTS2	BRIP1	IMR90	Hi-C	24141950	BRIP1	17407	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.147265152209192
chr17	60085676	60086036	60086030	Y	NACA2,MED13	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	54607	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	60141349	60141594	60141514	Y	NACA2,MED13	MED13	INTS2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MED13	706	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	60247601	60248070	60247921	Y	MED13	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	106958	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	60256998	60257133	60257064	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	116355	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	60557252	60557333	60557299	Y	NA	RP11-464D20.2	MRC2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-464D20.2	34795	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	60649611	60649792	60649701	Y	NA	NA	MRC2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-464D20.2	57483	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	60780424	60780717	60780568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-464D20.2	188296	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr17	60795868	60796183	60796045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-464D20.2	203740	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	60856273	60856623	60856561	Y	EFCAB3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-464D20.2	264145	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.257240939125811
chr17	60868052	60868313	60868162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-464D20.2	275924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.419648871531737
chr17	60868640	60868941	60868827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-464D20.2	276512	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	60869162	60869387	60869275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-464D20.2	277034	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.572372705240184
chr17	60897286	60897580	60897414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-464D20.2	305158	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr17	60970243	60970809	60970465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-464D20.2	378115	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	61043121	61043648	61043243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-464D20.2	450993	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	61243701	61244044	61243838	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB561	277695	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	61274452	61274584	61274536	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB561	247155	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	61299362	61299669	61299468	Y	MAP3K3	NA	MIR548W,DCAF7,MARCH10	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	222070	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	61370802	61371122	61370929	Y	MAP3K3,LIMD2	NA	MIR548W	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	150617	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	61538235	61538385	61538330	Y	NA	CYB561	CYB561,ACE,MIR548W,KCNH6,DCAF7,TACO1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CYB561	16496	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr17	61629052	61629111	61629082	Y	NA	DCAF7,TACO1	NA	NA	NA	NA	DCAF7	3230	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	61639369	61639739	61639552	Y	NA	DCAF7,TACO1	NA	NA	NA	NA	DCAF7	13547	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr17	61748394	61748578	61748486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K3	50619	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	61779039	61779508	61779383	Y	NA	STRADA	NA	NA	NA	NA	STRADA	37822	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	61787185	61787371	61787278	Y	NA	STRADA	NA	NA	NA	NA	STRADA	29959	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr17	61796482	61796787	61796636	Y	NA	STRADA	NA	NA	NA	NA	STRADA	20543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	62159440	62159790	62159613	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	46389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.339001461738516
chr17	62161129	62161576	62161448	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	44603	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.239212888630038
chr17	62252131	62252624	62252334	Y	LIMD2,ICAM2,DDX5,ERN1	ERN1,SNORD104	NA	NA	NA	NA	SNORD104	30688	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	62256473	62256785	62256630	Y	DDX5,ERN1	SNORD104	NA	NA	NA	NA	SNORD104	35030	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	62258830	62259200	62259015	Y	SCN4A	SNORD104	NA	NA	NA	NA	SNORD104	37387	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	62310016	62310373	62310195	Y	C17orf72	TEX2	NA	NA	NA	NA	TEX2	28288	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	62339620	62339793	62339707	Y	CEP95	TEX2	NA	NA	NA	NA	TEX2	959	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	62403904	62404562	62404234	Y	ERN1,PECAM1,DDX5	NA	NA	NA	NA	NA	TEX2	65243	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.557804144684405
chr17	62408874	62409016	62408933	Y	ICAM2,ERN1,PECAM1,DDX5	NA	NA	NA	NA	NA	TEX2	70213	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	62409252	62409599	62409468	Y	ICAM2,ERN1,PECAM1,DDX5	NA	NA	NA	NA	NA	TEX2	70591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.3386184981094
chr17	62409604	62410133	62409977	Y	ICAM2,ERN1,DDX5	NA	NA	NA	NA	NA	TEX2	70943	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.31859171239899
chr17	62484790	62485162	62485096	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	POLG2	5992	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	62526246	62526643	62526459	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	DDX5	23929	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	62586168	62586194	62586181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMURF2	69992	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	62675748	62676312	62676051	Y	SMURF2	SMURF2	SMURF2,LOC146880	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMURF2	19562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	62703261	62703596	62703473	Y	SMURF2	SMURF2	SMURF2	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF2	47075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	62966198	62966382	62966326	Y	DDX5,CEP95,RGS9,GNA13	AMZ2P1	NA	NA	NA	NA	AMZ2P1	3312	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	63038886	63039290	63039133	Y	GNA13	GNA13	NA	NA	NA	NA	GNA13	11667	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	63043139	63043174	63043152	Y	NA	GNA13	NA	NA	NA	NA	GNA13	7783	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	63060882	63060952	63060917	Y	GNA13	GNA13	GNA13,RGS9	IMR90	Hi-C	24141950	GNA13	9925	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	63119249	63119621	63119552	Y	GNA13	NA	RGS9,GNA13,AMZ2P1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GNA13	68292	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.499027238956066
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP112	545803	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.421995248652249
chr17	63996608	63996849	63996729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP112	189353	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	64194072	64194322	64194164	Y	NA	CEP112	NA	NA	NA	NA	CEP112	7870	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.609506140983346
chr17	64271821	64272172	64271887	Y	NA	APOH,PRKCA	PRKCA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	APOH	21178	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	64301184	64301397	64301241	Y	NA	PRKCA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	4430	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	64503657	64504241	64503882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	206903	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr17	64690651	64690854	64690753	Y	PRKCA,CACNG4	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	393897	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	64708077	64708220	64708107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	411323	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr17	65130860	65131108	65130984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HELZ	108997	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	65242250	65242562	65242536	Y	NA	HELZ,SNORA8	NA	NA	NA	NA	HELZ	2145	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	65339190	65339485	65339338	Y	BPTF	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PSMD12	21258	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	65386872	65387224	65386898	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	15297	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	65389377	65389540	65389482	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	17802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr17	65394789	65395150	65395019	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NOL11	IMR90	Hi-C	24141950	PITPNC1	23214	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	65418011	65418377	65418257	Y	HELZ,PSMD12,PITPNC1,BPTF	PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	46436	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	65470400	65470556	65470469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	98825	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	65471645	65472025	65471701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	100070	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	65516763	65517072	65516877	Y	PITPNC1	NA	NOL11	IMR90	Hi-C	24141950	PITPNC1	145188	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	65525014	65525424	65525241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	153439	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	65847253	65847408	65847335	Y	NA	BPTF	NA	NA	NA	NA	BPTF	27613	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	65897183	65897370	65897273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BPTF	77543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	65991434	65991739	65991543	Y	C17orf58	C17orf58,KPNA2	NA	NA	NA	NA	C17orf58	3669	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.04295764581263
chr17	66016382	66016768	66016696	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	12867	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	66030294	66030564	66030453	Y	NA	C17orf58,KPNA2	NA	NA	NA	NA	KPNA2	659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	66041204	66041633	66041268	Y	NA	KPNA2	NA	NA	NA	NA	KPNA2	11569	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	66284577	66285224	66284692	Y	BPTF,PRKAR1A,PRKAR1A,SLC16A6	AMZ2,ARSG,SLC16A6	NA	NA	NA	NA	SLC16A6	184	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr17	66306496	66306595	66306536	Y	BPTF,PRKAR1A,SLC16A6	SLC16A6	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC16A6	21088	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	66311166	66311345	66311242	Y	BPTF,PRKAR1A,PRKAR1A,SLC16A6	SLC16A6	NA	NA	NA	NA	SLC16A6	25758	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	66348483	66348670	66348577	Y	PRKAR1A	NA	NA	NA	NA	NA	SLC16A6	63075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	66374219	66374806	66374507	Y	SLC16A6	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	76848	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.771183924198905
chr17	66374808	66375131	66375016	Y	SLC16A6	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	76523	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.00186206136344
chr17	66376984	66377775	66377396	Y	NA	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	73879	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.708911750462707
chr17	66379549	66379922	66379702	Y	SLC16A6,WIPI1	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	71732	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.286186352620092
chr17	66380161	66380700	66380381	Y	SLC16A6	NA	NA	NA	NA	NA	WIPI1	70954	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	66382740	66382853	66382787	Y	NA	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	68801	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr17	66384429	66384662	66384544	Y	SLC16A6	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	66992	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	66419326	66419636	66419592	Y	NA	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	32018	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr17	66456929	66457226	66456998	Y	NA	WIPI1,PRKAR1A	NA	NA	NA	NA	WIPI1	5275	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	66509186	66509763	66509535	Y	SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A	PRKAR1A	NA	NA	NA	NA	PRKAR1A	3265	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr17	67315191	67315526	67315500	Y	NA	ABCA5	NA	NA	NA	NA	ABCA5	5859	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	67729924	67730199	67729927	Y	NA	NA	KCNJ2-AS1,KCNJ2,KCNJ16	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K6	321085	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	67757945	67758523	67758299	Y	KCNJ2	NA	KCNJ16,KCNJ2-AS1,KCNJ2,MAP2K6	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K6	349106	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	68133591	68133755	68133649	Y	KCNJ2	KCNJ2	NA	NA	NA	NA	KCNJ2	29059	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr17	69558525	69558657	69558591	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LOC124685	56462	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	69596730	69596951	69596781	Y	NA	LOC124685	NA	NA	NA	NA	LOC124685	18168	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	70417215	70417683	70417549	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	203687	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	70514986	70515384	70515137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	105986	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	70577972	70578326	70578149	Y	NA	RPL32P33	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	43044	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	70585924	70586379	70586141	Y	NA	RPL32P33	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	34991	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	70587266	70587776	70587444	Y	NA	RPL32P33	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	33594	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	70610080	70610203	70610142	Y	NA	RPL32P33	LOC100499467	MCF7	ChIA-PET	22265404	RPL32P33	11167	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr17	70680022	70680249	70680147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	58652	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr17	70706379	70706638	70706553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	85009	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.33477604454029
chr17	70712408	70712674	70712489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	91038	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr17	70939903	70940361	70940187	Y	SSTR2,C17orf80	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	146490	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.139807279150677
chr17	71024945	71025268	71025108	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	61583	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	71200352	71200549	71200451	Y	NA	COG1,C17orf80,FAM104A	NA	NA	NA	NA	COG1	13223	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	71287548	71287861	71287762	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	18453	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182052210831843
chr17	71301216	71301553	71301269	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	4761	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	71304431	71304616	71304518	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	1698	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.324588830732148
chr17	71305759	71306422	71306099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.335506193730656
chr17	71336325	71336719	71336454	Y	NA	CDC42EP4	CDC42EP4	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42EP4	30011	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20553894282687
chr17	71338137	71338558	71338458	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	31823	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	71427116	71427294	71427230	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	120802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	71603632	71603970	71603800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	297318	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	72543917	72544134	72544056	Y	TTYH2,CD300A,TMEM104,CD300LF,CD300E,CD300LB,CD300C,CD300LD	NA	NA	NA	NA	NA	GPRC5C	124927	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	72596633	72597034	72596924	Y	TTYH2,CD300A,TMEM104,CD300LF,CD300E,CD300LB,CD300C,CD300LD	NA	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	145757	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	72745955	72746124	72746086	Y	NA	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	3164	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr17	72746451	72746964	72746655	Y	NA	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	3660	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr17	72978355	72978661	72978434	Y	KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CDR2L	3066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.48282501541124
chr17	72984795	72985307	72985001	Y	RAB37,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	NA	NA	NA	NA	CDR2L	3068	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr17	73009835	73009966	73009891	Y	NA	CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H	NA	NA	NA	NA	ICT1	3070	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr17	73087456	73087829	73087515	Y	NA	ATP5H,SLC16A5,ARMC7,NT5C	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	5634	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.79049936481172
chr17	73091198	73091317	73091257	Y	TSEN54,LLGL2	SLC16A5,ARMC7,NT5C	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	9376	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr17	73120387	73120767	73120528	Y	GRB2,GRB2,CD300LF,HN1,HN1,SLC16A5,NT5C	SLC16A5,ARMC7,NT5C,HN1	NA	NA	NA	NA	NT5C	5123	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.435067732759428
chr17	73133469	73133809	73133510	Y	NA	ARMC7,NT5C,HN1,SUMO2	NA	NA	NA	NA	NT5C	7579	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	73304838	73305233	73305159	Y	UNK,SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19	MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	8177	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	73319762	73319905	73319788	Y	SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19	SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	6352	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	73333353	73333637	73333600	Y	H3F3B,GRB2,GRB2,GGA3	SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	19943	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr17	73351805	73351921	73351820	Y	NA	AC011933.1,GRB2	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	38395	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	73391809	73391943	73391876	Y	NA	GRB2,KIAA0195	NA	NA	NA	NA	GRB2	7847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr17	73426423	73426691	73426652	Y	MRPS7	GRB2,KIAA0195	NA	NA	NA	NA	KIAA0195	8549	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.223184029693526
chr17	73456599	73456615	73456608	Y	NA	KIAA0195	NA	NA	NA	NA	KIAA0195	21359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	73531533	73531826	73531590	Y	NA	CASKIN2,TSEN54,LLGL2	NA	NA	NA	NA	LLGL2	12372	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	73545364	73545732	73545559	Y	NA	CASKIN2,TSEN54,LLGL2	NA	NA	NA	NA	LLGL2	26203	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.274886025992467
chr17	73696530	73696897	73696707	Y	SAP30BP,ITGB4,ITGB4	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	ITGB4	18511	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.339348647299766
chr17	73718198	73718514	73718306	Y	NA	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	2790	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.180053019272583
chr17	73719261	73719909	73719549	Y	MRPS7,LLGL2,LOC100130933,EVPL,ITGB4,ITGB4	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	3853	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.366833762413314
chr17	73805010	73805399	73805102	Y	NA	GALK1,UNK,H3F3B,UNC13D,WBP2	NA	NA	NA	NA	H3F3B	25036	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	73868951	73869202	73869040	Y	TRIM47	UNC13D,WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38	NA	NA	NA	NA	TRIM47	3454	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr17	73891396	73891618	73891569	Y	NA	WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38,FBF1	NA	NA	NA	NA	TRIM65	312	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.27215668524284
chr17	73992927	73993207	73992957	Y	NA	TEN1,ACOX1,CDK3,EVPL	NA	NA	NA	NA	CDK3	1780	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	74067493	74067877	74067630	Y	RNF157,FAM100B	EVPL,SRP68,EXOC7	NA	NA	NA	NA	SRP68	759	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr17	74117633	74117738	74117682	Y	NA	EXOC7,FOXJ1	NA	NA	NA	NA	EXOC7	1976	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	74413626	74413718	74413672	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1,UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	33570	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr17	74415585	74415933	74415760	Y	MFSD11,RNF157	SPHK1,PRPSAP1,UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	31355	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	74496062	74496568	74496378	Y	FAM100B,SPHK1,SPHK1,ST6GALNAC2,JMJD6,RHBDF2,RHBDF2	UBE2O,RHBDF2	NA	NA	NA	NA	RHBDF2	190	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	74525516	74525637	74525615	Y	NA	RHBDF2	NA	NA	NA	NA	RHBDF2	29644	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	74525744	74526079	74526045	Y	ST6GALNAC2,MGAT5B,CYGB	RHBDF2	NA	NA	NA	NA	RHBDF2	29872	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr17	74526422	74526750	74526585	Y	CYGB	RHBDF2	NA	NA	NA	NA	RHBDF2	30550	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	74593962	74594390	74594127	Y	FAM100B,SPHK1,SPHK1,RHBDF2,JMJD6	ST6GALNAC2,ST6GALNAC1	ST6GALNAC2	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ST6GALNAC2	12924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	74705254	74705618	74705431	Y	MXRA7	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	MXRA7	156	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	74723995	74724371	74724344	Y	FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	METTL23	3083	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr17	74748247	74748435	74748347	Y	FAM100B,JMJD6,SRSF2	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	SRSF2	16791	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	75112462	75112730	75112694	Y	SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	31664	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	75120383	75120864	75120582	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	39585	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr17	75160724	75161106	75160798	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	79926	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	75278845	75279720	75279369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	198047	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	75281264	75281453	75281354	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	200466	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr17	75281811	75282557	75281917	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201013	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr17	75282703	75283463	75282995	Y	SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201905	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172595146214068
chr17	75284936	75285118	75285041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	204138	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18093909801236
chr17	75312591	75312808	75312697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	231793	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	75318206	75318391	75318316	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	237408	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr17	75319028	75319523	75319372	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	238230	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr17	75319670	75320031	75319742	Y	MGAT5B,SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	238872	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	75321712	75322201	75321955	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	240914	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	75384636	75384998	75384811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	303838	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr17	75405377	75405733	75405639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	324579	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	75456086	75456409	75456172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	375288	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	75461802	75462176	75461947	Y	SEC14L1,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	381004	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	RNU1-80P,TNRC6C	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-80P	40213	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	76165603	76166001	76165654	Y	SYNGR2	TMC8,TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5	NA	NA	NA	NA	SYNGR2	2964	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	76169246	76169385	76169328	Y	PGS1,SYNGR2	TMC8,TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5	NA	NA	NA	NA	SYNGR2	6607	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	76169539	76169762	76169683	Y	TMC6,SOCS3,PGS1,SYNGR2	TMC8,TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5	NA	NA	NA	NA	SYNGR2	6900	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	76195016	76195360	76195224	Y	TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5	BIRC5	IMR90	Hi-C	24141950	BIRC5	12907	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	76268764	76268973	76268872	Y	TNRC6C,TMC6,TMC8,TMC6,SOCS3,PGS1	NA	TK1,AFMID,CYTH1,TMC6,LOC100131096,TNRC6C,SOCS3,DNAH17,PGS1	IMR90	Hi-C	24141950	BIRC5	60497	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	76310071	76310633	76310436	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	PGS1,DNAH17,SOCS3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SOCS3	43525	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.458398535205044
chr17	76312866	76313241	76313131	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	SOCS3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SOCS3	40917	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.274886025992467
chr17	76313584	76313890	76313792	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	SOCS3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SOCS3	40268	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.01908795018849
chr17	76318991	76319257	76319075	Y	NA	SOCS3	NA	NA	NA	NA	SOCS3	34901	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	76325206	76325964	76325662	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	28194	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.246670761688553
chr17	76337607	76338208	76338068	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	15950	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.355377506236279
chr17	76338337	76338836	76338651	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	15322	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.239212888630038
chr17	76347582	76348110	76347694	Y	SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	6048	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	76348964	76349371	76349046	Y	USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4787	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr17	76349549	76349649	76349633	Y	NA	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4509	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.25324255600729
chr17	76356993	76357093	76357047	Y	SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	2835	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.321859489982521
chr17	76357167	76357466	76357379	Y	NA	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	3009	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr17	76377337	76378350	76377903	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	4616	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	76382008	76383398	76383057	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	9287	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	76412850	76413399	76413170	Y	CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1	PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	40129	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	76438570	76439399	76439026	Y	USP36,CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	NA	PGS1	65849	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr17	76480175	76480442	76480309	Y	TMEM235	RN7SL454P	NA	NA	NA	NA	RN7SL454P	46695	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.27015749368358
chr17	76529146	76529333	76529216	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	RN7SL454P	NA	NA	NA	NA	RN7SL454P	2009	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	76588219	76588768	76588537	Y	NA	NA	DNAH17,CYTH1,USP36	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SL454P	61082	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	76635137	76635288	76635196	Y	SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1	NA	CYTH1,DNAH17	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SL454P	108000	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	76641957	76642289	76642128	Y	SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1	NA	DNAH17,CYTH1	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SL454P	114820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	76669540	76669658	76669599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYTH1	106721	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	76744782	76745072	76745044	Y	SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1	CYTH1	NA	NA	NA	NA	CYTH1	31307	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	76813236	76813533	76813481	Y	CYTH1,ENGASE,USP36	CYTH1,USP36	NA	NA	NA	NA	USP36	21990	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	76858403	76858717	76858585	Y	PGS1,CYTH1,ENGASE,USP36	USP36	NA	NA	NA	NA	USP36	22880	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.234484356321151
chr17	76879007	76879631	76879400	Y	CYTH1,ENGASE,CANT1,USP36	USP36,TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	39838	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227912562002414
chr17	76879876	76880180	76879977	Y	NA	USP36,TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	39289	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr17	76929562	76929807	76929665	Y	CANT1	TIMP2,LGALS3BP	TIMP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TIMP2	10093	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr17	76930060	76930674	76930419	Y	NA	TIMP2,LGALS3BP	TIMP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TIMP2	10591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.583445997788102
chr17	77032690	77033106	77032818	Y	CYTH1,ENGASE	CANT1,ENGASE	NA	NA	NA	NA	CANT1	28741	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr17	77702456	77702572	77702532	Y	NA	CBX2	NA	NA	NA	NA	CBX2	47359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	77730841	77731207	77731024	Y	CBX8,CBX2	CBX2,CBX8	NA	NA	NA	NA	CBX2	18724	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.257971088316178
chr17	77776510	77776898	77776679	Y	CCDC40	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	3028	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr17	77778056	77778248	77778123	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	4574	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	77783959	77784243	77784073	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	10477	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.194238616199245
chr17	77784894	77785612	77785337	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	11412	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	77803693	77803802	77803748	Y	NA	CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX4	7426	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	77814369	77814482	77814427	Y	NA	CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX4	3141	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	77967532	77967765	77967641	Y	CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	39882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.613001408991205
chr17	78087852	78088239	78088062	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	GAA	14497	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	78121490	78121818	78121740	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	EIF4A3	2508	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr17	78134342	78134588	78134495	Y	NA	EIF4A3	EIF4A3,CARD14,SGSH,SLC26A11	IMR90	Hi-C	24141950	EIF4A3	15360	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	78149249	78149503	78149364	Y	NA	EIF4A3,SLC26A11,SGSH	EIF4A3	MCF7	ChIA-PET	22265404	EIF4A3	30267	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.223184029693526
chr17	78228476	78228940	78228764	Y	GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213	SLC26A11,SGSH,RNF213	NA	NA	NA	NA	RNF213	3725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.541045136557527
chr17	78238527	78238862	78238699	Y	GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213	SLC26A11,SGSH,RNF213	NA	NA	NA	NA	RNF213	5862	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr17	78289864	78290143	78290056	Y	NPTX1	NA	LOC100294362,ENDOV	IMR90	Hi-C	24141950	RNF213	57199	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	78352228	78352499	78352367	Y	GAA,RNF213	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	34466	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	78387431	78387634	78387516	Y	NA	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	466	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV,NPTX1	NA	NA	NA	NA	NPTX1	20369	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.44296269526307
chr17	78471918	78472124	78472096	Y	NA	NPTX1,RPL32P31,RPTOR	RPTOR,ENDOV,LOC100294362,CHMP6	IMR90	Hi-C	24141950	NPTX1	22275	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.180053019272583
chr17	78744627	78744900	78744734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	218498	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	78754047	78754707	78754061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	208691	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	78824691	78824852	78824790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	138546	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	78830209	78830686	78830492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	132712	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr17	78900870	78900990	78900942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	62408	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	78901796	78901941	78901869	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	61457	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	78958668	78958859	78958764	Y	NA	CHMP6,BAIAP2	NA	NA	NA	NA	CHMP6	4539	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	79017666	79018027	79017910	Y	AZI1,BAIAP2	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	10718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr17	79024187	79024380	79024262	Y	BAIAP2	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	17239	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	79107096	79107396	79107264	Y	AATK	NA	NA	NA	NA	NA	AZI1	87403	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.08941055963312
chr17	79123029	79123440	79123130	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AZI1	71359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	79261011	79261270	79261067	Y	NA	C17orf89,SLC38A10,LINC00482,TMEM105	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	6077	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	79302809	79302914	79302847	Y	NA	SLC38A10,LINC00482,TMEM105	NA	NA	NA	NA	TMEM105	335	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	79316253	79317268	79317090	Y	NA	SLC38A10,LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,C17orf56,C17orf89,LINC00482,MIR3186,C17orf70,FSCN2,NPLOC4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	13779	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr17	79317785	79317948	79317891	Y	FAM195B,C17orf70,ACTG1,BAHCC1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	15311	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.16823214247539
chr17	79318144	79318304	79318226	Y	TMEM105,BAHCC1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	15670	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr17	79319325	79319648	79319507	Y	FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	16851	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.10646308384986
chr17	79319812	79320225	79320116	Y	FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	17338	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr17	79360408	79361324	79361141	Y	ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	57934	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr17	79365060	79367456	79365203	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	62586	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18478155158147
chr17	79368790	79369424	79369000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	66316	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	79369574	79370687	79370597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	67100	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.120163000724761
chr17	79370754	79371569	79371407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	68280	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr17	79397073	79397461	79397298	Y	MAFG,MAFG,NPLOC4,HGS	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	80628	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr17	79399752	79400128	79399940	Y	NPB	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	77961	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	79451287	79451558	79451462	Y	AATK,AZI1,BAHCC1	RP13-766D20.1,RP13-766D20.2,ACTG1	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	26531	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.64575349798673
chr17	79546845	79547000	79546944	Y	PCYT2	C17orf70	NA	NA	NA	NA	C17orf70	27858	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	79779684	79779899	79779792	Y	NA	FAM195B,PPP1R27,P4HB,ARHGDIA	NA	NA	NA	NA	FAM195B	9279	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.139807279150677
chr17	79925685	79926075	79926048	Y	TSPAN10	SIRT7,MAFG,MAFG-AS1,AC137723.5,PYCR1,ASPSCR1	ASPSCR1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ASPSCR1	6608	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	79942701	79942868	79942785	Y	SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62	AC137723.5,PYCR1,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3	NA	NA	NA	NA	ASPSCR1	10018	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	79949658	79950000	79949804	Y	SLC25A10,STRA13,LRRC45,FASN,DCXR,PCYT2,NOTUM,ASPSCR1	ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR	NA	NA	NA	NA	ASPSCR1	16975	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr17	79979263	79979824	79979465	Y	NA	ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR,GPS1,RFNG,DUS1L	NA	NA	NA	NA	LRRC45	85	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr17	80052713	80052821	80052782	Y	MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN	GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	1387	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.246670761688553
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.10533253597147
chr17	80060759	80061000	80060880	Y	NA	DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	6551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	80068190	80068440	80068326	Y	NA	DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	13982	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr17	80068913	80069274	80069094	Y	NARF,HEXDC,CCDC57	DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	14705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	80079695	80079832	80079748	Y	NA	FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	25487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	80158664	80158910	80158860	Y	DUS1L,NARF,HEXDC,CD7,CCDC57	CCDC57,SLC16A3	FASN	K562	ChIA-PET	22265404	CCDC57	9796	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr17	80164087	80164383	80164236	Y	SIRT7,MAFG,MAFG,SECTM1,NARF,CSNK1D,C17orf62,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,CCDC57	CCDC57,SLC16A3	NA	NA	NA	NA	CCDC57	4323	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr17	80188750	80189250	80189000	Y	NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	SLC16A3	4477	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	80199457	80199968	80199484	Y	NA	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	SLC16A3	15184	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr17	80214734	80215057	80214944	Y	NA	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	14550	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr17	80215337	80215590	80215470	Y	SIRT7,WDR45L,NARF,CSNK1D,CD7,C17orf62,C17orf62,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	14017	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	80216124	80216440	80216314	Y	NA	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	13167	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr17	80239829	80239997	80239937	Y	NA	CSNK1D,SECTM1	CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1D	10222	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr17	80245965	80246238	80246057	Y	MAFG,MAFG,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1	CSNK1D,SECTM1	CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1D	16358	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.302215211556604
chr17	80255299	80255755	80255478	Y	SIRT7,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7	CSNK1D,SECTM1	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	25692	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.707451452081974
chr17	80255798	80256475	80256187	Y	SIRT7,MAFG,MAFG,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,HEXDC,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7	CSNK1D,SECTM1	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	26191	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.441483597528754
chr17	80296831	80297318	80297085	Y	NA	SECTM1,TEX19	SECTM1,CCDC57,SLC16A3,CSNK1D,CD7,TEX19,C17orf62,C17orf101,NARF,HEXDC,FOXK2,WDR45L	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SECTM1	6881	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.268158302124319
chr17	80454894	80455238	80455175	Y	LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	20351	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.306560780236375
chr17	80546229	80546455	80546368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK2	70640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	80594524	80594906	80594740	Y	UTS2R,WDR45L	NA	NA	NA	NA	NA	RAB40B	59698	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	80712796	80713169	80712899	Y	ZNF750,TBCD	FN3KRP,TBCD	NA	NA	NA	NA	TBCD	4856	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr17	80830952	80831086	80831038	Y	HEXDC,C17orf62,C17orf62	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	34498	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr17	80834580	80834819	80834710	Y	NA	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	38126	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	81031472	81031760	81031658	Y	METRNL	B3GNTL1,METRNL	B3GNTL1	K562	ChIA-PET	22265404	METRNL	3807	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.197698106139239
chr17	81038687	81040054	81039707	Y	B3GNTL1,METRNL	B3GNTL1,METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	3120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr17	81049749	81049909	81049815	Y	NA	B3GNTL1,METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	14182	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.478425777260077
chr17	81057799	81057924	81057864	Y	METRNL	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	22232	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr17	81058904	81059222	81058949	Y	METRNL	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	23337	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr17	81063257	81063563	81063336	Y	NA	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	27690	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr17	81066773	81067186	81066924	Y	NA	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	31206	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.518671517381983
chr17	81067352	81067511	81067418	Y	NA	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	31785	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.934094971715493
chr17	81143253	81144043	81143500	Y	NA	NA	METRNL	MCF7	ChIA-PET	22265404	METRNL	107686	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr17	81150899	81151424	81151082	Y	METRNL	NA	METRNL	MCF7	ChIA-PET	22265404	METRNL	115332	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	222573	222827	222703	Y	NA	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	43223	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr18	228420	228816	228694	Y	THOC1	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	37234	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr18	235900	236290	236249	Y	NA	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	29760	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	379694	380112	379776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THOC1	113644	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	395862	395959	395924	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THOC1	129812	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	666183	666708	666437	Y	THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	9843	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.543044328116787
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11293	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.20458221590142
chr18	668283	668526	668405	Y	THOC1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11943	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr18	711356	711474	711397	Y	ENOSF1,ENOSF1	ENOSF1	NA	NA	NA	NA	ENOSF1	680	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr18	781638	782117	782009	Y	NA	RNU1-109P,YES1	NA	NA	NA	NA	RNU1-109P	14019	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	830446	830703	830580	Y	NA	RNU1-109P,YES1	CLUL1,ENOSF1,YES1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YES1	19899	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	2302701	2302761	2302738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	266747	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.303831439486748
chr18	2516331	2516615	2516492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	52893	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	2548368	2548472	2548420	Y	NA	METTL4,NDC80	NA	NA	NA	NA	METTL4	21036	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	2549022	2549121	2549072	Y	NA	METTL4,NDC80	NA	NA	NA	NA	METTL4	20387	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	2605641	2605936	2605854	Y	NA	METTL4,NDC80,CBX3P2,SMCHD1	NA	NA	NA	NA	NDC80	36131	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.233754207130784
chr18	2656589	2657177	2656999	Y	NA	CBX3P2,SMCHD1	NA	NA	NA	NA	SMCHD1	2852	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	2855586	2855865	2855617	Y	NA	NA	LPIN2	IMR90	Hi-C	24141950	LPIN2	155448	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	2963165	2963356	2963277	Y	TGIF1,MYL12B,METTL4,SMCHD1,EMILIN2	LPIN2	NA	NA	NA	NA	LPIN2	47957	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	3015219	3015501	3015351	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,METTL4,EMILIN2	LPIN2	LPIN2	K562	ChIA-PET	22265404	LPIN2	3906	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.398891480286338
chr18	3251422	3251674	3251471	Y	MYOM1	MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12A	5943	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	3276279	3276423	3276302	Y	NA	MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12B	16372	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	3383416	3383792	3383691	Y	TGIF1,TGIF1	TGIF1	TGIF1	K562	ChIA-PET	22265404	TGIF1	25814	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.11832019505953
chr18	3385002	3385317	3385084	Y	NA	TGIF1	TGIF1	K562	ChIA-PET	22265404	TGIF1	24289	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20353975126761
chr18	3446696	3446930	3446873	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	TGIF1	NA	NA	NA	NA	TGIF1	37090	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.287802580550236
chr18	3594733	3596177	3595596	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	185127	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.625534999919858
chr18	3623872	3624258	3624140	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214266	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.19641208505607
chr18	3624338	3624601	3624482	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214732	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.725826688138997
chr18	3624841	3625119	3625035	Y	MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215235	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.86980617136113
chr18	3625326	3625427	3625380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215720	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.346076371167914
chr18	3639477	3639730	3639610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	229871	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.120163000724761
chr18	3650005	3650381	3650193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	240399	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr18	3665613	3666165	3665884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	256007	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.602048267924832
chr18	3676188	3676369	3676278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	266582	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.163294011145704
chr18	3704951	3705065	3705044	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,DLGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	295345	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	3794813	3795294	3795021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	385207	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.32625872813368
chr18	3806540	3806805	3806758	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	396934	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr18	3816827	3817202	3817015	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	407221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.176210565703473
chr18	4002405	4002762	4002417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	592799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	4004554	4004687	4004639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	594948	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	7048074	7048376	7048212	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAMA1	67437	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.72292398278106
chr18	7273554	7273981	7273852	Y	NA	SNORA48	PTPRM	IMR90	Hi-C	24141950	SNORA48	25170	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	7950764	7950916	7950843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRM	385984	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.448211321396903
chr18	8643425	8643722	8643508	Y	ANKRD12,ANKRD12,RAB12	RAB12	NA	NA	NA	NA	RAB12	35982	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	8730480	8730718	8730581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	123037	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	8801229	8801479	8801315	Y	CCDC165	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	193786	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.377020976221455
chr18	9017103	9017601	9017310	Y	ANKRD12	NA	CCDC165,ANKRD12,RALBP1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	83027	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr18	9017601	9018155	9017805	Y	NA	NA	CCDC165,ANKRD12,RALBP1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	82473	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr18	9094792	9095105	9094897	Y	ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	RALBP1,TWSG1,NDUFV2,CCDC165,ANKRD12	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NDUFV2	5523	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	9101793	9102110	9101852	Y	RAB12,ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	NA	NA	NA	NA	NDUFV2	1165	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr18	9128926	9129321	9129124	Y	NDUFV2,ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	ANKRD12	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD12	4905	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	9375216	9375438	9375327	Y	NA	TWSG1	NA	NA	NA	NA	TWSG1	42451	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	9548277	9548390	9548335	Y	ANKRD12,VAPA,RAB31,PPP4R1	NA	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	64848	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr18	9604214	9604566	9604459	Y	NA	PPP4R1	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	8672	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr18	9645725	9646120	9645908	Y	NA	PPP4R1	PPP4R1,VAPA,ANKRD12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP4R1	32487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	9658069	9658457	9658201	Y	PPP4R1	PPP4R1,RAB31	PPP4R1,VAPA,ANKRD12	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP4R1	44831	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr18	9705290	9705640	9705469	Y	NA	RAB31	NA	NA	NA	NA	RAB31	522	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr18	9711641	9712077	9711750	Y	PPP4R1,VAPA,RAB31	RAB31	NA	NA	NA	NA	RAB31	5479	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr18	9742767	9742849	9742828	Y	VAPA,RAB31	RAB31	TXNDC2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB31	36605	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr18	9743544	9744009	9743684	Y	VAPA,RAB31	RAB31	NA	NA	NA	NA	RAB31	37382	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.169865805464441
chr18	9753891	9754160	9754063	Y	VAPA,RAB31	RAB31	NA	NA	NA	NA	RAB31	47729	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.541428100186642
chr18	9755700	9755941	9755783	Y	RAB31	RAB31	TXNDC2,VAPA	IMR90	Hi-C	24141950	RAB31	49538	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	9758210	9758472	9758414	Y	PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	TXNDC2,VAPA	IMR90	Hi-C	24141950	RAB31	52048	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	9812085	9812326	9812208	Y	PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	NA	NA	NA	NA	VAPA	99673	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr18	9824351	9824715	9824532	Y	PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	TXNDC2,VAPA	IMR90	Hi-C	24141950	VAPA	87284	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr18	9828298	9828524	9828428	Y	RALBP1,PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	TXNDC2,VAPA	IMR90	Hi-C	24141950	VAPA	83475	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.559803336243666
chr18	9850282	9850437	9850360	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPA	61562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr18	9869849	9870152	9869995	Y	VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	41847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.508484303573841
chr18	9877272	9877635	9877453	Y	VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	34364	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.445481980647275
chr18	9899069	9899359	9899167	Y	NA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	12640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.360992117284943
chr18	9914998	9915501	9915128	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	2999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.77495572958234
chr18	10528233	10528593	10528264	Y	NA	NAPG	NA	NA	NA	NA	NAPG	4331	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr18	10543130	10543398	10543236	Y	NAPG	NAPG	NA	NA	NA	NA	NAPG	19228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	10544333	10544521	10544427	Y	NA	NAPG	NA	NA	NA	NA	NAPG	20431	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	10708268	10708433	10708298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	184366	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	10852460	10852708	10852534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	328558	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182052210831843
chr18	11431991	11432229	11432112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAL	254726	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr18	11490584	11490685	11490652	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAL	196270	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	11846235	11846388	11846281	Y	GNAL,GNAL	CHMP1B	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	3007	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	11849903	11850727	11850169	Y	MPPE1,CHMP1B	CHMP1B	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	508	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.46752630566509
chr18	11859926	11860218	11860181	Y	CHMP1B	CHMP1B,MPPE1	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	10531	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.51347148185478
chr18	11947272	11947721	11947412	Y	CHMP1B	MPPE1,IMPA2	IMPA2,GNAL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IMPA2	31303	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.70141900728639
chr18	11995516	11995787	11995574	Y	NA	IMPA2	NA	NA	NA	NA	IMPA2	16492	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	12092408	12092760	12092594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMPA2	113384	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	12288068	12288497	12288213	Y	NA	TUBB6	TUBB6	IMR90	Hi-C	24141950	TUBB6	17171	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr18	12306995	12307375	12307158	Y	CHMP1B	TUBB6	NA	NA	NA	NA	TUBB6	1327	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	12317654	12318000	12317871	Y	CHMP1B	TUBB6	NA	NA	NA	NA	TUBB6	11986	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	12336380	12336603	12336512	Y	NA	TUBB6,AFG3L2	NA	NA	NA	NA	TUBB6	30712	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	12408700	12408821	12408736	Y	NA	AFG3L2,SLMO1	SPIRE1	IMR90	Hi-C	24141950	SLMO1	2805	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr18	12471098	12471401	12471374	Y	PSMG2	NA	NA	NA	NA	NA	SLMO1	65203	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	12606965	12607268	12607096	Y	PTPN2,SPIRE1	AP005482.1,SPIRE1,PSMG2	NA	NA	NA	NA	AP005482.1	48774	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr18	12641281	12641332	12641311	Y	SPIRE1,SPIRE1,PSMG2	AP005482.1,SPIRE1,PSMG2	NA	NA	NA	NA	AP005482.1	14710	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	12763760	12763785	12763774	Y	CEP192,C18orf1	NA	PTPN2	IMR90	Hi-C	24141950	CEP76	62984	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	12837862	12838421	12838235	Y	PTPN2	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN2	89221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr18	12864190	12864369	12864245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN2	63273	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr18	12993260	12993605	12993433	Y	NA	SEH1L,CEP192	NA	NA	NA	NA	CEP192	3899	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr18	19090172	19090203	19090178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESCO1	88642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr18	19415827	19415836	19415832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIB1	132909	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	19774212	19774351	19774284	Y	GATA6	GATA6	NA	NA	NA	NA	GATA6	26808	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	19862450	19862773	19862669	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	GATA6	115046	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr18	20046739	20046926	20046743	Y	GATA6	NA	GATA6,CTAGE1	IMR90	Hi-C	24141950	GATA6	299335	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.198081069768355
chr18	20104385	20104397	20104392	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	271827	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	20139802	20140256	20140003	Y	GATA6	NA	CTAGE1,GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	235968	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr18	20254145	20254527	20254453	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	121697	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	20263132	20263811	20263406	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	112413	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	20274994	20275099	20275066	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	101125	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr18	20855209	20855599	20855401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CABLES1	142681	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.120163000724761
chr18	21165246	21165762	21165429	Y	C18orf8,NPC1	NPC1	NA	NA	NA	NA	NPC1	384	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr18	21228672	21228807	21228737	Y	LAMA3,ANKRD29	ANKRD29	NA	NA	NA	NA	ANKRD29	12042	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.232641094311301
chr18	21337339	21337459	21337412	Y	C18orf45	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD29	96490	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	21552370	21552656	21552582	Y	C18orf8,TTC39C,TTC39C	TTC39C	NA	NA	NA	NA	TTC39C	18081	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr18	21562247	21562750	21562607	Y	NA	TTC39C	TTC39C	IMR90	Hi-C	24141950	TTC39C	7987	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.953236135030749
chr18	23609881	23610142	23609962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SS18	59039	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	23624852	23624978	23624915	Y	NA	SS18	NA	NA	NA	NA	SS18	44203	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	23657156	23657540	23657507	Y	NA	SS18	NA	NA	NA	NA	SS18	11641	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr18	24107807	24108046	24107927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD1	127319	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	24120849	24120961	24120907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD1	114404	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	24237719	24238162	24238112	Y	NA	KCTD1	TAF4B,KCTD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KCTD1	2354	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.38832130284908
chr18	26231611	26231936	26231774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD1	1996246	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr18	28786845	28787168	28787084	Y	DSC3,DSC2,DSG3,DSG2,DSG1,DSC1	NA	DSC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	DSG2	288838	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr18	29092491	29092685	29092630	Y	DSC3,DSC2,DSG1,DSG2	DSG2	NA	NA	NA	NA	DSG2	16485	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr18	29542474	29542964	29542885	Y	RNF138	TRAPPC8	NA	NA	NA	NA	TRAPPC8	11375	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr18	29617639	29618031	29617775	Y	NA	RNF125	NA	NA	NA	NA	RNF125	21304	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	30862088	30862282	30862185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138	1192270	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	32239709	32239834	32239782	Y	MAPRE2,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA	NA	NA	NA	NA	NA	DTNA	168455	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr18	32289089	32289403	32289194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTNA	217835	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.299485870806977
chr18	32439346	32439714	32439476	Y	ZNF397,ZNF24,MAPRE2	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	115178	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	32671998	32672517	32672048	Y	MAPRE2,MAPRE2,ZNF397,ZNF24	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	117106	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	32674767	32675124	32674837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	119875	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr18	32829674	32829781	32829775	Y	ZNF397,ZSCAN30	ZNF397,ZSCAN30,ZNF271	NA	NA	NA	NA	ZNF397	10680	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	32906658	32906918	32906743	Y	NA	ZSCAN30,ZNF271,ZNF24,ZNF396	NA	NA	NA	NA	ZNF24	16528	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr18	32990022	32990156	32990089	Y	NA	ZNF396	GALNT1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF396	34721	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	33038926	33039146	33039052	Y	NA	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	36809	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr18	33040584	33040905	33040747	Y	NA	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	35050	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	33057648	33057699	33057650	Y	MAPRE2,MAPRE2,ZNF24,ZNF396,INO80C	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	18256	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr18	33073738	33073904	33073824	Y	NA	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	2051	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	33093148	33093751	33093628	Y	GALNT1	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	17193	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr18	33185452	33185527	33185471	Y	ZNF397,GALNT1	GALNT1	NA	NA	NA	NA	GALNT1	26371	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	33275532	33275916	33275719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT1	116451	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	33711406	33711801	33711526	Y	NA	SLC39A6,ELP2	NA	NA	NA	NA	ELP2	3999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr18	33737531	33737917	33737788	Y	NA	SLC39A6,ELP2,MOCOS	NA	NA	NA	NA	MOCOS	27565	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	33876540	33877026	33876703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MOCOS	111058	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr18	33878609	33878753	33878681	Y	FHOD3	NA	NA	NA	NA	NA	MOCOS	113127	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	34052267	34052344	34052306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MOCOS	286785	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	34406593	34406898	34406790	Y	NA	KIAA1328,TPGS2	NA	NA	NA	NA	KIAA1328	171	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr18	34532943	34533308	34533124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPGS2	125785	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr18	34915511	34915689	34915620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CELF4	228311	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	35000619	35000729	35000675	Y	CELF4	NA	NA	NA	NA	NA	CELF4	143271	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.676854032589683
chr18	35009721	35010039	35009931	Y	CELF4	NA	NA	NA	NA	NA	CELF4	133961	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr18	35024297	35024529	35024426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CELF4	119471	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr18	35028363	35028565	35028479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CELF4	115435	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.43051302140348
chr18	35066308	35066547	35066428	Y	CELF4	NA	NA	NA	NA	NA	CELF4	77453	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	37033966	37034182	37034037	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	120327	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	37101421	37101610	37101545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	187782	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr18	37151664	37151869	37151793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	238025	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr18	37629293	37629563	37629339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	715654	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	38447528	38447658	38447616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	1085513	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr18	39540677	39540940	39540809	Y	NA	PIK3C3	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	7506	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	42419261	42419416	42419316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETBP1	161123	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	43250326	43250536	43250381	Y	EPG5	NA	NA	NA	NA	NA	EPG5	294704	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr18	43373390	43373776	43373583	Y	PSTPIP2,EPG5	NA	SIGLEC15,SLC14A1,EPG5,SLC14A2	IMR90	Hi-C	24141950	EPG5	171464	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr18	43381768	43381900	43381886	Y	NA	NA	EPG5,SLC14A2,SLC14A1,SIGLEC15	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPG5	163340	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	43382830	43382969	43382904	Y	NA	NA	EPG5,SLC14A2,SLC14A1,SIGLEC15	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPG5	162271	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	43542357	43542726	43542619	Y	PSTPIP2,C18orf25,EPG5	EPG5	NA	NA	NA	NA	EPG5	2514	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	43608916	43609273	43609243	Y	PSTPIP2,EPG5	PSTPIP2	NA	NA	NA	NA	PSTPIP2	40965	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr18	43732950	43733330	43733193	Y	RNF165,C18orf25	C18orf25	NA	NA	NA	NA	C18orf25	18189	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.164024160336071
chr18	43874380	43874525	43874458	Y	NA	RNF165	RNF165,LOXHD1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF165	30247	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.750809496582622
chr18	44372138	44372406	44372272	Y	RNF165,PIAS2	NA	NA	NA	NA	NA	KATNAL2	123049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	44392877	44393138	44393020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KATNAL2	102317	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr18	44487034	44487390	44487355	Y	NA	KATNAL2,PIAS2	NA	NA	NA	NA	KATNAL2	8065	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	44605074	44605239	44605157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDHD2	69652	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	44675442	44676177	44675810	Y	NA	HDHD2,IER3IP1	NA	NA	NA	NA	HDHD2	551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.202426638448127
chr18	45420480	45420806	45420653	Y	NA	SMAD2	NA	NA	NA	NA	SMAD2	34709	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr18	45444466	45444807	45444662	Y	NA	SMAD2	NA	NA	NA	NA	SMAD2	10708	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr18	45454827	45455289	45455128	Y	NA	SMAD2	NA	NA	NA	NA	SMAD2	226	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18478155158147
chr18	45472001	45472124	45472045	Y	NA	SMAD2	SMAD2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SMAD2	16486	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20553894282687
chr18	45494348	45494736	45494572	Y	NA	SMAD2	NA	NA	NA	NA	SMAD2	38833	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.539428908627382
chr18	45529364	45529594	45529519	Y	NA	NA	SMAD2,ZBTB7C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD2	73849	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.636488140986231
chr18	45530162	45530545	45530368	Y	SMAD2,SMAD2	NA	SMAD2,ZBTB7C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD2	74647	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.614234673292234
chr18	45534549	45534809	45534718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	79034	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.317861106864
chr18	45541725	45542128	45542097	Y	SMAD2,SMAD2	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	86210	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.395049026717228
chr18	45687716	45687836	45687757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232201	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.72509653894863
chr18	45688048	45688324	45688110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232533	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.41651913209409
chr18	46066779	46067121	46067052	Y	CTIF	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	3362	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.303831439486748
chr18	46072108	46072320	46072224	Y	NA	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	8691	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	46213796	46213995	46213850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	150379	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	46253142	46253362	46253168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	189725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	46349762	46350033	46349891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD7	125048	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr18	46354445	46354549	46354497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD7	120532	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	46423062	46423579	46423314	Y	SMAD7	NA	SMAD7	MCF7	ChIA-PET	22265404	SMAD7	51502	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	46428346	46428737	46428479	Y	NA	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	46344	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	46456597	46456819	46456703	Y	SMAD7,SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	18262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	46461141	46461770	46461393	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	13311	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	46465508	46465942	46465798	Y	SMAD7,SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	9139	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	46478230	46479206	46479122	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	3149	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.581290876679432
chr18	46479420	46479772	46479694	Y	NA	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	4339	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr18	46482158	46482454	46482304	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	SMAD7	K562	ChIA-PET	22265404	SMAD7	7077	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	46502180	46502412	46502333	Y	SMAD7	SMAD7	SMAD7,CTIF	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SMAD7	27099	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.194968765389612
chr18	46518186	46518409	46518369	Y	NA	SMAD7	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD7	43105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.464970329523781
chr18	46519156	46519437	46519250	Y	DYM,SMAD7	SMAD7	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD7	44075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	46523478	46523814	46523611	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD7	48397	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210997624326124
chr18	46524155	46524830	46524741	Y	NA	SMAD7	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD7	49074	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr18	46543550	46543788	46543750	Y	NA	NA	SMAD7	MCF7	ChIA-PET	22265404	SMAD7	68469	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227912562002414
chr18	46547875	46548139	46548027	Y	NA	NA	SMAD7	MCF7	ChIA-PET	22265404	SMAD7	72794	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	6.20731292094573
chr18	47252630	47252839	47252704	Y	LIPG	NA	ACAA2,SCARNA17,MYO5B,LIPG	IMR90	Hi-C	24141950	ACAA2	85491	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	47325286	47325511	47325399	Y	NA	ACAA2	NA	NA	NA	NA	ACAA2	12819	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	47357197	47357543	47357370	Y	NA	ACAA2	NA	NA	NA	NA	ACAA2	18867	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr18	47785953	47786324	47786143	Y	NA	MBD1,CXXC1	NA	NA	NA	NA	MBD1	19820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr18	47794579	47794725	47794639	Y	NA	MBD1,CXXC1	NA	NA	NA	NA	MBD1	11419	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	48462357	48462700	48462360	Y	ME2	ELAC1,SMAD4	NA	NA	NA	NA	ELAC1	29661	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr18	48616016	48616044	48616031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD4	123606	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	48720847	48721238	48721193	Y	NA	MEX3C	NA	NA	NA	NA	MEX3C	21436	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	51883843	51884006	51883925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLI	90069	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr18	52613483	52613779	52613741	Y	NA	CCDC68	NA	NA	NA	NA	CCDC68	10960	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	53332836	53333181	53332979	Y	NA	TCF4	NA	NA	NA	NA	TCF4	2818	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	54070241	54070409	54070308	Y	NA	NA	TCF4,LOC100505474	IMR90	Hi-C	24141950	WDR7	246165	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	54487568	54487957	54487622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL1	170737	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr18	54745075	54745213	54745144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	355704	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	55095005	55095410	55095044	Y	ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	5507	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.43807777706015
chr18	55098490	55098766	55098627	Y	NA	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	2151	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.282187969501571
chr18	55101559	55101949	55101758	Y	NA	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr18	55102016	55102207	55102112	Y	ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	1099	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.265428961374692
chr18	55105190	55105288	55105239	Y	ST8SIA3,ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	4273	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr18	55108186	55108329	55108231	Y	NA	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	7269	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.282343899050982
chr18	55108837	55109086	55108936	Y	ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	7920	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr18	55109141	55109496	55109318	Y	ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	8224	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.377020976221455
chr18	55250571	55250884	55250819	Y	FECH	FECH,NARS	NA	NA	NA	NA	FECH	1120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	55267032	55267261	55267214	Y	NEDD4L	FECH,NARS	NA	NA	NA	NA	FECH	15028	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	55513608	55513807	55513708	Y	NA	ATP8B1	ATP8B1,NEDD4L,ALPK2	IMR90	Hi-C	24141950	ATP8B1	45275	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	55863542	55863917	55863628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	153943	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	55872819	55873190	55873005	Y	NEDD4L,NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	163220	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	55881305	55881780	55881408	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	171706	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	55889534	55890049	55889817	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	179935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	55890970	55891630	55891068	Y	NEDD4L,NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	181371	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr18	55929917	55930363	55930116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	220318	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr18	55957381	55957780	55957581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	247782	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	56339458	56339877	56339543	Y	MALT1	ALPK2,MALT1	NA	NA	NA	NA	MALT1	2840	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr18	56394566	56394962	56394680	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	MALT1	57948	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	56494810	56495111	56494923	Y	ALPK2	ZNF532	NA	NA	NA	NA	ZNF532	32721	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.219568610204122
chr18	56526446	56526759	56526519	Y	NA	ZNF532	NA	NA	NA	NA	ZNF532	1073	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr18	56537923	56538093	56537956	Y	ZNF532	ZNF532	NA	NA	NA	NA	ZNF532	10091	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr18	56631378	56631745	56631564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF532	103546	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	57541463	57541721	57541613	Y	NA	PMAIP1	PMAIP1,CCBE1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PMAIP1	23459	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	57572110	57572452	57572282	Y	PMAIP1	PMAIP1	NA	NA	NA	NA	PMAIP1	6930	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	57585799	57586003	57585903	Y	PMAIP1	PMAIP1	NA	NA	NA	NA	PMAIP1	20619	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr18	57620967	57621172	57621022	Y	NA	NA	PMAIP1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PMAIP1	55787	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	60117911	60118106	60117979	Y	KIAA1468,ZCCHC2	NA	PHLPP1,ZCCHC2	IMR90	Hi-C	24141950	ZCCHC2	70134	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	60118389	60118639	60118544	Y	KIAA1468,ZCCHC2	NA	PHLPP1,ZCCHC2	IMR90	Hi-C	24141950	ZCCHC2	69601	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr18	60172936	60173272	60173091	Y	NA	ZCCHC2	ZCCHC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZCCHC2	14968	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	60189219	60189514	60189362	Y	TNFRSF11A,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	979	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.356263584976056
chr18	60193382	60194139	60194065	Y	KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	5142	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.410191806913962
chr18	60221448	60221638	60221488	Y	NA	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	33208	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	60598497	60598585	60598560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLPP1	217825	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	60609893	60610245	60610069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLPP1	229221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	60877535	60878009	60877922	Y	SERPINB12,BCL2	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	107352	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	60886280	60886709	60886627	Y	BCL2	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	98652	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	60905272	60905593	60905493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	79768	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr18	60941193	60941490	60941349	Y	BCL2	BCL2	NA	NA	NA	NA	BCL2	43871	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	60979120	60979234	60979125	Y	BCL2	BCL2	NA	NA	NA	NA	BCL2	6127	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	61033511	61033750	61033687	Y	NA	BCL2,KDSR	NA	NA	NA	NA	KDSR	768	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.830690979117612
chr18	61085026	61085396	61085214	Y	VPS4B	VPS4B	NA	NA	NA	NA	VPS4B	2320	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr18	61121848	61122109	61121956	Y	SERPINB10,SERPINB12,SERPINB5	VPS4B,SERPINB5	NA	NA	NA	NA	SERPINB5	19885	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.579830578298698
chr18	61185797	61185958	61185852	Y	KDSR,SERPINB12	SERPINB5	NA	NA	NA	NA	SERPINB5	43803	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.395779175907595
chr18	61350519	61350880	61350698	Y	SERPINB5,SERPINB12,SERPINB3,SERPINB11	SERPINB4,SERPINB3	SERPINB10,SERPINB7	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINB3	23322	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.310403233805485
chr18	61549883	61550442	61550030	Y	VPS4B,SERPINB8,SERPINB2	SERPINB2,SERPINB10	SERPINB7	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINB10	11966	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	61565801	61566233	61565950	Y	NA	SERPINB2,SERPINB10	NA	NA	NA	NA	SERPINB10	3393	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	61852761	61853109	61852935	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERPINB8	217602	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	63434118	63434346	63434234	Y	CDH7	NA	NA	NA	NA	NA	DSEL	1747871	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.31986029842326
chr18	65434285	65434424	65434346	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSEL	252068	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	65945074	65945279	65945262	Y	NA	NA	LOC643542	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC102B	435167	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr18	66373953	66374204	66374079	Y	NA	CCDC102B,TMX3	NA	NA	NA	NA	CCDC102B	6242	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	66508189	66508486	66508312	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMX3	127654	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	67158128	67158224	67158176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTTN	712957	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	67862254	67862313	67862284	Y	NA	RTTN	NA	NA	NA	NA	RTTN	8868	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr18	67957012	67957306	67957264	Y	NA	SOCS6	NA	NA	NA	NA	SOCS6	2875	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.0072845084502
chr18	68004496	68004658	68004562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS6	50359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr18	68087534	68087889	68087601	Y	CD226,SOCS6	NA	RTTN,SOCS6	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS6	133397	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr18	68089361	68089784	68089523	Y	SOCS6	NA	RTTN,SOCS6	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS6	135224	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	70535937	70536272	70536159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO15	1276828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	71010965	71011298	71011132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO15	801802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	71730939	71731058	71731041	Y	FBXO15	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO15	82042	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	71819121	71819367	71819268	Y	C18orf55	FBXO15,TIMM21	NA	NA	NA	NA	TIMM21	5375	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	71916623	71916973	71916652	Y	CNDP2	CYB5A	NA	NA	NA	NA	CYB5A	40278	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	72676291	72676559	72676424	Y	ZNF407,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	242744	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr18	72704413	72704615	72704528	Y	TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	214688	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	72779359	72779673	72779506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	139630	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	72782580	72783607	72783115	Y	ZNF407,ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	135696	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr18	72837213	72837401	72837237	Y	NA	NA	ZNF407	IMR90	Hi-C	24141950	ZADH2	81902	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr18	72919537	72919929	72919697	Y	ZADH2	ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	ZADH2	234	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	72919988	72920296	72920123	Y	ZADH2,TSHZ1	ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	TSHZ1	414	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr18	73944750	73944917	73944845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	260560	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.418535758712255
chr18	74204839	74205357	74205296	Y	NA	RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	74277239	74277430	74277301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	71762	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.193352537459468
chr18	74292470	74292738	74292612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	86993	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr18	74766602	74767022	74766743	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	MBP	76617	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.61461763692135
chr18	74767033	74767545	74767189	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	MBP	76094	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	74768655	74769369	74768895	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	MBP	74270	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr18	74774000	74774964	74774473	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	MBP	68675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr18	74779066	74780013	74779875	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	MBP	63626	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr18	74783964	74784198	74784017	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	MBP	59441	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr18	74803559	74803662	74803615	Y	NA	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	39977	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	74805603	74805845	74805816	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	37794	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr18	74813361	74814191	74813850	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	29448	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr18	74816269	74816488	74816400	Y	NA	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	27151	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr18	74819276	74819721	74819374	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	23918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	74823541	74824614	74824455	Y	NA	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	19025	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	74829789	74830209	74830033	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	13430	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.124891533033648
chr18	74830215	74830809	74830560	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	12830	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227026483262636
chr18	74840150	74840705	74840388	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	2934	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	74841905	74842663	74842144	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	976	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr18	75149077	75149342	75149210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBP	305438	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr18	76831132	76831674	76831321	Y	NFATC1,NFATC1,ATP9B	ATP9B	NA	NA	NA	NA	ATP9B	3847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr18	77153646	77154504	77153944	Y	ATP9B,NFATC1,NFATC1	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr18	77331313	77331555	77331434	Y	NA	NA	NFATC1,ATP9B	IMR90	Hi-C	24141950	CTDP1	106246	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr18	77551694	77552094	77551810	Y	PQLC1,CTDP1	NA	KCNG2,PQLC1,CTDP1,RBFA,TXNL4A	IMR90	Hi-C	24141950	CTDP1	113893	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr18	77682652	77682872	77682762	Y	NA	PQLC1,HSBP1L1	NA	NA	NA	NA	PQLC1	26792	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	77715299	77715635	77715515	Y	NA	PQLC1,HSBP1L1	NA	NA	NA	NA	PQLC1	5635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr18	77936891	77937280	77937009	Y	CTDP1	NA	NA	NA	NA	NA	PARD6G	66149	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	289700	289869	289784	Y	C2CD4C,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	307	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.222297950953749
chr19	290136	290651	290316	Y	RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	743	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.348805711917541
chr19	481673	481793	481759	Y	PALM,HCN2,FGF22	MADCAM1,TPGS1,CDC34	NA	NA	NA	NA	MADCAM1	5383	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	488227	488667	488380	Y	NA	MADCAM1,TPGS1,CDC34	ODF3L2,SHC2,TPGS1,MADCAM1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	MADCAM1	1051	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	511222	511648	511350	Y	RNF126,GZMM	MADCAM1,TPGS1,CDC34	NA	NA	NA	NA	TPGS1	5923	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	532930	533293	533259	Y	C19orf6,C19orf22,ARID3A	MADCAM1,TPGS1,CDC34,BSG	NA	NA	NA	NA	CDC34	3216	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr19	555976	556322	556024	Y	NA	CDC34,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	12975	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.276729288002317
chr19	567332	567750	567473	Y	NA	CDC34,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	1547	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.284187161060831
chr19	573434	573573	573481	Y	ODF3L2,C19orf22,CDC34,BSG	CDC34,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	4137	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	661410	661735	661571	Y	HMHA1,GZMM,C19orf6,ABCA7,RNF126	POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM	NA	NA	NA	NA	RNF126	133	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	662216	662510	662281	Y	HMHA1,GZMM,C19orf6,C19orf22,ABCA7,RNF126	POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM	NA	NA	NA	NA	RNF126	939	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr19	675402	675838	675677	Y	FSTL3	POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM	NA	NA	NA	NA	FSTL3	1010	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.261586507805582
chr19	678997	679265	679214	Y	HCN2,PALM	POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM	NA	NA	NA	NA	FSTL3	4605	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	751766	752111	751822	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PALM,PTBP1	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42964	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.431296383720613
chr19	752652	753043	752777	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PALM,PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42032	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.2035223162087
chr19	753188	753320	753238	Y	C19orf20	PALM,PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	41755	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.24538428426076
chr19	778993	779222	779048	Y	GPX4,BSG,CNN2	PTBP1,MIR4745,AZU1	NA	NA	NA	NA	PTBP1	15853	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.225027291703376
chr19	782330	783005	782707	Y	NA	PTBP1,MIR4745,AZU1	NA	NA	NA	NA	PTBP1	12070	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	21.7075468178838
chr19	789308	789721	789469	Y	NA	PTBP1,MIR4745,AZU1,PRTN3	NA	NA	NA	NA	PTBP1	5354	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	791303	791398	791349	Y	NA	PTBP1,MIR4745,AZU1,PRTN3	NA	NA	NA	NA	PTBP1	3677	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr19	791656	792058	791976	Y	NA	PTBP1,MIR4745,AZU1,PRTN3	NA	NA	NA	NA	PTBP1	3017	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	800594	800755	800691	Y	NA	PTBP1,MIR4745,AZU1,PRTN3	NA	NA	NA	NA	MIR4745	2185	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	867005	867400	867203	Y	GPX4,GPX4,C19orf24,ATP5D,ODF3L2,C19orf20,BSG,POLRMT,CNN2,CFD	AZU1,PRTN3,CFD,MED16,RNU6-9,R3HDM4	NA	NA	NA	NA	CFD	9552	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr19	908605	908810	908775	Y	NA	MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A	NA	NA	NA	NA	R3HDM4	2430	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	925071	925217	925123	Y	NA	MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A	NA	NA	NA	NA	ARID3A	1290	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr19	928103	928378	928301	Y	SBNO2,MIDN,HMHA1,C19orf22,KISS1R,ARID3A	MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A	NA	NA	NA	NA	ARID3A	4322	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	934999	935434	935086	Y	MIDN,CIRBP	MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	ARID3A	11218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	980601	980803	980725	Y	NA	WDR18,RNU6-2,CNN2	NA	NA	NA	NA	WDR18	371	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr19	996390	996745	996544	Y	HMHA1,CIRBP,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7	WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7	NA	NA	NA	NA	WDR18	15216	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	1028160	1028923	1028240	Y	SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7	WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7,HMHA1	NA	NA	NA	NA	CNN2	3862	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.506102148385464
chr19	1069175	1069494	1069467	Y	C19orf22,C19orf6,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2	RNU6-2,CNN2,ABCA7,HMHA1,POLR2E,GPX4	NA	NA	NA	NA	HMHA1	5253	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	1085284	1085426	1085350	Y	C19orf22,ARID3A,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2	ABCA7,HMHA1,POLR2E,GPX4	NA	NA	NA	NA	POLR2E	8172	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	1101850	1102062	1101942	Y	C19orf6,MIDN,HMHA1,SBNO2,SBNO2	HMHA1,POLR2E	NA	NA	NA	NA	GPX4	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr19	1126082	1126504	1126271	Y	MIDN,SBNO2,SBNO2	POLR2E,GPX4,SBNO2	NA	NA	NA	NA	GPX4	24146	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	1140329	1140530	1140433	Y	NA	POLR2E,GPX4,SBNO2	NA	NA	NA	NA	SBNO2	31752	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	1161691	1161983	1161922	Y	NA	SBNO2	NA	NA	NA	NA	SBNO2	10299	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr19	1169743	1170349	1170015	Y	NA	SBNO2	NA	NA	NA	NA	SBNO2	1933	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.20682587659929
chr19	1171027	1171165	1171096	Y	NA	SBNO2	NA	NA	NA	NA	SBNO2	1117	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr19	1171933	1172315	1172045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SBNO2	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr19	1172839	1173266	1172915	Y	CFD,ATP5D,GPX4,GPX4	SBNO2	NA	NA	NA	NA	SBNO2	557	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.430566234530246
chr19	1183874	1184237	1184064	Y	SBNO2	SBNO2	ATP5D,MIDN,SBNO2,STK11,GPX4	MCF7	ChIA-PET	22265404	SBNO2	11592	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.464396109882825
chr19	1189532	1189666	1189566	Y	NA	SBNO2,C19orf26	NA	NA	NA	NA	SBNO2	17250	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr19	1240232	1240534	1240365	Y	MUM1,APC2,C19orf26	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	ATP5D	483	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.194968765389612
chr19	1252961	1253429	1253036	Y	C19orf22,ARID3A,CNN2,ABCA7,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3955	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.625690929469269
chr19	1260732	1261171	1260912	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3348	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.709641899653074
chr19	1262305	1262850	1262469	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	CIRBP	4921	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.17753327754376
chr19	1265810	1266064	1265967	Y	C19orf6,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6962	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.862748696990636
chr19	1400453	1400832	1400746	Y	NA	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	GAMT	884	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	1408607	1408695	1408655	Y	CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3039	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.341347838859027
chr19	1408835	1409120	1409078	Y	NA	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3267	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	1410481	1410741	1410600	Y	NA	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	4913	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	1411862	1412243	1411999	Y	HMHA1,CIRBP,REXO1	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	6294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	1445282	1445452	1445336	Y	C19orf26,EFNA2,MUM1,APC2	GAMT,DAZAP1,RPS15,C19orf25,PCSK4,REEP6	NA	NA	NA	NA	RPS15	8924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr19	1453873	1454140	1454045	Y	C19orf26,MUM1,APC2	DAZAP1,RPS15,C19orf25,PCSK4,REEP6	NA	NA	NA	NA	RPS15	17515	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr19	1651371	1651730	1651556	Y	NA	UQCR11,TCF3	NA	NA	NA	NA	TCF3	767	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr19	1672372	1672532	1672504	Y	NA	TCF3	TCF3,ONECUT3,REXO1,LOC100288123,ATP8B3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TCF3	21768	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr19	1725719	1725877	1725796	Y	C19orf26,MUM1,APC2	NA	TCF3,C19orf25,ONECUT3,PLK5,UQCR11,ATP8B3,LOC100288123,REXO1	IMR90	Hi-C	24141950	TCF3	75115	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr19	1747200	1747550	1747426	Y	PLEKHJ1,DAZAP1,RPS15,ONECUT3	NA	TCF3,ONECUT3,ADAMTSL5,PLK5,UQCR11,ATP8B3,REXO1,LOC100288123	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP8B3	62725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.225913370443154
chr19	1855247	1855761	1855485	Y	SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	5806	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.377751125411822
chr19	1942393	1942508	1942451	Y	OAZ1,DOT1L,C19orf35,MOBKL2A,MKNK2,REXO1,KLF16,CSNK1G2	SCAMP4,ADAT3,AC012615.1,CSNK1G2	NA	NA	NA	NA	CSNK1G2	3205	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.149994492958819
chr19	2032329	2032652	2032524	Y	LINGO3,C19orf35	BTBD2,MKNK2	NA	NA	NA	NA	BTBD2	228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.2971037156186
chr19	2049976	2050209	2050080	Y	OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MOBKL2A,MKNK2	BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	733	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr19	2056461	2056895	2056707	Y	OAZ1,C19orf35,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	7218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.00566828052006
chr19	2059605	2060167	2060113	Y	REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2	BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	10362	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.29458397388977
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.33933121224086
chr19	2162744	2162943	2162860	Y	CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	280	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	2165096	2165788	2165320	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	2632	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.415423454333511
chr19	2167436	2167667	2167594	Y	CSNK1G2,GADD45B,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	4972	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr19	2168320	2168637	2168529	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	5856	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	2168890	2169464	2169082	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	6426	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	2264561	2264657	2264590	Y	TMPRSS9,SPPL2B	SF3A2,PLEKHJ1,OAZ1	NA	NA	NA	NA	OAZ1	2828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	2494705	2495117	2494880	Y	DOT1L,GADD45B	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	20585	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	2507206	2507458	2507335	Y	DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B	GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	33086	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.325701943551631
chr19	2524971	2525260	2525066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	50851	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.486996763138074
chr19	2528875	2529093	2529033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	54755	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr19	2529574	2529858	2529677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	55454	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.294757338498089
chr19	2540691	2541097	2540881	Y	TIMM13	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	66571	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.268541265753436
chr19	2543618	2543970	2543682	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	69498	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.27399994725269
chr19	2578988	2579272	2579256	Y	TMPRSS9	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	104868	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr19	2599036	2599584	2599134	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	DIRAS1	119832	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	2950130	2950295	2950189	Y	NA	ZNF77,TLE6	THOP1,ZNF555,ZNF554,ZNF57,ZNF77,TLE6,AES,TLE2,GNA11,S1PR4,NCLN,GNA15,CELF5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF77	7161	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	2974450	2974580	2974523	Y	NFIC,TLE2,TLE2	ZNF77,TLE6	NA	NA	NA	NA	TLE6	864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	3035530	3035851	3035686	Y	NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2	TLE2,AES	NA	NA	NA	NA	TLE2	9782	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.90766975629466
chr19	3153392	3153939	3153476	Y	GNA15,FZR1	GNA15,NCLN	NA	NA	NA	NA	GNA15	19201	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	3154006	3154458	3154241	Y	GNA15,FZR1,S1PR4	GNA15,NCLN	NA	NA	NA	NA	GNA15	19815	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr19	3177322	3177366	3177344	Y	AES,S1PR4	GNA15,NCLN	NA	NA	NA	NA	NCLN	6195	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr19	3231384	3231772	3231576	Y	ZNF555,ZNF77,TLE2,C19orf29,CELF5,CELF5	NCLN	NA	NA	NA	NA	NCLN	47823	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	3338656	3338812	3338733	Y	NA	NFIC	ZNF77,CELF5,NFIC,DOHH,FZR1,C19orf77,C19orf29-AS1,GIPC3,TBXA2R,C19orf29,PIP5K1C,APBA3,MRPL54	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFIC	18749	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr19	3344211	3344472	3344340	Y	TLE2,TLE2,TLE2,AES,GNA11,PIP5K1C,DOHH,DOHH,NFIC,NFIC	NFIC	NFIC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	NFIC	13089	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr19	3360183	3360356	3360294	Y	TLE2,TLE2,TLE2,AES,CELF5,CELF5,MATK,FZR1,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	2622	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.535586455058272
chr19	3360896	3361804	3361247	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	3335	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.312402425364746
chr19	3367171	3367852	3367502	Y	NFIC,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	9610	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.780258025187565
chr19	3369394	3369884	3369615	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	11833	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	3387730	3388119	3388011	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	30169	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.293644225678606
chr19	3398670	3398894	3398830	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	41109	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	3428769	3429112	3428821	Y	TLE2,NFIC	C19orf77	NA	NA	NA	NA	C19orf77	49428	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr19	3450938	3451227	3451079	Y	GNA15	C19orf77,DOHH	NA	NA	NA	NA	C19orf77	27313	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	3503082	3503292	3503139	Y	TLE2,S1PR4,DOHH,DOHH,FZR1	C19orf77,DOHH,FZR1	NA	NA	NA	NA	FZR1	979	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	3520804	3521051	3520913	Y	NA	C19orf77,DOHH,FZR1,HMG20B	NA	NA	NA	NA	FZR1	16533	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr19	3521162	3521389	3521298	Y	FZR1	C19orf77,DOHH,FZR1,HMG20B	NA	NA	NA	NA	FZR1	16891	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18278236002221
chr19	3551628	3551981	3551925	Y	NA	FZR1,HMG20B,MFSD12	NA	NA	NA	NA	HMG20B	18794	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	3555158	3555442	3555300	Y	C19orf28	HMG20B,MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	HMG20B	15333	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr19	3562421	3562565	3562489	Y	NA	HMG20B,MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	HMG20B	8210	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.9539850835747
chr19	3570616	3571018	3570829	Y	C19orf28,HMG20B,GIPC3	MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	HMG20B	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.396665254647372
chr19	3607748	3607951	3607883	Y	NA	HMG20B,MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	TBXA2R	2910	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.331160625050885
chr19	3670243	3670423	3670333	Y	NFIC	PIP5K1C	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	28054	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr19	3693047	3693257	3693152	Y	RAX2	PIP5K1C	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	5220	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	3923611	3923782	3923733	Y	ITGB1BP3	ATCAY,DAPK3	NA	NA	NA	NA	DAPK3	45339	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	4008398	4008778	4008498	Y	MATK,ZFR2,ATCAY	DAPK3,SNORD37,EEF2,PIAS4	NA	NA	NA	NA	PIAS4	2754	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr19	4052414	4052757	4052628	Y	CCDC94,ZBTB7A	PIAS4,ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	12186	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	4053092	4053572	4053301	Y	CCDC94,ZBTB7A	PIAS4,ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	11371	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	4057405	4058198	4058044	Y	CCDC94,ZBTB7A	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	6745	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr19	4059413	4059635	4059428	Y	CCDC94	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	5308	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	4059877	4060289	4060128	Y	SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	4654	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	4061604	4061945	4061775	Y	SEMA6B,PLIN5	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	2998	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr19	4061996	4062359	4062178	Y	NA	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	2584	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	4064154	4064453	4064218	Y	SEMA6B,MATK	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	490	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr19	4064475	4064868	4064603	Y	SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	75	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr19	4089074	4089290	4089084	Y	NA	ZBTB7A,MAP2K2	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	24131	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr19	4123124	4123351	4123249	Y	MATK,ZFR2,ATCAY	MAP2K2,CREB3L3	NA	NA	NA	NA	MAP2K2	998	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.1996972976985
chr19	4375126	4375688	4375404	Y	NA	MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	22856	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr19	4375735	4376107	4375790	Y	ZBTB7A,EBI3	MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	22437	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	4379386	4379764	4379673	Y	NA	MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	18780	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	4393849	4394251	4394129	Y	NA	SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	4293	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	4456035	4456301	4456168	Y	NA	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	216	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	4567148	4567365	4567215	Y	TICAM1,SEMA6B	PLIN5,LRG1	NA	NA	NA	NA	LRG1	28662	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	4575288	4575908	4575613	Y	CCDC94,TICAM1,SEMA6B	PLIN5,LRG1	EBI3,CCDC94,ANKRD24,TNFAIP8L1,C19orf10	IMR90	Hi-C	24141950	LRG1	36802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.252512406816923
chr19	4593399	4593778	4593587	Y	SEMA6B,TICAM1	TNFAIP8L1	EBI3,CCDC94,ANKRD24,TNFAIP8L1,C19orf10	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP8L1	43752	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	4620862	4621172	4621017	Y	NA	TNFAIP8L1,C19orf10	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L1	16358	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	4636294	4636441	4636384	Y	ANKRD24,SH3GL1,SH3GL1,SEMA6B,TICAM1,TNFAIP8L1,TNFAIP8L1	TNFAIP8L1,C19orf10	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L1	1089	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	4812881	4813376	4813265	Y	SEMA6B,TICAM1	MIR7-3HG,FEM1A,TICAM1	NA	NA	NA	NA	TICAM1	16340	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr19	4870294	4870493	4870397	Y	SEMA6B,TICAM1	TICAM1,PLIN3,UHRF1	NA	NA	NA	NA	PLIN3	4514	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr19	4912030	4912419	4912247	Y	NA	PLIN3,UHRF1	NA	NA	NA	NA	UHRF1	10938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr19	4976440	4976890	4976638	Y	TICAM1,KDM4B	KDM4B	NA	NA	NA	NA	KDM4B	9315	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	5046594	5046918	5046679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4B	79469	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.290375991750453
chr19	5048305	5048678	5048483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4B	81180	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	5091152	5091532	5091191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4B	124027	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	5287522	5287818	5287647	Y	NA	RPL32P34	NA	NA	NA	NA	RPL32P34	11777	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	5336072	5336705	5336347	Y	PTPRS	PTPRS	NA	NA	NA	NA	PTPRS	2109	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr19	5339517	5339797	5339748	Y	HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,PTPRS	PTPRS	NA	NA	NA	NA	PTPRS	703	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr19	5578316	5578496	5578453	Y	NA	SAFB,SAFB2	NA	NA	NA	NA	SAFB	42550	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	5624052	5624252	5624226	Y	VMAC,RFX2,DUS3L,SAFB2,SAFB	SAFB,SAFB2,RPL36	NA	NA	NA	NA	SAFB2	1995	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	5804044	5804378	5804211	Y	NA	DUS3L,FUT3	NDUFA11,DUS3L,NRTN,LONP1,CATSPERD,RANBP3,LOC100128568,FUT6,VMAC,PRR22,FUT3,RFX2,FUT5,CAPS	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DUS3L	14795	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr19	6076501	6076965	6076757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	100348	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	6108691	6108922	6108748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88661	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	6108978	6109271	6109224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88312	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr19	6111447	6111675	6111584	Y	SAFB2,SAFB,RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	85908	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	6189136	6189412	6189274	Y	NA	RFX2	NA	NA	NA	NA	RFX2	8171	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	6271729	6272422	6272353	Y	NDUFA11,MLLT1	MLLT1	NA	NA	NA	NA	MLLT1	5537	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.412694113583884
chr19	6273754	6274259	6273940	Y	VAV1,GPR108,DENND1C,RFX2,MLLT1	MLLT1	NA	NA	NA	NA	MLLT1	3700	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.268158302124319
chr19	6423549	6423953	6423663	Y	NA	GTF2F1,KHSRP,CRB3,SLC25A23	NA	NA	NA	NA	KHSRP	744	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	6516969	6517178	6517079	Y	NA	TUBB4A,TNFSF9	TNFSF9	K562	ChIA-PET	22265404	TNFSF9	11832	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr19	6577471	6577956	6577654	Y	DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70	TNFSF9	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	48461	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.678123074958577
chr19	6579838	6580006	6579922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	50828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	6600003	6600291	6600148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	70993	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	6601519	6601863	6601720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	72509	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.242672378570032
chr19	6674780	6675150	6675080	Y	DENND1C,TNFSF9,VAV1,EMR1,TNFSF14	NA	NA	NA	NA	NA	C3	53423	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	6708735	6709024	6708902	Y	C3	C3,GPR108,TRIP10	NA	NA	NA	NA	C3	19549	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr19	6766042	6766297	6766158	Y	NA	C3,GPR108,TRIP10,SH2D3A,VAV1	NA	NA	NA	NA	SH2D3A	443	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	7197339	7197547	7197388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSR	94498	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr19	7445572	7445841	7445694	Y	ZNF557,XAB2,STXBP2,PNPLA6,LOC100131801,EVI5L,ARHGEF18	ARHGEF18	INSR,ARHGEF18	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGEF18	12158	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	7456079	7456435	7456169	Y	NA	ARHGEF18	NA	NA	NA	NA	ARHGEF18	1564	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr19	7525376	7525563	7525475	Y	NA	C19orf45,PEX11G	NA	NA	NA	NA	C19orf45	30299	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.315131766114373
chr19	7547905	7548376	7548024	Y	STXBP2,CD209,PEX11G,MCOLN1	C19orf45,PEX11G,ZNF358,MCOLN1,PNPLA6	NA	NA	NA	NA	C19orf45	7486	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.391936722338485
chr19	7588336	7588755	7588571	Y	PEX11G,MCOLN1	C19orf45,PEX11G,ZNF358,MCOLN1,PNPLA6	NA	NA	NA	NA	MCOLN1	2824	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	7608551	7608716	7608681	Y	PEX11G,MCOLN1,PNPLA6,C19orf59,STXBP2	PEX11G,ZNF358,MCOLN1,PNPLA6	NA	NA	NA	NA	PNPLA6	11661	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	7746304	7746484	7746360	Y	ARHGEF18,PEX11G,MCOLN1,PNPLA6,XAB2,LOC100131801,STXBP2,MAP2K7,EVI5L,RETN,C19orf59	STXBP2,TRAPPC5,FCER2	NA	NA	NA	NA	TRAPPC5	2575	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr19	7907381	7907869	7907475	Y	PNPLA6,PNPLA6,KIAA1543,FBN3,LASS4,EVI5L,FLJ22184,CTXN1	EVI5L,LRRC8E	NA	NA	NA	NA	EVI5L	14262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	8060665	8061040	8060896	Y	FLJ22184,FBN3	ELAVL1	NA	NA	NA	NA	ELAVL1	7503	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	8115456	8115774	8115631	Y	PRAM1,STXBP2,C19orf59	ELAVL1	NA	NA	NA	NA	ELAVL1	46913	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.73478063764611
chr19	8226134	8226320	8226231	Y	NA	CERS4	FBN3,TIMM44	IMR90	Hi-C	24141950	CERS4	43300	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.159295628027183
chr19	8272965	8273383	8273152	Y	NA	CERS4	NA	NA	NA	NA	CERS4	3345	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	8426850	8427217	8427032	Y	LOC645781,ANGPTL4	RPS28,NDUFA7,KANK3,ANGPTL4,RAB11B,MARCH2	NA	NA	NA	NA	ANGPTL4	677	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.239212888630038
chr19	8488784	8489136	8488939	Y	PRAM1,MYO1F	RAB11B,MARCH2,HNRNPM	NA	NA	NA	NA	MARCH2	12630	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	8518703	8518940	8518821	Y	NA	MARCH2,HNRNPM	NA	NA	NA	NA	HNRNPM	11052	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	8676425	8676449	8676437	Y	NA	ADAMTS10	NA	NA	NA	NA	ADAMTS10	2805	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	8989058	8989241	8989188	Y	ZNF177,ACTL9,MUC16,OR7G1	ZNF558	NA	NA	NA	NA	ZNF558	48054	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	9095662	9095964	9095813	Y	NA	MUC16	NA	NA	NA	NA	MUC16	5644	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr19	9119402	9119531	9119475	Y	NA	MUC16	NA	NA	NA	NA	MUC16	29384	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	9120594	9120838	9120762	Y	MUC16	MUC16	NA	NA	NA	NA	MUC16	30576	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr19	9128934	9129115	9129008	Y	NA	MUC16	NA	NA	NA	NA	MUC16	38916	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.757884406012021
chr19	9420483	9420931	9420837	Y	NA	ZNF559	NA	NA	NA	NA	ZNF559	11517	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.124891533033648
chr19	9747838	9748099	9747855	Y	ZNF559,ZNF559,ZNF846	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF561	17763	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	9776683	9777096	9776903	Y	OR7D4,ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF177,ZNF426,ZNF121,ZNF846,OLFM2	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	6680	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	9777343	9777681	9777659	Y	ZNF559,ZNF559,ZNF177,ZNF846	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	6095	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr19	9783821	9783976	9783959	Y	NA	ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	45	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.229755824012263
chr19	9902440	9902843	9902543	Y	ZNF699,ZNF266,ICAM1,ZNF846	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	33649	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	10148101	10148280	10148177	Y	NA	C19orf66	NA	NA	NA	NA	C19orf66	46518	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	10215832	10216068	10215900	Y	S1PR5,S1PR5,ANGPTL6	C19orf66,PPAN-P2RY11,PPAN,SNORD105B,EIF3G	NA	NA	NA	NA	PPAN	867	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	10304383	10304612	10304534	Y	TYK2,KRI1,ILF3	S1PR2,DNMT1	PPAN-P2RY11,EIF3G	MCF7	ChIA-PET	22265404	S1PR2	35336	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	10317020	10317257	10317138	Y	NA	S1PR2,DNMT1,MRPL4	DNMT1	IMR90	Hi-C	24141950	S1PR2	22691	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	10352370	10352740	10352555	Y	KRI1,ILF3,PPAN,RAVER1,MRPL4,DNMT1	S1PR2,DNMT1,MRPL4,ICAM1,ICAM5	MRPL4,ICAM1	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL4	7837	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	10513154	10513331	10513243	Y	ICAM1,DNM2,C19orf38,TYK2,PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	940	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	10515339	10515636	10515481	Y	PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	3125	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr19	10523082	10523284	10523181	Y	C19orf66,ICAM3,S1PR5,S1PR5,ATG4D,TYK2	TYK2,MIR1181	CDC37	K562	ChIA-PET	22265404	MIR1181	10868	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	10529596	10529758	10529677	Y	NA	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	17382	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	10678483	10678588	10678537	Y	TYK2,KRI1	ATG4D,KRI1,CDKN2D,SLC44A2	NA	NA	NA	NA	CDKN2D	748	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	10715339	10715596	10715546	Y	ICAM3,TYK2,PDE4A,DNM2,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2	KRI1,CDKN2D,SLC44A2,ILF3	NA	NA	NA	NA	SLC44A2	4206	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.123778420214165
chr19	10723101	10723460	10723261	Y	NA	KRI1,CDKN2D,SLC44A2,ILF3	NA	NA	NA	NA	SLC44A2	11968	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.189510083890358
chr19	10766466	10766790	10766534	Y	NA	ILF3,QTRT1	NA	NA	NA	NA	ILF3	3529	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	10829647	10829946	10829894	Y	ICAM3,TYK2,S1PR5,S1PR5,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2,C19orf38,DNM2	QTRT1,DNM2	NA	NA	NA	NA	DNM2	2892	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	10949257	10949551	10949405	Y	CDC37,KEAP1,KRI1,ILF3,QTRT1,DNM2,SPC24,SMARCA4,SMARCA4	TMED1,CARM1	NA	NA	NA	NA	TMED1	4263	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	10983653	10983862	10983766	Y	CARM1	TMED1,CARM1	NA	NA	NA	NA	CARM1	3464	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	11044199	11044446	11044323	Y	NA	YIPF2,C19orf52,SMARCA4	NA	NA	NA	NA	C19orf52	6790	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.123778420214165
chr19	11202212	11202837	11202668	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.154567095718296
chr19	11205696	11206011	11205901	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	7658	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309290120986003
chr19	11206953	11207150	11207057	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	8915	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr19	11248443	11248964	11248826	Y	NA	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	15520	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.477312664440594
chr19	11253262	11253482	11253341	Y	TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	11002	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.268158302124319
chr19	11253991	11254271	11254206	Y	PRKCSH,ECSIT,TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	10213	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.385591962099453
chr19	11404382	11404791	11404593	Y	ACP5,ACP5,C19orf38,LPPR2,CCDC159	DOCK6,CCDC159	NA	NA	NA	NA	DOCK6	33225	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.180053019272583
chr19	11449020	11449400	11449210	Y	NA	CCDC159,RAB3D,TMEM205,SWSAP1,EPOR	NA	NA	NA	NA	CCDC159	3960	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	11641329	11641510	11641441	Y	ZNF491,ZNF441,CCDC151,ELAVL3,ZNF653	ZNF653,CTC-398G3.2,ECSIT,ELOF1,ZNF627	NA	NA	NA	NA	ECSIT	3340	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	11925678	11926080	11925867	Y	NA	ZNF441,ZNF440	NA	NA	NA	NA	ZNF440	2579	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr19	12065633	12065838	12065735	Y	NA	ZNF700,ZNF763	NA	NA	NA	NA	ZNF763	31743	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	12724614	12724901	12724730	Y	ZNF136,ZNF44,ZNF563,ZNF564,JUNB,C19orf43,ZNF490,ZNF791,MAN2B1	ZNF791,ZNF490,CTD-2192J16.15	NA	NA	NA	NA	ZNF791	4882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	12844296	12844608	12844453	Y	NA	FBXW9,SNORD41,TNPO2,C19orf43,ASNA1	NA	NA	NA	NA	C19orf43	707	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.89972711113445
chr19	12889371	12889726	12889619	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10584	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.429836085339879
chr19	12892961	12894040	12893343	Y	ZNF44,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	6270	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.206269092017237
chr19	12894545	12895330	12894818	Y	ZNF44,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	4980	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.428722972520397
chr19	12895349	12896178	12895559	Y	ZNF563,JUNB	ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	4132	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr19	12896372	12896781	12896659	Y	ZNF44,ZNF564,ZNF490,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,STX10,LYL1,DNASE2,JUNB	JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	3529	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr19	12896870	12897372	12897198	Y	ZNF44,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,STX10,LYL1,DNASE2,JUNB	JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	2938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	12899457	12901460	12900777	Y	NA	PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.01969794789731
chr19	12901644	12901726	12901699	Y	NA	JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	1334	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	12929124	12929310	12929217	Y	NA	JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	MAST1	13455	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr19	13006078	13006409	13006086	Y	NA	HOOK2,DNASE2,GCDH,SYCE2,FARSA,CALR,RAD23A	NA	NA	NA	NA	GCDH	6238	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	13024998	13025376	13025029	Y	NA	HOOK2,DNASE2,GCDH,SYCE2,FARSA,CALR,RAD23A,GADD45GIP1	NA	NA	NA	NA	SYCE2	2714	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	13048278	13048689	13048364	Y	MAN2B1	GCDH,SYCE2,FARSA,CALR,RAD23A,GADD45GIP1	NA	NA	NA	NA	CALR	886	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	13094405	13094796	13094616	Y	ZNF709,TNPO2,TNPO2,MAST1,DAND5	CALR,RAD23A,GADD45GIP1,NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	9626	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	13143095	13143350	13143204	Y	WDR83,FBXW9,TNPO2,TNPO2	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	38673	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr19	13147424	13147812	13147700	Y	WDR83,FBXW9,TNPO2,TNPO2	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	43002	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr19	13231642	13232105	13231971	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	4725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	13232387	13232613	13232547	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	5470	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	13232805	13233031	13232944	Y	WDR83,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	5888	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	13238145	13238217	13238180	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	11228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.677584181780049
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.12527495300739
chr19	13273540	13274187	13273840	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	14311	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.806857061561334
chr19	13274586	13275096	13274696	Y	GADD45GIP1,NACC1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	15357	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.405966389715736
chr19	13275397	13275802	13275486	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	16168	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.552345463185151
chr19	13278382	13278991	13278445	Y	BEST2,JUNB,LYL1,STX10	STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	19153	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.3178436718051
chr19	13783472	13783589	13783575	Y	NA	NA	CACNA1A	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC130	56985	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	13907523	13907866	13907763	Y	NA	MRI1,C19orf53,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	3249	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.147265152209192
chr19	13944359	13944683	13944571	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15	ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	40085	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr19	13954357	13954714	13954441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	50083	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.303831439486748
chr19	13955108	13955589	13955298	Y	CCDC130,RFX1,DCAF15,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	50834	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.628647304298601
chr19	13957204	13959386	13957586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	52930	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146379073469414
chr19	13972364	13973309	13972780	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	41705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.627534191479119
chr19	13976745	13977653	13977105	Y	CACNA1A,RFX1,LPHN1,ZSWIM4,C19orf57	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	37361	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	13995440	13995781	13995611	Y	NA	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	19233	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	14097142	14097697	14097482	Y	CCDC130,PKN1,DDX39A,CD97,DCAF15,RFX1,IL27RA	DCAF15,PODNL1,RFX1,IL27RA	NA	NA	NA	NA	RFX1	18154	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	14241315	14241555	14241521	Y	NA	SAMD1,PRKACA,ASF1B	NA	NA	NA	NA	ASF1B	4213	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr19	14315596	14315828	14315635	Y	NA	LPHN1	NA	NA	NA	NA	LPHN1	597	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	14485924	14486626	14486057	Y	NA	CD97,DDX39A	DDX39A	K562	ChIA-PET	22265404	CD97	2687	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.272886834433207
chr19	14493470	14493891	14493578	Y	ZNF333,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,CD97,DDX39A	CD97,DDX39A,PKN1	NA	NA	NA	NA	CD97	4157	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	14499980	14500202	14500091	Y	OR7A17,ZNF333,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,CD97	CD97,DDX39A,PKN1	NA	NA	NA	NA	CD97	10667	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	14545997	14546246	14546106	Y	NA	DDX39A,PKN1	NA	NA	NA	NA	PKN1	4132	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	14570486	14570855	14570729	Y	OR7C2,ZNF333,IL27RA,DDX39A,PKN1	DDX39A,PKN1,GIPC1	NA	NA	NA	NA	PKN1	28621	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	14616908	14617174	14617017	Y	GIPC1	GIPC1,TECR,DNAJB1	GIPC1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TECR	8723	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.606429614672468
chr19	14636614	14636887	14636775	Y	OR7C2	GIPC1,TECR,DNAJB1,NDUFB7	NA	NA	NA	NA	DNAJB1	1695	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	14661096	14661426	14661346	Y	NA	TECR,DNAJB1,NDUFB7	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	19448	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	14670632	14670897	14670765	Y	NA	TECR,DNAJB1,NDUFB7	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	9977	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	14732511	14733275	14733016	Y	SYDE1	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	51637	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.377751125411822
chr19	14869692	14869911	14869839	Y	NA	EMR2,AC005255.3	NA	NA	NA	NA	EMR2	17442	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr19	14895618	14895793	14895687	Y	CD97,DDX39A,PKN1,DNAJB1,EMR3,ZNF333,EMR2	EMR2,AC005255.3	NA	NA	NA	NA	AC005255.3	5328	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	14999338	14999543	14999395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005255.3	98217	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	15321082	15321623	15321224	Y	RASAL3	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	11290	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.415423454333511
chr19	15492858	15492952	15492905	Y	NA	AKAP8,AKAP8L	NA	NA	NA	NA	AKAP8	4249	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	15505627	15505808	15505718	Y	NA	AKAP8,AKAP8L	NA	NA	NA	NA	AKAP8	17018	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	15944737	15944873	15944829	Y	OR10H2,OR10H3,OR10H4	UCA1	NA	NA	NA	NA	UCA1	6966	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr19	15947617	15948119	15947980	Y	AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1	UCA1	NA	NA	NA	NA	UCA1	9846	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.458398535205044
chr19	16181046	16181841	16181607	Y	OR10H2,OR10H3,OR10H4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	5215	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.164024160336071
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.51955759612176
chr19	16205409	16205807	16205414	Y	EPS15L1,RAB8A,HSH2D	TPM4,RAB8A,HSH2D	NA	NA	NA	NA	RAB8A	14632	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	16229373	16229857	16229589	Y	NA	RAB8A,HSH2D	NA	NA	NA	NA	RAB8A	8934	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	16230487	16230565	16230516	Y	TPM4	RAB8A,HSH2D	NA	NA	NA	NA	RAB8A	10048	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	16364400	16364769	16364668	Y	NWD1	NA	NA	NA	NA	NA	AP1M1	58011	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	16403791	16404489	16404426	Y	NA	KLF2	AP1M1,KLF2,EPS15L1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF2	29139	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr19	16441306	16441578	16441415	Y	RAB8A,HSH2D,MED26,EPS15L1,KLF2	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	7678	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	16442138	16442160	16442149	Y	NA	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	8510	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	16477143	16477842	16477298	Y	MED26,KLF2	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	43515	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	16482225	16482879	16482589	Y	MED26,KLF2	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	48597	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	16492713	16493267	16492962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF2	59085	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	16560891	16561165	16561157	Y	NA	EPS15L1,CALR3,C19orf44	NA	NA	NA	NA	EPS15L1	19731	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	16573693	16573897	16573763	Y	HSH2D	EPS15L1,CALR3,C19orf44	NA	NA	NA	NA	EPS15L1	6999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	16772555	16772747	16772653	Y	NA	MED26,TMEM38A	NA	NA	NA	NA	TMEM38A	2617	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	17131732	17132248	17131919	Y	NA	CPAMD8	NA	NA	NA	NA	CPAMD8	3377	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	17200566	17201240	17200825	Y	MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	15975	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.234484356321151
chr19	17236053	17237400	17237360	Y	MED26,HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	NA	MYO9B	51462	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	17246297	17246722	17246423	Y	SLC27A1,PGLS,OCEL1,MYO9B	NA	NA	NA	NA	NA	MYO9B	61706	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	17345747	17345835	17345791	Y	NA	USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1	NA	NA	NA	NA	NR2F6	8914	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.149994492958819
chr19	17371801	17372164	17371849	Y	NXNL1,GTPBP3	USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1,MRPL34,DDA1,ABHD8	NR2F6	K562	ChIA-PET	22265404	BABAM1	3995	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.551962499556035
chr19	17578706	17578913	17578810	Y	NA	TMEM221,SLC27A1,PGLS	NA	NA	NA	NA	SLC27A1	1128	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	17667126	17667426	17667289	Y	MAP1S,ARRDC2,MYO9B,SLC27A1,PGLS,GLT25D1	PGLS	NA	NA	NA	NA	PGLS	46688	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	17791017	17791370	17791235	Y	MAP1S,IFI30,ARRDC2,ARRDC2	UNC13A,MAP1S	NA	NA	NA	NA	UNC13A	6031	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.212996815885384
chr19	17890338	17890582	17890537	Y	FAM129C,MAST3,JAK3,FCHO1	FCHO1,B3GNT3	NA	NA	NA	NA	B3GNT3	13055	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	18064785	18064952	18064869	Y	NA	CCDC124,ARRDC2	NA	NA	NA	NA	CCDC124	22960	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	18131991	18132570	18132392	Y	MAP1S,FCHO1,KCNN1,PGPEP1,LRRC25,JUND,IFI30,ARRDC2,ARRDC2	ARRDC2	NA	NA	NA	NA	ARRDC2	22050	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr19	18133045	18133309	18133130	Y	FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2	ARRDC2	NA	NA	NA	NA	ARRDC2	23104	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.55434511108903
chr19	18134654	18135106	18134872	Y	MAP1S,LRRC25,JUND,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1	ARRDC2	NA	NA	NA	NA	ARRDC2	24713	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	18154526	18154804	18154610	Y	IFI30	ARRDC2	NA	NA	NA	NA	ARRDC2	44585	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	18230044	18230277	18230172	Y	FCHO1,JAK3	MAST3,PIK3R2	NA	NA	NA	NA	MAST3	23441	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	18315989	18316123	18316056	Y	NA	IFI30,MPV17L2,RAB3A	NA	NA	NA	NA	RAB3A	3105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.553614505554045
chr19	18382556	18382948	18382783	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4	NA	NA	NA	NA	KIAA1683	371	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	18393747	18393881	18393780	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4	NA	NA	NA	NA	MIR3188	2860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr19	18401020	18401539	18401437	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,LRRC25,JUND	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	10133	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	18402387	18403564	18402535	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	11500	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.224297142513009
chr19	18404099	18404539	18404373	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	13212	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.91516340742104
chr19	18405326	18405850	18405541	Y	JAK3,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,C19orf60,JUND	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	14439	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr19	18414244	18414595	18414365	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	17489	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.19729770745122
chr19	18415031	18416060	18415513	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	16024	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.98393627094568
chr19	18439179	18439536	18439334	Y	NA	JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1,GDF15	PGPEP1	K562	ChIA-PET	22265404	LSM4	7095	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255971896756917
chr19	18485152	18485556	18485412	Y	ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25	PGPEP1,GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	GDF15	1611	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.40523624052537
chr19	18497624	18497977	18497708	Y	PDE4C,GDF15	PGPEP1,GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	GDF15	14083	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.532353999197983
chr19	18527231	18527472	18527362	Y	LSM4,SSBP4,ISYNA1,ISYNA1	GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	SSBP4	202	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.624421887100376
chr19	18527701	18528040	18527800	Y	KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	SSBP4	27	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.426723780961136
chr19	18528263	18528792	18528577	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	SSBP4	589	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.824502148427991
chr19	18533547	18533601	18533574	Y	ARRDC2,IL12RB1	SSBP4	NA	NA	NA	NA	SSBP4	5873	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	18588665	18588964	18588926	Y	NA	ELL	NA	NA	NA	NA	ELL	41973	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr19	18589714	18590055	18589946	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,ELL,LRRC25	ELL	NA	NA	NA	NA	ELL	40882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	18606803	18607671	18607185	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,KLHL26,ELL,LRRC25	ELL,FKBP8	NA	NA	NA	NA	ELL	23266	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	18631384	18632027	18631497	Y	ELL	ELL,FKBP8,KXD1,UBA52	NA	NA	NA	NA	ELL	447	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	18793678	18793914	18793817	Y	PDE4C	KLHL26,CRTC1	NA	NA	NA	NA	CRTC1	1191	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	19027750	19028071	19027900	Y	MAU2	GDF1,CERS1,COPE,DDX49,HOMER3	NA	NA	NA	NA	COPE	135	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr19	19078398	19078892	19078760	Y	ELL,GATAD2A,HOMER3	DDX49,HOMER3	NA	NA	NA	NA	HOMER3	28328	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	19248583	19248716	19248628	Y	NA	TMEM161A	NA	NA	NA	NA	TMEM161A	1261	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr19	19432213	19432594	19432445	Y	SUGP2,NCAN,ZNF14,PBX4,SUGP1,MAU2	MAU2,SUGP1	NA	NA	NA	NA	SUGP1	2560	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr19	19432680	19432782	19432710	Y	NA	MAU2,SUGP1	NA	NA	NA	NA	SUGP1	3027	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	19483893	19484092	19484012	Y	NA	GATAD2A	NA	NA	NA	NA	GATAD2A	10543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr19	19488658	19488936	19488750	Y	NA	GATAD2A	NA	NA	NA	NA	GATAD2A	5699	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	19514283	19514636	19514393	Y	HOMER3,RFXANK,GMIP,GATAD2A	GATAD2A	NA	NA	NA	NA	GATAD2A	19648	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	19570650	19571032	19570761	Y	ZNF506,RFXANK,MAU2,GATAD2A,ZNF14,PBX4,GMIP	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	53513	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	19571175	19572073	19571752	Y	ZNF506,RFXANK,MAU2,GATAD2A,ZNF14,PBX4,GMIP	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	52472	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	19589693	19590012	19589853	Y	NA	NDUFA13,TSSK6,YJEFN3	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	34533	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	19623798	19624201	19624001	Y	NA	NDUFA13,TSSK6,YJEFN3	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	344	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	19711724	19712118	19712001	Y	RFXANK,GATAD2A,GMIP	PBX4,LPAR2,GMIP	NA	NA	NA	NA	PBX4	15607	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr19	19977247	19977754	19977315	Y	PBX4,LPAR2,ZNF101,ZNF14,ZNF682,ZNF682,ZNF506,ZNF253	ZNF253	NA	NA	NA	NA	ZNF253	2552	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	23309445	23309479	23309469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF91	266883	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	23310606	23310980	23310793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF91	265382	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	23530488	23530791	23530760	Y	NA	ZNF91	NA	NA	NA	NA	ZNF91	45571	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	23732304	23732710	23732386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF675	135312	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.327318171481775
chr19	24216985	24217321	24217111	Y	ZNF254	ZNF254	NA	NA	NA	NA	ZNF254	2709	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	28217479	28217822	28217621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1484626	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	28239770	28239799	28239785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1462649	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	28248561	28250861	28250165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1451587	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	28252106	28252716	28252616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1449732	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	28252920	28253113	28253061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1449335	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	28265126	28266155	28265940	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1436293	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr19	28270762	28271411	28271062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1431037	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	28274249	28275061	28274473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1427387	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	29702850	29703471	29703365	Y	NA	UQCRFS1	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	402	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr19	29875607	29875962	29875787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	173159	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	30157267	30157499	30157417	Y	PLEKHF1,C19orf12,C19orf12	PLEKHF1,C19orf12	NA	NA	NA	NA	PLEKHF1	3304	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	30195599	30196138	30195979	Y	NA	PLEKHF1,C19orf12	NA	NA	NA	NA	C19orf12	8226	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	30334239	30334593	30334547	Y	NA	CCNE1	NA	NA	NA	NA	CCNE1	33434	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	30447917	30448294	30448014	Y	NA	URI1	NA	NA	NA	NA	URI1	35366	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.507371190754358
chr19	31841682	31842327	31842237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF507	992173	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	32754044	32754196	32754068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF507	80304	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	32863977	32864267	32864121	Y	NA	ZNF507,DPY19L3	NA	NA	NA	NA	ZNF507	29477	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr19	33049643	33049878	33049760	Y	NA	PDCD5	NA	NA	NA	NA	PDCD5	20096	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	33165229	33165376	33165346	Y	NA	RGS9BP,ANKRD27,NUDT19	NA	NA	NA	NA	ANKRD27	127	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	33532238	33532582	33532339	Y	RHPN2,GPATCH1,PDCD5,ANKRD27,NUDT19,CEP89,C19orf40	RHPN2,GPATCH1	NA	NA	NA	NA	RHPN2	21212	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	33538325	33538659	33538479	Y	RHPN2,GPATCH1,NUDT19,CEP89,C19orf40	RHPN2,GPATCH1	NA	NA	NA	NA	RHPN2	15135	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr19	33664629	33664677	33664651	Y	NA	LRP3	NA	NA	NA	NA	LRP3	1832	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	33668108	33668528	33668227	Y	SLC7A10,LRP3	LRP3	NA	NA	NA	NA	LRP3	1599	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.452209704515423
chr19	33740333	33740640	33740371	Y	NA	NA	CHST8,CEBPA,LOC80054,PEPD	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPA	50830	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr19	33796303	33796393	33796348	Y	SLC7A9,CEBPA	CEBPA	NA	NA	NA	NA	CEBPA	4833	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr19	33888059	33888360	33888231	Y	CEBPA	CEBPG	NA	NA	NA	NA	CEBPG	25823	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	33996867	33997517	33996997	Y	LRP3	PEPD	NA	NA	NA	NA	PEPD	13183	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr19	34310855	34311133	34311012	Y	NA	KCTD15	NA	NA	NA	NA	KCTD15	26017	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.316244878933856
chr19	34625713	34625998	34625854	Y	PDCD2L	LSM14A	CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD	IMR90	Hi-C	24141950	LSM14A	35411	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.675740919770199
chr19	34746041	34746169	34746166	Y	KIAA0355	KIAA0355,RPL29P33	NA	NA	NA	NA	KIAA0355	2599	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr19	34752762	34752909	34752837	Y	NA	KIAA0355,RPL29P33	NA	NA	NA	NA	KIAA0355	9320	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr19	34850085	34850642	34850351	Y	ZNF599,ZNF302,ZNF181	GPI,PDCD2L	NA	NA	NA	NA	GPI	1700	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.596589586425577
chr19	34874880	34875495	34875019	Y	NA	GPI,PDCD2L,UBA2	NA	NA	NA	NA	PDCD2L	17794	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	35100505	35100815	35100739	Y	ZNF302	SCGB1B2P	NA	NA	NA	NA	SCGB1B2P	33899	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr19	35557782	35557965	35557875	Y	MAG,SCGBL,ZNF302,ZNF181,ZNF30,HPN,LGI4	SCN1B,FXYD3	NA	NA	NA	NA	SCN1B	38194	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	35605566	35605978	35605759	Y	MAG,FFAR1,LGI4	FXYD3,AC020907.2,FXYD5	NA	NA	NA	NA	FXYD3	834	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	35634936	35635340	35635202	Y	NA	FXYD3,AC020907.2,FXYD5	NA	NA	NA	NA	AC020907.2	6452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	35636009	35636339	35636175	Y	NA	FXYD3,AC020907.2,FXYD5	NA	NA	NA	NA	FXYD5	7294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	35643836	35643967	35643905	Y	FFAR3,USF2,MAG,HPN,LGI4	FXYD3,AC020907.2,FXYD5	NA	NA	NA	NA	FXYD5	203	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.277615366742094
chr19	35763394	35763606	35763496	Y	U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,USF2	LSR,USF2,MAG	NA	NA	NA	NA	USF2	5513	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	35763871	35764402	35764192	Y	FXYD1,FXYD1,HAMP	LSR,USF2,MAG	NA	NA	NA	NA	USF2	5990	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	35809679	35810380	35810036	Y	GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR2,U2AF1L4,IGFLR1,FFAR3	MAG	NA	NA	NA	NA	MAG	28651	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20553894282687
chr19	35920564	35920848	35920820	Y	GRAMD1A,FFAR3,U2AF1L4,TYROBP,NFKBID,MLL4,FFAR2	NA	NA	NA	NA	NA	DMKN	81712	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	36135988	36136183	36136108	Y	ARHGAP33	HAUS5,RBM42,ETV2,COX6B1	NA	NA	NA	NA	COX6B1	942	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	36376938	36377077	36377046	Y	NA	APLP1,NFKBID,HCST,LRFN3	NA	NA	NA	NA	NFKBID	14128	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	36519340	36519516	36519376	Y	ZNF565	SDHAF1,ALKBH6,THAP8,WDR62	NA	NA	NA	NA	ALKBH6	16199	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.317130957673633
chr19	36618643	36619171	36618835	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1	NA	NA	NA	NA	CAPNS1	9306	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.294374374868973
chr19	36648389	36648571	36648491	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1	NA	NA	NA	NA	CAPNS1	19912	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	36720266	36720641	36720459	Y	ARHGAP33,APLP1,CLIP3,CLIP3,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF382,ZNF260,ZFP14,ZNF565,ZNF565	ZNF146,ZNF565	NA	NA	NA	NA	ZNF565	14518	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	36882143	36882391	36882267	Y	NA	ZFP14,ZFP82	NA	NA	NA	NA	ZFP14	14042	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr19	36891925	36892272	36892205	Y	NA	ZFP14,ZFP82	NA	NA	NA	NA	ZFP82	15286	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	37171128	37171323	37171227	Y	NA	ZNF461,AC074138.3,ZNF567	ZNF383,ZNF461,ZNF567,ZNF850	IMR90	Hi-C	24141950	AC074138.3	5028	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	37246589	37246720	37246657	Y	NA	ZNF850	NA	NA	NA	NA	ZNF850	15007	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	37822125	37822150	37822138	Y	NA	HKR1,ZNF527	NA	NA	NA	NA	HKR1	20386	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	37830170	37830469	37830239	Y	NA	HKR1,ZNF527	ZNF527	IMR90	Hi-C	24141950	HKR1	28431	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr19	37894729	37894877	37894831	Y	NA	ZNF527	NA	NA	NA	NA	ZNF527	34766	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	38186506	38186731	38186619	Y	ZNF527,ZNF793,ZNF540,ZFP30,ZNF781,ZNF607,ZNF573	ZFP30,ZNF607	NA	NA	NA	NA	ZFP30	5268	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr19	38433320	38433698	38433507	Y	ZNF569,ZNF570,ZNF793,ZFP30,ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1,DPF1	WDR87,SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	37452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr19	38470537	38470671	38470619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	74669	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	38491114	38491333	38491222	Y	PPP1R14A	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	95246	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	38791297	38791661	38791416	Y	C19orf33	C19orf33,YIF1B,CATSPERG	NA	NA	NA	NA	C19orf33	1140	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	38796841	38796867	38796854	Y	NA	C19orf33,YIF1B,CATSPERG	NA	NA	NA	NA	C19orf33	4040	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	39148533	39148920	39148613	Y	C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4	MAP4K1,EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	39167742	39168127	39167771	Y	NA	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	31453	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	39175000	39175365	39175141	Y	NFKBIB,HNRNPL,EIF3K	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	38711	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.268158302124319
chr19	39177340	39177518	39177421	Y	RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	41051	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	39179503	39179787	39179628	Y	RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	43214	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr19	39184148	39184440	39184342	Y	C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	47859	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	39411140	39411539	39411467	Y	LGALS7	RINL,NFKBIB,SIRT2,MRPS12,SARS2	NA	NA	NA	NA	MRPS12	7649	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr19	39415058	39415337	39415248	Y	ZFP36,MAP4K1,HNRNPL,NFKBIB	RINL,NFKBIB,SIRT2,MRPS12,SARS2,FBXO17	NA	NA	NA	NA	MRPS12	3851	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	39755176	39755398	39755266	Y	ZFP36	NA	NA	NA	NA	NA	NCCRP1	69575	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	39831946	39832143	39832027	Y	NA	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29	NA	NA	NA	NA	SAMD4B	910	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	39849240	39849632	39849436	Y	NA	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530	MED29,PAF1	IMR90	Hi-C	24141950	SAMD4B	18204	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	39894353	39894945	39894613	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H	NA	NA	NA	NA	ZFP36	508	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.293644225678606
chr19	39921308	39921946	39921495	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H,TIMM50	NA	NA	NA	NA	RPS16	2642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr19	40543471	40543758	40543711	Y	SPTBN4,ZNF546,ZNF780B	ZNF780B	NA	NA	NA	NA	ZNF780B	16358	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	40725827	40726069	40725973	Y	NA	MAP3K10	NA	NA	NA	NA	MAP3K10	30176	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	40823184	40823546	40823487	Y	NA	AKT2,PLD3,C19orf47	NA	NA	NA	NA	PLD3	28817	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr19	40939716	40940068	40940022	Y	SERTAD1	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	8544	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.86636411648004
chr19	40942693	40943017	40942855	Y	NA	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	5595	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr19	40969437	40969789	40969613	Y	BLVRB	SERTAD1,SERTAD3	NA	NA	NA	NA	BLVRB	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr19	41108162	41108528	41108432	Y	NA	SHKBP1,LTBP4	NA	NA	NA	NA	LTBP4	11373	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.358262776535316
chr19	41109606	41110134	41110046	Y	SERTAD1,ITPKC,EGLN2,EGLN2,C19orf54,ADCK4,SHKBP1	SHKBP1,LTBP4	NA	NA	NA	NA	LTBP4	12817	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.355533435785689
chr19	41169097	41169273	41169245	Y	NA	NUMBL	NA	NA	NA	NA	NUMBL	25604	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	41226531	41226793	41226653	Y	PLD3,SPTBN4,LTBP4,EGLN2,EGLN2,CYP2B6,ITPKC,RAB4B	NUMBL,ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA	NA	NA	NA	NA	ADCK4	4419	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	41254580	41254859	41254762	Y	SHKBP1,ADCK4	ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	SNRPA	38	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr19	41260796	41261188	41261093	Y	SERTAD1,CYP2A13,CYP2B6,CYP2A6,ADCK4,ITPKC	ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	C19orf54	5338	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	41267029	41267391	41267210	Y	NA	ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	MIA	8162	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	41304071	41304255	41304136	Y	SERTAD1,SERTAD3,SHKBP1,ADCK4,ADCK4,RAB4B,HNRNPUL1	SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	EGLN2	1170	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr19	41680959	41681276	41681150	Y	NA	CYP2S1,AXL	CYP2A13,CYP2B7P1,HNRNPUL1,AXL,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8	IMR90	Hi-C	24141950	CYP2S1	15678	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	41681944	41682199	41682187	Y	NA	CYP2S1,AXL	CYP2B7P1,HNRNPUL1,CYP2A13,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8	IMR90	Hi-C	24141950	CYP2S1	14755	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.246670761688553
chr19	41702138	41702290	41702230	Y	ADCK4,ITPKC,TGFB1,CCDC97	CYP2S1,AXL	NA	NA	NA	NA	CYP2S1	5184	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	41729438	41729579	41729517	Y	ATP5SL,ATP5SL,AXL	CYP2S1,AXL,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	AXL	6330	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	41731541	41731893	41731762	Y	NA	CYP2S1,AXL,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	AXL	8433	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr19	41771602	41771660	41771636	Y	CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	AXL,HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	HNRNPUL1	5201	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.467855599822819
chr19	41795419	41795640	41795447	Y	CYP2A13,B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	CCDC97	18454	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18093909801236
chr19	41804006	41804567	41804366	Y	TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	CCDC97	9527	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	41816681	41817091	41817051	Y	NA	CCDC97,TMEM91,TGFB1	NA	NA	NA	NA	CCDC97	2587	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	41831643	41832527	41831971	Y	CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA	NA	NA	NA	NA	CCDC97	17549	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	41915515	41915996	41915671	Y	ARHGEF1,HNRNPUL1,TGFB1	B9D2,BCKDHA,EXOSC5,ATP5SL	NA	NA	NA	NA	EXOSC5	14131	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	CEACAMP3	75725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	42037922	42038313	42037990	Y	CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1	NA	LOC100505495	IMR90	Hi-C	24141950	CEACAMP3	65777	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr19	42404902	42404963	42404932	Y	NA	RPS19,CD79A,ARHGEF1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	19674	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	42419916	42420316	42420067	Y	ZNF574,GRIK5,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	CD79A,ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	34688	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	42429105	42429824	42429205	Y	DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	CD79A,ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	31718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	42514619	42514744	42514681	Y	ATP1A3	NA	NA	NA	NA	NA	RABAC1	53077	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	42750338	42750718	42750490	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC	NA	NA	NA	NA	GSK3A	5561	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.830343793556361
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	2115	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.229025674821897
chr19	42775992	42776735	42776352	Y	NA	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	NA	NA	NA	NA	CIC	5303	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr19	42784087	42784212	42784170	Y	CEACAM8,CEACAM3,DEDD2	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13398	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr19	42784527	42784991	42784716	Y	ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13838	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.7039924184866
chr19	42785500	42785936	42785827	Y	NA	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	14811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.154567095718296
chr19	42789863	42790090	42789919	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,DEDD2,CIC	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	PRR19	14160	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	43355116	43355369	43355287	Y	NA	PSG8,PSG1	NA	NA	NA	NA	PSG8	2474	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	43835548	43835842	43835742	Y	NA	CD177	TEX101	IMR90	Hi-C	24141950	CD177	19969	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.468968712642302
chr19	44124638	44124922	44124781	Y	CADM4	XRCC1,IRGQ,ZNF576,SRRM5,ZNF428,CADM4,PLAUR	NA	NA	NA	NA	ZNF428	2612	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	44138598	44138945	44138732	Y	ZNF575,ZNF284,ZNF224,ZNF223,ZNF221,LYPD5,LOC390940,CADM4	IRGQ,ZNF576,SRRM5,ZNF428,CADM4,PLAUR	NA	NA	NA	NA	CADM4	3046	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	44152096	44152277	44152103	Y	ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61,IRGQ	ZNF428,CADM4,PLAUR	CADM4	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	CADM4	10105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	44165978	44166186	44166121	Y	NA	ZNF428,CADM4,PLAUR	NA	NA	NA	NA	PLAUR	6513	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	44178912	44179361	44178991	Y	IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61	CADM4,PLAUR	PLAUR	MCF7	ChIA-PET	22265404	PLAUR	6213	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	44179506	44179853	44179716	Y	TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61	CADM4,PLAUR	PLAUR	MCF7	ChIA-PET	22265404	PLAUR	6807	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208998432766864
chr19	44196948	44197341	44197160	Y	NA	PLAUR	IRGC,SMG9,KCNN4,LYPD5,PLAUR	IMR90	Hi-C	24141950	PLAUR	24249	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	44249305	44249426	44249352	Y	IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61	SMG9,KCNN4	NA	NA	NA	NA	SMG9	7716	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	44269192	44269953	44269534	Y	IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4	NA	NA	NA	NA	SMG9	12050	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	44281524	44282142	44281780	Y	IRGQ,ZNF230,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	1267	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr19	44283400	44283793	44283490	Y	TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr19	44284114	44284247	44284152	Y	TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	44287065	44287299	44287223	Y	NA	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	3656	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.81671498121175
chr19	44288540	44288860	44288798	Y	NA	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	5131	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.189510083890358
chr19	44440425	44440707	44440629	Y	NA	ZNF45,ZNF221,ZNF155	NA	NA	NA	NA	ZNF45	2995	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr19	44711538	44711905	44711597	Y	NA	ZNF226,ZNF227,ZNF233	NA	NA	NA	NA	ZNF227	1838	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.425993631770769
chr19	44821121	44821451	44821434	Y	ZNF221,ZNF223,ZNF284,ZNF285,ZNF180,ZFP112,ZNF227	ZNF235	NA	NA	NA	NA	ZNF235	13922	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr19	45221919	45222313	45222185	Y	NA	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	26649	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.479155926450444
chr19	45228436	45228775	45228695	Y	IGSF23,RELB,APOE,APOC4,APOC2,BCL3	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	20187	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.692152742335828
chr19	45231729	45232033	45231881	Y	IGSF23,CLASRP,APOC2	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	16929	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr19	45242034	45242469	45242251	Y	RELB,CLASRP,BCL3	BCL3	BCL3	K562	ChIA-PET	22265404	BCL3	6493	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr19	45248499	45249479	45248793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL3	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.320973411242743
chr19	45256546	45257099	45256742	Y	ZNF296,RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	7584	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr19	45279679	45279961	45279836	Y	CEACAM19,CBLC,BCAM	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	30717	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr19	45352107	45352544	45352311	Y	NA	PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	4675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	45352951	45353140	45353112	Y	NA	PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	5519	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr19	45373382	45373614	45373476	Y	NA	PVRL2,TOMM40,APOE	NA	NA	NA	NA	TOMM40	18212	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	45393623	45393866	45393750	Y	ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40	PVRL2,TOMM40,APOE	NA	NA	NA	NA	TOMM40	1797	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.726712766878774
chr19	45584780	45584791	45584786	Y	CEACAM16,NKPD1	CLASRP,ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37	NA	NA	NA	NA	MARK4	4234	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	45755637	45756189	45755812	Y	RELB,CLASRP,VASP	NA	NA	NA	NA	NA	CKM	68046	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	45803954	45804164	45804074	Y	NA	CKM	NA	NA	NA	NA	CKM	20071	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	45879605	45879880	45879744	Y	NA	ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	ERCC2	7429	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr19	45905744	45905944	45905844	Y	EML2,KLC3,PPP1R13L,ERCC1,ERCC1	ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	CD3EAP	1523	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.275616175182834
chr19	45906934	45907335	45907067	Y	NA	ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	CD3EAP	132	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	45943163	45943490	45943268	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP,FOSB,CD3EAP,PPP1R13L	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	25763	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208268283576497
chr19	45945937	45946679	45946251	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22574	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22140	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	45952039	45952594	45952534	Y	GIPR,RELB,CLASRP,PPM1N,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	16659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	45953262	45953678	45953446	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,PPM1N,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	15575	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.128351022973642
chr19	45959420	45959846	45959631	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP	FOSB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	9407	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	45999277	45999601	45999579	Y	NOVA2,DMPK,RTN2,RTN2	FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	8236	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	46011701	46012269	46011904	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	3864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	46012498	46012899	46012640	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	4661	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr19	46133845	46134220	46134022	Y	NANOS2,IGFL4,NKPD1,EXOC3L2	OPA3,EML2,GIPR	NA	NA	NA	NA	EML2	12667	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr19	46361761	46362096	46361929	Y	NA	SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	SYMPK	2452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	46385401	46385465	46385433	Y	NA	SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	IRF2BP1	1911	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	46386037	46386278	46386146	Y	OPA3,GIPR,FBXO46,SYMPK,FOXA3	SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	IRF2BP1	1098	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	46478594	46479000	46478748	Y	NA	CCDC61	NA	NA	NA	NA	CCDC61	17339	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	46504246	46504437	46504355	Y	EML2,PNMAL2,PNMAL1,NOVA2	CCDC61	NA	NA	NA	NA	CCDC61	7907	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	46683956	46684315	46684191	Y	NA	IGFL1	NA	NA	NA	NA	IGFL1	46694	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.33149037555323
chr19	46698925	46699055	46698990	Y	NA	IGFL1	IGFL3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFL1	31954	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr19	46708652	46708841	46708747	Y	NA	IGFL1	NA	NA	NA	NA	IGFL1	22168	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	46802245	46802621	46802425	Y	IRF2BP1,MYPOP,DACT3,HIF3A,HIF3A,CCDC8	PPP5C	NA	NA	NA	NA	PPP5C	45630	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	46876247	46876539	46876393	Y	NA	PPP5C	NA	NA	NA	NA	PPP5C	27996	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	46905606	46905628	46905621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP5C	57355	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	46992955	46993234	46993212	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAPDHP38	66664	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	47062362	47062544	47062453	Y	NA	GAPDHP38,CALM3	NA	NA	NA	NA	GAPDHP38	2464	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr19	47142195	47142976	47142503	Y	NA	CALM3,PTGIR	NA	NA	NA	NA	PTGIR	15820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	47269374	47269772	47269575	Y	LOC100506012,SLC1A5,SLC1A5	FKRP,STRN4,SLC1A5	NA	NA	NA	NA	SLC1A5	20079	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.792288501005556
chr19	47367294	47367354	47367334	Y	NA	AP2S1	SLC1A5,ARHGAP35,ZC3H4	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	15045	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	47458912	47459233	47458939	Y	ZC3H4,CCDC9	NA	NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM160	90655	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	47552678	47552827	47552750	Y	NA	TMEM160	NA	NA	NA	NA	TMEM160	2790	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr19	47610820	47611121	47611012	Y	NA	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	3410	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr19	47613231	47613789	47613256	Y	PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	742	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr19	47613894	47614902	47614503	Y	PTGIR,PRKD2,NAPA,GPR77,GLTSCR1,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4	ZC3H4	NA	NA	NA	NA	SAE1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	47689758	47690163	47690151	Y	GLTSCR1,BBC3	MIR3191,BBC3	NA	NA	NA	NA	MIR3191	38036	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	47729030	47729228	47729064	Y	NA	MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	MIR3191	831	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	47746329	47746738	47746506	Y	SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24	MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24,C5AR1	NA	NA	NA	NA	CCDC9	10499	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24,C5AR1	NA	NA	NA	NA	PRR24	606	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.501912509255104
chr19	47792934	47793257	47793053	Y	NA	CCDC9,PRR24,C5AR1	NA	NA	NA	NA	C5AR1	1654	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.5822306248906
chr19	47805638	47805769	47805718	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,GPR77,C5AR1	CCDC9,PRR24,C5AR1,DHX34	PRR24,DHX34,SLC8A2,MEIS3,GLTSCR2,GLTSCR1,EHD2	IMR90	Hi-C	24141950	C5AR1	14358	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	47814150	47814595	47814332	Y	ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,C5AR1,GPR77	PRR24,C5AR1,DHX34	NA	NA	NA	NA	C5AR1	22870	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.413807226403367
chr19	47817254	47817597	47817448	Y	ZC3H4,NAPA,DHX34,BBC3,CCDC9,C5AR1,GPR77	PRR24,C5AR1,DHX34	NA	NA	NA	NA	C5AR1	25974	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	47818553	47819137	47818792	Y	ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,C5AR1,GPR77	PRR24,C5AR1,DHX34	NA	NA	NA	NA	C5AR1	27273	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr19	47833817	47834081	47833932	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,CCDC9,C5AR1,GPR77	C5AR1,DHX34	NA	NA	NA	NA	DHX34	16457	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	47854917	47855115	47854986	Y	ZC3H4,BBC3,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,DHX34	DHX34	NA	NA	NA	NA	DHX34	4379	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr19	47867147	47867265	47867191	Y	ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,DHX34	DHX34	NA	NA	NA	NA	DHX34	16609	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	47867637	47867786	47867679	Y	ZC3H4,C5AR1,NAPA,DHX34	DHX34	NA	NA	NA	NA	DHX34	17099	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	47893291	47893410	47893319	Y	ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,GLTSCR1,DHX34	DHX34,MEIS3	NA	NA	NA	NA	MEIS3	27370	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	48016569	48017036	48016994	Y	GLTSCR2,ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,DHX34,GLTSCR1,NAPA	KPTN,NAPA	NA	NA	NA	NA	NAPA	72	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	48076356	48076760	48076653	Y	SLC8A2,ZNF541	NA	GLTSCR1,KPTN,MEIS3,SLC8A2,NAPA,LOC100505681,ZNF541	IMR90	Hi-C	24141950	NAPA	59859	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	48101913	48102072	48101991	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85416	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	48102180	48102576	48102418	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85683	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.331160625050885
chr19	48151789	48152128	48151872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHD2	62472	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr19	48167427	48167718	48167620	Y	NA	EHD2	NA	NA	NA	NA	EHD2	46882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr19	48222362	48222481	48222377	Y	SEPW1,PLA2G4C,MEIS3,SLC8A2	EHD2,GLTSCR2	NA	NA	NA	NA	EHD2	7762	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	48226445	48226596	48226537	Y	NA	EHD2,GLTSCR2	NA	NA	NA	NA	EHD2	11845	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	48277326	48277623	48277440	Y	SLC8A2,PLA2G4C	GLTSCR2,SEPW1,RPL23AP80	NA	NA	NA	NA	SEPW1	2206	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	48352522	48352636	48352584	Y	NA	SULT2A1	NA	NA	NA	NA	SULT2A1	35018	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr19	48629286	48629473	48629353	Y	NA	PLA2G4C,LIG1,ZNF114	NA	NA	NA	NA	PLA2G4C	17212	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	48642255	48642637	48642446	Y	NA	PLA2G4C,LIG1,ZNF114	NA	NA	NA	NA	LIG1	29223	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	48648975	48649130	48649035	Y	SYNGR4,SPACA4	PLA2G4C,LIG1,ZNF114	NA	NA	NA	NA	LIG1	22730	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	48657871	48658185	48658028	Y	NA	PLA2G4C,LIG1,ZNF114	NA	NA	NA	NA	LIG1	13675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr19	48763023	48763379	48763092	Y	CARD8,IZUMO1,EMP3	CARD8	NA	NA	NA	NA	CARD8	5820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	48903013	48903207	48903134	Y	PPP1R15A,EMP3,FUT1,IZUMO1	TMEM143,SYNGR4,KDELR1,GRWD1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	10203	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.514829063812873
chr19	48903450	48903602	48903513	Y	NA	TMEM143,SYNGR4,KDELR1,GRWD1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	10640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr19	48996099	48996379	48996219	Y	NA	GRWD1,CYTH2,LMTK3	NA	NA	NA	NA	LMTK3	18067	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr19	49051864	49052159	49052158	Y	NA	LMTK3,SULT2B1	NA	NA	NA	NA	SULT2B1	1173	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	49057128	49057239	49057162	Y	NA	LMTK3,SULT2B1	NA	NA	NA	NA	SULT2B1	3796	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr19	49092091	49092636	49092297	Y	BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11	SULT2B1,SPHK2,RPL18,DBP	NA	NA	NA	NA	SPHK2	27912	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.436910994769278
chr19	49315464	49315783	49315738	Y	NA	BCAT2,HSD17B14	NA	NA	NA	NA	BCAT2	3178	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr19	49386525	49386775	49386581	Y	CD37,PPP1R15A	HSD17B14,PLEKHA4,PPP1R15A,NUCB1,DHDH	NA	NA	NA	NA	PPP1R15A	12876	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	49465555	49466264	49465736	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.32297305914663
chr19	49466802	49467527	49467169	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.13379272575861
chr19	49482120	49482542	49482303	Y	FUT1,C19orf73	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	12025	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	49482691	49482925	49482812	Y	NA	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	11642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	49493898	49494273	49494153	Y	NA	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.256857975496695
chr19	49495555	49495708	49495609	Y	SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2,CGB5	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	850	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.928253326587123
chr19	49521043	49521282	49521101	Y	NA	GYS1,RUVBL2,CGB5	NA	NA	NA	NA	CGB5	23859	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr19	49524183	49524468	49524237	Y	CGB5	GYS1,RUVBL2,CGB5	NA	NA	NA	NA	CGB5	20673	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	49590520	49590786	49590652	Y	NA	CGB5,SNRNP70,LIN7B,C19orf73,PPFIA3	NA	NA	NA	NA	SNRNP70	3844	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.145265960649932
chr19	49836983	49837445	49837293	Y	SNRNP70,IRF3,FLT3LG,FLT3LG,BCL2L12,ALDH16A1,CD37	CTC-301O7.4,DKKL1,TEAD2	NA	NA	NA	NA	CTC-301O7.4	4420	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	50116585	50116794	50116665	Y	NA	PRRG2,NOSIP,PRR12,RRAS,SCAF1	NA	NA	NA	NA	PRR12	23685	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	50141205	50141513	50141452	Y	AKT1S1,TRPM4,RCN3,AP2A1,RRAS	NOSIP,PRR12,SCAF1,BCL2L12,IRF3,PRMT1	NA	NA	NA	NA	RRAS	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.148378265028675
chr19	50276330	50276635	50276461	Y	VRK3,BCL2L12,AP2A1,MED25	AP2A1,MED25	NA	NA	NA	NA	AP2A1	8105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	50362574	50362883	50362717	Y	PRRG2,MYH14,PNKP	MED25,PTOV1,PNKP,TBC1D17,AKT1S1	NA	NA	NA	NA	PNKP	6283	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	50414628	50414884	50414779	Y	RPS11,FCGRT,NR1H2,IL4I1,NUP62,NUP62,NUP62,NUP62,IL4I1,ATF5	PNKP,TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751	NA	NA	NA	NA	ATF5	15075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr19	50417620	50417965	50417778	Y	NA	PNKP,TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751	NA	NA	NA	NA	ATF5	11994	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	50670716	50671002	50670859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK3	143513	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	50833837	50834367	50834143	Y	MYH14,GPR32,SYT3,SYT3,SHANK1,LRRC4B,ASPDH,KCNC3	NR1H2,NAPSB	NA	NA	NA	NA	NR1H2	2927	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	50990086	50990332	50990328	Y	NA	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	FAM71E1	12076	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	50993276	50993671	50993522	Y	MYH14,MYBPC2	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	FAM71E1	15266	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	50993680	50994951	50994565	Y	NA	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	FAM71E1	15670	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.543774477307153
chr19	51003635	51004295	51004006	Y	MYH14,MYBPC2	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	8315	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	51010284	51010518	51010437	Y	KLK4,ACPT,SYT3,SHANK1,LOC342918	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	2092	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr19	51012062	51012382	51012222	Y	KLK6,SYT3,SHANK1	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	51287900	51288107	51288100	Y	NA	C19orf48,KLK1	NA	NA	NA	NA	C19orf48	18079	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.196967956948873
chr19	51318804	51318947	51318869	Y	NA	C19orf48,KLK1	NA	NA	NA	NA	KLK1	6096	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	51339255	51339614	51339393	Y	KLK14,IGLON5,LRRC4B,SYT3,SYT3	C19orf48,KLK1	NA	NA	NA	NA	KLK1	14212	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr19	51665562	51665592	51665577	Y	SIGLEC8,SIGLEC6,CD33	NA	NA	NA	NA	NA	CTU1	55935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	51898753	51899047	51898851	Y	SIGLEC9,CD33,FPR2,SIGLEC14,SIGLEC10,FPR3,FPR2,FPR1	ETFB,CLDND2	NA	NA	NA	NA	CLDND2	28496	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	1272	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.68702381133892
chr19	52192842	52193550	52192951	Y	ZNF615,IGLON5,ZNF577,ZNF577	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	489	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.275616175182834
chr19	52193633	52193945	52193814	Y	ZNF836,ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC8,SIGLEC6,FPR2,FPR2,FPR1	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	94	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	52194056	52194504	52194155	Y	ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	17	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	52194594	52195259	52195000	Y	ZNF615,ZNF350,C19orf75,IGLON5,CLDND2,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	555	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr19	52586676	52587051	52586863	Y	NA	ZNF432,ZNF841	NA	NA	NA	NA	ZNF432	9940	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	52641935	52642117	52642107	Y	ZNF649,ZNF610,ZNF528,ZNF836,ZNF616	ZNF432,ZNF841,ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	ZNF616	760	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	52674093	52674226	52674127	Y	ZNF836	ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	ZNF836	1197	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	52697339	52697517	52697506	Y	ZNF350,ZNF432,ZNF836,ZNF83,ZNF808,ZNF766	ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	PPP2R1A	6047	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	53129559	53129725	53129643	Y	ZNF160,ZNF616,ZNF766,ZNF808,ZNF701,ZNF611,ZNF611,ZNF83	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF83	62024	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	53145294	53145545	53145446	Y	NA	ZNF83	NA	NA	NA	NA	ZNF83	46204	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.356263584976056
chr19	53150651	53150972	53150733	Y	NA	ZNF83	ZNF137P	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF83	40777	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.173481224953846
chr19	53237186	53237523	53237297	Y	ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611	ZNF83,ZNF611	NA	NA	NA	NA	ZNF611	860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr19	53426305	53426488	53426354	Y	ZNF765,ZNF468,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	17366	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.135808896032157
chr19	53444729	53445104	53444918	Y	ZNF765,ZNF761,ZNF665,ZNF347,ZNF347,ZNF160,ZNF808,ZNF701,ZNF701,ZNF83,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	875	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr19	53592651	53593387	53593361	Y	NA	ZNF160	NA	NA	NA	NA	ZNF160	11302	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF845	107141	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.767688656191047
chr19	53917190	53917573	53917346	Y	NA	ZNF765,ZNF761	NA	NA	NA	NA	ZNF761	15654	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	54048513	54048640	54048574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF813	79524	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	54049099	54049989	54049424	Y	ZNF160,ZNF845,ZNF761,ZNF813,NLRP12,ZNF331,ZNF331	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF813	80110	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr19	54168099	54168226	54168160	Y	ZNF765,ZNF761,ZNF813,DPRX	NA	NA	NA	NA	NA	AC008753.3	108627	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	54465243	54465494	54465291	Y	TFPT,PRPF31,NDUFA3,MYADM,CACNG7,CACNG8	NA	NA	NA	NA	NA	AC008753.6	94882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.244671570129293
chr19	54523388	54523781	54523608	Y	TARM1,VSTM1,RPS9,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LENG8,LAIR2,LAIR1,ZNF331,ZNF331,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA3	80255	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr19	54538982	54539278	54539125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA3	64758	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	54916959	54917284	54917122	Y	NA	LENG8,LENG8-AS1	TTYH1,LENG8	IMR90	Hi-C	24141950	LENG8	40781	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	55546101	55546409	55546255	Y	NA	RDH13	NA	NA	NA	NA	RDH13	34250	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	55582606	55582776	55582718	Y	NA	RDH13,PPP1R12C	NA	NA	NA	NA	RDH13	1947	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr19	55619280	55619321	55619308	Y	NA	RDH13,PPP1R12C,TNNT1	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	7606	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	55620515	55620603	55620559	Y	NA	RDH13,PPP1R12C,TNNT1	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	6324	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	55626810	55627228	55626935	Y	ZNF865,PPP1R12C	RDH13,TNNT1	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	55627475	55627790	55627718	Y	LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C	RDH13,PPP1R12C,TNNT1	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	548	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.223184029693526
chr19	55721470	55721547	55721521	Y	NA	PTPRH,PPP6R1	NA	NA	NA	NA	PTPRH	2596	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	55850120	55850505	55850225	Y	KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564	SUV420H2,IL11,TMEM238,RPL28	NA	NA	NA	NA	SUV420H2	899	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr19	55880979	55881171	55881094	Y	ZNF579,NAT14,COX6B2,IL11	SUV420H2,IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	IL11	1148	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	55885541	55885905	55885786	Y	NA	SUV420H2,IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	IL11	5710	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	55917170	55917359	55917333	Y	U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S	IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	UBE2S	25	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr19	55983917	55984059	55984005	Y	RDH13,HSPBP1,ISOC2	ISOC2,ZNF628,SSC5D	ZNF628,ISOC2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF628	1640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.212996815885384
chr19	55988531	55988605	55988568	Y	NAT14	ISOC2,ZNF628,SSC5D	NA	NA	NA	NA	ZNF628	2832	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.288915693369719
chr19	56031210	56031577	56031512	Y	TMEM150B,SGK110	ZNF628,SSC5D	NA	NA	NA	NA	SSC5D	33439	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr19	56060798	56061018	56060898	Y	NA	ZNF579,ZNF524	SGK110	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF579	29193	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.1996972976985
chr19	56061327	56061704	56061673	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1	SGK110	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF579	28507	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.457668386014678
chr19	56098668	56099098	56098905	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581	SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF579	8457	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.72911372142074
chr19	56117286	56117783	56117722	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	5950	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.155836138087189
chr19	56118803	56119132	56118967	Y	COX6B2	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	7467	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	56148080	56148375	56148228	Y	ZNF580	ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2,EPN1	NA	NA	NA	NA	CCDC106	2053	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	56218548	56218666	56218607	Y	SUV420H2,NLRP9,U2AF2	EPN1	NA	NA	NA	NA	EPN1	33956	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	56603212	56603388	56603235	Y	ZSCAN5A,NLRP11,NLRP8,NLRP5	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	27261	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	56621885	56622165	56622061	Y	NA	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	8484	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	56673673	56673939	56673846	Y	NA	ZNF787,ZNF444	GALP	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF444	31705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	56796830	56796936	56796883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN5A	80816	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	56807694	56808027	56807709	Y	NLRP13,ZSCAN5A	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN5A	69725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	56810811	56811236	56810900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN5A	66516	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr19	56831287	56831644	56831534	Y	ZSCAN5A	ZSCAN5A	NA	NA	NA	NA	ZSCAN5A	46108	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr19	57944833	57945004	57944919	Y	NA	ZNF548,ZNF17,ZNF749,ZNF772	NA	NA	NA	NA	ZNF749	136	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	58175767	58176046	58175802	Y	ZNF460,ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,ZNF772,ZNF549,ZSCAN18,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF776,ZNF671,ZNF586,ZNF418,ZNF417,ZNF256,ZNF135,ZNF550,ZNF211,ZNF551	ZNF211	NA	NA	NA	NA	ZNF211	36006	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	58317986	58318160	58318072	Y	NA	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	6121	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	58321012	58321020	58321017	Y	VN1R1,ZNF211,ZNF587,ZNF417,ZNF776,ZNF586,ZNF552	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	3261	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr19	58413801	58413982	58413868	Y	ZNF154,ZNF418	ZNF417	NA	NA	NA	NA	ZNF417	11996	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr19	58557282	58557656	58557471	Y	NA	CTD-2368P22.1,ZNF606	NA	NA	NA	NA	ZNF606	44565	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.145265960649932
chr19	58742086	58742094	58742090	Y	NA	ZNF274,ZNF544,ZNF8	NA	NA	NA	NA	ZNF544	4126	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr19	58781089	58781297	58781193	Y	NA	ZNF544,ZNF8,ERVK3-1	ZNF8	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF8	7021	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr19	58824678	58824957	58824818	Y	ZNF256	ZNF8,ERVK3-1,ZSCAN22,A1BG,ZNF497	NA	NA	NA	NA	ERVK3-1	9963	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	58886804	58887095	58886950	Y	ZNF606,ZSCAN22,ZNF324B	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584	NA	NA	NA	NA	ZNF837	3332	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.5004701022779
chr19	59029635	59029989	59029796	Y	NA	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M	SLC27A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC27A5	7855	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr19	59058033	59058475	59058195	Y	NA	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	TRIM28	4575	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	59078228	59078288	59078258	Y	CHMP2A,CHMP2A	ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	CENPBD1P1	4582	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr19	59087419	59087864	59087514	Y	NA	ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	MZF1	4477	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	393939	394227	394175	Y	SH3YL1	NA	NA	NA	NA	NA	ACP1	131799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.284187161060831
chr2	628526	628919	628630	Y	NA	TMEM18	FAM150B	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM18	46520	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.369563103162941
chr2	1590812	1591204	1590899	Y	NA	NA	PXDN,MYT1L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PXDN	155420	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20553894282687
chr2	1722150	1722351	1722236	Y	NA	PXDN	NA	NA	NA	NA	PXDN	24273	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	1725053	1725311	1725239	Y	NA	PXDN	NA	NA	NA	NA	PXDN	21313	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	2524878	2525262	2524882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PXDN	778254	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	2850815	2851100	2850821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	528553	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	3340825	3341028	3341010	Y	NA	TSSC1,TRAPPC12	NA	NA	NA	NA	TSSC1	38625	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr2	3483837	3484086	3483869	Y	NA	ADI1	NA	NA	NA	NA	ADI1	37421	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	3583560	3583858	3583796	Y	NA	AC108488.4,RNASEH1-AS1,RNASEH1,RPS7	NA	NA	NA	NA	AC108488.4	1097	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr2	7191649	7191931	7191786	Y	RNF144A	NA	NA	NA	NA	NA	RSAD2	187712	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	8163067	8163278	8163219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ID2	653697	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	8453183	8453334	8453274	Y	ID2	NA	NA	NA	NA	NA	ID2	363641	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	8712183	8712281	8712245	Y	NA	NA	LINC00299,LOC100506274,ID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ID2	104694	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	8743061	8743194	8743128	Y	ID2	NA	LOC100506274,ID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ID2	73781	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	8767111	8767480	8767322	Y	NA	ID2	LINC00299,LOC339788,LOC100506274	IMR90	Hi-C	24141950	ID2	49495	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	8816590	8817048	8816915	Y	NA	AC011747.7	NA	NA	NA	NA	ID2	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	8927568	8927875	8927735	Y	NA	KIDINS220	NA	NA	NA	NA	KIDINS220	47885	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	9347909	9348072	9347942	Y	NA	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	3015	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	9374844	9375591	9375054	Y	YWHAQ,ASAP2	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	29950	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	9391833	9392063	9392058	Y	NA	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	46939	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	9427801	9428115	9428020	Y	YWHAQ,ITGB1BP1,ASAP2	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	82907	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	9641378	9641587	9641543	Y	NA	IAH1	NA	NA	NA	NA	IAH1	29591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	9686288	9686554	9686518	Y	NA	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	7367	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	9688603	9688902	9688848	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	5019	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	9705660	9705808	9705714	Y	NA	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	11739	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.120163000724761
chr2	9795695	9795818	9795794	Y	NA	YWHAQ,RP11-521D12.1	YWHAQ,GRHL1,ADAM17,KLF11	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-521D12.1	18794	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	9815627	9815977	9815711	Y	NA	YWHAQ,RP11-521D12.1	NA	NA	NA	NA	RP11-521D12.1	38726	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr2	9826242	9826464	9826356	Y	NA	RP11-521D12.1	YWHAQ,ADAM17	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-521D12.1	49341	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.358262776535316
chr2	9893339	9893657	9893442	Y	ADAM17,KLF11,KLF11	NA	YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	TAF1B	87826	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328048320672142
chr2	9894353	9894610	9894569	Y	ADAM17,KLF11,KLF11,GRHL1	NA	YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1,KLF11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TAF1B	86873	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.283074048241349
chr2	9941222	9941554	9941329	Y	ADAM17,KLF11,KLF11	TAF1B	YWHAQ,KLF11,CYS1,ADAM17,ODC1,RRM2,GRHL1,TAF1B,HPCAL1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TAF1B	39929	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	10075100	10075410	10075131	Y	TAF1B	GRHL1	GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	GRHL1	7931	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr2	10176248	10176551	10176348	Y	NA	AC010969.1,KLF11	NA	NA	NA	NA	KLF11	4425	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	10260365	10260994	10260486	Y	ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.91149477480487
chr2	10261505	10261712	10261609	Y	NA	RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	1050	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr2	10274411	10274722	10274506	Y	TAF1B,RRM2,RRM2,C2orf48	RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	13956	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.395779175907595
chr2	10330449	10330626	10330557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	69994	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr2	10341486	10341905	10341708	Y	KLF11	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	81031	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	10423423	10423670	10423576	Y	NA	HPCAL1	RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HPCAL1	17345	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.202426638448127
chr2	10425680	10425925	10425803	Y	HPCAL1	HPCAL1	HPCAL1,RRM2,C2orf48,MIR4261	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HPCAL1	15090	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.275616175182834
chr2	10522808	10523000	10522904	Y	HPCAL1	NA	NA	NA	NA	NA	ODC1	63630	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr2	10540655	10540950	10540779	Y	KLF11,KLF11,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	NA	NA	NA	NA	ODC1	45680	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	10549320	10549595	10549372	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	NA	NA	NA	NA	ODC1	37035	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.34061768966866
chr2	10550434	10550795	10550555	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	ODC1	IMR90	Hi-C	24141950	ODC1	35835	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.881123933047661
chr2	10572027	10572239	10572154	Y	NA	ODC1,RP11-320M2.1	NA	NA	NA	NA	ODC1	14391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.989412387503838
chr2	11352501	11352895	11352887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLC3	59177	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr2	11483029	11483376	11483266	Y	NA	ROCK2	NA	NA	NA	NA	ROCK2	3080	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200810410517982
chr2	11514785	11514933	11514926	Y	NA	ROCK2	ROCK2,E2F6,PQLC3,PDIA6,C2orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ROCK2	28329	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.450593476585279
chr2	11547236	11547448	11547321	Y	NA	NA	ROCK2,PQLC3,C2orf50	IMR90	Hi-C	24141950	E2F6	56849	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	11720189	11720409	11720300	Y	NA	GREB1	NA	NA	NA	NA	GREB1	47947	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	11837707	11837887	11837797	Y	E2F6,LPIN1	LPIN1,AC106875.1	GREB1,LPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	AC106875.1	18121	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr2	11884050	11884543	11884432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC106875.1	64464	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.312402425364746
chr2	11893649	11894247	11893895	Y	LPIN1	NA	NA	NA	NA	NA	AC106875.1	74063	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	11970305	11970612	11970555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC106875.1	150719	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.232485164761891
chr2	12596433	12596805	12596535	Y	NA	NA	LPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	258210	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	12633247	12633315	12633291	Y	NA	NA	TRIB2,LPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	221700	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr2	13447993	13448374	13448173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB2	592978	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	15332010	15332377	15332192	Y	DDX1,NBAS	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	367077	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	15561739	15562014	15561765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	137440	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	17967823	17967867	17967845	Y	MSGN1	GEN1,SMC6	NA	NA	NA	NA	SMC6	11642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	19273463	19273583	19273517	Y	NA	NA	OSR1	IMR90	Hi-C	24141950	RDH14	533517	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	19548078	19548301	19548191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC32	551446	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	20171563	20171753	20171690	Y	TTC32	WDR35,MATN3	NA	NA	NA	NA	WDR35	16139	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	20176136	20176469	20176303	Y	WDR35	WDR35,MATN3	NA	NA	NA	NA	WDR35	11423	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr2	20249984	20250622	20250147	Y	TTC32,PUM2	MATN3,LAPTM4A,RP11-644K8.1	NA	NA	NA	NA	RP11-644K8.1	89	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr2	20252703	20252899	20252848	Y	NA	MATN3,LAPTM4A,RP11-644K8.1	NA	NA	NA	NA	RP11-644K8.1	2808	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr2	20262884	20263152	20263015	Y	TTC32	LAPTM4A,RP11-644K8.1	WDR35,MATN3,LAPTM4A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-644K8.1	12989	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	20407883	20408194	20408074	Y	RHOB,SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	15000	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	20421306	20421667	20421468	Y	NA	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	1527	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	20431248	20431615	20431535	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	8054	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	20491517	20491908	20491876	Y	NA	NA	SDC1	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	58087	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr2	20534195	20534238	20534216	Y	NA	PUM2	NA	NA	NA	NA	PUM2	15757	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	20544740	20544866	20544805	Y	NA	PUM2	PUM2,HS1BP3	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	5129	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	20548410	20548604	20548507	Y	NA	PUM2	HS1BP3,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	1391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	20638245	20638508	20638456	Y	HS1BP3	RHOB,AC023137.2	HS1BP3,GDF7	IMR90	Hi-C	24141950	RHOB	6327	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	20706791	20707147	20707052	Y	HS1BP3	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC023137.2	57988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.145265960649932
chr2	20709880	20710074	20709978	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90	Hi-C	24141950	AC023137.2	61077	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.634992064537633
chr2	20726594	20726630	20726611	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC023137.2	77791	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	20732744	20733106	20733037	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC023137.2	83941	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.8670768306115
chr2	20779015	20779511	20779185	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	69338	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr2	20784084	20784557	20784460	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	64292	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	20793103	20793496	20793437	Y	APOB	NA	HS1BP3,RHOB,PUM2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	55353	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr2	20795868	20796230	20795893	Y	RHOB,HS1BP3	NA	HS1BP3,RHOB,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	HS1BP3	52619	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	20796774	20797139	20797030	Y	APOB,RHOB,GDF7	NA	NA	NA	NA	NA	HS1BP3	51710	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	20817015	20817334	20817182	Y	RHOB,GDF7	HS1BP3	NA	NA	NA	NA	HS1BP3	31515	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr2	20848318	20848468	20848370	Y	NA	HS1BP3	NA	NA	NA	NA	HS1BP3	381	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	21691615	21691861	21691725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC067959.1	249568	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr2	23609943	23610311	23610250	Y	KLHL29	KLHL29	NA	NA	NA	NA	KLHL29	3855	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	23681941	23682000	23681953	Y	KLHL29	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	75853	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	23712282	23712487	23712385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	106194	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	23901919	23902357	23902230	Y	UBXN2A	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	245627	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	23923305	23923445	23923375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	224539	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	24122171	24122336	24122254	Y	NA	ATAD2B,UBXN2A,SDHCP3	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	25648	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	24491623	24491942	24491630	Y	ATAD2B,NCOA1,ITSN2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL36AP13	63439	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	24626364	24626604	24626483	Y	NA	ITSN2	CENPO,ADCY3,NCOA1,ITSN2,LOC375190,C2orf84,PTRHD1,EFR3B,DNAJC27,DNAJC27-AS1,POMC	IMR90	Hi-C	24141950	ITSN2	44781	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	24713346	24713697	24713476	Y	DNAJC27,ITSN2	NA	CENPO,NCOA1	IMR90	Hi-C	24141950	ITSN2	131763	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	24859370	24859696	24859496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPO	154309	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	25021346	25021618	25021482	Y	NA	CENPO,PTRHD1	NA	NA	NA	NA	PTRHD1	7095	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	25096617	25097268	25096771	Y	NA	ADCY3	NA	NA	NA	NA	ADCY3	43440	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.378134089040938
chr2	25136821	25136958	25136890	Y	NA	ADCY3	NA	NA	NA	NA	ADCY3	3750	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr2	25352140	25352468	25352150	Y	DNAJC27,EFR3B,DNMT3A,DNMT3A	NA	NA	NA	NA	NA	EFR3B	89141	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	25473699	25473887	25473786	Y	EFR3B	NA	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	89572	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	25517596	25517908	25517752	Y	DNAJC27,DNMT3A	DNMT3A	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	45551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	25518028	25518279	25518198	Y	DNAJC27,DNMT3A	DNMT3A	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	45180	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	25646148	25646487	25646318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	82689	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	25781272	25781487	25781393	Y	RAB10	NA	NA	NA	NA	NA	DTNB	113016	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	26220678	26220902	26220866	Y	RAB10	KIF3C,UQCRHP2,RAB10	ASXL2,RAB10,FAM59B,KIF3C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UQCRHP2	5015	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr2	26235500	26235661	26235564	Y	RAB10	KIF3C,UQCRHP2,RAB10	FAM59B,KIF3C,RAB10,ASXL2,HADHA,HADHB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAB10	19315	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	26241064	26241266	26241191	Y	RAB10	KIF3C,UQCRHP2,RAB10	ASXL2,RAB10,FAM59B,HADHB,KIF3C,HADHA	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAB10	13710	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	26258152	26258567	26258448	Y	RAB10	UQCRHP2,RAB10	NA	NA	NA	NA	RAB10	3176	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	26259161	26259559	26259360	Y	RAB10	UQCRHP2,RAB10	NA	NA	NA	NA	RAB10	4185	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr2	26352135	26352230	26352183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB10	97159	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr2	26522632	26522929	26522714	Y	NA	EPT1,GPR113	NA	NA	NA	NA	EPT1	6486	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	26605539	26605826	26605756	Y	RAB10	GPR113	NA	NA	NA	NA	GPR113	37854	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	26919291	26919602	26919376	Y	NA	AC015977.5,KCNK3	NA	NA	NA	NA	KCNK3	5672	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	26943701	26943984	26943834	Y	GPR113	AC015977.5,KCNK3,CENPA	NA	NA	NA	NA	KCNK3	30082	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.194968765389612
chr2	26946934	26947339	26946998	Y	C2orf28,C2orf28,HADHA,HADHB,C2orf18	AC015977.5,KCNK3,CENPA	NA	NA	NA	NA	KCNK3	33315	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.21468551264051
chr2	26980806	26981182	26980970	Y	C2orf18	CENPA	OTOF,CENPA,C2orf70,CIB4,KCNK3,DPYSL5,MAPRE3,C2orf18	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CENPA	3975	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.333889965800512
chr2	26991953	26992165	26992073	Y	GPR113	CENPA	CENPA	IMR90	Hi-C	24141950	CENPA	6796	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr2	27005355	27005756	27005547	Y	NA	CENPA	NA	NA	NA	NA	CENPA	20198	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.346076371167914
chr2	27304052	27304486	27304234	Y	CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1	AGBL5,OST4,KHK	NA	NA	NA	NA	KHK	3129	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.83218705556621
chr2	27543962	27544264	27544065	Y	NA	SLC30A3,TRIM54,MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17	NA	NA	NA	NA	MPV17	2283	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr2	27614467	27614499	27614483	Y	EIF2B4,EIF2B4	AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1	NA	NA	NA	NA	FTH1P3	233	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	27629706	27629770	27629738	Y	NA	EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1	NA	NA	NA	NA	PPM1G	784	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	27631105	27631216	27631160	Y	C2orf16	EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1	NA	NA	NA	NA	PPM1G	551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	27878874	27879165	27879028	Y	SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP	GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L	NA	NA	NA	NA	SLC4A1AP	5173	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr2	27942982	27943239	27943170	Y	RBKS	AC074091.13,MRPL33	RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2,PLB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC074091.13	6383	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	27958320	27958698	27958604	Y	NA	AC074091.13,MRPL33	BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC074091.13	21721	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.268158302124319
chr2	28003613	28003725	28003670	Y	NA	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	11029	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	28021914	28022357	28022176	Y	RBKS	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	29330	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	28024813	28024890	28024852	Y	IFT172,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L,MRPL33	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	32229	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	28077414	28077634	28077524	Y	ZNF513,ZNF513,RBKS	BRE,RBKS	MRPL33	IMR90	Hi-C	24141950	BRE	33174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	28124092	28124474	28124302	Y	FOSL2,RBKS	BRE,RBKS	NA	NA	NA	NA	RBKS	12127	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	28134368	28134411	28134390	Y	NA	BRE,RBKS	NA	NA	NA	NA	RBKS	22403	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	28143450	28143703	28143578	Y	FOSL2,RBKS,BRE,BRE	BRE,RBKS	NA	NA	NA	NA	RBKS	31485	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	28181257	28181638	28181448	Y	C2orf16	NA	NA	NA	NA	NA	RBKS	69292	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	28215985	28216067	28216026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBKS	104020	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	28383730	28384110	28383893	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	229205	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	28400759	28401210	28400868	Y	RBKS,BRE,BRE,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	212105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	28492228	28492339	28492284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	120976	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.381749508530343
chr2	28492364	28492732	28492561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	120583	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.286916501810459
chr2	28496743	28497020	28496828	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	116295	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	28497824	28498240	28497982	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	115075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	28498872	28499304	28499073	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	114011	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	28579030	28579220	28579083	Y	RBKS,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	NA	NA	NA	NA	FOSL2	34095	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.216839269454495
chr2	28582195	28582710	28582283	Y	NA	FOSL2,AC104695.3	NA	NA	NA	NA	FOSL2	30605	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.198081069768355
chr2	28583371	28583537	28583468	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	SLC4A1AP,MRPL33,RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2	IMR90	Hi-C	24141950	FOSL2	29778	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.145265960649932
chr2	28583784	28584228	28583975	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	SLC4A1AP,MRPL33,RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2	IMR90	Hi-C	24141950	FOSL2	29087	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr2	28589272	28589573	28589455	Y	FOSL2	FOSL2,AC104695.3	BRE,RBKS,FOSL2,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSL2	23742	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr2	28589661	28589896	28589794	Y	FOSL2	FOSL2,AC104695.3	BRE,RBKS,FOSL2,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSL2	23419	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	28600937	28601380	28601351	Y	RBKS,BRE,BRE,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	RBKS,BRE,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,MRPL33,LOC100505716,FOSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSL2	11935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	28621403	28621758	28621597	Y	PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	NA	NA	NA	NA	AC104695.3	5864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	28632075	28632521	28632225	Y	PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	NA	NA	NA	NA	AC104695.3	16536	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	28659517	28659673	28659646	Y	NA	FOSL2,AC104695.3	FOSL2	MCF7	ChIA-PET	22265404	AC104695.3	43978	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr2	28668874	28669088	28668964	Y	PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	BRE,RBKS,PLB1	IMR90	Hi-C	24141950	AC104695.3	53335	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	28767576	28768254	28768064	Y	WDR43,TRMT61B,SPDYA	NA	NA	NA	NA	NA	AC104695.3	152037	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.17530750824941
chr2	28806831	28807046	28806964	Y	FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1CB	165460	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr2	28833397	28833696	28833546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1CB	138810	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr2	28939068	28939564	28939261	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB	PPP1CB	PLB1,SLC4A1AP,PPP1CB,SPDYA	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1CB	32942	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	28976141	28976573	28976382	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B	PPP1CB	SPDYA	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1CB	3635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.155836138087189
chr2	29009696	29009902	29009742	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB	PPP1CB	NA	NA	NA	NA	PPP1CB	37190	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	29060448	29060640	29060540	Y	PPP1CB,PPP1CB	TRMT61B	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	30527	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	29075660	29075992	29075826	Y	TRMT61B	TRMT61B,WDR43	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	15175	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.135808896032157
chr2	29331222	29331429	29331307	Y	NA	CLIP4	CLIP4	MCF7	ChIA-PET	22265404	CLIP4	12651	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.509753345942734
chr2	29339148	29339698	29339489	Y	NA	CLIP4	NA	NA	NA	NA	CLIP4	20577	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.287072431359869
chr2	29746427	29746759	29746593	Y	ALK	NA	NA	NA	NA	NA	CLIP4	427856	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	30644994	30645276	30645103	Y	LBH	LCLAT1	LBH,LCLAT1	IMR90	Hi-C	24141950	LCLAT1	22816	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	30791728	30792075	30791902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	123636	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	30887906	30888094	30887998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPN13	153314	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr2	32166229	32166498	32166237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMO1	67801	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	33805444	33805464	33805454	Y	RASGRP3	FAM98A	NA	NA	NA	NA	FAM98A	16985	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	36189102	36189392	36189167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	391677	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	36584242	36585529	36584872	Y	FEZ2,CRIM1	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	3173	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.828344601997101
chr2	36599325	36599532	36599405	Y	NA	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	18256	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr2	36687110	36687380	36687132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	106041	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	36700444	36700711	36700553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	119375	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	36712578	36712925	36712822	Y	CRIM1,FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	131509	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	36713753	36714120	36713762	Y	CRIM1,VIT,FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	132684	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr2	36761840	36762400	36762263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	108830	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr2	36790074	36790520	36790216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	80710	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	36790527	36791707	36791646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79523	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.163294011145704
chr2	36791809	36792197	36792002	Y	CRIM1	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79033	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	36795570	36795942	36795825	Y	FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	75288	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	37116938	37117262	37117216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	74353	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	37383262	37383336	37383288	Y	NA	EIF2AK2,AC007390.4	NA	NA	NA	NA	EIF2AK2	1054	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr2	37489254	37489354	37489306	Y	NA	CEBPZ	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	32398	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	37491311	37491687	37491498	Y	NA	CEBPZ	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	34455	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	37788822	37789049	37788928	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	174562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr2	37789550	37789826	37789587	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	173785	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr2	37813379	37813644	37813592	Y	EIF2AK2,EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3	NA	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	149967	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	38340220	38340542	38340303	Y	CDC42EP3,CYP1B1	CYP1B1	FAM82A1,CYP1B1,CYP1B1-AS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP1B1	5176	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	38369402	38369882	38369670	Y	NA	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	34358	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	38373682	38374230	38374188	Y	CDC42EP3,CYP1B1	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	38638	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.120163000724761
chr2	38375670	38375904	38375803	Y	CDC42EP3,CYP1B1	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	40626	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.175324486963695
chr2	38395987	38396176	38396066	Y	CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P12	60534	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	38401547	38402107	38401851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P12	54603	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	38472288	38472516	38472419	Y	FAM82A1	RPL7P12,AC009229.5	FAM82A1,CYP1B1-AS1,CYP1B1	IMR90	Hi-C	24141950	AC009229.5	7556	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	38538303	38538646	38538475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATL2	63781	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	38552581	38552739	38552658	Y	NA	ATL2	NA	NA	NA	NA	ATL2	49688	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	39059251	39059604	39059469	Y	NA	DHX57,MORN2	NA	NA	NA	NA	DHX57	41471	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	39227784	39228037	39227911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOS1	121449	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	39334876	39335293	39335230	Y	NA	SOS1	NA	NA	NA	NA	SOS1	14193	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	39338546	39339120	39338978	Y	ARHGEF33	SOS1	NA	NA	NA	NA	SOS1	10366	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	39665108	39665339	39665266	Y	NA	AC007246.3,MAP4K3	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	2655	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.275616175182834
chr2	40740451	40740721	40740596	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007317.1	230906	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	42046531	42047126	42046845	Y	PKDCC	NA	NA	NA	NA	NA	AC104654.2	111737	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr2	42068299	42068635	42068587	Y	NA	NA	EML4	IMR90	Hi-C	24141950	AC104654.2	90228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	42149327	42149700	42149496	Y	PKDCC	AC104654.2	NA	NA	NA	NA	AC104654.2	9163	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	42155945	42156079	42156067	Y	NA	AC104654.2	NA	NA	NA	NA	AC104654.2	2784	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.429453121710763
chr2	42157961	42158315	42158139	Y	PKDCC	AC104654.2	NA	NA	NA	NA	AC104654.2	548	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.576718273919955
chr2	42161610	42162017	42161892	Y	NA	AC104654.2	NA	NA	NA	NA	AC104654.2	2747	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr2	42182061	42182670	42182320	Y	PKDCC	AC104654.2	NA	NA	NA	NA	AC104654.2	23198	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.64027738142857
chr2	42190702	42191089	42190887	Y	NA	AC104654.2	C2orf91	IMR90	Hi-C	24141950	AC104654.2	31839	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.499530354066727
chr2	42193606	42193918	42193678	Y	PKDCC	AC104654.2	C2orf91	IMR90	Hi-C	24141950	AC104654.2	34743	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.193352537459468
chr2	42194638	42194757	42194709	Y	NA	AC104654.2	C2orf91	IMR90	Hi-C	24141950	AC104654.2	35775	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.221184838134266
chr2	42278314	42278459	42278342	Y	NA	AC013480.2,PKDCC	NA	NA	NA	NA	PKDCC	5154	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	42351253	42351626	42351357	Y	EML4	EML4	EML4,COX7A2L,LOC388942	IMR90	Hi-C	24141950	EML4	42864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	42360195	42360705	42360352	Y	EML4	EML4	EML4,COX7A2L,LOC388942	IMR90	Hi-C	24141950	EML4	33785	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	42368526	42368635	42368598	Y	NA	EML4	EML4,LOC388942,C2orf91,COX7A2L	IMR90	Hi-C	24141950	EML4	25855	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr2	42368874	42369229	42369001	Y	EML4	EML4	EML4,LOC388942,C2orf91,COX7A2L	IMR90	Hi-C	24141950	EML4	25261	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.128351022973642
chr2	42481657	42481775	42481735	Y	EML4	NA	NA	NA	NA	NA	EML4	87167	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	42535809	42536204	42535901	Y	NA	NA	COX7A2L	IMR90	Hi-C	24141950	COX7A2L	114024	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	42567305	42567366	42567336	Y	EML4	NA	NA	NA	NA	NA	COX7A2L	82862	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	42696554	42696964	42696742	Y	NA	COX7A2L,KCNG3,MTA3	NA	NA	NA	NA	KCNG3	22273	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr2	43037224	43037999	43037611	Y	NA	NA	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC016735.2	226687	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr2	43038629	43038924	43038876	Y	NA	NA	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO,PLEKHH2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC016735.2	225762	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	43063239	43063414	43063325	Y	NA	NA	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,ABCG8	IMR90	Hi-C	24141950	AC016735.2	201272	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr2	43151826	43152270	43152066	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC016735.2	112416	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr2	43152648	43152978	43152751	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC016735.2	111708	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.145265960649932
chr2	43163572	43163725	43163650	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90	Hi-C	24141950	AC016735.2	100961	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	43245528	43245689	43245593	Y	NA	AC016735.2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90	Hi-C	24141950	AC016735.2	18997	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	43265724	43265951	43265843	Y	NA	AC016735.2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90	Hi-C	24141950	AC016735.2	1038	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr2	43267467	43267802	43267635	Y	NA	AC016735.2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC016735.2	2781	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	43269026	43269323	43269208	Y	NA	AC016735.2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC016735.2	4340	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr2	43302253	43302513	43302383	Y	NA	AC016735.2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC016735.2	37567	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr2	43310956	43311104	43311039	Y	NA	AC016735.2	THADA,ZFP36L2,LOC100129726	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC016735.2	46270	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	43358229	43358771	43358564	Y	NA	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	92977	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	43385938	43386506	43386186	Y	OXER1,ZFP36L2	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	65242	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.05514405118003
chr2	43396497	43396745	43396689	Y	OXER1,ZFP36L2	NA	LOC100129726,ZFP36L2,THADA	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	55003	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	43405877	43406433	43406206	Y	OXER1	ZFP36L2	ZFP36L2,THADA,LOC100129726	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	45315	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.1996972976985
chr2	43422005	43422472	43422185	Y	THADA,THADA,ZFP36L2	ZFP36L2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	29276	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	43532128	43532543	43532333	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZFP36L2	80380	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	43567873	43568259	43568066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP36L2	116125	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	43762812	43762910	43762862	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726	MCF7	ChIA-PET	22265404	THADA	58275	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	43818575	43818651	43818610	Y	NA	THADA	NA	NA	NA	NA	THADA	2534	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	44007303	44007575	44007439	Y	NA	DYNC2LI1	NA	NA	NA	NA	DYNC2LI1	8125	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	44212195	44212421	44212308	Y	NA	LRPPRC	NA	NA	NA	NA	LRPPRC	8723	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	44935582	44935781	44935667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012354.8	285771	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	45237112	45237533	45237325	Y	SIX2	AC012354.8,SIX2	NA	NA	NA	NA	SIX2	2543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	45405025	45405418	45405218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIX2	170456	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	45811183	45811373	45811272	Y	NA	SRBD1	NA	NA	NA	NA	SRBD1	25931	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	46265425	46265774	46265513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	253032	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	46294979	46295300	46295093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	223506	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr2	46303554	46303874	46303714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	214932	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.402506899775743
chr2	46409270	46409537	46409436	Y	EPAS1	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	109269	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr2	46451921	46452099	46452016	Y	NA	NA	PRKCE,EPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	EPAS1	66707	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr2	46452124	46452363	46452229	Y	RHOQ	NA	PRKCE,EPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	EPAS1	66443	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr2	46525633	46526278	46526263	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	6827	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr2	46536857	46537129	46536993	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	18051	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	46542401	46542637	46542520	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	23595	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	46542843	46542999	46542890	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	24037	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr2	46557036	46557117	46557077	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	38230	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	46578990	46579175	46579103	Y	EPAS1	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	60184	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	46586439	46586863	46586504	Y	EPAS1	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	67633	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	46825586	46825695	46825639	Y	NA	CRIPT,PIGF	NA	NA	NA	NA	CRIPT	15860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	46857387	46857788	46857588	Y	NA	CRIPT,PIGF	NA	NA	NA	NA	PIGF	15129	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr2	47075244	47075442	47075379	Y	MCFD2,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	65854	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	47076896	47077421	47077187	Y	SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	63875	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	47077976	47078245	47078111	Y	SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	63051	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	47100841	47101015	47100907	Y	NA	TTC7A	NA	NA	NA	NA	TTC7A	40281	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	47194379	47194775	47194547	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	27385	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr2	47195176	47195614	47195246	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	28182	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.961197123199925
chr2	47197841	47198107	47197954	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	30847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr2	47212237	47212567	47212294	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	45243	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	47213827	47213985	47213928	Y	NA	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	46833	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr2	47214273	47214540	47214407	Y	NA	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	47279	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	47229826	47230084	47229931	Y	TTC7A	NA	NA	NA	NA	NA	MCFD2	62832	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	47270774	47271231	47270943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFD2	103780	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr2	47297632	47297822	47297725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALM2	103918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	47405225	47405390	47405334	Y	NA	CALM2	C2orf61	IMR90	Hi-C	24141950	CALM2	3485	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	47418967	47419222	47419129	Y	NA	CALM2	TTC7A,C2orf61,SOCS5,MCFD2,CALM2,EPCAM	IMR90	Hi-C	24141950	CALM2	17227	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	47499706	47499760	47499719	Y	C2orf61	NA	TTC7A,CALM2,SOCS5,MCFD2,C2orf61	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPCAM	70537	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	47796567	47796699	47796698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079250.1	119686	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	48118003	48118146	48118074	Y	NA	FBXO11	NA	NA	NA	NA	FBXO11	12786	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	48709527	48709805	48709665	Y	FOXN2,KLRAQ1	PPP1R21	NA	NA	NA	NA	PPP1R21	43790	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	48718676	48719233	48718981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R21	52939	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	48737563	48737807	48737675	Y	STON1-GTF2A1L,STON1	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R21	71826	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr2	50631357	50631742	50631589	Y	NRXN1	NA	NA	NA	NA	NA	NRXN1	625932	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	50951878	50951957	50951935	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRXN1	305717	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	51010628	51010803	51010737	Y	NRXN1,NRXN1	NA	NA	NA	NA	NA	NRXN1	246871	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	53331505	53331666	53331586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHAC2	661263	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	53366403	53366414	53366408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHAC2	626515	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	54022416	54022710	54022562	Y	NA	CHAC2,ERLEC1	NA	NA	NA	NA	ERLEC1	10235	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	54111882	54111915	54111897	Y	NA	GPR75-ASB3,ASB3	NA	NA	NA	NA	ASB3	26585	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	54196339	54196842	54196524	Y	ASB3,ASB3,PSME4	ACYP2,PSME4	NA	NA	NA	NA	PSME4	362	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr2	54786900	54787386	54787056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	105478	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.515942176632355
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	106081	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.08047404518491
chr2	54796924	54797237	54797074	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	115502	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	54799241	54799892	54799606	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	117819	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	54801406	54802103	54801693	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	119984	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	55249584	55250267	55249993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	87490	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr2	55327095	55327368	55327210	Y	RTN4	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	10389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.171864997023702
chr2	55327778	55327923	55327859	Y	NA	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	9834	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	55329161	55329446	55329300	Y	NA	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	8311	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	55379709	55379882	55379800	Y	SMEK2,RTN4	RTN4	NA	NA	NA	NA	RTN4	41952	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	55450545	55450658	55450592	Y	CCDC88A,EML6,RTN4	RPS27A,MTIF2	NA	NA	NA	NA	RPS27A	6381	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	55767070	55767336	55767332	Y	NA	CCDC104	NA	NA	NA	NA	CCDC104	22330	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	56070301	56070618	56070423	Y	NA	NA	EFEMP1	IMR90	Hi-C	24141950	EFEMP1	78656	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	56089907	56090266	56090122	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFEMP1	59008	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	56099404	56099776	56099646	Y	NA	EFEMP1	NA	NA	NA	NA	EFEMP1	49498	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	58002154	58002414	58002211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	130372	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr2	58271974	58272513	58272036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	139188	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	58334895	58335527	58335141	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	130980	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	58339709	58340405	58340032	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	126102	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.252129443187807
chr2	59983827	59983888	59983858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	625852	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	60962204	60962802	60962781	Y	NA	PAPOLG	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	18563	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227912562002414
chr2	61061403	61061827	61061632	Y	NA	REL	NA	NA	NA	NA	REL	44829	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	61112067	61112568	61112226	Y	REL	REL,RNU4-51P	NA	NA	NA	NA	REL	5411	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	61126778	61127091	61126822	Y	REL	REL,RNU4-51P	NA	NA	NA	NA	RNU4-51P	9347	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	61165363	61165465	61165452	Y	NA	RNU4-51P	NA	NA	NA	NA	RNU4-51P	28925	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	61204524	61204872	61204698	Y	NA	PEX13,PUS10	REL	IMR90	Hi-C	24141950	PEX13	37488	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	61464355	61464721	61464539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHSA2	61802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	61586795	61586939	61586907	Y	AHSA2,USP34	NA	NA	NA	NA	NA	USP34	108965	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	61698926	61699282	61699220	Y	PUS10,AHSA2,USP34	USP34	NA	NA	NA	NA	USP34	3022	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	61748471	61748954	61748828	Y	NA	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	14807	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	61757728	61758222	61758112	Y	NA	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	5539	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr2	61766465	61766637	61766569	Y	AHSA2,USP34	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	2704	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	61898281	61898531	61898442	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90	Hi-C	24141950	XPO1	134520	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr2	61921641	61922071	61921953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM161A	157207	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.293644225678606
chr2	61990946	61991094	61991044	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	88184	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.398508516657222
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.76916729758074
chr2	62534127	62534336	62534147	Y	NA	NA	COMMD1	IMR90	Hi-C	24141950	B3GNT2	112879	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	63129477	63129780	63129501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OTX1	145412	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	63446182	63446204	63446197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OTX1	170990	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18478155158147
chr2	63452850	63453196	63453026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OTX1	177658	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr2	63961711	63961835	63961773	Y	NA	NA	UGP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC096664.1	52272	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	64017775	64017931	64017855	Y	PELI1	WDPCP,UGP2	UGP2	IMR90	Hi-C	24141950	WDPCP	35046	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	64207040	64207416	64207228	Y	NA	VPS54	NA	NA	NA	NA	VPS54	36790	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	64245195	64245602	64245370	Y	NA	VPS54	NA	NA	NA	NA	VPS54	989	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	64552666	64552842	64552755	Y	PELI1,SERTAD2,AFTPH	NA	PELI1,AFTPH,LINC00309	IMR90	Hi-C	24141950	LGALSL	126261	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	64587056	64587400	64587325	Y	NA	NA	AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	LGALSL	91703	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	64756167	64756526	64756224	Y	NA	AFTPH	NA	NA	NA	NA	AFTPH	6702	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	64772977	64773339	64773158	Y	SLC1A4,AFTPH	AFTPH	NA	NA	NA	NA	AFTPH	23512	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr2	64879120	64879608	64879340	Y	NA	NA	LOC339807	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	96531	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	64879615	64879792	64879667	Y	SERTAD2	NA	LOC339807	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	96347	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	64978173	64978610	64978385	Y	CEP68	SERTAD2	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	2034	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.244671570129293
chr2	64994926	64995226	64995021	Y	SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2	SERTAD2	SERTAD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	18787	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr2	64995321	64996019	64995711	Y	SERTAD2	SERTAD2	SERTAD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	19182	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	65058327	65058875	65058618	Y	AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	82188	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr2	65065938	65066285	65066136	Y	AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	89799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18278236002221
chr2	65086460	65086681	65086529	Y	AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	110321	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	65086968	65087262	65087080	Y	AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	110829	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	65093958	65094266	65094153	Y	NA	NA	SERTAD2,AFTPH,LOC339807	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SERTAD2	117819	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	65214378	65214996	65214823	Y	NA	SLC1A4	NA	NA	NA	NA	SLC1A4	767	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr2	65221577	65221744	65221661	Y	NA	SLC1A4	NA	NA	NA	NA	SLC1A4	7966	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	65303160	65303240	65303200	Y	SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A	CEP68	NA	NA	NA	NA	CEP68	21660	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	65326595	65326952	65326834	Y	NA	CEP68,RAB1A	NA	NA	NA	NA	RAB1A	28288	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	65328578	65328848	65328754	Y	NA	CEP68,RAB1A	NA	NA	NA	NA	RAB1A	26392	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	65440417	65440444	65440431	Y	NA	AC007318.5,ACTR2	LOC400958,CEP68,ACTR2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007318.5	10280	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	65583296	65583698	65583484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRED2	74073	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.356646548605172
chr2	65804222	65804385	65804306	Y	RAB1A	NA	ACTR2,SPRED2	IMR90	Hi-C	24141950	SPRED2	146451	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	67486839	67487275	67486977	Y	NA	NA	MEIS1,ETAA1,LOC644838,C1D	IMR90	Hi-C	24141950	ETAA1	135176	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.00165246234263
chr2	67680448	67680810	67680629	Y	NA	NA	MEIS1	IMR90	Hi-C	24141950	ETAA1	57997	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	67751414	67751623	67751484	Y	NA	NA	MEIS1	IMR90	Hi-C	24141950	ETAA1	128963	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	67876596	67876952	67876755	Y	NA	NA	MEIS1,ETAA1,LOC644838	IMR90	Hi-C	24141950	ETAA1	254145	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	67878004	67878254	67878218	Y	NA	NA	MEIS1,ETAA1,LOC644838	IMR90	Hi-C	24141950	ETAA1	255553	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	68278313	68278683	68278526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1D	57397	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	68428934	68429266	68429100	Y	NA	WDR92,PNO1	NA	NA	NA	NA	PNO1	45958	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	68432380	68432395	68432387	Y	NA	WDR92,PNO1,PPP3R1	NA	NA	NA	NA	PPP3R1	48974	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	68472906	68473226	68473141	Y	PPP3R1	PPP3R1	NA	NA	NA	NA	PPP3R1	8143	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr2	69135600	69135857	69135778	Y	NA	GKN2	ARHGAP25,APLF,FBXO48,BMP10	IMR90	Hi-C	24141950	GKN2	42245	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.299102907177861
chr2	69241314	69241782	69241454	Y	ANTXR1	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	3004	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	69250610	69250802	69250769	Y	NA	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	12300	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	69309666	69309994	69309927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	71356	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	69390293	69390547	69390355	Y	ARHGAP25,ARHGAP25	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	151983	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr2	69424670	69425029	69424849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	186360	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr2	69481133	69481450	69481229	Y	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	NA	GFPT1	130932	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146379073469414
chr2	69533941	69534050	69534019	Y	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	NA	GFPT1	78332	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr2	69578985	69578997	69578991	Y	NA	GFPT1	NA	NA	NA	NA	GFPT1	33385	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	69997386	69997753	69997552	Y	PCBP1,MXD1	NA	NA	NA	NA	NA	GMCL1	57021	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr2	70057532	70057914	70057667	Y	C2orf42,AAK1,GMCL1	GMCL1	NA	NA	NA	NA	GMCL1	2758	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	70141198	70141461	70141241	Y	NA	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	18378	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr2	70173540	70174234	70173890	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	13163	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	70205559	70206094	70205928	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	18162	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	70216700	70217012	70216811	Y	NA	ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	29303	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	70270545	70270983	70270722	Y	MXD1,ASPRV1,C2orf42,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1	NA	NA	NA	NA	PCBP1	41602	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	70273102	70273420	70273221	Y	GMCL1,MXD1,ASPRV1,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1	NA	NA	NA	NA	PCBP1	39165	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	70294861	70295138	70295000	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	PCBP1	17447	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	70335985	70336314	70336204	Y	AAK1,C2orf42,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	8302	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.682695677718053
chr2	70350372	70350687	70350608	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	22689	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.358262776535316
chr2	70363059	70363462	70363144	Y	MXD1,C2orf42,PCBP1	PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	35376	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.34784898499209
chr2	70388970	70389092	70389031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	61287	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	70608938	70609447	70609175	Y	TGFA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM136A	81716	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr2	70847317	70847463	70847388	Y	FIGLA,ADD2,ADD2	NA	NA	NA	NA	NA	TGFA	67992	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	71129017	71129173	71129049	Y	NA	VAX2,ATP6V1B1	NA	NA	NA	NA	VAX2	3297	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	71228347	71228418	71228366	Y	ANKRD53	TEX261	TEX261	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TEX261	8272	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.186780743140731
chr2	72372444	72372716	72372574	Y	CYP26B1	CYP26B1	NA	NA	NA	NA	CYP26B1	451	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.740239319145364
chr2	72416850	72417011	72416931	Y	NA	CYP26B1	NA	NA	NA	NA	CYP26B1	43683	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	72713565	72713630	72713598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	337540	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	72789461	72789923	72789792	Y	EXOC6B	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	261247	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	73233755	73233809	73233782	Y	NA	NA	EMX1	IMR90	Hi-C	24141950	SFXN5	66938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	73338552	73338952	73338867	Y	RAB11FIP5	SFXN5,RAB11FIP5	NA	NA	NA	NA	SFXN5	37805	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	73613683	73613856	73613817	Y	DUSP11,ALMS1	ALMS1	NA	NA	NA	NA	ALMS1	2797	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr2	73967118	73967501	73967310	Y	NA	TPRKB,DUSP11	NA	NA	NA	NA	TPRKB	4591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	74060180	74060503	74060342	Y	NA	STAMBP	NA	NA	NA	NA	STAMBP	6094	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	74152201	74152400	74152268	Y	NA	ACTG2,DGUOK	NA	NA	NA	NA	DGUOK	248	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	74446656	74447054	74446868	Y	NA	MOB1A,MTHFD2	NA	NA	NA	NA	MTHFD2	22967	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	74647656	74647929	74647851	Y	SLC4A5,SLC4A5,DCTN1,C2orf81	DCTN1,C2orf81,WDR54,INO80B,WBP1,MOGS	NA	NA	NA	NA	WDR54	851	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	74765672	74765911	74765792	Y	WBP1,LBX2,LOXL3,DOK1	LBX2,PCGF1,HTRA2,AUP1	NA	NA	NA	NA	AUP1	10606	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	74801154	74801351	74801200	Y	DOK1	HTRA2,AUP1	NA	NA	NA	NA	AUP1	46088	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr2	74930564	74930823	74930694	Y	NA	AC007387.2	NA	NA	NA	NA	AC007387.2	49123	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	74968770	74968998	74968973	Y	TLX2,HK2	AC007387.2	HK2,SEMA4F	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007387.2	10948	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.698377351093314
chr2	75072652	75072899	75072736	Y	HK2	HK2	NA	NA	NA	NA	HK2	13544	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	75103488	75103536	75103515	Y	LBX2,HK2	HK2	NA	NA	NA	NA	HK2	44380	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	75141745	75142080	75142074	Y	NA	POLE4	NA	NA	NA	NA	POLE4	41539	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	75172635	75172664	75172650	Y	NA	POLE4	POLE4,TACR1,HK2	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	POLE4	10955	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	75498571	75498680	75498627	Y	NA	NA	TACR1	IMR90	Hi-C	24141950	POLE4	314952	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	75894065	75894458	75894192	Y	NA	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	MRPL19	22156	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	75903279	75903482	75903481	Y	C2orf3,C2orf3	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	MRPL19	31370	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208998432766864
chr2	75912574	75912759	75912685	Y	NA	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	GCFC2	23356	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.139807279150677
chr2	76538969	76539122	76539040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCFC2	602854	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr2	77488333	77488701	77488549	Y	LRRTM4	NA	NA	NA	NA	NA	LRRTM4	329744	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	77555136	77555510	77555330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRTM4	262935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	78328146	78328439	78328293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	314638	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	78478830	78479153	78479031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	465322	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr2	78486500	78486864	78486682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	472992	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	78632836	78632912	78632895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	619328	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	79168770	79169144	79168957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	1155262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	79897461	79897533	79897497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	490728	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	81709176	81709459	81709306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	1320915	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	84683355	84683532	84683444	Y	NA	SUCLG1	NA	NA	NA	NA	SUCLG1	1637	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	84878729	84879090	84878910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG1	193560	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	85034355	85034669	85034421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMSB10	96080	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.747853121753289
chr2	85057054	85057454	85057405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMSB10	73295	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	85066726	85066734	85066730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMSB10	64015	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	85093452	85093824	85093680	Y	NA	TMSB10	NA	NA	NA	NA	TMSB10	36925	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr2	85116002	85116322	85116077	Y	C2orf89,TMSB10	TMSB10	TMSB10	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB10	14427	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146379073469414
chr2	85147093	85147556	85147171	Y	TMSB10	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	16344	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.754041952442911
chr2	85154234	85154422	85154323	Y	NA	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	23485	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.31586191530474
chr2	85166635	85167198	85166950	Y	KCMF1,C2orf89	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	KCMF1	29018	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	85173188	85173797	85173736	Y	TMSB10	TMSB10,KCMF1	KCMF1,TMSB10	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KCMF1	22419	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.25324255600729
chr2	85185071	85185576	85185382	Y	NA	KCMF1	TMSB10,KCMF1	IMR90	Hi-C	24141950	KCMF1	10640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	85242321	85242336	85242334	Y	NA	KCMF1	NA	NA	NA	NA	KCMF1	46105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.123778420214165
chr2	85267777	85267839	85267811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM3P3	59978	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	85404303	85404456	85404381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM3P3	76486	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	85567649	85568034	85567918	Y	NA	TGOLN2,ELMOD3,RETSAT	TGOLN2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ELMOD3	11483	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr2	85632531	85633066	85632892	Y	KCMF1,TGOLN2,CAPG	CAPG	NA	NA	NA	NA	CAPG	10489	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	85664544	85665596	85664830	Y	KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6	CAPG	NA	NA	NA	NA	CAPG	20989	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.2728693993743
chr2	85673142	85673285	85673214	Y	NA	CAPG	NA	NA	NA	NA	CAPG	29587	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.893729080112042
chr2	85726317	85726428	85726373	Y	CAPG,VAMP8	MAT2A	TMEM150A,USP39,SH2D6,MAT2A,LOC100630918,TGOLN2,RETSAT,GGCX,VAMP5,VAMP8,RNF181,CAPG,C2orf68	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAT2A	37860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	85764802	85765239	85764815	Y	SH2D6,USP39	MAT2A,GGCX,VAMP8	NA	NA	NA	NA	MAT2A	514	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.383592770540193
chr2	85932755	85933081	85932924	Y	SH2D6	RNU1-38P,ATOH8	ATOH8	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-38P	20379	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	85956315	85956539	85956423	Y	SH2D6	RNU1-38P,ATOH8	ATOH8,POLR1A,USP39,C2orf68,SFTPB,LOC284950,ST3GAL5,LOC90784,PTCD3	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-38P	2855	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	85969500	85969917	85969748	Y	VAMP5,TMEM150A,ATOH8	RNU1-38P,ATOH8	ATOH8,POLR1A,USP39,C2orf68,SFTPB,LOC284950,ST3GAL5,LOC90784,PTCD3	IMR90	Hi-C	24141950	ATOH8	6550	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.351535052667168
chr2	86102907	86103036	86102912	Y	NA	ST3GAL5	NA	NA	NA	NA	ST3GAL5	11101	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	86120990	86121249	86121122	Y	NA	ST3GAL5	ST3GAL5,POLR1A	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL5	6853	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	86163596	86163679	86163638	Y	NA	ST3GAL5	POLR1A,ST3GAL5,ATOH8,LOC90784,LOC284950	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL5	49459	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr2	86224309	86224458	86224357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	106820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	86225018	86225303	86225260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	105975	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.288915693369719
chr2	86225783	86226050	86225999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	105228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	86262986	86263343	86263241	Y	GNLY,KDM3A,KDM3A,PTCD3	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	67935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	86284876	86285205	86285126	Y	NA	POLR1A,PTCD3	NA	NA	NA	NA	POLR1A	46073	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	86388217	86388607	86388413	Y	NA	SNORD94,IMMT,MRPL35	NA	NA	NA	NA	SNORD94	27224	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	86562971	86563338	86563025	Y	REEP1,REEP1	NA	NA	NA	NA	NA	REEP1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	86722974	86723324	86723287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM3A	57204	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	88353539	88354148	88353800	Y	KRCC1	RNU2-63P,KRCC1	NA	NA	NA	NA	KRCC1	291	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.196967956948873
chr2	88590567	88590888	88590740	Y	C2orf51	NA	NA	NA	NA	NA	KRCC1	237319	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr2	88913679	88914090	88914022	Y	EIF2AK3	EIF2AK3	NA	NA	NA	NA	EIF2AK3	11004	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	88959127	88959352	88959240	Y	NA	EIF2AK3,RPIA	EIF2AK3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPIA	29810	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr2	88988290	88988604	88988447	Y	NA	RPIA	NA	NA	NA	NA	RPIA	558	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	91786584	91786786	91786661	Y	NA	NA	LOC654342	IMR90	Hi-C	24141950	RPIA	2797422	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	91815672	91815808	91815787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2826510	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.178209757262733
chr2	91815826	91816191	91816014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2826664	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	91821438	91821799	91821741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2832276	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	91936197	91936406	91936290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2947035	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.186780743140731
chr2	96782666	96782871	96782861	Y	NA	DUSP2,AC012307.2	NA	NA	NA	NA	DUSP2	26308	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	96811828	96812146	96811999	Y	TMEM127,KIAA1310,ARID5A,ASTL,DUSP2	DUSP2,AC012307.2	ASTL	IMR90	Hi-C	24141950	AC012307.2	1077	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.218455497384639
chr2	96813420	96813919	96813585	Y	NA	DUSP2,AC012307.2	ASTL	IMR90	Hi-C	24141950	AC012307.2	2669	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	96830596	96830784	96830751	Y	DUSP2	DUSP2,AC012307.2,STARD7	NA	NA	NA	NA	AC012307.2	19845	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	96871048	96871111	96871053	Y	ASTL,DUSP2,KIAA1310,ARID5A,TMEM127	STARD7	NA	NA	NA	NA	STARD7	1452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	96922307	96922515	96922363	Y	DUSP2,KIAA1310,ARID5A,TMEM127	STARD7,TMEM127,CIAO1,SNRNP200	NA	NA	NA	NA	TMEM127	7217	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	96995983	96996007	96995995	Y	ITPRIPL1,ITPRIPL1	SNRNP200,AC021188.4,NCAPH	NA	NA	NA	NA	NCAPH	3518	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	97330891	97331185	97331060	Y	TMEM127,ARID5A,KIAA1310	KANSL3	NA	NA	NA	NA	KANSL3	24367	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	97522669	97523105	97522935	Y	NA	CNNM3,ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	ANKRD39	837	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	97561594	97561991	97561828	Y	FAM178B	ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	SEMA4C	27100	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	98290312	98290690	98290542	Y	TMEM131	COX5B,ACTR1B,RNU4-8P	NA	NA	NA	NA	RNU4-8P	11118	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	98367978	98368166	98368128	Y	TMEM131,ANKRD36B,ZAP70,ZAP70	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-8P	88784	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	98443211	98443622	98443475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-8P	164017	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr2	98465985	98466159	98466067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	144229	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr2	98485830	98486136	98485916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	124252	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	98822932	98823207	98823080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	212544	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.244671570129293
chr2	99064911	99065194	99064955	Y	MGAT4A,MGAT4A,INPP4A	INPP4A	NA	NA	NA	NA	INPP4A	5594	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	99318923	99319110	99319017	Y	NA	MGAT4A	NA	NA	NA	NA	MGAT4A	26479	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	99453667	99453923	99453920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAT4A	108078	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	99792031	99792038	99792035	Y	NA	C2orf15,LIPT1,TSGA10,MITD1,MRPL30	NA	NA	NA	NA	MITD1	3483	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	100082054	100082282	100082201	Y	NA	REV1	NA	NA	NA	NA	REV1	22215	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	100104968	100105518	100105262	Y	REV1	REV1	NA	NA	NA	NA	REV1	471	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	100685193	100685529	100685389	Y	AFF3	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	346589	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	100907600	100907945	100907823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	124173	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	100908504	100908788	100908727	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	123330	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.262699620625065
chr2	100937334	100937484	100937407	Y	LONRF2	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	94634	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	101435496	101435968	101435616	Y	NPAS2	NPAS2	NA	NA	NA	NA	NPAS2	882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.289645842560086
chr2	101712877	101712902	101712892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL31	96700	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr2	101872333	101872649	101872491	Y	RNF149	TBC1D8,SNORD89	NA	NA	NA	NA	TBC1D8	5005	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	101884483	101884674	101884578	Y	MAP4K4,MAP4K4,RNF149	TBC1D8,SNORD89,RNF149	NA	NA	NA	NA	SNORD89	2837	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	101922226	101922443	101922331	Y	NA	SNORD89,RNF149	NA	NA	NA	NA	RNF149	720	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	101922561	101923216	101923063	Y	NA	SNORD89	NA	NA	NA	NA	RNF149	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	101923239	101923757	101923472	Y	RPL31,MAP4K4,MAP4K4,RNF149	SNORD89,RNF149	NA	NA	NA	NA	RNF149	76	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	101972073	101972519	101972434	Y	NA	RNF149,CREG2	NA	NA	NA	NA	CREG2	29538	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.855290823932122
chr2	102353138	102353817	102353456	Y	IL1R1,RNF149,MAP4K4,MAP4K4	MAP4K4	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	41826	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	102382879	102383094	102382925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	71567	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	102844003	102844653	102844435	Y	IL1R2,IL18RAP,IL1R1	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RL1	81309	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.232485164761891
chr2	102854655	102855173	102854991	Y	IL1R1	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RL1	70789	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr2	103280963	103281189	103281017	Y	IL1RL2,SLC9A2	SLC9A2	NA	NA	NA	NA	SLC9A2	46797	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	103390349	103390733	103390541	Y	NA	MFSD9,TMEM182	NA	NA	NA	NA	TMEM182	38982	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	105505799	105505908	105505854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS9	146533	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	105973379	105973614	105973553	Y	NA	TGFBRAP1,C2orf49	NA	NA	NA	NA	C2orf49	21563	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	106020017	106020290	106020154	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	32680	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	106474357	106474542	106474414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	115003	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	106712278	106712621	106712354	Y	NCK2	NA	NA	NA	NA	NA	UXS1	96174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	107198328	107198702	107198515	Y	NA	NA	UXS1	IMR90	Hi-C	24141950	AC114755.2	294819	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	108146627	108146991	108146734	Y	NA	AC096669.3	NA	NA	NA	NA	AC096669.3	2684	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	109506497	109506716	109506551	Y	LIMS1,CCDC138,EDAR	NA	NA	NA	NA	NA	EDAR	97112	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	109514642	109514975	109514799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDAR	88853	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	109830137	109830521	109830352	Y	RANBP2	NA	NA	NA	NA	NA	EDAR	226309	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	109859358	109859584	109859496	Y	SH3RF3	NA	NA	NA	NA	NA	EDAR	255530	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.229025674821897
chr2	110016494	110016637	110016500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT10	353146	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	110318153	110318301	110318244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT10	51482	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	110319562	110319852	110319693	Y	NA	SEPT10	NA	NA	NA	NA	SEPT10	49931	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	110859077	110859497	110859213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPHP1	101146	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.244671570129293
chr2	110871797	110872011	110872000	Y	MALL	NA	NA	NA	NA	NA	NPHP1	88632	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	112375521	112375561	112375551	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANAPC1	264706	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr2	112383763	112383890	112383828	Y	NA	NA	ACOXL,BCL2L11	IMR90	Hi-C	24141950	ANAPC1	256377	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	112417011	112417329	112417184	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90	Hi-C	24141950	ANAPC1	222938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.223184029693526
chr2	112456456	112456792	112456629	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	183475	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr2	112463608	112463919	112463793	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	176348	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	112811776	112811937	112811878	Y	ZC3H6	TMEM87B	NA	NA	NA	NA	TMEM87B	976	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	113008998	113009283	113009141	Y	ZC3H6	ZC3H8,ZC3H6	NA	NA	NA	NA	ZC3H8	1430	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	113292630	113292957	113292832	Y	IL1A	POLR1B,CHCHD5	NA	NA	NA	NA	POLR1B	4535	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	113380153	113380493	113380323	Y	IL1A	CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	AC079922.2	2409	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr2	113384986	113385271	113385131	Y	NA	CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	AC079922.2	7242	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr2	113448603	113448987	113448785	Y	IL36B,IL36G,IL1RN,IL1B,IL1A	SLC20A1	POLR1B,CHCHD5,SLC20A1,CKAP2L,FLJ42351	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC20A1	47169	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	113450039	113450435	113450231	Y	IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A	SLC20A1	SLC20A1,FLJ42351	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC20A1	48605	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.154567095718296
chr2	113450750	113451037	113450852	Y	NA	SLC20A1	SLC20A1,FLJ42351	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC20A1	49316	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	113512242	113512462	113512374	Y	ZC3H6,IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A	CKAP2L,IL1A	NA	NA	NA	NA	CKAP2L	7792	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	113551784	113552157	113551927	Y	IL36B,IL36G,IL1RN,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL37,IL1A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IL1A	11617	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr2	113552525	113552798	113552647	Y	IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL37,IL1A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IL1A	12358	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr2	113569466	113569945	113569683	Y	IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL1A,IL1B	NA	NA	NA	NA	IL1B	22535	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	113581693	113582026	113582010	Y	NA	IL1A,IL1B	NA	NA	NA	NA	IL1B	10454	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	113657771	113658101	113657937	Y	NA	NA	CKAP2L,IL1A,IL37,IL1B	IMR90	Hi-C	24141950	IL1B	65291	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr2	114046330	114046643	114046448	Y	NA	NA	PAX8,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	RABL2A	336163	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	114082449	114082815	114082523	Y	NA	NA	PAX8,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	RABL2A	299991	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.190240233080725
chr2	114469366	114469830	114469722	Y	SLC35F5	MIR4782,SLC35F5	NA	NA	NA	NA	MIR4782	7115	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr2	114634434	114634643	114634539	Y	NA	ACTR3	ACTR3	IMR90	Hi-C	24141950	ACTR3	10894	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	114644100	114644364	114644199	Y	CBWD2,ACTR3	ACTR3	NA	NA	NA	NA	ACTR3	1173	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	114649026	114649412	114649076	Y	CBWD2,ACTR3	ACTR3	NA	NA	NA	NA	ACTR3	3489	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr2	114672841	114673224	114672915	Y	NA	ACTR3	NA	NA	NA	NA	ACTR3	27304	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	115177421	115177704	115177562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR3	531884	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	118739522	118739775	118739730	Y	DDX18,CCDC93	CCDC93	NA	NA	NA	NA	CCDC93	29934	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	118740185	118740994	118740898	Y	DDX18,CCDC93	CCDC93	NA	NA	NA	NA	CCDC93	28715	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	119989660	119989833	119989766	Y	NA	STEAP3	NA	NA	NA	NA	STEAP3	10276	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	120996274	120996566	120996498	Y	NA	TMEM185B,RALB	EPB41L5,RALB,TMEM185B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RALB	634	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr2	121480209	121480601	121480371	Y	NA	GLI2	GLI2	IMR90	Hi-C	24141950	GLI2	10598	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	121650745	121651146	121650942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	159546	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	122275440	122275469	122275455	Y	NA	RNU4ATAC	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC	10988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	122405703	122406017	122405860	Y	NA	CLASP1,NIFK-AS1	NA	NA	NA	NA	NIFK-AS1	477	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	122480192	122480543	122480332	Y	NA	TSN	NA	NA	NA	NA	TSN	12136	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	123419039	123419339	123419226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSN	926360	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	127863441	127863795	127863513	Y	NA	BIN1	NA	NA	NA	NA	BIN1	510	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200810410517982
chr2	127915404	127915435	127915422	Y	NA	NA	CYP27C1,BIN1,MAP3K2	IMR90	Hi-C	24141950	BIN1	52473	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	127975624	127975823	127975720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCC3	73929	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr2	128143711	128144108	128144023	Y	SFT2D3,MAP3K2	NA	CYP27C1,IWS1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K2	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	128169566	128169991	128169902	Y	NA	MAP3K2	NA	NA	NA	NA	MAP3K2	25525	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	128258405	128258697	128258648	Y	NA	RNU4-48P,IWS1	NA	NA	NA	NA	IWS1	23765	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	128283052	128283292	128283172	Y	MAP3K2,SFT2D3,AMMECR1L	IWS1	NA	NA	NA	NA	IWS1	590	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr2	128453755	128454028	128453898	Y	MAP3K2,IWS1,AMMECR1L,SFT2D3	SFT2D3	LIMS2	IMR90	Hi-C	24141950	SFT2D3	2569	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	128469057	128469300	128469179	Y	NA	SFT2D3	NA	NA	NA	NA	SFT2D3	12460	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	128470034	128470252	128470136	Y	NA	SFT2D3	NA	NA	NA	NA	SFT2D3	13437	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	128562322	128562673	128562571	Y	NA	WDR33	LIMS2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR33	4088	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr2	128598749	128599093	128599053	Y	IWS1,SFT2D3,AMMECR1L	WDR33,POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	14638	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr2	128761594	128761964	128761779	Y	NA	SAP130	NA	NA	NA	NA	SAP130	21730	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	128800612	128800796	128800698	Y	NA	SAP130,UGGT1	UGGT1,SAP130	IMR90	Hi-C	24141950	SAP130	16918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	128919923	128920212	128920008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGGT1	73149	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	129073927	129074235	129074112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS6ST1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	129074706	129075071	129074888	Y	NA	HS6ST1	NA	NA	NA	NA	HS6ST1	555	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	129381655	129381863	129381711	Y	NA	NA	UGGT1,HS6ST1	IMR90	Hi-C	24141950	HS6ST1	307504	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr2	129901785	129902172	129901852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079776.4	793618	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	130087212	130087247	130087228	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079776.4	608543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr2	130201021	130201117	130201085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079776.4	494673	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr2	131148815	131149203	131148908	Y	FAM123C,FAM123C,FAM123C,CCDC115,PTPN18	PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	37235	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	131149333	131149678	131149410	Y	FAM123C,FAM123C,FAM123C	PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	37753	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	131555592	131555820	131555689	Y	CCDC115	NA	PLEKHB2,FAM168B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FAM168B	293213	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.174594337773329
chr2	131582042	131582382	131582235	Y	NA	NA	ARHGEF4	IMR90	Hi-C	24141950	FAM168B	266651	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104864290978615
chr2	131586593	131586950	131586772	Y	NA	NA	ARHGEF4	IMR90	Hi-C	24141950	FAM168B	262083	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	131745045	131745246	131745147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM168B	103787	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	131828545	131828813	131828794	Y	NA	FAM168B,PLEKHB2	NA	NA	NA	NA	FAM168B	20220	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	131863489	131864378	131863990	Y	PLEKHB2	FAM168B,PLEKHB2	NA	NA	NA	NA	PLEKHB2	3069	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr2	132130244	132130505	132130374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MZT2A	117811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	133640372	133640755	133640626	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD1	213220	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	133914495	133914622	133914567	Y	NCKAP5	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD1	487343	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	134084028	134084575	134084301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD1	656876	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.864903818099307
chr2	134193030	134193115	134193062	Y	NCKAP5	NA	NA	NA	NA	NA	MGAT5	682439	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.759883597571281
chr2	134878523	134878632	134878609	Y	MGAT5	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	2969	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr2	134878887	134879265	134878997	Y	NA	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	3333	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	136268329	136268541	136268430	Y	NA	ZRANB3,R3HDM1	NA	NA	NA	NA	ZRANB3	18265	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.135808896032157
chr2	136504457	136504522	136504461	Y	NA	UBXN4	NA	NA	NA	NA	UBXN4	7268	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	136632932	136633416	136633308	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	MCM6	NA	NA	NA	NA	MCM6	936	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr2	136971782	136972392	136972031	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	NA	NA	NA	NA	NA	CXCR4	98047	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr2	136996318	136996892	136996519	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	NA	NA	NA	NA	NA	CXCR4	122583	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.366450798784198
chr2	137003597	137004126	137003957	Y	CXCR4,CXCR4	NA	NA	NA	NA	NA	CXCR4	129862	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr2	138829868	138830168	138829962	Y	NA	NA	HNMT	MCF7	ChIA-PET	22265404	HNMT	110278	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	139260181	139260311	139260246	Y	SPOPL	AC097721.2,SPOPL	NA	NA	NA	NA	SPOPL	2810	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr2	139342135	139342417	139342276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOPL	84764	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	141602642	141602767	141602705	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	1284503	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	141613060	141613069	141613065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	1274201	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	141844279	141844394	141844337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	1042876	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	142150307	142150490	142150399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	736780	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	142222584	142223129	142223081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	664141	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	142343061	142343470	142343446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	543800	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	142404808	142405288	142404942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	481982	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	142449001	142449164	142449004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	438106	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	142647536	142647619	142647564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	239651	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	142789500	142789791	142789646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	97479	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr2	142874625	142874987	142874896	Y	LRP1B	LRP1B	NA	NA	NA	NA	LRP1B	12283	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr2	142886868	142887183	142887052	Y	LRP1B	LRP1B	NA	NA	NA	NA	LRP1B	87	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	143077888	143078204	143078046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	190618	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	143614638	143615023	143614910	Y	KYNU	KYNU	KYNU	MCF7	ChIA-PET	22265404	KYNU	18044	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.395779175907595
chr2	143615203	143615596	143615531	Y	KYNU	KYNU	KYNU	MCF7	ChIA-PET	22265404	KYNU	17471	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.330047512231402
chr2	143615896	143616223	143616082	Y	KYNU	KYNU	KYNU	MCF7	ChIA-PET	22265404	KYNU	16844	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.99346444009375
chr2	143621045	143621348	143621064	Y	KYNU	KYNU	KYNU	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KYNU	11719	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	143621410	143621600	143621515	Y	KYNU	KYNU	KYNU	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KYNU	11467	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	143624367	143624985	143624879	Y	KYNU	KYNU	KYNU	MCF7	ChIA-PET	22265404	KYNU	8082	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146379073469414
chr2	143625721	143626570	143625926	Y	KYNU	KYNU	KYNU	MCF7	ChIA-PET	22265404	KYNU	6497	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.969229215899397
chr2	143628214	143628759	143628425	Y	NA	KYNU	NA	NA	NA	NA	KYNU	4308	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	143630782	143631707	143631171	Y	KYNU	KYNU	NA	NA	NA	NA	KYNU	1360	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.70927727903292
chr2	143688672	143689047	143688712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	55605	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr2	143695947	143696225	143696015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	62880	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	143697269	143697638	143697450	Y	KYNU	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	64202	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.244671570129293
chr2	143699726	143700104	143699915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	66659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.218455497384639
chr2	143720663	143721004	143720729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	87596	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr2	143756654	143756995	143756685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	123587	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr2	143841282	143841488	143841338	Y	KYNU,ARHGAP15	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	208215	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	144155569	144155721	144155633	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	522502	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	146509165	146509664	146509334	Y	NA	NA	DKFZp686O1327,ZEB2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL6P5	416367	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	146510109	146510425	146510227	Y	NA	NA	DKFZp686O1327,ZEB2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL6P5	417311	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	148296630	148296767	148296652	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009480.4	269148	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	148671388	148671433	148671412	Y	ORC4,ORC4,ORC4,ORC4,ORC4	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR2A	71302	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	149267026	149267240	149267133	Y	EPC2	NA	NA	NA	NA	NA	EPC2	132769	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	150222263	150222576	150222421	Y	NA	LYPD6	NA	NA	NA	NA	LYPD6	37764	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.548885973245157
chr2	150278954	150279172	150279087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD6	94455	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr2	151537937	151538357	151538169	Y	NA	NA	RBM43,RND3,MMADHC	IMR90	Hi-C	24141950	RND3	144412	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	151768299	151768310	151768305	Y	NA	NA	RND3	IMR90	Hi-C	24141950	RBM43	348083	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	152144821	152144962	152144854	Y	RIF1,RIF1,RIF1,NMI	RBM43,NMI	NA	NA	NA	NA	NMI	250	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	153057173	153057360	153057266	Y	FMNL2	STAM2	FMNL2	IMR90	Hi-C	24141950	STAM2	26667	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	153261807	153262193	153261950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	72056	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	153275296	153275683	153275311	Y	FMNL2	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	85545	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	153309848	153310421	153310088	Y	CACNB4,CACNB4,FMNL2,ARL6IP6	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	120097	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	153362104	153362315	153362141	Y	FMNL2	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	172353	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	154333342	154333495	154333419	Y	RPRM	RPRM	NA	NA	NA	NA	RPRM	20	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.395779175907595
chr2	154335936	154336181	154336134	Y	RPRM	RPRM	NA	NA	NA	NA	RPRM	2614	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.25839119430784
chr2	154442869	154442990	154442930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPRM	109547	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr2	154446220	154446391	154446306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPRM	112898	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr2	154448468	154448804	154448636	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPRM	115146	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	157038752	157038990	157038871	Y	NR4A2	NA	NR4A2	MCF7	ChIA-PET	22265404	NR4A2	157870	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	157190328	157191531	157191235	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	5329	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.36900677492551
chr2	157191997	157192231	157192220	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	4629	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr2	157262022	157262267	157262175	Y	GPD2,NR4A2	GPD2	NR4A2,GALNT5,GPD2	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GPD2	27535	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	157287649	157287933	157287736	Y	NR4A2,GPD2	GPD2	GPD2	K562	ChIA-PET	22265404	GPD2	1869	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr2	158030373	158030519	158030484	Y	NA	NA	NR4A2,GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	ERMN	151706	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr2	158039321	158039798	158039630	Y	NA	NA	NR4A2,GALNT5,GPD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERMN	142427	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	158067838	158068005	158067865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERMN	114220	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	159354074	159354382	159354127	Y	NA	PKP4	NA	NA	NA	NA	PKP4	42598	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	159996824	159997456	159997123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	143854	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	160095412	160095531	160095474	Y	NA	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	45779	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	160100045	160100277	160100255	Y	NA	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	41033	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr2	160106082	160106269	160106215	Y	MARCH7	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	35041	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr2	160371940	160372153	160372033	Y	MARCH7,LY75,CD302,BAZ2B	NA	NA	NA	NA	NA	AC009506.2	54173	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	160470388	160470776	160470715	Y	NA	AC009506.1,BAZ2B	NA	NA	NA	NA	BAZ2B	427	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	161064664	161064880	161064794	Y	NA	NA	ITGB6,RBMS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PLA2R1	147543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18278236002221
chr2	161071101	161071394	161071301	Y	ITGB6	NA	ITGB6,RBMS1	IMR90	Hi-C	24141950	PLA2R1	153980	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr2	161078300	161078513	161078433	Y	ITGB6	NA	RBMS1,ITGB6,TANK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLA2R1	161179	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.231755015571524
chr2	161080666	161080905	161080769	Y	NA	NA	ITGB6,RBMS1,TANK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLA2R1	163545	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr2	161083916	161084239	161083958	Y	CD302,ITGB6	NA	ITGB6,TANK,RBMS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLA2R1	166795	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.322589639172887
chr2	161098241	161098623	161098428	Y	ITGB6	NA	TANK,ITGB6,RBMS1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4785	163770	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.178053827713323
chr2	161155946	161156394	161156280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4785	105999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	161232354	161232597	161232498	Y	NA	MIR4785	NA	NA	NA	NA	MIR4785	29796	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.382862621349826
chr2	161348201	161348679	161348535	Y	RBMS1	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	161522878	161523352	161523066	Y	TANK,TANK	NA	ITGB6,RBMS1	IMR90	Hi-C	24141950	RBMS1	174573	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	161979819	161979978	161979936	Y	TANK,TANK	TANK	PLA2R1,RBMS1,LY75-CD302,TANK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TANK	11441	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	162095171	162095411	162095272	Y	TBR1,SLC4A10	AC009299.3	NA	NA	NA	NA	AC009299.3	3839	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	162197345	162197490	162197464	Y	NA	PSMD14	NA	NA	NA	NA	PSMD14	34796	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr2	162565636	162565807	162565722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPP4	363245	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	163477809	163478160	163477991	Y	KCNH7	NA	NA	NA	NA	NA	GCA	304459	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	164204698	164204962	164204800	Y	NA	NA	FIGN	IMR90	Hi-C	24141950	FIGN	385560	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr2	164205577	164205788	164205730	Y	NA	NA	FIGN	IMR90	Hi-C	24141950	FIGN	384734	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	164534395	164534690	164534543	Y	FIGN	NA	NA	NA	NA	NA	FIGN	55832	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	165430240	165430431	165430256	Y	NA	GRB14	NA	NA	NA	NA	GRB14	45927	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr2	165683192	165683287	165683237	Y	NA	COBLL1	NA	NA	NA	NA	COBLL1	14902	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	165766653	165766876	165766835	Y	SLC38A11,COBLL1	NA	NA	NA	NA	NA	COBLL1	68464	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	166649551	166649790	166649651	Y	GALNT3	NA	NA	NA	NA	NA	TTC21B	158563	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	166734901	166734996	166734949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC21B	73357	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	166982475	166982914	166982672	Y	SCN1A,SCN1A	NA	NA	NA	NA	NA	SCN1A	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	168994093	168994243	168994234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK39	108408	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	170441657	170442069	170441908	Y	NA	FASTKD1,PPIG	NA	NA	NA	NA	PPIG	2807	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	170684911	170685465	170685124	Y	PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3	SSB,METTL5,UBR3	NA	NA	NA	NA	UBR3	2943	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr2	171786835	171787228	171786978	Y	TLK1	GORASP2	NA	NA	NA	NA	GORASP2	3861	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr2	171830049	171830396	171830113	Y	NA	GORASP2	NA	NA	NA	NA	GORASP2	47075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr2	172287168	172287529	172287349	Y	TLK1	DCAF17,METTL8	NA	NA	NA	NA	DCAF17	1198	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	172693152	172693396	172693274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAT1	83562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	172747551	172747817	172747684	Y	NA	HAT1	NA	NA	NA	NA	HAT1	29141	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	172959536	172959659	172959591	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	5969	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.257971088316178
chr2	172960097	172960530	172960322	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	5098	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.231755015571524
chr2	173544545	173544661	173544603	Y	NA	NA	PDK1,RAPGEF4	IMR90	Hi-C	24141950	AC093818.1	125221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	173796243	173796588	173796342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLK7-AS1	348176	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	173942556	173942831	173942720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLK7-AS1	201933	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	174007383	174007707	174007544	Y	ZAK	NA	NA	NA	NA	NA	MLK7-AS1	137057	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	174016358	174016802	174016556	Y	ZAK	NA	NA	NA	NA	NA	MLK7-AS1	127962	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	174800246	174800560	174800554	Y	NA	SP3	NA	NA	NA	NA	SP3	27870	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	175036157	175036485	175036321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OLA1	74941	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	175069870	175070170	175070019	Y	WIPF1,SP3,SP3	OLA1	NA	NA	NA	NA	OLA1	41256	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	175085975	175086128	175086062	Y	NA	OLA1	NA	NA	NA	NA	OLA1	25298	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	175248509	175248787	175248661	Y	SP3,SP3	CIR1,SCRN3	NA	NA	NA	NA	CIR1	9656	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	175708423	175708587	175708507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3AP4	125918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	175762241	175762347	175762322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3AP4	179736	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	176866139	176866392	176866261	Y	KIAA1715	KIAA1715	NA	NA	NA	NA	KIAA1715	572	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	177426339	177426739	177426504	Y	NA	NA	HOXD-AS2,HOXD8,MIR10B,HOXD9,HOXD4,HOXD3,HOXD-AS1,HOXD1,LOC375295	IMR90	Hi-C	24141950	MTX2	294216	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	178030162	178030520	178030353	Y	NFE2L2	HNRNPA3,AC079305.8	HOXD-AS2,LOC100130691,AGPS,PDE11A,NFE2L2,HNRNPA3,TTC30A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HNRNPA3	44771	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	178030872	178031290	178031011	Y	NFE2L2,NFE2L2	HNRNPA3,AC079305.8	HOXD-AS2,LOC100130691,AGPS,PDE11A,NFE2L2,HNRNPA3,TTC30A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HNRNPA3	44001	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	178100990	178101571	178101482	Y	NA	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128,AC079305.10	NA	NA	NA	NA	MIR3128	17167	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	178104644	178105169	178104872	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128,AC079305.10	NA	NA	NA	NA	MIR3128	13569	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.531588071939752
chr2	178116726	178117036	178116927	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128,AC079305.10	NA	NA	NA	NA	MIR3128	1702	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	178131060	178131559	178131324	Y	NA	MIR3128,AC079305.10	NA	NA	NA	NA	AC079305.10	3973	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr2	178146003	178146401	178146169	Y	HNRNPA3,NFE2L2,NFE2L2	MIR3128,AC079305.10	NA	NA	NA	NA	AC079305.10	18916	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	178176683	178176989	178176836	Y	NA	AC079305.10	NA	NA	NA	NA	AC079305.10	49596	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr2	178261376	178261686	178261570	Y	NA	AGPS,AC074286.1,NFE2L2	NA	NA	NA	NA	NFE2L2	5951	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	179471296	179471384	179471314	Y	TTN	NA	NA	NA	NA	NA	TTN-AS1	87386	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	179487942	179488336	179488251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTN-AS1	104032	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	180116495	180116858	180116779	Y	SESTD1	SESTD1	NA	NA	NA	NA	SESTD1	10659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	180625658	180625928	180625899	Y	ZNF385B	NA	NA	NA	NA	NA	CWC22	243912	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	182675600	182675877	182675735	Y	SSFA2	NA	SSFA2	IMR90	Hi-C	24141950	SSFA2	78683	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr2	182741385	182741846	182741532	Y	SSFA2	SSFA2	PPP1R1C	IMR90	Hi-C	24141950	SSFA2	12714	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.750199498873801
chr2	182942372	182942392	182942382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R1C	125404	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	183839050	183839414	183839395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	62172	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	183877830	183878146	183878099	Y	NA	NCKAP1	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	23440	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	183950583	183950613	183950599	Y	NA	NCKAP1,DUSP19,NUP35	NA	NA	NA	NA	DUSP19	9296	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	184691043	184691161	184691102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACYBPP2	220196	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	186832070	186832214	186832142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	516669	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	187263813	187264095	187263899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	84788	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	187420042	187420288	187420183	Y	ITGAV,ITGAV,ZC3H15	ITGAV	ZC3H15,ITGAV	IMR90	Hi-C	24141950	ITGAV	32504	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	187455745	187456210	187455889	Y	NA	ITGAV	NA	NA	NA	NA	ITGAV	2953	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr2	188280188	188280462	188280371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFPI	148025	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	188389811	188390126	188390006	Y	NA	TFPI	NA	NA	NA	NA	TFPI	38361	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	188404228	188404596	188404560	Y	TFPI	TFPI	NA	NA	NA	NA	TFPI	23891	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	188414787	188415077	188415012	Y	NA	TFPI	NA	NA	NA	NA	TFPI	13410	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	189973214	189973535	189973374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL5A2	69070	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	190014709	190015152	190014914	Y	NA	COL5A2	NA	NA	NA	NA	COL5A2	27453	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	190067676	190068381	190068047	Y	NA	COL5A2	GULP1,COL5A2	IMR90	Hi-C	24141950	COL5A2	25071	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	190235497	190235832	190235693	Y	NA	NA	COL5A2,GULP1	IMR90	Hi-C	24141950	WDR75	68327	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	190477917	190478080	190477982	Y	NA	ASNSD1	SLC40A1,WDR75,ASNSD1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ASNSD1	46031	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr2	190739432	190739578	190739518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMS1	92325	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	191075616	191075973	191075872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP1	130223	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.175324486963695
chr2	191443312	191443866	191443668	Y	NA	TMEM194B	TMEM194B	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM194B	45864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.149994492958819
chr2	191512036	191512188	191512066	Y	INPP1,STAT1,GLS,NAB1	NAB1	NA	NA	NA	NA	NAB1	2564	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	191706618	191706816	191706674	Y	GLS	GLS,AC005540.3	GLS,STAT1,NAB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLS	36737	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	191706974	191707041	191707034	Y	GLS	GLS,AC005540.3	GLS,STAT1,NAB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLS	36512	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	191708638	191708846	191708778	Y	STAT4,NAB1,STAT1,GLS	GLS,AC005540.3	GLS,STAT1,NAB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLS	34707	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	191709136	191709198	191709167	Y	STAT4,NAB1,STAT1,GLS	GLS,AC005540.3	GLS,STAT1,NAB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLS	34355	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr2	191815156	191815612	191815322	Y	GLS	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	40681	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	191861492	191861699	191861596	Y	STAT1	AC067945.3,STAT1	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	5199	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	191861736	191862119	191861929	Y	NA	AC067945.3,STAT1	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	5443	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	191984586	191984681	191984634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAT1	100900	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	192436242	192436430	192436383	Y	OBFC2A	NA	TMEFF2,OBFC2A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC098617.1	272835	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	192500525	192500897	192500643	Y	NA	NA	OBFC2A	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AC098617.1	208368	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	192503383	192503649	192503532	Y	OBFC2A	NA	OBFC2A	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AC098617.1	205616	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	194142383	194142416	194142400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEFF2	1083948	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr2	196400983	196401214	196401085	Y	NA	SLC39A10	SLC39A10	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SLC39A10	37487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	196425415	196425579	196425497	Y	NA	SLC39A10	SLC39A10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC39A10	13122	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	196425923	196426330	196426251	Y	NA	SLC39A10	SLC39A10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC39A10	12371	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.197698106139239
chr2	196426584	196426975	196426747	Y	NA	SLC39A10	SLC39A10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC39A10	11726	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr2	196427017	196427173	196427106	Y	NA	SLC39A10	SLC39A10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC39A10	11528	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	196427777	196428076	196427925	Y	NA	SLC39A10	SLC39A10	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC39A10	10625	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.68123537933732
chr2	196428777	196429172	196429092	Y	SLC39A10	SLC39A10	SLC39A10	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC39A10	9529	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.34463396419071
chr2	196478695	196478993	196478847	Y	NA	SLC39A10	SLC39A10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC39A10	39994	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.212996815885384
chr2	196523919	196524096	196523991	Y	SLC39A10	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	85218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.216456305825379
chr2	196617949	196618273	196617953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	179248	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	197097649	197097961	197097892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK17B	58422	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	197264939	197265165	197265058	Y	STK17B	NA	NA	NA	NA	NA	HECW2	191251	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	197466180	197466534	197466307	Y	NA	HECW2,CCDC150	CCDC150,HECW2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HECW2	9764	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.223184029693526
chr2	197623019	197623245	197623231	Y	NA	GTF3C3	NA	NA	NA	NA	GTF3C3	39204	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	197787148	197787421	197787192	Y	NA	PGAP1	NA	NA	NA	NA	PGAP1	3099	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	197934286	197934620	197934500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP1	143766	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.24940010243818
chr2	197974548	197974560	197974555	Y	ANKRD44	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P3	151275	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	198029302	198029554	198029323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P3	96281	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	198158784	198159350	198159060	Y	SF3B1,MOBKL3,MOBKL3,MOBKL3,COQ10B,ANKRD44	ATP5G2P3,ANKRD44	NA	NA	NA	NA	ANKRD44	14547	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	198328385	198328433	198328409	Y	PLCL1	SF3B1,COQ10B,HSPE1,MOB4	NA	NA	NA	NA	COQ10B	12238	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	198350765	198350931	198350852	Y	NA	COQ10B,HSPE1,MOB4,HSPD1	NA	NA	NA	NA	HSPE1	11787	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr2	198537682	198538053	198537906	Y	NA	RFTN2,MARS2	NA	NA	NA	NA	RFTN2	716	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	200270966	200271332	200271300	Y	NA	SATB2-AS1	NA	NA	NA	NA	SATB2-AS1	49091	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	200328214	200328741	200328463	Y	SATB2,SATB2,SATB2	SATB2-AS1,SATB2	NA	NA	NA	NA	SATB2	5248	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	200800298	200800427	200800328	Y	SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69	AC073043.1,C2orf69,C2orf47,TYW5	NA	NA	NA	NA	C2orf47	17613	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	201172384	201172536	201172446	Y	NA	SPATS2L	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	3780	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	201397001	201397079	201397012	Y	NA	SGOL2,KCTD18	NA	NA	NA	NA	KCTD18	14494	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	201411222	201411458	201411252	Y	PPIL3,NIF3L1,NIF3L1,SGOL2	SGOL2,KCTD18	NA	NA	NA	NA	KCTD18	28715	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	201652202	201652395	201652320	Y	NA	BZW1	BZW1	IMR90	Hi-C	24141950	BZW1	20922	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.727825879698257
chr2	201794314	201794594	201794537	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CASP10,CLK1,CLK1	PPIL3,NIF3L1,AC005037.3,ORC2	NA	NA	NA	NA	AC005037.3	31392	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	201829288	201829721	201829590	Y	KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2	AC005037.3,ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	2885	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	201830040	201830326	201830203	Y	KCTD18,FAM126B,CASP8,CLK1,CLK1	AC005037.3,ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	3637	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	201978583	201978718	201978642	Y	CLK1,CLK1,TRAK2,STRADB,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,FAM126B,CFLAR	NDUFB3,FAM126B,AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	109	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	201992378	201992654	201992500	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	13551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	202078581	202078959	202078777	Y	CASP10	CASP10,CASP8	NA	NA	NA	NA	CASP8	17207	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	202079360	202079680	202079556	Y	CLK1,CLK1,CFLAR,CASP10	CASP10,CASP8	NA	NA	NA	NA	CASP8	16486	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr2	202102159	202102434	202102342	Y	NA	CASP8	NA	NA	NA	NA	CASP8	5993	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr2	202104378	202104489	202104432	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	CASP8	NA	NA	NA	NA	CASP8	8212	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	202752724	202752776	202752749	Y	ALS2	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2V1P11	65453	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	202897639	202898135	202897874	Y	FZD7	FZD7	NA	NA	NA	NA	FZD7	329	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	FZD7	NA	NA	NA	NA	FZD7	872	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20353975126761
chr2	203090268	203090335	203090273	Y	NA	PSMA2P3,DAZAP2P1,SUMO1,NOP58	NA	NA	NA	NA	SUMO1	10996	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	203131534	203131826	203131673	Y	FAM117B,NOP58	SUMO1,NOP58	NA	NA	NA	NA	NOP58	3095	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	203159775	203160145	203159798	Y	NA	NOP58	NA	NA	NA	NA	NOP58	31336	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	203239784	203239912	203239798	Y	NA	BMPR2	NA	NA	NA	NA	BMPR2	125	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	203292079	203292309	203292231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMPR2	52420	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	203830574	203830808	203830669	Y	NA	WDR12,NBEAL1	NA	NA	NA	NA	WDR12	46713	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	204311629	204311925	204311741	Y	NBEAL1,CYP20A1,ABI2	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	86208	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	204315265	204315638	204315451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	82495	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	205530118	205530314	205530216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARD3B	121602	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	206005178	206005232	206005204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	539482	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	206948392	206948813	206948647	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	INO80D	214	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	208195614	208195873	208195761	Y	NA	NA	KLF7,CREB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB1	196588	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	208198821	208199856	208199157	Y	KLF7	NA	KLF7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB1	192605	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	208200012	208200111	208200057	Y	NA	NA	KLF7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB1	192350	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	208259563	208259980	208259919	Y	NA	NA	KLF7	IMR90	Hi-C	24141950	CREB1	132481	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	208395422	208395980	208395659	Y	PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1	CREB1,AC007879.5	NA	NA	NA	NA	AC007879.5	2903	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.175324486963695
chr2	208602415	208602802	208602609	Y	NA	CCNYL1,FZD5	NA	NA	NA	NA	CCNYL1	28151	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	208656928	208657357	208657034	Y	FZD5	FZD5	PLEKHM3,CCNYL1,FZD5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FZD5	24641	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr2	208977857	208977982	208977919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHM3	89573	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr2	210233724	210233884	210233805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2	52898	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	210872654	210873081	210872784	Y	C2orf67	RPE	NA	NA	NA	NA	RPE	7365	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	211413660	211414008	211413843	Y	ACADL,CPS1,CPS1	NA	NA	NA	NA	NA	CPS1	73254	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.44988121879844
chr2	211423571	211423754	211423675	Y	ACADL,CPS1,CPS1	NA	NA	NA	NA	NA	CPS1	83165	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.28215309938376
chr2	211423993	211424366	211424119	Y	CPS1,CPS1,CPS1	NA	NA	NA	NA	NA	CPS1	83587	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.18878039104461
chr2	211426065	211426416	211426368	Y	ACADL,CPS1,CPS1	NA	NA	NA	NA	NA	CPS1	85659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.817044275369476
chr2	211445580	211445639	211445609	Y	CPS1,CPS1	NA	NA	NA	NA	NA	CPS1	105174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr2	211470804	211470937	211470808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPS1	130398	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr2	213339164	213339568	213339278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERBB4	61997	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	213340230	213340572	213340527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERBB4	60993	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	213707567	213707874	213707766	Y	NA	NA	IKZF2	IMR90	Hi-C	24141950	ERBB4	306002	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr2	214566774	214567035	214566903	Y	LOC100130451	NA	NA	NA	NA	NA	SPAG16	419661	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	216222811	216223009	216222866	Y	NA	ATIC	NA	NA	NA	NA	ATIC	48271	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	216224117	216224404	216224261	Y	NA	ATIC	NA	NA	NA	NA	ATIC	49577	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	216483720	216484034	216483877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FN1	184825	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	216489283	216489494	216489351	Y	FN1	NA	NA	NA	NA	NA	FN1	190388	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	216698635	216698894	216698754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREG	197925	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	216870818	216871425	216871006	Y	NA	MREG	NA	NA	NA	NA	MREG	25394	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	217035180	217035407	217035275	Y	NA	NA	PKI55	IMR90	Hi-C	24141950	XRCC5	64993	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	217357637	217357999	217357758	Y	NA	RPL37A,AC098820.3	RPL37A	IMR90	Hi-C	24141950	RPL37A	2913	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	217970488	217971016	217970653	Y	NA	NA	IGFBP5,DIRC3,IGFBP2,TNP1	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB3P2	496806	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr2	218549825	218550302	218550107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB1P9	512855	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	218857857	218858115	218857951	Y	NA	NA	TNS1,RUFY4	IMR90	Hi-C	24141950	HMGB1P9	205042	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.470967904201562
chr2	219194739	219194938	219194840	Y	ARPC2,ARPC2,USP37,TTLL4,RQCD1,PNKD,SLC11A1	TMBIM1,AC021016.7	NA	NA	NA	NA	AC021016.7	21860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	219270976	219271406	219271230	Y	CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1	CTDSP1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	9997	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.351535052667168
chr2	219434664	219435146	219434778	Y	USP37	USP37,RQCD1,PLCD4	NA	NA	NA	NA	RQCD1	3361	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227912562002414
chr2	219596297	219596622	219596516	Y	TMBIM1,PNKD,SLC11A1,USP37,TTLL4,CYP27A1	TTLL4	NA	NA	NA	NA	TTLL4	22729	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	219759139	219759434	219759370	Y	WNT6,WNT10A	WNT6	NA	NA	NA	NA	WNT6	36595	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.301832247927488
chr2	219760047	219760178	219760137	Y	WNT10A	WNT6	NA	NA	NA	NA	WNT6	37503	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	219761045	219761550	219761369	Y	USP37,ZNF142,ZFAND2B,TUBA4A,CNPPD1,ANKZF1,ANKZF1,WNT10A	WNT6	NA	NA	NA	NA	WNT6	38501	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr2	219972742	219972853	219972823	Y	NA	NA	LOC100129175,CRYBA2,CCDC108,LOC151300,FEV,MIR375,IHH	IMR90	Hi-C	24141950	NHEJ1	50734	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	220138813	220139187	220138862	Y	INHA,CCDC108,ATG9A,GLB1L	ATG9A,ANKZF1,STK16,TUBA4A,DNAJB2,PTPRN	NA	NA	NA	NA	TUBA4A	1705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	220374836	220375176	220374958	Y	NA	GMPPA,TMEM198,CHPF	NA	NA	NA	NA	GMPPA	13247	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	220385870	220386219	220385945	Y	ACCN4	GMPPA,TMEM198,CHPF,INHA,OBSL1	NA	NA	NA	NA	TMEM198	20166	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	220443639	220443837	220443738	Y	NA	TMEM198,CHPF,INHA,OBSL1,STK11IP	NA	NA	NA	NA	OBSL1	9058	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	220460061	220460205	220460133	Y	NA	INHA,OBSL1,STK11IP	NA	NA	NA	NA	STK11IP	377	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	221093432	221093609	221093525	Y	NA	NA	EPHA4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AC009502.1	545915	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	222356179	222356366	222356273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	1162690	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	FARSB	691645	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.754041952442911
chr2	223429708	223429962	223429836	Y	FARSB	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	89094	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	223462160	223462364	223462326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	56692	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	223784632	223784923	223784806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL3	60980	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	224330555	224330880	224330675	Y	WDFY1	NA	SCG2	IMR90	Hi-C	24141950	AP1S3	369864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	224413942	224414282	224414142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP1S3	286462	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr2	224428219	224428432	224428353	Y	NA	NA	SCG2	IMR90	Hi-C	24141950	AP1S3	272312	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	224477772	224478078	224477872	Y	NA	NA	AP1S3,KCNE4,SCG2	IMR90	Hi-C	24141950	AP1S3	222666	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	224564336	224564481	224564409	Y	NA	NA	SCG2	IMR90	Hi-C	24141950	AP1S3	136263	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr2	224569350	224569680	224569515	Y	NA	NA	AP1S3	IMR90	Hi-C	24141950	AP1S3	131064	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr2	224666540	224666974	224666854	Y	AP1S3	AP1S3	NA	NA	NA	NA	AP1S3	33770	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr2	224751909	224752110	224752042	Y	WDFY1	NA	NA	NA	NA	NA	AP1S3	51165	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	225522077	225522236	225522157	Y	NA	NA	FAM124B	IMR90	Hi-C	24141950	CUL3	73967	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	225880660	225880871	225880768	Y	DOCK10	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	432550	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	227656309	227656561	227656437	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	5914	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr2	227822351	227822632	227822559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHBDD1	124054	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	228018054	228018265	228018160	Y	COL4A4	COL4A4,COL4A3	NA	NA	NA	NA	COL4A4	8564	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr2	228253438	228253721	228253534	Y	CCL20,AGFG1	NA	TM4SF20,AGFG1	IMR90	Hi-C	24141950	MFF	65571	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr2	228270733	228271155	228270942	Y	NA	NA	C2orf83,AGFG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AGFG1	63713	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr2	228276107	228276256	228276208	Y	AGFG1	NA	C2orf83,AGFG1	IMR90	Hi-C	24141950	AGFG1	58612	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	228280402	228280578	228280475	Y	CCL20,AGFG1	NA	C2orf83,AGFG1	IMR90	Hi-C	24141950	AGFG1	54290	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr2	228331050	228331499	228331159	Y	NA	AGFG1	AGFG1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AGFG1	3369	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	228437239	228437625	228437329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGFG1	102371	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	228728073	228728272	228728126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCL20	51515	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr2	229407284	229407450	229407381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCL20	730726	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr2	230015685	230015803	230015793	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	DNER	561471	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	230214973	230215418	230215277	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	DNER	361856	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	230274489	230274615	230274507	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	DNER	302659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	230319642	230320072	230319824	Y	TRIP12,PID1	NA	NA	NA	NA	NA	DNER	257202	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	230435730	230436079	230435905	Y	SLC16A14	NA	NA	NA	NA	NA	DNER	141195	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	230736228	230736612	230736477	Y	SP110	FBXO36,TRIP12	NA	NA	NA	NA	FBXO36	48406	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	231227266	231227536	231227388	Y	NA	SP140L	NA	NA	NA	NA	SP140L	37367	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	231276384	231276790	231276706	Y	NA	SP100	NA	NA	NA	NA	SP100	1867	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.206269092017237
chr2	231299753	231300176	231299905	Y	SP110,SP110,SP140,SP140L,CAB39,SP100,SP100	SP100	NA	NA	NA	NA	SP100	21096	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr2	231523565	231523670	231523633	Y	GPR55,SP110,SP140	NA	CAB39	K562	ChIA-PET	22265404	CAB39	51890	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	231649547	231649844	231649697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BANF1P3	61429	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	231922388	231922877	231922602	Y	NA	PSMD1	NA	NA	NA	NA	PSMD1	2810	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr2	232277113	232277443	232277206	Y	C2orf72	SNORD82	NA	NA	NA	NA	SNORD82	45708	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr2	232330093	232330255	232330170	Y	NA	SNORD82,NCL,LINC00471	NA	NA	NA	NA	SNORD82	6942	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00471	91838	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.43218246246039
chr2	232478392	232478857	232478528	Y	DIS3L2,PTMA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	90748	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.444751831456909
chr2	232478879	232479328	232479053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	90277	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.486613799508958
chr2	232505425	232505799	232505482	Y	NA	NA	PDE6D	IMR90	Hi-C	24141950	PTMA	63806	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	232507409	232507767	232507481	Y	NA	NA	PDE6D	IMR90	Hi-C	24141950	PTMA	61838	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr2	232526700	232527324	232527119	Y	DIS3L2	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	42281	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.617346977670977
chr2	232530920	232531416	232531295	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	38189	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.931712816527117
chr2	232531704	232531853	232531745	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	37752	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.45109659169594
chr2	232532385	232532510	232532473	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	37095	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	232536483	232536778	232536606	Y	DIS3L2,PTMA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	32827	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104864290978615
chr2	232537231	232537488	232537452	Y	DIS3L2,PTMA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	32117	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr2	232537656	232538064	232537748	Y	NA	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	31541	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255971896756917
chr2	232542757	232542767	232542764	Y	NA	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	26838	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	232545684	232546083	232545868	Y	COPS7B	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	23522	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.96052064348095
chr2	232546670	232546982	232546826	Y	NA	PTMA	PTMA,PDE6D	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PTMA	22623	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.330047512231402
chr2	233367792	233368150	233367876	Y	ALPP,GIGYF2,ALPI,ECEL1,PRSS56,TIGD1	EIF4E2,TIGD1	MIR1471,ECEL1P2	IMR90	Hi-C	24141950	EIF4E2	44612	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr2	233563344	233563704	233563468	Y	NA	GIGYF2	NA	NA	NA	NA	GIGYF2	3335	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	233654871	233654934	233654903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf82	65046	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	233766797	233767190	233766879	Y	NA	C2orf82	NA	NA	NA	NA	C2orf82	46817	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.180053019272583
chr2	234074569	234074943	234074824	Y	NA	ATG16L1	NA	NA	NA	NA	ATG16L1	41754	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.244671570129293
chr2	234322287	234322459	234322373	Y	SAG	NA	NA	NA	NA	NA	DGKD	61134	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	234330770	234331121	234330825	Y	INPP5D,ATG16L1	NA	USP40	IMR90	Hi-C	24141950	DGKD	69617	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr2	234465976	234466363	234466311	Y	HJURP	USP40	NA	NA	NA	NA	USP40	7065	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr2	234608579	234609196	234608912	Y	NA	UGT1A7,UGT1A6	NA	NA	NA	NA	UGT1A6	10326	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr2	234614877	234615153	234615015	Y	NA	UGT1A7,UGT1A6	NA	NA	NA	NA	UGT1A6	16624	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr2	234615498	234615635	234615567	Y	NA	UGT1A7,UGT1A6	NA	NA	NA	NA	UGT1A6	17245	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr2	234630754	234630813	234630784	Y	NA	UGT1A7,UGT1A6,UGT1A1	NA	NA	NA	NA	UGT1A6	32501	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	234673088	234673246	234673167	Y	NA	UGT1A1	NA	NA	NA	NA	UGT1A1	6194	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	234764859	234765061	234764972	Y	HJURP	HJURP,MSL3P1	NA	NA	NA	NA	HJURP	3647	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	235862299	235862667	235862586	Y	SH3BP4	SH3BP4	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	3682	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	235863329	235863490	235863430	Y	SH3BP4	SH3BP4	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	4712	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	235935583	235936015	235935761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	76966	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.407079502535219
chr2	235959667	235960159	235959834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	101050	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr2	236453392	236453640	236453439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	52659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	236489079	236489125	236489102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	88346	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	236663549	236663825	236663687	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	262816	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	237117535	237117935	237117735	Y	NA	AC079135.1,GBX2	NA	NA	NA	NA	GBX2	42523	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	237482983	237483115	237483021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBX2	407971	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	237640726	237641053	237640951	Y	NA	NA	IQCA1,CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COPS8	350902	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	237779975	237780996	237780247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS8	210959	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	237933842	237934085	237933935	Y	NA	NA	CXCR7,IQCA1,ASB18	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	COPS8	57870	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	238016795	238017153	238016975	Y	NA	COPS8,AC105760.2	NA	NA	NA	NA	AC105760.2	24335	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	238092955	238093156	238093082	Y	NA	NA	COL6A3,MLPH,LRRFIP1,RAB17,PRLH	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	100495	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	238223884	238224369	238224058	Y	COL6A3	NA	NA	NA	NA	NA	AC105760.2	231424	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	238374283	238374521	238374346	Y	COL6A3	NA	LRRFIP1,MLPH,PRLH,COL6A3,RAB17	IMR90	Hi-C	24141950	LRRFIP1	159698	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr2	238581844	238582251	238582110	Y	LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	47625	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	238598036	238598427	238598303	Y	ESPNL,UBE2F,LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	63817	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	238968617	238969014	238968782	Y	NA	SCLY	NA	NA	NA	NA	SCLY	1087	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr2	239050654	239050828	239050729	Y	KLHL30	FAM132B	NA	NA	NA	NA	FAM132B	14795	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr2	239080379	239080669	239080523	Y	NA	FAM132B,ILKAP	NA	NA	NA	NA	FAM132B	14756	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	239108088	239108227	239108158	Y	ILKAP	FAM132B,ILKAP,HES6	NA	NA	NA	NA	ILKAP	2143	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	239347857	239348510	239348285	Y	ASB1	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	14474	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.21138058795524
chr2	239631175	239631419	239631288	Y	NA	NA	LOC151171,TRAF3IP1,LOC150935	IMR90	Hi-C	24141950	TWIST2	123254	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	239758150	239758505	239758333	Y	NA	TWIST2	NA	NA	NA	NA	TWIST2	3477	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr2	239767893	239768141	239768017	Y	NA	TWIST2	NA	NA	NA	NA	TWIST2	13220	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	239772979	239773251	239773061	Y	NA	TWIST2	NA	NA	NA	NA	TWIST2	18306	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	239779123	239779526	239779330	Y	TWIST2	TWIST2	NA	NA	NA	NA	TWIST2	24450	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	240080723	240081253	240081085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	239877	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	240144176	240144295	240144274	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	176835	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	240186875	240187303	240186998	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	133827	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	240196255	240196671	240196554	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	124459	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.21193737253729
chr2	240196933	240197336	240197049	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	123794	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.697611423835083
chr2	240199614	240199929	240199643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	121201	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	240200846	240201180	240201020	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	119950	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	240201720	240202445	240202126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	118685	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	240243731	240244004	240243870	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	77126	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	240250439	240250711	240250592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	70419	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	240321591	240321797	240321685	Y	HDAC4	AC062017.1,HDAC4	NA	NA	NA	NA	HDAC4	243	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr2	240386953	240387173	240387118	Y	NA	NA	NDUFA10,HDAC4,LOC150935	IMR90	Hi-C	24141950	HDAC4	65605	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr2	240850818	240851277	240850917	Y	NA	NA	LOC150935,MIR4786	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFA10	111542	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	240866823	240867270	240867165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA10	95549	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr2	241190569	241190767	241190645	Y	NA	AC124861.1	GPC1,ANKMY1,PP14571	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC124861.1	2685	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr2	241309624	241309945	241309791	Y	GPC1	NA	PP14571,GPC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPC1	63143	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.159295628027183
chr2	241313615	241314182	241313884	Y	NA	NA	GPC1	IMR90	Hi-C	24141950	GPC1	58906	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr2	241366341	241366661	241366471	Y	GPR35,GPC1	GPC1	NA	NA	NA	NA	GPC1	6427	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.315131766114373
chr2	241373489	241373922	241373594	Y	GPC1	GPC1	NA	NA	NA	NA	GPC1	401	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.585636445359203
chr2	241374162	241374480	241374229	Y	GPC1	GPC1	NA	NA	NA	NA	GPC1	1074	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.935938233725343
chr2	241431316	241431521	241431419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPC1	58228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr2	242262018	242262304	242262161	Y	NA	SEPT2,HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	HDLBP	7542	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr2	242267084	242267405	242267274	Y	MTERFD2	SEPT2,HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	HDLBP	12608	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr2	242304310	242304654	242304483	Y	FARP2	HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	FARP2	10652	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.204425830007387
chr2	242455386	242455795	242455485	Y	NEU4,C2orf85	STK25,BOK	NA	NA	NA	NA	STK25	8241	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	242480531	242480899	242480752	Y	NA	STK25,BOK	NA	NA	NA	NA	BOK	15237	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr2	242698564	242698745	242698671	Y	THAP4,ATG4B,PDCD1,D2HGDH	D2HGDH	NA	NA	NA	NA	D2HGDH	26570	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr2	242703403	242703714	242703570	Y	ATG4B,D2HGDH	D2HGDH	NA	NA	NA	NA	D2HGDH	31409	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	242711564	242711834	242711650	Y	NEU4,GAL3ST2	D2HGDH	NA	NA	NA	NA	D2HGDH	39570	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr2	242714145	242714474	242714395	Y	NEU4,D2HGDH,GAL3ST2	D2HGDH	NA	NA	NA	NA	D2HGDH	42151	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr2	243028160	243028467	243028224	Y	ATG4B	AC093642.5	NA	NA	NA	NA	AC093642.5	317	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	352488	352859	352625	Y	SRXN1,FAM110A,RBCK1	SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	6402	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.630646495857861
chr20	353974	354548	354311	Y	SRXN1,FAM110A	SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	4713	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr20	382514	382753	382693	Y	CSNK2A1,ZCCHC3,TRIB3,RBCK1	TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	RBCK1	3389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr20	641092	641461	641194	Y	NA	SRXN1	SRXN1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SRXN1	9078	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	1119535	1119804	1119673	Y	NA	PSMF1	NA	NA	NA	NA	PSMF1	27629	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	1310858	1311228	1310987	Y	SDCBP2,SDCBP2,SIRPG	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	60578	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	1372355	1372517	1372472	Y	NA	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	549	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	1372569	1372994	1372930	Y	PSMF1,SDCBP2,SIRPB2,SIRPB1	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	763	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr20	1757792	1758093	1758078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSFL1C	305305	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	1881331	1881492	1881383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK35	198765	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	2295693	2295966	2295830	Y	SIRPA,SIRPA,SIRPA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD119	145717	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr20	2450025	2450398	2450237	Y	NA	SNORD119,SNRPB	NA	NA	NA	NA	SNRPB	526	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr20	2851057	2851398	2851292	Y	NA	VPS16,PTPRA	NA	NA	NA	NA	PTPRA	8227	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	2855066	2855678	2855300	Y	NA	VPS16,PTPRA	NA	NA	NA	NA	PTPRA	12236	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr20	3155446	3155862	3155811	Y	EBF4,PTPRA,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	16604	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr20	3156363	3156554	3156472	Y	EBF4,PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	17521	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr20	3170247	3170648	3170474	Y	NA	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	DDRGK1	12683	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr20	3188788	3188839	3188809	Y	NA	UBOX5,DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	ITPA	1274	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	3200687	3201082	3200885	Y	NA	DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	ITPA	13173	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr20	3779808	3780100	3779895	Y	PANK2,PANK2,CDC25B	C20orf27,SPEF1,CENPB,CDC25B,MAVS	NA	NA	NA	NA	CDC25B	14230	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr20	3788108	3788452	3788409	Y	NA	C20orf27,SPEF1,CENPB,CDC25B,MAVS	NA	NA	NA	NA	CDC25B	22530	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.128351022973642
chr20	3909447	3909819	3909642	Y	RNF24,RNF24,PANK2	PANK2	NA	NA	NA	NA	PANK2	41961	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr20	3932717	3933076	3932937	Y	NA	NA	MIR103B2,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF24	61153	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.492072481008213
chr20	3993168	3993585	3993445	Y	PANK2,PANK2,RNF24,RNF24	RNF24,FTLP3	NA	NA	NA	NA	RNF24	644	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	4016729	4016906	4016897	Y	NA	RNF24,FTLP3	RNF24,CENPB,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	FTLP3	14177	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	4018656	4019040	4018859	Y	PANK2,PANK2,PANK2,RNF24,RNF24	RNF24,FTLP3	RNF24,CENPB,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	FTLP3	16104	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	4045309	4045541	4045432	Y	C20orf27,CENPB,C20orf29	FTLP3	RNF24,PANK2,MAVS	IMR90	Hi-C	24141950	FTLP3	42757	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr20	4063526	4063882	4063813	Y	NA	SMOX	RNF24,PANK2,MAVS	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	35745	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	4063933	4064413	4064294	Y	NA	SMOX	RNF24,PANK2,MAVS	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	35214	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	4065883	4066158	4066005	Y	PANK2,RNF24,RNF24	SMOX	RNF24,PANK2,MAVS,MIR103B2,LOC728228	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	33469	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr20	4090299	4090467	4090408	Y	SMOX	SMOX	LOC728228,PANK2,MIR103B2,ADRA1D,SMOX	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	9160	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.13713160787244
chr20	4108169	4108199	4108184	Y	NA	SMOX	LOC728228,ADRA1D,SMOX,RNF24	IMR90	Hi-C	24141950	SMOX	8542	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	4116351	4116485	4116423	Y	PANK2,PANK2,SMOX	SMOX	ADRA1D,SMOX	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	16724	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.448211321396903
chr20	4198420	4198722	4198592	Y	SMOX,ADRA1D	NA	NA	NA	NA	NA	SMOX	98793	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr20	4206645	4206924	4206784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMOX	107018	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	5042007	5042186	5042103	Y	PRNP,PRNP,SLC23A2	NA	SLC23A2,C20orf30,RASSF2,PCNA-AS1,PCNA	IMR90	Hi-C	24141950	SLC23A2	53068	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	5046140	5046913	5046758	Y	PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2	NA	SLC23A2,C20orf30,RASSF2,PCNA,PCNA-AS1,PRND,PRNT,CDS2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC23A2	57201	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr20	5053777	5054341	5054121	Y	PRNP,PRNP,RASSF2,SLC23A2	NA	NA	NA	NA	NA	PCNA	50931	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr20	5127563	5128387	5127720	Y	GPCPD1,PRNP,PRNP,SLC23A2	PCNA,CDS2	NA	NA	NA	NA	CDS2	22131	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	5512444	5512652	5512587	Y	CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1	NA	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	77020	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	5628590	5628895	5628813	Y	TRMT6,GPCPD1	GPCPD1	C20orf196,GPCPD1,TRMT6	IMR90	Hi-C	24141950	GPCPD1	38918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr20	5635212	5635550	5635485	Y	TRMT6,GPCPD1	GPCPD1	C20orf196,GPCPD1,TRMT6	IMR90	Hi-C	24141950	GPCPD1	45540	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr20	5637936	5638327	5638312	Y	NA	GPCPD1	C20orf196,GPCPD1,TRMT6	IMR90	Hi-C	24141950	GPCPD1	48264	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr20	5739573	5739619	5739595	Y	PROKR2	C20orf196	NA	NA	NA	NA	C20orf196	10534	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	5741425	5741673	5741600	Y	NA	C20orf196	NA	NA	NA	NA	C20orf196	12386	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	5748625	5748995	5748810	Y	NA	C20orf196	NA	NA	NA	NA	C20orf196	19586	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	5826892	5827249	5827089	Y	NA	RNU1-55P	NA	NA	NA	NA	RNU1-55P	41452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr20	5900000	5900262	5900165	Y	GPCPD1,TRMT6	RNU1-55P,TRMT6,MCM8	NA	NA	NA	NA	TRMT6	28920	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	5927973	5928389	5928216	Y	GPCPD1,TRMT6	TRMT6,MCM8	NA	NA	NA	NA	TRMT6	793	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	6688727	6688944	6688822	Y	BMP2	NA	NA	NA	NA	NA	BMP2	57367	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.284187161060831
chr20	6975107	6975482	6975156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMP2	228796	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr20	7058177	7058257	7058218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMP2	311866	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	7821750	7822142	7821946	Y	NA	NA	BMP2,HAO1,FERMT1	IMR90	Hi-C	24141950	TMX4	176334	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	7998924	7999176	7999047	Y	NA	TMX4	NA	NA	NA	NA	TMX4	448	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	8464613	8464952	8464618	Y	PLCB1	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	353789	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	10466571	10466854	10466711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	53701	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	10468745	10468922	10468834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	55875	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	10471502	10471750	10471599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	58632	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr20	10477280	10477577	10477381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	64410	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	10482481	10482747	10482670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	69611	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	10492212	10492484	10492413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	79342	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr20	10532947	10533172	10533034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JAG1	91842	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	10652083	10652420	10652292	Y	JAG1	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	27069	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr20	10655214	10655688	10655561	Y	NA	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	30200	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	11831025	11831188	11831107	Y	BTBD3	BTBD3	NA	NA	NA	NA	BTBD3	38183	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.10050128723994
chr20	12250218	12250236	12250226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD3	380847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	12975484	12975554	12975510	Y	NA	SPTLC3	NA	NA	NA	NA	SPTLC3	12073	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	13221839	13221847	13221843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTLC3	234212	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	13705752	13706023	13705888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESF1	57509	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	14036151	14036406	14036253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACROD2	62136	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	14248741	14249040	14248807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT3	67222	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	14266623	14266907	14266765	Y	MACROD2	FLRT3	NA	NA	NA	NA	FLRT3	49355	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	14500869	14501154	14501002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT3	184607	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr20	15012319	15012450	15012385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT3	696057	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr20	16555525	16555956	16555640	Y	NA	KIF16B	NA	NA	NA	NA	KIF16B	3447	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr20	17946136	17946538	17946496	Y	SNX5,SNX5	SNORD17,SNX5,PTMAP3	NA	NA	NA	NA	SNX5	1085	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr20	18276093	18276447	18276109	Y	CSRP2BP	ZNF133	NA	NA	NA	NA	ZNF133	8972	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.241942229379666
chr20	19716018	19716528	19716293	Y	NA	RP1-122P22.2	NA	NA	NA	NA	RP1-122P22.2	19824	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	19804713	19804972	19804782	Y	NA	NA	RIN2,SLC24A3,NAA20	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-122P22.2	68361	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr20	20714961	20715479	20715201	Y	RALGAPA2	RALGAPA2	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	23830	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	21147247	21147656	21147458	Y	NA	PLK1S1	NA	NA	NA	NA	PLK1S1	42623	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr20	21170951	21171134	21171012	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK1S1	66327	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr20	22567524	22567732	22567628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NXT1	761641	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	22743134	22743499	22743315	Y	NA	NA	THBD,NXT1,NAPB	IMR90	Hi-C	24141950	NXT1	585874	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	22744166	22744500	22744407	Y	THBD	NA	THBD,NXT1,NAPB	IMR90	Hi-C	24141950	NXT1	584873	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr20	23084032	23084273	23084186	Y	THBD,CD93,GZF1	NA	NA	NA	NA	NA	NXT1	245100	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	23117564	23117783	23117655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NXT1	211590	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	23123782	23124035	23123853	Y	NA	NA	LOC200261	IMR90	Hi-C	24141950	NXT1	205338	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	23136585	23137102	23136883	Y	THBD,CD93,GZF1	NA	NA	NA	NA	NA	NXT1	192271	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr20	24934359	24934890	24934516	Y	CST7,C20orf3	NA	NA	NA	NA	NA	ENTPD6	239439	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	25214082	25214352	25214216	Y	ENTPD6,PYGB	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	12353	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	25218471	25218756	25218634	Y	NA	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	7949	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.117433659975133
chr20	25229395	25229593	25229494	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	2690	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr20	25267859	25268242	25268026	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	41154	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr20	25671297	25671837	25671511	Y	NA	ZNF337	NA	NA	NA	NA	ZNF337	3640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr20	25842208	25842444	25842317	Y	ZNF337	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF337	166731	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr20	26116339	26116766	26116505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR663A	113396	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	29518777	29518943	29518821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1B	90914	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	30109241	30109638	30109448	Y	HM13	HM13	NA	NA	NA	NA	HM13	9010	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	30111445	30111879	30111615	Y	HM13	HM13	NA	NA	NA	NA	HM13	11214	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	30148718	30149081	30148825	Y	HCK,HM13	HM13,ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	42005	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr20	30161920	30162316	30162154	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	28770	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.220454688943899
chr20	30175524	30175854	30175562	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	15232	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.478042813630961
chr20	30182515	30183026	30182914	Y	NA	ID1	HM13	MCF7	ChIA-PET	22265404	ID1	8060	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	12.8679124295531
chr20	30183712	30184220	30184085	Y	ID1	ID1	HM13	MCF7	ChIA-PET	22265404	ID1	6866	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.17697740565095
chr20	30190743	30190994	30190797	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	92	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.27087020781504
chr20	30191850	30192346	30192159	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	764	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.44803795678859
chr20	30194967	30195344	30195216	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	3881	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.602048267924832
chr20	30196293	30196740	30196417	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	5207	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.58238655444001
chr20	30200712	30201016	30200864	Y	TTLL9,DUSP15,DEFB116,DEFB121	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	9626	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.342233917598804
chr20	30249247	30249862	30249570	Y	TTLL9	NA	NA	NA	NA	NA	ID1	58161	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	30255856	30255976	30255884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	53816	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	30292336	30292785	30292516	Y	NA	BCL2L1,TPX2	COX4I2	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2L1	17007	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	30300504	30300973	30300648	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8819	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr20	30301047	30301377	30301326	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8415	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr20	30303594	30303801	30303667	Y	TTLL9,DUSP15	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	5991	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr20	30307720	30308274	30308104	Y	POFUT1	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	1518	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.313132574555112
chr20	30658621	30658804	30658731	Y	PLAGL2,C20orf112,HCK	TM9SF4	NA	NA	NA	NA	TM9SF4	36505	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	30699679	30699866	30699769	Y	BCL2L1,HCK,C20orf112,TM9SF4,PLAGL2	TM9SF4	NA	NA	NA	NA	TM9SF4	4370	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	30700574	30701059	30700820	Y	HCK,C20orf112,TM9SF4,PLAGL2	TM9SF4	NA	NA	NA	NA	TM9SF4	5265	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr20	30793339	30793589	30793452	Y	HCK,TM9SF4,PLAGL2	PLAGL2,POFUT1	NA	NA	NA	NA	PLAGL2	5	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr20	30796713	30797081	30796897	Y	NA	PLAGL2,POFUT1	NA	NA	NA	NA	POFUT1	3030	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	30807220	30807332	30807276	Y	NA	PLAGL2,POFUT1	NA	NA	NA	NA	POFUT1	13537	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr20	31063072	31063625	31063366	Y	NA	NA	ASXL1	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf112	107251	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.27705949484929
chr20	31126982	31127359	31127172	Y	NA	C20orf112	NA	NA	NA	NA	C20orf112	43517	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	31171182	31171312	31171248	Y	DNMT3B,C20orf203	C20orf112	NA	NA	NA	NA	C20orf112	306	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr20	31373290	31373636	31373312	Y	C20orf185,DNMT3B,DNMT3B	COMMD7,DNMT3B,MAPRE1	MAPRE1	IMR90	Hi-C	24141950	DNMT3B	25099	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	31410946	31411262	31411169	Y	NA	MAPRE1	NA	NA	NA	NA	MAPRE1	5247	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	31687729	31687935	31687834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE1	282030	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr20	31998840	31999088	31998873	Y	C20orf185	CDK5RAP1,SNTA1	CDK5RAP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDK5RAP1	11473	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.139807279150677
chr20	32093960	32094027	32093984	Y	NA	CBFA2T2	NA	NA	NA	NA	CBFA2T2	18079	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	32142835	32143155	32142948	Y	C20orf186,CDK5RAP1,CHMP4B	NA	NA	NA	NA	NA	CBFA2T2	66954	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.278728479561577
chr20	32321714	32321896	32321832	Y	NA	E2F1,PXMP4,ZNF341	NA	NA	NA	NA	ZNF341	4251	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.600205005914982
chr20	32400902	32401106	32400958	Y	CHMP4B	CHMP4B	NA	NA	NA	NA	CHMP4B	3792	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr20	32425244	32425406	32425325	Y	CHMP4B	CHMP4B	NA	NA	NA	NA	CHMP4B	28134	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	32623943	32624156	32623948	Y	NA	RALY,RP5-1125A11.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1125A11.1	43780	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	32690137	32690399	32690268	Y	NA	EIF2S2,RPS2P1	NA	NA	NA	NA	EIF2S2	7739	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	32694090	32694253	32694172	Y	NA	EIF2S2,RPS2P1	NA	NA	NA	NA	EIF2S2	3885	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.171482033394586
chr20	32803033	32803441	32803244	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	94167	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr20	32803456	32803920	32803688	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	93688	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.325318979922515
chr20	32966378	32966977	32966403	Y	GGT7	ITCH	NA	NA	NA	NA	ITCH	17337	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	33064297	33064587	33064427	Y	ACSS2	FDX1P1,DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	FDX1P1	2018	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr20	33150860	33150919	33150894	Y	NA	DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	DYNLRB1	48646	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr20	33152713	33153029	33152857	Y	TP53INP2	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLRB1	50499	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	33263826	33263865	33263846	Y	MYH7B	PIGU,TP53INP2	NA	NA	NA	NA	PIGU	916	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr20	33491673	33492056	33491689	Y	TP53INP2,ACSS2	ACSS2,GSS	NA	NA	NA	NA	ACSS2	33724	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	33723601	33723932	33723853	Y	EDEM2	TRPC4AP,PROCR	NA	NA	NA	NA	PROCR	33944	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr20	33899361	33899545	33899443	Y	EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EIF6	28573	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr20	33900177	33900484	33900409	Y	GSS,EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EIF6	29389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr20	33907005	33907177	33907091	Y	EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	36217	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	34197138	34197351	34197252	Y	NA	SPAG4	NA	NA	NA	NA	SPAG4	4463	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	34217204	34217560	34217502	Y	NA	SPAG4,CPNE1,RBM12	NA	NA	NA	NA	SPAG4	15390	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr20	34330989	34331372	34331294	Y	SPAG4,SCAND1,SCAND1,PHF20,RBM39	ROMO1,NFS1,RBM39,RPF2P1,PHF20	NA	NA	NA	NA	RBM39	2755	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr20	34357066	34357356	34357208	Y	NA	RBM39,RPF2P1,PHF20	NA	NA	NA	NA	PHF20	540	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr20	34463368	34463773	34463624	Y	NFS1	RNU4-40P	NA	NA	NA	NA	RNU4-40P	9808	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.36699014830735
chr20	34471781	34472424	34472101	Y	NA	RNU4-40P	NA	NA	NA	NA	RNU4-40P	1157	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.888234620544923
chr20	34479476	34479734	34479606	Y	NA	RNU4-40P	NA	NA	NA	NA	RNU4-40P	5895	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr20	34652590	34653055	34652672	Y	NA	EPB41L1	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EPB41L1	24371	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr20	34681523	34681969	34681863	Y	EPB41L1,DLGAP4,EPB41L1	EPB41L1	LOC647979,PHF20,EPB41L1,C20orf4,C20orf152	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPB41L1	4097	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	34686333	34686697	34686525	Y	SPAG4,RBM39,PHF20	EPB41L1	SCAND1,C20orf152,EPB41L1	IMR90	Hi-C	24141950	EPB41L1	8907	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr20	34689096	34689267	34689261	Y	C20orf152	EPB41L1	SCAND1,C20orf152,EPB41L1	IMR90	Hi-C	24141950	EPB41L1	11670	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	34790985	34791133	34791034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLGAP4	101125	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	35234952	35235695	35235080	Y	NA	RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24	NA	NA	NA	NA	C20orf24	2815	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.438024107588761
chr20	35290523	35290606	35290565	Y	DLGAP4	NA	SLA2,TGIF2-C20ORF24	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf24	58386	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	35305263	35305453	35305359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG3	67028	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	35305679	35305903	35305811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG3	66578	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.343347030418287
chr20	35464098	35464342	35464182	Y	RBL1,DSN1,DSN1	NA	NA	NA	NA	NA	DSN1	63877	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.80409239908847
chr20	35489284	35489554	35489419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	88692	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	35490387	35490628	35490526	Y	MANBAL,KIAA0889	NA	KIAA0889	MCF7	ChIA-PET	22265404	SAMHD1	87618	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.216456305825379
chr20	35572677	35573004	35572914	Y	RBL1,TGIF2,TGIF2,SLA2,SAMHD1	SAMHD1	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	5242	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	35612420	35612442	35612434	Y	RBL1	SAMHD1	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	34174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr20	35723463	35723698	35723601	Y	NA	RBL1	NA	NA	NA	NA	RBL1	1275	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr20	35821029	35821195	35821110	Y	NA	RPN2	GHRH	IMR90	Hi-C	24141950	RPN2	16216	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	35923453	35923684	35923588	Y	SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC	MANBAL	NA	NA	NA	NA	MANBAL	7412	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	36034782	36035452	36035129	Y	C20orf132,VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	36484	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.246670761688553
chr20	36132626	36132893	36132840	Y	NA	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	21440	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr20	36135409	36135682	36135567	Y	NA	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	18651	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr20	36154671	36154957	36154793	Y	BLCAP,BLCAP,BLCAP	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	338	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr20	36389387	36389716	36389551	Y	NA	NA	VSTM2L	IMR90	Hi-C	24141950	CTNNBL1	68979	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	36542931	36543304	36543133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTI1	116566	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	36616982	36617239	36617111	Y	NA	TTI1,RPRD1B	NA	NA	NA	NA	TTI1	42631	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	36621379	36621533	36621455	Y	NNAT,VSTM2L	TTI1,RPRD1B	NA	NA	NA	NA	TTI1	38337	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr20	36763112	36763416	36763201	Y	NA	TGM2	NA	NA	NA	NA	TGM2	29564	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr20	36772576	36772945	36772677	Y	RPRD1B,BPI	TGM2	NA	NA	NA	NA	TGM2	20035	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104864290978615
chr20	36780859	36781241	36781066	Y	RPRD1B,RALGAPB,BPI	TGM2	NA	NA	NA	NA	TGM2	11739	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr20	36796708	36797026	36796907	Y	CTNNBL1,RPRD1B,RALGAPB,BPI	TGM2	TGM2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TGM2	3728	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr20	36927231	36927507	36927350	Y	BPI	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA71C	128939	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	37603521	37603525	37603523	Y	NA	DHX35	NA	NA	NA	NA	DHX35	14579	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	37678805	37678873	37678867	Y	SLC32A1,PPP1R16B	NA	NA	NA	NA	NA	DHX35	89863	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	39135119	39135769	39135457	Y	MAFB	NA	NA	NA	NA	NA	MAFB	180111	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr20	39190771	39191062	39190839	Y	TOP1,MAFB	NA	NA	NA	NA	NA	MAFB	124818	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	39632234	39632572	39632465	Y	MAFB,TOP1	RNU2-52P,TOP1	PLCG1,TOP1,ZHX3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU2-52P	18273	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr20	39661985	39662084	39662008	Y	NA	RNU2-52P,TOP1	NA	NA	NA	NA	TOP1	6527	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr20	39771751	39772110	39771932	Y	CHD6,PLCG1	PLCG1	NA	NA	NA	NA	PLCG1	8151	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr20	39785946	39786458	39785968	Y	CHD6,PLCG1	PLCG1	NA	NA	NA	NA	PLCG1	22346	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	39938508	39938643	39938544	Y	NA	ZHX3,LPIN3	ZHX3,PLCG1	IMR90	Hi-C	24141950	ZHX3	5669	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	40193452	40193754	40193691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD6	51379	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	40247725	40248017	40247738	Y	NA	CHD6	NA	NA	NA	NA	CHD6	2592	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	42118767	42119112	42118938	Y	PTPRT,TOX2,SGK2,L3MBTL1	SRSF6,L3MBTL1	SGK2	IMR90	Hi-C	24141950	L3MBTL1	15208	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	42286061	42286420	42286177	Y	SRSF6,L3MBTL1,MYBL2	RPL27AP,MYBL2	MYBL2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL27AP	6898	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.45732165679805
chr20	42780306	42780638	42780459	Y	NA	JPH2	NA	NA	NA	NA	JPH2	33580	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr20	42809563	42809791	42809669	Y	FITM2,JPH2	JPH2,OSER1-AS1	NA	NA	NA	NA	JPH2	4427	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	42828501	42828745	42828623	Y	NA	JPH2,OSER1-AS1	NA	NA	NA	NA	OSER1-AS1	8855	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	42833040	42833424	42833233	Y	C20orf111	JPH2,OSER1-AS1	NA	NA	NA	NA	OSER1-AS1	4176	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr20	42948601	42948866	42948737	Y	NA	FITM2,HNF4A	GDAP1L1,FITM2,C20orf111,LOC100505783,RIMS4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FITM2	10792	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.502642658445471
chr20	43123975	43124199	43124088	Y	C20orf111,STK4,ADA,SERINC3	RPL37AP1,TTPAL,SERINC3,PKIG	NA	NA	NA	NA	TTPAL	21449	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr20	43238683	43239068	43238831	Y	NA	ADA	NA	NA	NA	NA	ADA	39806	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.163294011145704
chr20	43271158	43271637	43271427	Y	NA	ADA	NA	NA	NA	NA	ADA	7237	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr20	43292777	43293302	43293042	Y	NA	ADA,RP11-445H22.3,WISP2	NA	NA	NA	NA	ADA	13903	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	43321614	43322020	43321838	Y	WISP2,KCNK15	ADA,RP11-445H22.3,WISP2	LOC79015,YWHAB,WISP2,SERINC3,TTPAL,PKIG,ADA,KCNK15,RIMS4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-445H22.3	717	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.91187728208936
chr20	43327095	43327376	43327211	Y	KCNK15	ADA,RP11-445H22.3,WISP2,KCNK15	YWHAB,WISP2,PKIG	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-445H22.3	4358	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.70522522644301
chr20	43517782	43518230	43517943	Y	NA	YWHAB,PABPC1L	PABPC1L	IMR90	Hi-C	24141950	YWHAB	5465	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr20	43569969	43570092	43570031	Y	RBPJL,TP53TG5,STK4	PABPC1L,TOMM34,STK4	NA	NA	NA	NA	TOMM34	17035	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr20	43582253	43582415	43582335	Y	NA	PABPC1L,TOMM34,STK4	NA	NA	NA	NA	TOMM34	4712	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr20	43596220	43596403	43596301	Y	SERINC3,YWHAB,SYS1,STK4	TOMM34,STK4	NA	NA	NA	NA	STK4	3105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	43598276	43598454	43598400	Y	SERINC3,ADA,SYS1,STK4	TOMM34,STK4	NA	NA	NA	NA	STK4	5161	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	43689990	43690348	43690045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WFDC12	60758	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr20	43700046	43700199	43700110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WFDC12	50907	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr20	43869504	43869693	43869682	Y	DBNDD2,SLPI	SLPI	NA	NA	NA	NA	SLPI	11512	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	43970100	43970351	43970215	Y	NA	MATN4,SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	4713	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr20	43972131	43972359	43972259	Y	NA	MATN4,SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	2705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr20	43972821	43973151	43973055	Y	SYS1,SDC4	MATN4,SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	1913	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr20	43974041	43974470	43974334	Y	NA	MATN4,SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	594	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	44001576	44001658	44001579	Y	WFDC11,KCNS1,TP53TG5,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2,PIGT	NA	NA	NA	NA	SYS1-DBNDD2	11736	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr20	44056635	44056652	44056644	Y	NA	PIGT	NA	NA	NA	NA	PIGT	13918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	44410242	44410504	44410445	Y	NA	WFDC3,DNTTIP1,UBE2C,SNX21	NA	NA	NA	NA	WFDC3	8067	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	44622132	44622355	44622242	Y	CD40,ZNF335	ZNF335,MMP9,SLC12A5	ZNF335,MMP9,SLC12A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	MMP9	13192	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	45006307	45006609	45006393	Y	PCIF1,ZNF335	SLC35C2	NA	NA	NA	NA	SLC35C2	15264	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.190240233080725
chr20	45858819	45859007	45858915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	124560	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	45870109	45870518	45870490	Y	ZMYND8,NCOA3	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	113049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr20	45943818	45944172	45944095	Y	NA	ZMYND8	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	39395	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	45944502	45944683	45944617	Y	NA	ZMYND8	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	38884	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	45946049	45946481	45946179	Y	NA	ZMYND8	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	37086	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.450210512956163
chr20	45962816	45963214	45963054	Y	NA	ZMYND8	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	20353	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr20	45987479	45988292	45987961	Y	NA	ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	3912	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.667935861150435
chr20	45988883	45989283	45988988	Y	SULF2	ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	5316	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr20	45989347	45989834	45989660	Y	SULF2	ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	5780	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.70201066198625
chr20	46082300	46082410	46082355	Y	NA	NCOA3	NCOA3,ZMYND8	IMR90	Hi-C	24141950	NCOA3	46191	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr20	46239342	46239637	46239413	Y	NCOA3	NA	NA	NA	NA	NA	NCOA3	110741	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	46356086	46356757	46356412	Y	SULF2,SULF2	NA	NA	NA	NA	NA	NCOA3	227485	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	46653872	46653986	46653882	Y	NA	NA	SULF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	NCOA3	525271	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	47316327	47316412	47316396	Y	PREX1	NA	NA	NA	NA	NA	PREX1	126008	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	47343676	47344035	47343854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PREX1	98385	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	47373433	47373685	47373559	Y	PREX1	NA	NA	NA	NA	NA	PREX1	68735	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	47400245	47400718	47400585	Y	ZNFX1,PREX1	PREX1	NA	NA	NA	NA	PREX1	41702	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	47405213	47405452	47405443	Y	ZNFX1,PREX1	PREX1	NA	NA	NA	NA	PREX1	36968	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	47443501	47443751	47443699	Y	NA	PREX1	NA	NA	NA	NA	PREX1	1081	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr20	47470610	47470767	47470691	Y	NA	PREX1	PREX1	IMR90	Hi-C	24141950	PREX1	28190	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	47547466	47547777	47547635	Y	ZNFX1,ARFGEF2	ARFGEF2	NA	NA	NA	NA	ARFGEF2	11039	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr20	47750965	47751079	47750977	Y	ZNFX1	NA	NA	NA	NA	NA	STAU1	51825	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.09723305331179
chr20	47796581	47796870	47796726	Y	NA	STAU1,DDX27	NA	NA	NA	NA	STAU1	6034	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	47803381	47804147	47803544	Y	PREX1,STAU1	STAU1,DDX27	NA	NA	NA	NA	STAU1	477	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr20	47893075	47893400	47893157	Y	B4GALT5,ZNFX1	ZNFX1,SNORD12B,SNORD12	NA	NA	NA	NA	ZNFX1	112	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr20	48291121	48291501	48291391	Y	ZNFX1,SNAI1,SLC9A8,B4GALT5	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	36914	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr20	48315836	48316073	48315912	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	12342	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.221184838134266
chr20	48316345	48316673	48316621	Y	NA	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	11742	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	48317219	48317517	48317348	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	10898	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	48317822	48318037	48318021	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	10378	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	48327368	48328064	48327696	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	351	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18093909801236
chr20	48334324	48334539	48334447	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	B4GALT5	K562	ChIA-PET	22265404	B4GALT5	5909	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	48388811	48389348	48388940	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8	SNRPFP1,SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC9A8	37902	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151837754968669
chr20	48391675	48392320	48391995	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8	SNRPFP1,SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC9A8	34930	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.368832953972574
chr20	48406651	48406821	48406652	Y	B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8	SLC9A8	KCNB1,B4GALT5,SLC9A8,SPATA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC9A8	20429	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	48406938	48407203	48407095	Y	B4GALT5,SNAI1,SLC9A8	SLC9A8	KCNB1,B4GALT5,SLC9A8,SPATA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC9A8	20047	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr20	48411231	48411773	48411549	Y	B4GALT5,TMEM189,SNAI1,RNF114,CEBPB,SLC9A8	SLC9A8	KCNB1,B4GALT5,SLC9A8,SPATA2,ZNFX1,ZNFX1-AS1,PTGIS,RNF114	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC9A8	15477	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	48533898	48534043	48533948	Y	B4GALT5,SLC9A8,CEBPB,SPATA2,SNAI1,RNF114	SPATA2,RNF114	NA	NA	NA	NA	SPATA2	3818	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr20	48598723	48598794	48598730	Y	B4GALT5,SLC9A8,TMEM189,CEBPB,RNF114,SNAI1	RNF114,SNAI1	NA	NA	NA	NA	SNAI1	1187	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr20	48615959	48616196	48616096	Y	B4GALT5,SLC9A8,TMEM189,CEBPB,RNF114,SNAI1	SNAI1	NA	NA	NA	NA	SNAI1	18423	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	48644508	48644680	48644594	Y	B4GALT5,SLC9A8,SNAI1,TMEM189,PTPN1,CEBPB	SNAI1	TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,SNAI1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNAI1	46972	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	48646361	48646933	48646559	Y	NA	SNAI1	TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,SNAI1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNAI1	48825	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr20	48650281	48650896	48650575	Y	NA	NA	TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,SNAI1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNAI1	52745	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr20	48663510	48663968	48663673	Y	NA	NA	SNAI1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SNAI1	65974	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	48717588	48717974	48717858	Y	NA	UBE2V1	NA	NA	NA	NA	UBE2V1	12522	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	48753681	48754062	48753956	Y	B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,PTPN1,CEBPB	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4	NA	NA	NA	NA	TMEM189-UBE2V1	14112	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	48760872	48761304	48761158	Y	B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	TMEM189-UBE2V1	6870	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	48763277	48763795	48763638	Y	B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	TMEM189-UBE2V1	4379	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr20	48804007	48804349	48804187	Y	B4GALT5,SLC9A8,SPATA2,PTPN1,CEBPB	TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	CEBPB	1027	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.469698861832669
chr20	48809447	48810205	48810164	Y	B4GALT5,SPATA2,SPATA2,CEBPB	TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	CEBPB	4071	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	48838079	48838414	48838219	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	CEBPB,RP11-290F20.3	PTPN1,CEBPB,LOC284751,FAM65C,MIR645	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPB	32703	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr20	48876301	48877479	48876571	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	RP11-290F20.3	PTPN1,LOC284751,FAM65C,PARD6B,CEBPB	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-290F20.3	4544	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.159295628027183
chr20	48900220	48901229	48900600	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	RP11-290F20.3	PTPN1,LOC284751,PARD6B,FAM65C,MIR645,CEBPB,TMEM189-UBE2V1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-290F20.3	18197	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.813931970990732
chr20	48901354	48901524	48901384	Y	NA	RP11-290F20.3	PTPN1,LOC284751,PARD6B,FAM65C,MIR645,CEBPB,TMEM189-UBE2V1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-290F20.3	19331	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	48902426	48902799	48902722	Y	CEBPB	RP11-290F20.3	LOC284751,PARD6B,PTPN1,FAM65C,MIR645,CEBPB	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-290F20.3	20403	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr20	48903106	48903611	48903352	Y	NA	RP11-290F20.3	LOC284751,PARD6B,PTPN1,FAM65C,MIR645,CEBPB	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-290F20.3	21083	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.64224079491997
chr20	48924890	48925591	48925260	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	RP11-290F20.3	NA	NA	NA	NA	RP11-290F20.3	42867	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.45987717659474
chr20	48938558	48938763	48938674	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-290F20.3	56535	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	48950504	48950697	48950581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-290F20.3	68481	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr20	48951795	48951969	48951898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-290F20.3	69772	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.262699620625065
chr20	48995783	48996016	48995938	Y	NA	NA	LOC284751,PTPN1,MIR645,CEBPB	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-290F20.3	113760	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr20	49032230	49032497	49032297	Y	NA	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	92394	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.70618240971308
chr20	49044286	49044567	49044388	Y	RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C	IMR90	Hi-C	24141950	PTPN1	80324	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr20	49055532	49055924	49055757	Y	SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	68967	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.154567095718296
chr20	49057048	49057261	49057196	Y	SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	67630	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr20	49067387	49067853	49067497	Y	SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C,MIR645,PARD6B	IMR90	Hi-C	24141950	PTPN1	57038	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr20	49068016	49068199	49068168	Y	SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C,MIR645,PARD6B	IMR90	Hi-C	24141950	PTPN1	56692	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr20	49100027	49100544	49100221	Y	TMEM189,CEBPB,PTPN1	PTPN1	LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	24347	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr20	49130261	49130753	49130448	Y	TMEM189,CEBPB,PTPN1	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	5370	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	49133154	49133451	49133362	Y	CEBPB,PTPN1	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	8263	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	49137019	49137081	49137050	Y	PTPN1	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	12128	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	49286898	49287066	49286958	Y	NA	NA	PTPN1,PARD6B,FAM65C,BCAS4,EYA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARD6B	59015	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr20	49346260	49347200	49346344	Y	NA	PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	179	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	49378305	49378754	49378413	Y	DPM1,PARD6B,BCAS4	PARD6B,BCAS4	NA	NA	NA	NA	BCAS4	30677	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr20	49406894	49407134	49407016	Y	NA	BCAS4	ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCAS4	2297	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr20	49407275	49407470	49407371	Y	MOCS3	BCAS4	ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCAS4	1961	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.823616069688213
chr20	49432002	49432389	49432365	Y	NA	BCAS4	NA	NA	NA	NA	BCAS4	22571	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	49524499	49524706	49524614	Y	ADNP	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	20815	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr20	49539044	49539098	49539071	Y	NA	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	6423	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	49574418	49574471	49574465	Y	PTPN1,ADNP	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	MOCS3	1055	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr20	49650336	49650514	49650422	Y	NA	NA	KCNG1,NFATC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MOCS3	76973	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	49838536	49838841	49838768	Y	NA	NA	KCNG1	IMR90	Hi-C	24141950	MOCS3	265173	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.229025674821897
chr20	49963208	49963745	49963374	Y	NFATC2	NA	KCNG1,ATP9A,NFATC2	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-827A12.2	385327	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	49967560	49968079	49967777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	380993	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	49982226	49982434	49982404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	366638	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr20	49982609	49983533	49983215	Y	KCNG1	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	365539	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.630646495857861
chr20	50033542	50033860	50033623	Y	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	315212	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	50072988	50073809	50073517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	275263	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr20	50247670	50248383	50248096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	100689	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	50366318	50366439	50366379	Y	NA	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	16734	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr20	50366772	50367203	50366881	Y	ZFP64,ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A,SALL4	NA	NA	NA	NA	ATP9A	15970	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.474427394141556
chr20	50383575	50384083	50383723	Y	ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A,SALL4	NA	NA	NA	NA	ATP9A	402	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.58601940898832
chr20	50416342	50416699	50416509	Y	NA	ATP9A,SALL4	NA	NA	NA	NA	SALL4	360	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	50416703	50416783	50416765	Y	ZFP64,SALL4	ATP9A,SALL4	NA	NA	NA	NA	SALL4	276	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	50527143	50527170	50527154	Y	NA	NA	ZFP64,SALL4,ATP9A	IMR90	Hi-C	24141950	SALL4	110084	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr20	50601567	50601698	50601647	Y	NA	NA	ATP9A,SALL4,NFATC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SALL4	184508	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.117433659975133
chr20	50692863	50693237	50693120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP64	125610	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	51611135	51611148	51611142	Y	TSHZ2	TSHZ2	NA	NA	NA	NA	TSHZ2	24189	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	51694232	51694450	51694303	Y	TSHZ2	NA	NA	NA	NA	NA	TSHZ2	107286	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	51779015	51779124	51779066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSHZ2	192069	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	52195908	52196455	52196142	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	27991	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	52201463	52201802	52201714	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	22644	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.216612235374789
chr20	52212842	52213180	52212942	Y	ZNF217	ZNF217	BMP7,SUMO1P1,BCAS1,CYP24A1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF217	11266	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr20	52238141	52238435	52238216	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	13695	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr20	52238527	52238650	52238555	Y	NA	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	14081	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.149994492958819
chr20	52239995	52240318	52240062	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	15549	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.59186105411669
chr20	52392953	52393088	52393021	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	SUMO1P1	97008	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr20	52445816	52446339	52446069	Y	ZNF217	SUMO1P1	ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SUMO1P1	43757	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr20	52483715	52484176	52483911	Y	NA	SUMO1P1	NA	NA	NA	NA	SUMO1P1	5920	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	52531977	52532203	52532002	Y	NA	SUMO1P1	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SUMO1P1	41881	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	52532315	52532889	52532591	Y	ZNF217	SUMO1P1	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SUMO1P1	42219	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr20	52543055	52543571	52543250	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	SUMO1P1	52959	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	52740107	52740637	52740253	Y	NA	CYP24A1	DOK5,SULF2,ZMYND8,BMP7,PTPRT	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP24A1	47875	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	52749215	52749597	52749386	Y	NA	CYP24A1	DOK5	IMR90	Hi-C	24141950	CYP24A1	38915	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr20	54729980	54730207	54730095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM210B	201764	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	55264382	55264603	55264519	Y	NA	PTMAP6	BMP7,TFAP2C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMAP6	9967	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	55362710	55362938	55362792	Y	AURKA,TFAP2C	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTMAP6	88140	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.620076318420604
chr20	55363467	55363682	55363577	Y	NA	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTMAP6	88897	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.573102854430551
chr20	55403523	55403730	55403625	Y	TFAP2C	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTMAP6	128953	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr20	55964119	55964506	55964297	Y	ZBP1,MTRNR2L3,RBM38	RAE1,MTRNR2L3	NA	NA	NA	NA	RBM38	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr20	56027077	56027304	56027131	Y	NA	HMGB1P1	MIR5095	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HMGB1P1	34779	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	56032255	56032633	56032497	Y	NA	HMGB1P1	MIR5095,CTCFL	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HMGB1P1	29450	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	56255217	56255759	56255498	Y	ZBP1,PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	28833	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	56270075	56270492	56270216	Y	PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	14100	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	56273255	56273697	56273462	Y	PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	10895	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr20	56293544	56293843	56293665	Y	NA	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	8952	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.330430475860518
chr20	56323662	56324029	56323724	Y	NA	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	39070	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr20	56881560	56881733	56881657	Y	STX16,RAB22A	PPP4R1L,RAB22A	NA	NA	NA	NA	PPP4R1L	762	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	56881907	56882420	56882011	Y	STX16,RAB22A	PPP4R1L,RAB22A	NA	NA	NA	NA	PPP4R1L	75	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	57018014	57018479	57018179	Y	STX16	NA	NA	NA	NA	NA	VAPB	55836	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.139807279150677
chr20	57198784	57199334	57199089	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16	24994	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr20	57270107	57270808	57270490	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1	NA	NA	NA	NA	NPEPL1	7920	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	57557787	57558211	57558054	Y	ZNF831,STX16	CTSZ,ATP5E	NA	NA	NA	NA	CTSZ	22091	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	57697718	57697916	57697753	Y	STX16,ZNF831	NA	GNAS,GNAS-AS1,ZNF831	IMR90	Hi-C	24141950	SLMO2	81754	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	57975904	57976026	57975986	Y	EDN3	NA	NA	NA	NA	NA	SLMO2	359940	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	58451421	58451787	58451564	Y	SYCP2,PPP1R3D,C20orf177,C20orf177	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3D	61565	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	60033866	60034028	60033960	Y	CDH4	NA	NA	NA	NA	NA	TAF4	604838	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	60529765	60530009	60529928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF4	108857	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	60561621	60561764	60561683	Y	GATA5,CABLES2	NA	NA	NA	NA	NA	TAF4	77102	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	60605862	60606121	60605992	Y	NA	TAF4	NA	NA	NA	NA	TAF4	32745	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	60719468	60719634	60719593	Y	SS18L1,GTPBP5	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	2646	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.709641899653074
chr20	60758632	60758689	60758683	Y	GATA5,CABLES2	PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	41810	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr20	60803093	60803442	60803179	Y	NA	OSBPL2	NA	NA	NA	NA	OSBPL2	8138	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr20	60914790	60915105	60914838	Y	NA	ADRM1,MIR4758,LAMA5,RPS21	NA	NA	NA	NA	MIR4758	9177	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	60924549	60924827	60924688	Y	TAF4,SS18L1,SLCO4A1,C20orf151,LAMA5	ADRM1,MIR4758,LAMA5,RPS21	NA	NA	NA	NA	LAMA5	15541	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	60933408	60933760	60933692	Y	NA	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	ADRM1	K562	ChIA-PET	22265404	LAMA5	6608	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.281074856682088
chr20	60934143	60934390	60934309	Y	TAF4,PSMA7,SS18L1,RPS21,NTSR1,CABLES2,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	ADRM1	K562	ChIA-PET	22265404	LAMA5	5978	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.48426787873307
chr20	60935306	60935741	60935523	Y	NA	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	ADRM1	K562	ChIA-PET	22265404	LAMA5	4627	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	60940876	60941209	60940968	Y	PSMA7,SLCO4A1,RPS21,NTSR1,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	508	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.353534244226429
chr20	60941528	60941750	60941608	Y	SLCO4A1,ADRM1,LAMA5	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	1160	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.323319788363254
chr20	60943690	60943839	60943760	Y	NA	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	3322	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.346076371167914
chr20	60944265	60944566	60944463	Y	NA	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	3897	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr20	60956313	60956720	60956445	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	RPS21	3452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	60956743	60957219	60956871	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	RPS21	2953	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr20	60972798	60973035	60972874	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	CABLES2	7306	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.379020167780716
chr20	61187660	61187821	61187741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO4A1	83976	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.283074048241349
chr20	61192605	61193059	61192901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO4A1	78738	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.891467076405213
chr20	61282674	61283033	61282738	Y	OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1	SLCO4A1	NA	NA	NA	NA	SLCO4A1	10877	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	61283206	61283870	61283565	Y	OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1	SLCO4A1	NA	NA	NA	NA	SLCO4A1	11409	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr20	61335955	61336196	61336080	Y	NA	NA	C20orf20,LOC100652730,SLCO4A1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLCO4A1	64158	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr20	61337130	61337323	61337237	Y	NA	NA	C20orf20,LOC100652730,SLCO4A1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLCO4A1	65333	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	61371540	61371927	61371747	Y	DPH3P1,DIDO1,OGFR	NA	NA	NA	NA	NA	OGFR	62260	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr20	61400175	61400479	61400325	Y	NA	OGFR	NA	NA	NA	NA	OGFR	33708	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	61425509	61425950	61425706	Y	DPH3P1,DIDO1,OGFR	OGFR,DPH3P1	NA	NA	NA	NA	OGFR	8237	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr20	61505589	61505880	61505712	Y	BHLHE23,DIDO1,C20orf11	DPH3P1,TCFL5	TCFL5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TCFL5	14474	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr20	61506279	61506510	61506352	Y	BHLHE23,TCFL5,DIDO1,C20orf11	DPH3P1,TCFL5	TCFL5	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TCFL5	15164	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr20	61553883	61554120	61553955	Y	DIDO1	DIDO1	NA	NA	NA	NA	DIDO1	13184	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	61555881	61556606	61556058	Y	DIDO1	DIDO1	NA	NA	NA	NA	DIDO1	10698	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	61687989	61688195	61688101	Y	NA	HAR1B	NA	NA	NA	NA	HAR1B	43476	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr20	61724045	61724282	61724168	Y	NA	HAR1B	NA	NA	NA	NA	HAR1B	7389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr20	61822824	61823015	61822948	Y	NA	YTHDF1	NA	NA	NA	NA	YTHDF1	22571	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr20	62313782	62314225	62314041	Y	NA	STMN3,RTEL1,TNFRSF6B,ZGPAT,ARFRP1	NA	NA	NA	NA	TNFRSF6B	11796	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.261430578256172
chr20	62466212	62466776	62466445	Y	OPRL1,ABHD16B	ZBTB46,TPD52L2	PTK6,SLC2A4RG,ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,ABHD16B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZBTB46	5615	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.17369082397465
chr20	62527317	62528264	62527831	Y	PRIC285,PRIC285,GMEB2,ZGPAT,ZGPAT,LIME1,TPD52L2,RGS19,RGS19,OPRL1,DNAJC5	TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	DNAJC5	2799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr20	62545436	62545544	62545492	Y	NA	DNAJC5,RNU1-134P,UCKL1	NA	NA	NA	NA	RNU1-134P	7128	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr20	62609214	62609358	62609321	Y	SAMD10	UCKL1,SAMD10,PRPF6	NA	NA	NA	NA	SAMD10	3	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr20	62676233	62676312	62676273	Y	SLC2A4RG,TCEA2,SOX18	LINC00176,ZNF512B,SOX18,TCEA2,RGS19	NA	NA	NA	NA	ZNF512B	1801	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr20	62887659	62888425	62887862	Y	SAMD10,PCMTD2	PCMTD2	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	2565	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.448367250946313
chr21	9881917	9882087	9882000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3648	58085	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.231755015571524
chr21	11118249	11118623	11118434	Y	NA	NA	BAGE5	IMR90	Hi-C	24141950	TEKT4P2	1151664	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr21	11174514	11174910	11174556	Y	NA	NA	BAGE5,TPTE	IMR90	Hi-C	24141950	TEKT4P2	1207929	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr21	11184749	11185145	11184947	Y	BAGE2,BAGE	NA	NA	NA	NA	NA	TEKT4P2	1218164	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr21	15442714	15442952	15442833	Y	NA	AP001347.6	NA	NA	NA	NA	AP001347.6	44972	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr21	15450488	15450803	15450511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001347.6	52746	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr21	16222795	16222981	16222977	Y	NA	NA	NRIP1	IMR90	Hi-C	24141950	NRIP1	212340	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr21	16354668	16355055	16354876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRIP1	80266	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	16594224	16594634	16594357	Y	NRIP1	NA	NRIP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NRIP1	158903	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	17103695	17103792	17103750	Y	USP25	USP25	NA	NA	NA	NA	USP25	3351	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146379073469414
chr21	17104761	17105053	17104812	Y	USP25	USP25	NA	NA	NA	NA	USP25	4417	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr21	17568022	17568137	17568068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD74	86952	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.704339147703231
chr21	17656088	17656430	17656111	Y	NA	SNORD74	NA	NA	NA	NA	SNORD74	999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr21	17660204	17660286	17660245	Y	NA	SNORD74	NA	NA	NA	NA	SNORD74	5115	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr21	17672058	17672352	17672205	Y	NA	SNORD74	NA	NA	NA	NA	SNORD74	16969	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr21	17678130	17678559	17678221	Y	NA	SNORD74	NA	NA	NA	NA	SNORD74	23041	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.123778420214165
chr21	17681993	17682347	17682285	Y	NA	SNORD74	NA	NA	NA	NA	SNORD74	26904	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr21	17745935	17746301	17746052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD74	90846	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr21	17790629	17790733	17790681	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7C	119410	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	17842479	17842645	17842562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7C	67498	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	17882685	17882787	17882770	Y	NA	MIRLET7C	NA	NA	NA	NA	MIRLET7C	27356	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	17906909	17907886	17907248	Y	NA	MIRLET7C	NA	NA	NA	NA	MIRLET7C	2257	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr21	17947903	17948171	17948037	Y	NA	MIRLET7C	NA	NA	NA	NA	MIRLET7C	37760	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr21	17958916	17959192	17958984	Y	NA	MIRLET7C	NA	NA	NA	NA	MIRLET7C	48773	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr21	17959400	17959753	17959559	Y	NA	MIRLET7C	NA	NA	NA	NA	MIRLET7C	49257	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.447325242657125
chr21	17960667	17961305	17960883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7C	50524	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.465126259073192
chr21	18886111	18886899	18886569	Y	NA	CXADR	NA	NA	NA	NA	CXADR	3411	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	18891260	18891546	18891459	Y	NA	CXADR	NA	NA	NA	NA	CXADR	8560	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr21	18984370	18984546	18984496	Y	NA	BTG3	NA	NA	NA	NA	BTG3	1105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr21	20866297	20866716	20866515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP22	638200	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr21	22545026	22545343	22545185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBAP	2234105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	26874070	26874470	26874443	Y	NA	NA	LINC00515,MRPL39	IMR90	Hi-C	24141950	MIR155HG	57751	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr21	26952057	26952278	26952105	Y	JAM2	MIR155HG,MRPL39	NA	NA	NA	NA	MIR155HG	19836	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr21	26960524	26960778	26960645	Y	NA	MIR155HG,MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	17051	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr21	26962945	26963646	26963455	Y	NA	MIR155HG,MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	14183	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210997624326124
chr21	27370700	27370785	27370725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APP	170661	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr21	27942681	27943072	27942893	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001597.1	178727	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	28018634	28018812	28018723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS1	196916	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr21	28173911	28174139	28174005	Y	ADAMTS1	ADAMTS1	ADAMTS1	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS1	41589	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.543044328116787
chr21	28207147	28207505	28207325	Y	NA	ADAMTS1	NA	NA	NA	NA	ADAMTS1	8223	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr21	28219280	28219541	28219411	Y	NA	ADAMTS1	NA	NA	NA	NA	ADAMTS1	3552	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	28221663	28222017	28221832	Y	NA	ADAMTS1	LINC00113	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS1	5935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210267475135757
chr21	28300536	28300937	28300780	Y	ADAMTS5,ADAMTS1	ADAMTS5	NA	NA	NA	NA	ADAMTS5	35895	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr21	28336800	28337144	28336952	Y	ADAMTS1,ADAMTS5	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS5	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	28369813	28370030	28369922	Y	NA	ADAMTS5	ADAMTS5	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS5	32981	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	29461833	29462120	29461977	Y	NA	AL035610.1	NA	NA	NA	NA	AL035610.1	43100	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	30009773	30009970	30009799	Y	NA	NA	ADAMTS1,LINC00161	IMR90	Hi-C	24141950	N6AMT1	245723	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr21	30191610	30191885	30191792	Y	C21orf7	NA	ADAMTS1	IMR90	Hi-C	24141950	N6AMT1	63808	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.88237599670227
chr21	30390843	30391016	30390919	Y	NA	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	NA	NA	NA	NA	RWDD2B	1144	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	30472474	30472512	30472479	Y	USP16,BACH1,BACH1	CCT8	NA	NA	NA	NA	CCT8	28356	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	30535919	30536092	30536051	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,BACH1	NA	NA	NA	NA	U3	14868	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	30555048	30555502	30555259	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,BACH1	NA	NA	NA	NA	U3	4088	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.313132574555112
chr21	30567218	30567411	30567380	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	2826	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	30567933	30569654	30568878	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	3541	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr21	30590117	30590529	30590261	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	25725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	30603394	30603504	30603466	Y	USP16,BACH1,BACH1	BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	39002	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr21	30604921	30605035	30604987	Y	USP16,BACH1,BACH1	BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	40529	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.353917207855545
chr21	30631059	30631204	30631132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	66667	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr21	30675702	30676052	30675894	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	111310	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr21	30754427	30754628	30754578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	190035	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr21	30967382	30967686	30967533	Y	GRIK1	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	402990	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr21	31029045	31029571	31029224	Y	BACH1,BACH1	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	464653	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	33104933	33105321	33105127	Y	NA	SCAF4	NA	NA	NA	NA	SCAF4	2545	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	33105563	33105881	33105775	Y	SCAF4	SCAF4	NA	NA	NA	NA	SCAF4	3175	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr21	33670455	33670601	33670551	Y	NA	MIS18A	NA	NA	NA	NA	MIS18A	21075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	33822696	33822707	33822702	Y	C21orf63,C21orf62	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf119	59257	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	33836273	33836551	33836412	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf119	72834	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr21	33853478	33853730	33853567	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf119	90039	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.754041952442911
chr21	33870747	33870982	33870865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf119	107308	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	33893754	33894020	33893930	Y	C21orf63	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf59	89156	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.317861106864
chr21	34075111	34075304	34075194	Y	NA	SYNJ1	NA	NA	NA	NA	SYNJ1	23055	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr21	34350736	34350972	34350872	Y	OLIG2,OLIG1	OLIG2	ITSN1	K562	5C	22955621	OLIG2	45181	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	34659541	34659728	34659635	Y	NA	IL10RB,IFNAR1	NA	NA	NA	NA	IL10RB	22878	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr21	34733678	34734189	34733958	Y	OLIG1,IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,IFNGR2,GART,GART	IFNAR1,IFNGR2	NA	NA	NA	NA	IFNAR1	38944	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	34752926	34753284	34753094	Y	IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2	IFNGR2	NA	NA	NA	NA	IFNGR2	19918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.411425071214991
chr21	34755296	34756154	34755534	Y	IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2	IFNGR2	IFNGR2	MCF7	ChIA-PET	22265404	IFNGR2	17048	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr21	35099909	35100119	35099917	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRYZL1	85677	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr21	35319562	35320491	35320153	Y	NA	ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	33278	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr21	35397758	35397925	35397838	Y	NA	MRPS6,SLC5A3	MRPS6,LOC100506334,LINC00310,FAM165B,KCNE2	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS6	45599	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	35891449	35891717	35891494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	93724	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	36143971	36144119	36144107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	158530	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	36167928	36168243	36168166	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	182487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	36179679	36180279	36179996	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	194238	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	36185927	36186112	36186038	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	200486	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr21	36207924	36208159	36208081	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	222483	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	36208387	36209191	36208566	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	222946	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.508484303573841
chr21	36214787	36216208	36215152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	229346	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr21	36219873	36220239	36220187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	234432	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr21	36254204	36254725	36254297	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	268763	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.124891533033648
chr21	36419290	36419780	36419662	Y	RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	433849	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr21	36423642	36423856	36423739	Y	RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	438201	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr21	37695369	37695803	37695437	Y	MORC3	MORC3	NA	NA	NA	NA	MORC3	4882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	37712607	37712952	37712729	Y	NA	MORC3,CHAF1B	NA	NA	NA	NA	MORC3	22120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr21	38062761	38063015	38062888	Y	NA	SIM2	CLDN14,HLCS	IMR90	Hi-C	24141950	SIM2	6418	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	38072912	38073314	38073050	Y	SIM2	SIM2	HLCS	IMR90	Hi-C	24141950	SIM2	3479	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr21	38074425	38074708	38074699	Y	NA	SIM2	HLCS	IMR90	Hi-C	24141950	SIM2	4992	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	38077611	38077801	38077726	Y	DSCR6,SIM2	SIM2	HLCS	IMR90	Hi-C	24141950	SIM2	8178	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr21	38151764	38151954	38151859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIM2	82331	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr21	38232574	38232719	38232637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	104093	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.594746324415728
chr21	38349168	38349478	38349323	Y	TTC3,DYRK1A,HLCS	AP000704.5,HLCS	NA	NA	NA	NA	HLCS	11058	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr21	38500086	38500176	38500125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC3	56560	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr21	38628157	38628175	38628166	Y	NA	DSCR9,AP001432.14,DSCR3	NA	NA	NA	NA	DSCR3	10087	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr21	38801876	38802213	38802018	Y	DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	65784	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr21	38825760	38825986	38825873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	89668	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	38839400	38839766	38839583	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	103308	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	38935728	38936411	38936235	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	199636	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210267475135757
chr21	38936686	38937128	38936852	Y	DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	200594	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.232485164761891
chr21	39543838	39544086	39544003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001422.3	159257	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr21	39649239	39650359	39649644	Y	KCNJ15,KCNJ15,KCNJ15	NA	NA	NA	NA	NA	AP001422.3	52984	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.316747994044517
chr21	39652414	39652814	39652623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001422.3	50529	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	39654732	39655403	39655082	Y	KCNJ15,KCNJ15,KCNJ15	AP001422.3	NA	NA	NA	NA	AP001422.3	47940	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	39661705	39662059	39661845	Y	KCNJ15	AP001422.3	NA	NA	NA	NA	AP001422.3	41284	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr21	39675119	39675662	39675396	Y	NA	AP001422.3	NA	NA	NA	NA	AP001422.3	27681	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr21	39678263	39678712	39678528	Y	NA	AP001422.3	NA	NA	NA	NA	AP001422.3	24631	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr21	39682559	39682791	39682680	Y	ETS2	AP001422.3	NA	NA	NA	NA	AP001422.3	20552	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	39687013	39687366	39687190	Y	NA	AP001422.3	NA	NA	NA	NA	AP001422.3	15977	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr21	39691855	39692024	39691944	Y	ETS2	AP001422.3	NA	NA	NA	NA	AP001422.3	11319	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	39696232	39696607	39696353	Y	NA	AP001422.3	KCNJ6,DSCR10,KCNJ15,DSCR8	IMR90	Hi-C	24141950	AP001422.3	6736	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr21	39715625	39715930	39715831	Y	ERG	AP001422.3	KCNJ15,KCNJ6,DSCR8	IMR90	Hi-C	24141950	AP001422.3	12282	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146379073469414
chr21	39722623	39722941	39722785	Y	ETS2	AP001422.3	NA	NA	NA	NA	AP001422.3	19280	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr21	39723755	39724311	39724014	Y	ETS2	AP001422.3	NA	NA	NA	NA	AP001422.3	20412	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.796669847753192
chr21	39724680	39725061	39724870	Y	ETS2	AP001422.3	NA	NA	NA	NA	AP001422.3	21337	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr21	40159439	40159794	40159507	Y	NA	ETS2	ETS2,LINC00114	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ETS2	15437	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr21	40182920	40183779	40183392	Y	ETS2	ETS2	NA	NA	NA	NA	ETS2	7689	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	40211972	40212276	40212079	Y	ETS2	ETS2	NA	NA	NA	NA	ETS2	36741	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	40225341	40225561	40225501	Y	ETS2	NA	LINC00114,ETS2,PSMG1,BRWD1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS2	50110	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.231755015571524
chr21	40277371	40277733	40277541	Y	NA	NA	ETS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ETS2	102140	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr21	40278958	40279421	40279192	Y	NA	NA	ETS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ETS2	103727	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.560186299872782
chr21	40393264	40393350	40393326	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	160427	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	40673787	40673929	40673891	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	17556	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr21	40690087	40690386	40690238	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	1099	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	40753076	40753485	40753292	Y	WRB	HMGN1,WRB	NA	NA	NA	NA	WRB	2906	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.173481224953846
chr21	40814197	40814412	40814270	Y	NA	LCA5L,SH3BGR	NA	NA	NA	NA	LCA5L	1319	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr21	43181534	43181711	43181623	Y	MX2,MX1,MX1,MX1,ZNF295,ABCG1	RIPK4	NA	NA	NA	NA	RIPK4	3555	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	43331076	43331447	43331406	Y	NA	PRDM15,C2CD2	NA	NA	NA	NA	PRDM15	33485	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr21	43372239	43372638	43372317	Y	C2CD2	C2CD2	NA	NA	NA	NA	C2CD2	240	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	43426535	43426580	43426552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2CD2	54536	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr21	43615416	43615758	43615654	Y	ZNF295,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1	ABCG1	ABCG1	K562	ChIA-PET	22265404	ABCG1	2041	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	43653155	43654253	43653819	Y	NA	ABCG1	TFF3	IMR90	Hi-C	24141950	ABCG1	35356	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.225913370443154
chr21	43654635	43655282	43654967	Y	NA	ABCG1	TFF3	IMR90	Hi-C	24141950	ABCG1	36836	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.341347838859027
chr21	43832072	43832298	43832177	Y	NA	TFF1,TMPRSS3	NA	NA	NA	NA	TMPRSS3	17117	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr21	43835171	43835549	43835341	Y	C2CD2,ZNF295,UMODL1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,UBASH3A	TMPRSS3	NA	NA	NA	NA	TMPRSS3	20216	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.327318171481775
chr21	43952961	43953452	43953160	Y	PKNOX1,ABCG1,ABCG1,ABCG1	SLC37A1,RSPH1	NA	NA	NA	NA	RSPH1	38497	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr21	44104688	44105340	44105026	Y	ABCG1,ABCG1,UBASH3A	PDE9A	NA	NA	NA	NA	PDE9A	32942	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	44278308	44278654	44278481	Y	NA	WDR4,NDUFV3	NA	NA	NA	NA	WDR4	19024	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr21	44395482	44395891	44395810	Y	NA	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	2862	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.308559971795636
chr21	44395922	44396228	44396080	Y	WDR4,U2AF1,CBS	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	3302	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr21	44425410	44425661	44425536	Y	NA	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	32790	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	44465598	44466060	44465736	Y	PKNOX1	CBS	NA	NA	NA	NA	CBS	28993	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr21	44469974	44470172	44470008	Y	CBS	CBS	NA	NA	NA	NA	CBS	24881	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr21	44499901	44500036	44499938	Y	NA	CBS,U2AF1	NA	NA	NA	NA	CBS	4848	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr21	44573696	44574026	44573784	Y	NA	U2AF1,CRYAA	HSF2BP,LINC00319,LINC00313,SIK1,RRP1B,U2AF1,WDR4,NDUFV3,PDXK	IMR90	Hi-C	24141950	CRYAA	13092	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	44582937	44583304	44583126	Y	NA	CRYAA	HSF2BP,LINC00313,U2AF1	IMR90	Hi-C	24141950	CRYAA	3814	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr21	44597156	44597534	44597315	Y	SIK1	CRYAA	NA	NA	NA	NA	CRYAA	10038	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.920448267967356
chr21	44598375	44598751	44598475	Y	NA	CRYAA	NA	NA	NA	NA	CRYAA	11257	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr21	44631329	44631684	44631488	Y	NA	CRYAA	LINC00313,SIK1,HSF2BP,LINC00319	IMR90	Hi-C	24141950	CRYAA	44211	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.72292398278106
chr21	44631926	44632172	44632049	Y	NA	CRYAA	LINC00313,SIK1,HSF2BP,LINC00319	IMR90	Hi-C	24141950	CRYAA	44808	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.379750316971083
chr21	44727003	44727328	44727122	Y	RRP1,HSF2BP	LINC00322	LINC00313,SIK1,HSF2BP	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00322	22591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.218455497384639
chr21	44727448	44727599	44727495	Y	PKNOX1,SIK1	LINC00322	LINC00313,SIK1,HSF2BP	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00322	22320	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr21	44752617	44753007	44752874	Y	NA	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	2698	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.281457820311205
chr21	44753292	44753457	44753456	Y	NA	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	3373	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.14495500950117
chr21	44753663	44753942	44753875	Y	NA	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	3744	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.470967904201562
chr21	44759656	44759904	44759692	Y	NA	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	9737	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.499183168505477
chr21	44760713	44760913	44760830	Y	NA	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	10794	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.42491675336377
chr21	44761192	44761567	44761446	Y	CRYAA	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319,CRYAA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	11273	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.619346169230237
chr21	44764269	44764611	44764455	Y	NA	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319,CRYAA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	14350	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	44765825	44766380	44766074	Y	PKNOX1	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	15906	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.314401616924006
chr21	44792965	44793192	44793096	Y	NA	LINC00322	LINC00313,CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00322	43046	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.718368815080482
chr21	44796506	44796705	44796660	Y	NA	LINC00322,SIK1	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00322	46587	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.653906193773182
chr21	44816664	44817004	44816885	Y	NA	SIK1,LINC00319	NA	NA	NA	NA	SIK1	28004	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	8.35501932877558
chr21	44817742	44818046	44817914	Y	NA	SIK1,LINC00319	NA	NA	NA	NA	SIK1	26962	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr21	44830426	44830842	44830489	Y	SIK1	SIK1,LINC00319	NA	NA	NA	NA	SIK1	14166	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.339504576849177
chr21	44831891	44832268	44832005	Y	SIK1	SIK1,LINC00319	NA	NA	NA	NA	SIK1	12740	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	44832284	44832425	44832365	Y	SIK1	SIK1,LINC00319	NA	NA	NA	NA	SIK1	12583	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr21	44848808	44849083	44848957	Y	CBS	SIK1,LINC00319,LINC00313	NA	NA	NA	NA	SIK1	3800	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr21	44850435	44851222	44850996	Y	CBS	SIK1,LINC00319,LINC00313	CRYAA,SIK1,HSF2BP,LINC00313,LINC00319,RRP1B	IMR90	Hi-C	24141950	SIK1	5427	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.475313472881334
chr21	44859375	44859527	44859442	Y	NA	SIK1,LINC00319,LINC00313	NA	NA	NA	NA	LINC00319	4954	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.303831439486748
chr21	44860778	44861412	44860950	Y	SIK1	SIK1,LINC00319,LINC00313	NA	NA	NA	NA	LINC00319	3069	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.85805639909424
chr21	44862613	44862764	44862681	Y	NA	SIK1,LINC00319,LINC00313	NA	NA	NA	NA	LINC00319	1717	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.362991308844204
chr21	44867284	44867543	44867469	Y	NA	SIK1,LINC00319,LINC00313	NA	NA	NA	NA	LINC00319	2803	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	44874156	44874417	44874299	Y	NA	SIK1,LINC00319,LINC00313	NA	NA	NA	NA	LINC00319	9675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	44913472	44913707	44913565	Y	PDXK	LINC00319,LINC00313	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00313	16058	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr21	44914466	44914931	44914660	Y	PDXK,U2AF1,SIK1	LINC00319,LINC00313	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00313	17052	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.414537375593734
chr21	44918002	44918401	44918083	Y	NA	LINC00313	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00313	20588	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.423994440211509
chr21	44936784	44937143	44936907	Y	PDXK	LINC00313	NA	NA	NA	NA	LINC00313	39370	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.286916501810459
chr21	44937659	44937875	44937741	Y	PDXK	LINC00313	NA	NA	NA	NA	LINC00313	40245	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr21	45020604	45020960	45020754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSF2BP	56414	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr21	45029471	45029828	45029593	Y	PDXK	HSF2BP,RRP1B	NA	NA	NA	NA	HSF2BP	47546	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr21	45065485	45065706	45065596	Y	NA	HSF2BP,RRP1B	NA	NA	NA	NA	HSF2BP	11668	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182052210831843
chr21	45080522	45080871	45080626	Y	TRAPPC10,PWP2,SIK1,RRP1B	HSF2BP,RRP1B	NA	NA	NA	NA	RRP1B	3093	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.176210565703473
chr21	45117744	45118082	45118052	Y	NA	HSF2BP,RRP1B,PDXK	PDXK	IMR90	Hi-C	24141950	PDXK	18893	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151837754968669
chr21	45132062	45132504	45132250	Y	HSF2BP,PDXK	PDXK	NA	NA	NA	NA	PDXK	4471	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.790445238995705
chr21	45146832	45147391	45147298	Y	NA	PDXK,CSTB	NA	NA	NA	NA	PDXK	9857	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	45187861	45188442	45188176	Y	ICOSLG,PDXK,CSTB	CSTB,RRP1	NA	NA	NA	NA	CSTB	5884	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.443638718637426
chr21	45235037	45235392	45235184	Y	NA	CSTB,RRP1,MYL6P1,AGPAT3	NA	NA	NA	NA	RRP1	27643	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	45237788	45238060	45237872	Y	TRAPPC10,ICOSLG,AGPAT3	CSTB,RRP1,MYL6P1,AGPAT3	NA	NA	NA	NA	RRP1	30394	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	45337582	45337952	45337767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT3	54515	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	45441566	45441868	45441701	Y	C21orf2,TRAPPC10	TRAPPC10,H2AFZP1	PWP2,C21orf33	IMR90	Hi-C	24141950	TRAPPC10	11366	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr21	45558236	45558599	45558477	Y	PDXK,AGPAT3,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	6749	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr21	45627966	45628150	45628090	Y	NA	ICOSLG	NA	NA	NA	NA	ICOSLG	30699	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	45661962	45662435	45662161	Y	TRAPPC10,PWP2,C21orf2,ICOSLG	ICOSLG,DNMT3L	NA	NA	NA	NA	ICOSLG	3113	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr21	45720945	45721140	45721043	Y	NA	DNMT3L,PFKL,C21orf2	NA	NA	NA	NA	PFKL	3011	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr21	46097395	46097576	46097539	Y	KRTAP10-7,KRTAP10-12	NA	NA	NA	NA	NA	KRTAP10-9	52355	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.444368867827792
chr21	46294509	46294819	46294590	Y	ITGB2	PTTG1IP	NA	NA	NA	NA	PTTG1IP	2757	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr21	46298625	46298957	46298811	Y	ITGB2	PTTG1IP	PTTG1IP	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PTTG1IP	6873	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	46302248	46302499	46302417	Y	ITGB2	PTTG1IP,ITGB2	PTTG1IP	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PTTG1IP	10496	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr21	46302536	46302756	46302646	Y	NA	PTTG1IP,ITGB2	PTTG1IP	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTTG1IP	10784	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr21	46387960	46388437	46388173	Y	POFUT2,ITGB2	ITGB2,FAM207A,LINC00162	NA	NA	NA	NA	FAM207A	30035	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.571259592420701
chr21	46461202	46461645	46461341	Y	ITGB2,ADARB1	LINC00162,ADARB1	ADARB1,SSR4P1	K562	ChIA-PET	22265404	ADARB1	30123	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.03137752832315
chr21	46470710	46471152	46470922	Y	NA	LINC00162,ADARB1	NA	NA	NA	NA	ADARB1	20616	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.687424210026941
chr21	46488937	46489238	46489088	Y	NA	ADARB1	NA	NA	NA	NA	ADARB1	2530	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	46495480	46495526	46495490	Y	KRTAP10-12,ADARB1	ADARB1	NA	NA	NA	NA	ADARB1	3712	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.284917310251198
chr21	46496242	46496452	46496442	Y	NA	ADARB1	NA	NA	NA	NA	ADARB1	4474	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.38832130284908
chr21	46501791	46502122	46501857	Y	NA	ADARB1	NA	NA	NA	NA	ADARB1	10023	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr21	46549530	46549961	46549631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADARB1	57762	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr21	46552843	46553033	46552936	Y	KRTAP10-11,KRTAP12-2,KRTAP12-1,ITGB2	NA	NA	NA	NA	NA	ADARB1	61075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr21	46737459	46737695	46737585	Y	COL18A1	POFUT2	COL18A1	MCF7	ChIA-PET	22265404	POFUT2	31646	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr21	46738832	46739011	46738964	Y	COL18A1	POFUT2	COL18A1	MCF7	ChIA-PET	22265404	POFUT2	33019	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.0973889828612
chr21	46739517	46739788	46739671	Y	NA	POFUT2	COL18A1	MCF7	ChIA-PET	22265404	POFUT2	33704	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.952123022211265
chr21	46740711	46740979	46740801	Y	NA	POFUT2	COL18A1	MCF7	ChIA-PET	22265404	POFUT2	34898	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	46749941	46750271	46750188	Y	NA	POFUT2	COL18A1,LINC00315,LOC642852,POFUT2,COL18A1-AS1,LOC100129027,PCBP3,ADARB1,SLC19A1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	POFUT2	44128	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr21	46783934	46784395	46784118	Y	NA	NA	ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	POFUT2	78121	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	46836537	46836812	46836569	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC19A1	125513	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr21	47563985	47564239	47564071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSS	82499	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.194968765389612
chr21	47564330	47564867	47564460	Y	S100B,FTCD	NA	NA	NA	NA	NA	LSS	81871	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr21	47651317	47651563	47651562	Y	NA	LSS,MCM3AP-AS1	NA	NA	NA	NA	MCM3AP-AS1	4186	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr21	47724911	47725263	47725135	Y	PRMT2	MCM3AP,YBEY,C21orf58,PCNT	NA	NA	NA	NA	C21orf58	16526	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr21	47935050	47935239	47935141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2A	58238	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr21	47968526	47968894	47968542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT2	84185	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr22	17202718	17203118	17202890	Y	IL17RA,CECR1	NA	NA	NA	NA	NA	FABP5P11	128343	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	17306294	17306463	17306397	Y	IL17RA,CECR1	NA	NA	NA	NA	NA	FABP5P11	231919	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr22	17652206	17652871	17652785	Y	NA	CECR5-AS1,CECR5,AC005300.5	NA	NA	NA	NA	CECR5	8029	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.288915693369719
chr22	17697692	17697885	17697853	Y	BCL2L13,IL17RA,CECR1	AC005300.5	NA	NA	NA	NA	AC005300.5	25866	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	18254449	18254719	18254597	Y	NA	BID	NA	NA	NA	NA	BID	817	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	18372617	18372984	18372801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BID	117081	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	18506386	18506784	18506419	Y	MICAL3	MICAL3	NA	NA	NA	NA	MICAL3	1061	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr22	18916909	18917370	18917163	Y	MICAL3,TUBA8,DGCR6,PRODH,PRODH	DGCR6,PRODH,DGCR5	NA	NA	NA	NA	PRODH	4696	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	18919384	18919770	18919551	Y	PRODH,PRODH	DGCR6,PRODH,DGCR5	NA	NA	NA	NA	PRODH	2296	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	19043288	19043502	19043327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGCR2	64465	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	5.45673000683738
chr22	19331396	19331535	19331466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLTCL1	54157	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	19337870	19338225	19337898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLTCL1	60631	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	19378121	19378382	19378253	Y	NA	MRPL40	NA	NA	NA	NA	MRPL40	39043	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr22	19410653	19410889	19410838	Y	HIRA	MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39	NA	NA	NA	NA	MRPL40	6536	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr22	19447944	19448297	19448121	Y	NA	MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39,UFD1L,CDC45	NA	NA	NA	NA	C22orf39	14189	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	19866426	19867011	19866578	Y	ZDHHC8,DGCR6L,COMT	C22orf29,GNB1L	GNB1L	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNB1L	25964	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr22	19869401	19869687	19869604	Y	NA	C22orf29,GNB1L	NA	NA	NA	NA	GNB1L	28939	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr22	19930770	19931097	19930953	Y	ZDHHC8,COMT	COMT,TXNRD2	NA	NA	NA	NA	TXNRD2	3429	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr22	19946096	19946477	19946360	Y	NA	COMT,TXNRD2	NA	NA	NA	NA	TXNRD2	18755	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	20068627	20068902	20068750	Y	COMT,DGCR8	DGCR8,RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8	NA	NA	NA	NA	DGCR8	2872	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.145265960649932
chr22	20258205	20258516	20258358	Y	NA	RTN4R,XXbac-B444P24.10,DGCR6L	NA	NA	NA	NA	RTN4R	10253	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr22	20287043	20287283	20287165	Y	NA	RTN4R,XXbac-B444P24.10,DGCR6L	NA	NA	NA	NA	XXbac-B444P24.10	1760	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.390320494408341
chr22	20848736	20849050	20848893	Y	NA	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	536	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	20850844	20851071	20850923	Y	PI4KA,AIFM3,AIFM3	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	2644	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr22	20885626	20885829	20885752	Y	NA	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	37426	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr22	20923375	20923909	20923414	Y	THAP7,MED15	NA	NA	NA	NA	NA	MED15	75175	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	21221716	21221966	21221814	Y	NA	SNAP29,PI4KA,CRKL	NA	NA	NA	NA	PI4KA	10011	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	21285744	21286048	21285865	Y	NA	CRKL,LZTR1	NA	NA	NA	NA	CRKL	16030	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	22010846	22011267	22010978	Y	YPEL1	YDJC,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	6287	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	22186398	22186549	22186531	Y	NA	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	33421	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	22478098	22478432	22478244	Y	CCDC116,YPEL1,ZNF280B	NA	NA	NA	NA	NA	IGLV6-57	69681	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	23415058	23415342	23415197	Y	NA	GNAZ	NA	NA	NA	NA	GNAZ	4518	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	23863943	23864332	23864232	Y	GNAZ,RTDR1,BCR	NA	ZDHHC8P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC8P1	121030	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.494071672567473
chr22	24153288	24153648	24153392	Y	RGL4,LOC391322	CHCHD10,SMARCB1,DERL3,SLC2A11	DERL3	IMR90	Hi-C	24141950	DERL3	25667	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	24255997	24256450	24256302	Y	C22orf43,CABIN1,CABIN1	MIF	NA	NA	NA	NA	MIF	21806	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.13563553142384
chr22	24603797	24604355	24604162	Y	GGT1,ADORA2A	SUSD2	NA	NA	NA	NA	SUSD2	28570	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	24752898	24753006	24752951	Y	UPB1	NA	NA	NA	NA	NA	SPECC1L-ADORA2A	88032	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr22	24795656	24796304	24795694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPECC1L-ADORA2A	130790	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	24796747	24798216	24797446	Y	GGT1	NA	NA	NA	NA	NA	SPECC1L-ADORA2A	131881	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	24878539	24879065	24878732	Y	GGT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNRPD3	70406	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	25348731	25349104	25348989	Y	NA	NA	SGSM1,KIAA1671,TMEM211	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORD56	53550	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr22	25349333	25349980	25349695	Y	NA	NA	SGSM1,KIAA1671,TMEM211	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORD56	54152	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr22	25354945	25355076	25355012	Y	NA	NA	KIAA1671,SGSM1,TMEM211	IMR90	Hi-C	24141950	SNORD56	59764	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	25365957	25366157	25366057	Y	NA	NA	KIAA1671	IMR90	Hi-C	24141950	SNORD56	70776	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	25373601	25373706	25373654	Y	NA	NA	KIAA1671	IMR90	Hi-C	24141950	SNORD56	78420	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.229755824012263
chr22	25381840	25382180	25381995	Y	NA	NA	KIAA1671	IMR90	Hi-C	24141950	SNORD56	86659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr22	25390259	25390306	25390285	Y	NA	NA	KIAA1671	MCF7	ChIA-PET	22265404	SNORD56	95078	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	25458331	25458606	25458444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD56	163150	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	25883503	25883619	25883561	Y	NA	CRYBB2P1	MYO18B,LRP5L,CRYBB2P1,ADRBK2,SEZ6L	IMR90	Hi-C	24141950	CRYBB2P1	41431	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	26150935	26151135	26151006	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRYBB2P1	308863	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr22	27041081	27041748	27041447	Y	SEZ6L,ASPHD2	CTA-211A9.5	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-211A9.5	24982	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	27131212	27131584	27131334	Y	NA	NA	MN1,PITPNB,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-211A9.5	64482	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr22	28065247	28065726	28065530	Y	PITPNB,MN1	NA	MIAT,MN1	IMR90	Hi-C	24141950	MN1	129760	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.988909272393177
chr22	28082615	28082869	28082755	Y	MN1	NA	MIAT,MN1	IMR90	Hi-C	24141950	MN1	112617	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.234484356321151
chr22	28114157	28114741	28114406	Y	PITPNB,MN1	NA	NA	NA	NA	NA	MN1	80745	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.297486679247717
chr22	28115717	28115905	28115775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MN1	79581	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.34155743787983
chr22	28122669	28123242	28122949	Y	PITPNB,MN1	NA	NA	NA	NA	NA	MN1	72244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.257971088316178
chr22	28261904	28262359	28262203	Y	PITPNB,MN1	NA	NA	NA	NA	NA	TTC28-AS1	51005	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	28304832	28305219	28305193	Y	NA	TTC28-AS1,PITPNB	NA	NA	NA	NA	TTC28-AS1	8145	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr22	28314180	28314595	28314448	Y	PITPNB	TTC28-AS1,PITPNB	NA	NA	NA	NA	PITPNB	58	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr22	28549378	28549438	28549411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNB	235256	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	28837872	28838192	28838073	Y	TTC28	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	297827	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18093909801236
chr22	28879777	28880035	28879909	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	255984	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr22	28956104	28956479	28956470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	179540	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr22	29132423	29132599	29132510	Y	NA	HSCB,CHEK2,CCDC117	NA	NA	NA	NA	HSCB	3420	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	29165082	29165344	29165211	Y	C22orf31	HSCB,CHEK2,CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6	NA	NA	NA	NA	CCDC117	1318	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr22	29319930	29320200	29320120	Y	NA	ZNRF3	NA	NA	NA	NA	ZNRF3	42350	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	29621754	29622103	29621915	Y	NA	EMID1,EWSR1,RHBDD3	NA	NA	NA	NA	EMID1	21914	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	29781967	29782037	29782002	Y	NA	AP1B1	NA	NA	NA	NA	AP1B1	35131	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	30279863	30280214	30279898	Y	NA	ASCC2,MTMR3	NA	NA	NA	NA	MTMR3	2719	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr22	30591785	30593544	30592394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATSL3	90072	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr22	30598549	30598642	30598596	Y	LIF	NA	HORMAD2,LIF,GATSL3	IMR90	Hi-C	24141950	GATSL3	84974	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr22	30604572	30605275	30604996	Y	NA	NA	HORMAD2,LIF,GATSL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GATSL3	78341	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr22	30649196	30649657	30649496	Y	MTMR3,TBC1D10A,SF3A1,DUSP18,LIF,OSM	GATSL3	NA	NA	NA	NA	GATSL3	33959	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr22	30650339	30650644	30650477	Y	LIF	GATSL3	NA	NA	NA	NA	GATSL3	32972	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	30651841	30652045	30651989	Y	RNF215	GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	GATSL3	31571	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr22	30653574	30654311	30654075	Y	RNF215,GAL3ST1	GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	GATSL3	29305	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.00601546608131
chr22	30666798	30667328	30667040	Y	MTMR3,TBC1D10A,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM	GATSL3	NA	NA	NA	NA	GATSL3	16288	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	30808332	30808723	30808528	Y	NA	SEC14L2,RNF215,MTFP1	NA	NA	NA	NA	RNF215	7037	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	31005316	31005631	31005442	Y	SMTN,OSM,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1,DUSP18,SLC35E4	RP1-56J10.8,PES1,SLC35E4,CTA-963H5.5	NA	NA	NA	NA	PES1	4246	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr22	31219107	31219239	31219180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBP2	131338	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.72492317434032
chr22	31226011	31226350	31226247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORC2	135934	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.40907869409448
chr22	31229455	31229575	31229536	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORC2	132709	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.85946302800358
chr22	31278490	31278624	31278556	Y	SEC14L4	NA	NA	NA	NA	NA	MORC2	83660	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr22	31294163	31294373	31294268	Y	OSBP2	NA	MORC2,MORC2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	MORC2	67911	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	31298089	31298190	31298144	Y	NA	NA	MORC2,MORC2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	MORC2	64094	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	31609195	31609531	31609513	Y	RNF185,LIMK2	LIMK2	NA	NA	NA	NA	LIMK2	2970	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr22	31629034	31629491	31629163	Y	SMTN,RNF185,LIMK2	LIMK2	NA	NA	NA	NA	LIMK2	22809	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr22	31639418	31639541	31639442	Y	NA	LIMK2,PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	LIMK2	33193	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.229755824012263
chr22	31639861	31640267	31640177	Y	NA	LIMK2,PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	LIMK2	33636	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr22	31689398	31689773	31689585	Y	SMTN,DEPDC5	PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	PIK3IP1	2878	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	31692333	31692587	31692466	Y	SMTN,RNF185	PIK3IP1,PATZ1,AC005003.1	NA	NA	NA	NA	PIK3IP1	5813	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr22	31934846	31935146	31934960	Y	NA	EIF4ENIF1	NA	NA	NA	NA	EIF4ENIF1	44752	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	32048774	32049039	32049031	Y	NA	PISD	SFI1,EIF4ENIF1,DEPDC5,YWHAH,C22orf24,C22orf28,LOC339666,RFPL3-AS1,PRR14L	GM12878,K562,IMR90	5C,Hi-C	22955621,24141950	PISD	7379	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr22	32446579	32447120	32446852	Y	NA	SC22CB-1E7.1	NA	NA	NA	NA	SC22CB-1E7.1	13102	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	32737226	32737568	32737481	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	131095	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	32806612	32806674	32806643	Y	RFPL2,RFPL3,TIMP3	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	61989	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr22	32928366	32928835	32928615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	59703	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr22	33199078	33199894	33199157	Y	NA	TIMP3	NA	NA	NA	NA	TIMP3	3391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr22	33291094	33291121	33291108	Y	TIMP3	Z98256.1	NA	NA	NA	NA	Z98256.1	36674	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr22	34249918	34249944	34249938	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA76	151012	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr22	35767811	35768194	35767985	Y	APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1	HMOX1,MCM5	NA	NA	NA	NA	HMOX1	6160	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr22	35772921	35773272	35773050	Y	APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1	HMOX1,MCM5	TOM1,MCM5,HMOX1,RASD2,MB,APOL6,APOL5,RBFOX2	IMR90	Hi-C	24141950	HMOX1	1082	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr22	35842495	35842590	35842543	Y	NA	MCM5	NA	NA	NA	NA	MCM5	48439	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	35983528	35983815	35983759	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APOL6	58627	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	8.262701897609
chr22	35998340	35998679	35998418	Y	TOM1,TOM1,HMOX1,APOL6,MB,MB	APOL6	NA	NA	NA	NA	APOL6	43763	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.224297142513009
chr22	36149671	36149849	36149827	Y	NA	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	APOL6	107229	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr22	36172767	36172943	36172931	Y	MB,MB,RBFOX2,RBFOX2	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	APOL6	130325	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	36299462	36299943	36299718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	122530	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr22	36310688	36310985	36310744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	111488	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.265428961374692
chr22	36325608	36325959	36325784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	96514	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr22	36343697	36344006	36343862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	78467	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr22	36727482	36728450	36727733	Y	APOL3	NA	NA	NA	NA	NA	MYH9	53613	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr22	36858236	36858440	36858372	Y	MYH9	RP5-1119A7.14,TXN2,FOXRED2	NA	NA	NA	NA	RP5-1119A7.14	9245	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr22	37483105	37483447	37483337	Y	IL2RB	KCTD17	NA	NA	NA	NA	KCTD17	37326	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	37490501	37490532	37490517	Y	NA	KCTD17	NA	NA	NA	NA	KCTD17	44722	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	37582993	37583226	37583109	Y	NA	RP1-151B14.6,IL2RB,C1QTNF6	NA	NA	NA	NA	C1QTNF6	10199	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.301832247927488
chr22	37585028	37585323	37585113	Y	NA	RP1-151B14.6,IL2RB,C1QTNF6	NA	NA	NA	NA	C1QTNF6	8102	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr22	37624836	37624960	37624904	Y	SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,IL2RB,RAC2,CYTH4	C1QTNF6,RAC2	NA	NA	NA	NA	RAC2	13528	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	37702859	37703284	37702965	Y	SH3BP1,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4	NA	NA	NA	NA	NA	RAC2	64371	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	37703985	37704250	37704217	Y	SH3BP1,MFNG,MFNG,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,IL2RB,RAC2,CYTH4	NA	NA	NA	NA	NA	RAC2	65497	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	37937864	37938255	37937972	Y	SH3BP1,LGALS2,GGA1,GGA1	CARD10,CDC42EP1	CARD10,MFNG,LGALS2,PDXP,TRIOBP,ELFN2,CDC42EP1,GGA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC42EP1	16199	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	37942064	37942352	37942192	Y	KCTD17,TRIOBP,POLR2F,MICALL1,LGALS1,ANKRD54,CARD10,CDC42EP1	CARD10,CDC42EP1	ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC42EP1	12102	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.421995248652249
chr22	37942978	37943343	37943114	Y	NA	CARD10,CDC42EP1	ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC42EP1	11111	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.139807279150677
chr22	37948648	37948841	37948736	Y	NA	CARD10,CDC42EP1	NA	NA	NA	NA	CDC42EP1	5613	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	37957606	37958042	37957847	Y	NA	CARD10,CDC42EP1,GGA1	NA	NA	NA	NA	CDC42EP1	3152	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.225913370443154
chr22	38003646	38003923	38003656	Y	GGA1,GGA1	CDC42EP1,GGA1,SH3BP1,PDXP	NA	NA	NA	NA	GGA1	1165	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr22	38023382	38023702	38023683	Y	RAC2,CYTH4,GGA1,GGA1,NOL12	GGA1,SH3BP1,PDXP,LGALS1	NA	NA	NA	NA	SH3BP1	4959	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	38069633	38069980	38069807	Y	RAC2,CYTH4,GGA1,SH3BP1	SH3BP1,PDXP,LGALS1,NOL12,TRIOBP	NA	NA	NA	NA	LGALS1	18	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	38139873	38139989	38139967	Y	NA	TRIOBP	H1F0,GCAT	IMR90	Hi-C	24141950	TRIOBP	48862	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	38142899	38142964	38142949	Y	CDC42EP1,LGALS1,TRIOBP,POLR2F,GCAT,ANKRD54	NA	NA	NA	NA	NA	TRIOBP	51888	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.164024160336071
chr22	38148564	38148886	38148725	Y	CDC42EP1	NA	NA	NA	NA	NA	H1F0	50228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr22	38351215	38351232	38351224	Y	NA	POLR2F,C22orf23,SOX10	NA	NA	NA	NA	C22orf23	3539	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	38572177	38572681	38572373	Y	DDX17,EIF3L,PLA2G6,PLA2G6,MAFF,MAFF	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	MAFF	23208	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr22	38599886	38600218	38600032	Y	NA	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	189	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr22	38614588	38614867	38614785	Y	MICALL1,TMEM184B,TMEM184B,CSNK1E,MAFF,MAFF	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	14891	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.684694869277314
chr22	38711439	38711868	38711815	Y	SUN2,SUN2,JOSD1,GTPBP1,PLA2G6,PLA2G6	TMEM184B	NA	NA	NA	NA	TMEM184B	44399	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr22	38750839	38750902	38750852	Y	NA	CSNK1E	NA	NA	NA	NA	CSNK1E	41625	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	39462078	39462341	39462224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APOBEC3D	53710	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	39540965	39541288	39541019	Y	NA	CBX7	NA	NA	NA	NA	CBX7	5391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	39541576	39542088	39541730	Y	JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7	CBX7	NA	NA	NA	NA	CBX7	4591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.204425830007387
chr22	39570711	39571096	39570941	Y	JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,PDGFB,APOBEC3G,APOBEC3H	CBX7	PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CBX7	24032	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr22	39608827	39609203	39608881	Y	NA	PDGFB	NA	NA	NA	NA	PDGFB	29553	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	39649567	39649736	39649595	Y	SUN2,APOBEC3A,PDGFB	PDGFB	CBX7,RNU86,RPL3,SNORD83A,PDGFB	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PDGFB	10811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.1996972976985
chr22	39650923	39651173	39651026	Y	ATF4,SUN2,SUN2,APOBEC3A	PDGFB	CBX7,RNU86,RPL3,SNORD83A,PDGFB	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PDGFB	12167	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	39679510	39679847	39679626	Y	NA	PDGFB,RPL3	CBX7,PDGFB,SNORD83A,SNORD83B,RNU86,RPL3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL3	34547	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr22	39704707	39705214	39704970	Y	ATF4,APOBEC3A	RPL3,SYNGR1	NA	NA	NA	NA	RPL3	9180	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr22	40384673	40384943	40384833	Y	FAM83F	NA	NA	NA	NA	NA	TNRC6B	53878	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	40589903	40590338	40589971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P52	88833	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	40686331	40686363	40686350	Y	MKL1,GRAP2,TNRC6B	NA	NA	NA	NA	NA	ADSL	54144	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	40885973	40886127	40886071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSM3	121378	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	40908486	40908830	40908701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL1	121876	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr22	40958851	40958976	40958969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL1	71730	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr22	40982487	40982801	40982645	Y	NA	MKL1	NA	NA	NA	NA	MKL1	47905	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	41047729	41047883	41047796	Y	NA	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17023	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.816158196629698
chr22	41048065	41048352	41048232	Y	EP300,MKL1	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.326049129112881
chr22	41417973	41418366	41418067	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39690	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.63772140528726
chr22	41418482	41418837	41418726	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39219	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.262699620625065
chr22	41460471	41460696	41460583	Y	NA	RP11-12M9.3,RP11-12M9.4,EP300	RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-12M9.3	2415	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr22	41684313	41684541	41684479	Y	PPPDE2,RANGAP1	RANGAP1,ZC3H7B	NA	NA	NA	NA	RANGAP1	4058	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.250513215257663
chr22	41776948	41777130	41776981	Y	NA	TEF	NA	NA	NA	NA	TEF	15611	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	41798116	41798195	41798164	Y	CHADL,TOB2,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TEF	36779	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.75513763020349
chr22	41839332	41839605	41839469	Y	TOB2	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	1422	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	41840300	41840792	41840564	Y	NA	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	235	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	41844337	41844774	41844650	Y	SHISA8,TEF,TEF,TOB2	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	3310	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr22	42008568	42008780	42008674	Y	NA	PMM1,XRCC6	NA	NA	NA	NA	XRCC6	6343	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	42062739	42062953	42062873	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19990	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.501026430515326
chr22	42063539	42063782	42063553	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19161	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.365947683673536
chr22	42327988	42328313	42328152	Y	NA	CENPM,SEPT3	TNFRSF13C	MCF7	ChIA-PET	22265404	CENPM	12855	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	42339043	42339310	42339264	Y	NA	CENPM,SEPT3	NA	NA	NA	NA	CENPM	1858	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr22	42345988	42346366	42346055	Y	NA	CENPM,SEPT3,WBP2NL	NA	NA	NA	NA	CENPM	4820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	42485778	42486189	42485966	Y	CCDC134,CENPM,NFAM1,C22orf32	NAGA,FAM109B,NDUFA6,OLA1P1	NA	NA	NA	NA	NDUFA6	819	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr22	42696920	42697075	42696965	Y	NA	NA	TCF20,NFAM1	IMR90	Hi-C	24141950	Z83851.1	66167	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	42772096	42772265	42772163	Y	ARFGAP3,NAGA,NFAM1	Z83851.1	NA	NA	NA	NA	Z83851.1	8854	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	43076677	43076928	43076817	Y	NFAM1,ARFGAP3	CYB5R3,A4GALT	NA	NA	NA	NA	CYB5R3	33103	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr22	43084467	43084751	43084635	Y	TSPO,MCAT,CYB5R3,A4GALT	CYB5R3,A4GALT	NA	NA	NA	NA	A4GALT	30553	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr22	43116155	43116318	43116237	Y	CYB5R3,A4GALT	A4GALT	NA	NA	NA	NA	A4GALT	851	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr22	43144166	43144283	43144173	Y	NA	A4GALT	CYB5R3,ARFGAP3,PACSIN2,A4GALT	IMR90	Hi-C	24141950	A4GALT	28862	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr22	43333511	43333722	43333661	Y	POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2,PACSIN2	NA	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	75429	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	43387243	43387305	43387274	Y	PACSIN2,PACSIN2	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	21846	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	43400219	43400728	43400510	Y	NA	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	8423	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	43421059	43421209	43421134	Y	NA	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	11908	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.145265960649932
chr22	43550927	43551235	43551079	Y	ARFGAP3	BIK,MCAT,TSPO,TTLL12	NA	NA	NA	NA	TSPO	5407	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	44541394	44541995	44541679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARVB	148303	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr22	44731310	44731638	44731630	Y	NA	KIAA1644	NA	NA	NA	NA	KIAA1644	24579	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	44756999	44757252	44757125	Y	NA	NA	KIAA1644,PARVB,LINC00207,SAMM50,LINC00229	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1644	50268	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.421109169912471
chr22	44757371	44757617	44757493	Y	NA	NA	KIAA1644,PARVB,LINC00207,SAMM50,LINC00229	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1644	50640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.426723780961136
chr22	44759236	44759683	44759589	Y	NA	NA	KIAA1644,PARVB,LINC00207,SAMM50,LINC00229	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1644	52505	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.659591909352142
chr22	44947082	44947372	44947286	Y	PARVG,PARVG	NA	PARVB,KIAA1644,SAMM50,LINC00229	IMR90	Hi-C	24141950	LDOC1L	54904	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr22	45106642	45106985	45106689	Y	NA	PRR5,PRR5-ARHGAP8,ARHGAP8	NA	NA	NA	NA	ARHGAP8	10287	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	45501114	45501367	45501144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	56295	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr22	45543738	45543876	45543815	Y	PHF21B,NUP50,NUP50	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	13786	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	45554826	45555155	45554995	Y	KIAA0930	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	2507	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr22	45642150	45642482	45642292	Y	NA	KIAA0930	LOC100506714,NUP50,KIAA0930,UPK3A,FBLN1,SMC1B	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0930	7500	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr22	45879926	45880282	45880095	Y	NA	FBLN1	FBLN1,NUP50,UPK3A,FAM118A,SMC1B	IMR90	Hi-C	24141950	FBLN1	15836	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr22	45944996	45945587	45945178	Y	NA	FBLN1	NA	NA	NA	NA	FBLN1	48878	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	46004834	46005031	46004922	Y	C22orf26	CTA-941F9.9	NA	NA	NA	NA	CTA-941F9.9	5333	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	46041491	46041960	46041628	Y	NA	CTA-941F9.9,ATXN10	ATXN10,WNT7B,FAM118A,SMC1B,FBLN1,LOC730668,LOC100271722,MIRLET7BHG	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATXN10	23718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr22	46325366	46325760	46325504	Y	NA	WI2-85898F10.1,WNT7B	NA	NA	NA	NA	WI2-85898F10.1	43738	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr22	46330758	46331082	46331012	Y	NA	WI2-85898F10.1,WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	39927	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.325318979922515
chr22	46374166	46374684	46374539	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	3157	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.260700429065805
chr22	46374858	46375446	46375153	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	3849	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.270887642873947
chr22	46432742	46433091	46432929	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.3	14494	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	46441533	46441708	46441621	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.3	5877	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	46462776	46462894	46462836	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	877	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.272886834433207
chr22	46464940	46465203	46464976	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	1169	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.363721458034571
chr22	46467914	46468476	46468052	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	4143	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.422725397842615
chr22	46470082	46470656	46470309	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	6311	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr22	46472616	46472825	46472697	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	8845	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.311289312545263
chr22	46474643	46475112	46474791	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	10872	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.525016277621014
chr22	46480881	46481264	46481017	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	17110	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.00839762126968
chr22	46495432	46495673	46495573	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B,PPARA	NA	NA	NA	NA	MIR4763	11773	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.159295628027183
chr22	46771050	46771392	46771204	Y	NA	TRMU	NA	NA	NA	NA	TRMU	46278	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	46928379	46928595	46928487	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	NA	NA	NA	NA	CELSR1	2472	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	46934347	46934575	46934459	Y	CELSR1	CELSR1,GRAMD4	NA	NA	NA	NA	CELSR1	3280	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	46934777	46935027	46934877	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	NA	NA	NA	NA	CELSR1	3710	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr22	46935060	46935431	46935290	Y	CELSR1	CELSR1,GRAMD4	NA	NA	NA	NA	CELSR1	3993	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	46957537	46957704	46957620	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	TRMU,CELSR1,GRAMD4	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	12205	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.462396918323565
chr22	46970983	46971382	46971054	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	TRMU,GRAMD4,CELSR1	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	1074	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr22	46973801	46973805	46973803	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	TRMU,GRAMD4,CELSR1	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	3892	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	46982383	46982526	46982455	Y	NA	GRAMD4	TRMU,GRAMD4	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	12474	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	46988577	46988710	46988625	Y	NA	GRAMD4	GRAMD4,CELSR1	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	18668	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	47128172	47128501	47128260	Y	NA	CERK,TBC1D22A	NA	NA	NA	NA	CERK	3657	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	47134957	47135355	47135288	Y	NA	CERK,TBC1D22A	NA	NA	NA	NA	CERK	2799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.225913370443154
chr22	47150443	47150659	47150583	Y	CERK,TBC1D22A	CERK,TBC1D22A	CERK	MCF7	ChIA-PET	22265404	TBC1D22A	5859	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr22	47250044	47250415	47250236	Y	CERK,TBC1D22A	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	93526	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	47363549	47363576	47363563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	207031	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	47525665	47525872	47525801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	369147	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr22	50232497	50232886	50232656	Y	TUBGCP6,BRD1,ZBED4,CRELD2	BRD1,ZBED4	ZBED4	K562	ChIA-PET	22265404	ZBED4	12604	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	50248429	50248807	50248623	Y	TUBGCP6,TRABD,SELO,PIM3,MOV10L1,HDAC10,BRD1,ZBED4	BRD1,ZBED4	NA	NA	NA	NA	ZBED4	2939	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	50324610	50324932	50324739	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	14504	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	50327213	50327243	50327226	Y	PIM3	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	17107	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr22	50327730	50328489	50328002	Y	TRABD,SELO,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	17624	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.4689512775834
chr22	50329443	50330313	50330025	Y	TUBGCP6,TRABD,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	19337	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.312402425364746
chr22	50330725	50331030	50330945	Y	MAPK12,MAPK11	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	20619	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.155836138087189
chr22	50341970	50342055	50341995	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	10106	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.185511700771837
chr22	50342658	50342932	50342773	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	PLXNB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIM3	9229	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.993984990263317
chr22	50344780	50345228	50344944	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	PLXNB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIM3	6933	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.639720596846521
chr22	50345940	50346570	50346146	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	PLXNB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIM3	5591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr22	50364171	50364294	50364188	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12010	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr22	50364350	50364715	50364589	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12189	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.00617139563072
chr22	50625511	50626004	50625814	Y	BRD1,ZBED4,PIM3,SCO2,SBF1,PPP6R2,ODF3B,NCAPH2,CHKB,ARSA,PANX2,TUBGCP6,SELO,HDAC10	PANX2,TRABD,SELO	NA	NA	NA	NA	TRABD	3167	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	50710173	50710402	50710310	Y	MLC1,MOV10L1,MOV10L1,MOV10L1,SHANK3,SBF1,PPP6R2,MAPK8IP2,MAPK8IP2,FAM116B,ACR,MAPK11	TUBGCP6,HDAC10,MAPK12,MAPK11,PLXNB2	NA	NA	NA	NA	MAPK11	2977	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	50738042	50738272	50738161	Y	NA	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	5784	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18478155158147
chr22	50741057	50741253	50741136	Y	PIM3,TRABD	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	2803	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr22	50741799	50742849	50742615	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	1207	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr22	50742925	50743370	50743124	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	686	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr22	50743436	50743850	50743726	Y	PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	206	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr22	50743986	50744741	50744427	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.399968815037955
chr22	50744748	50744986	50744827	Y	PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	692	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr22	50747003	50747284	50747232	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	2947	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr22	50784754	50785397	50785059	Y	PPP6R2	PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PPP6R2	5021	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr22	50977955	50978429	50978214	Y	PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B	LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,CTA-384D8.31,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	CTA-384D8.31	4415	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.63956466729711
chr22	51138872	51139009	51138949	Y	SELO	NA	NA	NA	NA	NA	RPL23AP82	54367	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	742885	743118	742977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC090044.1	166971	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.424880518951286
chr3	3177157	3177268	3177188	Y	CRBN	TRNT1,CRBN	NA	NA	NA	NA	TRNT1	10557	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	3854493	3854653	3854575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETMAR	488335	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	4392615	4392774	4392664	Y	ITPR1	SETMAR	NA	NA	NA	NA	SETMAR	49627	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr3	4428359	4428568	4428464	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUMF1	78397	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	4561829	4562207	4561897	Y	BHLHE40,ITPR1	ITPR1-AS1,ITPR1	NA	NA	NA	NA	ITPR1	28797	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	4571700	4571916	4571754	Y	BHLHE40,ITPR1	ITPR1-AS1,ITPR1	NA	NA	NA	NA	ITPR1	38668	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	4575529	4575739	4575617	Y	NA	ITPR1-AS1,ITPR1	NA	NA	NA	NA	ITPR1	42497	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	4781579	4781854	4781808	Y	EDEM1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	236947	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr3	4782990	4783362	4783182	Y	ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	235439	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	4783422	4783695	4783523	Y	EDEM1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	235106	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	4801058	4801218	4801184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	217583	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	4867902	4868594	4868233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	150207	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	4871506	4871670	4871602	Y	ITPR1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	147131	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.196967956948873
chr3	4881719	4881745	4881731	Y	ITPR1	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	137056	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.218455497384639
chr3	4885679	4886087	4885777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	132714	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr3	4891899	4892323	4892162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	126478	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	4909917	4910799	4910503	Y	ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	108002	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr3	5027453	5027635	5027574	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	7807	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	5028057	5028369	5028268	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	8411	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	5028534	5029013	5028702	Y	ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	8888	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.221567801763382
chr3	5036570	5037120	5036867	Y	NA	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	16924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	5052861	5053708	5053449	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	BHLHE40-AS1	33215	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	5054958	5055470	5055112	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	BHLHE40-AS1	35312	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr3	5058332	5058543	5058409	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BHLHE40-AS1	38686	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr3	5059566	5059965	5059743	Y	ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	39920	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.234484356321151
chr3	5063521	5063694	5063575	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	43875	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr3	5065036	5065378	5065161	Y	BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	45390	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.358262776535316
chr3	5067974	5068590	5068209	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	48328	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.216456305825379
chr3	5182623	5182897	5182737	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	ARL8B,AC026202.3,EDEM1	EDEM1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL8B	20718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	5237403	5237551	5237430	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	AC026202.3,EDEM1	NA	NA	NA	NA	EDEM1	10072	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	6573697	6574039	6573711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM1	1346366	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.921178417157725
chr3	6741976	6742157	6742067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM1	1514645	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr3	8924124	8924195	8924160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD18	79262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr3	9452001	9452408	9452073	Y	MTMR14,SETD5	THUMPD3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5-AS1	13738	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	9721492	9721576	9721535	Y	IL17RC,IL17RC,CIDEC,CIDEC	MTMR14,BRPF1	NA	NA	NA	NA	MTMR14	32375	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr3	9926228	9926446	9926367	Y	LOC401052,ARPC4,TADA3,RPUSD3,CIDEC,CIDEC,CIDEC,JAGN1,IL17RE,IL17RE,IL17RC,IL17RC	RPUSD3,JAGN1,IL17RE,IL17RC,CRELD1	IL17RE,IL17RC,JAGN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	JAGN1	3792	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr3	10202652	10202802	10202719	Y	TATDN2,VHL,IRAK2	BRK1,VHL,IRAK2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	1747	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr3	10215234	10216150	10215734	Y	NA	VHL,IRAK2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	10685	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	10228924	10229327	10229283	Y	VHL,IRAK2,TATDN2	VHL,IRAK2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	24375	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	10231143	10231913	10231419	Y	ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	26594	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	10233695	10234220	10233931	Y	VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	29146	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr3	10236121	10236711	10236339	Y	NA	IRAK2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	31572	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	10238203	10238635	10238546	Y	ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2,TATDN2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	33654	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr3	10240437	10240684	10240523	Y	ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2,TATDN2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	35888	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	10240691	10241307	10240999	Y	ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2,TATDN2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	36142	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr3	10247090	10247317	10247193	Y	VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2,TATDN2	NA	NA	NA	NA	TATDN2	40390	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	10276652	10276834	10276729	Y	NA	TATDN2	NA	NA	NA	NA	TATDN2	10873	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr3	11187629	11187920	11187792	Y	HRH1	HRH1	NA	NA	NA	NA	HRH1	10850	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	11197111	11197379	11197271	Y	VGLL4,SLC6A11,SLC6A1,HRH1	HRH1	NA	NA	NA	NA	HRH1	20332	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr3	11261398	11261658	11261529	Y	HRH1	NA	NA	NA	NA	NA	ATG7	50337	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.194968765389612
chr3	11279893	11280094	11280011	Y	NA	ATG7	NA	NA	NA	NA	ATG7	31901	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	11314967	11316155	11315793	Y	HRH1,ATG7	ATG7	NA	NA	NA	NA	ATG7	2972	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	11316376	11316801	11316733	Y	NA	ATG7	NA	NA	NA	NA	ATG7	4381	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr3	11591830	11592141	11591986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	168079	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	11688028	11688035	11688032	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	72185	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	12234951	12235397	12235194	Y	RAF1,PPARG,PPARG	TIMP4	NA	NA	NA	NA	TIMP4	36100	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr3	12235782	12236012	12235937	Y	RAF1,PPARG,PPARG,PPARG	TIMP4	NA	NA	NA	NA	TIMP4	36931	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr3	12350153	12350305	12350183	Y	NA	PPARG	NA	NA	NA	NA	PPARG	23286	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr3	12369841	12370512	12370195	Y	PPARG,PPARG,PPARG	PPARG	NA	NA	NA	NA	PPARG	42974	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	12395386	12395555	12395486	Y	RAF1,PPARG,PPARG,PPARG	NA	NA	NA	NA	NA	PPARG	68519	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr3	12398616	12399008	12398699	Y	RAF1,PPARG,PPARG	NA	NA	NA	NA	NA	PPARG	71749	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	12512871	12513125	12512991	Y	PPARG,PPARG	TSEN2	PPARG,TSEN2,SYN2,TIMP4	IMR90	Hi-C	24141950	TSEN2	10806	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr3	13035460	13035932	13035883	Y	CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	76685	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr3	13040844	13041238	13041111	Y	RAF1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	71379	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	13452835	13453081	13452953	Y	IQSEC1,HDAC11,HDAC11	NUP210	NA	NA	NA	NA	NUP210	6728	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	13455554	13455885	13455702	Y	NUP210	NUP210	NA	NA	NA	NA	NUP210	3924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	13457131	13457321	13457226	Y	NUP210	NUP210	NA	NA	NA	NA	NUP210	2488	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	13460446	13460799	13460651	Y	NA	NUP210	NA	NA	NA	NA	NUP210	637	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr3	13493281	13493606	13493395	Y	NA	NUP210,HDAC11,HDAC11-AS1	IQSEC1,NUP210	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HDAC11	25618	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.10067510819288
chr3	13526767	13526807	13526787	Y	NA	HDAC11,HDAC11-AS1	NA	NA	NA	NA	HDAC11-AS1	7214	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr3	13549267	13549563	13549350	Y	NA	HDAC11,HDAC11-AS1	NA	NA	NA	NA	HDAC11-AS1	29714	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr3	13575229	13575656	13575462	Y	NA	NA	HDAC11,FBLN2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HDAC11-AS1	55676	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr3	13599112	13599483	13599298	Y	FBLN2	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC11-AS1	79559	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	13936849	13937176	13936976	Y	NA	NA	C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CHCHD4	227194	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr3	14167210	14167731	14167391	Y	TMEM43,XPC	CHCHD4,TMEM43,AC093495.4	NA	NA	NA	NA	TMEM43	2770	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.838531815805243
chr3	14246419	14246703	14246618	Y	NA	LSM3,XPC	NA	NA	NA	NA	XPC	28136	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.311672276174379
chr3	14444961	14445761	14445267	Y	C3orf19,SLC6A6	SLC6A6	NA	NA	NA	NA	SLC6A6	2885	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr3	14481755	14482066	14481803	Y	C3orf19,XPC,SLC6A6	SLC6A6	NA	NA	NA	NA	SLC6A6	39679	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	14483107	14483358	14483285	Y	C3orf19,SLC6A6	SLC6A6	NA	NA	NA	NA	SLC6A6	41031	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	14817078	14817479	14817226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf20	102472	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	15060728	15061023	15060876	Y	NR2C2	MRPS25	NA	NA	NA	NA	MRPS25	43819	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	15105615	15105982	15105798	Y	NA	MRPS25,ZFYVE20	NA	NA	NA	NA	MRPS25	773	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr3	15285479	15285699	15285585	Y	NR2C2,ZFYVE20,SH3BP5,CAPN7	CAPN7	NA	NA	NA	NA	CAPN7	39820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr3	15286616	15286745	15286681	Y	NR2C2,ZFYVE20,SH3BP5,EAF1,COLQ,CAPN7	CAPN7	NA	NA	NA	NA	CAPN7	40957	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr3	15334615	15334919	15334862	Y	NR2C2,SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,CAPN7	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	45956	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.224297142513009
chr3	15335582	15336799	15336677	Y	NR2C2,CAPN7,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	44076	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	15337572	15337812	15337795	Y	NA	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	43063	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	15338366	15338748	15338633	Y	NA	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	42127	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	15343024	15343227	15343058	Y	NA	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	37648	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	15453852	15454017	15453935	Y	NA	EAF1,METTL6	NA	NA	NA	NA	EAF1	12845	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	15672231	15672450	15672312	Y	NA	BTD,HACL1	NA	NA	NA	NA	HACL1	30893	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	15675662	15676068	15675826	Y	NA	BTD,HACL1	NA	NA	NA	NA	HACL1	34324	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.235214505511518
chr3	15678965	15679290	15679049	Y	NA	BTD,HACL1	NA	NA	NA	NA	HACL1	37627	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr3	15704167	15704382	15704274	Y	ANKRD28,CAPN7	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	62829	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr3	15712856	15713111	15712984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	71518	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	15780032	15780074	15780052	Y	SH3BP5,EAF1	NA	BTD	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD28	119204	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	15783171	15783247	15783208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD28	116031	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	15901875	15902313	15902310	Y	METTL6,ANKRD28	ANKRD28	NA	NA	NA	NA	ANKRD28	2597	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr3	16101834	16102183	16102049	Y	NA	NA	GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28	IMR90	Hi-C	24141950	DPH3	202296	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr3	16102393	16102705	16102619	Y	NA	NA	GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28	IMR90	Hi-C	24141950	DPH3	201774	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	16324333	16324353	16324342	Y	NA	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	19627	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.234484356321151
chr3	16351640	16351656	16351648	Y	RFTN1,OXNAD1	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	46934	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr3	16373323	16373612	16373405	Y	ANKRD28,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	68617	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr3	16379433	16379643	16379566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	74727	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	16380469	16380852	16380674	Y	DPH3	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	75763	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	17345014	17345355	17345310	Y	TBC1D5,TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	502855	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	17506581	17506846	17506713	Y	TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	664422	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr3	17679954	17680161	17680022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	804148	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	17913596	17913897	17913750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	570412	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr3	18140643	18140862	18140682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	343447	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	2077	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.876551330288184
chr3	19379484	19379512	19379499	Y	KCNH8	NA	NA	NA	NA	NA	EFHB	607005	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	19993428	19993925	19993635	Y	KAT2B,RAB5A	EFHB,RAB5A,RNU4-85P	NA	NA	NA	NA	RAB5A	6857	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr3	20012721	20012798	20012760	Y	NA	EFHB,RAB5A,RNU4-85P	NA	NA	NA	NA	RNU4-85P	23497	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	20190984	20191185	20191115	Y	SGOL1,SGOL1	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	34599	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr3	20200050	20200329	20200065	Y	NA	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	25455	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr3	20201632	20201832	20201780	Y	KAT2B	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	23952	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	20205868	20206079	20206039	Y	SGOL1,SGOL1	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	19705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	22039046	22039346	22039196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB1P5	381964	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	22144385	22144677	22144533	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB1P5	276633	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	23201434	23201636	23201539	Y	UBE2E2	UBE2E2	UBE2E1,UBE2E2	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2E2	40875	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	23206478	23206499	23206488	Y	NA	UBE2E2	UBE2E1,UBE2E2	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2E2	36012	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr3	23389835	23390198	23389844	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2E2	147324	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	23709947	23710120	23710034	Y	UBE2E1	NA	UBE2E2,UBE2E1,NKIRAS1,RPL15	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2E1	135274	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	23782023	23782329	23782145	Y	NR1D2,UBE2E1	NA	UBE2E2,UBE2E1	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2E1	63065	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	23935594	23935945	23935770	Y	NA	RPL15,NR1D2	NA	NA	NA	NA	RPL15	20091	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	24197996	24198283	24198140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKIRAS1	211914	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr3	24492184	24492324	24492254	Y	NA	THRB	NA	NA	NA	NA	THRB	42449	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	24525285	24525656	24525591	Y	NA	THRB	NA	NA	NA	NA	THRB	9117	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	25198005	25198299	25198060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOP2B	506099	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	25790563	25790933	25790768	Y	NA	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	31475	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18478155158147
chr3	25796078	25796406	25796226	Y	NGLY1	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	26002	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr3	27448684	27449023	27448831	Y	NA	NA	NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	SLC4A7	74888	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	27524458	27524952	27524717	Y	NA	SLC4A7,RNU1-96P	NA	NA	NA	NA	SLC4A7	547	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.25324255600729
chr3	27575366	27575733	27575573	Y	NA	RNU1-96P	AZI2,SLC4A7,NEK10,EOMES	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-96P	22004	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.57800520769238
chr3	27719100	27719312	27719216	Y	NA	AC098614.2,EOMES	NEK10,SLC4A7	IMR90	Hi-C	24141950	EOMES	42894	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr3	28367464	28367703	28367584	Y	NA	AZI2,ZCWPW2	NA	NA	NA	NA	AZI2	20915	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	29365730	29366225	29365913	Y	NA	RBMS3	NA	NA	NA	NA	RBMS3	45257	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	29660032	29660218	29660060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	339559	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	29725037	29725420	29725261	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	404564	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	29736457	29736614	29736535	Y	RBMS3	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	415984	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr3	29800986	29801236	29801157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	480513	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr3	31212919	31213134	31212993	Y	NA	NA	GADL1	IMR90	Hi-C	24141950	STT3B	358996	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	31690891	31691368	31691073	Y	ZNF860,OSBPL10	NA	NA	NA	NA	NA	STT3B	118761	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr3	32534481	32534843	32534759	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	8057	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	32535422	32535827	32535806	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	7073	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr3	32549205	32549429	32549313	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	6305	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.366450798784198
chr3	32822383	32822764	32822428	Y	TRIM71	AC139452.2	NA	NA	NA	NA	AC139452.2	2374	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	32877551	32877785	32877669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC139452.2	52413	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	33002804	33002999	33002866	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC13P1	70356	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	33081513	33081785	33081661	Y	NA	SEC13P1	NA	NA	NA	NA	SEC13P1	8158	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr3	33089398	33089551	33089467	Y	CCR4	SEC13P1,TMPPE,GLB1	NA	NA	NA	NA	SEC13P1	16043	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	33190938	33191178	33190994	Y	NA	CRTAP	NA	NA	NA	NA	CRTAP	37467	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr3	33382066	33382350	33382208	Y	CLASP2	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL2	65549	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	33590851	33591213	33591209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBP1	109988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	33639579	33639904	33639592	Y	CLASP2	NA	NA	NA	NA	NA	CLASP2	117944	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr3	33837400	33837658	33837523	Y	CLASP2,PDCD6IP	PDCD6IP	NA	NA	NA	NA	PDCD6IP	186	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	35749341	35749720	35749410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAC	670116	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	35790038	35790162	35790114	Y	ARPP21	NA	NA	NA	NA	NA	STAC	629674	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	36536348	36536512	36536414	Y	MLH1,MLH1,EPM2AIP1	NA	NA	NA	NA	NA	STAC	116512	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	36936505	36936649	36936593	Y	MLH1,EPM2AIP1	TRANK1	NA	NA	NA	NA	TRANK1	47899	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	36937540	36937792	36937666	Y	NA	TRANK1	NA	NA	NA	NA	TRANK1	46756	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	37011455	37011827	37011685	Y	LRRFIP2,ITGA9,GOLGA4,MLH1,MLH1,EPM2AIP1	TRANK1,EPM2AIP1,MLH1,RPL29P11	NA	NA	NA	NA	EPM2AIP1	20968	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	37164159	37164535	37164493	Y	NA	NA	MLH1	IMR90	Hi-C	24141950	LRRFIP2	58645	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	37218637	37218971	37218954	Y	DCLK3,TRANK1,C3orf35	LRRFIP2	MLH1	IMR90	Hi-C	24141950	LRRFIP2	4209	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	37221290	37221535	37221382	Y	NA	LRRFIP2	LRRFIP2	IMR90	Hi-C	24141950	LRRFIP2	1645	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	37259018	37259236	37259127	Y	NA	LRRFIP2,GOLGA4,AC097359.1	LRRFIP2,MLH1,EPM2AIP1	IMR90	Hi-C	24141950	GOLGA4	23432	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr3	37901883	37902306	37902042	Y	CTDSPL	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	432	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.163294011145704
chr3	38072885	38073008	38072928	Y	PLCD1	NA	NA	NA	NA	NA	ACAA1	103725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr3	38195534	38195789	38195689	Y	VILL,ACAA1,MYD88,OXSR1	ACAA1,MYD88,OXSR1	OXSR1	IMR90	Hi-C	24141950	OXSR1	8791	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	38207945	38208258	38208101	Y	VILL,PLCD1,DLEC1,MYD88,OXSR1	ACAA1,MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	3365	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr3	38209266	38209592	38209336	Y	VILL,PLCD1,SLC22A14,ACAA1,MYD88,OXSR1	ACAA1,MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	4686	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	38568637	38569221	38568871	Y	SCN10A,SCN11A,SLC22A14,EXOG	EXOG	NA	NA	NA	NA	EXOG	33019	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	39191403	39191804	39191748	Y	NA	TTC21A,GORASP1,CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	2249	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	39192381	39192719	39192586	Y	WDR48,CSRNP1	TTC21A,GORASP1,CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	1334	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr3	39192828	39193549	39193225	Y	NA	TTC21A,GORASP1,CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	504	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	39193999	39194528	39194467	Y	NA	TTC21A,GORASP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.350804903476802
chr3	39222162	39222653	39222434	Y	NA	CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	28109	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr3	39500188	39500458	39500320	Y	TTC21A,CX3CR1,CX3CR1,MOBP	NA	NA	NA	NA	NA	RPSA	54008	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr3	40341288	40341806	40341708	Y	EIF1B	EIF1B	NA	NA	NA	NA	EIF1B	7369	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	40491258	40491489	40491375	Y	NA	ENTPD3-AS1,RPL14,ZNF619	NA	NA	NA	NA	ENTPD3-AS1	1331	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	41388560	41388910	41388735	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNNB1	154232	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	41886280	41886299	41886290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ULK4	115623	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	42062353	42062651	42062504	Y	NA	TRAK1	TRAK1,ULK4	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	9059	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.212996815885384
chr3	42103073	42103570	42103397	Y	NA	TRAK1	ZNF621,ZNF620,TRAK1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	49779	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr3	42220925	42221235	42221114	Y	TRAK1	NA	NA	NA	NA	NA	TRAK1	167631	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	43221606	43221805	43221773	Y	CCDC13,SNRK	NA	SNRK,ANO10,FAM198A,ABHD5	IMR90	Hi-C	24141950	SNRK	104199	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr3	43812189	43812581	43812343	Y	NA	NA	ANO10,MIR138-1	IMR90	Hi-C	24141950	ANO10	81103	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr3	44040259	44040834	44040651	Y	NA	NA	ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	ANO10	309173	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.24940010243818
chr3	44621262	44622718	44622436	Y	NA	ZNF197	NA	NA	NA	NA	ZNF197	1662	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.50064346688621
chr3	44643970	44644223	44644141	Y	ZNF445,ZNF660,ZNF35,ZNF197	ZNF197,ZNF35	NA	NA	NA	NA	ZNF197	19590	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	44697594	44698203	44697878	Y	NA	ZNF35	NA	NA	NA	NA	ZNF35	9375	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	44925504	44925895	44925674	Y	NA	TMEM42,MIR564	NA	NA	NA	NA	MIR564	24124	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	45103596	45103920	45103694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC3B	62556	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	45106273	45106458	45106405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC3B	65233	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr3	45138887	45139080	45139004	Y	NA	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	46834	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr3	45157727	45158120	45157925	Y	CDCP1	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	27794	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr3	45165344	45165812	45165623	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	20102	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	45185924	45186005	45185965	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	10	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr3	45240276	45240388	45240335	Y	NA	RPS24P8,TMEM158	NA	NA	NA	NA	TMEM158	25382	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	45387426	45387653	45387535	Y	NA	LARS2	LIMD1,LARS2,CLEC3B,LOC644714,SACM1L,EXOSC7,CDCP1,TMEM158,FYCO1	IMR90	Hi-C	24141950	LARS2	40345	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	45512532	45512880	45512706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMD1	82006	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	45587097	45587360	45587213	Y	LIMD1	LIMD1	NA	NA	NA	NA	LIMD1	7526	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	45594952	45595331	45595047	Y	LIMD1	LIMD1	NA	NA	NA	NA	LIMD1	66	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr3	45657242	45657607	45657425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMD1	62356	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	45681547	45681721	45681608	Y	LIMD1	SACM1L	NA	NA	NA	NA	SACM1L	46827	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	46036343	46036779	46036493	Y	CCR5,CCR2,SACM1L,CXCR6,FYCO1	FYCO1	NA	NA	NA	NA	FYCO1	1027	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr3	46152557	46153082	46152773	Y	CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR3,CCR1	NA	CCR5,FYCO1,CCR1,CCR2	IMR90	Hi-C	24141950	FYCO1	117241	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.164024160336071
chr3	46246833	46247045	46246952	Y	CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-24F11.2	199505	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	46546407	46546628	46546504	Y	CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2	LTF	NA	NA	NA	NA	LTF	21683	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	46967558	46967892	46967707	Y	KLHL18,NBEAL2	NA	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	51281	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	46971519	46971826	46971651	Y	SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	47347	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr3	46989533	46989702	46989634	Y	SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	29471	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr3	46989736	46990203	46989983	Y	SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	28970	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr3	46990572	46990937	46990863	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	28236	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	47000781	47001063	47000953	Y	SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	18110	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	47002825	47003246	47003204	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	15927	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	47004561	47004925	47004746	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	14248	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	47072517	47072982	47072882	Y	NBEAL2	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC12	51017	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	47120016	47120037	47120026	Y	SETD2,KLHL18,PRSS45,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NA	SETD2	83420	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	47176804	47177094	47176949	Y	PRSS45,PRSS42	SETD2,KIF9-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD2	26363	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	47201175	47201471	47201342	Y	CSPG5,SETD2	SETD2,KIF9-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD2	1986	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	47204029	47204492	47204291	Y	NA	SETD2,KIF9-AS1	NA	NA	NA	NA	KIF9-AS1	42	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr3	47420724	47420876	47420775	Y	NA	PTPN23	NA	NA	NA	NA	PTPN23	223	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr3	47421570	47421869	47421711	Y	NA	PTPN23	NA	NA	NA	NA	PTPN23	1069	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.220454688943899
chr3	47577675	47577951	47577814	Y	CSPG5	CSPG5	SMARCC1,C3orf75,SCAP,CSPG5,DHX30	IMR90	Hi-C	24141950	CSPG5	42331	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	47704557	47705253	47705047	Y	SETD2	NA	NA	NA	NA	NA	CSPG5	84275	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.287802580550236
chr3	47879431	47879730	47879653	Y	SPINK8	DHX30	NA	NA	NA	NA	DHX30	37032	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr3	47898226	47898293	47898260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHX30	55827	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	47991974	47992099	47992083	Y	CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4	136670	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.630263532228746
chr3	48128782	48129302	48129029	Y	NA	MAP4,RP11-1029M24.1	NA	NA	NA	NA	MAP4	13	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.385591962099453
chr3	48332679	48332937	48332732	Y	SPINK8	NME6	NA	NA	NA	NA	NME6	8238	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	48469321	48469953	48469633	Y	NA	CCDC51,ATRIP,TREX1	NA	NA	NA	NA	PLXNB1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr3	48651627	48651919	48651775	Y	TREX1,DALRD3,ARIH2	COL7A1,UQCRC1,SLC26A6,CELSR3	NA	NA	NA	NA	UQCRC1	5218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	48860064	48860139	48860102	Y	NA	PRKAR2A-AS1,PRKAR2A	NA	NA	NA	NA	PRKAR2A-AS1	22866	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	49123301	49123671	49123633	Y	NA	QRICH1,QARS,USP19	NA	NA	NA	NA	QRICH1	6125	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr3	49218772	49219051	49218909	Y	NA	CCDC71	NA	NA	NA	NA	CCDC71	17018	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	49286239	49286578	49286497	Y	ARIH2,DALRD3,NDUFAF3,RHOA,USP4	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC71	84485	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	49358291	49358883	49358713	Y	ARIH2,C3orf71,NDUFAF3,DALRD3,QRICH1,USP19,UBA7,IP6K1,USP4	USP4,GPX1	NA	NA	NA	NA	USP4	17262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr3	49425171	49425361	49425266	Y	ARIH2,QRICH1,USP4,UBA7	USP4,GPX1,TCTA,RHOA,NICN1	NA	NA	NA	NA	TCTA	22278	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr3	49503154	49503264	49503210	Y	NA	NICN1,DAG1	NA	NA	NA	NA	DAG1	882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.362835379294793
chr3	49905616	49905814	49905653	Y	NA	TRAIP,MST1R	NA	NA	NA	NA	TRAIP	13609	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	49938038	49938186	49938111	Y	TUSC2,APEH,GMPPB,SEMA3F,MST1R,MON1A,IFRD2,C3orf54	TRAIP,MST1R,MON1A,RBM6	NA	NA	NA	NA	MST1R	1113	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr3	50040739	50040850	50040788	Y	SEMA3B	NA	NA	NA	NA	NA	RBM6	65299	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr3	50194710	50194859	50194796	Y	TUSC2,HYAL2,GMPPB,C3orf54,MST1R,MON1A,IFRD2,SEMA3F	SEMA3F,RP11-493K19.3	NA	NA	NA	NA	RP11-493K19.3	3192	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.443638718637426
chr3	50201601	50201845	50201760	Y	TUSC2,HYAL2,C3orf54,MST1R,MON1A,SEMA3F,IFRD2	SEMA3F,RP11-493K19.3	NA	NA	NA	NA	RP11-493K19.3	10083	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.772070002938683
chr3	50204265	50204566	50204413	Y	HYAL2	SEMA3F,RP11-493K19.3	NA	NA	NA	NA	RP11-493K19.3	12747	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	50204844	50205012	50204945	Y	NA	SEMA3F,RP11-493K19.3	NA	NA	NA	NA	RP11-493K19.3	13326	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	50208155	50208394	50208279	Y	MAPKAPK3,RBM5,GNAI2	SEMA3F,RP11-493K19.3	GNAT1,SLC38A3,GNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-493K19.3	16637	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.349188675546657
chr3	50239388	50239565	50239461	Y	HYAL1,SLC38A3	SEMA3F,RP11-493K19.3,GNAI2	NA	NA	NA	NA	GNAI2	22159	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	50264852	50265230	50265012	Y	TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2	GNAI2,SEMA3B-AS1,SEMA3B	NA	NA	NA	NA	GNAI2	3128	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.347189483987397
chr3	50274525	50274666	50274593	Y	RASSF1,IP6K1,RBM5,GNAI2,GNAI2	GNAI2,SEMA3B-AS1,SEMA3B	NA	NA	NA	NA	GNAI2	12801	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr3	50302065	50302532	50302296	Y	SEMA3B	GNAI2,SEMA3B-AS1,SEMA3B,IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL1	NA	NA	NA	NA	SEMA3B-AS1	271	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.405966389715736
chr3	50354393	50354598	50354449	Y	MST1R	IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL1,HYAL2,TUSC2,RASSF1,CYB561D2,NPRL2,TMEM115	NA	NA	NA	NA	HYAL2	3739	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr3	50377372	50377700	50377536	Y	NA	IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL1,HYAL2,TUSC2,RASSF1,CYB561D2,NPRL2,TMEM115	NA	NA	NA	NA	RASSF1	961	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.197698106139239
chr3	50638353	50638905	50638586	Y	MAPKAPK3,CISH	HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK3	8046	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr3	51062777	51063032	51062936	Y	VPRBP,RBM15B	NA	NA	NA	NA	NA	MANF	357446	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	51377903	51378233	51378113	Y	NA	MANF,RBM15B	NA	NA	NA	NA	MANF	42245	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.346076371167914
chr3	51506153	51506528	51506417	Y	VPRBP,RAD54L2,GPR62	VPRBP	NA	NA	NA	NA	VPRBP	25482	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr3	51573530	51573858	51573781	Y	VPRBP,RAD54L2	VPRBP	NA	NA	NA	NA	VPRBP	41520	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	51628881	51628909	51628894	Y	GPR62	NA	NA	NA	NA	NA	TEX264	65800	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr3	52079728	52079827	52079778	Y	DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	8739	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	52080287	52080923	52080751	Y	NT5DC2,TWF2,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	7643	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.528128581999758
chr3	52081342	52081690	52081545	Y	GPR62,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	6876	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr3	52091161	52091675	52091445	Y	TWF2,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	2595	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.174594337773329
chr3	52278175	52278351	52278252	Y	PBRM1,PBRM1,WDR82,GLYCTK,TWF2,PPM1M,PPM1M	ALAS1,RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M,GLYCTK,WDR82	NA	NA	NA	NA	PPM1M	334	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr3	52287340	52287625	52287477	Y	PBRM1,NISCH,WDR82,GLYCTK,PPM1M,PPM1M	RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M,GLYCTK,WDR82	NA	NA	NA	NA	PPM1M	9499	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	52590623	52590962	52590793	Y	NA	NT5DC2	NA	NA	NA	NA	NT5DC2	23553	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr3	52625235	52625395	52625315	Y	DNAH1,PBRM1	NA	NA	NA	NA	NA	NT5DC2	58165	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	52652258	52652629	52652403	Y	GLYCTK,MUSTN1,GLT8D1	NA	NA	NA	NA	NA	GNL3	60543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	53136597	53136930	53136874	Y	PBRM1,PBRM1,TMEM110,DCP1A,PRKCD	RFT1	NA	NA	NA	NA	RFT1	25548	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr3	53270281	53270430	53270371	Y	PRKCD,DCP1A,TKT	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	17638	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.362105230104426
chr3	53272912	53273168	53273085	Y	TMEM110,PRKCD,DCP1A	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	14900	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	53283824	53284319	53284192	Y	PRKCD,DCP1A	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	3749	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr3	53288705	53289353	53289077	Y	NA	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	637	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr3	53304049	53304491	53304265	Y	PRKCD,DCP1A,TKT	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	15981	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.33477604454029
chr3	53360286	53360418	53360351	Y	NA	DCP1A	NA	NA	NA	NA	DCP1A	19236	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr3	53380883	53380907	53380896	Y	TMEM110,PRKCD,DCP1A	DCP1A	NA	NA	NA	NA	DCP1A	1229	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr3	53859957	53860202	53860080	Y	CACNA1D,CHDH	CHDH,IL17RB	NA	NA	NA	NA	CHDH	18215	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr3	53897423	53897785	53897604	Y	NA	CHDH,IL17RB,ACTR8,SELK	NA	NA	NA	NA	ACTR8	16444	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr3	54059827	54060023	54059926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D3	94551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr3	54389983	54390168	54390067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D3	235409	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.565644981372036
chr3	54390282	54390612	54390584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D3	235708	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.38447884927997
chr3	54686814	54686829	54686822	Y	NA	RPS15P5	NA	NA	NA	NA	RPS15P5	28572	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	54851764	54851786	54851775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS15P5	193522	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	54856337	54856720	54856396	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS15P5	198095	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	55194265	55194440	55194343	Y	WNT5A	NA	WNT5A,CACNA2D3,ERC2	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	327533	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr3	55203569	55203824	55203706	Y	WNT5A	NA	WNT5A,CACNA2D3,ERC2,LRTM1,C3orf51	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	318149	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	55219456	55219785	55219624	Y	NA	NA	WNT5A,CACNA2D3,ERC2,C3orf51	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	302188	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr3	55223485	55223775	55223588	Y	WNT5A	NA	WNT5A,CACNA2D3,ERC2,C3orf51	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	298198	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr3	55364571	55364745	55364625	Y	NA	NA	CACNA2D3,WNT5A,ERC2,C3orf51	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	157228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr3	55398457	55398867	55398717	Y	NA	NA	CACNA2D3	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	123106	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.117433659975133
chr3	55401949	55401987	55401976	Y	NA	NA	CACNA2D3	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	119986	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr3	55517501	55517653	55517577	Y	NA	WNT5A,RP11-875H7.5	NA	NA	NA	NA	WNT5A	4320	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr3	55518078	55518594	55518516	Y	WNT5A	WNT5A,RP11-875H7.5	NA	NA	NA	NA	WNT5A	3379	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr3	56665346	56665542	56665444	Y	C3orf63	FAM208A	NA	NA	NA	NA	FAM208A	49723	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr3	56769464	56769764	56769614	Y	CCDC66	NA	NA	NA	NA	NA	FAM208A	54199	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	57096152	57096374	57096203	Y	ASB14	SPATA12,ARHGEF3	NA	NA	NA	NA	SPATA12	3683	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	57102609	57102968	57102819	Y	ARHGEF3	SPATA12,ARHGEF3	NA	NA	NA	NA	ARHGEF3	8389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	57197470	57197866	57197668	Y	NA	RP11-157F20.1,IL17RD	NA	NA	NA	NA	IL17RD	4468	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	57562103	57562255	57562188	Y	SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	19692	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	57572232	57572342	57572306	Y	NA	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	9605	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr3	57637831	57638080	57637955	Y	SLMAP,FAM116A,PDE12	RP11-755B10.3	NA	NA	NA	NA	RP11-755B10.3	38852	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	57874517	57874643	57874579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLNB	117484	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	57937235	57937402	57937348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLNB	54725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.322589639172887
chr3	57945627	57945950	57945779	Y	PDE12	FLNB	FLNB,ARF4	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	46177	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.621309582721632
chr3	57955527	57955938	57955800	Y	FLNB	FLNB	FLNB,ARF4	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	36189	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.259970279875438
chr3	57957829	57958015	57957905	Y	NA	FLNB	FLNB,ARF4	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	34112	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr3	57958534	57958833	57958768	Y	FLNB	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	33294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18278236002221
chr3	57960548	57960842	57960815	Y	FLNB	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	31285	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.423108361471731
chr3	57963451	57963815	57963633	Y	NA	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	28312	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.387938339219964
chr3	57964155	57964263	57964209	Y	FLNB	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	27864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.289645842560086
chr3	57968397	57968639	57968468	Y	PDE12,PXK	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	23488	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	57969350	57969849	57969627	Y	PDE12,PXK	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	22278	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.230641902752041
chr3	57971589	57971767	57971672	Y	PDE12,PXK	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	20360	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	57995654	57995894	57995762	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	3527	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	57995926	57996426	57996121	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	3799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr3	58029786	58030054	58029903	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	37659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr3	58035006	58035314	58035102	Y	FLNB	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	42879	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	58163548	58163776	58163593	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD6	57457	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr3	58192298	58192649	58192549	Y	NA	ABHD6	NA	NA	NA	NA	ABHD6	28584	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.163294011145704
chr3	58246699	58246763	58246737	Y	ABHD6	ABHD6	NA	NA	NA	NA	ABHD6	25466	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	58321418	58321818	58321477	Y	NA	RPP14,PXK	NA	NA	NA	NA	PXK	4811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr3	58336517	58336871	58336595	Y	PXK	RPP14,PXK	NA	NA	NA	NA	PXK	19910	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	58390134	58390421	58390274	Y	NA	PDHB	NA	NA	NA	NA	PDHB	27163	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	58400417	58400633	58400461	Y	NA	PDHB	NA	NA	NA	NA	PDHB	16951	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	58411955	58412199	58412053	Y	NA	PDHB	NA	NA	NA	NA	PDHB	5385	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	58412465	58412623	58412544	Y	NA	PDHB	NA	NA	NA	NA	PDHB	4961	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr3	58457172	58457525	58457255	Y	RPP14,RPP14,KCTD6	PDHB,KCTD6	PXK,RPP14,KCTD6,ACOX2,PDHB	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD6	18316	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200810410517982
chr3	60715683	60716344	60716091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	518789	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.268158302124319
chr3	61728117	61728514	61728321	Y	NA	RPL10AP6	NA	NA	NA	NA	RPL10AP6	1337	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	62590103	62590230	62590174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP6	863323	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr3	63848274	63848561	63848418	Y	NA	THOC7	NA	NA	NA	NA	THOC7	695	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	63942094	63942115	63942105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMD6	65543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	63946118	63946531	63946303	Y	NA	NA	LOC100507062	IMR90	Hi-C	24141950	PSMD6	61127	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	65016570	65016819	65016695	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	1005690	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	66353986	66354551	66354135	Y	SLC25A26	NA	NA	NA	NA	NA	LRIG1	195136	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	67420914	67421310	67421112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG2	281728	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	67938562	67938814	67938688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-81N13.1	235441	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	69131956	69132274	69132164	Y	TMF1,ARL6IP5	TMF1,UBA3,LMOD3	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	69134869	69134938	69134904	Y	TMF1	TMF1,UBA3,ARL6IP5,LMOD3	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	2774	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr3	69135158	69135511	69135504	Y	NA	TMF1,UBA3,ARL6IP5,LMOD3	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	3063	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.642449937596148
chr3	69261592	69261838	69261780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMOD3	91409	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr3	69337600	69337654	69337627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMOD3	167417	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	69504160	69504419	69504290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITF	282167	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	69789363	69789667	69789441	Y	MITF	MITF	NA	NA	NA	NA	MITF	2777	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	69840236	69840485	69840360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITF	53650	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	70175230	70175612	70175604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITF	388644	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr3	71151319	71151713	71151657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	479427	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	71153323	71153512	71153422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	477628	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	71494304	71494367	71494336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	136773	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	71553174	71553740	71553492	Y	EIF4E3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	77400	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr3	72386025	72386536	72386317	Y	NA	NA	SHQ1,GXYLT2,RYBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RYBP	107533	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr3	72862614	72863000	72862807	Y	SHQ1	SHQ1	NA	NA	NA	NA	SHQ1	46065	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	72977666	72978074	72977791	Y	RYBP	GXYLT2,FTH1P23	NA	NA	NA	NA	FTH1P23	1471	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr3	73049169	73049333	73049244	Y	PPP4R2,EBLN2	PPP4R2	NA	NA	NA	NA	PPP4R2	5233	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr3	73159773	73160145	73159855	Y	EBLN2	NA	PDZRN3,CACNA1D	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC75P1	70297	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309673084615119
chr3	73697614	73697785	73697708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC75P1	467172	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.135808896032157
chr3	75229755	75230024	75229900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86DP	252237	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	76160921	76161072	76160934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	320097	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	76950761	76950890	76950828	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	469592	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr3	77273270	77273652	77273462	Y	ROBO2,ROBO2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	792101	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	78881449	78881566	78881507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	933399	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	78934560	78934824	78934693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	880141	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18278236002221
chr3	80820355	80820528	80820440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBE1	988784	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	81766105	81766391	81766248	Y	NA	GBE1	NA	NA	NA	NA	GBE1	42921	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	85318532	85318917	85318639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADM2	312400	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	85479934	85479951	85479943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADM2	473802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	86972169	86972375	86972272	Y	VGLL3	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL3	65894	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	86999128	86999300	86999212	Y	CHMP2B	VGLL3	NA	NA	NA	NA	VGLL3	38969	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	87038252	87038431	87038423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL3	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	87038753	87038992	87038799	Y	VGLL3	VGLL3	NA	NA	NA	NA	VGLL3	484	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.124891533033648
chr3	87382490	87382853	87382616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP2B	108069	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr3	88208920	88209337	88209164	Y	CGGBP1,C3orf38	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	CGGBP1	11885	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr3	88367245	88367614	88367269	Y	NA	ABCF2P1	NA	NA	NA	NA	ABCF2P1	2939	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18478155158147
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPKP4	269654	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.562532676993293
chr3	97200440	97200579	97200496	Y	EPHA6	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6	280786	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	98363153	98363375	98363252	Y	ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	CPOX	52586	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	98497643	98498236	98497973	Y	ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	120297	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	98504725	98505044	98504856	Y	OR5K4,ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	113489	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	99254161	99254407	99254283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2021J15.1	634893	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr3	99262027	99262447	99262268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2021J15.1	642759	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	99579229	99579736	99579484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	398108	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr3	99587238	99587483	99587373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	390361	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	99600050	99600430	99600273	Y	FILIP1L,C3orf26	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	377414	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	99620045	99620512	99620235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	357332	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	99657499	99657599	99657549	Y	FILIP1L	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	320245	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	99751196	99751332	99751292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	226512	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	99761045	99761306	99761215	Y	TMEM45A	NA	TMEM30C	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D23	216538	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	99944403	99944723	99944568	Y	NA	TBC1D23	C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D23	33121	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr3	100054250	100054545	100054496	Y	NA	NIT2	NA	NA	NA	NA	NIT2	2705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	100077983	100078198	100078091	Y	FILIP1L	NIT2,LNP1,TOMM70A	NA	NA	NA	NA	NIT2	26438	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	100088429	100088702	100088566	Y	NA	NIT2,LNP1,TOMM70A	NA	NA	NA	NA	LNP1	29335	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr3	100244695	100244934	100244873	Y	NA	TMEM45A	NA	NA	NA	NA	TMEM45A	35232	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	100601460	100601811	100601657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFG	175255	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	101046086	101046265	101046174	Y	ZBTB11,SENP7,CEP97	NA	NA	NA	NA	NA	SENP7	183820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	101146332	101146443	101146386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP7	83642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	101403455	101403770	101403678	Y	SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24	ZBTB11,CEP97	NA	NA	NA	NA	RPL24	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.956312661341626
chr3	101444542	101444901	101444615	Y	FAM55C,FAM55C,CEP97	RPL24,CEP97	NA	NA	NA	NA	CEP97	3773	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.173481224953846
chr3	101843193	101843415	101843276	Y	ZPLD1	NA	FAM55C,LOC152225,NFKBIZ	IMR90	Hi-C	24141950	NFKBIZ	298358	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	101900579	101900614	101900597	Y	NA	NA	FAM55C,LOC152225,NFKBIZ	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFKBIZ	355744	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	101901132	101901377	101901290	Y	NA	NA	FAM55C,LOC152225,NFKBIZ	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFKBIZ	356297	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	105087492	105087848	105087688	Y	NA	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	3739	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr3	105087916	105088171	105088021	Y	ALCAM	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	4163	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr3	105088270	105088514	105088471	Y	ALCAM	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	4517	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr3	105549302	105549342	105549320	Y	CBLB	CBLB	NA	NA	NA	NA	CBLB	37054	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	105716646	105717231	105716913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	130250	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr3	105722948	105723182	105723045	Y	CBLB	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	136552	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr3	107318808	107318949	107318879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBX	79025	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr3	107504411	107504731	107504449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBX	264628	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	107803224	107803878	107803522	Y	NA	CD47	NA	NA	NA	NA	CD47	3994	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	110559654	110560043	110559944	Y	NA	NA	PVRL3,PVRL3-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	PVRL3	226875	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	110800210	110800608	110800220	Y	NA	PVRL3,PVRL3-AS1	NA	NA	NA	NA	PVRL3-AS1	11810	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	111420857	111420932	111420895	Y	NA	PLCXD2,PHLDB2	PHLDB2,CD96,ABHD10	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDB2	28412	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	111521164	111521550	111521388	Y	PHLDB2,PHLDB2	NA	NA	NA	NA	NA	PHLDB2	71820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr3	111583903	111584464	111583984	Y	PHLDB2,PHLDB2	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	111393	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	111623667	111623869	111623803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	71988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.169865805464441
chr3	111655124	111655265	111655201	Y	NA	ABHD10	NA	NA	NA	NA	ABHD10	40592	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr3	111816359	111816505	111816432	Y	C3orf52	C3orf52	NA	NA	NA	NA	C3orf52	13177	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	111877933	111878040	111878010	Y	SLC9A10	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf52	74751	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	112182390	112182567	112182476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35A5	95989	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	112258715	112258936	112258847	Y	SLC35A5,ATG3	SLC35A5,ATG3	NA	NA	NA	NA	SLC35A5	19620	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr3	113078924	113079182	113079053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPICE1	152852	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.171482033394586
chr3	113473473	113473635	113473557	Y	QTRTD1,KIAA2018,NAA50,ATP6V1A	NAA50,ATP6V1A,RP11-271C24.2	NA	NA	NA	NA	RP11-271C24.2	9218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	113638745	113638778	113638762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-435F17.1	71167	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr3	113701770	113701838	113701802	Y	KIAA1407,DRD3,ZDHHC23	QTRTD1	NA	NA	NA	NA	QTRTD1	20842	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	114122649	114123036	114122843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20-AS1	53991	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr3	114127669	114128003	114127894	Y	ZBTB20,ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20-AS1	59011	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	114144881	114145214	114145066	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20-AS1	76223	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr3	114246828	114247170	114246841	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20-AS1	178170	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	114287427	114287687	114287530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20-AS1	218769	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	114289543	114289832	114289667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20-AS1	220885	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	114349924	114350199	114350024	Y	ZBTB20,ZBTB20,ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20-AS1	281266	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	114354102	114354718	114354116	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20-AS1	285444	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	114358213	114358332	114358238	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20-AS1	289555	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	114373701	114374062	114373901	Y	ZBTB20,ZBTB20,ZBTB20,ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20-AS1	305043	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr3	114500516	114500693	114500605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	363425	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	114563365	114563725	114563545	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	300393	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr3	114577698	114578255	114577941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	285863	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	114681173	114681431	114681302	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	182687	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	114724447	114724794	114724621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	139324	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	114813239	114813371	114813303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	50747	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr3	114858726	114858764	114858745	Y	NA	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	5354	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	114998646	114998840	114998743	Y	NA	NA	GAP43	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB20	134528	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	115345321	115345682	115345589	Y	GAP43	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	481203	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	115502758	115503253	115502970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	638640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.589634828477724
chr3	115511576	115511993	115511793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	647458	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr3	115545713	115545826	115545800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	681595	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.348805711917541
chr3	115558428	115558819	115558693	Y	GAP43	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	694310	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr3	115595102	115595314	115595123	Y	GAP43	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	730984	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	115696572	115696769	115696673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	832454	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr3	115776361	115776759	115776562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	912243	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr3	115790074	115790198	115790193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	925956	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.243941420938926
chr3	115843003	115843038	115843021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	900507	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	115863058	115863426	115863241	Y	LSAMP	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	880119	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	115918215	115918449	115918332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	825096	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	116949788	116950143	116949966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	206243	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	117632292	117632433	117632362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	888747	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	118561016	118561389	118561159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B4GALT4	396561	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr3	119146429	119146829	119146680	Y	ARHGAP31,CD80,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	38848	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	119202050	119202231	119202120	Y	NA	TMEM39A,POGLUT1,TIMMDC1	NA	NA	NA	NA	TIMMDC1	13148	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr3	119237356	119237846	119237595	Y	ARHGAP31,COX17,CD80,ADPRH,TMEM39A,POGLUT1	TIMMDC1,CD80	NA	NA	NA	NA	TIMMDC1	21977	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr3	119238487	119238668	119238501	Y	NA	TIMMDC1,CD80	NA	NA	NA	NA	TIMMDC1	23108	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr3	119357693	119358081	119357897	Y	GSK3B,ARHGAP31,ADPRH	RP11-190C22.1,COX17	NA	NA	NA	NA	RP11-190C22.1	4696	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	119514057	119514298	119514132	Y	NR1I2,NR1I2	NA	NA	NA	NA	NA	COX17	119756	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr3	119613107	119613331	119613219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSK3B	197933	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	119758013	119758347	119758179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSK3B	52917	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr3	119798224	119798287	119798255	Y	NA	GSK3B,RP11-18H7.1	NA	NA	NA	NA	GSK3B	12977	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr3	119864415	119864682	119864534	Y	COX17,GSK3B	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-18H7.1	52673	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr3	120065370	120065692	120065535	Y	NA	LRRC58	NA	NA	NA	NA	LRRC58	494	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr3	120167583	120167922	120167648	Y	NA	FSTL1	NA	NA	NA	NA	FSTL1	178	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.310403233805485
chr3	120286327	120286455	120286388	Y	NA	NDUFB4	FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB4	26701	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	120397142	120397339	120397236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2E1	62145	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	120397505	120397688	120397597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2E1	61796	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr3	120463141	120463503	120463258	Y	NA	GTF2E1,RABL3	NA	NA	NA	NA	RABL3	3301	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	120492875	120493095	120492951	Y	NA	GTF2E1,RABL3	NA	NA	NA	NA	RABL3	33035	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.149994492958819
chr3	120493479	120494008	120493729	Y	NA	GTF2E1,RABL3	NA	NA	NA	NA	RABL3	33639	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.145265960649932
chr3	121125286	121125288	121125287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP11	85669	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	121257379	121257441	121257436	Y	NA	RPL7AP11,POLQ	NA	NA	NA	NA	POLQ	5412	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.196967956948873
chr3	121450275	121450346	121450335	Y	NA	GOLGB1	NA	NA	NA	NA	GOLGB1	16256	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	121520314	121520680	121520641	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	31246	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	121749287	121749529	121749356	Y	HCLS1,EAF2,CD86,CD86	NA	NA	NA	NA	NA	EAF2	197257	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	122400701	122401439	122401076	Y	CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,HSPBAP1,DIRC2,PARP14	EIF4BP8,PARP14	NA	NA	NA	NA	PARP14	3236	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr3	122489447	122489759	122489603	Y	CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DIRC2	HSPBAP1,DIRC2	NA	NA	NA	NA	HSPBAP1	20912	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	122493180	122493752	122493620	Y	CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DIRC2	HSPBAP1,DIRC2	NA	NA	NA	NA	HSPBAP1	16919	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	122516218	122516436	122516387	Y	CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DIRC2	HSPBAP1,DIRC2	NA	NA	NA	NA	DIRC2	4576	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	123229622	123229815	123229688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPLB	72217	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	123241172	123241525	123241376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPLB	60507	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	123263878	123263964	123263921	Y	ADCY5,ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	PTPLB	38068	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr3	123304962	123305362	123305193	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	2573	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.433451504829284
chr3	123321303	123321432	123321369	Y	ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	18914	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr3	123324068	123324437	123324253	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	21679	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.173481224953846
chr3	123351425	123351671	123351446	Y	ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	49036	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	123355394	123355731	123355464	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	53005	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr3	123469666	123469916	123469803	Y	MYLK	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	167277	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	124531464	124532111	124531823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UMPS	84251	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr3	124553626	124554125	124554004	Y	KALRN	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	64140	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	124564415	124564677	124564502	Y	HEG1,ITGB5	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	53588	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr3	124605050	124605342	124605178	Y	ITGB5	ITGB5	NA	NA	NA	NA	ITGB5	12923	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	124708345	124708776	124708566	Y	NA	MUC13	NA	NA	NA	NA	MUC13	37682	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr3	124773884	124774020	124773942	Y	NA	HEG1	NA	NA	NA	NA	HEG1	1082	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	124779995	124780351	124780112	Y	ITGB5,HEG1	HEG1	NA	NA	NA	NA	HEG1	7193	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr3	124964412	124964802	124964608	Y	NA	SLC12A8	SLC12A8	IMR90	Hi-C	24141950	SLC12A8	31219	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	125053590	125053890	125053754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC12A8	57569	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	125231315	125231583	125231558	Y	NA	SNX4	NA	NA	NA	NA	SNX4	5458	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	125351909	125352225	125352071	Y	OSBPL11	OSBPL11	NA	NA	NA	NA	OSBPL11	39975	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr3	125363284	125363563	125363390	Y	OSBPL11	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL11	51350	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	125709142	125709481	125709414	Y	ZXDC,CCDC37	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86JP	75679	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr3	125736670	125736776	125736727	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-124N2.1	64287	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	125986265	125986571	125986320	Y	NA	NA	KLF15,ZXDC,ALDH1L1,CCDC37	IMR90	Hi-C	24141950	KLF15	87714	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.180053019272583
chr3	126074775	126075511	126074965	Y	ALDH1L1,UROC1,CCDC37,KLF15	KLF15	NA	NA	NA	NA	KLF15	490	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr3	126359707	126359720	126359714	Y	NA	TXNRD3NB,TXNRD3	NA	NA	NA	NA	TXNRD3	12278	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	126391611	126391660	126391640	Y	NA	TXNRD3,CHCHD6	NA	NA	NA	NA	TXNRD3	19613	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20353975126761
chr3	126630341	126630598	126630469	Y	ZXDC	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA1	74839	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr3	126700801	126701293	126700904	Y	NA	PLXNA1	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PLXNA1	4144	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	126701397	126702091	126701497	Y	PLXNA1	PLXNA1	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PLXNA1	3346	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.581290876679432
chr3	126945431	126945830	126945484	Y	MCM2	NA	NUP210P1	IMR90	Hi-C	24141950	PLXNA1	239994	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.243941420938926
chr3	126945882	126946306	126946211	Y	MCM2	NA	NUP210P1	IMR90	Hi-C	24141950	PLXNA1	240445	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr3	127448420	127448704	127448528	Y	TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	NA	NA	NA	NA	NA	ABTB1	58642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	127465577	127465875	127465733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLL	74176	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.83102072961996
chr3	127469268	127470071	127469577	Y	TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	NA	NA	NA	NA	NA	MGLL	69980	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr3	127487223	127487760	127487461	Y	TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	NA	NA	NA	NA	NA	MGLL	52291	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr3	127522578	127522702	127522699	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	MGLL	NA	NA	NA	NA	MGLL	17349	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr3	127536409	127536633	127536521	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL,KBTBD12	MGLL	NA	NA	NA	NA	MGLL	3418	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr3	127539467	127539812	127539513	Y	MGLL,MGLL	MGLL	NA	NA	NA	NA	MGLL	239	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	127632728	127633069	127632897	Y	KBTBD12	NA	KBTBD12,MCM2,PODXL2,ABTB1,MGLL,SEC61A1	IMR90	Hi-C	24141950	MGLL	92677	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr3	127729316	127729371	127729322	Y	DNAJB8	SEC61A1	SEC61A1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SEC61A1	39113	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr3	127813021	127813267	127813144	Y	NA	SEC61A1	NA	NA	NA	NA	SEC61A1	44537	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	128129010	128129170	128129084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475N22.4	76885	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr3	128134219	128134423	128134321	Y	GATA2,GATA2,GATA2,DNAJB8	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475N22.4	71632	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.975956939767544
chr3	128134820	128135360	128135009	Y	EEFSEC,GATA2,GATA2,GATA2,DNAJB8	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475N22.4	70695	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.171482033394586
chr3	128135736	128135843	128135790	Y	GATA2,GATA2,GATA2,C3orf27,DNAJB8	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475N22.4	70212	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.353534244226429
chr3	128152586	128152939	128152776	Y	NA	NA	EEFSEC,DNAJB8-AS1,DNAJB8,LOC90246,GATA2,C3orf27	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-475N22.4	53116	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	128214371	128214730	128214426	Y	EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2	RP11-475N22.4,GATA2	DNAJB8,DNAJB8-AS1,GATA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GATA2	4343	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr3	128216520	128216923	128216625	Y	EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2	RP11-475N22.4,GATA2	GATA2,C3orf27,RUVBL1,EEFSEC,DNAJB8,DNAJB8-AS1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GATA2	6492	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr3	128267469	128267837	128267725	Y	NA	NA	GATA2	K562	ChIA-PET	22265404	GATA2	57441	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr3	128366732	128367045	128366901	Y	NA	RPN1	NA	NA	NA	NA	RPN1	30873	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	128446542	128446927	128446583	Y	NA	RPN1,RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	RAB7A	3577	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	128475272	128475670	128475352	Y	RAB7A,ISY1,CNBP	RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	FTH1P4	6191	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	128538992	128539042	128539017	Y	DNAJB8,C3orf27	NA	NA	NA	NA	NA	FTH1P4	57131	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	128745839	128746109	128746044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB43	93535	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr3	128945338	128945482	128945420	Y	MBD4,ISY1,CNBP	CNBP	KIAA1257,CCDC48,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1,GP9,C3orf37	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNBP	44573	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr3	128947996	128948470	128948199	Y	MBD4,KIAA1257,RAB43,RAB43,RAB43,RAB43,ISY1,CNBP	CNBP	KIAA1257,CCDC48,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1,GP9,C3orf37	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNBP	47231	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr3	128954316	128954512	128954416	Y	NA	NA	KIAA1257,COPG1,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,CNBP	IMR90	Hi-C	24141950	CNBP	53551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	128957834	128958071	128957930	Y	NA	NA	KIAA1257,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNBP	57069	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr3	128967680	128967946	128967799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H1FX-AS1	64289	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr3	129167159	129167354	129167260	Y	NA	MBD4,IFT122	NA	NA	NA	NA	IFT122	10191	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.189510083890358
chr3	129344975	129345039	129344984	Y	NA	PLXND1	NA	NA	NA	NA	PLXND1	21314	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	129519745	129520139	129519943	Y	H1FOO	NA	NA	NA	NA	NA	TMCC1	90280	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	129572979	129573244	129573238	Y	NA	TMCC1	NA	NA	NA	NA	TMCC1	37175	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr3	130637982	130638444	130638066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2C1	70543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	131197540	131197572	131197556	Y	NA	MRPL3	NA	NA	NA	NA	MRPL3	22255	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr3	132138974	132139193	132139084	Y	NA	DNAJC13	NA	NA	NA	NA	DNAJC13	4604	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr3	133289121	133289251	133289178	Y	SRPRB	CDV3	CDV3	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDV3	1323	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	133295128	133295300	133295215	Y	NA	CDV3	NA	NA	NA	NA	CDV3	4554	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr3	133537876	133537890	133537883	Y	NA	SRPRB	NA	NA	NA	NA	SRPRB	36999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr3	133811108	133811508	133811147	Y	SLCO2A1	SLCO2A1	SLCO2A1,C3orf36	IMR90	Hi-C	24141950	SLCO2A1	42080	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.909374975419438
chr3	133956955	133957302	133957129	Y	NA	RYK	NA	NA	NA	NA	RYK	10387	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	133968581	133968789	133968685	Y	NA	RYK	NA	NA	NA	NA	RYK	892	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	134045700	134046050	134045958	Y	NA	RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	27353	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr3	134047160	134047394	134047241	Y	ANAPC13,ANAPC13,ANAPC13,AMOTL2	RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	26009	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr3	134050159	134050571	134050486	Y	AMOTL2	RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	22832	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.268158302124319
chr3	134051149	134051359	134051254	Y	NA	RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	22044	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr3	134082893	134083489	134083439	Y	AMOTL2	RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	AMOTL2	8832	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	135235230	135235627	135235440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R3A	446888	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	135890782	135891068	135890882	Y	NA	MSL2	NA	NA	NA	NA	MSL2	23015	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	136153802	136154197	136154172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCCB	186654	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	136327517	136327655	136327647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG1	141565	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr3	136448168	136448437	136448423	Y	NA	STAG1	NA	NA	NA	NA	STAG1	20783	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	136492102	136492187	136492145	Y	NA	STAG1	NCK1,IL20RB	IMR90	Hi-C	24141950	STAG1	22882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	136509398	136509586	136509492	Y	NA	STAG1	PPP2R3A,STAG1,IL20RB,NCK1,MSL2,TMEM22	IMR90	Hi-C	24141950	STAG1	40178	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr3	136563637	136563997	136563817	Y	NA	RP11-85F14.5,NCK1	NA	NA	NA	NA	RP11-85F14.5	14899	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr3	136571906	136572239	136572061	Y	TMEM22	RP11-85F14.5,NCK1	NA	NA	NA	NA	RP11-85F14.5	6657	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr3	136631651	136631818	136631718	Y	NA	IL20RB	NA	NA	NA	NA	IL20RB	31254	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr3	138364761	138365360	138365102	Y	PIK3CB,ARMC8	FAIM	NA	NA	NA	NA	FAIM	39313	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr3	138582294	138582582	138582441	Y	MRPS22	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	30514	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr3	138634319	138634690	138634472	Y	NA	FOXL2,C3orf72	ESYT3,PIK3CB,MRPS22,MRAS,CEP70,FAIM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXL2	29292	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr3	139018358	139018692	139018412	Y	FOXL2,C3orf72	NA	BPESC1	IMR90	Hi-C	24141950	COPB2	87882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200810410517982
chr3	139064285	139064552	139064299	Y	NA	COPB2,RP11-319G6.1	NA	NA	NA	NA	COPB2	42022	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208268283576497
chr3	139253953	139254145	139254018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMNAT3	140714	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr3	141032180	141032338	141032258	Y	NA	ZBTB38	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	8717	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr3	141050524	141051086	141050761	Y	NA	ZBTB38	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	9469	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	141118771	141119120	141118811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	77716	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr3	141126018	141126305	141126087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	77584	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	141131755	141132151	141131882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	71738	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	141133650	141133961	141133787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	69928	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	141173878	141174028	141173977	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	29861	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	141319185	141319480	141319327	Y	RASA2	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	115296	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr3	141458120	141458481	141458300	Y	RASA2	RNF7	NA	NA	NA	NA	RNF7	3074	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr3	141482175	141482451	141482314	Y	NA	RNF7	NA	NA	NA	NA	RNF7	27129	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr3	141610914	141611173	141610928	Y	NA	ATP1B3	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	17948	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr3	141611491	141611772	141611584	Y	NA	ATP1B3	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	18525	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr3	141659994	141660128	141660061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	67028	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr3	141758240	141758617	141758356	Y	NA	RP11-343B5.1	NA	NA	NA	NA	RP11-343B5.1	2423	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	141887290	141887616	141887590	Y	NA	TFDP2	NA	NA	NA	NA	TFDP2	20904	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr3	142130035	142130079	142130067	Y	NA	RNU1-100P,XRN1	NA	NA	NA	NA	RNU1-100P	7132	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	142164400	142165110	142164972	Y	XRN1	RNU1-100P	NA	NA	NA	NA	XRN1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	142225702	142226031	142225867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRN1	60798	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	142580771	142580984	142580878	Y	NA	RP11-372E1.1,PCOLCE2	NA	NA	NA	NA	PCOLCE2	25061	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	142585828	142586021	142585923	Y	NA	RP11-372E1.1,PCOLCE2	NA	NA	NA	NA	PCOLCE2	20024	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	142723898	142724007	142723903	Y	NA	U2SURP	NA	NA	NA	NA	U2SURP	42559	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr3	142804014	142804376	142804307	Y	NA	NA	CHST2	K562	ChIA-PET	22265404	PBX2P1	88751	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	143162621	143163181	143162827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX2P1	269494	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	143352573	143352896	143352700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC9A9	212477	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr3	143693787	143694146	143693885	Y	C3orf58,C3orf58	C3orf58	NA	NA	NA	NA	C3orf58	5147	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr3	143696383	143696503	143696442	Y	C3orf58,C3orf58	C3orf58	NA	NA	NA	NA	C3orf58	7743	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	143705621	143705974	143705695	Y	C3orf58,C3orf58	C3orf58	NA	NA	NA	NA	C3orf58	16981	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	144134299	144134312	144134306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf58	445659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	145931100	145931141	145931121	Y	PLSCR5,PLSCR4	PLSCR4	NA	NA	NA	NA	PLSCR4	35825	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr3	145959602	145959992	145959865	Y	PLSCR4	PLSCR4	NA	NA	NA	NA	PLSCR4	6974	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	146031799	146032049	146031857	Y	PLSCR4	NA	PLOD2	IMR90	Hi-C	24141950	PLSCR4	64833	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18278236002221
chr3	146259909	146260381	146260206	Y	PLSCR1	PLSCR2,PLSCR1	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	270	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr3	146955604	146955955	146955778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	694953	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	147663875	147664087	147663997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P20	218998	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	148704982	148705163	148705084	Y	NA	GYG1	HLTF,GYG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GYG1	1965	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.1996972976985
chr3	148781596	148781850	148781723	Y	NA	HLTF	NA	NA	NA	NA	HLTF	20491	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	148864917	148865175	148865046	Y	NA	HPS3	NA	NA	NA	NA	HPS3	19546	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	148942843	148943311	148943144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-206M11.7	57258	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.299102907177861
chr3	149057749	149057981	149057865	Y	NA	TM4SF1	NA	NA	NA	NA	TM4SF1	35671	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr3	149099928	149100323	149100052	Y	TM4SF1	TM4SF1	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1	IMR90	Hi-C	24141950	TM4SF1	6276	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.84324291305523
chr3	149104739	149105065	149104981	Y	COMMD2,TM4SF1	TM4SF1	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TM4SF1	11087	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.98051210746812
chr3	149108520	149108892	149108690	Y	COMMD2,TM4SF1	TM4SF1	WWTR1,HLTF,HPS3,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1-AS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TM4SF1	14868	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.234484356321151
chr3	149119420	149119639	149119543	Y	NA	TM4SF1	WWTR1,ANKUB1	IMR90	Hi-C	24141950	TM4SF1	25768	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr3	149151278	149151442	149151363	Y	NA	NA	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,WWTR1,WWTR1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	TM4SF1	57626	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr3	149265788	149265935	149265852	Y	WWTR1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	55341	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	149284462	149284628	149284613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	74015	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr3	149330317	149330600	149330464	Y	WWTR1,WWTR1,WWTR1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	119870	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	149657313	149657850	149657694	Y	TSC22D2,RNF13	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	26322	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr3	150086629	150086866	150086749	Y	NA	TSC22D2	RNF13,PFN2,TSC22D2,SERP1,EIF2A,LOC646903	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D2	37256	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	150089534	150090066	150089791	Y	NA	TSC22D2	TSC22D2,LOC646903,RNF13,PFN2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D2	34056	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr3	150329194	150329427	150329421	Y	NA	SELT,SERP1	NA	NA	NA	NA	SERP1	10179	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr3	150417166	150417289	150417212	Y	NA	RP11-103G8.2,FAM194A	NA	NA	NA	NA	RP11-103G8.2	2062	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	150478267	150478712	150478564	Y	TSC22D2,SERP1,SELT,GPR171,SIAH2	SIAH2-AS1,SIAH2	NA	NA	NA	NA	SIAH2-AS1	543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr3	150482569	150482635	150482602	Y	NA	SIAH2-AS1,SIAH2	NA	NA	NA	NA	SIAH2	3305	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	151582597	151582803	151582700	Y	NA	NA	MED12L	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-64D22.2	96381	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	151739734	151740181	151739895	Y	NA	NA	MBNL1	IMR90	Hi-C	24141950	MBNL1	219436	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	151970606	151970904	151970617	Y	NA	MBNL1,MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1	10989	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	151993494	151994006	151993570	Y	NA	MBNL1,MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	8150	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr3	151996540	151996946	151996646	Y	NA	MBNL1,MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	11196	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	152030036	152030551	152030147	Y	MBNL1,MBNL1	MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	44692	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr3	152121454	152121974	152121660	Y	MBNL1	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	136110	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	152856443	152856813	152856615	Y	RAP2B	RAP2B	RAP2B	MCF7	ChIA-PET	22265404	RAP2B	21216	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr3	154787580	154787808	154787649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PABPC1P10	237788	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	156252887	156253352	156253202	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	17621	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr3	156268270	156268550	156268410	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	2423	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	156403084	156403595	156403347	Y	LEKR1,LEKR1,CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	TIPARP,TIPARP-AS1	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	12917	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	156432757	156433079	156432845	Y	CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	TIPARP,TIPARP-AS1	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	42590	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr3	156502026	156502257	156502105	Y	SSR3	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	PA2G4P4	24264	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	156527707	156527883	156527795	Y	NA	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	PA2G4P4	1186	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr3	156530301	156530778	156530576	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	LINC00886	2073	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr3	157935893	157935900	157935896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSRC1	114249	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	158447066	158447110	158447086	Y	NA	MFSD1,RP11-379F4.4,RARRES1	NA	NA	NA	NA	MFSD1	877	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	159480182	159480541	159480238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCHIP1	75109	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	159542121	159542517	159542198	Y	NA	SCHIP1	NA	NA	NA	NA	SCHIP1	13133	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	159983948	159984179	159984064	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC4	130883	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	160014353	160014630	160014494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC4	100432	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	160177930	160178178	160178054	Y	NA	TRIM59	TRIM59	K562	ChIA-PET	22265404	TRIM59	23383	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.147265152209192
chr3	160267928	160268193	160268163	Y	NA	SCARNA7,KPNA4	NA	NA	NA	NA	KPNA4	13183	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr3	160949185	160949470	160949344	Y	OTOL1	NA	NA	NA	NA	NA	NMD3	128701	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr3	163153271	163153291	163153281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMD3	2332787	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr3	165215447	165215733	165215492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCHE	337527	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr3	165215973	165216343	165216172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCHE	336917	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr3	167243322	167243651	167243487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD10	207076	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	167737805	167738014	167737910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOLIM4	73749	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	168939202	168939471	168939359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	439935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr3	169075984	169076327	169076322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	303079	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr3	169172792	169172932	169172865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	206474	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	169299138	169299197	169299168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	80209	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr3	169300300	169300658	169300540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	78748	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.139807279150677
chr3	169344202	169344434	169344318	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	34972	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	169376858	169377055	169376957	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	2351	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr3	169377431	169377952	169377740	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	1454	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr3	169378305	169378656	169378554	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	750	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr3	169379063	169379412	169379208	Y	MECOM	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr3	169379831	169380308	169379976	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	425	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr3	169482089	169482431	169482154	Y	NA	TERC,MYNN	NA	NA	NA	NA	TERC	1241	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.231755015571524
chr3	169494029	169494036	169494033	Y	NA	TERC,MYNN	NA	NA	NA	NA	MYNN	5410	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	169502698	169502873	169502785	Y	GPR160,MYNN,LRRC34	TERC,MYNN	NA	NA	NA	NA	MYNN	14079	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	169508571	169508792	169508647	Y	NA	TERC,MYNN	NA	NA	NA	NA	MYNN	19952	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	169872442	169872609	169872497	Y	NA	PHC3	NA	NA	NA	NA	PHC3	24928	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	169941070	169941418	169941334	Y	MYNN,MYNN,LRRIQ4,PHC3	PHC3,PRKCI	NA	NA	NA	NA	PRKCI	2917	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr3	170073991	170074311	170074218	Y	SKIL,SKIL	SKIL	NA	NA	NA	NA	SKIL	525	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr3	170469010	170469069	170469037	Y	CLDN11,CLDN11,EIF5A2	NA	SLC7A14,CLDN11,SKIL	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22L1	117203	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr3	170527835	170528013	170527928	Y	NA	NA	SLC7A14,CLDN11,SKIL,PRKCI	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22L1	58259	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr3	170584649	170585013	170584680	Y	NA	RPL22L1,EIF5A2	NA	NA	NA	NA	RPL22L1	1259	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr3	170613123	170613340	170613232	Y	NA	RPL22L1,EIF5A2	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	11142	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	170807604	170807852	170807633	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	183122	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	171531632	171532210	171532036	Y	FNDC3B,PLD1	PP13439,PLD1	PLD1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PLD1	4892	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	171542633	171542898	171542814	Y	FNDC3B,PLD1	PP13439,PLD1	FNDC3B,PLD1,TMEM212	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLD1	15893	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr3	171543191	171543627	171543455	Y	FNDC3B,PLD1	PP13439,PLD1	FNDC3B,PLD1,TMEM212	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLD1	16451	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr3	171592038	171592451	171592208	Y	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	PLD1	65298	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr3	171594447	171594730	171594655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLD1	67707	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.190240233080725
chr3	171597232	171597577	171597404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLD1	70492	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	171678764	171678932	171678818	Y	NA	NA	PLD1,FNDC3B,TMEM212,TNIK	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3B	76486	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr3	171684878	171685278	171685188	Y	PLD1,FNDC3B	NA	PLD1,FNDC3B,TMEM212	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3B	70140	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.258354051945294
chr3	171816708	171816982	171816800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	61290	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	171825348	171825521	171825406	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	69930	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	171826024	171826613	171826515	Y	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	70606	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	171847438	171848726	171847798	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	92020	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr3	171855430	171855856	171855550	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	100012	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	171858231	171859026	171858504	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	102813	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr3	171863188	171863575	171863224	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	107770	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	171878014	171878468	171878150	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	122596	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	171927297	171927567	171927433	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	171879	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr3	171948409	171948713	171948561	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	192991	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	172038895	172038985	172038971	Y	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	BZW1P1	103894	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	172280796	172281206	172280981	Y	TNFSF10,TNFSF10	TNFSF10	NCEH1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF10	41499	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	172416643	172417031	172416658	Y	NA	NCEH1,ECT2	NA	NA	NA	NA	NCEH1	9977	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr3	172467147	172467552	172467259	Y	NA	NCEH1,ECT2,RNU4-4P	NCEH1,ECT2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ECT2	675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.402506899775743
chr3	176912879	176913389	176913098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr3	176916249	176916425	176916364	Y	NA	TBL1XR1	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	2988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr3	177076157	177076922	177076435	Y	TBL1XR1	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	162896	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20353975126761
chr3	177077500	177078084	177077832	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	164239	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr3	177167081	177167399	177167234	Y	NA	NA	TBL1XR1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TBL1XR1	253820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	177167478	177167833	177167747	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90	Hi-C	24141950	TBL1XR1	254217	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	177623365	177623625	177623388	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90	Hi-C	24141950	TBL1XR1	710104	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	178671519	178671916	178671775	Y	NA	NA	KCNMB2	IMR90	Hi-C	24141950	ZMAT3	116151	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	178978348	178978737	178978528	Y	PIK3CA,MFN1,GNB4	LRRFIP1P1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1P1	1287	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.403620012595225
chr3	179165833	179166212	179166067	Y	NA	GNB4	NA	NA	NA	NA	GNB4	1166	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	179182237	179182507	179182372	Y	NA	GNB4	GNB4	IMR90	Hi-C	24141950	GNB4	14859	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	179309053	179309431	179309273	Y	NA	ACTL6A,MRPL47,NDUFB5	NA	NA	NA	NA	MRPL47	11011	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr3	179372057	179372188	179372123	Y	NA	USP13	NA	NA	NA	NA	USP13	3514	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	179471930	179472312	179472121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP13	103387	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr3	180040639	180040822	180040650	Y	NA	NA	PEX5L	IMR90	Hi-C	24141950	TTC14	277096	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	181474625	181474969	181474797	Y	SOX2	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC19	769063	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	181537254	181537571	181537413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC19	831692	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	182645862	182646115	182645990	Y	MCF2L2,MCCC1	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D1	55626	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr3	182825824	182825958	182825903	Y	NA	MCCC1	NA	NA	NA	NA	MCCC1	5905	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.279458628751944
chr3	182978108	182978472	182978157	Y	ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24	NA	NA	NA	NA	NA	MCCC1	146245	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	182980917	182981737	182981029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCC1	149054	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr3	183003579	183004143	183003750	Y	ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L2	140423	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.80618058184236
chr3	183010054	183010455	183010255	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L2	134111	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr3	183024720	183025033	183024891	Y	B3GNT5,KLHL6,KLHL24	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L2	119533	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	183726020	183726143	183726081	Y	NA	ABCC5,EEF1A1P8	PARL	IMR90	Hi-C	24141950	ABCC5	7660	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	184078263	184078665	184078465	Y	NA	EIF4G1,FAM131A,CLCN2,POLR2H,CHRD	NA	NA	NA	NA	POLR2H	757	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	184560038	184560430	184560098	Y	VPS8	VPS8	NA	NA	NA	NA	VPS8	32107	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr3	184655907	184656134	184656021	Y	VPS8	NA	NA	NA	NA	NA	VPS8	127976	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	184727770	184727947	184727859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS8	199839	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	184775166	184775451	184775309	Y	VPS8	NA	NA	NA	NA	NA	EIF2S2P2	186778	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr3	185034789	185035224	185034953	Y	NA	EHHADH,MAP3K13	NA	NA	NA	NA	MAP3K13	36060	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr3	185215412	185215562	185215482	Y	NA	TMEM41A	NA	NA	NA	NA	TMEM41A	567	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	185339016	185339200	185339107	Y	NA	SENP2,RP11-537I16.2	NA	NA	NA	NA	RP11-537I16.2	16653	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr3	186695100	186695431	186695266	Y	RTP1	ST6GAL1	NA	NA	NA	NA	ST6GAL1	48826	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	186746012	186746360	186746185	Y	RTP1,ST6GAL1	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GAL1	99738	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	186819692	186820086	186819740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL39L	76610	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.617850092781637
chr3	187004502	187004623	187004526	Y	MASP1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL39L	107806	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.781754101636163
chr3	187459288	187459644	187459469	Y	RTP4,BCL6,BCL6,BCL6	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	1871	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	187566904	187567160	187566982	Y	RTP4,BCL6,BCL6,BCL6	NA	LPP,BCL6	IMR90	Hi-C	24141950	BCL6	105389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	187673173	187673416	187673302	Y	RTP2,BCL6,BCL6	NA	BCL6,LPP,LPP-AS2	IMR90	Hi-C	24141950	LPP	195656	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr3	187682660	187682900	187682757	Y	BCL6,BCL6	NA	BCL6,LPP,LPP-AS2	IMR90	Hi-C	24141950	LPP	186172	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	187686706	187686977	187686870	Y	BCL6,BCL6	NA	BCL6,LPP,LPP-AS2	IMR90	Hi-C	24141950	LPP	182095	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	187690684	187690704	187690694	Y	RTP2	NA	BCL6,LPP	IMR90	Hi-C	24141950	LPP	178368	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	187704282	187704692	187704483	Y	BCL6,BCL6	NA	BCL6,LPP,LPP-AS2	IMR90	Hi-C	24141950	LPP	164380	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	187883507	187883633	187883573	Y	NA	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	13662	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	187891343	187891657	187891500	Y	NA	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	21498	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr3	187901313	187901616	187901372	Y	NA	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	31468	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr3	187904912	187905263	187905013	Y	BCL6,BCL6	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	35067	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	187983465	187984215	187983993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	113620	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	188057374	188057458	188057417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	187529	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	188155903	188156126	188156022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	286058	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr3	188405130	188405536	188405435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1-AS1	257892	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	188537744	188538118	188537883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1-AS1	125310	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr3	188986096	188986296	188986196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1-AS1	322668	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr3	189022377	189022942	189022424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1-AS1	358949	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr3	189034066	189034494	189034299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1-AS1	370638	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr3	189111445	189111690	189111608	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1-AS1	448017	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr3	189524070	189524362	189524216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLDN1	513902	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	189628932	189629095	189629014	Y	CLDN1,TP63	NA	NA	NA	NA	NA	CLDN1	409169	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	190062904	190063381	190063085	Y	LEPREL1,CLDN1,CLDN16	CLDN1	LEPREL1,CLDN1,CLDN16	IMR90	Hi-C	24141950	CLDN1	24640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr3	190104242	190104447	190104367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLDN1	65978	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr3	192289148	192289495	192289213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MB21D2	344455	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	192634153	192634990	192634777	Y	MB21D2	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	203	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr3	192873675	192873788	192873739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MB21D2	239725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.343347030418287
chr3	193807302	193807696	193807488	Y	ATP13A3,HES1	HES1	HES1,LOC100131551,LOC647323	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HES1	44238	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.330430475860518
chr3	193851636	193853009	193852912	Y	ATP13A3,HES1	NA	NA	NA	NA	NA	HES1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.558187108313521
chr3	193858651	193858843	193858731	Y	NA	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	6717	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.259970279875438
chr3	193859199	193859624	193859359	Y	TMEM44	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	7265	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.487343948699325
chr3	193876735	193877026	193876899	Y	NA	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	24801	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.292375183309713
chr3	194022185	194022450	194022442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC15	66022	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	194040514	194040910	194040840	Y	HES1	LRRC15	NA	NA	NA	NA	LRRC15	47562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.07595511189682
chr3	194041526	194041906	194041553	Y	HES1	LRRC15	NA	NA	NA	NA	LRRC15	46566	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr3	194048965	194049014	194048990	Y	NA	LRRC15	NA	NA	NA	NA	LRRC15	39458	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	194153543	194153935	194153911	Y	ATP13A3	NA	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	63158	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr3	194227767	194228126	194227819	Y	ATP13A3	ATP13A3	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	10674	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	194242291	194242478	194242395	Y	ATP13A3	ATP13A3	TMEM44,ATP13A3,GP5,FLJ34208,LSG1	IMR90	Hi-C	24141950	ATP13A3	25198	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	194247870	194248550	194248205	Y	HES1,ATP13A3	ATP13A3	ATP13A3,GP5,TMEM44,FLJ34208	IMR90	Hi-C	24141950	ATP13A3	30777	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr3	194282077	194282468	194282283	Y	NA	TMEM44-AS1	ATP13A3,TMEM44,LRRC15,CPN2,FLJ34208,XXYLT1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM44-AS1	20272	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr3	194298758	194299295	194298977	Y	NA	TMEM44-AS1	ATP13A3,FLJ34208	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM44-AS1	3445	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	194341751	194341921	194341813	Y	NA	TMEM44-AS1,AC046143.3,TMEM44,LSG1	NA	NA	NA	NA	AC046143.3	9731	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	194561866	194562021	194561957	Y	FAM43A	NA	LOC100507391,XXYLT1,ACAP2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM43A	157244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	194754255	194754281	194754268	Y	NA	NA	XXYLT1,LOC100507391,LSG1,FAM43A,PPP1R2	IMR90	Hi-C	24141950	XXYLT1	235615	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr3	194824432	194824598	194824501	Y	PPP1R2	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	165298	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	194826238	194826399	194826316	Y	FAM43A	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	163497	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	194839135	194839291	194839213	Y	FAM43A,C3orf21	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	150605	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	194843909	194844196	194844053	Y	APOD	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	145700	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	194871039	194871493	194871089	Y	FAM43A,C3orf21	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	118403	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	194881062	194881476	194881270	Y	FAM43A,C3orf21	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	108420	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	194898663	194899282	194898930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	90614	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	194909017	194909237	194909137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	80659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr3	194973636	194973680	194973658	Y	NA	XXYLT1	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	16216	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	194979031	194979323	194979161	Y	NA	XXYLT1	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	10573	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	195073897	195074088	195073990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	84001	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	195264699	195265107	195264994	Y	ACAP2,TNK2,PPP1R2	PPP1R2,APOD	NA	NA	NA	NA	PPP1R2	3102	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr3	195542423	195542578	195542499	Y	MUC20,MUC4	AC124944.5	NA	NA	NA	NA	AC124944.5	42697	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	195573980	195574341	195574135	Y	MUC20,MUC4	AC124944.5	NA	NA	NA	NA	AC124944.5	10934	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr3	195628817	195629072	195628853	Y	NA	AC124944.5,TNK2	NA	NA	NA	NA	TNK2	7744	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	195854063	195854320	195854202	Y	TFRC,TFRC	TFRC	LOC401109,PCYT1A,TFRC,MIR570,MUC20,UBXN7	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFRC	47003	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr3	195921077	195921299	195921227	Y	UBXN7,RNF168,LRRC33,TM4SF19,PCYT1A	NA	NA	NA	NA	NA	PCYT1A	91529	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	196047617	196047878	196047747	Y	NA	PCYT1A,TCTEX1D2,TM4SF19	NA	NA	NA	NA	TCTEX1D2	4447	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr3	196244998	196245175	196245085	Y	NA	RNF168,FBXO45,WDR53	NA	NA	NA	NA	RNF168	16359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	196255741	196255873	196255820	Y	NA	RNF168,FBXO45,WDR53	UBXN7,MUC20,RNF168,C3orf43,PCYT1A,TM4SF19-TCTEX1D2,WDR53,FBXO45,CEP19	IMR90	Hi-C	24141950	RNF168	27102	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	196339004	196339201	196339061	Y	LRRC33	FBXO45,WDR53,LINC01063,PIGX	PCYT1A,TCTEX1D2,FBXO45,WDR53,CEP19,PIGX,LRRC33,PAK2,MFI2,MFI2-AS1,SENP5	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01063	18257	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	196437709	196437842	196437776	Y	NA	CEP19,PAK2	NA	NA	NA	NA	CEP19	545	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr3	196635737	196635948	196635847	Y	UBXN7,RNF168,CEP19,PIGX,PAK2,SENP5	SENP5,NCBP2	NA	NA	NA	NA	NCBP2	31520	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.276729288002317
chr3	196696811	196697020	196696957	Y	LRRC33,PIGZ	NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1	NA	NA	NA	NA	PIGZ	2880	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.871475612418044
chr3	196995168	196995509	196995411	Y	NA	DLG1	NA	NA	NA	NA	DLG1	28662	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	197007663	197007913	197007866	Y	NA	DLG1	NA	NA	NA	NA	DLG1	16258	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr3	197036480	197036785	197036693	Y	NA	DLG1	NA	NA	NA	NA	DLG1	12309	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	197153931	197154131	197153988	Y	MFI2,MFI2	NA	BDH1,DLG1,LOC100507086	IMR90	Hi-C	24141950	DLG1	129760	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	197214864	197215009	197214889	Y	NA	NA	DLG1,LOC100507086,BDH1,MFI2	IMR90	Hi-C	24141950	BDH1	83185	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr3	197216995	197217339	197217145	Y	DLG1	NA	NA	NA	NA	NA	BDH1	80855	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr3	197264445	197264691	197264611	Y	NA	BDH1	NA	NA	NA	NA	BDH1	33503	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr3	197439165	197439566	197439302	Y	IQCG,LRCH3,KIAA0226	MIR922,FYTTD1,KIAA0226	NA	NA	NA	NA	FYTTD1	22484	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr3	197478210	197478491	197478305	Y	IQCG,KIAA0226,FYTTD1,FYTTD1,LRCH3	FYTTD1,KIAA0226,LRCH3	NA	NA	NA	NA	KIAA0226	3612	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr4	330052	330352	330160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCA11P	135566	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	683740	684022	683889	Y	GAK,MYL5,MFSD7,PCGF3	MYL5,ATP5I,PCGF3	NA	NA	NA	NA	PCGF3	13515	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr4	693278	693552	693364	Y	GAK,MFSD7,PCGF3	MYL5,ATP5I,PCGF3	NA	NA	NA	NA	PCGF3	3985	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr4	751950	752022	752014	Y	NA	RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	21615	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200810410517982
chr4	765995	766248	766202	Y	NA	RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	7389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	899253	899541	899397	Y	NA	GAK,TMEM175	NA	NA	NA	NA	GAK	24620	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	924714	925388	925028	Y	MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,IDUA,GAK	GAK,TMEM175	NA	NA	NA	NA	TMEM175	539	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	1027686	1027967	1027729	Y	FGFRL1,FGFRL1,FGFRL1	DGKQ,IDUA,FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	25962	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	1037465	1037841	1037534	Y	MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,GAK,IDUA	FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	35741	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr4	1129933	1130282	1130090	Y	NA	RNF212	RNF212,TMED11P,KIAA1530,SPON2,CTBP1,C4orf42,MAEA,FAM53A,SLBP	IMR90	Hi-C	24141950	RNF212	24583	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr4	1170900	1171323	1171147	Y	GAK,DGKQ,KIAA1530	NA	NA	NA	NA	NA	RNF212	65550	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	1181039	1181331	1181185	Y	DGKQ,RNF212	NA	NA	NA	NA	NA	CTBP1	60410	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	1184509	1184886	1184846	Y	RNF212,CRIPAK	NA	NA	NA	NA	NA	CTBP1	56855	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	1237849	1238004	1237927	Y	NA	CTBP1,MAEA	NA	NA	NA	NA	CTBP1	3737	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	1339592	1340250	1339850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEA	57953	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr4	1562061	1562319	1562152	Y	NA	RP11-1398P2.1	NA	NA	NA	NA	RP11-1398P2.1	17661	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	1710531	1710811	1710671	Y	NA	SLBP,TMEM129,TACC3	NA	NA	NA	NA	SLBP	1471	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr4	1712467	1712893	1712787	Y	WHSC1	SLBP,TMEM129,TACC3	NA	NA	NA	NA	SLBP	185	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr4	1769544	1769746	1769644	Y	FGFR3	TMEM129,TACC3,FGFR3	FGFR3	MCF7	ChIA-PET	22265404	FGFR3	23288	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr4	1796551	1796852	1796752	Y	NA	FGFR3	NA	NA	NA	NA	FGFR3	3517	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	1874737	1875082	1874826	Y	WHSC1	LETM1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	WHSC1	3586	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	1875191	1875366	1875328	Y	NA	LETM1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	WHSC1	4040	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr4	1966776	1967112	1967086	Y	WHSC1,WHSC1	SCARNA22	NA	NA	NA	NA	SCARNA22	7251	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr4	1972677	1973039	1972858	Y	WHSC1	SCARNA22	NA	NA	NA	NA	SCARNA22	1324	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	2414575	2415364	2414914	Y	HAUS3,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,ZFYVE28,RNF4,RNF4,LOC402160	ZFYVE28,RNF4	NA	NA	NA	NA	ZFYVE28	3026	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	2537711	2538436	2538089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	75764	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.364834570854054
chr4	2538945	2539718	2539367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	76998	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.170751884204219
chr4	2574508	2574529	2574516	Y	NA	NA	POLN,MXD4,LOC402160,RNF4,FAM193A,TNIP2,ADD1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF4	112561	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr4	2764467	2764789	2764630	Y	LOC402160	TNIP2,SH3BP2	TNIP2,NOP14-AS1,NOP14,MFSD10	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TNIP2	8364	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.493185593827696
chr4	3085381	3085754	3085447	Y	NA	HTT	NA	NA	NA	NA	HTT	10973	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	3293872	3294174	3294028	Y	NA	RGS12	RGS12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RGS12	1117	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr4	3391112	3391254	3391201	Y	RGS12	NA	NA	NA	NA	NA	RGS12	98357	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	3438789	3438989	3438900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRPAP1	93297	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.252129443187807
chr4	3484611	3485071	3484896	Y	NA	LRPAP1	NA	NA	NA	NA	LRPAP1	47215	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	3492056	3492792	3492287	Y	DOK7	LRPAP1	NA	NA	NA	NA	LRPAP1	39494	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	4577048	4577566	4577357	Y	NA	STX18-AS1,STX18	NA	NA	NA	NA	STX18	34975	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr4	6635412	6635534	6635472	Y	NA	MRFAP1,AC093323.3,RP11-539L10.3	NA	NA	NA	NA	MRFAP1	4284	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr4	6734442	6734743	6734533	Y	KIAA0232	S100P,MRFAP1L1,KIAA0232	NA	NA	NA	NA	MRFAP1L1	24835	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.355533435785689
chr4	6785099	6785509	6785391	Y	TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232	KIAA0232	NA	NA	NA	NA	KIAA0232	3997	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.398508516657222
chr4	6809071	6809294	6809183	Y	TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232	KIAA0232	NA	NA	NA	NA	KIAA0232	27969	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	6934348	6934486	6934417	Y	NA	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	25379	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	6959680	6959690	6959685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	50711	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	7122134	7122443	7122315	Y	NA	NA	ABLIM2,SORCS2,GRPEL1	IMR90	Hi-C	24141950	GRPEL1	54210	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	7191564	7191944	7191754	Y	NA	SORCS2	NA	NA	NA	NA	SORCS2	321	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	7208150	7208325	7208274	Y	NA	SORCS2	NA	NA	NA	NA	SORCS2	15885	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr4	7209017	7209262	7209117	Y	NA	SORCS2	NA	NA	NA	NA	SORCS2	16752	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr4	7510082	7510101	7510091	Y	SORCS2	NA	NA	NA	NA	NA	SORCS2	317817	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	7649791	7650390	7650086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	289263	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.155836138087189
chr4	7834057	7834311	7834184	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	105342	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr4	7868592	7868926	7868734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	70727	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	7962509	7962775	7962724	Y	NA	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	22856	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr4	7966281	7966672	7966392	Y	NA	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	26628	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	7972368	7972631	7972565	Y	NA	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	32715	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr4	7974971	7975417	7975298	Y	AFAP1	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	35318	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	7975985	7976228	7976096	Y	NA	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	36332	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr4	8614691	8614733	8614712	Y	NA	CPZ	NA	NA	NA	NA	CPZ	22304	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	8617311	8617700	8617508	Y	NA	CPZ	NA	NA	NA	NA	CPZ	24924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr4	9154755	9155069	9154900	Y	NA	FAM86KP	NA	NA	NA	NA	FAM86KP	1733	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr4	11489568	11489726	11489663	Y	NA	NA	CLNK,HS3ST1	IMR90	Hi-C	24141950	HS3ST1	60179	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr4	12642016	12642195	12642111	Y	NA	RP11-352E6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-352E6.2	1755	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.38247965772071
chr4	13329661	13329866	13329822	Y	NA	HSP90AB2P	HSP90AB2P	IMR90	Hi-C	24141950	HSP90AB2P	3172	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr4	13439753	13439937	13439845	Y	NA	RAB28	NA	NA	NA	NA	RAB28	44052	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	13484540	13485001	13484899	Y	NA	RAB28	NA	NA	NA	NA	RAB28	551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	13613048	13613249	13613164	Y	NA	AC006445.7	NA	NA	NA	NA	AC006445.7	18974	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	15036867	15037072	15036952	Y	NA	CPEB2	NA	NA	NA	NA	CPEB2	34569	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr4	15074859	15075210	15075035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB2	72561	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	15594702	15595080	15594956	Y	FBXL5	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	86205	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	15651682	15652058	15651870	Y	NA	FAM200B,FBXL5	NA	NA	NA	NA	FAM200B	29227	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	15655935	15656313	15656300	Y	FBXL5,BST1	FAM200B,FBXL5	NA	NA	NA	NA	FAM200B	24972	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr4	15675759	15675987	15675856	Y	CD38,FBXL5,BST1	FAM200B,FBXL5	CC2D2A	IMR90	Hi-C	24141950	FAM200B	5298	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	15684115	15684561	15684231	Y	FBXL5,FAM200B,BST1	FAM200B,FBXL5,RP11-115L11.1	NA	NA	NA	NA	FBXL5	2813	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr4	15895700	15895839	15895750	Y	FGFBP1	FGFBP1	CC2D2A	IMR90	Hi-C	24141950	FGFBP1	42524	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	15907638	15908044	15907859	Y	FBXL5,BST1,FGFBP1	FGFBP1	BST1	IMR90	Hi-C	24141950	FGFBP1	30319	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.333889965800512
chr4	15922988	15923279	15923080	Y	FGFBP1	FGFBP1	NA	NA	NA	NA	FGFBP1	15084	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	16629750	16630155	16629855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS21P4	373572	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr4	17483580	17483992	17483821	Y	QDPR,CLRN2	QDPR	NA	NA	NA	NA	QDPR	27865	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	17642152	17642177	17642165	Y	CLRN2	MED28	NA	NA	NA	NA	MED28	27898	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	17829390	17829398	17829394	Y	CLRN2,NCAPG	DCAF16,NCAPG	NA	NA	NA	NA	NCAPG	18865	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	17853657	17853735	17853696	Y	NA	DCAF16,NCAPG	NA	NA	NA	NA	NCAPG	43132	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr4	17979858	17980211	17980206	Y	CLRN2,LCORL	LCORL	NA	NA	NA	NA	LCORL	41288	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	20197125	20197285	20197196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PACRGL	498620	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	20521707	20522059	20521739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PACRGL	173846	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	20627000	20627372	20627197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PACRGL	68533	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	21602576	21603408	21603328	Y	KCNIP4,KCNIP4,KCNIP4	NA	NA	NA	NA	NA	PACRGL	906671	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	21619972	21620195	21620166	Y	KCNIP4,KCNIP4,KCNIP4	NA	NA	NA	NA	NA	GPR125	895482	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	22743232	22743512	22743354	Y	NA	CDC42P6	NA	NA	NA	NA	CDC42P6	15659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	23335645	23335866	23335720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPARGC1A	567846	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	23879721	23879980	23879976	Y	NA	PPARGC1A	NA	NA	NA	NA	PPARGC1A	23732	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	23890124	23890507	23890316	Y	PPARGC1A	PPARGC1A	NA	NA	NA	NA	PPARGC1A	13205	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	23890635	23890864	23890849	Y	NA	PPARGC1A	NA	NA	NA	NA	PPARGC1A	12848	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr4	24050121	24050356	24050240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPARGC1A	146409	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	24079320	24079729	24079712	Y	NA	NA	PPARGC1A	IMR90	Hi-C	24141950	PPARGC1A	175608	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr4	24107474	24107652	24107563	Y	NA	NA	PPARGC1A	IMR90	Hi-C	24141950	PPARGC1A	203762	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.155836138087189
chr4	24212017	24212413	24212209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPARGC1A	308305	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.337002270179255
chr4	24220772	24221175	24221047	Y	PPARGC1A	NA	NA	NA	NA	NA	PPARGC1A	317060	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.549772051984935
chr4	24227575	24227894	24227795	Y	NA	NA	PPARGC1A	IMR90	Hi-C	24141950	PPARGC1A	323863	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr4	24262994	24263251	24263044	Y	NA	NA	PPARGC1A	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	320922	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.741125397885142
chr4	24263388	24263431	24263410	Y	NA	NA	PPARGC1A	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	320742	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr4	24263661	24263923	24263768	Y	NA	NA	PPARGC1A	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	320250	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.539428908627382
chr4	24322640	24323331	24322979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHX15	260842	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	31.3430635207358
chr4	24324211	24324732	24324357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHX15	259441	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.08207283805615
chr4	24324929	24325054	24324992	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHX15	259119	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.330047512231402
chr4	24332761	24333117	24332939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHX15	251056	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.610236290173713
chr4	24346800	24347040	24346920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHX15	237133	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	24474307	24474984	24474891	Y	NA	NA	PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	109189	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr4	24660007	24660225	24660117	Y	NA	ATP5LP3	CCDC149,MIR573	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5LP3	2009	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr4	25175369	25175577	25175408	Y	NA	SEPSECS,PI4K2B	NA	NA	NA	NA	PI4K2B	15106	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.135808896032157
chr4	25554656	25554918	25554808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-302F12.1	123554	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	25828026	25828318	25828201	Y	NA	SEL1L3	NA	NA	NA	NA	SEL1L3	35064	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	26123354	26123506	26123386	Y	NA	RBPJ	RBPJ,STIM2	IMR90	Hi-C	24141950	RBPJ	39571	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	30718904	30719447	30718947	Y	PCDH7,PCDH7	PCDH7	NA	NA	NA	NA	PCDH7	590	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.477312664440594
chr4	30719661	30720023	30719741	Y	PCDH7,PCDH7	PCDH7	NA	NA	NA	NA	PCDH7	14	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr4	34183539	34183770	34183747	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	2060361	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr4	36019806	36020078	36020073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	224053	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr4	36183139	36183486	36183313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	60645	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	36210207	36210423	36210315	Y	NA	ARAP2	NA	NA	NA	NA	ARAP2	33708	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	36243506	36243686	36243606	Y	NA	ARAP2,DTHD1	NA	NA	NA	NA	ARAP2	445	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	37668347	37668621	37668474	Y	NA	RELL1	NA	NA	NA	NA	RELL1	17377	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr4	37956443	37956472	37956456	Y	NA	PTTG2	NA	NA	NA	NA	PTTG2	3584	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr4	38080568	38081008	38080843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	120512	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr4	38159115	38159505	38159287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	199059	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.224297142513009
chr4	38162192	38162313	38162253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	202136	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr4	38320550	38320897	38320770	Y	NA	NA	FLJ13197,KLF3,TBC1D1,TLR10	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF3	342920	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	38665008	38665204	38665059	Y	TLR6,TLR1,KLHL5,KLF3	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	504	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr4	38668617	38669179	38668850	Y	KLF3	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	4113	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr4	38671040	38671097	38671090	Y	NA	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	6536	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	38673994	38674276	38674074	Y	NA	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	9490	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr4	38674773	38675062	38674906	Y	KLF3	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	10269	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr4	38679741	38680082	38679809	Y	NA	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	15237	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr4	38697805	38697826	38697816	Y	NA	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	33301	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	38859134	38859762	38859410	Y	KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6	TLR1,TLR6,FAM114A1	NA	NA	NA	NA	TLR1,TLR6	2696	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	5.86819130772567
chr4	38870386	38870769	38870503	Y	FAM114A1	TLR1,TLR6,FAM114A1	NA	NA	NA	NA	FAM114A1	3088	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr4	39045195	39045532	39045360	Y	NA	TMEM156,KLHL5	NA	NA	NA	NA	KLHL5	536	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	39641402	39641506	39641505	Y	NA	RP11-539G18.2	NA	NA	NA	NA	RP11-539G18.2	2642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr4	39894546	39894889	39894718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDS5A	82687	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	39908966	39909133	39909103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDS5A	68443	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr4	39913580	39913628	39913604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDS5A	63948	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	39933245	39933555	39933419	Y	NA	PDS5A	NA	NA	NA	NA	PDS5A	44021	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	40056293	40056591	40056356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP2	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	40057110	40057493	40057154	Y	RHOH,N4BP2	N4BP2	NA	NA	NA	NA	N4BP2	664	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr4	40181948	40182292	40182189	Y	RBM47	RHOH	NA	NA	NA	NA	RHOH	8381	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	40313713	40314128	40314012	Y	PDS5A,N4BP2,RHOH,RBM47	CHRNA9	N4BP2,RHOH,RBM47,LOC344967,NSUN7,CHRNA9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CHRNA9	21218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	40556143	40556529	40556261	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	RBM47	74363	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	40578690	40579499	40579160	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	RBM47	51393	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	40588724	40589296	40588980	Y	RBM47	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	41596	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	40589734	40590029	40589952	Y	RBM47	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	40863	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	40609271	40609510	40609444	Y	NA	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	21382	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	40623743	40623952	40623867	Y	RBM47	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	6940	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr4	40628627	40628976	40628881	Y	NA	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	1916	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	40674929	40675349	40675137	Y	RBM47	RBM47	RBM47	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RBM47	44037	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr4	40733927	40734212	40733987	Y	RBM47	NA	NSUN7,RBM47,N4BP2,CHRNA9	IMR90	Hi-C	24141950	RBM47	103035	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	40910052	40910602	40910542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM47	279160	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.45293985370579
chr4	41162074	41162440	41162321	Y	APBB2	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	54291	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	41363966	41364137	41364015	Y	LIMCH1,LIMCH1	LIMCH1	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	4342	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.292375183309713
chr4	41365518	41365934	41365651	Y	NA	LIMCH1	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	5894	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr4	41384257	41384615	41384267	Y	NA	LIMCH1	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	24633	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr4	41434914	41435283	41435075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	75290	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr4	41469951	41470276	41469966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	110327	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.135808896032157
chr4	41509451	41509766	41509557	Y	LIMCH1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	149827	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.301102098737121
chr4	41574178	41574364	41574271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	214554	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.164024160336071
chr4	41704988	41705115	41705052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00682	177513	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.218455497384639
chr4	41859260	41859639	41859308	Y	PHOX2B	LINC00682	PHOX2B	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00682	22989	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	41880927	41881193	41881022	Y	PHOX2B	LINC00682	PHOX2B,LIMCH1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00682	1435	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	41886373	41886653	41886561	Y	PHOX2B	LINC00682,TMEM33	PHOX2B,LIMCH1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00682	3745	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr4	41936193	41936441	41936268	Y	TMEM33	TMEM33	NA	NA	NA	NA	TMEM33	1056	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.234484356321151
chr4	42073690	42073968	42073740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC30A9	83201	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	44727575	44727855	44727678	Y	KCTD8,GNPDA2	GUF1,GNPDA2	NA	NA	NA	NA	GNPDA2	963	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr4	45914442	45914779	45914611	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAC1P2	809846	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	47464691	47464980	47464836	Y	NA	COMMD8,ATP10D	NA	NA	NA	NA	COMMD8	955	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr4	47495543	47495885	47495605	Y	COMMD8	COMMD8,ATP10D	NA	NA	NA	NA	ATP10D	10238	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	48130124	48130516	48130320	Y	TXK	NA	NA	NA	NA	NA	CNGA1	113435	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	48263385	48263565	48263503	Y	NA	TEC	TXK	IMR90	Hi-C	24141950	TEC	6316	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	48851417	48851730	48851443	Y	ZAR1,FRYL	OCIAD1	NA	NA	NA	NA	OCIAD1	46188	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr4	52725801	52726193	52725998	Y	NA	DCUN1D4	NA	NA	NA	NA	DCUN1D4	18635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr4	53725752	53726074	53725904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP46-AS1	202179	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	54794044	54794386	54794192	Y	NA	NA	SCFD2,PDGFRA,CHIC2,FIP1L1,LNX1,RPL21P44,GSX2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	134471	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.265428961374692
chr4	54866446	54866641	54866544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHIC2	62216	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	56178022	56178286	56178222	Y	TMEM165,SRD5A3	SRD5A3	KDR	IMR90	Hi-C	24141950	SRD5A3	31990	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	56379806	56379963	56379885	Y	NA	CLOCK	NA	NA	NA	NA	CLOCK	31342	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	57048653	57048701	57048677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP31	171600	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	57254661	57255026	57254688	Y	CEP135	RPL7AP31,AASDH,PPAT,PAICS	NA	NA	NA	NA	AASDH	2995	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	57313900	57314193	57314047	Y	NA	PPAT,PAICS,SRP72	NA	NA	NA	NA	PAICS	13993	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr4	57831930	57832208	57832081	Y	NA	POLR2B,NOA1	NA	NA	NA	NA	POLR2B	9680	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr4	65473910	65474488	65474148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-204H9.2	179283	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	66899965	66900079	66900021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-396M11.1	57765	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	66960590	66960760	66960693	Y	NA	RP11-396M11.1	NA	NA	NA	NA	RP11-396M11.1	2746	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.148378265028675
chr4	71695000	71695080	71695041	Y	NA	GRSF1	NA	NA	NA	NA	GRSF1	8582	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr4	73887463	73887489	73887476	Y	NA	COX18	ADAMTS3	IMR90	Hi-C	24141950	COX18	45983	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	74055104	74055142	74055123	Y	ANKRD17,ALB,AFM	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD17	67373	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr4	74545430	74545943	74545736	Y	CXCL6,CXCL1	NA	CXCL2,CXCL5,PPBP,PPBPL2,PF4	IMR90	Hi-C	24141950	IL8	58280	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	74549349	74549563	74549470	Y	MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2	NA	CXCL5,IL8,CXCL6,CXCL3,CXCL2	IMR90	Hi-C	24141950	IL8	54660	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	74569694	74570920	74570464	Y	ANKRD17,MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2	IL8	MTHFD2L	IMR90	Hi-C	24141950	IL8	33303	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr4	74922344	74922785	74922568	Y	IL8,MTHFD2L,EREG,CXCL3,CXCL2	CXCL3,CXCL2	CXCL3	K562	ChIA-PET	22265404	CXCL3	19820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr4	74961952	74962121	74962037	Y	IL8,MTHFD2L,EREG,CXCL3,CXCL2	CXCL2,MTHFD2L	NA	NA	NA	NA	CXCL2	889	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	74974477	74974715	74974630	Y	IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L	CXCL2,MTHFD2L	RASSF6	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFD2L	3176	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	74974850	74975280	74974976	Y	IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L	CXCL2,MTHFD2L	RASSF6	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFD2L	2611	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172595146214068
chr4	74975298	74975961	74975834	Y	CXCL1,AREG	CXCL2,MTHFD2L	RASSF6	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFD2L	1930	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.222297950953749
chr4	74977136	74977379	74977289	Y	IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L	CXCL2,MTHFD2L	RASSF6	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFD2L	512	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	74982637	74982975	74982882	Y	IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L	CXCL2,MTHFD2L	RASSF6,IL8,CXCL3,MTHFD2L,PF4,PPBPL2	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFD2L	4746	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr4	75183618	75183847	75183685	Y	CXCL3,CXCL2,MTHFD2L,EREG	EPGN,EREG	NA	NA	NA	NA	EPGN	11428	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr4	75187079	75187238	75187159	Y	EPGN	EPGN,EREG	NA	NA	NA	NA	EPGN	14889	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr4	75409847	75410209	75409849	Y	NA	NA	EREG	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EREG	180987	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	76750745	76750859	76750802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USO1	102968	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr4	77009750	77009882	77009792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP54	57786	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	77468225	77468282	77468244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	113972	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	77543952	77543974	77543961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	189699	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	77611633	77612016	77611712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT11	256840	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr4	77705263	77705447	77705355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT11	163409	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	77752154	77752315	77752229	Y	NA	NA	SHROOM3,SEPT11,SOWAHB	IMR90	Hi-C	24141950	SEPT11	116541	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr4	77928518	77929121	77928831	Y	CCNI,CCNG2	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT11	59662	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	78656019	78656351	78656260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNOT6L	82418	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	78711096	78711128	78711114	Y	NA	CNOT6L	NA	NA	NA	NA	CNOT6L	27641	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr4	78977894	78978171	78977912	Y	FRAS1	FRAS1	NA	NA	NA	NA	FRAS1	1170	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr4	78979777	78980204	78980085	Y	NA	FRAS1	NA	NA	NA	NA	FRAS1	3053	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr4	79264997	79265051	79265025	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA3	205622	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	79550555	79550802	79550658	Y	NA	LINC01094	NA	NA	NA	NA	LINC01094	14255	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr4	79579251	79579554	79579361	Y	BMP2K	LINC01094	NA	NA	NA	NA	LINC01094	14194	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	80991308	80991698	80991476	Y	PRDM8,ANTXR2	NA	NA	NA	NA	NA	PAQR3	1132716	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	81093417	81093540	81093479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAQR3	1234825	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	82057432	82057578	82057505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASGEF1B,RP11-689K5.3	905819	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	82411951	82412176	82412142	Y	RASGEF1B	NA	NA	NA	NA	NA	RASGEF1B,RP11-689K5.3	551221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	83755588	83755973	83755970	Y	NA	SCD5	NA	NA	NA	NA	SCD5	37578	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	84071761	84071998	84071930	Y	THAP9,HPSE,HPSE,HPSE,COQ2,AGPAT9,PLAC8	PLAC8	NA	NA	NA	NA	PLAC8	15533	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	84130014	84130163	84130089	Y	NA	NA	COPS4,COQ2,PLAC8	IMR90	Hi-C	24141950	PLAC8	73786	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr4	84196492	84196601	84196547	Y	NA	COQ2	NA	NA	NA	NA	COQ2	7466	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	84398625	84398990	84398638	Y	NA	HELQ,MRPS18C,FAM175A	NA	NA	NA	NA	MRPS18C	23540	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr4	84469544	84469879	84469660	Y	PLAC8,COQ2,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,AGPAT9	FAM175A,AGPAT9	NA	NA	NA	NA	AGPAT9	14477	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr4	84491178	84491513	84491320	Y	COQ2,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,AGPAT9	FAM175A,AGPAT9	NA	NA	NA	NA	AGPAT9	36111	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	84773321	84773491	84773400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT9	318254	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	85798168	85798515	85798434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDFY3-AS2	87023	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	87835479	87835856	87835675	Y	NA	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	AFF1	18298	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr4	87838829	87839174	87839055	Y	NA	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	AFF1	14980	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.194238616199245
chr4	87849171	87849370	87849272	Y	HSD17B11	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	AFF1	4784	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.40523624052537
chr4	87881950	87882282	87882116	Y	NA	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	TECRP1	12674	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	87882810	87883321	87882982	Y	KLHL8,AFF1,AFF1	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	TECRP1	13534	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr4	87920181	87920277	87920229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TECRP1	50905	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr4	87960081	87960248	87960138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TECRP1	90805	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr4	88128179	88128500	88128218	Y	NA	KLHL8	NA	NA	NA	NA	KLHL8	30966	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr4	88128695	88128755	88128733	Y	NA	KLHL8	NA	NA	NA	NA	KLHL8	30711	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr4	88310144	88310324	88310202	Y	AFF1,HSD17B11	HSD17B11,NUDT9	NA	NA	NA	NA	HSD17B11	214	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	88443267	88443740	88443428	Y	DSPP,SPARCL1	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT9	101533	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	88770840	88771156	88770955	Y	HSD17B11	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-36P	148233	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	89099576	89099877	89099636	Y	HERC6,HERC5	NA	PKD2	IMR90	Hi-C	24141950	ABCG2	50597	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr4	89299019	89299120	89299070	Y	NA	HERC6	NA	NA	NA	NA	HERC6	1128	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	89302401	89302730	89302543	Y	HERC6,HERC5	HERC6	NA	NA	NA	NA	HERC6	4510	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	89377235	89377564	89377513	Y	HERC6,HERC5	HERC5	NA	NA	NA	NA	HERC5	967	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr4	89667506	89667617	89667562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGY	226566	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	89747458	89747948	89747469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM13A	282601	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr4	90212945	90213002	90212979	Y	GPRIN3	NA	NA	NA	NA	NA	FAM13A	182396	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr4	90391330	90391567	90391434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-115D19.1	78940	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	91049597	91049943	91049669	Y	FAM190A	NA	NA	NA	NA	NA	SNCA	292131	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.218455497384639
chr4	91238961	91239218	91239076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNCA	481495	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	91453996	91454262	91454133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNCA	696530	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	95373822	95374139	95373960	Y	PDLIM5	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	2785	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.265428961374692
chr4	99827146	99827610	99827384	Y	NA	AC019131.1,EIF4E	NA	NA	NA	NA	AC019131.1	21528	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr4	99848541	99848872	99848707	Y	NA	AC019131.1,EIF4E	NA	NA	NA	NA	AC019131.1	266	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	99984592	99984944	99984751	Y	NA	ADH5	NA	NA	NA	NA	ADH5	23008	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	100861794	100861850	100861822	Y	NA	LAMTOR3,DNAJB14,RP11-15B17.1,H2AFZ	NA	NA	NA	NA	DNAJB14	4033	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr4	102131266	102131303	102131283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	135634	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	102254740	102255090	102255043	Y	NA	AP001816.1,PPP3CA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	11847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	102266716	102267419	102267189	Y	NA	PPP3CA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	103089994	103090308	103090151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A8	260107	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	103359657	103359837	103359736	Y	SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,NFKB1,MANBA	SLC39A8	BDH2,NFKB1,SLC9B1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC39A8	9242	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr4	103360468	103360812	103360586	Y	SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,NFKB1,MANBA	SLC39A8	BDH2,NFKB1,SLC9B1,UBE2D3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC39A8	10053	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	103360821	103361254	103361183	Y	SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,NFKB1,MANBA	SLC39A8	NFKB1,SLC9B1,UBE2D3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC39A8	10406	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr4	103655976	103656198	103656076	Y	NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA	MANBA	NA	NA	NA	NA	MANBA	23953	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	103673229	103673433	103673315	Y	NHEDC1,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA	MANBA	NA	NA	NA	NA	MANBA	6718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr4	103678847	103679008	103678977	Y	NA	MANBA	NA	NA	NA	NA	MANBA	1143	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	103750426	103750532	103750434	Y	NHEDC1,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3	RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2	NA	NA	NA	NA	RP11-10L12.4	3214	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	103788773	103788886	103788830	Y	NA	RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2	NA	NA	NA	NA	CISD2	638	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	103967476	103967511	103967493	Y	NA	SLC9B1,SLC9B2	NA	NA	NA	NA	SLC9B1	28580	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	106064596	106064807	106064750	Y	NA	TET2	TET2	K562	ChIA-PET	22265404	TET2	225	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	106071010	106071297	106071196	Y	TET2,TET2	TET2	NA	NA	NA	NA	TET2	5978	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr4	106226051	106226420	106226239	Y	TET2,TET2	NA	NA	NA	NA	NA	TET2	161019	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	106324406	106324791	106324687	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPA2	68447	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr4	106362976	106363368	106363172	Y	NA	PPA2,EEF1A1P9	NA	NA	NA	NA	PPA2	29870	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	106383790	106383988	106383871	Y	TET2,TET2	PPA2,EEF1A1P9	NA	NA	NA	NA	PPA2	9250	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	106628155	106628490	106628322	Y	NA	GSTCD	NA	NA	NA	NA	GSTCD	220	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr4	106635528	106635690	106635582	Y	NA	GSTCD	NA	NA	NA	NA	GSTCD	7593	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr4	110043690	110043849	110043769	Y	COL25A1	NA	NA	NA	NA	NA	COL25A1	177964	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr4	110449545	110449722	110449703	Y	SEC24B	CCDC109B	CCDC109B	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC109B	29639	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr4	110604562	110604565	110604563	Y	NA	CASP6,PLA2G12A	NA	NA	NA	NA	CASP6	18174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	111086740	111086853	111086804	Y	NA	RP11-115A14.1,ELOVL6	NA	NA	NA	NA	RP11-115A14.1	21210	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.221184838134266
chr4	111114926	111115298	111115104	Y	GAR1,ELOVL6,ELOVL6	RP11-115A14.1,ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	3057	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	111116750	111117174	111116883	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	1181	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr4	111117471	111117868	111117585	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.535203491429156
chr4	113067380	113067784	113067656	Y	LARP7,LARP7,TIFA,AP1AR,C4orf32	C4orf32	NA	NA	NA	NA	C4orf32	2827	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	113095488	113095850	113095539	Y	NA	C4orf32	NA	NA	NA	NA	C4orf32	30935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr4	113181018	113181306	113181029	Y	AP1AR,TIFA	AP1AR,ALPK1,TIFA	NA	NA	NA	NA	ALPK1	23359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.120163000724761
chr4	113572868	113573168	113573031	Y	NA	LARP7,C4orf21	NA	NA	NA	NA	C4orf21	16717	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr4	114355245	114355627	114355568	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	15766	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.167136464714814
chr4	114389425	114389805	114389547	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	49946	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	117519495	117520605	117520296	Y	NA	ACTN4P1	NA	NA	NA	NA	ACTN4P1	2178	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.322589639172887
chr4	119115424	119115493	119115457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNHG8	82371	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	119629667	119629850	119629760	Y	NA	METTL14	NA	NA	NA	NA	METTL14	25144	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	120024463	120024846	120024696	Y	NA	NA	SYNPO2,USP53,MYOZ2	IMR90	Hi-C	24141950	USP53	106896	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	120130181	120130604	120130427	Y	NA	USP53,RP11-455G16.1	NA	NA	NA	NA	USP53	1138	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	120458820	120459280	120459019	Y	PDE5A,PDE5A,PDE5A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	84874	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	121812608	121812671	121812657	Y	NA	PRDM5	NA	NA	NA	NA	PRDM5	29354	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr4	122609803	122610189	122610094	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	6079	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	122611926	122612330	122612120	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	3938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr4	122632771	122633033	122632919	Y	NA	ANXA5	ANXA5,BBS7,CCNA2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ANXA5	16503	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr4	123074024	123074337	123074286	Y	KIAA1109,IL21,IL2	KIAA1109	KIAA1109	K562	ChIA-PET	22265404	KIAA1109	2536	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr4	123685251	123685615	123685333	Y	FGF2	CETN4P,BBS12	NA	NA	NA	NA	BBS12	33394	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr4	123686146	123686329	123686228	Y	FGF2	CETN4P,BBS12	NA	NA	NA	NA	BBS12	34289	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	123704519	123704897	123704616	Y	FGF2	FGF2	FGF2,NUDT6,SPATA5	IMR90	Hi-C	24141950	FGF2	40966	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr4	123719302	123719557	123719375	Y	FGF2	FGF2	FGF2,NUDT6,BBS12	IMR90	Hi-C	24141950	FGF2	26306	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	123751494	123751575	123751556	Y	FGF2	FGF2	NA	NA	NA	NA	FGF2	5631	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	123792983	123793156	123793069	Y	NA	FGF2,NUDT6,SPATA5	NA	NA	NA	NA	FGF2	47120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	124073506	124073670	124073588	Y	NUDT6	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA5	231277	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	125359100	125359252	125359188	Y	NA	TECRP2	ANKRD50	MCF7	ChIA-PET	22265404	TECRP2	23693	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	125634465	125634726	125634691	Y	NA	ANKRD50	NA	NA	NA	NA	ANKRD50	2578	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	128752654	128753022	128752839	Y	HSPA4L	PLK4	NA	NA	NA	NA	PLK4	46994	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr4	128894970	128895372	128895225	Y	NA	C4orf29,MFSD8	NA	NA	NA	NA	MFSD8	9820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	128990801	128990842	128990822	Y	NA	LARP1B	NA	NA	NA	NA	LARP1B	10378	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr4	129244135	129244496	129244419	Y	NA	PGRMC2,RP11-420A23.1	PGRMC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-420A23.1	32229	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr4	129244714	129244881	129244798	Y	NA	PGRMC2,RP11-420A23.1	PGRMC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-420A23.1	32808	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	129254148	129254471	129254310	Y	NA	PGRMC2,RP11-420A23.1	PHF17,LARP1B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-420A23.1	42242	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	129275726	129275798	129275762	Y	NA	NA	PHF17,LARP1B,SCLT1,C4orf33,PGRMC2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-420A23.1	63820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr4	129308281	129308471	129308363	Y	NA	NA	PGRMC2,PHF17,LARP1B,SCLT1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-420A23.1	96375	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr4	129474102	129474409	129474120	Y	NA	NA	PGRMC2,PHF17,LARP1B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-420A23.1	262196	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr4	129733811	129733921	129733891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf33	278551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	129965980	129966229	129966106	Y	NA	C4orf33,SCLT1	NA	NA	NA	NA	C4orf33	46243	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	130012970	130013118	130013063	Y	PHF17,SCLT1,C4orf33	C4orf33,SCLT1	NA	NA	NA	NA	SCLT1	206	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	131082218	131082340	131082279	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCLT1	1069454	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr4	133266182	133266225	133266204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PABPC4L	1854678	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.237943846261145
chr4	133409064	133409406	133409234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PABPC4L	1711497	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	133821685	133822080	133822027	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PABPC4L	1298823	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	134077378	134077602	134077486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PABPC4L	1043301	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.57416275412326
chr4	134164621	134164860	134164692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PABPC4L	956043	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.170751884204219
chr4	134191473	134191538	134191506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PABPC4L	929365	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.58417614697847
chr4	138342628	138342994	138342814	Y	NA	RPS23P2	NA	NA	NA	NA	RPS23P2	24247	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	138974806	138975089	138974892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC7A11	186414	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	138975341	138975477	138975408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC7A11	186026	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	139156559	139157143	139156950	Y	SLC7A11	SLC7A11	NA	NA	NA	NA	SLC7A11	4360	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18278236002221
chr4	139158628	139158837	139158817	Y	SLC7A11	SLC7A11	NA	NA	NA	NA	SLC7A11	2666	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr4	139173167	139173319	139173175	Y	NA	SLC7A11	SLC7A11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC7A11	11664	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.489726103887702
chr4	139177153	139177364	139177274	Y	SLC7A11	SLC7A11	SLC7A11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC7A11	15650	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.716525553070633
chr4	139326439	139326794	139326543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC7A11	164936	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr4	139831999	139832463	139832295	Y	NA	NA	LOC641365,SLC7A11,LOC641364	IMR90	Hi-C	24141950	CCRN4L	102480	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	139960939	139961173	139961057	Y	NAA15,CCRN4L	CCRN4L	NA	NA	NA	NA	CCRN4L	25996	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr4	140003738	140004448	140004114	Y	CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2	NA	CCRN4L	K562	ChIA-PET	22265404	CCRN4L	68795	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.280344707491722
chr4	140035787	140036142	140035958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELF2	60230	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	140096766	140097018	140096889	Y	CCRN4L,RAB33B,ELF2	ELF2	ELF2,NAA15	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ELF2	394	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	140235316	140235657	140235500	Y	ELF2,RAB33B	NAA15,NDUFC1	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	13611	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	140278994	140279360	140279178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	57289	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr4	140321405	140321719	140321434	Y	ELF2,NAA15,RAB33B	NA	NA	NA	NA	NA	RAB33B	50667	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr4	140334690	140334958	140334824	Y	ELF2	RAB33B	NA	NA	NA	NA	RAB33B	37428	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	140696118	140696274	140696196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	111196	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr4	140897225	140897350	140897279	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	175988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	141011416	141011614	141011507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	61724	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	141012548	141012827	141012747	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	60511	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr4	141017143	141017617	141017414	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	55721	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	141071687	141072625	141072041	Y	MAML3	MAML3	NA	NA	NA	NA	MAML3	713	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr4	142250253	142250616	142250501	Y	ZNF330,IL15	NA	IL15,INPP4B,ZNF330	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF330	110212	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	142271356	142271489	142271421	Y	ZNF330,IL15	NA	IL15,INPP4B	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF330	131315	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	142347756	142348088	142347922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL15	207664	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	142477035	142477207	142477121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL15	78545	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	142561940	142562315	142562048	Y	ZNF330,IL15	IL15	NA	NA	NA	NA	IL15	6188	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr4	142569165	142569426	142569320	Y	ZNF330,IL15	IL15	NA	NA	NA	NA	IL15	13413	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	143012897	143013276	143013057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL15	457145	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.333159816610145
chr4	143488504	143488630	143488569	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP38	615440	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	144271294	144271615	144271412	Y	NA	GAB1	NA	NA	NA	NA	GAB1	15379	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr4	144981582	144981869	144981726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA5	548966	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	145956046	145956369	145956259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCE1	60715	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr4	145975837	145976119	145976108	Y	NA	ABCE1,ANAPC10	NA	NA	NA	NA	ABCE1	40965	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr4	146101946	146102251	146102199	Y	NA	OTUD4	ABCE1	K562	ChIA-PET	22265404	OTUD4	2633	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr4	146408898	146409228	146409003	Y	OTUD4	SMAD1	NA	NA	NA	NA	SMAD1	8552	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	146546923	146547210	146547042	Y	ZNF827	MMAA	NA	NA	NA	NA	MMAA	9508	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	146856855	146857112	146856936	Y	NA	ZNF827	NA	NA	NA	NA	ZNF827	675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr4	147183888	147184022	147183955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM6	89051	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	147194396	147194957	147194565	Y	ZNF827,LSM6	NA	NA	NA	NA	NA	LSM6	99559	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	147710837	147711224	147710894	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-44P	211637	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	148374725	148374999	148374823	Y	TMEM184C	NA	TMEM184C	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM184C	161535	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.171864997023702
chr4	148426409	148426782	148426596	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM184C	109752	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	148654111	148654384	148654270	Y	PRMT10	ARHGAP10	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	2897	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr4	148654665	148655045	148654996	Y	NA	ARHGAP10	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	3451	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	148677279	148677473	148677309	Y	NA	ARHGAP10	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	26065	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	148752985	148753384	148753090	Y	PRMT10	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	101771	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	150977820	150977939	150977880	Y	NA	DCLK2	DCLK2	IMR90	Hi-C	24141950	DCLK2	19487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	151241204	151241585	151241396	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCLK2	243778	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	151641898	151642513	151641954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	292366	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr4	152047125	152047385	152047255	Y	NA	RPS3A	NA	NA	NA	NA	RPS3A	28400	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	152117073	152117218	152117121	Y	FAM160A1,SH3D19	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3A	98348	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr4	152226044	152226315	152226216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-610P16.1	101672	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	152246032	152246165	152246086	Y	FAM160A1	NA	FAM160A1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-610P16.1	81822	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.224297142513009
chr4	152367520	152367754	152367585	Y	NA	RP11-610P16.1,FAM160A1	NA	NA	NA	NA	FAM160A1	39152	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	153265183	153265560	153265526	Y	FBXW7	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4453	189856	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	153313306	153313343	153313324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4453	142073	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr4	153445736	153446128	153446118	Y	NA	MIR4453	NA	NA	NA	NA	MIR4453	9288	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	153717992	153718074	153718038	Y	NA	TIGD4,ARFIP1	NA	NA	NA	NA	ARFIP1	18903	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr4	153858553	153859077	153858605	Y	TRIM2,FHDC1	RP11-206F17.2,FHDC1	ARFIP1,FHDC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FHDC1	3049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	154170296	154170804	154170469	Y	TIGD4,KIAA0922	NA	NA	NA	NA	NA	MND1	92997	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.124891533033648
chr4	154253952	154254140	154254046	Y	NA	MND1	NA	NA	NA	NA	MND1	9661	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	154269495	154269528	154269512	Y	TRIM2,MND1	MND1	NA	NA	NA	NA	MND1	5694	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr4	154360422	154360809	154360778	Y	MND1,KIAA0922	KIAA0922	MND1,TRIM2,KIAA0922	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA0922	24689	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	154580466	154580842	154580627	Y	TLR2	TLR2	NA	NA	NA	NA	TLR2	39810	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr4	154598070	154598582	154598380	Y	TLR2	TLR2	TLR2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TLR2	22070	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	155239135	155239272	155239204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLRG1	230315	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	155519290	155519521	155519383	Y	FGB,FGA,FGG	PLRG1,FGB,FGG	NA	NA	NA	NA	FGG	12598	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	157870715	157871133	157870964	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	19413	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	158125886	158126027	158125941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFC	235340	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	159592059	159592445	159592194	Y	NA	ETFDH,C4orf46	NA	NA	NA	NA	C4orf46	652	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr4	159643443	159643599	159643521	Y	FNIP2,PPID	PPID,FNIP2	NA	NA	NA	NA	PPID	895	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	159857327	159857643	159857481	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	169037	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	159925060	159925429	159925240	Y	FNIP2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	236770	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr4	160195976	160196239	160196029	Y	RAPGEF2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	507686	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	160199508	160199928	160199727	Y	RAPGEF2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	511218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	161769764	161769816	161769790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-234O6.2	528289	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	164414222	164414415	164414319	Y	TKTL2,C4orf43	NA	NA	NA	NA	NA	NAF1	328149	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	164464203	164464350	164464219	Y	NPY1R,NPY5R,MARCH1	NA	NA	NA	NA	NA	NAF1	378130	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	165728924	165729125	165729024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-366M4.2	111090	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	166315734	166315907	166315821	Y	NA	CPE	NA	NA	NA	NA	CPE	35388	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr4	166397894	166398226	166397967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPE	117548	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	169371058	169372404	169371437	Y	DDX60,DDX60L	PALLD	NA	NA	NA	NA	PALLD	43813	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	169372558	169373482	169372741	Y	NA	PALLD	NA	NA	NA	NA	PALLD	42735	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	169375795	169375933	169375918	Y	NA	PALLD	NA	NA	NA	NA	PALLD	40284	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	169406739	169406912	169406786	Y	DDX60,DDX60L	PALLD	DDX60,DDX60L,PALLD	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PALLD	9305	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	169408175	169408648	169408311	Y	DDX60,DDX60L	PALLD,DDX60L	DDX60,DDX60L,PALLD	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PALLD	7569	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr4	169479701	169480223	169479961	Y	NA	DDX60L	NA	NA	NA	NA	DDX60L	22764	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.159295628027183
chr4	169509077	169509260	169509148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	52140	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.124891533033648
chr4	169522008	169522260	169522060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	65071	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr4	169526711	169526794	169526753	Y	PALLD,PALLD	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	69774	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr4	169540430	169540723	169540575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	83493	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	169555491	169556032	169555691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	98554	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr4	169557546	169558299	169557820	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	100609	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr4	169559092	169559502	169559116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	102155	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	169559850	169560019	169559874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	102913	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	169644236	169644423	169644322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	187299	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr4	169658786	169659496	169659136	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	201849	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr4	169662986	169663338	169663111	Y	DDX60,DDX60L	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	206049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	169705913	169706245	169706080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	223181	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210997624326124
chr4	169716186	169716224	169716221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	213202	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	169718415	169718594	169718475	Y	DDX60,DDX60L	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	210832	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr4	169757761	169758092	169757987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	171334	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr4	169802596	169802736	169802661	Y	PALLD	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	126690	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	170026437	170026753	170026620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	97011	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	170172551	170172946	170172870	Y	NA	SH3RF1	NA	NA	NA	NA	SH3RF1	17310	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr4	170266359	170266712	170266646	Y	NA	NA	CBR4,SH3RF1,NEK1	IMR90	Hi-C	24141950	SH3RF1	76103	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	170543360	170543629	170543529	Y	NEK1,CLCN3	NEK1,CLCN3	C4orf27	IMR90	Hi-C	24141950	CLCN3	11576	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr4	170570348	170570457	170570384	Y	NA	NEK1,CLCN3	NA	NA	NA	NA	CLCN3	38564	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr4	173917824	173917970	173917931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT7	169934	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr4	173920202	173920438	173920320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT7	167466	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	174185845	174186217	174186078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB2	68059	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	174285204	174285286	174285258	Y	NA	HMGB2,SAP30	SAP30	K562	ChIA-PET	22265404	SAP30	3834	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr4	174337339	174338040	174337759	Y	SAP30	SAP30	HMGB2,GALNT7,SAP30	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	SAP30	48219	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr4	174443232	174443552	174443433	Y	HAND2	NA	NA	NA	NA	NA	RANP6	109970	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	176349248	176349641	176349474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA4	765181	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	177159899	177160093	177159996	Y	NA	SPATA4	SPATA4	IMR90	Hi-C	24141950	SPATA4	45077	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	177710943	177711419	177711262	Y	VEGFC	VEGFC	NA	NA	NA	NA	VEGFC	462	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	179520060	179520380	179520220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-45P	484045	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	180546541	180546896	180546719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-45P	1510526	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr4	180585671	180585931	180585800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-45P	1549656	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	180979740	180980372	180979835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-45P	1943725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	181459981	181460098	181460039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC108142.1	1604304	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr4	183110695	183110955	183110887	Y	NA	AC108142.1	NA	NA	NA	NA	AC108142.1	46293	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	183161464	183161792	183161628	Y	ODZ3	NA	ODZ3	IMR90	Hi-C	24141950	AC108142.1	97062	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr4	183897058	183897307	183897172	Y	NA	NA	WWC2,FAM92A3	IMR90	Hi-C	24141950	DCTD	59969	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	184208528	184208558	184208557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN2AIP	155186	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	184256615	184256836	184256706	Y	NA	NA	CLDN24,CLDN22	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN2AIP	106908	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	184270201	184270461	184270317	Y	NA	NA	CLDN24,CLDN22	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN2AIP	93283	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr4	184270914	184271169	184271084	Y	NA	NA	CLDN24,CLDN22	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN2AIP	92575	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	184319940	184320161	184319981	Y	NA	CDKN2AIP	WWC2,CLDN22,CDKN2AIP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIP	43583	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr4	184328356	184328744	184328447	Y	CDKN2AIP	CDKN2AIP	WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIP	35000	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.34197663592144
chr4	184330014	184330225	184330125	Y	CDKN2AIP	CDKN2AIP	WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIP	33519	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.45843476961753
chr4	184423820	184424211	184423984	Y	STOX2	NA	NA	NA	NA	NA	ING2	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	184718887	184719489	184719407	Y	NA	NA	ENPP6,CASP3	IMR90	Hi-C	24141950	TRAPPC11	140467	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr4	185115354	185115759	185115584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-739P1.2	208523	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	185189191	185189340	185189323	Y	IRF2,CASP3	NA	IRF2,CASP3,LOC728175,CCDC111,MLF1IP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2	204394	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr4	185189434	185189785	185189717	Y	IRF2,CASP3	NA	IRF2,CASP3,LOC728175,CCDC111,MLF1IP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2	203949	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr4	185269961	185270243	185270083	Y	ACSL1,IRF2	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	123491	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr4	185276361	185276710	185276589	Y	ACSL1,IRF2	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	117024	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	185296800	185297408	185297103	Y	ACSL1,IRF2	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	96326	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	185331149	185331516	185331503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	62218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr4	185382837	185383066	185382954	Y	NA	IRF2	NA	NA	NA	NA	IRF2	10668	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr4	185573558	185573933	185573744	Y	NA	CASP3	NA	NA	NA	NA	CASP3	4895	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr4	185589829	185589977	185589872	Y	ACSL1,IRF2	CASP3	NA	NA	NA	NA	CASP3	21166	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	186495067	186495245	186495187	Y	NA	PDLIM3	NA	NA	NA	NA	PDLIM3	40301	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18478155158147
chr4	186760271	186760668	186760511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLR3	227638	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr4	187591076	187591113	187591095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAT1	54763	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	187766570	187766763	187766651	Y	NA	RP11-11N5.1	FAT1,LOC339975	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-11N5.1	43360	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr4	189029344	189029687	189029466	Y	ZFP42,TRIML2	TRIML2,RP11-366H4.1	FAT1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIML2	587	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr4	189048639	189048958	189048819	Y	NA	TRIML2,RP11-366H4.1	NA	NA	NA	NA	TRIML2	19882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.204425830007387
chr4	189101565	189101968	189101694	Y	TRIML2	RP11-366H4.1	TRIML1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-366H4.1	22346	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr4	190708637	190708848	190708802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-51P	79769	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	126972	127168	127053	Y	NA	NA	PLEKHG4B	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC127	89162	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	366173	366499	366337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHRR	63882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr5	372694	372970	372922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	68288	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr5	373392	373627	373429	Y	EXOC3,C5orf55,PDCD6	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	67631	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.513212835882728
chr5	373695	374160	373984	Y	EXOC3	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	67098	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.70077739768522
chr5	378611	379250	378849	Y	EXOC3	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	62008	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	389983	390379	390026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	50879	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr5	392668	393182	392808	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	48076	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr5	394851	394874	394864	Y	NA	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	46384	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr5	400756	401055	400906	Y	NA	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	40203	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	402925	403258	403130	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	38000	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	413817	414070	413960	Y	NA	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	27188	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.23431099171284
chr5	426647	427011	426980	Y	NA	C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5	NA	NA	NA	NA	C5orf55	14247	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	448928	449328	449227	Y	NA	C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5	NA	NA	NA	NA	EXOC3	7655	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	656184	656577	656381	Y	SLC9A3,ZDHHC11,TPPP	CEP72,TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	34933	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr5	672237	672545	672500	Y	EXOC3,CEP72	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18965	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	672861	673336	673024	Y	NA	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	759096	759567	759320	Y	TPPP	NA	SLC9A3,ZDHHC11,CEP72,BRD9,TRIP13	IMR90	Hi-C	24141950	TPPP	67586	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	777448	777883	777776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPPP	85938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	784651	785023	784908	Y	ZDHHC11,TPPP	NA	NA	NA	NA	NA	TPPP	93141	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210267475135757
chr5	1080709	1080898	1080802	Y	NA	SLC12A7	NA	NA	NA	NA	SLC12A7	29252	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr5	1103805	1104368	1103973	Y	LPCAT1,SLC12A7	SLC12A7	NA	NA	NA	NA	SLC12A7	5782	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	1110480	1111164	1110500	Y	LPCAT1,SLC12A7	SLC12A7	NA	NA	NA	NA	SLC12A7	330	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	1144141	1144479	1144312	Y	NA	SLC12A7	BRD9,LOC100506688,SLC12A7,TRIP13,ZDHHC11,LOC728613,SLC6A18	IMR90	Hi-C	24141950	SLC12A7	33991	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	1485196	1485502	1485375	Y	SLC12A7,LPCAT1	SLC6A3,LPCAT1	SLC6A3	IMR90	Hi-C	24141950	LPCAT1	36590	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	1498250	1498484	1498297	Y	LPCAT1	LPCAT1	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	23608	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr5	1501941	1502569	1502322	Y	LPCAT1	LPCAT1	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	19523	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	1503544	1504024	1503726	Y	LPCAT1	LPCAT1	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	18068	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	1521795	1522349	1522119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr5	1522529	1522699	1522639	Y	NA	LPCAT1	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	437	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr5	1525802	1526000	1525905	Y	NA	LPCAT1	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	3710	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	1725421	1725568	1725519	Y	NA	NA	MIR4277	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL36	73912	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	5026027	5026363	5026168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	392414	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	5340490	5340721	5340596	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	78056	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	5351586	5351742	5351664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	67035	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.179322870082216
chr5	5376440	5376820	5376639	Y	NA	KIAA0947	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	41957	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.31986029842326
chr5	5423578	5423857	5423693	Y	KIAA0947	KIAA0947	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	4801	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr5	6373242	6373393	6373318	Y	NA	MED10	NA	NA	NA	NA	MED10	3314	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-332J15.3	50027	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	8.11443051517848
chr5	6766717	6766947	6766763	Y	SRD5A1,PAPD7	RP11-332J15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-332J15.3	2713	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr5	7421559	7421813	7421686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRR	427486	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	8843874	8844185	8844159	Y	NA	NA	SEMA5A	IMR90	Hi-C	24141950	FASTKD3	976724	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	10270287	10270466	10270406	Y	NA	FAM173B,CCT5,CMBL	NA	NA	NA	NA	CCT5	22254	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	10302153	10302258	10302208	Y	NA	CMBL,MARCH6	NA	NA	NA	NA	CMBL	3880	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	10309087	10309259	10309181	Y	NA	CMBL,MARCH6	NA	NA	NA	NA	CMBL	2949	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.212996815885384
chr5	10352620	10352938	10352732	Y	NA	CMBL,MARCH6	NA	NA	NA	NA	MARCH6	805	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.196081878209095
chr5	10422961	10423316	10423021	Y	NA	ROPN1L	NA	NA	NA	NA	ROPN1L	16320	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr5	10485180	10485474	10485337	Y	NA	ROPN1L,RPL30P7	NA	NA	NA	NA	RPL30P7	1458	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.38647804083923
chr5	10551479	10551871	10551616	Y	NA	ANKRD33B	MARCH6,ANKRD33B,ROPN1L	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33B	10571	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr5	10601684	10601853	10601839	Y	ANKRD33B	ANKRD33B	NA	NA	NA	NA	ANKRD33B	39242	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr5	10733059	10733302	10733226	Y	NA	DAP	NA	NA	NA	NA	DAP	26082	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr5	10743646	10743952	10743932	Y	NA	DAP	NA	NA	NA	NA	DAP	15432	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	10759548	10759882	10759715	Y	NA	DAP	NA	NA	NA	NA	DAP	164	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	10996392	10996605	10996573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	237008	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	14011107	14011342	14011264	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	68455	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr5	14035955	14036534	14036234	Y	TRIO	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	93303	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	14036813	14036909	14036843	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	94161	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr5	14142803	14143164	14142969	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	992	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr5	14185691	14186191	14185984	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	43880	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr5	14186205	14186627	14186374	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	44394	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	14204877	14205144	14204973	Y	FAM105B	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	63066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	14251046	14251256	14251151	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	109235	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	14264855	14265210	14264930	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	123044	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.277615366742094
chr5	14268390	14268821	14268476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	126579	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr5	14408020	14408375	14408038	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	FAM105A	171509	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	14639692	14640047	14639871	Y	NA	EEF1A1P13,FAM105B	TRIO,FAM105A	IMR90	Hi-C	24141950	EEF1A1P13	11391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr5	14666216	14666664	14666270	Y	FAM105A,FAM105B	EEF1A1P13,FAM105B	NA	NA	NA	NA	FAM105B	3443	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	14668408	14668752	14668531	Y	FAM105A,FAM105B	EEF1A1P13,FAM105B	NA	NA	NA	NA	FAM105B	5635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	14719922	14720222	14720072	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM105B	57149	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	14739809	14739939	14739877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBBP4P1	56570	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr5	14758065	14758328	14758197	Y	NA	RBBP4P1	NA	NA	NA	NA	RBBP4P1	38181	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	14817188	14817452	14817373	Y	NA	RBBP4P1	NA	NA	NA	NA	RBBP4P1	20679	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	14872714	14873077	14873012	Y	NA	ANKH	NA	NA	NA	NA	ANKH	2827	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr5	15008718	15008950	15008809	Y	ANKH	NA	FAM105B,ANKH,LOC100130744	IMR90	Hi-C	24141950	ANKH	138831	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	15451801	15451916	15451863	Y	NA	NA	FBXL7	IMR90	Hi-C	24141950	ANKH	581914	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr5	16492574	16492683	16492630	Y	FAM134B	ZNF622	NA	NA	NA	NA	ZNF622	28673	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr5	16715199	16715528	16715435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	100032	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr5	16727981	16728387	16728161	Y	FAM134B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	112814	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	16894604	16895174	16894829	Y	NA	CTB-55B8.1,MYO10	NA	NA	NA	NA	CTB-55B8.1	5576	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146379073469414
chr5	17157273	17157661	17157421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC091878.1	57495	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	17177639	17177702	17177672	Y	NA	AC091878.1	NA	NA	NA	NA	AC091878.1	37454	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.582176955419209
chr5	17196578	17196835	17196707	Y	NA	AC091878.1	NA	NA	NA	NA	AC091878.1	18321	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr5	17224986	17225514	17225115	Y	BASP1	AC091878.1	NA	NA	NA	NA	AC091878.1	9830	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr5	17249327	17249860	17249454	Y	NA	AC091878.1	NA	NA	NA	NA	AC091878.1	34171	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr5	17252511	17253031	17252811	Y	BASP1	AC091878.1	NA	NA	NA	NA	AC091878.1	37355	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	17255490	17256325	17255691	Y	BASP1	AC091878.1	NA	NA	NA	NA	AC091878.1	40334	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr5	17282496	17282827	17282587	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP133	60898	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr5	17302170	17302536	17302353	Y	BASP1	RN7SKP133	BASP1,LOC285696	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RN7SKP133	41189	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr5	17302742	17303327	17302998	Y	BASP1	RN7SKP133,FTH1P10	BASP1,LOC285696	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RN7SKP133	40398	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.412694113583884
chr5	18391290	18391435	18391363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL36AP21	343631	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	18698353	18698759	18698423	Y	NA	CTD-2023M8.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2023M8.1	45523	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	18745140	18745321	18745192	Y	NA	CTD-2023M8.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2023M8.1	858	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr5	23303766	23303789	23303778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH10	1339298	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	24132806	24133151	24133050	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH10	509936	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.480042005190221
chr5	24155781	24155941	24155882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH10	487146	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	24272966	24273308	24273185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH10	369779	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.390320494408341
chr5	24283282	24283641	24283411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH10	359446	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.69924645111881
chr5	24498008	24498123	24498090	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH10	144964	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.353534244226429
chr5	25910581	25911176	25910785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	721816	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.10390756405317
chr5	30099812	30100097	30099950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL19P11	951575	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.143649732719787
chr5	30104227	30104618	30104445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL19P11	947054	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	31894536	31894834	31894609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOLPH3	277622	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	32164142	32164348	32164245	Y	ZFR	GOLPH3	NA	NA	NA	NA	GOLPH3	8108	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	32175167	32175567	32175368	Y	NA	GOLPH3,CTD-2186M15.1	NA	NA	NA	NA	GOLPH3	2711	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.164024160336071
chr5	32283224	32283342	32283283	Y	NA	MTMR12	NA	NA	NA	NA	MTMR12	27773	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	32391012	32391652	32391274	Y	SUB1	NA	NA	NA	NA	NA	ZFR	51215	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.445134795086024
chr5	32582779	32582965	32582856	Y	SUB1	NA	ZFR,SUB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SUB1	53040	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	32592950	32593432	32593186	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUB1	63211	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	32760271	32760413	32760371	Y	SUB1	NA	NA	NA	NA	NA	NPR3	73095	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.375021784662195
chr5	32768263	32768639	32768422	Y	SUB1	NA	NA	NA	NA	NA	NPR3	81087	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.607506949424086
chr5	33003912	33004012	33003962	Y	NA	NA	NPR3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-36C20.1	156273	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	33313222	33313474	33313360	Y	NA	NA	NPR3,TARS	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2203K17.1	125251	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr5	33442170	33442454	33442303	Y	NA	CTD-2203K17.1,TARS	NA	NA	NA	NA	TARS	3368	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.28455268963104
chr5	34048471	34048803	34048799	Y	NA	AMACR	NA	NA	NA	NA	AMACR	42251	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr5	34949030	34949157	34949062	Y	NA	BRIX1,RAD1,DNAJC21	NA	NA	NA	NA	DNAJC21	21332	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	35857994	35858411	35858032	Y	IL7R	IL7R	NA	NA	NA	NA	IL7R	7197	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	35884312	35884698	35884400	Y	NA	IL7R	NA	NA	NA	NA	IL7R	33515	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr5	36119586	36119746	36119728	Y	SLC1A3,SLC1A3,C5orf33,C5orf33,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	LMBRD2	30317	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr5	36151218	36151404	36151252	Y	C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	1127	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.01224007483879
chr5	36174356	36174616	36174412	Y	SLC1A3,SLC1A3,RANBP3L,C5orf33,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	24265	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.196967956948873
chr5	36229884	36229947	36229916	Y	UGT3A1,C5orf33,C5orf33	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3L	70269	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr5	36657665	36658163	36657813	Y	NIPBL	NA	NA	NA	NA	NA	SLC1A3	53208	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr5	36898243	36898633	36898363	Y	NIPBL	NIPBL	NA	NA	NA	NA	NIPBL	23382	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	37029618	37029862	37029736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP6	53296	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr5	37272795	37272956	37272876	Y	C5orf42	C5orf42	NA	NA	NA	NA	C5orf42	25265	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.416536567152994
chr5	37275525	37275858	37275640	Y	NA	C5orf42	NA	NA	NA	NA	C5orf42	27995	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr5	37311676	37311784	37311730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP155	57499	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	37615302	37615631	37615482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR70	237988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.128351022973642
chr5	37776965	37777327	37776998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR70	399651	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	38514652	38514707	38514680	Y	NA	CTD-2263F21.1,MIR3650	NA	NA	NA	NA	MIR3650	40956	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr5	38660472	38660667	38660594	Y	LIFR	NA	EGFLAM,LIFR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LIFR	54016	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.04685467680319
chr5	38846956	38846992	38846979	Y	OSMR,OSMR	CTD-2127H9.1,OSMR	NA	NA	NA	NA	OSMR	2996	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr5	38872248	38872554	38872396	Y	NA	CTD-2127H9.1,OSMR	NA	NA	NA	NA	OSMR	28288	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr5	38968924	38969094	38969009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RICTOR	103416	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	39069838	39069965	39069908	Y	NA	RICTOR	NA	NA	NA	NA	RICTOR	2545	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr5	39072904	39073873	39073587	Y	FYB,RICTOR	RICTOR	NA	NA	NA	NA	RICTOR	394	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr5	39194499	39195200	39195005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYB	77430	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	39211947	39212087	39212048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYB	60543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	39399549	39400018	39399831	Y	NA	C9	NA	NA	NA	NA	C9	22952	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr5	39403483	39403837	39403660	Y	NA	C9	NA	NA	NA	NA	C9	19133	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	39411101	39411451	39411362	Y	NA	C9,DAB2	NA	NA	NA	NA	C9	11519	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr5	39519768	39520016	39519839	Y	DAB2	NA	DAB2	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	59366	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	39713773	39713912	39713841	Y	NA	NA	TTC33,PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	253371	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	39716547	39716931	39716737	Y	NA	NA	TTC33,PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	256145	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	39721328	39721512	39721418	Y	NA	NA	TTC33,PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	260926	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr5	40411118	40411409	40411246	Y	PTGER4,CARD6	NA	PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	PTGER4	266191	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr5	40689630	40689893	40689724	Y	NA	PTGER4	NA	NA	NA	NA	PTGER4	12030	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	40754670	40754884	40754791	Y	PTGER4	TTC33,PRKAA1	NA	NA	NA	NA	TTC33	593	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	40796420	40796758	40796693	Y	NA	TTC33,RPL37,CARD6	NA	NA	NA	NA	PRKAA1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr5	41808683	41808882	41808783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OXCT1	59739	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	41826733	41826755	41826744	Y	NA	OXCT1	NA	NA	NA	NA	OXCT1	41866	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	41845041	41845055	41845050	Y	OXCT1,FBXO4	OXCT1	NA	NA	NA	NA	OXCT1	23566	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.490456253078068
chr5	42465969	42466319	42466144	Y	GHR,GHR,GHR,GHR,GHR,GHR,GHR	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC152	288584	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	42468582	42468751	42468671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC152	286152	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	42994649	42995346	42995172	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	21185	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.56435850394424
chr5	42999523	42999876	42999700	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	16655	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	43007637	43008177	43007831	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	8354	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.5612461995655
chr5	43008201	43008438	43008332	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	8093	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.394666063088112
chr5	43009341	43009652	43009530	Y	ZNF131,C5orf39	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	6879	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr5	43020158	43020617	43020275	Y	C5orf28,ZNF131,C5orf39	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	3627	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.484997571578814
chr5	43020658	43020829	43020797	Y	ZNF131,C5orf39	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	4127	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr5	43051482	43051716	43051600	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	ZNF131	11562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227026483262636
chr5	43061828	43062062	43061945	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	ZNF131	1216	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.225027291703376
chr5	43105884	43106284	43106088	Y	NA	ZNF131,CTD-2201E18.3	LOC153684,LOC100132356,ZNF131	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2201E18.3	40363	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr5	43498058	43498404	43498231	Y	NA	C5orf28,RP11-159F24.3,C5orf34	C5orf28	MCF7	ChIA-PET	22265404	C5orf34	14843	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr5	44805965	44806268	44806131	Y	NA	RP11-53O19.1,MRPS30	NA	NA	NA	NA	RP11-53O19.1	611	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr5	44821100	44821499	44821234	Y	NA	RP11-53O19.1,MRPS30	NA	NA	NA	NA	MRPS30	14073	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr5	50263404	50263601	50263575	Y	ISL1	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA1	1818129	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	50522243	50522486	50522368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA1	1559244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	50677492	50677845	50677668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA1	1403885	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	52023689	52023809	52023721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA1	57921	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr5	52094372	52094720	52094546	Y	NA	ITGA1,PELO	NA	NA	NA	NA	PELO	12598	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	52155124	52155267	52155195	Y	NA	CTD-2207L17.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2207L17.1	42471	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	52327592	52327905	52327807	Y	ITGA2	ITGA2,CTD-2175A23.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2175A23.1	43484	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr5	52545484	52545615	52545603	Y	ITGA2,FST	NA	ARL15,FST	IMR90	Hi-C	24141950	MOCS2	141591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr5	52693799	52694135	52693979	Y	NA	NA	ARL15,LOC257396	IMR90	Hi-C	24141950	FST	80104	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr5	52714720	52715039	52714904	Y	NA	NA	ARL15	IMR90	Hi-C	24141950	FST	59200	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.54031498736716
chr5	53293727	53293898	53293842	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2081C10.1	180211	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	53309437	53310024	53309694	Y	ARL15	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2081C10.1	195921	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	53317506	53317866	53317808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2081C10.1	203990	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	54120977	54121197	54121092	Y	NA	NA	SNX18	IMR90	Hi-C	24141950	SNX18	309388	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr5	54472215	54472598	54472476	Y	NA	GPX8,CDC20B	NA	NA	NA	NA	CDC20B	5210	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr5	54622279	54622499	54622328	Y	NA	DHX29,SKIV2L2	NA	NA	NA	NA	SKIV2L2	20691	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr5	54722913	54723133	54723024	Y	SKIV2L2	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	101396	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	54729958	54730125	54730050	Y	SKIV2L2,DDX4	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	94404	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	54731133	54731267	54731160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	93262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	54893100	54893403	54893257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2A	64222	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr5	54896440	54896979	54896639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2A	67562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	54897039	54897427	54897238	Y	IL6ST,PPAP2A	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2A	68161	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.206269092017237
chr5	55287334	55287994	55287973	Y	NA	IL6ST,CTD-2031P19.3	NA	NA	NA	NA	IL6ST	827	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr5	55289605	55289989	55289924	Y	IL6ST	IL6ST,CTD-2031P19.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2031P19.3	610	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.429836085339879
chr5	55384905	55385304	55385215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2031P19.3	95910	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	55444591	55444725	55444658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2031P19.3	155596	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	55462645	55462763	55462717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2031P19.3	173650	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	55463907	55464287	55464105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2031P19.3	174912	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr5	55471391	55471677	55471521	Y	IL6ST	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2031P19.3	182396	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr5	55830072	55830234	55830153	Y	NA	AC022431.1	MAP3K1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC022431.1	31173	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.202426638448127
chr5	56468272	56468727	56468348	Y	MAP3K1,C5orf35,GPBP1,GPBP1,GPBP1	GPBP1	NA	NA	NA	NA	GPBP1	497	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr5	57537303	57537570	57537449	Y	NA	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	PLK2	216517	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr5	57542411	57542665	57542608	Y	NA	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	PLK2	211422	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	57758033	57758252	57758173	Y	NA	PLK2	NA	NA	NA	NA	PLK2	3946	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	58186995	58187365	58187085	Y	PDE4D	NA	PDE4D	IMR90	Hi-C	24141950	PLK2	432908	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.45878149883416
chr5	58232883	58233370	58233101	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	478796	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr5	58314415	58314788	58314579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	560328	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	58317891	58318186	58317997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	563804	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	58332286	58332474	58332297	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	578199	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr5	58343486	58343717	58343566	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	589399	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	58359884	58360252	58360059	Y	RAB3C,PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	605797	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.173481224953846
chr5	58365928	58366326	58366127	Y	PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	611841	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	58374119	58374354	58374236	Y	PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	620032	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr5	58375824	58376057	58376052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	621737	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr5	58391200	58391585	58391393	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	637113	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr5	58395760	58396044	58395902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	641673	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr5	58400134	58400374	58400226	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	646047	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr5	58408149	58408473	58408383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	654062	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr5	58408556	58408894	58408726	Y	PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	654469	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr5	58418380	58418697	58418552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	664293	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	58420146	58420252	58420199	Y	PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	666059	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr5	58422372	58422713	58422580	Y	PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	668285	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.464240180333415
chr5	58423022	58423147	58423096	Y	PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	668935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr5	58423311	58423752	58423511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	669224	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.434564617648767
chr5	58426345	58426806	58426483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	672258	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	58428038	58428165	58428144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	673951	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr5	58445128	58445519	58445324	Y	PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	691041	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr5	58487190	58487374	58487282	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	733103	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr5	58497739	58497828	58497784	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	743652	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	58508843	58508938	58508881	Y	PDE4D,PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	754756	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.250513215257663
chr5	58575824	58576193	58576112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	821737	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.284187161060831
chr5	58616191	58616562	58616377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	862104	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr5	58900988	58901299	58901144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	914648	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	58951498	58952014	58951831	Y	PDE4D,PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	863933	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr5	59041159	59041490	59041319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	774457	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.233754207130784
chr5	59045613	59045932	59045792	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	770015	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	59056590	59056824	59056644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	759123	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	59057056	59057135	59057102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	758812	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr5	59070253	59070532	59070393	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	745415	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr5	59086263	59086677	59086406	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	729270	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.685425018467681
chr5	59173236	59173442	59173374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	642505	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr5	59183388	59183889	59183871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	632058	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	59492329	59492580	59492443	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	323367	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr5	60239574	60239836	60239702	Y	ELOVL7,ZSWIM6,ERCC8	ERCC8,NDUFAF2	NA	NA	NA	NA	NDUFAF2	618	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	60258688	60258981	60258835	Y	NA	ERCC8,NDUFAF2	NA	NA	NA	NA	NDUFAF2	19732	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	60315642	60315784	60315678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFAF2	76686	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr5	60625710	60626179	60625844	Y	ELOVL7,ZSWIM6	NA	ZSWIM6	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZSWIM6	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	60626321	60626538	60626370	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.22629633407227
chr5	60629701	60630027	60629731	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	3601	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr5	60704594	60705129	60704691	Y	NA	RPL3P6	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	18896	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr5	60751661	60751965	60751750	Y	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	65963	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr5	61661747	61661797	61661772	Y	NA	DIMT1,IPO11	NA	NA	NA	NA	DIMT1	35969	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr5	61843905	61844215	61843940	Y	NA	CKS1B	NA	NA	NA	NA	CKS1B	37596	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	64062074	64062237	64062149	Y	NA	SREK1IP1,CWC27	NA	NA	NA	NA	SREK1IP1	275	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	64398874	64399506	64398924	Y	NA	NA	ADAMTS6,CWC27,PPWD1,CENPK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CWC27	336117	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	64710773	64711167	64710966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	64580	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr5	64755187	64755203	64755196	Y	NA	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	20544	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	64778400	64778738	64778694	Y	NA	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	2653	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	64796548	64796879	64796719	Y	PPWD1,CENPK	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	20801	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr5	64809602	64809952	64809754	Y	NA	ADAMTS6,CENPK,PPWD1	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	33855	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr5	64821420	64821488	64821458	Y	NA	ADAMTS6,CENPK,PPWD1	NA	NA	NA	NA	CENPK	35510	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr5	65220429	65221204	65220462	Y	NA	ERBB2IP	NA	NA	NA	NA	ERBB2IP	126	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	65447669	65447962	65447814	Y	SREK1,SREK1	SREK1	NA	NA	NA	NA	SREK1	13870	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	66145750	66145926	66145797	Y	NA	NA	CD180	IMR90	Hi-C	24141950	MAST4-AS1	151855	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	66178568	66178972	66178612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAST4-AS1	118809	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.36756391160368
chr5	66786490	66786676	66786582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD180	295863	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	67643475	67643635	67643573	Y	PIK3R1	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-537E7.3	84673	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	SLC30A5	NA	NA	NA	NA	SLC30A5	48595	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.484614607949698
chr5	70772003	70772134	70772073	Y	NA	BDP1	NA	NA	NA	NA	BDP1	22561	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr5	71045616	71045849	71045733	Y	NA	CARTPT	MCCC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	CARTPT	32626	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr5	71505945	71506221	71506083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTCD2	107973	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	71643596	71644131	71643868	Y	NA	PTCD2,MRPS27	NA	NA	NA	NA	MRPS27	29123	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr5	71659094	71659472	71659166	Y	NA	PTCD2,MRPS27	NA	NA	NA	NA	MRPS27	44621	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr5	71748206	71748633	71748536	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS27	133733	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr5	71763835	71764098	71763993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS27	149362	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	71790341	71790453	71790397	Y	MAP1B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS27	175868	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	71790679	71790815	71790747	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS27	176206	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	71800012	71800268	71800102	Y	ZNF366	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS27	185539	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	71896178	71896784	71896469	Y	NA	NA	TNPO1,ZNF366,PTCD2	IMR90	Hi-C	24141950	TNPO1	213355	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr5	71998945	71999238	71999064	Y	NA	NA	ZNF366,TNPO1	IMR90	Hi-C	24141950	TNPO1	110901	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr5	72511984	72512100	72512037	Y	FOXD1	NA	FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3	IMR90	Hi-C	24141950	FOXD1	230252	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	72512311	72512636	72512493	Y	FOXD1	NA	FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3	IMR90	Hi-C	24141950	FOXD1	229716	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	72607592	72607820	72607706	Y	NA	NA	FCHO2,FOXD1,TMEM171,BTF3	IMR90	Hi-C	24141950	FOXD1	134532	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	72792808	72793048	72792966	Y	NA	BTF3	NA	NA	NA	NA	BTF3	575	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	73162116	73162205	73162161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRA2	302605	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	74616844	74617109	74616992	Y	COL4A3BP,COL4A3BP	HMGCR,CTD-2235C13.2	NA	NA	NA	NA	HMGCR	13045	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr5	74805918	74806308	74805968	Y	NA	POLK	NA	NA	NA	NA	COL4A3BP	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	74883919	74884208	74884013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A3BP	77956	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	74974099	74974276	74974194	Y	ANKRD31,COL4A3BP,POLK,COL4A3BP,POC5	POC5	NA	NA	NA	NA	POC5	37037	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	74997783	74997822	74997793	Y	COL4A3BP,COL4A3BP	POC5	NA	NA	NA	NA	POC5	13491	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	76034658	76035100	76034908	Y	IQGAP2	F2R	NA	NA	NA	NA	F2R	24790	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr5	76102045	76102389	76102284	Y	F2RL1	NA	F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R	IMR90	Hi-C	24141950	F2R	92177	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	76110007	76110333	76110205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	F2R	100139	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	76527343	76527617	76527432	Y	S100Z	NA	NA	NA	NA	NA	ZBED3	146195	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	76590045	76590451	76590191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBED3	208897	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr5	76958449	76958840	76958645	Y	NA	WDR41	NA	NA	NA	NA	WDR41	44013	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	77140620	77140840	77140736	Y	NA	TBCA	NA	NA	NA	NA	TBCA	21764	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr5	77582031	77582256	77582186	Y	AP3B1	AP3B1	NA	NA	NA	NA	AP3B1	6323	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	77792703	77793028	77792954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	138364	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	77807354	77807759	77807583	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	153015	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	77826174	77826769	77826484	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	171835	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	78013975	78014102	78013987	Y	NA	LHFPL2	ARSB,SCAMP1,LHFPL2	IMR90	Hi-C	24141950	LHFPL2	49742	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	78270986	78271091	78271032	Y	NA	ARSB	NA	NA	NA	NA	ARSB	8819	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr5	78439900	78440059	78439990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMGDH	89802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr5	78612719	78612843	78612781	Y	JMY	CTC-451P13.1	NA	NA	NA	NA	CTC-451P13.1	33978	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	78990549	78990790	78990669	Y	THBS4,CMYA5	NA	NA	NA	NA	NA	PAPD4	84606	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	79428091	79428419	79428255	Y	SERINC5	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	121479	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	79543086	79543324	79543242	Y	ZFYVE16,SERINC5	SERINC5	NA	NA	NA	NA	SERINC5	6574	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr5	79768084	79768333	79768119	Y	NA	FAM151B,CTD-2015H6.3,RPL7P24	NA	NA	NA	NA	FAM151B	13455	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr5	80026504	80026674	80026589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHFR	77702	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	80260404	80260721	80260547	Y	NA	RASGRF2	NA	NA	NA	NA	RASGRF2	5913	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr5	80564528	80564843	80564784	Y	NA	CKMT2-AS1,ZCCHC9	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	30536	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	80898051	80898414	80898329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP2	147202	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	80989989	80990372	80990282	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP2	55244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	CTD-2249K22.1	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2249K22.1	2217	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.790289309446295
chr5	82356692	82356869	82356781	Y	NA	XRCC4,TMEM167A	NA	NA	NA	NA	XRCC4	14448	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr5	82453115	82453241	82453191	Y	TMEM167A,XRCC4,VCAN	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM167A	81433	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	82608517	82608916	82608727	Y	TMEM167A,XRCC4,VCAN	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM167A	236835	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	82670509	82670662	82670577	Y	TMEM167A,VCAN	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM167A	298827	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	86610420	86610785	86610768	Y	NA	RASA1	NA	NA	NA	NA	RASA1	48715	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	86629389	86629577	86629451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA1	67684	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	86649300	86650123	86649885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNH	56713	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	86653612	86653965	86653789	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNH	52871	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	86662563	86662890	86662661	Y	RASA1,RASA1	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	43946	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	86667091	86667409	86667357	Y	NA	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	39427	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr5	86673186	86673474	86673330	Y	CCNH,CCNH	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	33362	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	88063737	88063896	88063817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2C	134026	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	88598870	88599245	88599100	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2C	400948	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	90458384	90458975	90458686	Y	ARRDC3	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-90P	105569	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	90597376	90597666	90597555	Y	ARRDC3	RNU4-90P,LUCAT1	GPR98,ARRDC3,LOC100129716	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LUCAT1	10553	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	90673049	90673245	90673226	Y	ARRDC3	ARRDC3	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	3931	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	90680524	90680637	90680608	Y	ARRDC3	ARRDC3	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	3348	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	90686186	90686389	90686288	Y	NA	ARRDC3	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	9010	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	90772639	90772960	90772848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	95463	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr5	92932960	92933102	92933051	Y	NA	NR2F1	NA	NA	NA	NA	NR2F1	15917	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.403237048966109
chr5	92935260	92935353	92935337	Y	NA	NR2F1	NA	NA	NA	NA	NR2F1	18217	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.746584079384396
chr5	92940140	92940350	92940245	Y	NR2F1	NR2F1	NA	NA	NA	NA	NR2F1	23097	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr5	92949916	92950260	92950088	Y	NA	NR2F1	NA	NA	NA	NA	NR2F1	32873	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr5	93013083	93013343	93013254	Y	NA	NPM1P27	NA	NA	NA	NA	NPM1P27	4030	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	93256507	93256894	93256879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	188510	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr5	93434612	93434657	93434635	Y	NA	FAM172A	NA	NA	NA	NA	FAM172A	10747	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr5	93638641	93638753	93638697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	193237	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr5	93758562	93758770	93758652	Y	FAM172A,KIAA0825	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD32	193282	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr5	93768342	93768439	93768383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD32	183613	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr5	93769266	93769440	93769342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD32	182612	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	93853995	93854051	93854006	Y	ANKRD32	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD32	98001	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.91187728208936
chr5	93900444	93900820	93900632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD32	51232	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr5	94033836	94034405	94034124	Y	KIAA0825,ANKRD32	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0825	81527	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.715639474330855
chr5	94038768	94039036	94038830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0825	86459	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr5	94049532	94049756	94049644	Y	KIAA0825	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0825	97223	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr5	94052096	94052474	94052285	Y	KIAA0825	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0825	99787	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr5	94072643	94072953	94072798	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0825	120334	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	94380006	94380293	94380145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTP1	237986	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	94843632	94843977	94843805	Y	NA	TTC37,ARSK	NA	NA	NA	NA	TTC37	44734	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	95048086	95048445	95048385	Y	NA	RHOBTB3,CTD-2154I11.2	RHOBTB3,ARSK,SPATA9,RFESD	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RHOBTB3	860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr5	95094861	95094991	95094889	Y	NA	RHOBTB3,CTD-2154I11.2	GLRX	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2154I11.2	28862	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr5	95113820	95114121	95113969	Y	NA	CTD-2154I11.2,GLRX	NA	NA	NA	NA	GLRX	42588	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	95170246	95170624	95170377	Y	GLRX,ELL2	GLRX,C5orf27,AC008592.5	RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLRX	13537	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.180053019272583
chr5	95170754	95171173	95170855	Y	GLRX,ELL2	GLRX,C5orf27,AC008592.5	RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLRX	14045	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.581673840308548
chr5	95178953	95179190	95179087	Y	GLRX,ELL2	GLRX,C5orf27,AC008592.5	GLRX,SPATA9,RFESD,RHOBTB3,C5orf27	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C5orf27	6746	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	95199166	95199388	95199264	Y	GLRX,ELL2	GLRX,C5orf27,AC008592.5	NA	NA	NA	NA	AC008592.5	3676	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr5	95295681	95296335	95296056	Y	ELL2	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2337A12.1,ELL2	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.179322870082216
chr5	95298372	95298734	95298686	Y	ELL2	CTD-2337A12.1,ELL2	NA	NA	NA	NA	ELL2	2597	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	95403711	95404019	95403912	Y	ELL2	NA	ELL2,CAST,MIR583,C5orf27	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ELL2	107936	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr5	95406696	95406840	95406768	Y	NA	NA	ELL2,MIR583	IMR90	Hi-C	24141950	ELL2	110921	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	95414896	95415105	95415065	Y	GLRX,ELL2	NA	NA	NA	NA	NA	ELL2	119121	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	95507678	95508048	95507916	Y	NA	NA	ELL2,MIR583	IMR90	Hi-C	24141950	ELL2	211903	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr5	95594948	95595289	95595074	Y	ELL2	NA	ELL2,RFESD,GLRX	IMR90	Hi-C	24141950	PCSK1	172558	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	95845653	95846023	95845804	Y	NA	CAST	NA	NA	NA	NA	CAST	12948	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.440023299148021
chr5	95873123	95873359	95873236	Y	LNPEP,CAST,CAST	CAST	ELL2,PCSK1,CAST	IMR90	Hi-C	24141950	CAST	14152	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	96142552	96142955	96142798	Y	CAST,CAST,LNPEP	ERAP1	NA	NA	NA	NA	ERAP1	749	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr5	98175322	98175662	98175493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGMB-AS1	68149	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr5	98262747	98263243	98263080	Y	CHD1	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.164024160336071
chr5	99382569	99383254	99382906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	485712	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.413807226403367
chr5	99386410	99387139	99386777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	481827	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	480121	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.503528737185248
chr5	99389717	99390411	99390143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	478555	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	100113377	100113868	100113542	Y	ST8SIA4,ST8SIA4	NA	NA	NA	NA	NA	FAM174A	244368	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr5	102091646	102092087	102091846	Y	NA	PAM	NA	NA	NA	NA	PAM	3961	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.310403233805485
chr5	105752390	105752961	105752697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	1251635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	106803068	106803432	106803267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	201164	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	106823409	106823505	106823457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	181091	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr5	106878561	106878904	106878854	Y	EFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	125692	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr5	106900103	106900354	106900202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	104242	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	106908701	106908838	106908775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	95758	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	106967635	106967784	106967710	Y	NA	EFNA5	NA	NA	NA	NA	EFNA5	36812	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	107004755	107005118	107004922	Y	NA	EFNA5	NA	NA	NA	NA	EFNA5	159	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	108137615	108137706	108137661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FER	56092	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.189510083890358
chr5	108791627	108791782	108791705	Y	NA	PJA2	PJA2	IMR90	Hi-C	24141950	PJA2	47932	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr5	109125780	109125881	109125831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAN2A1	102713	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	109870902	109871116	109871008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A46	200721	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	110846985	110847356	110847238	Y	WDR36,STARD4	STARD4	NA	NA	NA	NA	STARD4	697	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr5	110865894	110866475	110866210	Y	STARD4	STARD4	NA	NA	NA	NA	STARD4	19606	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	111502817	111502914	111502867	Y	C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,EPB41L4A	EPB41L4A-AS1	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A-AS1	8594	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.265428961374692
chr5	111528702	111529013	111528858	Y	EPB41L4A	EPB41L4A-AS1	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A-AS1	34479	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	111742657	111742758	111742708	Y	NA	EPB41L4A	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A	10255	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr5	112054250	112054372	112054293	Y	NA	APC	NA	NA	NA	NA	APC	13055	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	112218687	112219263	112218745	Y	APC	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	SRP19	23768	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr5	112219334	112219897	112219506	Y	NA	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	SRP19	24415	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr5	112251574	112251628	112251601	Y	NA	REEP5	NA	NA	NA	NA	REEP5	4608	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166753501085698
chr5	112509140	112509432	112509369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP2	198741	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr5	112585066	112585229	112585152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCC	237298	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	113754554	113754720	113754637	Y	KCNN2,KCNN2	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM36-IT1	728621	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	114726097	114726311	114726134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC112	95569	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	114749513	114749705	114749609	Y	FEM1C	NA	FEM1C	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC112	118985	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	114750887	114751289	114751050	Y	NA	NA	FEM1C	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC112	120359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	114755701	114755980	114755870	Y	PGGT1B,TICAM2,FEM1C	NA	FEM1C,TMED7-TICAM2	IMR90	Hi-C	24141950	FEM1C	122611	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr5	114847596	114847935	114847760	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	30656	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.455669194455417
chr5	114848957	114849251	114849109	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	29340	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr5	114959651	114959879	114959766	Y	COMMD10	AC010226.4,TMED7	NA	NA	NA	NA	TMED7-TICAM2,TICAM2	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	114970299	114970641	114970577	Y	NA	AC010226.4,TMED7-TICAM2,TICAM2,TMED7	NA	NA	NA	NA	TMED7	3610	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr5	115236990	115237113	115237051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATG12	61435	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	115420076	115420175	115420113	Y	LOC644100	CTD-2287O16.1,COMMD10	NA	NA	NA	NA	COMMD10	1388	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	115794810	115794877	115794844	Y	COMMD10,SEMA6A	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-118N6.1	101381	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	115911792	115912152	115911976	Y	SEMA6A	CTB-118N6.1,SEMA6A	NA	NA	NA	NA	SEMA6A	3162	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	116259364	116259561	116259432	Y	SEMA6A	NA	NA	NA	NA	NA	RPS17P2	209435	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	117774677	117774715	117774696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP2	532776	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr5	118453384	118453586	118453485	Y	NA	CTB-161M19.4,RP11-950K24.2	NA	NA	NA	NA	RP11-950K24.2	8553	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr5	118592872	118593203	118593036	Y	NA	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	9184	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	118605337	118605637	118605457	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	2950	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr5	118609146	118609633	118609193	Y	NA	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	6759	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	118610393	118610883	118610628	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	8006	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.460397726764304
chr5	118627745	118627943	118627845	Y	NA	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	25358	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr5	118659966	118660476	118660173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	57579	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr5	118666258	118666609	118666386	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	63871	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	118667521	118667660	118667595	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	65134	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	118677194	118677610	118677495	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	74807	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	118678067	118678220	118678144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	75680	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	118701841	118702237	118702039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSD17B4	83901	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	118725501	118725774	118725509	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	NA	HSD17B4	60364	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr5	118733226	118733719	118733474	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	NA	HSD17B4	52419	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr5	118734927	118735157	118735058	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	NA	HSD17B4	50981	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr5	118747776	118748171	118748023	Y	NA	HSD17B4	NA	NA	NA	NA	HSD17B4	37967	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	119016321	119016356	119016339	Y	NA	CTC-507E12.1	NA	NA	NA	NA	CTC-507E12.1	2429	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	119940626	119940961	119940736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-507E12.1	926734	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	120004624	120004640	120004633	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-507E12.1	990732	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr5	121516793	121517196	121516968	Y	LOX,LOX	NA	NA	NA	NA	NA	LOX	104813	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	121523144	121523526	121523308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LOX	111164	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	122087226	122087448	122087366	Y	NA	SNX2	PRDM6	IMR90	Hi-C	24141950	SNX2	21243	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.279458628751944
chr5	122181959	122182300	122182177	Y	NA	SNX24	NA	NA	NA	NA	SNX24	4825	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr5	122765811	122765999	122765906	Y	NA	CEP120	CEP120	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CEP120	8525	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr5	122796075	122796194	122796152	Y	CEP120	CEP120,CSNK1G3	CSNK1G3	IMR90	Hi-C	24141950	CEP120	38789	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr5	122885327	122885717	122885442	Y	CEP120,CSNK1G3	CSNK1G3	NA	NA	NA	NA	CSNK1G3	39534	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	123149626	123149860	123149667	Y	NA	NA	ZNF608	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1G3	303833	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr5	123150600	123150782	123150669	Y	NA	NA	ZNF608	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1G3	304807	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr5	123738017	123738276	123738143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-436H11.1	404650	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr5	123997171	123997561	123997207	Y	ZNF608	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-436H11.1	145365	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	125686848	125687181	125687011	Y	GRAMD3	GRAMD3	GRAMD3,ALDH7A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GRAMD3	6643	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	125690030	125690185	125690123	Y	GRAMD3,GRAMD3	GRAMD3	GRAMD3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GRAMD3	3639	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr5	125721947	125722154	125722072	Y	NA	GRAMD3	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	28123	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	125773418	125773804	125773609	Y	GRAMD3	NA	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	79594	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	125779791	125780174	125779834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	85967	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr5	125782209	125782552	125782386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	88385	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	126149471	126149945	126149720	Y	NA	RP11-434D11.4,LMNB1	NA	NA	NA	NA	LMNB1	39156	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	126181513	126181654	126181594	Y	MARCH3	NA	NA	NA	NA	NA	LMNB1	71198	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	126478879	126479210	126479043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARCH3	114379	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	126847905	126848122	126848004	Y	NA	PRRC1	PRRC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	PRRC1	3179	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.27015749368358
chr5	127611074	127611113	127611094	Y	FBN2	NA	NA	NA	NA	NA	SLC12A2	193616	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	128432436	128432693	128432508	Y	SLC27A6,SLC27A6,ISOC1	ISOC1	NA	NA	NA	NA	ISOC1	3992	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	130718102	130718482	130718270	Y	FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42SE2	138916	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	130872269	130872423	130872341	Y	FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF6	96506	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	130970028	130970178	130970095	Y	FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6	RAPGEF6	NA	NA	NA	NA	RAPGEF6	1099	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	130971517	130972046	130971999	Y	NA	RAPGEF6	NA	NA	NA	NA	RAPGEF6	2588	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	131074214	131074509	131074363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP1	56201	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr5	131316068	131316385	131316249	Y	ACSL6,ACSL6,ACSL6	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP1	185358	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	131439036	131439325	131439215	Y	NA	NA	PDLIM4,IL3	IMR90	Hi-C	24141950	SLC22A4	188811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	131594769	131595694	131595371	Y	PDLIM4	SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	SLC22A4	32442	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	131603786	131604244	131603934	Y	NA	SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	SLC22A4	23892	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	131629178	131629624	131629352	Y	FNIP1,IRF1,SLC22A4	SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	170	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.477539698520299
chr5	131633963	131634368	131634191	Y	IRF1,SLC22A4	SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	4955	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	131757211	131757329	131757283	Y	SLC22A4,IRF1	C5orf56,AC116366.6	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	C5orf56	12883	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	131774835	131775712	131775188	Y	SLC22A4,IRF1	C5orf56,AC116366.6,IRF1	NA	NA	NA	NA	C5orf56	30507	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	131832561	131832909	131832704	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.6,IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8071	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.79355754337445
chr5	131833002	131833333	131833168	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.6,IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8512	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	131833993	131834254	131834119	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.6,IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	9503	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	131981394	131981469	131981432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF3A	89861	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr5	132323487	132323535	132323508	Y	NA	AFF4,AC010240.3,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	AC010240.3	1685	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.131080363723269
chr5	132551805	132551897	132551851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA4	166151	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	132628245	132628453	132628349	Y	GDF9	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA4	242591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	133465161	133465539	133465291	Y	UBE2B,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	TCF7,SKP1	NA	NA	NA	NA	TCF7	16759	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	133540709	133541017	133540863	Y	NA	SKP1,PPP2CA	NA	NA	NA	NA	PPP2CA	18816	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr5	133681629	133682059	133681927	Y	NA	CDKL3,UBE2B	NA	NA	NA	NA	CDKL3	22679	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	133801466	133801754	133801589	Y	NA	AC005355.2	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.2	38489	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.589131713367063
chr5	133802349	133802592	133802584	Y	PPP2CA,SEC24A,UBE2B	AC005355.2	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.2	37651	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr5	133839310	133839404	133839346	Y	NA	AC005355.2	PHF15,PPP2CA,CDKL3,CDKN2AIPNL,SAR1B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.2	839	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr5	133847692	133847829	133847767	Y	NA	AC005355.2	PHF15,CDKN2AIPNL,CDKL3,UBE2B,SKP1,PPP2CA	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.2	7449	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr5	133863130	133863560	133863438	Y	NA	AC005355.2	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	22887	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr5	133880902	133881116	133881009	Y	PCBD2,CDKL3,PHF15	AC005355.2	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	40659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	133890161	133890536	133890268	Y	TCF7,PPP2CA,CDKL3,UBE2B,SEC24A,CAMLG,PHF15	AC005355.2	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	49918	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr5	133890594	133890960	133890666	Y	PPP2CA,UBE2B,SEC24A	NA	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	50351	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr5	133891612	133892163	133891823	Y	PPP2CA,UBE2B,SEC24A	NA	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	51369	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.350804903476802
chr5	134259128	134259903	134259220	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461	NA	NA	NA	NA	MTND5P11	246	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.351535052667168
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND4P12,MIR4461	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.751312611693284
chr5	134469772	134469821	134469797	Y	C5orf20	NA	PCBD2,LOC340073,PITX1,CATSPER3,H2AFY	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITX1	101269	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr5	134471631	134472059	134471710	Y	C5orf20,PITX1	NA	PCBD2,LOC340073,CATSPER3,H2AFY,PITX1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITX1	103128	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.96909162935895
chr5	134475601	134475808	134475692	Y	PITX1	NA	LOC340073,PCBD2,CATSPER3,H2AFY	IMR90	Hi-C	24141950	PITX1	107098	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.999096486201318
chr5	134727973	134728292	134728105	Y	H2AFY	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	5312	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	134733668	134734080	134733976	Y	H2AFY	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	64	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr5	135347172	135347285	135347252	Y	NA	TGFBI	TGFBI,VTRNA2-1,FBXL21	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBI	15299	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	135356057	135356513	135356322	Y	NA	TGFBI	VTRNA2-1,TGFBI,FBXL21,LECT2,SMAD5	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBI	6071	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr5	135416297	135416409	135416350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD5	50125	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr5	135538532	135538688	135538610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD5	71998	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	136592978	136593359	136593358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOCK1	338709	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	136727566	136727823	136727577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOCK1	204245	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	136900041	136900222	136900186	Y	NA	SPOCK1	TRPC7	IMR90	Hi-C	24141950	SPOCK1	31846	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.6566892039942
chr5	137075973	137076263	137076118	Y	NA	HNRNPA0	NA	NA	NA	NA	HNRNPA0	11776	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	137333439	137333810	137333723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM13B	51840	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr5	137370531	137370718	137370637	Y	PKD2L2,KDM3B,FAM53C,FAM53C,FAM13B,NME5	FAM13B	PKD2L2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM13B	14932	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.223184029693526
chr5	137784370	137784924	137784495	Y	NA	EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	14255	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	137785775	137785891	137785836	Y	WNT8A,NME5,LRRTM2,REEP2	EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	13288	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.56910447131203
chr5	137800317	137800564	137800421	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1	EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	1138	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.538315795807899
chr5	137827710	137828119	137827817	Y	EGR1	EGR1,ETF1	NA	NA	NA	NA	EGR1	28531	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr5	137870529	137870619	137870574	Y	FAM53C,KDM3B,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	6370	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	137881069	137881276	137881109	Y	WNT8A,FAM53C,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	4080	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr5	137908044	137908328	137908223	Y	NA	ETF1,HSPA9,CTNNA1	NA	NA	NA	NA	HSPA9	805	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr5	138127302	138127500	138127374	Y	NA	AC034243.1	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	40304	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr5	138248139	138248403	138248239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	161141	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	138258617	138258897	138258757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	171619	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr5	138262166	138262549	138262196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	175168	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	138277949	138278244	138278038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	190951	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr5	138620359	138620541	138620439	Y	UBE2D2,MATR3	MATR3,SIL1	NA	NA	NA	NA	SIL1	6705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.173481224953846
chr5	138686401	138686737	138686569	Y	NA	PAIP2,SLC23A1	NA	NA	NA	NA	PAIP2	11125	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr5	138897527	138897822	138897662	Y	MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2	TMEM173,UBE2D2	DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBE2D2	6194	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.622422695541115
chr5	138965572	138965797	138965632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	59087	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.24740091087892
chr5	139015811	139016118	139015905	Y	MATR3,MATR3,MZB1,CXXC5	CXXC5	CXXC5	IMR90	Hi-C	24141950	CXXC5	8766	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	139017086	139017541	139017145	Y	CXXC5	CXXC5	CXXC5	IMR90	Hi-C	24141950	CXXC5	7343	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr5	139017934	139018665	139018227	Y	MZB1,CXXC5	CXXC5	CXXC5	IMR90	Hi-C	24141950	CXXC5	6219	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr5	139022530	139022885	139022670	Y	NA	CXXC5	CXXC5	IMR90	Hi-C	24141950	CXXC5	1999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.164024160336071
chr5	139023017	139023340	139023136	Y	NA	CXXC5	CXXC5	IMR90	Hi-C	24141950	CXXC5	1544	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	139031397	139032095	139031636	Y	C5orf53,PSD2,NRG2,CXXC5	CXXC5	NA	NA	NA	NA	CXXC5	6513	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr5	139040519	139041115	139040855	Y	PAIP2	CXXC5	NA	NA	NA	NA	CXXC5	15635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.393779984348334
chr5	139088295	139089196	139088669	Y	NA	NA	CXXC5	K562	ChIA-PET	22265404	CXXC5	63411	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	139488718	139489038	139488945	Y	NA	PURA,IGIP	NRG2,CYSTM1,IGIP	IMR90	Hi-C	24141950	PURA	3356	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	139629538	139629745	139629587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN1	50961	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr5	139631101	139631601	139631302	Y	SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	49105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr5	139633683	139634086	139633757	Y	SRA1,IK,HBEGF,EIF4EBP3,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	46620	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	139636160	139636260	139636251	Y	SRA1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	44446	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.254128634747068
chr5	139638984	139639383	139639269	Y	C5orf32,ZMAT2,SRA1,IK,HARS2,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	41323	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	139677985	139678148	139678067	Y	NA	PFDN1,HBEGF	NA	NA	NA	NA	PFDN1	2558	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	139683573	139683663	139683637	Y	NA	PFDN1,HBEGF	NA	NA	NA	NA	PFDN1	2867	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr5	139782360	139782578	139782471	Y	NA	RNU4-14P,ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3	NA	NA	NA	NA	ANKHD1-EIF4EBP3	2867	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.31586191530474
chr5	139933633	139933898	139933723	Y	ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3	SRA1,SLC35A4,APBB3	NA	NA	NA	NA	SRA1	1997	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr5	140090601	140091006	140090806	Y	NA	WDR55,DND1,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-1	1741	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.619693354791488
chr5	140098281	140098628	140098472	Y	NA	DND1,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-3	5115	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.467855599822819
chr5	140648312	140648399	140648356	Y	NA	PCDHB14,TAF7	NA	NA	NA	NA	PCDHB14	47381	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	140875639	140876085	140875835	Y	PCDHB16,TAF7,RELL2,DIAPH1	NA	NA	NA	NA	NA	PCDHGA10	84896	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	140985133	140985553	140985464	Y	TAF7,PCDH12,KIAA0141,ARAP3,DIAPH1	DIAPH1,HDAC3,RELL2,FCHSD1	NA	NA	NA	NA	DIAPH1	11069	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr5	141138262	141138286	141138277	Y	NA	NA	LOC729080,PCDH12,KIAA0141,RNF14,ARAP3,PCDH1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARAP3	78474	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	141201064	141201327	141201197	Y	PCDH1	NA	PCDH1,LOC729080,FCHSD1,ARAP3,KIAA0141,PCDH12,RNF14	IMR90	Hi-C	24141950	PCDH1	55484	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr5	141209314	141209613	141209459	Y	NA	PCDH1	PCDH1,ARAP3,FCHSD1,LOC729080,RNF14	IMR90	Hi-C	24141950	PCDH1	47198	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	141256552	141256862	141256814	Y	PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1,PCDH1	KIAA0141	NA	NA	NA	NA	PCDH1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr5	141311332	141311399	141311366	Y	NA	KIAA0141,RNF14	NA	NA	NA	NA	KIAA0141	9959	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	141404371	141404781	141404694	Y	DIAPH1,FCHSD1	GNPDA1	GNPDA1,NDFIP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GNPDA1	13765	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.120163000724761
chr5	141736379	141736797	141736670	Y	ARHGAP26	SPRY4	NDFIP1,FGF1,SPRY4,GNPDA1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SPRY4	32359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.198081069768355
chr5	141977799	141977936	141977865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	170013	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	142157420	142157683	142157517	Y	NA	ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	9471	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	142209487	142209761	142209583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	61538	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	142315332	142315934	142315386	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	167383	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr5	142580387	142580630	142580509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	129540	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	142623562	142623962	142623719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	86208	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.380133280600199
chr5	142625760	142626024	142625785	Y	ARHGAP26,NR3C1,NR3C1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	84146	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr5	142690864	142691375	142691192	Y	NR3C1,NR3C1	RPL7P21	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	18795	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	142785420	142785784	142785543	Y	NR3C1	NR3C1	ARHGAP26	IMR90	Hi-C	24141950	NR3C1	27293	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151837754968669
chr5	142875254	142875630	142875434	Y	NR3C1,NR3C1	NA	ARHGAP26,NR3C1,HMHB1	IMR90	Hi-C	24141950	NR3C1	62177	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr5	142930383	142930535	142930459	Y	NA	NA	ARHGAP26,NR3C1	IMR90	Hi-C	24141950	NR3C1	117306	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	142937060	142937324	142937206	Y	NR3C1,NR3C1	NA	ARHGAP26,HMHB1,NR3C1,YIPF5	IMR90	Hi-C	24141950	NR3C1	123983	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	142956241	142956608	142956394	Y	NR3C1,NR3C1	NA	HMHB1,NR3C1,ARHGAP26	IMR90	Hi-C	24141950	NR3C1	143164	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr5	142960828	142960965	142960872	Y	NR3C1,NR3C1	NA	HMHB1,NR3C1,ARHGAP26	IMR90	Hi-C	24141950	NR3C1	147751	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	142974978	142975222	142975128	Y	NR3C1,NR3C1	NA	ARHGAP26,NR3C1,KCTD16,YIPF5,HMHB1	IMR90	Hi-C	24141950	NR3C1	161901	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr5	143567299	143567675	143567503	Y	NA	YIPF5	NA	NA	NA	NA	YIPF5	19021	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr5	143569314	143569909	143569557	Y	KCTD16	YIPF5	NA	NA	NA	NA	YIPF5	21036	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr5	144549099	144549238	144549211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELID2	663694	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	144741919	144742138	144742043	Y	NA	NA	KCTD16,SH3RF2	IMR90	Hi-C	24141950	PRELID2	470794	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	145498086	145498488	145498483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARS	61735	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr5	145499175	145499563	145499369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARS	60660	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	145827727	145827826	145827802	Y	NA	TCERG1	GPR151	IMR90	Hi-C	24141950	TCERG1	2853	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr5	146832241	146832308	146832261	Y	JAKMIP2,DPYSL3	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf46	451793	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	147603808	147604119	147603866	Y	SPINK6,SPINK13	SPINK6,CTC-295J13.3,SPINK13	NA	NA	NA	NA	CTC-295J13.3	12014	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.917335963588614
chr5	147605275	147606051	147605859	Y	NA	SPINK6,CTC-295J13.3,SPINK13	NA	NA	NA	NA	CTC-295J13.3	10082	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.229025674821897
chr5	147616301	147616769	147616552	Y	FBXO38	SPINK6,CTC-295J13.3,SPINK13	NA	NA	NA	NA	CTC-295J13.3	168	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr5	147621065	147621397	147621193	Y	NA	SPINK6,CTC-295J13.3,SPINK13	NA	NA	NA	NA	CTC-295J13.3	4932	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	147646107	147646243	147646175	Y	NA	CTC-295J13.3,SPINK13,SPINK7	NA	NA	NA	NA	SPINK13	364	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	147722722	147723108	147722793	Y	SPINK14,SPINK7	SPINK7,RP11-373N22.3,FBXO38	NA	NA	NA	NA	SPINK7	32740	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166753501085698
chr5	147777538	147777934	147777556	Y	NA	RP11-373N22.3,FBXO38	NA	NA	NA	NA	FBXO38	16040	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	148170506	148170627	148170569	Y	FBXO38,ADRB2	ADRB2	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	33529	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	148172345	148172765	148172447	Y	FBXO38,ADRB2	ADRB2	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	31391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr5	148290314	148290586	148290452	Y	NA	NA	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	86158	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr5	148292484	148292904	148292843	Y	NA	NA	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	88328	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr5	148293572	148293925	148293745	Y	NA	NA	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	89416	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	148336270	148336420	148336344	Y	NA	NA	ADRB2,ABLIM3,SH3TC2	IMR90	Hi-C	24141950	SH3TC2	104306	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr5	148349939	148350092	148350025	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3TC2	90634	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	148352583	148352893	148352766	Y	ADRB2	NA	NA	NA	NA	NA	SH3TC2	87833	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	148508817	148508996	148508890	Y	NA	ABLIM3	ADRB2,AFAP1L1,SH3TC2,ABLIM3,PCYOX1L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ABLIM3	10050	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	148514080	148514173	148514127	Y	NA	ABLIM3	ABLIM3,AFAP1L1,ADRB2,SH3TC2	IMR90	Hi-C	24141950	ABLIM3	4873	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr5	148520255	148520308	148520282	Y	NA	ABLIM3	NA	NA	NA	NA	ABLIM3	1209	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	148549934	148550119	148550027	Y	ABLIM3	ABLIM3	AFAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	ABLIM3	30888	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	148664486	148664850	148664668	Y	NA	AFAP1L1	NA	NA	NA	NA	AFAP1L1	15052	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	148700478	148700631	148700542	Y	NA	GRPEL2,PCYOX1L	GRPEL2,PCYOX1L	IMR90	Hi-C	24141950	GRPEL2	22362	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr5	148738164	148738422	148738235	Y	PCYOX1L	GRPEL2,PCYOX1L,MIR143HG	NA	NA	NA	NA	PCYOX1L	2594	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr5	148822199	148822381	148822290	Y	NA	MIR143HG	NA	NA	NA	NA	MIR143HG	37947	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	149110531	149110757	149110649	Y	PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2670	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr5	149110836	149111455	149111198	Y	ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2975	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.154567095718296
chr5	149111581	149111664	149111645	Y	NA	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	3720	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	149162715	149163110	149162913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	54854	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	149318595	149318961	149318771	Y	CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3	SLC26A2	NA	NA	NA	NA	SLC26A2	19339	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr5	149319494	149320025	149319793	Y	CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3	SLC26A2	NA	NA	NA	NA	SLC26A2	18275	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr5	149339062	149339484	149339111	Y	CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3	SLC26A2,HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	SLC26A2	762	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr5	149379132	149379170	149379142	Y	NA	SLC26A2,HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	TIGD6	402	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr5	149422019	149422297	149422100	Y	NA	HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	TIGD6	43289	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	149518246	149518623	149518550	Y	NA	PDGFRB	NA	NA	NA	NA	PDGFRB	14812	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.589131713367063
chr5	149522462	149523132	149522666	Y	NA	PDGFRB	NA	NA	NA	NA	PDGFRB	10303	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328431284301258
chr5	149852669	149852742	149852704	Y	NA	RPS14,NDST1,CTC-367J11.1	SYNPO,MYOZ3,C5orf62,RPS14,NDST1,DCTN4,RBM22	IMR90	Hi-C	24141950	NDST1	10639	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	150086779	150087134	150086956	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4	RBM22,DCTN4	MYOZ3,RBM22	IMR90	Hi-C	24141950	RBM22	8110	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr5	150108879	150109189	150109172	Y	SYNPO	RBM22,DCTN4	NA	NA	NA	NA	DCTN4	27482	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr5	150454717	150454894	150454780	Y	NA	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	16244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	150455023	150455538	150455407	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	15600	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	150461516	150462400	150461744	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62,SLC36A1,CCDC69,TNIP1	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	8738	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	150462985	150463261	150463131	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	7877	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	150464543	150466084	150465220	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	5054	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr5	150593680	150594043	150593885	Y	DCTN4,DCTN4,TNIP1,SLC36A1,CCDC69	GM2A,CCDC69	NA	NA	NA	NA	GM2A	3969	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	150594261	150594451	150594361	Y	TNIP1,CCDC69,ANXA6	GM2A,CCDC69	NA	NA	NA	NA	GM2A	4550	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	150635446	150635735	150635667	Y	DCTN4,C5orf62,TNIP1,SLC36A1,CCDC69	GM2A,CCDC69	NA	NA	NA	NA	CCDC69	33740	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	151088912	151089056	151088970	Y	SLC36A3	SPARC	NA	NA	NA	NA	SPARC	24186	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	151129219	151129502	151129338	Y	SLC36A1	RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1	NA	NA	NA	NA	RP11-54C4.1	14437	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	151200780	151201112	151200835	Y	GLRA1	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	50687	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	153743049	153743076	153743063	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAP30L-AS1	80334	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	153809274	153809597	153809436	Y	NA	SAP30L-AS1,SAP30L	NA	NA	NA	NA	SAP30L-AS1	13813	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	153896784	153897165	153896975	Y	NA	NA	SAP30L,HAND1	IMR90	Hi-C	24141950	SAP30L	73267	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr5	153900553	153900872	153900681	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAP30L	77036	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.196081878209095
chr5	153903267	153903411	153903357	Y	HAND1	NA	NA	NA	NA	NA	SAP30L	79750	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.295260453608751
chr5	153939934	153940118	153940082	Y	NA	NA	FAM114A2,MFAP3,SAP30L	IMR90	Hi-C	24141950	SAP30L	116417	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	153955712	153955778	153955745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAP30L	132195	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	153963327	153963532	153963423	Y	MRPL22,SAP30L,HAND1	NA	NA	NA	NA	NA	LARP1	126930	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	5.26744740863216
chr5	153983483	153983878	153983688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARP1	106584	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.139807279150677
chr5	153988097	153988522	153988309	Y	NA	NA	GRIA1,FAM114A2,MFAP3,GALNT10,FLJ38109,SAP30L,HAND1,C5orf4	IMR90	Hi-C	24141950	LARP1	101940	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.475313472881334
chr5	153990009	153990256	153990067	Y	NA	NA	GRIA1,FAM114A2,MFAP3,GALNT10,FLJ38109,SAP30L,HAND1,C5orf4	IMR90	Hi-C	24141950	LARP1	100206	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.370293252353308
chr5	154007617	154007930	154007773	Y	NA	NA	C5orf4,MFAP3,FAM114A2	IMR90	Hi-C	24141950	LARP1	82532	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	154071115	154071211	154071188	Y	NA	LARP1	LARP1,C5orf4	IMR90	Hi-C	24141950	LARP1	19251	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr5	154205315	154205569	154205444	Y	KIF4B,GEMIN5	CNOT8	NA	NA	NA	NA	CNOT8	29544	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.254128634747068
chr5	154219246	154219480	154219363	Y	NA	CNOT8	NA	NA	NA	NA	CNOT8	15633	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	154274946	154275114	154275030	Y	NA	CNOT8,GEMIN5,MRPL22	NA	NA	NA	NA	CNOT8	39833	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL22	552820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.649907810654663
chr5	156527508	156527705	156527630	Y	NIPAL4,ADAM19,HAVCR2	HAVCR2	NA	NA	NA	NA	HAVCR2	40175	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	156708045	156708232	156708114	Y	HAVCR2,NIPAL4,ADAM19,CYFIP2,CYFIP2,CYFIP2	CYFIP2	NA	NA	NA	NA	CYFIP2	16956	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr5	156718541	156718931	156718583	Y	HAVCR2,ADAM19,CYFIP2,CYFIP2,CYFIP2	CYFIP2	NA	NA	NA	NA	CYFIP2	27452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	157156902	157157206	157157039	Y	THG1L	THG1L,LSM11	NA	NA	NA	NA	THG1L	697	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	157257409	157257732	157257678	Y	NA	CLINT1	NA	NA	NA	NA	CLINT1	26451	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr5	157284724	157285025	157284835	Y	NIPAL4,ADAM19	CLINT1	LSM11	IMR90	Hi-C	24141950	CLINT1	541	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	157297918	157298287	157298172	Y	NA	CLINT1	CLINT1	IMR90	Hi-C	24141950	CLINT1	13735	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	157521038	157521096	157521067	Y	NA	NA	EBF1	IMR90	Hi-C	24141950	CLINT1	236855	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	158166813	158166864	158166841	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-11I22.1	468065	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	158385170	158385443	158385354	Y	RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,IL12B	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-11I22.1	249486	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	158491555	158491917	158491726	Y	EBF1	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-11I22.1	143012	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr5	158605991	158606398	158606265	Y	NA	CTB-11I22.1,RNF145	NA	NA	NA	NA	CTB-11I22.1	28531	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr5	158611896	158612266	158612182	Y	IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145	CTB-11I22.1,RNF145	NA	NA	NA	NA	CTB-11I22.1	22663	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	158632432	158632664	158632544	Y	NA	CTB-11I22.1,RNF145	NA	NA	NA	NA	CTB-11I22.1	2265	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	158764609	158764870	158764738	Y	RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,IL12B	NA	NA	NA	NA	NA	UBLCP1	76520	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr5	159451021	159451194	159451125	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	16901	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.218455497384639
chr5	159496389	159496537	159496463	Y	NA	PWWP2A	NA	NA	NA	NA	PWWP2A	47893	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	159533500	159533764	159533742	Y	NA	PWWP2A	NA	NA	NA	NA	PWWP2A	10666	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr5	159592107	159592427	159592336	Y	NA	PWWP2A,FABP6	TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FABP6	19947	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.391050643598707
chr5	159592617	159593055	159592885	Y	NA	PWWP2A,FABP6	TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FABP6	19319	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.392319685967601
chr5	159837617	159837836	159837727	Y	NA	C5orf54,SLU7,PTTG1	NA	NA	NA	NA	SLU7	8882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	167126470	167126930	167126675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	589726	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	167716783	167717259	167717053	Y	NA	WWC1	NA	NA	NA	NA	WWC1	127	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	167741798	167742197	167741960	Y	WWC1	WWC1	NA	NA	NA	NA	WWC1	25142	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr5	167744761	167745078	167744891	Y	WWC1	WWC1	NA	NA	NA	NA	WWC1	28105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr5	167752204	167752623	167752553	Y	PANK3	WWC1	RARS	IMR90	Hi-C	24141950	WWC1	35548	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr5	168051900	168052268	168052099	Y	NA	PANK3,CTC-575D19.1	SLIT3	IMR90	Hi-C	24141950	CTC-575D19.1	10583	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr5	169398141	169398453	169398335	Y	NA	FAM196B	NA	NA	NA	NA	FAM196B	7291	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	169404223	169404546	169404350	Y	FAM196B	FAM196B	NA	NA	NA	NA	FAM196B	1198	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr5	170060615	170060931	170060764	Y	RANBP17	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP17	225943	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	170289548	170289859	170289780	Y	NA	RANBP17	NA	NA	NA	NA	RANBP17	2674	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	170378492	170378604	170378547	Y	RANBP17	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP17	91618	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	170878093	170878163	170878150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1	65973	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.120163000724761
chr5	171298269	171298393	171298371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW11	133484	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	171388246	171388386	171388315	Y	UBTD2,STK10	FBXW11	NA	NA	NA	NA	FBXW11	43491	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	171431879	171432256	171432181	Y	UBTD2,STK10	FBXW11	NA	NA	NA	NA	FBXW11	2	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr5	171432610	171432692	171432660	Y	NA	FBXW11	NA	NA	NA	NA	FBXW11	733	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	171498342	171498743	171498483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW11	66465	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	171505010	171505317	171505162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW11	73133	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	171556306	171556459	171556365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK10	56931	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	171560333	171560981	171560496	Y	UBTD2,STK10	NA	NA	NA	NA	NA	STK10	52409	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	171581047	171581366	171581364	Y	NA	STK10	NA	NA	NA	NA	STK10	32024	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	171602273	171602685	171602548	Y	STK10	STK10	NA	NA	NA	NA	STK10	10705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr5	171660495	171660734	171660615	Y	NA	STK10,UBTD2	NA	NA	NA	NA	STK10	47105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	171681735	171682053	171681977	Y	NA	UBTD2	NA	NA	NA	NA	UBTD2	27022	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.265428961374692
chr5	171709316	171709633	171709569	Y	NA	UBTD2	NA	NA	NA	NA	UBTD2	241	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr5	171788471	171789086	171788773	Y	DUSP1,STK10,UBTD2	NA	NA	NA	NA	NA	UBTD2	79396	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.242325193008782
chr5	171847636	171847998	171847816	Y	NA	SH3PXD2B	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2B	31529	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr5	171879589	171880295	171879961	Y	SH3PXD2B	SH3PXD2B	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2B	62	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr5	172142561	172142691	172142626	Y	UBTD2,DUSP1	NA	RPL26L1,LOC100268168,ERGIC1,DUSP1,ATP6V0E1,C5orf41,BNIP1,STC2,NEURL1B,NKX2-5	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DUSP1	53507	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	172160207	172160396	172160286	Y	NA	DUSP1	ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	35802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr5	172160417	172160946	172160788	Y	ATP6V0E1	DUSP1	ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	35252	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.350804903476802
chr5	172192263	172193766	172192583	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2432	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.123778420214165
chr5	172193800	172194232	172193914	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	1966	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	172198749	172199959	172199636	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.494454636196589
chr5	172202171	172203025	172202666	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	5973	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	172205264	172205447	172205353	Y	UBTD2,C5orf41,DUSP1	DUSP1	DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,ATP6V0E1,RPL26L1	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP1	9066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr5	172209593	172209865	172209663	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1,ERGIC1	ERGIC1,DUSP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	13395	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr5	172216221	172216413	172216309	Y	C5orf41,DUSP1	DUSP1,ERGIC1	ERGIC1,DUSP1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	20023	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr5	172234136	172234644	172234380	Y	NA	DUSP1,ERGIC1	DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERGIC1	24634	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.778258833628305
chr5	172308731	172309533	172309021	Y	DUSP1,C5orf41	ERGIC1	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	49453	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	172313877	172314602	172314167	Y	DUSP1,C5orf41	NA	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	54599	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	172350033	172350394	172350214	Y	NA	RPL26L1	NA	NA	NA	NA	RPL26L1	33338	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	172380663	172381064	172380838	Y	ERGIC1,ATP6V0E1	RPL26L1,ATP6V0E1	NA	NA	NA	NA	RPL26L1	2668	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	172442253	172442613	172442433	Y	NA	ATP6V0E1	NA	NA	NA	NA	ATP6V0E1	33493	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	172451248	172451363	172451250	Y	NA	ATP6V0E1	NA	NA	NA	NA	ATP6V0E1	42488	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	172698519	172698848	172698679	Y	NA	NA	ATP6V0E1,BNIP1,C5orf41,LOC285593	IMR90	Hi-C	24141950	STC2	55658	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	172710965	172711353	172711102	Y	NA	STC2	ATP6V0E1,BNIP1,LOC285593,NKX2-5,NEURL1B,RPL26L1,STC2,C5orf41	IMR90	Hi-C	24141950	STC2	43153	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	172879193	172879453	172879250	Y	CPEB4	NA	LOC285593,STC2,BOD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STC2	124687	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	172880266	172880558	172880434	Y	NA	NA	LOC285593,STC2,BOD1,CPEB4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STC2	125760	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	172881373	172881649	172881564	Y	CPEB4	NA	LOC285593,STC2,BOD1,CPEB4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STC2	126867	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr5	172882283	172882785	172882503	Y	NA	NA	LOC285593,STC2,BOD1,NKX2-5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STC2	127777	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.159295628027183
chr5	172921295	172921366	172921331	Y	NA	NA	STC2,LOC285593,BNIP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BOD1	120297	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	173031200	173031306	173031275	Y	NA	BOD1	NA	NA	NA	NA	BOD1	10357	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr5	173153574	173153834	173153704	Y	NA	CTB-43E15.3	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CTB-43E15.3	17380	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr5	173169045	173169768	173169685	Y	NA	CTB-43E15.3	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CTB-43E15.3	1446	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18478155158147
chr5	173169995	173170330	173170163	Y	NA	CTB-43E15.3	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CTB-43E15.3	884	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.441639527078165
chr5	173180419	173180632	173180581	Y	NA	CTB-43E15.3	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CTB-43E15.3	9205	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.878550521847443
chr5	173189921	173190166	173190045	Y	CPEB4	CTB-43E15.3	CPEB4,C5orf47	IMR90	Hi-C	24141950	CTB-43E15.3	18707	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr5	173191567	173191754	173191643	Y	CPEB4	CTB-43E15.3	CPEB4,C5orf47	IMR90	Hi-C	24141950	CTB-43E15.3	20353	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr5	173193377	173193650	173193560	Y	NA	CTB-43E15.3	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CTB-43E15.3	22163	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.29585301625867
chr5	173205115	173205307	173205218	Y	CPEB4	CTB-43E15.3	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CTB-43E15.3	33901	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr5	173205731	173206004	173205814	Y	CPEB4	CTB-43E15.3	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CTB-43E15.3	34517	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	173208911	173209406	173209234	Y	CPEB4	CTB-43E15.3	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CTB-43E15.3	37697	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.385591962099453
chr5	173251298	173251668	173251379	Y	NA	NA	BOD1,CPEB4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CPEB4	61615	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr5	173282717	173283022	173282777	Y	NA	CPEB4	BOD1,C5orf47	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	30261	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172595146214068
chr5	173285551	173285919	173285810	Y	NA	CPEB4	BOD1,C5orf47,CPEB4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CPEB4	27364	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.180053019272583
chr5	173311853	173312083	173311958	Y	NA	CPEB4	NA	NA	NA	NA	CPEB4	1200	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr5	173312606	173312854	173312733	Y	CPEB4	CPEB4	NA	NA	NA	NA	CPEB4	429	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.00801465764057
chr5	173346462	173346760	173346662	Y	NA	CPEB4	NA	NA	NA	NA	CPEB4	33179	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	173369010	173369228	173369031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB4	55727	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	173391031	173391183	173391109	Y	HMP19	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB4	77748	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	173586705	173586920	173586830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-267A15.1	174378	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	173764742	173765021	173764892	Y	NA	RP11-267A15.1	HMP19,MIR4634,MSX2,FLJ16171	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-267A15.1	3444	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	173765324	173765497	173765445	Y	MSX2	RP11-267A15.1	HMP19,MIR4634,MSX2,FLJ16171	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-267A15.1	4026	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr5	173846140	173846257	173846227	Y	NA	NA	MSX2,MIR4634	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-267A15.1	84842	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.186780743140731
chr5	173846628	173846975	173846845	Y	NA	NA	MSX2,MIR4634	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-267A15.1	85330	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr5	173888869	173889090	173888998	Y	NA	NA	MSX2,MIR4634	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-267A15.1	127571	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	173909800	173909986	173909867	Y	NA	NA	MIR4634,MSX2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-267A15.1	148502	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	174906234	174906555	174906308	Y	NA	SFXN1	NA	NA	NA	NA	SFXN1	4169	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	175960481	175960718	175960661	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,RNF44,CDHR2	RNF44	NA	NA	NA	NA	RNF44	2308	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	175962179	175962700	175962413	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,HK3,HIGD2A,RNF44,CDHR2	RNF44	FAF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNF44	326	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr5	176245417	176245632	176245534	Y	EIF4E1B,UNC5A	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN17	173029	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.322589639172887
chr5	176250127	176250448	176250189	Y	GPRIN1,SNCB,EIF4E1B,NSD1,UNC5A	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN17	177739	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr5	176422952	176423155	176423071	Y	HK3,UIMC1,UIMC1,UIMC1,RAB24,GRK6	UIMC1,ZNF346	NA	NA	NA	NA	UIMC1	24479	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	176424414	176424699	176424557	Y	NA	UIMC1,ZNF346	NA	NA	NA	NA	UIMC1	22935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr5	176699119	176699281	176699198	Y	NSD1	RAB24,PRELID1,MXD3	NA	NA	NA	NA	RAB24	29464	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr5	176782864	176783054	176782988	Y	NA	MXD3,LMAN2,RGS14,GRK6	NA	NA	NA	NA	RGS14	26	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	176808266	176808459	176808400	Y	PRR7,DBN1,PRELID1	LMAN2,RGS14,GRK6	NA	NA	NA	NA	GRK6	19746	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	176855088	176855271	176855220	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,NSD1,RAB24,RGS14,FAM193B,GRK6,PRR7,DOK3,DOK3	GRK6,PRR7,PRR7-AS1,DBN1	NA	NA	NA	NA	PRR7	16175	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	176856256	176856655	176856453	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,NSD1,RAB24,RGS14,FAM193B,GRK6,PRR7,DOK3,DOK3	GRK6,PRR7,PRR7-AS1,DBN1	NA	NA	NA	NA	PRR7	14791	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	176972522	176972758	176972729	Y	NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3	PDLIM7,DDX41,FAM193B,TMED9	NA	NA	NA	NA	FAM193B	6784	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr5	176973275	176973657	176973542	Y	NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3	DDX41,FAM193B,TMED9	NA	NA	NA	NA	FAM193B	5885	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	177541057	177541427	177541157	Y	N4BP3	N4BP3,RMND5B,NHP2	NA	NA	NA	NA	N4BP3	2613	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr5	177645267	177645446	177645363	Y	N4BP3,CLK4,AGXT2L2	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15759	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr5	177647239	177647603	177647383	Y	CLK4,AGXT2L2	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	17731	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	178069436	178069827	178069736	Y	NA	CLK4	ZFP2,COL23A1,ZNF879,AACSP1,GRM6	IMR90	Hi-C	24141950	CLK4	13820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	178985972	178986151	178986083	Y	NA	RUFY1	NA	NA	NA	NA	RUFY1	10413	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr5	179513863	179514025	179513944	Y	NA	RNF130	NA	NA	NA	NA	RNF130	16745	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr5	179718006	179718384	179718320	Y	NA	MAPK9	NA	NA	NA	NA	CTB-129O4.1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr5	179892034	179892360	179892206	Y	NA	CTC-573N18.1,CNOT6	GFPT2,RASGEF1C,MAPK9,CNOT6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTC-573N18.1	25475	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	179894931	179895217	179894999	Y	NA	CTC-573N18.1,CNOT6	GFPT2,MAPK9,CNOT6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNOT6	24195	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr5	180396070	180396284	180396178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP62	109784	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr5	180541875	180541994	180541989	Y	OR2Y1	NA	BTNL8,MGAT1	IMR90	Hi-C	24141950	CTC-338M12.5	74930	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr5	180611137	180611357	180611292	Y	MGAT1	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	5567	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.234484356321151
chr5	180615428	180615595	180615512	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	1329	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr5	180615864	180616079	180615972	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	845	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr5	180616521	180617006	180616799	Y	ZFP62,TRIM52,TRIM41	TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr5	180633694	180634117	180633980	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1	NA	NA	NA	NA	TRIM7	3401	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.369563103162941
chr5	180634441	180634803	180634658	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1	NA	NA	NA	NA	TRIM7	4148	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.663207328841547
chr5	180672693	180672910	180672808	Y	NA	TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1,TRIM52,TRIM52-AS1	NA	NA	NA	NA	GNB2L1	186	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr6	1055850	1056126	1055989	Y	FOXQ1	NA	NA	NA	NA	NA	FOXQ1	254549	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	1131986	1132306	1132130	Y	NA	NA	LOC285768	IMR90	Hi-C	24141950	FOXQ1	178369	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.851831333992127
chr6	1311552	1311897	1311757	Y	NA	FOXQ1	NA	NA	NA	NA	FOXQ1	877	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr6	1335859	1336005	1335918	Y	NA	FOXQ1	LOC285768	IMR90	Hi-C	24141950	FOXQ1	25184	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr6	1391827	1392023	1391957	Y	FOXF2	FOXF2	NA	NA	NA	NA	FOXF2	3758	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr6	1394442	1394694	1394568	Y	NA	FOXF2	NA	NA	NA	NA	FOXF2	6373	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	1554418	1554641	1554530	Y	NA	NA	MYLK4,LOC100508120,EXOC2,GMDS	IMR90	Hi-C	24141950	FOXC1	54040	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	1609094	1609758	1609395	Y	FOXC1	FOXC1	NA	NA	NA	NA	FOXC1	413	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr6	2330490	2330806	2330587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS-AS1	86508	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	2377151	2377429	2377354	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS-AS1	133169	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	2543068	2543554	2543252	Y	SERPINB1	NA	GMDS,LOC100508120,C6orf195	IMR90	Hi-C	24141950	C6orf195	89283	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	2684459	2684567	2684519	Y	SERPINB9,SERPINB1,NQO2	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf195	51622	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.27015749368358
chr6	2726588	2726793	2726728	Y	SERPINB9,SERPINB1,RIPK1,NQO2	WRNIP1	NA	NA	NA	NA	WRNIP1	36855	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr6	2763251	2763536	2763387	Y	NA	WRNIP1	NA	NA	NA	NA	WRNIP1	112	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.407965581274997
chr6	2858879	2859560	2859431	Y	SERPINB9,RIPK1,NQO2,SERPINB1	SERPINB1	NA	NA	NA	NA	SERPINB1	18639	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr6	2872094	2872570	2872534	Y	NA	SERPINB1	NA	NA	NA	NA	SERPINB1	31854	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr6	2875221	2875651	2875270	Y	SERPINB9,RIPK1,NQO2,SERPINB1	SERPINB1	NA	NA	NA	NA	SERPINB1	34981	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr6	2877769	2878087	2877933	Y	SERPINB9,NQO2,SERPINB1	SERPINB1	NA	NA	NA	NA	SERPINB1	37529	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr6	2980500	2980669	2980575	Y	SERPINB1,RIPK1,SERPINB9	SERPINB6,NQO2,RP1-90J20.8,HTATSF1P2	WRNIP1,MYLK4,MIR4645,MGC39372,SERPINB1,DKFZP686I15217,SERPINB6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NQO2	5552	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.527015469180275
chr6	2982794	2982947	2982869	Y	SERPINB1,RIPK1,SERPINB9	SERPINB6,NQO2,RP1-90J20.8,HTATSF1P2	SERPINB6	MCF7	ChIA-PET	22265404	NQO2	3274	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.707068488452858
chr6	3160462	3160701	3160583	Y	NA	BPHL,TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	4702	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.293644225678606
chr6	3163246	3163428	3163368	Y	NA	BPHL,TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	7486	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr6	3166310	3166878	3166542	Y	NA	BPHL,TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	10550	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr6	3209395	3209963	3209634	Y	SERPINB9	PSMG4	NA	NA	NA	NA	PSMG4	19674	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr6	3238745	3238826	3238788	Y	NA	PSMG4	NA	NA	NA	NA	PSMG4	9108	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	3254273	3254642	3254472	Y	SLC22A23	PSMG4	NA	NA	NA	NA	PSMG4	24636	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.312402425364746
chr6	3259939	3260435	3260206	Y	NA	PSMG4	NA	NA	NA	NA	PSMG4	30302	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.186780743140731
chr6	3511713	3512018	3511866	Y	NA	NA	PXDC1,SLC22A23	IMR90	Hi-C	24141950	SLC22A23	56457	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	3797931	3798162	3798051	Y	NA	PXDC1,FAM50B	SLC22A23,FAM50B,TUBB2B,RIPK1,BPHL	IMR90	Hi-C	24141950	PXDC1	47671	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr6	3826272	3826513	3826435	Y	C6orf145	FAM50B	SLC22A23,TUBB2B	IMR90	Hi-C	24141950	FAM50B	21107	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr6	3987035	3987350	3987158	Y	NA	PRPF4B	SLC22A23,FAM50B,PXDC1,TUBB2B,BPHL,LOC100507194	IMR90	Hi-C	24141950	PRPF4B	32151	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	4317088	4317563	4317434	Y	CDYL	NA	RPP40,CDYL,LYRM4	IMR90	Hi-C	24141950	ECI2	183257	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.542888398567376
chr6	4358823	4359231	4358978	Y	CDYL	NA	CDYL,RPP40	IMR90	Hi-C	24141950	ECI2	224992	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr6	4362615	4362967	4362771	Y	CDYL	NA	CDYL	IMR90	Hi-C	24141950	ECI2	228784	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	4582137	4582541	4582469	Y	NA	NA	CDYL,RPP40	IMR90	Hi-C	24141950	CDYL	121852	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	4613428	4613746	4613742	Y	NA	NA	CDYL,RPP40	IMR90	Hi-C	24141950	CDYL	90647	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	4688350	4688741	4688427	Y	NA	CDYL	CDYL,FAM217A,C6orf201,ECI2	IMR90	Hi-C	24141950	CDYL	15652	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr6	4778036	4778769	4778420	Y	CDYL	NA	NA	NA	NA	NA	CDYL	73643	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	4931719	4931926	4931911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPP40	70371	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr6	5179288	5179492	5179391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYRM4	79680	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18278236002221
chr6	5296297	5296648	5296345	Y	NA	LYRM4,FARS2	NA	NA	NA	NA	FARS2	37020	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr6	5660943	5661332	5661178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARS2	401666	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	6164416	6164764	6164590	Y	F13A1	NA	NA	NA	NA	NA	FARS2	905139	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	6657678	6658009	6657847	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	447821	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.198811218958722
chr6	6678540	6678781	6678655	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	427049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	6687140	6687567	6687361	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	418263	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.630263532228746
chr6	6694635	6694734	6694680	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	411096	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr6	6712780	6713068	6712936	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	392762	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr6	6750084	6750462	6750414	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1,SSR1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	355368	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.348805711917541
chr6	6803868	6804205	6804018	Y	RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	301625	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.274886025992467
chr6	6811454	6812228	6812086	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	293602	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.747697192203879
chr6	6825409	6825642	6825558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	280188	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.216456305825379
chr6	6826283	6826384	6826333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	279446	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	6851413	6851674	6851488	Y	NA	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	254156	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.317861106864
chr6	6856813	6857789	6856950	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	248041	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.70216659153566
chr6	6876146	6876412	6876208	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	229418	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr6	6879215	6879409	6879309	Y	RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	226421	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.350804903476802
chr6	6881907	6882296	6882232	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	223534	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.171482033394586
chr6	6884588	6884911	6884764	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	220919	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	6885637	6886125	6885854	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	219705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	11.2659041058716
chr6	6886373	6886682	6886449	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	219148	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.508987418684502
chr6	6892535	6892715	6892637	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	213115	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	6940785	6941121	6940953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	164709	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.838687745354653
chr6	6970116	6970321	6970219	Y	NA	NA	LY86	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	135509	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	7043208	7043422	7043355	Y	NA	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	62408	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	7052517	7053280	7052961	Y	LY86	NA	RREB1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RREB1	52550	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr6	7058764	7058925	7058840	Y	DSP	RREB1	RREB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RREB1	46905	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.403620012595225
chr6	7074033	7074425	7074227	Y	LY86,RREB1,RREB1	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	31405	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	7130548	7130794	7130662	Y	RREB1,RREB1	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	24718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr6	7157997	7158379	7158000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	52167	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr6	7202193	7202713	7202370	Y	RIOK1,SSR1,RREB1,RREB1	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	96363	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	7261407	7261720	7261663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-69L16.5	76081	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr6	7505623	7505742	7505694	Y	RREB1,DSP	DSP	DSP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DSP	34066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	7591248	7591486	7591394	Y	NA	SNRNP48	NA	NA	NA	NA	SNRNP48	2816	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	7618671	7618993	7618833	Y	NA	SNRNP48	NA	NA	NA	NA	SNRNP48	30239	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr6	7673327	7673604	7673437	Y	NA	NA	MUTED-TXNDC5,BMP6	IMR90	Hi-C	24141950	BMP6	51426	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.194968765389612
chr6	7692548	7692711	7692643	Y	NA	BMP6	PIP5K1P1,MUTED-TXNDC5,BMP6,TXNDC5,EEF1E1-MUTED,SSR1	IMR90	Hi-C	24141950	BMP6	32319	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr6	7731119	7731407	7731310	Y	TXNDC5,TXNDC5,BMP6	BMP6	NA	NA	NA	NA	BMP6	6089	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr6	8180632	8181260	8180704	Y	NA	NA	EEF1E1-MUTED	IMR90	Hi-C	24141950	EEF1E1	79821	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	8283102	8283467	8283280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35B3	150327	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr6	9516527	9516706	9516607	Y	NA	NA	LOC100130275,TFAP2A,LINC00518	IMR90	Hi-C	24141950	HULC	866157	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	9710906	9711148	9711028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	706744	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	10315279	10315501	10315368	Y	PAK1IP1,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	NA	LOC100506207,TFAP2A,LOC100130275	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP2A	102391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.754424916072027
chr6	10316491	10316897	10316818	Y	TFAP2A,TFAP2A	NA	LOC100506207,TFAP2A,LOC100130275	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP2A	100995	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.563801719362186
chr6	10383571	10383981	10383824	Y	TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A,LINC00518	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	33911	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.0002095990208
chr6	10403752	10404250	10404030	Y	TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A,LINC00518	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	13642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.18777416082329
chr6	10407698	10407754	10407725	Y	PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A,LINC00518	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	10138	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.220454688943899
chr6	10441526	10441791	10441655	Y	TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,GCNT2,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A,LINC00518,GCNT2	NA	NA	NA	NA	LINC00518	8419	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.8491019932425
chr6	10458287	10458428	10458359	Y	NA	TFAP2A,LINC00518,GCNT2	NA	NA	NA	NA	LINC00518	25180	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	10552532	10552740	10552636	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCNT2	62076	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	10719904	10720278	10720060	Y	NA	PAK1IP1,C6orf52,TMEM14C,TMEM14B,SYCP2L	NA	NA	NA	NA	TMEM14C	870	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr6	10970926	10971179	10971053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAK	134162	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr6	11144047	11144288	11144135	Y	TMEM170B,C6orf52,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	236293	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	11212824	11213214	11213068	Y	TMEM170B,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	167367	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	11229489	11229708	11229675	Y	TMEM170B,MAK,ELOVL2,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	150873	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	11243333	11243432	11243383	Y	MAK,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	137149	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	11374452	11374883	11374763	Y	TMEM170B,NEDD9,NEDD9	NEDD9	NA	NA	NA	NA	NEDD9	5698	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	11393241	11393536	11393390	Y	NEDD9	NEDD9	NEDD9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEDD9	12660	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	11428073	11428442	11428380	Y	NA	NEDD9	NEDD9,C6orf228,SYCP2L,ELOVL2,ERVFRD-1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEDD9	47492	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	11772710	11773287	11772940	Y	NEDD9,TMEM170B,HIVEP1	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP1	233708	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	12052115	12052407	12052202	Y	HIVEP1	HIVEP1	NA	NA	NA	NA	HIVEP1	45120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	12277553	12277959	12277761	Y	HIVEP1,EDN1	EDN1	NA	NA	NA	NA	EDN1	10637	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	12324386	12324755	12324542	Y	NA	EDN1	EDN1	MCF7	ChIA-PET	22265404	EDN1	35790	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	12472967	12473281	12473124	Y	NA	RPL15P3	NA	NA	NA	NA	RPL15P3	39061	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	12484193	12484504	12484246	Y	EDN1	RPL15P3	EDN1,TMEM170B,HIVEP1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL15P3	27838	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	12577591	12578036	12577836	Y	NA	NA	EDN1,TMEM170B	IMR90	Hi-C	24141950	RPL15P3	65249	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr6	12595340	12595665	12595564	Y	NA	NA	TMEM170B,EDN1,HIVEP1,ADTRP	IMR90	Hi-C	24141950	RPL15P3	82998	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	13184302	13184661	13184471	Y	NA	RNU1-11P	NA	NA	NA	NA	RNU1-11P	27627	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	13302642	13303798	13303216	Y	GFOD1,GFOD1,TBC1D7	TBC1D7	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	23017	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	13404217	13404579	13404523	Y	GFOD1	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	77402	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	13449737	13449960	13449842	Y	TBC1D7,GFOD1,GFOD1	GFOD1	NA	NA	NA	NA	GFOD1	35934	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	13649579	13649948	13649702	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	36020	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr6	13651430	13651585	13651505	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	37871	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	13662469	13662838	13662724	Y	NA	NOL7,RANBP9	NA	NA	NA	NA	RANBP9	46958	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr6	13709903	13710182	13710119	Y	TBC1D7,CD83,RANBP9	RANBP9	SIRT5,NOL7	K562	ChIA-PET	22265404	RANBP9	107	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	13762938	13763200	13763069	Y	RNF182	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP9	53142	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	13811144	13811203	13811174	Y	RNF182,RNF182	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP9	101348	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr6	14138760	14138894	14138788	Y	CD83	CD83	NA	NA	NA	NA	CD83	22888	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	14211061	14211714	14211398	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD83	95189	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.346076371167914
chr6	14271187	14271701	14271310	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	155315	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	14713126	14713654	14713380	Y	NA	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	530873	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	14744083	14744613	14744392	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	499914	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr6	14777704	14777964	14777898	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	466563	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	15066743	15067555	15067031	Y	NA	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JARID2	176972	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	15299924	15300312	15299931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JARID2-AS1	53059	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	15436683	15436898	15436793	Y	JARID2	NA	NA	NA	NA	NA	JARID2-AS1	189818	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	15516223	15516554	15516389	Y	DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	144735	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr6	15580663	15580900	15580755	Y	JARID2	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	80389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	15616123	15616332	15616207	Y	JARID2	DTNBP1	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	44957	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	15908447	15908579	15908514	Y	NA	NA	MYLIP	K562	ChIA-PET	22265404	MYLIP	218777	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	16218769	16218941	16218854	Y	NA	NA	GMPR,JARID2,DTNBP1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYLIP	91413	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr6	16495109	16495178	16495163	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	264191	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	16607418	16607798	16607611	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	151571	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	16636472	16636800	16636538	Y	ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	122569	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	16712557	16713382	16713252	Y	ATXN1	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	45987	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	16713666	16713734	16713668	Y	ATXN1	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	45635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	16724246	16724395	16724344	Y	ATXN1	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	34974	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	16741302	16741617	16741570	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	17752	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr6	16766520	16766751	16766672	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	ATXN1	K562	ChIA-PET	22265404	ATXN1	6798	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	16771345	16771373	16771363	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	ATXN1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ATXN1	11623	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr6	16849710	16850068	16849769	Y	ATXN1	NA	ATXN1	IMR90	Hi-C	24141950	ATXN1	89988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	17015732	17016108	17015919	Y	FLJ23152	NA	ATXN1,GMPR	IMR90	Hi-C	24141950	ATXN1	256010	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	17496190	17496270	17496230	Y	NA	RPL7P26	NA	NA	NA	NA	RPL7P26	33613	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	17614611	17614952	17614695	Y	KIF13A,NUP153,FAM8A1	SUMO2P13,FAM8A1	NA	NA	NA	NA	FAM8A1	16025	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	17715315	17715544	17715493	Y	NUP153	NUP153	NUP153,KIF13A	IMR90	Hi-C	24141950	NUP153	10659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	17729455	17729796	17729624	Y	NA	NUP153	NUP153	K562	ChIA-PET	22265404	NUP153	24799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.512099723063246
chr6	17910535	17910706	17910642	Y	RNF144B	NA	NA	NA	NA	NA	KIF13A	75148	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	18020711	18021071	18020890	Y	NA	KIF13A	KIF13A,NHLRC1,TPMT	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KIF13A	34857	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr6	18148522	18148811	18148697	Y	RNF144B,NHLRC1,KDM1B	TPMT,KDM1B	NHLRC1	IMR90	Hi-C	24141950	TPMT	4494	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr6	18263099	18263635	18263391	Y	RNF144B,DEK	DEK	NA	NA	NA	NA	DEK	45	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	18391380	18391715	18391394	Y	KIF13A,KDM1B,RNF144B	RNF144B	NA	NA	NA	NA	RNF144B	24601	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	18434796	18435132	18434964	Y	KIF13A,KDM1B,RNF144B	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144B	68017	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	18436625	18436893	18436744	Y	KDM1B,RNF144B	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144B	69846	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	20174199	20174610	20174442	Y	MBOAT1	MBOAT1	NA	NA	NA	NA	MBOAT1	36060	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	20211469	20211688	20211565	Y	NA	MBOAT1	NA	NA	NA	NA	MBOAT1	799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr6	20239709	20240042	20239874	Y	E2F3	MBOAT1	MBOAT1	IMR90	Hi-C	24141950	MBOAT1	29039	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	20404913	20405227	20404970	Y	MBOAT1	E2F3	NA	NA	NA	NA	E2F3	4515	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr6	20811412	20811642	20811580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	278724	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.250513215257663
chr6	21028713	21029000	21028890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	496025	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	21098770	21098791	21098780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	493181	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr6	21383430	21383704	21383606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	208268	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	21587723	21589288	21589205	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2684	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.301832247927488
chr6	21589338	21589711	21589681	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2261	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr6	21808482	21808727	21808539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	216510	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	24302656	24303033	24302868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRS2	98120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	24584505	24584676	24584669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0319	59707	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.315131766114373
chr6	24659946	24660207	24660006	Y	TDP2,C6orf62	KIAA0319,TDP2,ACOT13	NA	NA	NA	NA	TDP2	5054	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	24698648	24698887	24698768	Y	NA	TDP2,ACOT13,C6orf62	NA	NA	NA	NA	C6orf62	20177	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	24743523	24743742	24743610	Y	TDP2,C6orf62	C6orf62,GMNN	GMNN,CMAHP,C6orf62	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C6orf62	24459	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.163294011145704
chr6	24743891	24744276	24743998	Y	TDP2,C6orf62	C6orf62,GMNN	GMNN,CMAHP,C6orf62	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C6orf62	24827	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr6	24879563	24879866	24879842	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP29	94781	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr6	24926284	24926609	24926580	Y	ALDH5A1,TDP2	PPIAP29	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	PPIAP29	48038	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	24981053	24981388	24981201	Y	NA	PPIAP29	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	PPIAP29	6406	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	25006784	25007291	25007025	Y	TDP2,C6orf62	PPIAP29	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	PPIAP29	32137	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	25043414	25043566	25043497	Y	TDP2,C6orf62	NA	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	PPIAP29	68767	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	25094713	25094741	25094729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMAHP	70052	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	25137169	25137503	25137225	Y	C6orf62	CMAHP	NA	NA	NA	NA	CMAHP	27290	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr6	25174209	25174610	25174347	Y	C6orf62	CMAHP	CMAHP,FAM65B,LRRC16A	IMR90	Hi-C	24141950	CMAHP	9416	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr6	25193718	25194203	25194002	Y	NA	CMAHP	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	CMAHP	28925	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr6	25331178	25331378	25331244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	53872	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	25352378	25352572	25352400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	75072	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	25458860	25459089	25458879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	181554	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	25597775	25597986	25597875	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AA	126804	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	25836224	25836451	25836337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BA	111087	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2	NA	NA	NA	NA	HIST1H1A	22967	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.97107384220393
chr6	26006419	26006453	26006436	Y	NA	TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H1A	9587	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	26025834	26026125	26026038	Y	BTN2A1,BTN2A1,TRIM38	HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H4B	354	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	26026306	26026795	26026679	Y	HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A	HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H4B	826	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.260700429065805
chr6	26029019	26029363	26029242	Y	NA	HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H3B	925	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	26126352	26126787	26126533	Y	HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E	HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AC	3979	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.935938233725343
chr6	26169489	26169538	26169514	Y	BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1	HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H2BE,HIST1H4D,HIST1H1PS1,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BE	12420	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	26266741	26266990	26266911	Y	NA	HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI,HIST1H4H	NA	NA	NA	NA	HIST1H3G	2622	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	26322637	26323123	26322876	Y	NA	HIST1H4H,BTN3A2	HIST1H1D,HIST1H4F,ABT1,HIST1H4G,HMGN4,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2BI,HIST1H3G,HCG11,HIST1H4I,HIST1H2BK	IMR90	Hi-C	24141950	HIST1H4H	38875	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.387208190029597
chr6	26332123	26332243	26332193	Y	NA	HIST1H4H,BTN3A2,BTN2A2	HIST1H1D,HIST1H4F,ABT1,HMGN4,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AE,HIST1H2BG,BTN2A3P,HIST1H2AG,HIST1H2BJ,BTN2A2,HIST1H2AH,MIR3143,LOC285819,BTN2A1,HCG11,HIST1H3F,HIST1H4D,HIST1H4E,HIST1H2BH,HIST1H3E,HIST1H3D,HIST1H4G,HIST1H2BF,HIST1H3G,HIST1H2BI,HIST1H4H,BTN3A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN1A1,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H2BM,HIST1H4K,HIST1H2BO,HIST1H3J,HIST1H4L,HIST1H2AM,HIST1H3I	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BTN3A2	31144	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr6	26474010	26474599	26474187	Y	NA	BTN3A3,BTN2A1,HCG11	NA	NA	NA	NA	BTN2A1	17860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	26521003	26521206	26521108	Y	HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	927	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.244671570129293
chr6	26521444	26521777	26521577	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	1368	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr6	26522673	26522990	26522813	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	2597	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.24740091087892
chr6	26533222	26533398	26533310	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	3235	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr6	26537641	26538043	26537718	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	1008	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.401237857406849
chr6	26550694	26551000	26550826	Y	NA	HCG11,HMGN4,ABT1	NA	NA	NA	NA	HMGN4	14061	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.337505385289917
chr6	27065086	27065154	27065121	Y	NA	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BJ	33387	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	27145585	27145720	27145705	Y	FKSG83,ZNF184,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	31303	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr6	27145729	27146130	27146023	Y	ZNF184	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	30893	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.242672378570032
chr6	27156271	27156423	27156401	Y	NA	HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	20600	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	27203038	27203420	27203229	Y	NA	RP11-209A2.1	OR2B2,LOC100131289,ZNF184	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-209A2.1	26015	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	27416333	27416557	27416445	Y	NA	ZNF184	NA	NA	NA	NA	ZNF184	22340	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	27446506	27447382	27447356	Y	NA	ZNF184	ZNF184,HIST1H2AG,MIR3143,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,PRSS16,LOC100131289,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,OR2B2,HIST1H3J,HIST1H2BO,HIST1H2AM	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF184	7609	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146379073469414
chr6	27640311	27640352	27640335	Y	NA	NA	ZNF391,PRSS16	IMR90	Hi-C	24141950	HIST1H2BL	133357	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	27655152	27655475	27655306	Y	FKSG83,ZNF391,ZNF184,ZNF192,HIST1H3H,HIST1H2BO,HIST1H2BN,HIST1H2AM	NA	LOC100507173,ZNF184	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HIST1H2BL	118234	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	27655687	27656083	27655918	Y	NA	NA	LOC100507173	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HIST1H2BL	117626	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146379073469414
chr6	27706104	27706357	27706299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	67352	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	27759985	27760333	27760032	Y	ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	13376	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.370449181902718
chr6	27780866	27781094	27780996	Y	ZNF184,HIST1H4L,HIST1H4K,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H2AK,HIST1H1B,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AJ	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2BPS2,HIST1H2AL	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BM	44	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr6	27798416	27798741	27798578	Y	NA	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2BPS2,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L	NA	NA	NA	NA	HIST1H4K	1111	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	27807310	27807672	27807617	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2BPS2,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BN	2987	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.729825071257516
chr6	27862895	27863061	27863012	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	HIST1H2BPS2,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BO	3692	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.252512406816923
chr6	27863298	27863662	27863535	Y	ZKSCAN3,ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZNF323,ZNF193,ZNF192,ZKSCAN4,PGBD1,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	HIST1H2BPS2,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BO	4095	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.294374374868973
chr6	28072476	28072872	28072543	Y	HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192	ZNF165,ZSCAN16	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	17466	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.00601546608131
chr6	28099505	28099599	28099552	Y	OR2B2,OR2B6,ZNF187,ZSCAN16	ZSCAN16,ZNF192P1	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	9167	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.149994492958819
chr6	28101066	28101269	28101177	Y	OR2B2,ZNF187,ZKSCAN4,ZSCAN16	ZSCAN16,ZNF192P1	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	10728	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr6	28102608	28102781	28102677	Y	ZSCAN16	ZSCAN16,ZNF192P1	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	12270	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	28180543	28180884	28180590	Y	NA	ZKSCAN4	NA	NA	NA	NA	ZKSCAN4	44127	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	28280351	28280639	28280495	Y	NA	PGBD1,ZKSCAN3	NA	NA	NA	NA	PGBD1	33037	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr6	28302002	28302386	28302196	Y	NA	ZKSCAN3	NA	NA	NA	NA	ZKSCAN3	13305	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	28414953	28415259	28415025	Y	NA	ZSCAN12,COX11P1	NA	NA	NA	NA	COX11P1	2203	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.176210565703473
chr6	28457225	28458028	28457315	Y	NA	COX11P1	NA	NA	NA	NA	COX11P1	44475	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.642449937596148
chr6	28710805	28711035	28710922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXbac-BPG308K3.5	93748	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr6	28805076	28805418	28805247	Y	NA	XXbac-BPG308K3.5	NA	NA	NA	NA	XXbac-BPG308K3.5	293	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	29932777	29932958	29932802	Y	HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A	HLA-K,HLA-A,HLA-J	NA	NA	NA	NA	HLA-A	25740	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.56107283495718
chr6	29933738	29934144	29933980	Y	NA	HLA-K,HLA-A,HLA-J	NA	NA	NA	NA	HLA-A	26701	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.260700429065805
chr6	29935319	29935652	29935489	Y	NA	HLA-K,HLA-A,HLA-J	NA	NA	NA	NA	HLA-A	28282	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr6	30010922	30011054	30010960	Y	NA	HLA-J,ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39	NA	NA	NA	NA	ZNRD1	13622	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr6	30068638	30068845	30068662	Y	NA	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39,TRIM31	NA	NA	NA	NA	TRIM31	10038	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.239943037820405
chr6	30069810	30070038	30069951	Y	HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39,TRIM31	NA	NA	NA	NA	TRIM31	8845	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.518671517381983
chr6	30177609	30178061	30177863	Y	NA	TRIM26	NA	NA	NA	NA	TRIM26	1143	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	30182160	30182533	30182417	Y	NA	TRIM26	NA	NA	NA	NA	TRIM26	2956	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr6	30254050	30254472	30254356	Y	NA	TRIM39,HCG18	NA	NA	NA	NA	TRIM39	37784	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr6	30453844	30454132	30453996	Y	ZNRD1,TUBB	RANP1,HLA-E	HLA-E	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HLA-E	1112	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.463127067513932
chr6	30519269	30519607	30519590	Y	NA	PRR3,GNL1,ABCF1	NA	NA	NA	NA	PRR3	3056	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr6	30604064	30604457	30604261	Y	NA	MRPS18B,PPP1R10,ATAT1,PTMAP1,C6orf136,DHX16,PPP1R18	NA	NA	NA	NA	PTMAP1	4655	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	30649746	30650798	30650074	Y	TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949	C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB	NA	NA	NA	NA	PPP1R18	2874	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr6	30716597	30717062	30716912	Y	IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	6266	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr6	30717441	30717627	30717503	Y	RPP21,SFTA2,PSORS1C1	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	7110	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.577101237549071
chr6	30719576	30719814	30719695	Y	IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20	DPCR1,NRM,PPP1R18,MDC1,FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,VARS2,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	9245	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	30720004	30720713	30720325	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20	DPCR1,NRM,PPP1R18,MDC1,FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,VARS2,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	9673	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.447481172206536
chr6	30731781	30732171	30732168	Y	NA	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20	DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A	IMR90	Hi-C	24141950	HCG20	431	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr6	30736850	30737361	30737156	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3	FLOT1,IER3,HCG20	DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HCG20	4248	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr6	30737456	30737900	30737560	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3	FLOT1,IER3,HCG20	DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A,MRPS18B,PPP1R10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HCG20	4854	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.312402425364746
chr6	30746716	30747579	30747014	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,FLOT1,IER3	FLOT1,IER3,HCG20	CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,PRRC2A,C6orf15,MUC22,DHX16,PPP1R18,TUBB,MDC1,IER3,DDR1,CDSN	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HCG20	14114	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr6	30774085	30774428	30774395	Y	NA	HCG20	FLOT1,C6orf15,PSORS1C1,TUBB,DDR1,VARS2,DHX16,SFTA2,PPP1R18,NRM,IER3,MUC22	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HCG20	41483	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	30785907	30786494	30786279	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,FLOT1,IER3	NA	FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HCG20	53305	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255971896756917
chr6	30787859	30788252	30788206	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,IER3	NA	FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DDR1	53946	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.502642658445471
chr6	30796195	30796565	30796398	Y	HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3	DDR1	IER3,FLOT1,DDR1,VARS2,GTF2H4,C6orf136,DHX16,C6orf15,PSORS1C1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DDR1	45633	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	30845366	30845734	30845666	Y	PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3	DDR1,GTF2H4,VARS2	NA	NA	NA	NA	DDR1	3168	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	30923441	30923743	30923649	Y	GNL1,CCHCR1,CCHCR1,DDR1	GTF2H4,VARS2	NA	NA	NA	NA	VARS2	49422	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr6	31240851	31241006	31240942	Y	NCR3,LY6G5B,LTB,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,ABHD16A,ABHD16A,HLA-C,HLA-B	HLA-C,RPL3P2	NA	NA	NA	NA	HLA-C	2944	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	31702368	31703528	31702658	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,DDAH2,CLIC1,MSH5,VWA7	NA	NA	NA	NA	CLIC1	2012	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146379073469414
chr6	31705604	31706142	31705906	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,DDAH2,CLIC1,VWA7	NA	NA	NA	NA	MSH5	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr6	31761868	31762215	31762042	Y	LY6G5C	VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1L,HSPA1B,C6orf48,SNORD52	NA	NA	NA	NA	VARS	138	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	31789098	31789184	31789146	Y	TNF,HSPA1L,HSPA1A,NEU1,HSPA1B	VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1L,HSPA1B,C6orf48,SNORD52,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	4328	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1L,HSPA1B,C6orf48,SNORD52,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.56835688706276
chr6	31942054	31942322	31942254	Y	NA	CFB,SKIV2L,STK19	NA	NA	NA	NA	STK19	5186	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	32050642	32051035	32051003	Y	LY6G6C,TNXB,PPT2,PPT2,TNXB	ATF6B,FKBPL	NA	NA	NA	NA	ATF6B	42995	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.268158302124319
chr6	32051111	32051460	32051307	Y	NA	ATF6B,FKBPL	NA	NA	NA	NA	ATF6B	42570	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	32081652	32082042	32081917	Y	NA	ATF6B,FKBPL,PPT2,EGFL8	NA	NA	NA	NA	ATF6B	11988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr6	32114130	32114430	32114186	Y	GPANK1,GPANK1,LY6G5C,DOM3Z,FKBPL	ATF6B,FKBPL,PPT2,EGFL8,AGPAT1,RNF5,XXbac-BPG300A18.13,PBX2,GPSM3	NA	NA	NA	NA	PPT2	4788	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187893855960214
chr6	32787339	32787575	32787566	Y	TAP1,PSMB8	HLA-DOB,TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1	NA	NA	NA	NA	HLA-DOB	4514	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	32789030	32789171	32789101	Y	HSD17B8,PSMB8	HLA-DOB,TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1	NA	NA	NA	NA	HLA-DOB	6205	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	32802290	32802518	32802510	Y	NA	HLA-DOB,TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1	NA	NA	NA	NA	TAP2	2039	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr6	33129390	33129479	33129402	Y	NA	SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1	NA	NA	NA	NA	SLC39A7	36743	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr6	33392796	33393285	33393082	Y	SYNGAP1	KIFC1,PHF1,CUTA,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	CUTA	8702	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr6	33396313	33396709	33396628	Y	SYNGAP1	KIFC1,PHF1,CUTA,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	CUTA	12219	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	33538911	33539356	33539169	Y	LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	BAK1	6663	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.223184029693526
chr6	33558672	33558897	33558785	Y	NA	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	BAK1	12653	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr6	33581625	33581918	33581825	Y	NA	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	ITPR3	4224	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.392666871528852
chr6	33590898	33591125	33590902	Y	ITPR3	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	ITPR3	4756	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr6	33950913	33951144	33951041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEMD2	196000	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	34150537	34150894	34150814	Y	HMGA1	CYCSP55	C6orf106,NUDT3,RPS10-NUDT3,PACSIN1,MNF1,ANKS1A,SPDEF,HMGA1,IP6K3,MLN,LEMD2,GRM4,UHRF1BP1,TAF11,SNRPC,C6orf1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYCSP55	34322	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	34173295	34173599	34173423	Y	NA	CYCSP55,HMGA1,C6orf1	C6orf106,RPS10-NUDT3,NUDT3,SNRPC,HMGA1,C6orf1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYCSP55	11617	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	34191726	34192136	34191830	Y	C6orf1,HMGA1	CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2	RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CYCSP55	6510	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.556691031864922
chr6	34358644	34359014	34358829	Y	NA	NUDT3,RPS10	NA	NA	NA	NA	NUDT3	193	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.272886834433207
chr6	34404691	34404878	34404787	Y	ANKS1A	NUDT3,RPS10,PACSIN1	NA	NA	NA	NA	RPS10	12789	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr6	34624445	34624747	34624649	Y	TAF11	C6orf106	NA	NA	NA	NA	C6orf106	37889	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr6	34663389	34663600	34663462	Y	NA	C6orf106,RP3-375P9.2	NA	NA	NA	NA	C6orf106	753	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr6	34760607	34760986	34760926	Y	UHRF1BP1	SNRPC,UHRF1BP1	NA	NA	NA	NA	UHRF1BP1	2750	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr6	34992488	34992843	34992549	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKS1A	137446	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr6	35149645	35149913	35149805	Y	NA	NA	UHRF1BP1,ANKS1A,SCUBE3,ZNF76,TCP11	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF76	74773	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210997624326124
chr6	35152934	35153484	35153156	Y	NA	NA	UHRF1BP1,ANKS1A,SCUBE3,ZNF76,TCP11	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF76	71202	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	35185451	35185811	35185631	Y	NA	ZNF76	NA	NA	NA	NA	ZNF76	38875	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	35337950	35338511	35338285	Y	ZNF76,RPL10A,DEF6,PPARD	PPARD	NA	NA	NA	NA	PPARD	29615	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	35445364	35445634	35445501	Y	RPL10A	FANCE,RPL10A,TEAD3	NA	NA	NA	NA	RPL10A	11179	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr6	35453228	35453566	35453395	Y	NA	FANCE,RPL10A,TEAD3	NA	NA	NA	NA	TEAD3	9287	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr6	35561770	35562146	35562007	Y	NA	RP3-340B19.2	NA	NA	NA	NA	RP3-340B19.2	40120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr6	35875551	35875739	35875654	Y	SLC26A8,SLC26A8,SLC26A8,MAPK14,MAPK13,BRPF3,SRPK1	SRPK1	NA	NA	NA	NA	SRPK1	11380	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	36010041	36010276	36010159	Y	NA	MAPK14	NA	NA	NA	NA	MAPK14	16553	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr6	36086314	36086741	36086595	Y	SRPK1,SLC26A8,SLC26A8,SLC26A8,MAPK14,STK38,SRSF3,PXT1,KCTD20,BRPF3	NA	NA	NA	NA	NA	BRPF3	75780	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	36203078	36203345	36203212	Y	CDKN1A,CDKN1A	BRPF3,RP1-179N16.6	NA	NA	NA	NA	RP1-179N16.6	40096	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	36277211	36277557	36277384	Y	C6orf222	C6orf222	NA	NA	NA	NA	C6orf222	25105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr6	36321421	36321620	36321472	Y	CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7	C6orf222	NA	NA	NA	NA	C6orf222	18759	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	36330558	36330875	36330837	Y	NA	C6orf222	NA	NA	NA	NA	C6orf222	27896	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	36391024	36391283	36391227	Y	SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,PXT1	KCTD20,PXT1	NA	NA	NA	NA	KCTD20	17261	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.337505385289917
chr6	36391779	36391863	36391821	Y	NA	KCTD20,PXT1	NA	NA	NA	NA	KCTD20	16681	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	36399958	36400295	36400126	Y	NA	KCTD20,PXT1	NA	NA	NA	NA	KCTD20	8249	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr6	36404249	36404468	36404378	Y	MAPK14,PNPLA1,STK38	KCTD20,PXT1	ETV7	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD20	4076	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	36409257	36409482	36409373	Y	MAPK14,BRPF3,STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7,PXT1,KCTD20	KCTD20,PXT1	NA	NA	NA	NA	PXT1	591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.425610668141653
chr6	36547678	36548077	36547769	Y	PI16,MTCH1	STK38,SRSF3	STK38,SRSF3,KCTD20,PXT1,MIR3925	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SRSF3	12068	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr6	36560154	36560313	36560234	Y	STK38,SRSF3	STK38,SRSF3,RNU1-88P	NA	NA	NA	NA	SRSF3	9	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	36628616	36629003	36628769	Y	ETV7,ETV7,KCTD20,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A	RNU1-88P,LAP3P2,CDKN1A	CDKN1A,SRSF3,MIR3925,CPNE5,PPIL1	IMR90	Hi-C	24141950	LAP3P2	10591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	36634782	36635224	36635042	Y	MTCH1,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A	RNU1-88P,LAP3P2,CDKN1A	CDKN1A,SRSF3,MIR3925,CPNE5,PPIL1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LAP3P2	4370	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	36737758	36737957	36737899	Y	ETV7,ETV7,PXT1,PIM1	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN1A	95453	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	36795582	36795983	36795798	Y	NA	C6orf89,PPIL1	NA	NA	NA	NA	C6orf89	41663	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	37024161	37024556	37024514	Y	NA	NA	CPNE5,C6orf89,FGD2,PIM1,TMEM217,TBC1D22B	IMR90	Hi-C	24141950	MTCH1	72087	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	37070053	37070857	37070460	Y	CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2	NA	PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	65122	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.194968765389612
chr6	37093441	37093739	37093580	Y	NA	PIM1	PIM1,PPIL1,FGD2,C6orf89,TMEM217,CPNE5,MTCH1,TBC1D22B,CDKN1A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	42240	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr6	37094186	37094408	37094276	Y	PPIL1	PIM1	PIM1,PPIL1,FGD2,C6orf89,TMEM217,CPNE5,MTCH1,TBC1D22B,CDKN1A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	41571	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.588401564176696
chr6	37098455	37099411	37099295	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2	IMR90	Hi-C	24141950	PIM1	36568	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236483547880411
chr6	37102324	37102775	37102642	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	33204	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.180053019272583
chr6	37104071	37104158	37104105	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	31821	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr6	37104908	37105418	37105405	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	30561	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.422378212281365
chr6	37190361	37190574	37190538	Y	NA	TBC1D22B,TMEM217	NA	NA	NA	NA	TBC1D22B	32974	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr6	37212541	37212901	37212835	Y	NA	TBC1D22B,TMEM217	NA	NA	NA	NA	TBC1D22B	10647	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr6	37424991	37425195	37425093	Y	NA	CCDC167	CCDC167	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC167	40503	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	37484293	37484960	37484497	Y	NA	CCDC167	CCDC167,MDGA1,RNF8,FTSJD2,TBC1D22B,MIR4462,ZFAND3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC167	18595	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	37752102	37752667	37752552	Y	MDGA1	ZFAND3	BTBD9,ZFAND3,FTSJD2,CCDC167,MDGA1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND3	32608	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	37892657	37892863	37892737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	107382	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	38033139	38033395	38033278	Y	ZFAND3	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	247864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr6	39171657	39171958	39171719	Y	NA	KCNK5	NA	NA	NA	NA	KCNK5	23268	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.40139378695626
chr6	39195802	39196179	39195967	Y	KCNK5	KCNK5	NA	NA	NA	NA	KCNK5	576	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	39279620	39279758	39279742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNK5	84394	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	39285225	39285328	39285279	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNK5	89999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	41153851	41154204	41154120	Y	TREML4,TREM1,NFYA	NA	NA	NA	NA	NA	NFYA	115167	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	41472054	41472459	41472263	Y	NA	FOXP4,RP11-328M4.2	FOXP4	IMR90	Hi-C	24141950	FOXP4	39705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	41506487	41506686	41506561	Y	NFYA,TREML4,TREM1,TFEB	FOXP4,RP11-328M4.2	NA	NA	NA	NA	FOXP4	5478	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	41512989	41513289	41513139	Y	NA	FOXP4,RP11-328M4.2	NA	NA	NA	NA	FOXP4	825	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr6	41672440	41672821	41672622	Y	TFEB	TFEB	NA	NA	NA	NA	TFEB	29176	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	41686086	41686432	41686391	Y	NA	TFEB	NA	NA	NA	NA	TFEB	15565	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr6	41889955	41890338	41890119	Y	FRS3	USP49,MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	3029	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.185511700771837
chr6	41906927	41907077	41907010	Y	CCND3	USP49,MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	20001	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	41929474	41929675	41929644	Y	NA	MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	42548	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	42013318	42013860	42013560	Y	TFEB,TRERF1,CCND3	CCND3,TAF8	NA	NA	NA	NA	CCND3	2235	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	42067343	42067714	42067701	Y	NA	C6orf132	NA	NA	NA	NA	C6orf132	40643	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr6	42086253	42086632	42086383	Y	NA	C6orf132	NA	NA	NA	NA	C6orf132	21725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr6	42228452	42228568	42228527	Y	NA	MRPS10	NA	NA	NA	NA	MRPS10	44849	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr6	42255073	42255501	42255249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS10	71470	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	42259187	42259201	42259195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS10	75584	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	42283170	42283354	42283262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS10	99567	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr6	42306418	42306926	42306742	Y	UBR2,TRERF1	NA	NA	NA	NA	NA	TRERF1	110863	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr6	42372266	42372455	42372353	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	45334	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	42409399	42409623	42409499	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	8166	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	42420719	42421067	42420926	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	2930	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.67539373420895
chr6	42421408	42421762	42421484	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	3619	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr6	42515407	42515543	42515467	Y	NA	UBR2	TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBR2	14257	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr6	42515662	42516014	42516002	Y	GUCA1A,MEA1,KIAA0240	UBR2	TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBR2	13786	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	42722931	42723177	42723029	Y	NA	ATP6V0CP3,TBCC	UBR2,KIAA0240,TBCC,PRPH2,RPL7L1,KLHDC3,RRP36,GUCA1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBCC	10373	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	42738530	42739530	42738949	Y	CUL9,TRERF1,UBR2,TBCC,CNPY3,C6orf226	ATP6V0CP3,TBCC	KIAA0240,GUCA1A,UBR2,ATP6V0CP3,PRPH2,RPL7L1,TBCC,C6orf226,TRERF1,PTCRA,PPP2R5D	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBCC	25972	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	42944777	42944970	42944923	Y	NA	CNPY3,RPL24P4,PPP2R5D,MEA1,KLHDC3,RRP36	NA	NA	NA	NA	PEX6	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	43001164	43001472	43001318	Y	NA	MEA1,KLHDC3,RRP36,KLC4,CUL7,MRPL2	NA	NA	NA	NA	KLC4	5043	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr6	43084087	43084410	43084171	Y	PTK7	NA	NA	NA	NA	NA	SRF	52627	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	43332066	43332081	43332075	Y	NA	ZNF318	NA	NA	NA	NA	ZNF318	3135	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	43636886	43637091	43636988	Y	NA	GTPBP2,MAD2L1BP,MRPS18A	NA	NA	NA	NA	MRPS18A	16437	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	43692783	43693195	43692965	Y	TJAP1,MAD2L1BP	MRPS18A,VEGFA	MRPS18A,LOC100132354,RSPH9,MRPL14,CAPN11,TMEM63B,POLH,VEGFA,XPO5,MAD2L1BP,GTPBP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPS18A	39255	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.448594285026018
chr6	43766474	43766976	43766784	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	VEGFA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	30553	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182052210831843
chr6	43878497	43878687	43878563	Y	GTPBP2,MRPS18A	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf223	87630	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.516708103890587
chr6	43894411	43894725	43894584	Y	NFKBIE,TJAP1,GTPBP2,MAD2L1BP	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf223	71592	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.164407123965187
chr6	43974450	43974566	43974521	Y	NA	C6orf223	NA	NA	NA	NA	C6orf223	8133	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr6	44002049	44002379	44002368	Y	NFKBIE,GTPBP2	C6orf223,RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	C6orf223	35732	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr6	44002811	44003092	44003040	Y	NFKBIE	C6orf223,RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	C6orf223	36494	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr6	44009201	44009753	44009484	Y	SLC35B2,MRPL14	C6orf223,RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1120P11.3	29897	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.68926747203679
chr6	44010067	44010199	44010133	Y	C6orf223	C6orf223,RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1120P11.3	29451	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.231755015571524
chr6	44011469	44011879	44011690	Y	NA	C6orf223,RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1120P11.3	27771	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.281457820311205
chr6	44011946	44012485	44012109	Y	NA	C6orf223,RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1120P11.3	27165	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.41691953078211
chr6	44019349	44019523	44019394	Y	NA	RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,VEGFA,MRPS18A,MAD2L1BP,C6orf223	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-1120P11.3	20127	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr6	44020614	44020967	44020695	Y	NFKBIE	RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1120P11.3	18683	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	44021972	44022127	44022048	Y	SLC35B2	RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1120P11.3	17523	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr6	44022822	44022968	44022901	Y	NA	RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-1120P11.3	16682	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.194968765389612
chr6	44024667	44024914	44024806	Y	SLC35B2	RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-1120P11.3	14736	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	44025238	44025386	44025330	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-1120P11.3	14264	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr6	44026121	44027353	44026480	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-1120P11.3	12297	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.297486679247717
chr6	44031882	44032664	44032378	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MAD2L1BP,C6orf223,MRPS18A,VEGFA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-1120P11.3	6986	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr6	44040704	44041103	44040711	Y	C6orf223,NFKBIE	RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1	POLH,GTPBP2,LOC100132354,RSPH9,MAD2L1BP,VEGFA,MRPS18A,HSP90AB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-1120P11.1	315	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	44044328	44044673	44044418	Y	C6orf223,NFKBIE	RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1,TMEM63B,MRPL14	POLH,GTPBP2,LOC100132354,RSPH9,MAD2L1BP,VEGFA,HSP90AB1,XPO5,MRPS18A,C6orf223,CAPN11,TMEM63B	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-1120P11.1	3939	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr6	44052522	44052743	44052633	Y	NA	RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1,TMEM63B,MRPL14	MAD2L1BP,GTPBP2,RSPH9,POLH,VEGFA,MRPS18A,XPO5,LOC100132354,TMEM63B,CAPN11,MRPL14,HSP90AB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-1120P11.1	12133	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr6	44070488	44070804	44070651	Y	NA	RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1,TMEM63B,MRPL14	NA	NA	NA	NA	TMEM63B	21847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr6	44184938	44185313	44184944	Y	MRPL14	HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	SLC29A1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	44186277	44186510	44186378	Y	SLC29A1	SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	SLC29A1	1035	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	44205272	44205504	44205346	Y	NFKBIE	SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	HSP90AB1	7320	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.147265152209192
chr6	44443307	44443732	44443616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC5L	90045	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr6	45302184	45302302	45302245	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	41388	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	45322073	45322342	45322124	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	21348	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	45322429	45322774	45322605	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	20916	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	45392235	45392572	45392528	Y	RUNX2	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	48545	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	45413515	45413853	45413708	Y	RUNX2	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	69825	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr6	45503403	45503548	45503462	Y	RUNX2	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	159713	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	45575518	45575910	45575680	Y	NA	NA	RUNX2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SUPT3H	231828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr6	45623562	45623937	45623654	Y	NA	NA	RUNX2,SUPT3H,CLIC5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SUPT3H	279872	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.259970279875438
chr6	45665421	45665594	45665503	Y	NA	NA	RUNX2,CDC5L,CLIC5	IMR90	Hi-C	24141950	SUPT3H	321731	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr6	45678135	45678537	45678416	Y	NA	NA	RUNX2,CDC5L,SUPT3H	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SUPT3H	334445	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr6	46738555	46739161	46738809	Y	PLA2G7,PLA2G7	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A27	119877	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	47102503	47102708	47102571	Y	NA	NA	TNFRSF21	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFRSF21	172933	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	47121097	47121235	47121166	Y	NA	NA	TNFRSF21	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF21	154406	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	47214948	47215452	47215060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFRSF21	60189	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	47220408	47220656	47220576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFRSF21	54985	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	47263537	47263554	47263549	Y	NA	TNFRSF21	NA	NA	NA	NA	TNFRSF21	12087	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr6	47275760	47275938	47275849	Y	NA	TNFRSF21	NA	NA	NA	NA	TNFRSF21	119	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	47382599	47382792	47382666	Y	NA	NA	CD2AP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD2AP	60733	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	48794608	48794845	48794713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MUT	634059	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr6	49508939	49509088	49508998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPQ	79848	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	49524322	49524464	49524384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHAG	78088	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	51275260	51275721	51275608	Y	NA	RP3-437C15.1	NA	NA	NA	NA	RP3-437C15.1	1925	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	52217307	52217701	52217502	Y	NA	PAQR8	PAQR8,MCM3,EFHC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAQR8	6518	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr6	52259035	52259232	52259147	Y	NA	PAQR8,EFHC1	NA	NA	NA	NA	EFHC1	23874	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	52261634	52261809	52261784	Y	EFHC1	PAQR8,EFHC1	NA	NA	NA	NA	EFHC1	21297	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr6	52339756	52339820	52339788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFHC1	56650	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	52377018	52377269	52377212	Y	GSTA5,TRAM2	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	62444	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	52389241	52389494	52389368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	50219	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	52404444	52404567	52404560	Y	NA	TRAM2	EFHC1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAM2	35146	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	52431726	52432083	52432005	Y	TRAM2	TRAM2	EFHC1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAM2	7630	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	52522235	52522527	52522515	Y	NA	TMEM14A	NA	NA	NA	NA	TMEM14A	11380	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	52741236	52741253	52741245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSTA4	116923	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	52911792	52912057	52911925	Y	NA	FBXO9,ICK	NA	NA	NA	NA	FBXO9	2732	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr6	52952230	52952503	52952367	Y	NA	FBXO9,ICK	NA	NA	NA	NA	ICK	27630	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104864290978615
chr6	53165916	53166137	53165996	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	45810	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	53191249	53191636	53191614	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	20311	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	53195071	53195341	53195324	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	16606	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	53224045	53224723	53224315	Y	NA	ELOVL5	ELOVL5	K562	ChIA-PET	22265404	ELOVL5	12098	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.81850457375021
chr6	53329907	53330283	53330016	Y	NA	NA	GCM1	IMR90	Hi-C	24141950	ELOVL5	117960	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	53376137	53376766	53376496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	103002	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	53412768	53413364	53413026	Y	GCLC	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	66404	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.31986029842326
chr6	53617793	53617916	53617855	Y	NA	LRRC1	LRRC1,GCLC	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC1	39379	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr6	55706850	55707208	55707026	Y	NA	BMP5	NA	NA	NA	NA	BMP5	31154	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	56296413	56296568	56296543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BEND6	521205	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.753311803252543
chr6	57004936	57005232	57005084	Y	NA	BAG2	NA	NA	NA	NA	BAG2	29892	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	57046105	57046302	57046204	Y	NA	BAG2,RAB23	NA	NA	NA	NA	BAG2	10981	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr6	57052407	57052730	57052411	Y	NA	BAG2,RAB23	NA	NA	NA	NA	BAG2	17283	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr6	57327654	57327860	57327770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	150051	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	57389697	57390070	57389732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	212094	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	58776280	58777091	58777029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	521711	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	58778631	58779245	58778717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	524062	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	64055548	64055769	64055667	Y	NA	NA	PTP4A1,EYS	IMR90	Hi-C	24141950	FKBP1C	136197	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	64151294	64151779	64151706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTP4A1	77887	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr6	64308595	64308777	64308676	Y	NA	PHF3	NA	NA	NA	NA	PHF3	34948	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	64398084	64398491	64398303	Y	PHF3	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	54359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr6	64771855	64771881	64771868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-59D5__B.2	257126	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	70808594	70808991	70808795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMBRD1	303591	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr6	71133094	71133376	71133235	Y	NA	FAM135A	NA	NA	NA	NA	FAM135A	12450	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	71337325	71337571	71337450	Y	NA	SMAP1	NA	NA	NA	NA	SMAP1	37908	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr6	71906987	71907342	71907159	Y	NA	NA	OGFRL1,MIR30A	IMR90	Hi-C	24141950	OGFRL1	89164	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	71907627	71907757	71907669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OGFRL1	88749	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	72010402	72010735	72010435	Y	NA	OGFRL1	NA	NA	NA	NA	OGFRL1	13896	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	72043439	72043836	72043633	Y	OGFRL1	OGFRL1	NA	NA	NA	NA	OGFRL1	46933	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	72051718	72051897	72051837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OGFRL1	55212	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr6	72055906	72056381	72056246	Y	NA	NA	OGFRL1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR30A	54943	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	72092992	72093394	72093291	Y	NA	MIR30A,LINC00472	NA	NA	NA	NA	MIR30A	17930	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.145265960649932
chr6	72103028	72103231	72103130	Y	NA	MIR30A,LINC00472	NA	NA	NA	NA	MIR30A	8093	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151837754968669
chr6	72103736	72104124	72104114	Y	NA	MIR30A,LINC00472	NA	NA	NA	NA	MIR30A	7200	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr6	72114373	72114910	72114587	Y	NA	MIR30A,LINC00472	NA	NA	NA	NA	MIR30A	3049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.278345515932461
chr6	72188537	72188902	72188719	Y	NA	NA	OGFRL1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00472	60065	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	72294841	72295504	72295148	Y	NA	NA	RIMS1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00472	166369	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr6	73867627	73867898	73867877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	103040	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr6	73975471	73975797	73975634	Y	NA	RP11-398K22.12,KHDC1	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	4533	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	73981759	73981798	73981779	Y	NA	RP11-398K22.12,KHDC1	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	10821	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	74186150	74186447	74186193	Y	MTO1	MB21D1,MTO1,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	MTO1	16849	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr6	74289769	74290568	74290415	Y	MB21D1,SLC17A5,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1	58249	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18478155158147
chr6	74290752	74291151	74290952	Y	CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1	59232	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	74295249	74295764	74295450	Y	MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1	63729	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.568530251671074
chr6	74295823	74296227	74295840	Y	MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1	64303	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr6	74432369	74432753	74432573	Y	MB21D1,EEF1A1,SLC17A5,CD109,CD109	CD109	NA	NA	NA	NA	CD109	28861	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	75341134	75341498	75341316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL12A1	572269	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr6	75853490	75853812	75853630	Y	COL12A1	NA	NA	NA	NA	NA	COL12A1	59955	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	75914223	75914620	75914578	Y	COL12A1	COL12A1,COX7A2	NA	NA	NA	NA	COL12A1	456	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr6	79597447	79597572	79597510	Y	NA	IRAK1BP1	NA	NA	NA	NA	IRAK1BP1	22258	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	79773928	79774085	79774072	Y	NA	PHIP	NA	NA	NA	NA	PHIP	11868	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	80487784	80488033	80487927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTK	223571	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr6	80663174	80663336	80663221	Y	NA	TTK	NA	NA	NA	NA	TTK	48268	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	80777050	80777287	80777243	Y	NA	BCKDHB	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	37077	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr6	81197510	81197656	81197595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	383146	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	81429960	81430117	81430036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	615596	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	82444623	82444816	82444722	Y	NA	FAM46A	NA	NA	NA	NA	FAM46A	15675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	82547816	82548067	82547911	Y	FAM46A	NA	FAM46A	MCF7	ChIA-PET	22265404	FAM46A	87325	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	82648128	82648420	82648330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM46A	187637	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr6	82956000	82956181	82956090	Y	NA	IBTK	NA	NA	NA	NA	IBTK	529	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	83106802	83107017	83106898	Y	NA	TPBG	TPBG	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TPBG	35879	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	83737150	83737334	83737242	Y	NA	DOPEY1	NA	NA	NA	NA	DOPEY1	38051	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr6	83745270	83745402	83745336	Y	NA	DOPEY1	NA	NA	NA	NA	DOPEY1	29983	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	83756669	83757034	83756938	Y	PGM3,DOPEY1	DOPEY1	NA	NA	NA	NA	DOPEY1	18351	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	83893224	83893469	83893362	Y	RWDD2A,PGM3,PGM3	RWDD2A,PGM3	NA	NA	NA	NA	RWDD2A	7629	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	83935269	83935637	83935453	Y	NA	RWDD2A,PGM3	NA	NA	NA	NA	PGM3	33614	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	84139998	84140114	84140099	Y	ME1	ME1	NA	NA	NA	NA	ME1	1201	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr6	84577292	84577766	84577526	Y	CYB5R4	CYB5R4	NA	NA	NA	NA	CYB5R4	9930	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	84877511	84877669	84877594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1009	57684	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr6	84917634	84917758	84917696	Y	NA	KIAA1009	NA	NA	NA	NA	KIAA1009	17595	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	85334002	85334301	85334152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1009	398649	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	86113432	86113601	86113525	Y	NT5E	NT5E	NT5E,SNX14	IMR90	Hi-C	24141950	NT5E	44208	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	86114496	86114829	86114663	Y	NT5E	NT5E	NT5E,SNX14	IMR90	Hi-C	24141950	NT5E	42980	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	86377022	86377042	86377037	Y	NA	SYNCRIP,SNHG5	NA	NA	NA	NA	SNHG5	9409	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	87433521	87433927	87433716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGA	368897	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	87800989	87801207	87801098	Y	CGA	CGA,RCN1P1	NA	NA	NA	NA	CGA	1617	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	87832223	87832245	87832242	Y	NA	CGA,RCN1P1,ZNF292	ZNF292	IMR90	Hi-C	24141950	RCN1P1	1817	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr6	87881047	87881581	87881092	Y	NA	ZNF292	NA	NA	NA	NA	ZNF292	20496	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	88183289	88183642	88183572	Y	NA	SLC35A1	NA	NA	NA	NA	SLC35A1	4948	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	88213981	88214157	88214070	Y	GJB7	SLC35A1	NA	NA	NA	NA	SLC35A1	35640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	88401154	88401337	88401278	Y	NA	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	8590	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr6	88408243	88408692	88408556	Y	AKIRIN2	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	1235	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	88433013	88433258	88433054	Y	AKIRIN2	AKIRIN2	AKIRIN2-AS1,AKIRIN2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	AKIRIN2	23086	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr6	89470471	89470676	89470540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNGTT	200672	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr6	89473318	89473558	89473438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNGTT	197790	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	89744158	89744669	89744587	Y	UBE2J1,RRAGD,PNRC1	PNRC1	PNRC1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PNRC1	43801	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr6	89744998	89746016	89745827	Y	UBE2J1,PNRC1	PNRC1	PNRC1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PNRC1	42454	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr6	89754563	89754924	89754852	Y	UBE2J1,RRAGD,PNRC1,RNGTT	PNRC1	PNRC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PNRC1	33546	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	89758081	89758394	89758222	Y	UBE2J1,PNRC1	PNRC1	PNRC1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PNRC1	30076	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr6	90550185	90550523	90550354	Y	NA	MDN1,CASP8AP2	NA	NA	NA	NA	CASP8AP2	12572	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr6	90596283	90596734	90596349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASP8AP2	58670	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr6	90856849	90857084	90856969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH2	147543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	91134952	91135221	91135020	Y	NA	NA	BACH2	IMR90	Hi-C	24141950	BACH2	130325	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	92185644	92186055	92185825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K7	890880	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	93802046	93802077	93802062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANEA	2221342	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr6	94494942	94495122	94494946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANEA	1528297	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	95244699	95244909	95244803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANEA	778510	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	97632369	97632997	97632691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMS22L	96096	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr6	97681036	97681361	97681334	Y	NA	MMS22L	NA	NA	NA	NA	MMS22L	47732	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	97911204	97911291	97911247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMS22L	182111	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	99886915	99887218	99887074	Y	NA	COQ3,RP11-98I9.4,PNISR	NA	NA	NA	NA	PNISR	15708	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	99901572	99901766	99901669	Y	NA	RP11-98I9.4,PNISR	NA	NA	NA	NA	PNISR	30365	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	99995359	99995841	99995579	Y	PNISR	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	19008	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr6	100002359	100002730	100002672	Y	PNISR,USP45,LOC100130890	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	12119	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	100007525	100007878	100007702	Y	LOC100130890	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	6971	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	100008682	100008928	100008805	Y	NA	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	5921	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	100012296	100012415	100012356	Y	NA	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	2434	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	100584000	100584312	100584155	Y	NA	NA	SIM1,ASCC3	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-121G13.3	391840	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	100676865	100677032	100676949	Y	NA	NA	SIM1	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-121G13.3	299120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr6	101149750	101149957	101149936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-121G13.3	173598	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr6	101204667	101204976	101204826	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCC3	122272	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	101311437	101311450	101311446	Y	NA	ASCC3	NA	NA	NA	NA	ASCC3	15798	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	106048262	106048533	106048347	Y	NA	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PREP	199303	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	106049296	106049799	106049571	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PREP	200337	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr6	106057484	106057635	106057546	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PREP	208525	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	106243976	106244328	106244157	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	287867	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr6	106252415	106252491	106252453	Y	PRDM1	NA	ATG5,PRDM1	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	279704	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr6	106253342	106253636	106253548	Y	PRDM1	NA	ATG5,PRDM1	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	278559	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	106258484	106259193	106259052	Y	NA	NA	ATG5,PRDM1	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	273002	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	106320025	106320545	106320363	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	211650	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	106440406	106440671	106440473	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	91524	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.299102907177861
chr6	106442778	106443178	106442990	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	89017	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.253972705197657
chr6	106537985	106538349	106538117	Y	PRDM1,PRDM1	PRDM1	NA	NA	NA	NA	PRDM1	5790	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	106545257	106545540	106545397	Y	PRDM1	PRDM1	NA	NA	NA	NA	PRDM1	13062	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	106582399	106582514	106582457	Y	AIM1	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM1	50204	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr6	106643011	106643217	106643065	Y	PRDM1	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM1	110816	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	107014040	107014053	107014047	Y	BEND3,RTN4IP1	NA	NA	NA	NA	NA	AIM1	56310	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr6	107047078	107047343	107047210	Y	BEND3	RTN4IP1,QRSL1	NA	NA	NA	NA	RTN4IP1	28030	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	107216864	107217098	107216981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf203	130309	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	108239964	108240066	108240015	Y	NA	SEC63	NA	NA	NA	NA	SEC63	37327	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	108455044	108455377	108455332	Y	NA	OSTM1	LACE1,ARMC2,NR2E1	IMR90	Hi-C	24141950	OSTM1	29681	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	108574394	108574619	108574507	Y	NA	SNX3,LACE1	NA	NA	NA	NA	SNX3	5845	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	108879164	108879427	108879300	Y	SESN1,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	126	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr6	108879521	108879931	108879808	Y	SESN1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	483	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.431452313270024
chr6	108883670	108884545	108884024	Y	OSTM1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	4632	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.234484356321151
chr6	108954654	108955002	108954825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO3	75616	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	109011028	109011405	109011217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO3	131990	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	109056613	109056789	109056693	Y	FOXO3	NA	FOXO3,LINC00222	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARMC2	110830	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr6	109288163	109288636	109288487	Y	FOXO3,SMPD2,MICAL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-249L21.4	61087	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr6	109558807	109559007	109558956	Y	SMPD2,MICAL1,CD164	NA	CD164,CCDC162P	K562	ChIA-PET	22265404	CD164	142755	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	110415658	110415810	110415734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WASF1	83397	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	110456590	110456951	110456841	Y	WASF1,CDC40,C6orf186	WASF1,CDC40	NA	NA	NA	NA	WASF1	42256	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	110502951	110503352	110503102	Y	FIG4,CDC40	WASF1,CDC40	NA	NA	NA	NA	CDC40	3607	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	111049772	111049981	111049963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK19	85180	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr6	111409580	111409942	111409703	Y	AMD1,AMD1,REV3L,SLC16A10	SLC16A10	NA	NA	NA	NA	SLC16A10	2799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	111666861	111666999	111666959	Y	REV3L,FYN	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1919	88310	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	111720734	111721265	111721077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	81449	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	111727743	111727975	111727836	Y	SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	74739	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	111733320	111733976	111733973	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	68738	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr6	111758931	111759246	111759206	Y	NA	TRAF3IP2-AS1,REV3L	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	43468	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr6	111776910	111777281	111777179	Y	NA	TRAF3IP2-AS1,REV3L	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	25433	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr6	111784023	111784230	111784203	Y	NA	TRAF3IP2-AS1,REV3L	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	18484	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	111795712	111796054	111795883	Y	NA	TRAF3IP2-AS1,REV3L	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	6660	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	111873587	111873978	111873729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2	51503	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	111889822	111890007	111889856	Y	REV3L	TRAF3IP2	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2	35474	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	111924339	111924647	111924531	Y	TRAF3IP2	TRAF3IP2	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2	834	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	112110533	112110931	112110911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYN	81724	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr6	112145008	112145393	112145362	Y	REV3L,TRAF3IP2,FYN,FYN,FYN	FYN	NA	NA	NA	NA	FYN	47262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr6	112163238	112163349	112163330	Y	NA	FYN	NA	NA	NA	NA	FYN	29306	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	112170510	112170904	112170903	Y	NA	FYN	NA	NA	NA	NA	FYN	21751	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	112173257	112173622	112173448	Y	NA	FYN	NA	NA	NA	NA	FYN	19033	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	112523729	112524008	112523937	Y	LAMA4	NA	NA	NA	NA	NA	TUBE1	116997	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	112525181	112525504	112525289	Y	LAMA4	NA	NA	NA	NA	NA	TUBE1	118449	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	114176108	114176553	114176196	Y	MARCKS	NA	NA	NA	NA	NA	MARCKS	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr6	114318333	114318559	114318390	Y	NA	RP3-399L15.3,HDAC2	NA	NA	NA	NA	HDAC2	11913	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	116469368	116469398	116469382	Y	NA	NT5DC1	NA	NA	NA	NA	NT5DC1	49356	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	116550472	116550927	116550585	Y	KPNA5,TSPYL4,TSPYL1	TSPYL4,RP3-486I3.4,TSPYL1	NA	NA	NA	NA	TSPYL4	22334	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr6	116708158	116708375	116708238	Y	ZUFSP,DSE,FAM26F	NA	NA	NA	NA	NA	TSPYL1	109092	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr6	116988703	116988966	116988944	Y	DSE,ZUFSP,KPNA5	ZUFSP,KPNA5	NA	NA	NA	NA	ZUFSP	746	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr6	117761832	117762028	117761987	Y	NA	DCBLD1	DCBLD1,GOPC	IMR90	Hi-C	24141950	DCBLD1	10952	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr6	117804575	117804878	117804739	Y	NA	DCBLD1	NA	NA	NA	NA	DCBLD1	31595	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255241747566551
chr6	117914764	117915043	117914904	Y	NA	GOPC	NA	NA	NA	NA	GOPC	6648	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr6	119151345	119151482	119151449	Y	MCM9	NA	NA	NA	NA	NA	ASF1A	61902	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	119166106	119166505	119166300	Y	NA	ASF1A	NA	NA	NA	NA	ASF1A	46879	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	119214275	119214495	119214295	Y	C6orf204,C6orf204,FAM184A,MCM9,ASF1A	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	891	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	119218988	119219366	119219177	Y	MCM9	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	5604	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	121399720	121399938	121399829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-276J11.2	300680	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	123017370	123017507	123017435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMPDL3A	90808	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	123074884	123075101	123074982	Y	NA	SMPDL3A	NA	NA	NA	NA	SMPDL3A	33214	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	125335634	125335813	125335724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF217	53943	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr6	125420883	125421200	125421024	Y	NA	TPD52L1	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	16995	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr6	125424080	125424400	125424202	Y	NA	TPD52L1	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	13795	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr6	125523153	125523251	125523202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	84958	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr6	125622252	125622475	125622321	Y	NA	HDDC2	NA	NA	NA	NA	HDDC2	970	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr6	125952984	125953298	125953141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEY2	113512	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	126108316	126108682	126108499	Y	NA	HEY2,NCOA7,NCOA7-AS1	NA	NA	NA	NA	NCOA7	8009	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr6	126112858	126113033	126112985	Y	TRMT11,HINT3,NCOA7	HEY2,NCOA7,NCOA7-AS1	NA	NA	NA	NA	NCOA7	12551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.174594337773329
chr6	126167488	126167529	126167508	Y	NCOA7	NCOA7-AS1	NA	NA	NA	NA	NCOA7-AS1	29484	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	126241150	126241321	126241235	Y	NCOA7	HINT3	NA	NA	NA	NA	HINT3	34606	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.395049026717228
chr6	126265741	126265870	126265827	Y	NCOA7	HINT3,TRMT11	NA	NA	NA	NA	HINT3	10057	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.216839269454495
chr6	126267356	126267782	126267584	Y	NCOA7	HINT3,TRMT11	NA	NA	NA	NA	HINT3	8145	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.19879378389982
chr6	126271537	126271736	126271680	Y	NA	HINT3,TRMT11	NA	NA	NA	NA	HINT3	4191	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.681965528527687
chr6	126279126	126279509	126279187	Y	NCOA7	HINT3,TRMT11	NA	NA	NA	NA	HINT3	3199	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr6	126579500	126579620	126579560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPW	79700	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr6	127423270	127423808	127423538	Y	RNF146	RSPO3	NA	NA	NA	NA	RSPO3	13941	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	127481688	127482073	127481881	Y	RNF146,C6orf174,RSPO3	RSPO3	NA	NA	NA	NA	RSPO3	43939	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr6	127638757	127639069	127638966	Y	NA	ECHDC1	NA	NA	NA	NA	ECHDC1	23685	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	127892310	127892704	127892511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	137529	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	127980874	127981174	127981075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	226093	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.234484356321151
chr6	127981338	127981402	127981371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	226557	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	128607751	128608140	128608092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	231730	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	128816273	128816626	128816620	Y	NA	PTPRK	NA	NA	NA	NA	PTPRK	23244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	128840669	128840970	128840936	Y	PTPRK,PTPRK	PTPRK	NA	NA	NA	NA	PTPRK	799	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	128847994	128848227	128848111	Y	NA	PTPRK	NA	NA	NA	NA	PTPRK	8124	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	129250577	129251100	129251039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	410707	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	129480057	129480411	129480316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	548959	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr6	129822485	129822770	129822701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	206600	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	130005105	130005433	130005370	Y	L3MBTL3,ARHGAP18	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	23937	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	130008447	130008678	130008538	Y	NA	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	20692	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	130342212	130342458	130342393	Y	SAMD3,SAMD3,L3MBTL3	L3MBTL3	NA	NA	NA	NA	L3MBTL3	9368	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.294374374868973
chr6	130513480	130513753	130513616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	L3MBTL3	180636	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	131527646	131527881	131527784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP7	72840	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	131578505	131578692	131578683	Y	AKAP7,MED23,AKAP7	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP7	123699	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	131595636	131595766	131595737	Y	MED23,AKAP7	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP7	140830	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	132787299	132787948	132787832	Y	NA	STX7	NA	NA	NA	NA	STX7	44389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr6	133133336	133133580	133133458	Y	NA	SNORD101	NA	NA	NA	NA	RPS12	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	133134288	133134908	133134317	Y	NA	RPS12	NA	NA	NA	NA	SNORD101	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	133787838	133788115	133788090	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYA4	228102	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	133837061	133837238	133837150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYA4	277325	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	133839183	133839299	133839241	Y	EYA4	NA	NA	NA	NA	NA	EYA4	279447	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	133843297	133843543	133843427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYA4	283561	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr6	133890779	133890909	133890844	Y	NA	NA	MGC34034,TBPL1,SLC2A12,TCF21	IMR90	Hi-C	24141950	EYA4	331043	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.268158302124319
chr6	134608836	134609436	134609187	Y	SGK1,SGK1,SGK1,SGK1	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	27814	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr6	134609640	134610343	134609803	Y	SGK1,SGK1,SGK1	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	26907	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.155836138087189
chr6	134614780	134615032	134614956	Y	SGK1,SGK1	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	22218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.52611195538159
chr6	134616841	134617592	134617239	Y	SGK1,SGK1,SGK1	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	19658	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.95429603472346
chr6	134620325	134620468	134620398	Y	NA	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	16782	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.565644981372036
chr6	134620653	134620958	134620903	Y	SGK1	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	16292	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr6	134622486	134622615	134622584	Y	SGK1	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	14635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr6	134629171	134629337	134629251	Y	SGK1,SGK1	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	7913	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	134668918	134669336	134669288	Y	NA	SGK1	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	31668	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.922638715538458
chr6	134669516	134669878	134669820	Y	NA	SGK1	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	32266	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.19538796343122
chr6	134679459	134679725	134679553	Y	SGK1,SGK1	SGK1	SGK1,ALDH8A1,LOC154092	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	42209	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.553614505554045
chr6	134684660	134684778	134684697	Y	SGK1,SGK1	SGK1	SGK1,ALDH8A1,LOC154092	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	47410	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	134700193	134700599	134700296	Y	SGK1,SGK1	NA	ALDH8A1,LOC154092,SGK1,HBS1L,MIR3662	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	62943	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	134741718	134742020	134741875	Y	SGK1,SGK1,SGK1	NA	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	104468	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr6	134742048	134742399	134742278	Y	SGK1,SGK1	NA	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	104798	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr6	134743944	134744382	134744175	Y	SGK1,SGK1,SGK1	NA	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	106694	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.155836138087189
chr6	134838672	134838766	134838701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGK1	201422	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	134838896	134839303	134839202	Y	SGK1,SGK1,SGK1	NA	NA	NA	NA	NA	SGK1	201646	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr6	134845573	134845660	134845628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGK1	208323	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	135045910	135046288	135046221	Y	NA	NA	SGK1,ALDH8A1,LOC154092	IMR90	Hi-C	24141950	HBS1L	375906	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.147265152209192
chr6	135707385	135707414	135707388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00271	109075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr6	136174498	136174747	136174644	Y	PDE7B	PDE7B	NA	NA	NA	NA	PDE7B	3664	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	136293369	136293422	136293396	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE7B	122535	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	136312028	136312251	136312140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE7B	141194	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	136336050	136336507	136336258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE7B	165216	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr6	136688131	136688248	136688227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	79142	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	136691586	136691742	136691665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	82597	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	136724164	136724966	136724405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	115175	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.252129443187807
chr6	136729350	136729610	136729525	Y	MAP7,MAP7,MAP7,MAP7,MAP7	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	120361	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.31401865329489
chr6	136813959	136814231	136814138	Y	MAP7,MAP7,MAP7,MAP7	NA	NA	NA	NA	NA	MAP7	55726	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr6	136839838	136840084	136840036	Y	NA	MAP7	NA	NA	NA	NA	MAP7	29873	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr6	137082760	137083090	137082822	Y	MAP3K5	MAP3K5	NA	NA	NA	NA	MAP3K5	28566	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	137181238	137181571	137181404	Y	PEX7	PEX7	NA	NA	NA	NA	PEX7	39521	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr6	137231671	137231914	137231792	Y	NA	NA	SLC35D3	IMR90	Hi-C	24141950	PEX7	89954	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr6	137545116	137545441	137545236	Y	MAP3K5,IFNGR1	IFNGR1	NA	NA	NA	NA	IFNGR1	6530	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	138005755	138006075	138006062	Y	NA	NA	IL20RA	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	180276	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	138132277	138133056	138132650	Y	TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFAIP3	53295	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr6	138427134	138427492	138427302	Y	PERP	PERP	NA	NA	NA	NA	PERP	486	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr6	138776959	138777186	138777132	Y	PBOV1	NA	NA	NA	NA	NA	HEBP2	54291	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr6	138786189	138786282	138786236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEBP2	63521	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	139213986	139214343	139214165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REPS1	93055	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	139350632	139351255	139350885	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	43234	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	139351818	139352158	139351992	Y	CCDC28A,C6orf115,HECA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	44420	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	139697079	139697371	139697327	Y	NA	CITED2	NA	NA	NA	NA	CITED2	3322	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	139909356	139909574	139909434	Y	NA	NA	CITED2,LOC645434,LOC100132735,MIR3668	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CITED2	215599	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	140029935	140030328	140030123	Y	CITED2,CITED2,CITED2	NA	CITED2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED2	336178	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	140085604	140086085	140085978	Y	CITED2,CITED2,CITED2	NA	TXLNB,CITED2,LOC645434,LOC100132735	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED2	391847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	141204403	141204777	141204486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	1261590	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	142508557	142508921	142508635	Y	NA	VTA1	NA	NA	NA	NA	VTA1	42190	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.348805711917541
chr6	142698366	142698689	142698587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR126	77375	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr6	143150171	143150307	143150239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	114031	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	143206296	143206927	143206703	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	57411	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	143223836	143224147	143224035	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	40191	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	143247398	143248213	143248022	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	16125	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	143770817	143770943	143770879	Y	ADAT2	ADAT2,PEX3	NA	NA	NA	NA	PEX3	873	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr6	144007310	144007644	144007477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-468K18.5	118585	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	144066654	144067070	144066822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-468K18.5	59159	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	144537313	144537754	144537668	Y	NA	TPT1P4	STX11,SF3B5	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TPT1P4	17211	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	146064598	146064921	146064634	Y	FBXO30	EPM2A	NA	NA	NA	NA	EPM2A	9438	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	146867560	146867942	146867733	Y	RAB32	RAB32	NA	NA	NA	NA	RAB32	4731	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr6	147235088	147235549	147235197	Y	RAB32,STXBP5	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	288012	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr6	147235645	147236230	147236149	Y	RAB32,STXBP5	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	287331	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr6	147643373	147644201	147643793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1P1	81824	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr6	149018728	149019099	149018916	Y	NA	UST	LOC100128176,UST	IMR90	Hi-C	24141950	UST	47365	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	149069640	149070024	149069807	Y	UST	UST	NA	NA	NA	NA	UST	3176	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.218455497384639
chr6	149081701	149082266	149082198	Y	UST	UST	NA	NA	NA	NA	UST	15237	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	149376073	149376391	149376158	Y	NA	RP11-162J8.3	NA	NA	NA	NA	RP11-162J8.3	24364	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	149400726	149401123	149400736	Y	NA	RP11-162J8.3	NA	NA	NA	NA	RP11-162J8.3	49017	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	149554491	149554815	149554668	Y	ZC3H12D	TAB2	UST,TAB2	IMR90	Hi-C	24141950	TAB2	16714	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	149657882	149658028	149657899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAB2	120105	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	149693406	149693750	149693583	Y	NA	NA	ZC3H12D	IMR90	Hi-C	24141950	TAB2	155629	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr6	150075680	150075936	150075837	Y	SUMO4	LATS1,PCMT1,NUP43	NA	NA	NA	NA	NUP43	6879	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	150076607	150076998	150076645	Y	KATNA1,LATS1	LATS1,PCMT1,NUP43	NA	NA	NA	NA	NUP43	7806	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr6	150176203	150176399	150176290	Y	NA	LRP11,RAET1E	NA	NA	NA	NA	LRP11	7800	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	150183311	150183513	150183478	Y	NA	LRP11,RAET1E	NA	NA	NA	NA	LRP11	686	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr6	150200694	150201094	150200866	Y	NA	LRP11,RAET1E,RAET1G	NA	NA	NA	NA	RAET1E	16144	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.265428961374692
chr6	150286198	150286452	150286311	Y	ULBP1	RAET1G,ULBP1,RAET1K	NA	NA	NA	NA	ULBP1	3055	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	151178145	151178545	151178467	Y	MTHFD1L	MTHFD1L	NA	NA	NA	NA	MTHFD1L	6140	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr6	151178746	151179109	151178841	Y	NA	MTHFD1L	NA	NA	NA	NA	MTHFD1L	5576	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.293644225678606
chr6	151302311	151302568	151302430	Y	PLEKHG1	RP1-99E18.2	NA	NA	NA	NA	RP1-99E18.2	48207	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	151365804	151366060	151365928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	52605	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	151366985	151367228	151367157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	51437	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	151373285	151373500	151373395	Y	NA	RP1-292B18.1	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	45165	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	151381285	151381592	151381452	Y	NA	RP1-292B18.1	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	37073	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	151806818	151807048	151806974	Y	ZBTB2	RMND1,C6orf211	NA	NA	NA	NA	C6orf211	35396	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	154753926	154754309	154754118	Y	CNKSR3	NA	NA	NA	NA	NA	CNKSR3	75484	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	155179611	155179904	155179758	Y	NA	NA	TIAM2	IMR90	Hi-C	24141950	SCAF8	127152	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	155193821	155194059	155193913	Y	NA	NA	TIAM2,TFB1M,CLDN20	IMR90	Hi-C	24141950	SCAF8	141362	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr6	155636183	155636317	155636271	Y	NA	TFB1M	NA	NA	NA	NA	TFB1M	2556	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr6	157007979	157008724	157008580	Y	ARID1B	NA	MIR4466,ARID1B,NOX3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	88339	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.327318171481775
chr6	157041058	157041538	157041248	Y	ARID1B	NA	ARID1B,MIR4466	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	55525	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.364834570854054
chr6	157096939	157097165	157097038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	157097774	157098131	157097933	Y	NA	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	711	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	157101566	157102083	157101700	Y	ARID1B	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	4503	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.06187177504818
chr6	157162870	157163071	157163026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	65807	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	157267788	157267851	157267817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	170725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr6	157297453	157297730	157297519	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	200390	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	157342507	157343524	157343342	Y	ARID1B,ZDHHC14	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	245444	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.623308774280891
chr6	157542479	157542718	157542566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	199915	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.301832247927488
chr6	157695432	157695688	157695582	Y	NA	TMEM242	NA	NA	NA	NA	TMEM242	46945	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	157738321	157738749	157738506	Y	NA	TMEM242	NA	NA	NA	NA	TMEM242	3884	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr6	158034114	158034488	158034146	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX9	207808	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	158136804	158137189	158136890	Y	NA	NA	TMEM242,SNX9,ZDHHC14	IMR90	Hi-C	24141950	SNX9	105107	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.67454388988166
chr6	158178530	158178849	158178637	Y	SNX9	NA	SNX9,ZDHHC14,TMEM242,SYNJ2,SERAC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNX9	63447	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	158182288	158182636	158182583	Y	SNX9	NA	SNX9,ZDHHC14,TMEM242,SYNJ2,SERAC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNX9	59660	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	158184460	158184689	158184561	Y	SNX9	NA	SNX9,TMEM242,ZDHHC14,SYNJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNX9	57607	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	158254729	158255396	158255020	Y	NA	SNX9	NA	NA	NA	NA	SNX9	12433	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.477312664440594
chr6	158375265	158375579	158375328	Y	NA	SYNJ2	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	25309	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	158440159	158440546	158440248	Y	SYNJ2	SYNJ2	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	39271	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	158463343	158463878	158463391	Y	SNX9,SYNJ2	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	62455	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr6	158464788	158465005	158464892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	63900	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	158468247	158468495	158468433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	67359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	158515424	158515781	158515670	Y	SYNJ2,SYNJ2	NA	NA	NA	NA	NA	SERAC1	71531	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr6	158640222	158640658	158640460	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2H5	52838	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr6	158981403	158981866	158981661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	81905	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.401237857406849
chr6	158982051	158982465	158982168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	81306	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr6	158987674	158988091	158987879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	75680	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr6	159141436	159141829	159141621	Y	TAGAP,DYNLT1,SYTL3,C6orf99,EZR,EZR	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	77665	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr6	159268112	159268313	159268204	Y	NA	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	20658	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr6	159270971	159271326	159271104	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	17645	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr6	159271429	159272000	159271674	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	16971	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr6	159273925	159274893	159274526	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	14078	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.614964822482601
chr6	159284894	159285253	159285074	Y	NA	EZR,C6orf99	OSTCP1	K562	ChIA-PET	22265404	C6orf99	3718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	159383408	159383511	159383422	Y	NA	RSPH3	NA	NA	NA	NA	RSPH3	35708	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr6	159416474	159416597	159416565	Y	NA	RSPH3	NA	NA	NA	NA	RSPH3	2622	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.123778420214165
chr6	160083070	160083297	160083182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WTAP	61320	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	160137124	160138386	160137829	Y	NA	WTAP,ACAT2,SOD2	LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WTAP	6231	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr6	160141572	160141909	160141740	Y	MAS1,IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP	WTAP,ACAT2,SOD2	LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WTAP	2708	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr6	160144181	160144267	160144224	Y	NA	WTAP,ACAT2,SOD2	NA	NA	NA	NA	WTAP	350	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr6	160399624	160399885	160399732	Y	SOD2,WTAP,WTAP,MAS1	IGF2R	NA	NA	NA	NA	IGF2R	11493	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	163833338	163833600	163833428	Y	QKI	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	306	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	163833938	163834442	163834340	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	906	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr6	163840967	163841346	163841003	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	7935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr6	164011259	164011546	164011401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKI	178227	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	165837337	165837347	165837342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE10A	560744	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr6	165988383	165988522	165988473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE10A	409569	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	166115463	166115816	166115719	Y	NA	NA	PDE10A	IMR90	Hi-C	24141950	PDE10A	282275	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr6	166218273	166218557	166218298	Y	NA	NA	PDE10A	IMR90	Hi-C	24141950	PDE10A	179534	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.124891533033648
chr6	166364914	166365167	166365041	Y	T	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	PDE10A	32924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr6	166378442	166378825	166378818	Y	NA	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	PDE10A	19266	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.222297950953749
chr6	166385606	166385834	166385795	Y	NA	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	PDE10A	12257	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr6	166386011	166386354	166386183	Y	NA	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	PDE10A	11737	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	166398427	166398527	166398479	Y	NA	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	PDE10A	336	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.569643364490557
chr6	166418787	166419137	166419099	Y	NA	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	LINC00473	19251	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr6	166419567	166419719	166419697	Y	PRR18	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	LINC00473	20031	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.260700429065805
chr6	166420168	166420416	166420184	Y	T	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	LINC00473	20632	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.337505385289917
chr6	166765505	166765751	166765595	Y	NA	SFT2D1	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	11426	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	166795008	166795404	166795174	Y	NA	SFT2D1	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	40929	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr6	167115544	167115618	167115576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-514O12.4	251994	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr6	167395299	167395692	167395496	Y	NA	RP11-514O12.4,RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP	NA	NA	NA	NA	RP1-167A14.2	14861	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr6	167411045	167411413	167411177	Y	NA	RP11-514O12.4,RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP	NA	NA	NA	NA	FGFR1OP	375	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr6	169308928	169309266	169309084	Y	THBS2	NA	WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242	IMR90	Hi-C	24141950	WDR27	790893	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr7	373094	373351	373247	Y	PRKAR1B	NA	FLJ44511,PDGFA	MCF7	ChIA-PET	22265404	FAM20C	182125	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.441639527078165
chr7	508552	508748	508658	Y	ADAP1	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	49185	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr7	577876	578141	578015	Y	PRKAR1B,PRKAR1B,HEATR2,GET4,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	19943	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.333889965800512
chr7	579426	579712	579625	Y	PRKAR1B,PRKAR1B,GET4,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	21493	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.180053019272583
chr7	652642	652893	652768	Y	PRKAR1B,ADAP1	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	94709	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr7	946891	947297	947190	Y	ZFAND2A,COX19,ADAP1	GET4,ADAP1	NA	NA	NA	NA	GET4	32702	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	949099	949177	949151	Y	ZFAND2A,ADAP1	GET4,ADAP1	NA	NA	NA	NA	GET4	34910	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.147265152209192
chr7	1066965	1067028	1066969	Y	NA	GPR146	NA	NA	NA	NA	GPR146	15184	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	1456103	1456158	1456132	Y	NA	MICALL2	NA	NA	NA	NA	MICALL2	40980	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	1495047	1495214	1495102	Y	NA	MICALL2,INTS1	NA	NA	NA	NA	MICALL2	1924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	1553000	1553189	1553120	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A	MICALL2,INTS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	INTS1	9511	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.71162365615343
chr7	1560213	1560697	1560426	Y	C7orf50,TMEM184A,PSMG3,PSMG3,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	7653	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.539428908627382
chr7	1571273	1571500	1571366	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	2923	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.459667577573938
chr7	1571848	1572026	1571934	Y	ZFAND2A,TMEM184A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3498	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	1572262	1572844	1572636	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3912	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.666666818781541
chr7	1573524	1573718	1573598	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	5174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr7	1574153	1574602	1574313	Y	NA	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	5803	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	1658452	1658596	1658524	Y	ELFN1	PSMG3	NA	NA	NA	NA	PSMG3	49811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	1945683	1945719	1945693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC074389.9	165756	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	2081068	2081519	2081307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	189359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	2276986	2277172	2277058	Y	LFNG,SNX8	MAD1L1,FTSJ2,NUDT1	NA	NA	NA	NA	FTSJ2	2668	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	2306623	2306831	2306646	Y	MAD1L1	MAD1L1,FTSJ2,NUDT1	NA	NA	NA	NA	NUDT1	26766	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr7	2353156	2353455	2353307	Y	NA	EIF3B,SNX8	NA	NA	NA	NA	EIF3B	38266	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	2561604	2562123	2561810	Y	LFNG,LFNG	LFNG,BRAT1,IQCE	NA	NA	NA	NA	LFNG	11441	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr7	2569438	2569603	2569498	Y	LFNG,LFNG,IQCE,BRAT1	LFNG,BRAT1,IQCE	NA	NA	NA	NA	LFNG	19275	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr7	2569854	2570215	2570046	Y	LFNG,LFNG,IQCE,BRAT1	LFNG,BRAT1,IQCE	NA	NA	NA	NA	LFNG	19691	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr7	2570337	2570495	2570402	Y	LFNG,BRAT1	LFNG,BRAT1,IQCE	NA	NA	NA	NA	LFNG	20174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr7	2575019	2575461	2575251	Y	NA	LFNG,BRAT1,IQCE	NA	NA	NA	NA	BRAT1	17900	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	2681143	2681305	2681209	Y	SNX8,LFNG,LFNG,TTYH3	TTYH3	NA	NA	NA	NA	TTYH3	11558	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr7	2733557	2733913	2733713	Y	SNX8,LFNG,LFNG,GNA12	NA	NA	NA	NA	NA	TTYH3	63972	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	2797465	2798227	2798113	Y	SNX8,LFNG,GNA12	NA	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	75028	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr7	2827851	2827916	2827884	Y	NA	AC006028.11	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	45339	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	2860040	2860490	2860319	Y	LFNG,LFNG,GNA12	AC006028.11,GNA12	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	12765	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr7	2903227	2903785	2903462	Y	LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12	AC006028.11,GNA12	GNA12	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNA12	21269	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.453670002896157
chr7	2980860	2981267	2981182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNA12	98902	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	3668930	3669293	3669112	Y	SDK1	NA	NA	NA	NA	NA	GNA12	786972	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	4660172	4660397	4660258	Y	NA	FOXK1	SDK1,FOXK1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXK1	20991	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr7	4681329	4681565	4681443	Y	MMD2	NA	SDK1,FOXK1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXK1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.99351810956514
chr7	4764796	4765177	4765030	Y	KIAA0415	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	83408	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr7	4765280	4765661	4765569	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	83892	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	4784652	4785031	4784763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	103264	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr7	4913549	4913687	4913618	Y	NA	AC092610.12	NA	NA	NA	NA	AC092610.12	10114	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	5231323	5231672	5231498	Y	WIPI2	WIPI2	NA	NA	NA	NA	WIPI2	3504	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	5388439	5388783	5388611	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNRC18	74262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	5458136	5458686	5458477	Y	FBXL18,TNRC18	TNRC18	NA	NA	NA	NA	TNRC18	4359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	5471668	5472052	5471860	Y	NA	TNRC18	WIPI2,SLC29A4,TNRC18,RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	TNRC18	8623	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	5492663	5492953	5492758	Y	MMD2,SLC29A4	TNRC18	TNRC18	MCF7	ChIA-PET	22265404	TNRC18	29618	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	5571351	5571818	5571666	Y	WIPI2,ACTB	FBXL18,ACTB	NA	NA	NA	NA	FBXL18	19922	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	5594554	5594977	5594837	Y	WIPI2	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	6438	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.929366439406606
chr7	5595490	5596184	5595557	Y	CCZ1,ACTB	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	5231	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.763343087511275
chr7	5596196	5596581	5596543	Y	CCZ1,ACTB	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	4834	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr7	5609221	5609424	5609333	Y	FBXL18	ACTB,FSCN1	RNF216,FSCN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	7806	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr7	5609541	5610012	5609880	Y	SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216,FSCN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	8126	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.739473391887132
chr7	5631413	5631525	5631469	Y	NA	ACTB,FSCN1	RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	FSCN1	974	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr7	5634980	5635411	5634989	Y	AIMP2,FBXL18,ACTB,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	FSCN1	4541	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.31986029842326
chr7	5635420	5636238	5635862	Y	NA	ACTB,FSCN1	NA	NA	NA	NA	FSCN1	4981	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.135808896032157
chr7	5638553	5639025	5638653	Y	NA	ACTB,FSCN1	NA	NA	NA	NA	FSCN1	8114	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr7	5650367	5650762	5650403	Y	NA	ACTB,FSCN1	NA	NA	NA	NA	FSCN1	19928	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	5724329	5724708	5724518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSCN1	93890	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr7	5761606	5761918	5761762	Y	USP42,RNF216	NA	NA	NA	NA	NA	RNF216	57452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	6049655	6049813	6049700	Y	NA	PMS2,AIMP2,EIF2AK1	NA	NA	NA	NA	AIMP2	2779	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr7	6096315	6096609	6096412	Y	EIF2AK1	PMS2,AIMP2,EIF2AK1,AC004895.4,USP42	NA	NA	NA	NA	EIF2AK1	252	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	6145406	6145878	6145682	Y	USP42	EIF2AK1,AC004895.4,USP42	NA	NA	NA	NA	USP42	2891	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr7	6467944	6468137	6468104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAGLB	53684	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	6677371	6677641	6677424	Y	DAGLB,ZNF12,C7orf26	C7orf26,ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	2418	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.128351022973642
chr7	6682292	6682670	6682512	Y	C7orf26	ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	7339	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr7	6741580	6741996	6741754	Y	C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12	ZNF12,PMS2CL	NA	NA	NA	NA	ZNF12	2558	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr7	7249464	7249811	7249639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1	54899	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	7604061	7604281	7604173	Y	MIOS	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	222	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr7	7605671	7605858	7605804	Y	NA	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	1168	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr7	7608686	7608956	7608841	Y	MIOS	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	4183	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	7759003	7759285	7759121	Y	NA	RPA3,RPL23AP51	NA	NA	NA	NA	RPA3	2765	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr7	7835201	7835604	7835382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL23AP51	55035	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	7911710	7911812	7911761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLCCI1	94613	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	7984706	7984926	7984839	Y	GLCCI1	GLCCI1	RPA3,LOC729852	IMR90	Hi-C	24141950	GLCCI1	21499	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	7996944	7997264	7997104	Y	NA	GLCCI1	LOC729852,GLCCI1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLCCI1	9161	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr7	8016516	8016759	8016566	Y	GLCCI1	GLCCI1	NA	NA	NA	NA	GLCCI1	10091	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr7	8254354	8254751	8254559	Y	NA	AC007009.1,ICA1	NA	NA	NA	NA	AC007009.1	45112	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	8295276	8295343	8295310	Y	NA	AC007009.1,ICA1	NA	NA	NA	NA	AC007009.1	4520	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	8300852	8301132	8300960	Y	ICA1,ICA1,ICA1	AC007009.1,ICA1	NA	NA	NA	NA	ICA1	535	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.190240233080725
chr7	8550473	8550803	8550530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ICA1	250156	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	11499121	11499331	11499225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF14	487622	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	11606918	11607025	11606951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF14	595419	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	11860647	11861050	11860853	Y	THSD7A	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM106B	387817	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr7	12463736	12464090	12463948	Y	NA	VWDE	NA	NA	NA	NA	VWDE	22169	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	12755276	12755712	12755432	Y	VWDE,ARL4A	ARL4A	NA	NA	NA	NA	ARL4A	30795	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.274886025992467
chr7	12758831	12759023	12758905	Y	ARL4A	ARL4A	ARL4A	K562	ChIA-PET	22265404	ARL4A	34350	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr7	12759260	12759464	12759402	Y	NA	ARL4A	ARL4A	K562	ChIA-PET	22265404	ARL4A	34779	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	12759659	12759934	12759702	Y	ARL4A,ARL4A	ARL4A	ARL4A	K562	ChIA-PET	22265404	ARL4A	35178	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	13368007	13368354	13368181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL4A	643526	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	16095120	16095542	16095311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKMY2	587900	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr7	16707771	16707941	16707875	Y	NA	ANKMY2,BZW2	NA	NA	NA	NA	BZW2	24015	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr7	16886935	16887473	16887050	Y	NA	AGR2	NA	NA	NA	NA	AGR2	15878	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr7	16961680	16961908	16961842	Y	NA	NA	AGR2	MCF7	ChIA-PET	22265404	AGR2	90623	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	17029591	17029925	17029620	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AGR2	158534	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr7	17139132	17139382	17139242	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AHR	196864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr7	17412000	17412058	17412028	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AC003075.4	75019	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.216839269454495
chr7	17446496	17446663	17446580	Y	AHR	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AC003075.4	109515	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr7	17564000	17564574	17564249	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AC003075.4	227019	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr7	17729678	17729968	17729803	Y	AHR	NA	HDAC9	IMR90	Hi-C	24141950	SNX13	248156	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	20191913	20192270	20192088	Y	TWISTNB	NA	NA	NA	NA	NA	MACC1	62757	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	20439186	20439753	20439406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB8	70861	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	20447290	20447655	20447472	Y	ITGB8	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB8	78965	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr7	20837430	20837819	20837731	Y	SP8	RPL23P8	SP8	K562	ChIA-PET	22265404	RPL23P8	27126	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	21260621	21260992	21260836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP4	204660	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr7	21928607	21928632	21928620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7L	55070	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr7	22011633	22011901	22011770	Y	NA	CDCA7L	NA	NA	NA	NA	CDCA7L	27931	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.258701237506544
chr7	22130088	22130317	22130208	Y	NA	NA	RAPGEF5	IMR90	Hi-C	24141950	CDCA7L	146386	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr7	22616365	22616571	22616440	Y	IL6	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P6	66747	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	22616988	22617783	22617407	Y	IL6	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P6	67370	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.234484356321151
chr7	22622740	22623204	22623070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P6	73122	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.372292443912568
chr7	22667218	22667359	22667242	Y	IL6	NA	LOC100506178,SNORD93,IL6,TOMM7	IMR90	Hi-C	24141950	IL6	96144	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	22757674	22758207	22757934	Y	NA	IL6,AC073072.5	NA	NA	NA	NA	IL6	5296	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr7	22851635	22851773	22851763	Y	NA	TOMM7,AC005682.5	NA	NA	NA	NA	TOMM7	8697	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	22861021	22861212	22861181	Y	NA	TOMM7,AC005682.5	NA	NA	NA	NA	TOMM7	551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr7	22894313	22894860	22894668	Y	STEAP1B,TOMM7	TOMM7,AC005682.5	NA	NA	NA	NA	AC005682.5	2516	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.405966389715736
chr7	23059376	23059761	23059564	Y	NA	FAM126A	LOC100506178,IL6,SNORD93,TOMM7,FAM126A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM126A	7627	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	23229571	23229876	23229614	Y	NA	NUPL2,GPNMB	NA	NA	NA	NA	NUPL2	10125	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr7	23346374	23346675	23346525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPNMB	72788	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	23348040	23348443	23348292	Y	KLHL7,KLHL7,NUPL2,IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	NA	GPNMB	74454	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	23410116	23410259	23410188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	97827	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	23501559	23501943	23501874	Y	NUPL2,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	6143	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	23504984	23505316	23505313	Y	NA	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2770	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	23510676	23511223	23510889	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2590	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.19735137692261
chr7	23513815	23514383	23514045	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	MALSU1	K562	ChIA-PET	22265404	IGF2BP3	5729	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.08680137036504
chr7	23853769	23853785	23853777	Y	NPY	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC126	218771	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	23904639	23904947	23904793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC126	269641	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.281457820311205
chr7	24092646	24092866	24092724	Y	NPY	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC126	457648	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.931748594594982
chr7	24151573	24151679	24151626	Y	NPY	NA	NA	NA	NA	NA	MPP6	459208	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	24626460	24626850	24626473	Y	NA	MPP6	NA	NA	NA	NA	MPP6	15573	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr7	24739704	24740021	24739930	Y	DFNA5,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	67223	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	24803089	24803421	24803235	Y	DFNA5,DFNA5	DFNA5	DFNA5,OSBPL3	IMR90	Hi-C	24141950	DFNA5	3823	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	24826484	24826966	24826807	Y	C7orf31,DFNA5,DFNA5	DFNA5	NA	NA	NA	NA	DFNA5	19240	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	24861129	24861331	24861204	Y	C7orf31,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	53885	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr7	24868518	24868812	24868715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	61274	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	24963944	24964392	24964187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	54861	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	25002827	25003181	25002973	Y	C7orf31,OSBPL3	OSBPL3	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	16072	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	25009429	25009748	25009721	Y	NA	OSBPL3	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	9505	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	25064852	25065012	25064919	Y	NA	OSBPL3	OSBPL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL3	45599	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208268283576497
chr7	25068217	25068495	25068356	Y	NA	OSBPL3	OSBPL3	IMR90	Hi-C	24141950	OSBPL3	48964	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr7	26220261	26220628	26220627	Y	CBX3	CBX3,HNRNPA2B1	NA	NA	NA	NA	CBX3	18154	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	26460550	26460642	26460600	Y	NA	AC004540.5	NA	NA	NA	NA	AC004540.5	24337	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	26589150	26589521	26589235	Y	SNX10	NA	LOC441204,KIAA0087	IMR90	Hi-C	24141950	AC004540.5	152937	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182052210831843
chr7	26815721	26816027	26815980	Y	SNX10,SNX10,SKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	SKAP2	216831	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr7	27143635	27143783	27143725	Y	NA	HOTAIRM1,HOXA1,HOXA-AS2,HOXA4,HOXA5,HOXA6	NA	NA	NA	NA	HOXA-AS2	1613	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	27188378	27188640	27188509	Y	NA	HOXA-AS2,HOXA4,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA10-AS,HOXA9,RP1-170O19.20,HOXA10,HOXA11,HOXA13	NA	NA	NA	NA	HOXA6	156	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	27231816	27231998	27231907	Y	HOXA10,HOXA11,HOXA13	HOXA6,HOXA7,HOXA10-AS,HOXA9,RP1-170O19.20,HOXA10,HOXA11,HOXA13	NA	NA	NA	NA	HOXA13	5727	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.02677285732671
chr7	27531639	27532015	27531830	Y	NA	EIF4HP1	NA	NA	NA	NA	EIF4HP1	35171	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166753501085698
chr7	27573880	27573985	27573933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4HP1	77412	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	27717680	27717897	27717733	Y	NA	HIBADH	HOTTIP,HOXA13,HIBADH,TAX1BP1,JAZF1	IMR90	Hi-C	24141950	HIBADH	17066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.171482033394586
chr7	28076890	28077172	28076964	Y	CREB5	NA	NA	NA	NA	NA	JAZF1-AS1	140769	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr7	28205904	28206253	28206092	Y	NA	JAZF1-AS1,JAZF1	NA	NA	NA	NA	JAZF1-AS1	11688	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	28221716	28221868	28221792	Y	NA	JAZF1-AS1,JAZF1	NA	NA	NA	NA	JAZF1	3354	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	29115131	29115317	29115226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPVL	117750	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	29163209	29163338	29163275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPVL	69729	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr7	29500841	29501198	29501020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007255.8	100088	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	30212903	30212961	30212932	Y	NA	AC007036.5	NA	NA	NA	NA	AC007036.5	17756	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	30224515	30225078	30224817	Y	ZNRF2	AC007036.5	NA	NA	NA	NA	AC007036.5	29368	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	30505141	30505406	30505161	Y	NA	NOD1	NA	NA	NA	NA	NOD1	10994	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr7	30658764	30658962	30658863	Y	NA	GARS	NA	NA	NA	NA	GARS	26467	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	30933146	30933539	30933344	Y	ADCYAP1R1	NA	AQP1	IMR90	Hi-C	24141950	GARS	300849	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	31033316	31033696	31033508	Y	CRHR2,FAM188B	NA	NA	NA	NA	NA	GARS	401019	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	32026855	32027150	32027002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM5	505745	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	32546004	32546038	32546035	Y	NA	LSM5,AVL9	NA	NA	NA	NA	AVL9	12966	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	32551548	32551619	32551584	Y	NA	LSM5,AVL9	NA	NA	NA	NA	AVL9	18510	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	32944853	32945232	32945065	Y	KBTBD2	KBTBD2,RP9P,FKBP9	NA	NA	NA	NA	KBTBD2	13110	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	33316298	33316594	33316442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBS9	149442	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	33762230	33762341	33762268	Y	NA	NA	BMPER,BBS9	IMR90	Hi-C	24141950	BBS9	595374	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr7	33943577	33943776	33943645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBS9	776721	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	35075861	35076697	35076367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERPUD2	656484	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.536316604248639
chr7	36480174	36480717	36480189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	52440	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.190240233080725
chr7	36555269	36555573	36555424	Y	ELMO1,AOAH,EEPD1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	127535	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	36698240	36698520	36698401	Y	AOAH	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P18	158044	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	36776109	36776821	36776493	Y	ELMO1,AOAH	NA	ELMO1	IMR90	Hi-C	24141950	NPM1P18	79743	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	36843340	36843728	36843600	Y	ELMO1	NPM1P18	NA	NA	NA	NA	NPM1P18	12836	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	36903591	36903813	36903689	Y	AOAH,ELMO1	NPM1P18	NA	NA	NA	NA	NPM1P18	47027	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	37071492	37071821	37071657	Y	AOAH,ELMO1,ELMO1	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P18	214928	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	37221797	37222057	37221923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P18	365233	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	37706109	37706403	37706265	Y	GPR141	GPR141,EPDR1	NA	NA	NA	NA	GPR141	14996	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.204269900457976
chr7	39660879	39661112	39661042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALA	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	39661364	39661771	39661496	Y	NA	RALA	NA	NA	NA	NA	RALA	282	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr7	39661947	39662014	39661981	Y	NA	RALA	NA	NA	NA	NA	RALA	865	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr7	40007110	40007159	40007135	Y	NA	CDK13	NA	NA	NA	NA	CDK13	19474	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr7	40088776	40089159	40088837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	101140	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.256857975496695
chr7	40756959	40757193	40757114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	769323	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr7	40937326	40937587	40937437	Y	NA	NA	C7orf10,LOC285954,INHBA	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	803119	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr7	40938770	40939089	40938937	Y	NA	NA	C7orf10,LOC285954,INHBA	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	801617	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.78672801103372
chr7	40952368	40952631	40952468	Y	NA	NA	C7orf10,INHBA,LOC285954	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	788075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	40961938	40962183	40962107	Y	NA	NA	C7orf10,INHBA,LOC285954	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	778523	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.202809602077243
chr7	41025919	41026252	41026112	Y	NA	NA	C7orf10,LOC285954,INHBA	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	714454	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.117433659975133
chr7	41046291	41046547	41046419	Y	NA	NA	LOC285954,INHBA,C7orf10	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	694159	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.174594337773329
chr7	41800026	41800177	41800090	Y	INHBA	NA	NA	NA	NA	NA	INHBA	59320	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr7	42258020	42258279	42258155	Y	GLI3	GLI3	NA	NA	NA	NA	GLI3	17190	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	42927750	42928726	42928340	Y	NA	C7orf25,MRPL32,PSMA2	NA	NA	NA	NA	C7orf25	21178	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.03788192794249
chr7	43117230	43117632	43117554	Y	NA	NA	HECW1,MRPL32,PSMA2	IMR90	Hi-C	24141950	PSMA2	147408	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	43593728	43593915	43593801	Y	NA	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	26442	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr7	43612098	43612408	43612297	Y	DBNL	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	7949	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr7	43625293	43625372	43625313	Y	URGCP,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	4936	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr7	43654812	43655175	43654945	Y	POLM,DBNL,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	34455	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr7	43657815	43658085	43657951	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	37458	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr7	43658377	43658532	43658408	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	38020	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr7	43659947	43660692	43660336	Y	DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	39590	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr7	43670120	43670185	43670135	Y	POLM,DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	49763	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr7	43676905	43677264	43677045	Y	POLM,DBNL,STK17A,URGCP	NA	NA	NA	NA	NA	STK17A	56548	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr7	43740255	43740653	43740556	Y	GCK	NA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	55626	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr7	43789186	43789414	43789300	Y	NA	BLVRA	C7orf44,BLVRA	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BLVRA	6865	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	43801940	43802267	43802061	Y	NA	BLVRA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	5661	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr7	43835897	43835899	43835898	Y	NA	BLVRA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	39618	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	43959007	43959429	43959215	Y	NA	URGCP,UBE2D4	NA	NA	NA	NA	URGCP	4581	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr7	43996825	43996925	43996859	Y	NA	URGCP,UBE2D4	NA	NA	NA	NA	UBE2D4	32788	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.218455497384639
chr7	44085815	44086626	44086335	Y	STK17A,DBNL,POLM	POLR2J4,DBNL,POLM	NA	NA	NA	NA	DBNL	3576	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr7	44616133	44616490	44616314	Y	NA	DDX56,TMED4,OGDH	NA	NA	NA	NA	TMED4	3396	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	44654798	44655022	44654925	Y	ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	DDX56,TMED4,OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	10627	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	44674941	44675231	44675112	Y	PURB,MYO1G,CCM2,DDX56,OGDH	OGDH	ZMIZ2	IMR90	Hi-C	24141950	OGDH	30770	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.408695730465364
chr7	44677628	44678244	44677873	Y	ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	ZMIZ2	IMR90	Hi-C	24141950	OGDH	33457	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.58273374000126
chr7	44678622	44679047	44678972	Y	ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	34451	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.731668333267367
chr7	44679392	44679514	44679453	Y	ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	35221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr7	44775082	44775384	44775244	Y	OGDH,PURB,MYO1G,ZMIZ2,ZMIZ2	ZMIZ2	DDX56,TMED4,OGDH,PPIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZMIZ2	10796	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr7	45019224	45019585	45019470	Y	OGDH,ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G	MYO1G,SNHG15,CCM2	NA	NA	NA	NA	MYO1G	2527	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.76023123947715
chr7	45232429	45232709	45232603	Y	ZMIZ2,PURB,MYO1G	NA	NA	NA	NA	NA	TBRG4	82783	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	46331323	46331686	46331505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGFBP3	371850	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	46385021	46385087	46385052	Y	NA	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP3	425548	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr7	47390589	47390737	47390670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	229419	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	47514732	47515208	47514929	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	104948	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr7	47553531	47553930	47553845	Y	C7orf65	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	66226	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	47588229	47588393	47588311	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	31763	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	47610205	47610436	47610283	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	9720	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	47620098	47620164	47620135	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr7	47631233	47631542	47631345	Y	C7orf69,TNS3	TNS3	TNS3,LINC00525,C7orf69,PKD1L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS3	11077	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.294374374868973
chr7	47641076	47641289	47641172	Y	NA	TNS3	TNS3,C7orf65,LINC00525,PKD1L1,C7orf69	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS3	20920	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	47641950	47642196	47642073	Y	NA	TNS3	TNS3,C7orf65,C7orf69,PKD1L1,LINC00525	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS3	21794	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	47644474	47644665	47644612	Y	NA	TNS3	TNS3,C7orf65,C7orf69,PKD1L1,LINC00525	IMR90	Hi-C	24141950	TNS3	24318	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr7	47691174	47691510	47691360	Y	C7orf69,TNS3,C7orf65	NA	TNS3,PKD1L1,LINC00525,C7orf69	IMR90	Hi-C	24141950	TNS3	71018	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	47709189	47709374	47709294	Y	UPP1,UPP1,HUS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	89033	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr7	47823605	47823820	47823740	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	HUS1	193358	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr7	47826128	47826596	47826342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HUS1	190582	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr7	48240591	48240965	48240675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UPP1	114366	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	50306514	50306844	50306594	Y	IKZF1,FIGNL1	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	209244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	50602565	50602886	50602809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	86477	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	50769181	50769534	50769358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRB10	89625	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	50859334	50859716	50859525	Y	NA	GRB10	NA	NA	NA	NA	GRB10	175	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr7	50889237	50889584	50889351	Y	NA	GRB10	COBL,GRB10	IMR90	Hi-C	24141950	GRB10	30078	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr7	51370562	51370701	51370648	Y	COBL	COBL	NA	NA	NA	NA	COBL	11814	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	51382954	51383359	51383079	Y	COBL	COBL	NA	NA	NA	NA	COBL	439	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr7	51417920	51418197	51418059	Y	NA	COBL	NA	NA	NA	NA	COBL	35405	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.180053019272583
chr7	55035120	55035446	55035284	Y	EGFR	EGFR	EGFR	IMR90	Hi-C	24141950	EGFR	49268	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	55063452	55063479	55063466	Y	NA	EGFR	EGFR	IMR90	Hi-C	24141950	EGFR	21235	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr7	55063666	55063958	55063856	Y	EGFR	EGFR	EGFR	IMR90	Hi-C	24141950	EGFR	20756	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr7	55132578	55133258	55132929	Y	SEC61G,EGFR	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	47864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.180053019272583
chr7	55141624	55142112	55141893	Y	SEC61G,EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	56910	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.189510083890358
chr7	55146809	55147410	55146997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	62095	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.22629633407227
chr7	55155188	55155533	55155358	Y	EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	70474	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr7	55313083	55313480	55313282	Y	NA	CALM1P2	EGFR,SEC61G,LANCL2	IMR90	Hi-C	24141950	CALM1P2	12469	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr7	55322570	55322956	55322611	Y	EGFR	CALM1P2	EGFR,SEC61G	IMR90	Hi-C	24141950	CALM1P2	2993	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.503755771264953
chr7	55529793	55530311	55530129	Y	ZNF713,VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL2	98652	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18278236002221
chr7	55542922	55542955	55542935	Y	VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	VOPP1	95726	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	55543241	55543436	55543358	Y	VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	VOPP1	95245	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	55637465	55637727	55637601	Y	VOPP1	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	954	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	56013517	56013601	56013542	Y	ZNF713	GBAS,MRPS17	NA	NA	NA	NA	GBAS	3885	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	56034549	56034772	56034661	Y	NA	GBAS,MRPS17	NA	NA	NA	NA	MRPS17	17037	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	56168682	56168929	56168809	Y	ZNF713	SUMF2,CHCHD2,NUPR1L	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	3340	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr7	56173322	56173423	56173410	Y	NA	SUMF2,CHCHD2,NUPR1L	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	1053	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	56243524	56243790	56243559	Y	LOC389493	NA	NA	NA	NA	NA	NUPR1L	61431	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	57639323	57639702	57639567	Y	ZNF479,ZNF716	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-760D2.10	976251	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	61972235	61972539	61972387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF727	1531282	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	64196878	64197130	64197096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF138	55636	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr7	65761130	65761447	65761274	Y	RABGEF1,KCTD7	NA	NA	NA	NA	NA	TPST1	92944	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	66015251	66015629	66015440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GS1-124K5.4	58558	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr7	66040596	66040908	66040816	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD7	50960	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	66056218	66056609	66056384	Y	NA	KCTD7	KCTD7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KCTD7	35259	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	66096553	66096745	66096681	Y	NA	KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	KCTD7	4685	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr7	66120269	66120628	66120390	Y	RABGEF1,KCTD7	KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	RP4-756H11.3	2744	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr7	66184244	66184571	66184390	Y	NA	RABGEF1	LOC493754,RABGEF1,LOC729156	IMR90	Hi-C	24141950	RABGEF1	39093	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	66223934	66224293	66224105	Y	KCTD7,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RABGEF1	78783	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	66783772	66783944	66783858	Y	NA	STAG3L4,PMS2P4	NA	NA	NA	NA	PMS2P4	17878	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	69393144	69393376	69393212	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-859M6.1	1289359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr7	72929530	72929887	72929777	Y	NA	BAZ1B,BCL7B	NA	NA	NA	NA	BAZ1B	4721	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr7	72934537	72934921	72934642	Y	NA	BCL7B	NA	NA	NA	NA	BAZ1B	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.241942229379666
chr7	73002313	73002519	73002399	Y	BCL7B	BCL7B,TBL2,MLXIPL	TBL2	K562	ChIA-PET	22265404	TBL2	11192	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr7	73015142	73015298	73015257	Y	NA	BCL7B,TBL2,MLXIPL	NA	NA	NA	NA	MLXIPL	21575	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	73037168	73037552	73037436	Y	MLXIPL	TBL2,MLXIPL	NA	NA	NA	NA	MLXIPL	295	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.589514676996178
chr7	73062013	73062614	73062579	Y	BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A	MLXIPL,WBSCR22,DNAJC30	MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A	IMR90	Hi-C	24141950	MLXIPL	25140	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.578561535929805
chr7	73132412	73132545	73132481	Y	LAT2,BCL7B	WBSCR22,DNAJC30,STX1A,ABHD11	NA	NA	NA	NA	STX1A	410	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	73133049	73133354	73133303	Y	NA	WBSCR22,DNAJC30,STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	STX1A	1047	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	73153813	73154099	73154081	Y	FZD9,STX1A,ABHD11,CLDN4,CLDN3	STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	ABHD11	2616	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr7	73236868	73237278	73236968	Y	CLDN3,CLDN4	CLDN4,WBSCR27	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	17587	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr7	73265870	73266203	73266092	Y	BCL7B	WBSCR27	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	11005	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.212996815885384
chr7	73309402	73309628	73309515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	54537	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	73512377	73512557	73512465	Y	NA	CTB-51J22.1,LIMK1	NA	NA	NA	NA	LIMK1	17114	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr7	73641053	73641366	73641100	Y	LIMK1,LAT2	LAT2,RFC2	NA	NA	NA	NA	RFC2	25408	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	73694024	73694283	73694118	Y	LAT2	RFC2,CLIP2	CLIP2	IMR90	Hi-C	24141950	CLIP2	7522	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr7	73866647	73867033	73866768	Y	LAT2	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	527	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.15475925968019
chr7	73869161	73869472	73869346	Y	NA	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	3041	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr7	73869724	73869891	73869863	Y	GTF2IRD1	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	3604	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.19641162871144
chr7	73897037	73897256	73897156	Y	NA	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	30917	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.315131766114373
chr7	73983073	73983199	73983128	Y	NA	NA	GTF2I	IMR90	Hi-C	24141950	GTF2I	86795	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	73994648	73994954	73994780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2I	75040	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr7	74001829	74001994	74001904	Y	NA	NA	GTF2I	IMR90	Hi-C	24141950	GTF2I	68000	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.313132574555112
chr7	74020286	74020548	74020393	Y	NA	GTF2I	NA	NA	NA	NA	GTF2I	49446	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.418535758712255
chr7	74020929	74021149	74021053	Y	NA	GTF2I	NA	NA	NA	NA	GTF2I	48845	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr7	74050043	74050194	74050049	Y	GTF2IRD2B	GTF2I	GTF2IRD1,GTF2I	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GTF2I	19800	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20553894282687
chr7	74064444	74064957	74064539	Y	GTF2IRD2B,LAT2	GTF2I	NA	NA	NA	NA	GTF2I	5037	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr7	75266605	75266883	75266780	Y	CCL26,HIP1	NA	NA	NA	NA	NA	HIP1	99397	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	75267820	75268040	75267850	Y	POR	NA	NA	NA	NA	NA	HIP1	98240	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	75268782	75269322	75269061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIP1	96958	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.162024968776811
chr7	75291375	75291448	75291402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIP1	74832	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr7	75354773	75355120	75354947	Y	NA	HIP1	NA	NA	NA	NA	HIP1	11160	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	75465283	75465439	75465360	Y	MDH2	CCL26,RHBDD2	STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR	IMR90	Hi-C	24141950	RHBDD2	4481	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.268158302124319
chr7	75479654	75479859	75479743	Y	POR	RHBDD2,POR	HIP1,STYXL1,CCL24,POR,CCL26,RHBDD2,TMEM120A,MDH2	IMR90	Hi-C	24141950	RHBDD2	9734	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	75546128	75546229	75546156	Y	NA	POR	STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	POR	19610	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	75563701	75564093	75563872	Y	POR	POR	NA	NA	NA	NA	POR	37183	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.164024160336071
chr7	75567331	75567651	75567437	Y	POR	POR	NA	NA	NA	NA	POR	40813	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.149994492958819
chr7	75573320	75573489	75573400	Y	POR	POR,TMEM120A	NA	NA	NA	NA	POR	46802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	75595933	75596261	75596039	Y	NA	TMEM120A	NA	NA	NA	NA	TMEM120A	25716	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	75599122	75599360	75599199	Y	NA	TMEM120A	NA	NA	NA	NA	TMEM120A	22617	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	75601289	75601466	75601374	Y	NA	TMEM120A	NA	NA	NA	NA	TMEM120A	20511	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	75795833	75796053	75795969	Y	RHBDD2,POR	SRRM3	SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	SRRM3	33163	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.602778417115198
chr7	75923846	75924306	75924205	Y	HSPB1	HSPB1	NA	NA	NA	NA	HSPB1	5555	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.375907863401973
chr7	75947305	75947626	75947472	Y	RHBDD2,SRRM3	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	17444	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.70892964186623
chr7	75948116	75948327	75948250	Y	RHBDD2	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	18255	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.533587263499012
chr7	75993529	75993613	75993570	Y	POR	YWHAG,ZP3	YWHAG	MCF7	ChIA-PET	22265404	YWHAG	7181	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	75993825	75994303	75994024	Y	NA	YWHAG,ZP3	YWHAG	MCF7	ChIA-PET	22265404	YWHAG	7477	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr7	76002661	76002791	76002762	Y	POR	YWHAG,ZP3	NA	NA	NA	NA	YWHAG	16313	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18478155158147
chr7	76009173	76009680	76009431	Y	POR	YWHAG,ZP3	NA	NA	NA	NA	ZP3	15155	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.421995248652249
chr7	76627484	76628238	76628092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM185BP	121195	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	77177634	77177834	77177685	Y	FGL2,PION,PTPN12,PTPN12	PTPN12	NA	NA	NA	NA	PTPN12	13042	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	77199277	77199536	77199359	Y	FGL2,PION,PTPN12,PTPN12	PTPN12	NA	NA	NA	NA	PTPN12	34685	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr7	77201219	77201434	77201295	Y	FGL2,PION,PTPN12,PTPN12	PTPN12	NA	NA	NA	NA	PTPN12	36627	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	77316787	77316835	77316811	Y	NA	RSBN1L-AS1,RSBN1L	NA	NA	NA	NA	RSBN1L-AS1	6747	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	77428722	77429286	77429067	Y	PION,PTPN12,RSBN1L,PHTF2,PHTF2	TMEM60,PHTF2	NA	NA	NA	NA	PHTF2	2600	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr7	78922771	78923130	78923056	Y	MAGI2	NA	NA	NA	NA	NA	GNAI1	838141	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	79776985	79777288	79777110	Y	NA	GNAI1	NA	NA	NA	NA	GNAI1	15714	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr7	80128570	80128822	80128710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD36	131679	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr7	80171671	80172049	80171853	Y	NA	NA	GNAT3,CD36	IMR90	Hi-C	24141950	CD36	174780	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr7	80352083	80352704	80352185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3C	196971	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	80550378	80550824	80550614	Y	NA	SEMA3C	NA	NA	NA	NA	SEMA3C	703	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	80571600	80571811	80571745	Y	NA	SEMA3C	NA	NA	NA	NA	SEMA3C	21925	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	81234008	81234151	81234026	Y	NA	NA	HGF,CACNA2D1	IMR90	Hi-C	24141950	SEMA3C	684333	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	81377318	81377637	81377478	Y	HGF	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	693477	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr7	81582871	81583219	81583134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	487895	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	82071570	82071737	82071656	Y	NA	CACNA2D1	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	456	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	83092459	83092603	83092529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	1021345	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	84248657	84248668	84248663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3A	128617	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr7	86534596	86534997	86534797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1324L	152018	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr7	86948267	86948659	86948457	Y	CROT	TP53TG1,CROT	NA	NA	NA	NA	TP53TG1	24172	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr7	87571513	87571795	87571654	Y	NA	ADAM22	NA	NA	NA	NA	ADAM22	10055	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	87886356	87886519	87886436	Y	STEAP4	SRI,STEAP4	NA	NA	NA	NA	SRI	32048	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr7	87918906	87919150	87919043	Y	SRI	STEAP4	NA	NA	NA	NA	STEAP4	15056	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.778258833628305
chr7	87937179	87937443	87937284	Y	STEAP4	STEAP4	NA	NA	NA	NA	STEAP4	2973	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.466969521083042
chr7	90224046	90224366	90224206	Y	STEAP2	AC002456.2	CDK14,MTERF,FZD1,STEAP2,C7orf63	IMR90,H1ESC	Hi-C,5C	24141950,22955621	AC002456.2	301	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr7	90242419	90242638	90242578	Y	NA	AC002456.2	CDK14,FZD1	IMR90	Hi-C	24141950	AC002456.2	17752	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	90253502	90253813	90253671	Y	NA	AC002456.2	CDK14	IMR90	Hi-C	24141950	AC002456.2	28835	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	90596654	90596860	90596743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FZD1	294923	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr7	92053507	92053858	92053662	Y	NA	GATAD1	GATAD1,ANKIB1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GATAD1	20909	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr7	92156983	92157235	92157087	Y	CDK6,CDK6,PEX1,FAM133B,C7orf64	PEX1,RBM48	NA	NA	NA	NA	RBM48	896	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr7	92217809	92218139	92217980	Y	NA	FAM133B	NA	NA	NA	NA	FAM133B	101	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	92277080	92277232	92277129	Y	ANKIB1,GATAD1,CDK6	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	59372	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	92282305	92282698	92282463	Y	LRRD1,KRIT1,KRIT1,KRIT1,SAMD9L,SAMD9	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	64597	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	92324544	92325563	92325510	Y	NA	NA	FAM133B	IMR90	Hi-C	24141950	FAM133B	106836	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	92382003	92382200	92382102	Y	CDK6	NA	NA	NA	NA	NA	CDK6	81708	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr7	92392967	92393205	92393086	Y	PEX1,C7orf64,FAM133B,SAMD9,CDK6,CDK6	NA	FAM133B	IMR90	Hi-C	24141950	CDK6	70703	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	92439060	92439368	92439205	Y	PEX1,C7orf64,FAM133B,SAMD9	CDK6	NA	NA	NA	NA	CDK6	24540	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr7	92459714	92460134	92460069	Y	SAMD9	CDK6	NA	NA	NA	NA	CDK6	3774	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr7	92745192	92745375	92745297	Y	SAMD9	SAMD9L	NA	NA	NA	NA	SAMD9	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	93231275	93231507	93231391	Y	CCDC132	NA	NA	NA	NA	NA	GNG11	317504	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr7	93577576	93577749	93577619	Y	NA	GNG11	GNG11,BET1	IMR90	Hi-C	24141950	GNG11	28565	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	93812688	93813130	93812921	Y	NA	NA	TFPI2,BET1,GNGT1	IMR90	Hi-C	24141950	BET1	180994	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.278728479561577
chr7	93970898	93971123	93971011	Y	NA	NA	COL1A2	IMR90	Hi-C	24141950	COL1A2	50750	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	94280099	94280356	94280228	Y	NA	SGCE,PEG10,RPS3AP25	NA	NA	NA	NA	SGCE	3165	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr7	94284072	94284624	94284343	Y	NA	SGCE,PEG10,RPS3AP25	NA	NA	NA	NA	PEG10	435	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	94286949	94287416	94287082	Y	PPP1R9A,PPP1R9A,CASD1,PEG10,PEG10	SGCE,PEG10,RPS3AP25	NA	NA	NA	NA	PEG10	3312	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr7	94781809	94782176	94781990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-16P	56270	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	95111846	95112133	95111988	Y	ASB4	PON2	NA	NA	NA	NA	PON2	49336	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.163294011145704
chr7	95179507	95179842	95179679	Y	DYNC1I1	PDK4,AC002451.3	NA	NA	NA	NA	PDK4	43961	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	95238124	95238400	95238252	Y	PON1,PON3	PDK4,AC002451.3	NA	NA	NA	NA	AC002451.3	14130	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr7	95765148	95765192	95765170	Y	DYNC1I1,FLJ42280	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	184267	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	95768848	95769030	95768942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	180429	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	95835254	95835261	95835258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	114198	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr7	95861904	95862185	95862172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	87274	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr7	95877265	95877280	95877275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	72179	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr7	97761073	97761517	97761248	Y	BRI3,LMTK2	LMTK2	NA	NA	NA	NA	LMTK2	26876	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	97763037	97763356	97763224	Y	BRI3,LMTK2	LMTK2	NA	NA	NA	NA	LMTK2	28840	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr7	97763424	97763629	97763532	Y	BRI3,LMTK2	LMTK2	NA	NA	NA	NA	LMTK2	29227	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr7	97913424	97913987	97913861	Y	LMTK2,BRI3	TECPR1,BRI3	NA	NA	NA	NA	BRI3	33733	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr7	97915595	97916070	97915699	Y	LMTK2,BRI3	TECPR1,BRI3	NA	NA	NA	NA	BRI3	35904	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr7	97994295	97994325	97994312	Y	BAIAP2L1	RPS3AP26,BAIAP2L1	BRI3	IMR90	Hi-C	24141950	RPS3AP26	19571	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.272886834433207
chr7	98028342	98028618	98028511	Y	BRI3	RPS3AP26	NA	NA	NA	NA	BAIAP2L1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr7	98048213	98048460	98048408	Y	BRI3	RPS3AP26,BAIAP2L1	BAIAP2L1,TRRAP,TMEM130	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BAIAP2L1	19833	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr7	98383358	98383761	98383522	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRRAP	89795	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	98650927	98651298	98651264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMURF1	88425	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	98809347	98809684	98809536	Y	ZNF655,ZNF655,ZKSCAN5,PTCD1,PDAP1,FAM200A,CPSF4,BUD31,ATP5J2,ARPC1A,SMURF1,KPNA7	NA	SMURF1	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF1	69624	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr7	98871923	98872129	98871984	Y	NA	ARPC1A	NA	NA	NA	NA	ARPC1A	49392	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr7	98970307	98970479	98970399	Y	PTCD1,CPSF4	ARPC1A,ARPC1B,BUD31,PDAP1	NA	NA	NA	NA	ARPC1B	435	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	98973055	98973209	98973129	Y	ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B	ARPC1B,BUD31,PDAP1	NA	NA	NA	NA	ARPC1B	3183	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.313132574555112
chr7	98978423	98978863	98978747	Y	SMURF1,ZNF655,ZNF655,ZNF498,ZNF394,ZKSCAN5	ARPC1B,BUD31,PDAP1	NA	NA	NA	NA	ARPC1B	8551	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	99000499	99000617	99000560	Y	NA	ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4	NA	NA	NA	NA	BUD31	3647	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.230641902752041
chr7	99094567	99094648	99094634	Y	NA	PTCD1,ATP5J2-PTCD1,ATP5J2,ZNF789,ZNF394,ZKSCAN5	NA	NA	NA	NA	ZNF394	1299	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	99785086	99785350	99785241	Y	ZKSCAN1,MCM7,GATS	C7orf43,GAL3ST4,GPC2	NA	NA	NA	NA	GPC2	12091	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	99942530	99942666	99942614	Y	OR2AE1,ZCWPW1,MEPCE,PILRA	PILRB,PMS2P1	NA	NA	NA	NA	PMS2P1	4999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr7	99957855	99958254	99957887	Y	NA	PILRB,PMS2P1	NA	NA	NA	NA	PMS2P1	20324	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr7	99961767	99962035	99961969	Y	NA	PILRB,PMS2P1	PILRA	IMR90	Hi-C	24141950	PMS2P1	24236	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr7	99962576	99962959	99962740	Y	MCM7,C7orf43,ZCWPW1,TSC22D4,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,GIGYF1,PILRB,PILRA	PILRB,PMS2P1	PILRA	IMR90	Hi-C	24141950	PMS2P1	25045	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	100042030	100042585	100042239	Y	COPS6,EPHB4	MEPCE,ZCWPW1,RP11-758P17.2,PPP1R35,TSC22D4	NA	NA	NA	NA	PPP1R35	9842	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.139807279150677
chr7	100142246	100142436	100142312	Y	NA	AGFG2,RP11-44M6.3,LRCH4	NA	NA	NA	NA	AGFG2	7412	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	100143295	100143664	100143516	Y	NA	AGFG2,RP11-44M6.3,LRCH4	NA	NA	NA	NA	AGFG2	8461	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr7	100144720	100144853	100144769	Y	NA	AGFG2,RP11-44M6.3,LRCH4	NA	NA	NA	NA	AGFG2	9886	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	100167857	100168189	100168134	Y	NA	AGFG2,RP11-44M6.3,LRCH4,MOSPD3	NA	NA	NA	NA	RP11-44M6.3	2103	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	100433472	100433773	100433685	Y	NA	SLC12A9,EPHB4,RP11-126L15.4,TRIP6,SRRT	AGFG2,MOSPD3,PCOLCE,FBXO24,LOC100129845,POP7,EPO,GIGYF1,EPHB4,ZAN,SRRT,SLC12A9,TRIP6,SERPINE1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHB4	10351	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	100743461	100743946	100743576	Y	GNB2,TRIM56	TRIM56,SERPINE1	SERPINE1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM56	16741	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.322589639172887
chr7	100749807	100749916	100749853	Y	TRIM56	TRIM56,SERPINE1,AP1S1	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	18454	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	100765253	100766084	100765924	Y	TRIM56,SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	2286	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	101245696	101245932	101245814	Y	MOGAT3	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	211027	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr7	101361034	101362207	101361111	Y	CUX1,CUX1	NA	CUX1,EMID2,SH2B2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CUX1	94752	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr7	101372678	101373024	101372861	Y	NA	NA	CUX1,EMID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CUX1	83935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.793174579745333
chr7	101377148	101377442	101377338	Y	NA	NA	CUX1,EMID2,SH2B2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CUX1	79517	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.342233917598804
chr7	101499743	101500539	101499888	Y	SH2B2,CUX1,CUX1,CUX1	CUX1	NA	NA	NA	NA	CUX1	42784	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	101525517	101525682	101525579	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	68558	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr7	101526005	101526525	101526438	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	69046	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.54415744093627
chr7	101569375	101569771	101569405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	112416	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	101585210	101585567	101585389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	128251	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	101590034	101590314	101590170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	133075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	101613260	101613283	101613272	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	156301	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	101672273	101672589	101672281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	215314	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.220454688943899
chr7	101690848	101690892	101690861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	233889	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr7	101705228	101705677	101705492	Y	SH2B2,ORAI2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	248269	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	101707897	101708291	101708217	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	250938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20353975126761
chr7	101775527	101775981	101775908	Y	CUX1,CUX1,SH2B2,ORAI2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	226338	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	101929501	101929660	101929574	Y	CUX1,CUX1,CUX1,POLR2J3,ORAI2,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.303831439486748
chr7	101929978	101930313	101930074	Y	CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72006	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.76499554985391
chr7	102081983	102082063	102082048	Y	NA	ORAI2,ALKBH4,LRWD1,POLR2J	NA	NA	NA	NA	ORAI2	10430	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr7	102104317	102104602	102104460	Y	NA	ORAI2,ALKBH4,LRWD1,POLR2J	NA	NA	NA	NA	LRWD1	941	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr7	102464517	102464880	102464701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM185A	77099	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr7	102773056	102773346	102773244	Y	NA	RPL19P12,NAPEPLD	ARMC10	IMR90	Hi-C	24141950	RPL19P12	7040	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr7	102790674	102790901	102790766	Y	NAPEPLD	RPL19P12,NAPEPLD	NA	NA	NA	NA	NAPEPLD	2667	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	102958965	102959200	102958983	Y	NA	PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4	NA	NA	NA	NA	PMPCB	23096	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr7	102959356	102959407	102959404	Y	PMPCB,DNAJC2	PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4	NA	NA	NA	NA	PSMC2	23294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	104844953	104845066	104844998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	192689	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr7	104884738	104885065	104884890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	152690	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	105123568	105123582	105123575	Y	NA	PUS7,RINT1	NA	NA	NA	NA	PUS7	37132	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	105223133	105223294	105223281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RINT1	52601	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr7	105447842	105448108	105447962	Y	NA	CTA-351J1.1	NA	NA	NA	NA	CTA-351J1.1	9830	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	105459888	105460220	105459903	Y	NA	CTA-351J1.1	NA	NA	NA	NA	CTA-351J1.1	1950	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.437641143959645
chr7	105508245	105508445	105508345	Y	NA	ATXN7L1,CDHR3	NA	NA	NA	NA	ATXN7L1	6605	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	105705488	105705603	105705542	Y	NA	SYPL1	ATXN7L1,SYPL1,CDHR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SYPL1	45419	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.260700429065805
chr7	105857491	105857771	105857742	Y	NA	NA	NAMPT,CCDC71L	IMR90	Hi-C	24141950	NAMPT	67001	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	105859767	105859956	105859881	Y	NA	NA	NAMPT	IMR90	Hi-C	24141950	NAMPT	64816	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	106065261	106066901	106065591	Y	NA	NA	NAMPT,CCDC71L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAMPT	140489	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr7	106089773	106090176	106089868	Y	NAMPT,PIK3CG	NA	NAMPT	IMR90	Hi-C	24141950	NAMPT	165001	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	106209189	106209713	106209400	Y	NAMPT	NA	CCDC71L,NAMPT,ATXN7L1,PIK3CG	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC004917.1	89629	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr7	106358724	106358979	106358846	Y	NAMPT,PIK3CG,HBP1,FLJ36031	NA	CCDC71L,NAMPT	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC71L	59282	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	106413227	106413352	106413289	Y	FLJ36031	NA	CCDC71L,HBP1,NAMPT,CBLL1,PIK3CG,PRKAR2B	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC71L	113785	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	106808132	106808705	106808532	Y	NA	HBP1	NA	NA	NA	NA	HBP1	726	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.216839269454495
chr7	106838325	106838672	106838499	Y	NA	HBP1	NA	NA	NA	NA	HBP1	30919	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr7	107026511	107026865	107026723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	175064	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	107109276	107109645	107109473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	92284	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr7	107190959	107191312	107191306	Y	NA	DUS4L,COG5,BCAP29	NA	NA	NA	NA	DUS4L	10617	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr7	107562078	107562130	107562088	Y	NA	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	32663	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr7	107567511	107567568	107567540	Y	NA	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	38096	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr7	107573965	107574445	107574339	Y	LAMB1	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	44550	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr7	107923246	107923634	107923440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P32	225043	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	108118010	108118358	108118206	Y	NA	RPL7P32	NA	NA	NA	NA	RPL7P32	30319	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	110326552	110326706	110326634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRN3	402356	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr7	110470494	110470759	110470627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRN3	258303	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	110723657	110723799	110723727	Y	LRRN3	LRRN3	NA	NA	NA	NA	LRRN3	5263	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	110732834	110733321	110733005	Y	NA	LRRN3	NA	NA	NA	NA	LRRN3	3772	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr7	110753766	110754103	110753883	Y	LRRN3	LRRN3	NA	NA	NA	NA	LRRN3	24704	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	110778024	110778148	110778086	Y	NA	LRRN3	NA	NA	NA	NA	LRRN3	48962	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	110808410	110808626	110808556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRN3	79348	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr7	110856868	110857086	110856977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRN3	127806	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	110874557	110874601	110874588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRN3	145495	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr7	110956734	110956926	110956906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRN3	227672	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr7	111024464	111024780	111024739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	175793	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	111156714	111156954	111156834	Y	NA	IMMP2L	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	43619	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.225183221252787
chr7	111200844	111201149	111201059	Y	NA	IMMP2L	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	271	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr7	111396932	111397360	111397129	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	196359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	111641194	111641556	111641398	Y	ZNF277,IFRD1,DOCK4	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK4	202910	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.244671570129293
chr7	111971895	111972278	111972086	Y	NA	RN7SKP187	NA	NA	NA	NA	RN7SKP187	45217	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	113233852	113234207	113234027	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00998	477184	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr7	113724652	113724941	113724845	Y	FOXP2	FOXP2	NA	NA	NA	NA	FOXP2	270	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	114056337	114056620	114056363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP2	331955	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	114637628	114638014	114637704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFIC	77419	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	115887290	115887609	115887434	Y	NA	TES,CAV2	NA	NA	NA	NA	CAV2	37825	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	116035470	116035688	116035648	Y	NA	NA	CAV1	IMR90	Hi-C	24141950	CAV2	110036	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	116271021	116271344	116271193	Y	NA	MET	TES,CAV1,MET,CAPZA2	IMR90,H1ESC,GM12878	Hi-C,5C	24141950,22955621	MET	39100	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr7	116314942	116315351	116315128	Y	ST7,TES,CAV2,CAV2,MET	MET	NA	NA	NA	NA	MET	4498	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr7	116328034	116328226	116328184	Y	ST7,CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,MET	MET	NA	NA	NA	NA	MET	17590	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr7	116332814	116332936	116332875	Y	CAPZA2,TES	MET	NA	NA	NA	NA	MET	22370	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	116356493	116356879	116356812	Y	NA	MET	NA	NA	NA	NA	MET	46049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr7	116523983	116524309	116524052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7	66983	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	116793573	116793925	116793605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7-AS1	201185	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	116804623	116804954	116804811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7-AS1	212235	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	118520575	118520914	118520745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA38	698489	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	120589568	120589730	120589649	Y	ING3	ING3	NA	NA	NA	NA	ING3	765	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr7	120659124	120659336	120659215	Y	ING3	NA	NA	NA	NA	NA	ING3	70321	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	120660854	120661051	120660925	Y	ING3	NA	NA	NA	NA	NA	ING3	72051	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr7	120723269	120723399	120723324	Y	C7orf58	NA	NA	NA	NA	NA	ING3	134466	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	121170486	121170616	121170551	Y	NA	NA	FAM3C,WNT16	IMR90	Hi-C	24141950	FAM3C	136068	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	121955592	121955853	121955810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P31	363491	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	123387168	123387479	123387315	Y	NA	WASL	NA	NA	NA	NA	WASL	47	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	123387767	123387941	123387854	Y	NA	WASL	NA	NA	NA	NA	WASL	646	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr7	123903491	123903761	123903674	Y	NA	NA	GPR37,LOC154872	IMR90	Hi-C	24141950	GPR37	499920	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr7	126214480	126214602	126214539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF800	855376	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	126299329	126299605	126299476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF800	770373	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	126341155	126341491	126341268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF800	728487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr7	127807416	127807928	127807646	Y	LRRC4	NA	SND1	IMR90	Hi-C	24141950	RBM28	174034	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr7	127841401	127841535	127841457	Y	FAM71F2	NA	SND1,MIR129-1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RBM28	140427	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	128094514	128094949	128094639	Y	LEP,C7orf68	IMPDH1,HILPDA,RP11-155G14.6,METTL2B	NA	NA	NA	NA	RP11-155G14.6	523	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.4156867228257
chr7	128249599	128249637	128249625	Y	NA	RP11-212P7.1	FLJ45340,CALU,FAM71F1,IRF5	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-212P7.1	40857	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr7	128383172	128383597	128383318	Y	NA	CALU,CCDC136	NA	NA	NA	NA	CALU	5826	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr7	128696279	128696583	128696469	Y	NA	TNPO3	NA	NA	NA	NA	TNPO3	3081	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr7	128915299	128915657	128915368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHCYL2	52435	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	129014301	129014725	129014533	Y	AHCYL2,FAM40B,AHCYL2	RP11-305M3.2	FAM40B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-305M3.2	33486	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr7	129078824	129079119	129078920	Y	NA	RP11-305M3.2,RNU1-72P	NA	NA	NA	NA	RP11-305M3.2	30613	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr7	129246747	129246901	129246817	Y	NA	NRF1	NRF1	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	2654	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	129419876	129420343	129420085	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	170321	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.941779878853713
chr7	129421490	129421976	129421792	Y	FAM40B	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	UBE2H	168813	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	129460659	129460706	129460683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	130083	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	129464915	129465297	129464948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	125492	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.339348647299766
chr7	129465628	129465864	129465722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	124925	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.483884458759331
chr7	129590044	129590333	129590306	Y	NA	UBE2H	NA	NA	NA	NA	UBE2H	456	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	129598516	129598781	129598654	Y	NRF1,UBE2H,UBE2H	UBE2H	UBE2H,NRF1,AHCYL2,SMO,ZC3HC1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	UBE2H	7727	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr7	129609674	129609888	129609791	Y	NA	UBE2H	AHCYL2,ZC3HC1,SMO,UBE2H	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBE2H	18885	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	129650131	129650429	129650342	Y	NRF1	ZC3HC1	NA	NA	NA	NA	ZC3HC1	38862	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	129960010	129960125	129960069	Y	NA	CPA4	NA	NA	NA	NA	CPA4	29036	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	130013597	130013906	130013823	Y	CPA2,CPA1	NA	NA	NA	NA	NA	CEP41	66368	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.272886834433207
chr7	130571851	130572495	130572306	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	23574	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr7	130575591	130576512	130576394	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	19557	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	130581597	130582393	130581985	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	13676	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	130583676	130584341	130584164	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	11728	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	130586004	130586434	130586371	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	9635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr7	130588239	130588699	130588531	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	7370	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr7	130589567	130590049	130589961	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6020	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr7	130602337	130602820	130602733	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	FLJ43663	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6268	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	130606000	130606565	130606293	Y	NA	MIR29A	LOC646329	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR29A	9931	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr7	130614674	130615489	130615212	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	18605	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	130633473	130633870	130633858	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	37404	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr7	130645057	130645459	130645325	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	48988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr7	130658258	130658537	130658456	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR29A	62189	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	130684801	130685194	130685004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR29A	88732	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr7	130692586	130692952	130692786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR29A	96517	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	130695403	130695870	130695708	Y	MKLN1	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	96985	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	130696655	130697004	130696978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	95851	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.123778420214165
chr7	130697034	130697567	130697379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	95288	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr7	130720133	130720826	130720768	Y	MKLN1,MKLN1	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	72029	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr7	130741821	130742227	130742136	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	50628	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	130756735	130757090	130757043	Y	NA	MKLN1,LINC-PINT	NA	NA	NA	NA	MKLN1	35765	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	130795999	130796263	130796171	Y	MKLN1,MKLN1	MKLN1,LINC-PINT	NA	NA	NA	NA	LINC-PINT	3064	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.797399996943559
chr7	130799789	130800044	130799917	Y	NA	MKLN1,LINC-PINT	NA	NA	NA	NA	LINC-PINT	6854	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr7	130875085	130875581	130875276	Y	NA	AC009362.2	NA	NA	NA	NA	AC009362.2	49768	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.145265960649932
chr7	130910382	130910723	130910553	Y	MKLN1	AC009362.2	NA	NA	NA	NA	AC009362.2	14626	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr7	130916172	130916668	130916569	Y	NA	AC009362.2	NA	NA	NA	NA	AC009362.2	8681	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr7	130920397	130920794	130920689	Y	MKLN1,MKLN1	AC009362.2	NA	NA	NA	NA	AC009362.2	4555	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr7	130923142	130923337	130923228	Y	MKLN1,MKLN1	AC009362.2	NA	NA	NA	NA	AC009362.2	2012	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	131239359	131239620	131239490	Y	NA	PODXL	NA	NA	NA	NA	PODXL	1356	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr7	131271012	131271384	131271093	Y	NA	PODXL	NA	NA	NA	NA	PODXL	30036	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.626804042288752
chr7	131289586	131289917	131289766	Y	PODXL	PODXL	PODXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PODXL	48610	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr7	131314351	131314532	131314442	Y	NA	NA	PODXL,MKLN1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PODXL	73375	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.303831439486748
chr7	131919616	131920007	131919874	Y	PLXNA4	NA	NA	NA	NA	NA	PODXL	678640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr7	132607236	132607300	132607268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	157548	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr7	133092941	133093104	133093022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC083875.2	94774	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	134117156	134117311	134117298	Y	NA	AKR1B1	NA	NA	NA	NA	AKR1B1	24725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.77952833234182
chr7	134142605	134142975	134142790	Y	AKR1B1	AKR1B1	NA	NA	NA	NA	AKR1B1	569	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr7	134247089	134247493	134247269	Y	LRGUK	AKR1B10,AKR1B15	NA	NA	NA	NA	AKR1B15	15201	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	134845913	134846266	134846037	Y	WDR91,CNOT4,TMEM140	TMEM140,C7orf49,WDR91	NA	NA	NA	NA	C7orf49	7281	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	134862087	134862457	134862329	Y	NA	TMEM140,C7orf49,WDR91	NA	NA	NA	NA	C7orf49	8540	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr7	135120473	135120740	135120725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNOT4	72135	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	135395183	135395352	135395286	Y	NA	C7orf73	NA	NA	NA	NA	C7orf73	49939	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	135430585	135430983	135430863	Y	FAM180A	NA	NA	NA	NA	NA	C7orf73	85341	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	135665513	135665767	135665568	Y	NA	MTPN	NA	NA	NA	NA	MTPN	5412	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.52340004969087
chr7	135771654	135771794	135771701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPN	111553	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr7	135815346	135815684	135815515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPN	155245	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	137387266	137387617	137387499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	297196	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	137573369	137573542	137573460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	111271	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	137663180	137663556	137663478	Y	CREB3L2	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	21257	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	137685065	137685809	137685664	Y	TRIM24,CREB3L2	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	252	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	137715600	137715833	137715719	Y	NA	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	30787	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	137942214	137942717	137942409	Y	TRIM24	AC008155.2	NA	NA	NA	NA	AC008155.2	38512	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr7	138250447	138250496	138250473	Y	AKR1D1,TRIM24	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM24	107368	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	138650306	138650635	138650366	Y	SVOPL,UBN2,LUC7L2,KIAA1549	KIAA1549	NA	NA	NA	NA	KIAA1549	13429	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	138779904	138780459	138780182	Y	NA	ZC3HAV1,TTC26	NA	NA	NA	NA	ZC3HAV1	12006	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	138791748	138791993	138791908	Y	UBN2,LUC7L2,ZC3HAV1	ZC3HAV1,TTC26	NA	NA	NA	NA	ZC3HAV1	472	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr7	138917056	138917428	138917261	Y	ZC3HAV1,UBN2	UBN2	NA	NA	NA	NA	UBN2	3954	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr7	139227178	139227349	139227257	Y	NA	ERHP1	NA	NA	NA	NA	ERHP1	10192	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	139366770	139367125	139366961	Y	TBXAS1	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	108452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	139410403	139410671	139410537	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	64906	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	139420496	139420947	139420749	Y	TBXAS1,JHDM1D,HIPK2	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	54630	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	139431881	139432226	139432135	Y	TBXAS1,JHDM1D,HIPK2	HIPK2	NA	NA	NA	NA	HIPK2	43351	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	139616229	139616509	139616457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	140652	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	139865327	139865485	139865448	Y	TBXAS1,JHDM1D	NA	NA	NA	NA	NA	PARP12	103806	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr7	140271542	140271796	140271668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRN1	94173	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	140613036	140613224	140613135	Y	NA	BRAF	NA	NA	NA	NA	BRAF	9340	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr7	140885436	140885795	140885618	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-74P	135387	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	141334636	141334647	141334642	Y	TAS2R3	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1147	65306	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr7	141371952	141372250	141372100	Y	CLEC5A	KIAA1147	NA	NA	NA	NA	KIAA1147	27703	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	141380130	141380660	141380538	Y	NA	KIAA1147,RNU1-82P	NA	NA	NA	NA	KIAA1147	19293	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr7	143083267	143084129	143083354	Y	TAS2R40,FAM131B,FAM131B	AC093673.5,ZYX	NA	NA	NA	NA	ZYX	7094	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.244671570129293
chr7	144539832	144539937	144539881	Y	TPK1	TPK1	TPK1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TPK1	8344	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	146573041	146573429	146573238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005229.5	1702064	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr7	148269293	148269443	148269383	Y	NA	AC005229.5	NA	NA	NA	NA	AC005229.5	6050	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	148334506	148334940	148334775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL1	58066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.145265960649932
chr7	148553939	148554320	148554152	Y	CUL1,EZH2,EZH2	EZH2	NA	NA	NA	NA	EZH2	25093	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr7	148637842	148638122	148637883	Y	NA	RNY5	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNY5	1262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	RNY5	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNY5	1693	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.07484199907734
chr7	148680544	148680840	148680694	Y	NA	RNY5,PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	42893	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	148684338	148684706	148684475	Y	NA	RNY5,PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	39027	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr7	148788414	148788490	148788418	Y	CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2540	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.164024160336071
chr7	148788628	148788884	148788863	Y	ZNF783,CUL1,EZH2,ZNF786,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2754	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.252129443187807
chr7	148824928	148825234	148824952	Y	NA	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF398	3420	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	149318954	149319342	149319148	Y	ZNF746,SSPO	ZNF767	NA	NA	NA	NA	ZNF767	501	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	149468740	149469267	149468803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRBA1	58868	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr7	150075425	150075527	150075503	Y	NA	REPIN1,ZNF775	NA	NA	NA	NA	ZNF775	11546	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	150952931	150953287	150953115	Y	SMARCD3	ABCF2,CHPF2,SMARCD3	NA	NA	NA	NA	SMARCD3	19695	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	151157060	151157432	151157203	Y	NA	NA	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	57774	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.178209757262733
chr7	151184518	151184840	151184768	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	30366	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	151193551	151193826	151193799	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	21380	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	151198552	151198933	151198803	Y	AGAP3,PRKAG2,PRKAG2	RHEB	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	16273	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.221184838134266
chr7	151386683	151387049	151386915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHEB	171477	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	151490681	151491129	151490922	Y	RHEB,PRKAG2,PRKAG2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAG2-AS1	80998	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	151493401	151493985	151493754	Y	RHEB,PRKAG2,PRKAG2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAG2-AS1	78142	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.128351022973642
chr7	151493991	151494555	151494124	Y	PRKAG2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAG2-AS1	77572	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr7	152065077	152065428	152065152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	66552	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	152105895	152106094	152106005	Y	NA	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	25886	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr7	152160343	152160554	152160402	Y	ACTR3B	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	28363	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	152160715	152161193	152160959	Y	NA	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	28735	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.623535808360598
chr7	152161348	152162014	152161594	Y	NA	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	29368	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.231755015571524
chr7	152219127	152219295	152219254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	87147	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.497531162507467
chr7	152235560	152235891	152235729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	103580	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr7	152338571	152338711	152338613	Y	NA	XRCC2	NA	NA	NA	NA	XRCC2	32539	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr7	152365221	152365384	152365303	Y	MLL3	XRCC2	NA	NA	NA	NA	XRCC2	5866	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	153876218	153876403	153876311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAXIP1	916391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	154742897	154743129	154742996	Y	NA	PAXIP1	NA	NA	NA	NA	PAXIP1	49665	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr7	154746550	154746681	154746616	Y	NA	PAXIP1	NA	NA	NA	NA	PAXIP1	46113	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	154958521	154958650	154958585	Y	NA	NA	PAXIP1,HTR5A,LOC100128264,CNPY1	IMR90	Hi-C	24141950	INSIG1	128836	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	154999343	155001070	155000829	Y	NA	NA	INSIG1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	INSIG1	86416	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr7	155006028	155006426	155006187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSIG1	81060	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	155137693	155138087	155137815	Y	NA	NA	INSIG1,PAXIP1,LOC100132707,LOC100128264,HTR5A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INSIG1	50207	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr7	155744220	155744341	155744281	Y	NA	NA	LOC285889,SHH,LMBR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC009403.2	308321	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr7	155744375	155744769	155744531	Y	NA	NA	LOC285889,SHH,LMBR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC009403.2	308476	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr7	156800292	156800601	156800569	Y	MNX1,MNX1	MNX1	NA	NA	NA	NA	MNX1	744	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr7	156932490	156932855	156932681	Y	NA	UBE3C	NA	NA	NA	NA	UBE3C	2883	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr7	157054104	157054271	157054188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-814D15.2	71042	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	157070019	157070314	157070105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	55761	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	157082177	157082296	157082243	Y	NA	DNAJB6	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	43779	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.415423454333511
chr7	157082402	157082699	157082633	Y	NA	DNAJB6	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	43376	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr7	157085416	157085724	157085621	Y	DNAJB6,DNAJB6	DNAJB6	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	40351	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr7	157092515	157093215	157092989	Y	DNAJB6,DNAJB6	DNAJB6	UBE3C,DNAJB6	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB6	32860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.478425777260077
chr7	157112606	157112849	157112710	Y	NA	DNAJB6	UBE3C,DNAJB6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAJB6	13226	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr7	157943729	157944143	157943925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	551377	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	158054533	158054880	158054707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	440640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr7	158224670	158224991	158224878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	270529	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr7	158493510	158493807	158493659	Y	NCAPG2	NCAPG2	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	1713	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr7	158527660	158527846	158527783	Y	NA	NCAPG2	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	32140	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr7	158595763	158596162	158596010	Y	ESYT2	ESYT2	NA	NA	NA	NA	ESYT2	24782	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr7	158613624	158614053	158613981	Y	ESYT2	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	6891	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr7	158656529	158657066	158657015	Y	NA	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	WDR60	9260	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.402506899775743
chr7	158808159	158808606	158808258	Y	VIPR2	NA	NA	NA	NA	NA	VIPR2	127043	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.840878192925754
chr7	158905033	158905150	158905046	Y	NA	VIPR2	NA	NA	NA	NA	VIPR2	30499	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	582547	582966	582856	Y	ERICH1	NA	NA	NA	NA	NA	ERICH1	103140	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	637812	637858	637835	Y	NA	ERICH1	NA	NA	NA	NA	ERICH1	48248	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr8	638062	638589	638348	Y	ZNF596,ZNF596,ERICH1	ERICH1	NA	NA	NA	NA	ERICH1	47517	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.789211974694678
chr8	1220424	1220599	1220512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLN8	481345	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	1693574	1694042	1693752	Y	CLN8	CLN8,CTD-2336O2.1	ARHGEF10,CLN8,MIR596,KBTBD11,ZNF596	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLN8	7902	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr8	1836847	1837132	1836956	Y	KBTBD11	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10	66705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr8	1971088	1971527	1971116	Y	NA	MYOM2	NA	NA	NA	NA	MYOM2	19628	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	2418829	2418999	2418939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYOM2	427674	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr8	6323096	6323426	6323195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-115C21.2	60433	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	6400051	6400348	6400277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-115C21.2	137388	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	6405382	6405492	6405403	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-115C21.2	142719	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	6536860	6537447	6537204	Y	NA	CTD-2541M15.1,AGPAT5	LOC100287015,MCPH1,ANGPT2	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2541M15.1	26283	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	6577742	6577949	6577849	Y	NA	CTD-2541M15.1,AGPAT5	NA	NA	NA	NA	AGPAT5	13864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	6722894	6722949	6722922	Y	NA	XKR5,DEFB1	NA	NA	NA	NA	DEFB1	10595	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	8147008	8147233	8147135	Y	NA	ALG1L13P	SGK223,MFHAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ALG1L13P	46819	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	8153597	8154098	8153801	Y	NA	NA	MFHAS1,SGK223,CLDN23,FLJ10661	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ALG1L13P	53408	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.198081069768355
chr8	8247461	8247709	8247494	Y	NA	SGK223	NA	NA	NA	NA	SGK223	5453	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	8742026	8742246	8742225	Y	NA	MFHAS1	NA	NA	NA	NA	MFHAS1	6909	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr8	8830847	8830920	8830884	Y	NA	ERI1	FLJ10661,MFHAS1,SGK223	IMR90	Hi-C	24141950	ERI1	26737	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr8	8878847	8879137	8878870	Y	NA	ERI1	NA	NA	NA	NA	ERI1	21190	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr8	9408701	9409304	9408905	Y	NA	TNKS	NA	NA	NA	NA	TNKS	2120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	9764051	9764441	9764391	Y	MSRA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRA	145337	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	9912937	9913246	9913138	Y	NA	MSRA	NA	NA	NA	NA	MSRA	3159	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr8	9978890	9979101	9978960	Y	MSRA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRA	69112	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	10573649	10573859	10573801	Y	SOX7	RP1L1	NA	NA	NA	NA	RP1L1	5952	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182052210831843
chr8	11032163	11032532	11032339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR9	107393	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr8	11690057	11690160	11690110	Y	NA	SUB1P1,FDFT1,RP11-297N6.4,CTSB	NA	NA	NA	NA	RP11-297N6.4	31980	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	13224231	13224684	13224410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LONRF1	612649	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr8	15395546	15395769	15395644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC3	122822	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr8	15443006	15443379	15443076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC3	170282	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	15503132	15503306	15503219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC3	230408	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr8	15546823	15547116	15546970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC3	274099	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	16185668	16185862	16185777	Y	MSR1	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC2	825676	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	16476986	16477261	16477122	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC2	534277	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	16479323	16479556	16479440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC2	531982	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr8	16569846	16570195	16569986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC2	441343	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.231755015571524
chr8	17355613	17356072	17355737	Y	NA	SLC7A2	NA	NA	NA	NA	SLC7A2	3016	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.180053019272583
chr8	18722659	18722821	18722740	Y	PSD3	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	217419	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	19066932	19067320	19067099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH2D4A	101808	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr8	19236420	19236600	19236592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH2D4A	67292	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	19266409	19266742	19266623	Y	CSGALNACT1	NA	NA	NA	NA	NA	SH2D4A	97281	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr8	19293000	19293226	19293113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH2D4A	123872	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr8	19341372	19341590	19341526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH2D4A	172244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr8	19368663	19368998	19368809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-1105O14.1	165085	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr8	19436473	19436611	19436572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-1105O14.1	97472	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.353534244226429
chr8	19518773	19518959	19518866	Y	NA	RP11-1105O14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-1105O14.1	15124	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200810410517982
chr8	19522969	19523285	19523139	Y	NA	RP11-1105O14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-1105O14.1	10798	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.933364822525127
chr8	19534251	19534633	19534630	Y	NA	RP11-1105O14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-1105O14.1	168	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	19557842	19558052	19557944	Y	NA	RP11-1105O14.1	CSGALNACT1,SH2D4A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1105O14.1	23759	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	19562281	19562595	19562501	Y	ATP6V1B2	RP11-1105O14.1	CSGALNACT1,SH2D4A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1105O14.1	28198	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	19566953	19567512	19567287	Y	NA	RP11-1105O14.1,CSGALNACT1	CSGALNACT1,SH2D4A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1105O14.1	32870	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr8	19591741	19592019	19591880	Y	NA	CSGALNACT1	CSGALNACT1,SH2D4A	IMR90	Hi-C	24141950	CSGALNACT1	21521	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr8	19808496	19808756	19808622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC100802.3	126060	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	20055803	20056436	20056187	Y	ATP6V1B2	ATP6V1B2	NA	NA	NA	NA	ATP6V1B2	2925	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	21804083	21804253	21804128	Y	NA	DOK2,XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	28903	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr8	21867707	21867918	21867811	Y	PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2	NPM2	NA	NA	NA	NA	NPM2	11718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.729286178078991
chr8	21999982	22000221	22000101	Y	POLR3D	NUDT18,HR,REEP4,BMP1	NA	NA	NA	NA	REEP4	2518	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr8	22068132	22068339	22068246	Y	NA	BMP1,PHYHIP,MIR320A,POLR3D	NA	NA	NA	NA	PHYHIP	19515	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr8	22103553	22103662	22103605	Y	NA	PHYHIP,MIR320A,POLR3D	NA	NA	NA	NA	POLR3D	2936	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	22227261	22227593	22227504	Y	SLC39A14,SLC39A14	SLC39A14	NA	NA	NA	NA	SLC39A14	4499	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	22240884	22241560	22241218	Y	C8orf58	SLC39A14	NA	NA	NA	NA	SLC39A14	18122	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr8	22300361	22300587	22300487	Y	BIN3,PPP3CC	PPP3CC,RP11-382J24.2	NA	NA	NA	NA	PPP3CC	4029	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr8	22439546	22439823	22439672	Y	NA	SORBS3,PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	PDLIM2	5754	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.481885267200071
chr8	22468597	22468907	22468752	Y	TNFRSF10C,EGR3,PDLIM2,PDLIM2,BIN3	PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	C8orf58	13483	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr8	22469003	22469432	22469219	Y	NA	PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	C8orf58	13889	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr8	22513437	22513754	22513670	Y	NA	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	BIN3	10907	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	22535910	22536200	22536167	Y	NA	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	BIN3	11249	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	22551843	22553123	22552848	Y	PPP3CC,PDLIM2,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10C,EGR3	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	EGR3	3028	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.277615366742094
chr8	22561043	22561327	22561142	Y	PPP3CC,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10B,EGR3	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	EGR3	12228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr8	22808149	22808394	22808223	Y	NA	RHOBTB2	PEBP4,TNFRSF10B,BIN3,EGR3,RHOBTB2	IMR90	Hi-C	24141950	RHOBTB2	34536	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	22832854	22833100	22833063	Y	CHMP7	RHOBTB2	BIN3,PEBP4,LOC254896,TNFRSF10B,RHOBTB2,C8orf58,KIAA1967	IMR90	Hi-C	24141950	RHOBTB2	9830	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	22838413	22838742	22838578	Y	NA	RHOBTB2	BIN3,TNFRSF10B,RHOBTB2,PEBP4,C8orf58,KIAA1967,LOC286059	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RHOBTB2	4188	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr8	22840134	22840430	22840185	Y	BIN3,TNFRSF10B	RHOBTB2	BIN3,TNFRSF10B,RHOBTB2,PEBP4,C8orf58,KIAA1967,LOC286059	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RHOBTB2	2500	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr8	22854119	22854395	22854224	Y	EGR3,EGR3,RHOBTB2,RHOBTB2	RHOBTB2	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	11189	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr8	22872750	22872814	22872762	Y	NA	RHOBTB2	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	29820	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	23014689	23015093	23014900	Y	NA	TNFRSF10D	NA	NA	NA	NA	TNFRSF10D	4450	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	23016406	23016568	23016458	Y	ENTPD4,ENTPD4,BIN3,TNFRSF10C	TNFRSF10D	NA	NA	NA	NA	TNFRSF10D	2975	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	23034603	23034952	23034670	Y	TNFRSF10B,TNFRSF10D	TNFRSF10D,TNFRSF10A	NA	NA	NA	NA	TNFRSF10D	15060	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	23195606	23195838	23195725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	R3HCC1	69973	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	23202733	23203217	23203148	Y	LOXL2	NA	NA	NA	NA	NA	R3HCC1	77100	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr8	23203813	23204244	23204131	Y	LOXL2	NA	NA	NA	NA	NA	LOXL2	76597	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr8	23210314	23210863	23210698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LOXL2	69978	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	23353842	23353942	23353892	Y	TNFRSF10C,SLC25A37	ENTPD4,SLC25A37	NKX3-1,SLC25A37,NKX2-6	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A37	30376	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	23408969	23409174	23408998	Y	TNFRSF10B,ENTPD4,ENTPD4	SLC25A37,RNU4-71P	NA	NA	NA	NA	SLC25A37	24651	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr8	23411826	23412031	23411908	Y	TNFRSF10B,ENTPD4,ENTPD4	SLC25A37,RNU4-71P	NA	NA	NA	NA	SLC25A37	27508	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	23418368	23418748	23418630	Y	TNFRSF10B,ENTPD4,ENTPD4	SLC25A37,RNU4-71P	NA	NA	NA	NA	SLC25A37	34050	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	24013716	24014104	24013764	Y	STC1	NA	STC1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-148P	81045	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	24857844	24858008	24857898	Y	NA	NEFL	NA	NA	NA	NA	NEFL	45220	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	24858208	24858485	24858356	Y	NA	NEFL	NA	NA	NA	NA	NEFL	45584	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.311289312545263
chr8	25092167	25092564	25092364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK5	51929	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	25284653	25284746	25284700	Y	NA	KCTD9,CDCA2	NA	NA	NA	NA	KCTD9	29246	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	25348135	25348483	25348309	Y	CDCA2	KCTD9,CDCA2	NA	NA	NA	NA	CDCA2	33622	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr8	26008929	26009154	26009015	Y	NA	NA	PPP2R2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP2R2A	137853	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.531588071939752
chr8	26123466	26123833	26123529	Y	NA	PPP2R2A	PPP2R2A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP2R2A	23174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	26232086	26232281	26232177	Y	NA	BNIP3L,SDAD1P1	NA	NA	NA	NA	BNIP3L	6133	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr8	26305968	26306033	26305997	Y	NA	NA	BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DPYSL2	63758	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.38247965772071
chr8	26306627	26307336	26307213	Y	NA	NA	BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DPYSL2	62455	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.06171584549877
chr8	26429509	26429959	26429867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL2	59718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.28184078394032
chr8	26433425	26433611	26433473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL2	63634	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	27192227	27192436	27192262	Y	PTK2B,PTK2B	TRIM35,PTK2B	NA	NA	NA	NA	PTK2B	25228	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.320590447613627
chr8	27198229	27198437	27198331	Y	PTK2B,PTK2B	TRIM35,PTK2B	NA	NA	NA	NA	PTK2B	31230	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr8	27219743	27220043	27219778	Y	PTK2B,PTK2B	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2B	52744	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr8	27387404	27387600	27387502	Y	PTK2B,PTK2B,EPHX2	EPHX2	NA	NA	NA	NA	EPHX2	41108	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	27464961	27465271	27465267	Y	NA	CLU,SCARA3	NA	NA	NA	NA	CLU	5277	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	27474556	27474730	27474657	Y	NA	CLU,SCARA3	SCARA3,TRIM35,CLU,CCDC25,ESCO2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CLU	4008	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	27494025	27494256	27494186	Y	STMN4,CHRNA2,CLU	CLU,SCARA3	NA	NA	NA	NA	SCARA3	4640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	27517363	27517693	27517481	Y	NA	CLU,SCARA3	NA	NA	NA	NA	SCARA3	27978	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr8	27547704	27547787	27547746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARA3	58319	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	27694349	27694720	27694534	Y	NA	PBK	NA	NA	NA	NA	PBK	737	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr8	27730121	27730534	27730322	Y	ELP3,PBK	PBK	NA	NA	NA	NA	PBK	36509	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.09071492846444
chr8	28258528	28258941	28258737	Y	HMBOX1,HMBOX1	ZNF395	ZNF395,FBXO16	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF395	310	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr8	28269273	28269920	28269515	Y	ZNF395	ZNF395	NA	NA	NA	NA	ZNF395	11055	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.558690223424183
chr8	28565617	28566294	28565942	Y	EXTL3	EXTL3-AS1	NA	NA	NA	NA	EXTL3-AS1	8636	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	28884105	28884486	28884217	Y	HMBOX1,HMBOX1	CTD-2647L4.4	NA	NA	NA	NA	CTD-2647L4.4	26966	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	29097584	29097960	29097935	Y	HMBOX1,HMBOX1,KIF13B	KIF13B	NA	NA	NA	NA	KIF13B	20681	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	29230784	29230978	29230896	Y	KIF13B,DUSP4	DUSP4	C8orf75,LOC286135,MIR3148,MIR548O2,TMEM66,LEPROTL1,DUSP4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP4	24599	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	29316675	29316889	29316765	Y	KIF13B,DUSP4	NA	C8orf75	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	110490	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr8	29413574	29413927	29413748	Y	DUSP4	NA	DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR548O2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP4	207389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr8	29499383	29499527	29499389	Y	KIF13B	NA	DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR3148	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	293198	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	29522725	29523096	29522814	Y	KIF13B	NA	LOC286135,DUSP4,C8orf75	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP4	316540	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr8	29526859	29527039	29527017	Y	NA	NA	LOC286135,DUSP4,C8orf75	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	320674	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.164024160336071
chr8	29533274	29533303	29533292	Y	NA	NA	DUSP4	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	327089	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr8	29595040	29595214	29595121	Y	KIF13B,DUSP4,DUSP4,TMEM66,LEPROTL1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM66	343509	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr8	29612596	29612731	29612664	Y	NA	NA	C8orf75	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM66	325992	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr8	29630716	29630847	29630782	Y	NA	NA	C8orf75,LOC286135	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM66	307876	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	29914930	29915195	29915084	Y	NA	TMEM66,LEPROTL1	NA	NA	NA	NA	TMEM66	23528	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	29946002	29946367	29946215	Y	TMEM66,LEPROTL1	TMEM66,LEPROTL1,RPS15AP24	NA	NA	NA	NA	LEPROTL1	4547	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr8	29948448	29949236	29948548	Y	TMEM66,LEPROTL1	TMEM66,LEPROTL1,RPS15AP24	NA	NA	NA	NA	LEPROTL1	1678	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	29957112	29957836	29957408	Y	TMEM66,LEPROTL1	TMEM66,LEPROTL1,RPS15AP24	NA	NA	NA	NA	LEPROTL1	6198	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	30278706	30278862	30278761	Y	NA	RBPMS,RBPMS-AS1	NA	NA	NA	NA	RBPMS-AS1	37789	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	30363851	30364149	30364000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBPMS-AS1	122934	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	30580467	30580796	30580574	Y	GSR	GSR,UBXN8	NA	NA	NA	NA	GSR	2647	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	30892240	30892587	30892393	Y	UBXN8	WRN	NA	NA	NA	NA	WRN	2923	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.234484356321151
chr8	31040746	31040774	31040760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRN	151429	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	31888630	31888701	31888666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRN	999313	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	33245630	33245874	33245728	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT10	83066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	33287156	33287526	33287341	Y	NA	FUT10	NA	NA	NA	NA	FUT10	41414	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	33291442	33291793	33291639	Y	MAK16,FUT10,C8orf41,C8orf41	FUT10,MAK16	NA	NA	NA	NA	FUT10	37147	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr8	35119361	35119644	35119503	Y	UNC5D	NA	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	261637	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.12683796781076
chr8	37002327	37002551	37002443	Y	NA	NA	KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-150O12.1	407150	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr8	37005639	37005772	37005739	Y	NA	NA	KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-150O12.1	403929	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr8	37376212	37376482	37376355	Y	NA	RP11-150O12.1	KCNU1,ERLIN2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-150O12.1	33219	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	37643587	37643772	37643645	Y	NA	PROSC,GPR124	NA	NA	NA	NA	GPR124	3878	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.38447884927997
chr8	37748183	37748461	37748291	Y	WHSC1L1,RAB11FIP1,LETM2,LETM2	BRF2,RAB11FIP1	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP1	6524	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	37754518	37754975	37754800	Y	NA	BRF2,RAB11FIP1	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP1	10	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	37889292	37889604	37889448	Y	NA	EIF4EBP1	NA	NA	NA	NA	EIF4EBP1	3433	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr8	37928414	37928535	37928451	Y	ADRB3,WHSC1L1	EIF4EBP1,ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	32225	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr8	37961561	37961954	37961758	Y	NA	ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	801	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.294374374868973
chr8	38035023	38035257	38035173	Y	WHSC1L1,LETM2,LETM2,BAG4	BAG4,LSM1,DDHD2	NA	NA	NA	NA	LSM1	2775	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr8	38077409	38077725	38077419	Y	NA	BAG4,LSM1,DDHD2,PPAPDC1B	DDHD2	IMR90	Hi-C	24141950	DDHD2	3011	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	38262735	38263237	38262894	Y	TACC1,PLEKHA2,C8orf86	WHSC1L1,LETM2	NA	NA	NA	NA	LETM2	21010	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr8	38312135	38312514	38312441	Y	NA	FGFR1	NA	NA	NA	NA	FGFR1	11838	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr8	38313401	38313535	38313485	Y	NA	FGFR1	NA	NA	NA	NA	FGFR1	10817	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	38330883	38331237	38331060	Y	NA	FGFR1	NA	NA	NA	NA	FGFR1	6531	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	38647998	38648343	38648132	Y	LETM2,LETM2,PLEKHA2,TACC1	NA	NA	NA	NA	NA	TACC1	64294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	38757431	38758061	38757845	Y	C8orf86,TACC1,PLEKHA2	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	678	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	38762883	38763134	38762941	Y	TACC1,PLEKHA2	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	6130	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr8	38770998	38771507	38771224	Y	NA	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	14245	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	38781974	38782296	38782041	Y	NA	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	25221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr8	38790614	38790631	38790622	Y	NA	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	33861	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	38794203	38794537	38794324	Y	TACC1,PLEKHA2	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	37450	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.307290929426742
chr8	38794582	38795442	38794757	Y	TACC1,PLEKHA2	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	37829	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.294374374868973
chr8	38816649	38817007	38816807	Y	NA	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	TM2D2	35336	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr8	38856419	38857534	38856583	Y	NA	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	ADAM9	4031	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.301102098737121
chr8	38895649	38895937	38895811	Y	TACC1,PLEKHA2,HTRA4	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	ADAM9	43261	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	39797063	39797940	39797610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C8orf4	211049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	39800131	39800493	39800357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C8orf4	208496	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr8	39855903	39856119	39855979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C8orf4	152870	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	39912317	39912749	39912459	Y	C8orf4	NA	C8orf4,ZMAT4	IMR90	Hi-C	24141950	C8orf4	96240	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	39957250	39957527	39957387	Y	NA	NA	C8orf4	IMR90	Hi-C	24141950	C8orf4	51462	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	39976615	39976841	39976744	Y	IDO1	C8orf4	C8orf4	IMR90	Hi-C	24141950	C8orf4	32148	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr8	40016557	40016909	40016733	Y	NA	C8orf4	NA	NA	NA	NA	C8orf4	7568	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.306943743865492
chr8	40032102	40032537	40032342	Y	IDO1	C8orf4	NA	NA	NA	NA	C8orf4	23113	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.124891533033648
chr8	40056491	40056661	40056575	Y	C8orf4	C8orf4	GOLGA7,ZMAT4,IDO2	IMR90	Hi-C	24141950	C8orf4	47502	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr8	40207660	40208018	40207838	Y	NA	CTA-392C11.1	ZMAT4	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-392C11.1	8739	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	41462271	41462436	41462354	Y	NA	AGPAT6,RP11-360L9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-360L9.4	28384	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	41570603	41570760	41570682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-360L9.4	136716	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	41649689	41649828	41649744	Y	NKX6-3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-360L9.4	215802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr8	41819161	41819283	41819222	Y	POLB	NA	NA	NA	NA	NA	KAT6A	88225	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	41886687	41887061	41886965	Y	NA	KAT6A	NA	NA	NA	NA	KAT6A	20447	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	41908079	41908836	41908505	Y	POLB,IKBKB,IKBKB,AP3M2,AGPAT6,MYST3	KAT6A	NA	NA	NA	NA	KAT6A	571	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr8	42072486	42072556	42072531	Y	NA	PLAT	AP3M2,IKBKB	IMR90	Hi-C	24141950	PLAT	9244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	42149533	42149606	42149596	Y	NA	RP11-231D20.2,IKBKB,POLB	NA	NA	NA	NA	IKBKB	22713	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr8	42184337	42184357	42184347	Y	NA	POLB	NA	NA	NA	NA	POLB	9615	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	42377318	42377512	42377415	Y	NA	SLC20A2	NA	NA	NA	NA	SLC20A2	17557	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	42398083	42398473	42398470	Y	NA	SLC20A2	NA	NA	NA	NA	SLC20A2	3014	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	42748560	42748749	42748647	Y	THAP1,HOOK3	MIR4469,HOOK3,RNF170	NA	NA	NA	NA	MIR4469	669	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	43092918	43093442	43093017	Y	HOOK3	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	99362	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.456399343645784
chr8	43093596	43094096	43093640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	100040	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.234484356321151
chr8	48242793	48242802	48242797	Y	NA	NA	PRKDC	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFA5P12	168300	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	48265617	48265884	48265750	Y	CEBPD	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5P12	191124	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr8	48265920	48266584	48265994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5P12	191427	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.415267524784101
chr8	48282787	48283030	48282901	Y	KIAA0146,CEBPD	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5P12	208294	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	48311654	48311845	48311740	Y	CEBPD	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-697N18.2	191326	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	48424795	48425379	48425168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-697N18.2	77792	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.457512456465267
chr8	48746170	48746340	48746217	Y	MCM4	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPD	96522	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr8	48814148	48814416	48814291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKDC	56327	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr8	49426742	49426952	49426814	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	131592	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr8	49426952	49427328	49427172	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	131802	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.6564796049734
chr8	49427546	49427722	49427633	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	132396	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.221184838134266
chr8	49541228	49541500	49541360	Y	SNAI2	NA	SNAI2,EFCAB1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	246078	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	49701443	49701572	49701502	Y	NA	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	SNAI2	130727	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr8	49835974	49836286	49836197	Y	SNAI2	SNAI2	NA	NA	NA	NA	SNAI2	3675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182052210831843
chr8	50653553	50653944	50653741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTG1	166405	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	50968903	50969278	50969091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTG1	148554	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	50969485	50969741	50969613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTG1	149136	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	52747281	52747589	52747434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCMTD1	62146	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	52809491	52809887	52809877	Y	PCMTD1	NA	NA	NA	NA	NA	PCMTD1,RP11-110G21.1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr8	53013780	53014013	53013897	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-110G21.1	203895	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.163294011145704
chr8	53188453	53188874	53188470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-110G21.1	378568	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr8	53379796	53380092	53379874	Y	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	276311	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.379020167780716
chr8	53625473	53626379	53625848	Y	RB1CC1	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	30024	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	54256811	54256964	54256882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP6V1H	497154	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr8	54659884	54660111	54659998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP6V1H	94007	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	54798731	54798762	54798749	Y	NA	ATP6V1H,RGS20	NA	NA	NA	NA	RGS20	36363	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	54884595	54884649	54884642	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	48440	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	54884977	54885679	54885327	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	47410	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chr8	54932125	54932445	54932251	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	644	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	55389317	55389516	55389419	Y	SOX17	SOX17	NA	NA	NA	NA	SOX17	20822	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	56796346	56796794	56796413	Y	LYN	LYN	NA	NA	NA	NA	LYN	5974	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr8	56887750	56888682	56888353	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD54	95778	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr8	56916302	56916441	56916350	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD54	68019	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr8	56919174	56919348	56919316	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD54	65112	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	57122742	57122884	57122813	Y	NA	PLAG1,CHCHD7	NA	NA	NA	NA	CHCHD7	497	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr8	57788912	57789128	57789020	Y	NA	NA	CHCHD7,PLAG1	IMR90	Hi-C	24141950	IMPAD1	115275	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	57857435	57857807	57857506	Y	NA	IMPAD1	NA	NA	NA	NA	IMPAD1	46596	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	59499727	59499886	59499762	Y	UBXN2B,NSMAF,NSMAF,SDCBP	SDCBP	NA	NA	NA	NA	SDCBP	36244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	59529081	59529390	59529262	Y	SDCBP	NSMAF	NA	NA	NA	NA	NSMAF	41013	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	59714074	59714335	59714193	Y	TOX	RNU4-50P	NA	NA	NA	NA	RNU4-50P	10776	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	59763369	59763610	59763548	Y	NA	RNU4-50P	NA	NA	NA	NA	RNU4-50P	38258	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr8	59959496	59959676	59959637	Y	TOX	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-25K19.1	69923	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr8	59974801	59974880	59974841	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-25K19.1	54719	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	61511489	61511770	61511631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-91I20.2	52350	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr8	61564243	61564650	61564285	Y	CA8,CHD7	RP11-91I20.2,CHD7	CHD7,RAB2A	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-91I20.2	123	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr8	61592861	61593584	61592948	Y	NA	RP11-91I20.2,CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	3524	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr8	61626654	61626933	61626781	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	37317	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr8	61627150	61627529	61627187	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	37813	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.94845438959509
chr8	61657043	61657068	61657053	Y	CHD7	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	67706	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr8	61660299	61660611	61660357	Y	CHD7	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	70962	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr8	61664874	61665035	61664955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	75537	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	61824212	61824789	61824465	Y	CHD7	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	234875	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	61850490	61850754	61850677	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	261153	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.543774477307153
chr8	61850776	61851191	61851141	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	261439	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.288915693369719
chr8	62445230	62445580	62445420	Y	CLVS1,ASPH	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	179575	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr8	62534300	62534453	62534449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	90702	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr8	62600598	62600698	62600684	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	24457	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr8	62606389	62606706	62606619	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	18449	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.239212888630038
chr8	62620817	62621622	62621526	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	3533	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr8	62624516	62625412	62625017	Y	ASPH	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH,MIR4470	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr8	62630891	62631364	62631206	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	MIR4470	5544	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr8	62631895	62632623	62632238	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	MIR4470	6548	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr8	62634023	62634407	62634126	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	MIR4470	8676	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.729286178078991
chr8	62634431	62634735	62634612	Y	ASPH	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	MIR4470	9084	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr8	62646245	62646286	62646251	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	MIR4470	20898	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	62647103	62647241	62647155	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	MIR4470	21756	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	62679636	62680132	62679874	Y	NA	NA	ASPH,MIR4470	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MIR4470	54289	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.242672378570032
chr8	62937802	62937913	62937858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4470	312455	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	63051600	63051694	63051612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4470	426253	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr8	63074544	63074897	63074721	Y	NKAIN3	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4470	449197	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr8	63776641	63776831	63776733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGH	172899	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.180053019272583
chr8	63934936	63935021	63934979	Y	NA	GGH	NA	NA	NA	NA	GGH	14709	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr8	63945359	63945546	63945425	Y	YTHDF3	GGH	NA	NA	NA	NA	GGH	4184	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	64082499	64082747	64082682	Y	YTHDF3	YTHDF3	NA	NA	NA	NA	YTHDF3	3387	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr8	64133013	64133210	64133061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTHDF3	53901	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	66615323	66615688	66615531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	60354	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr8	66641187	66641625	66641410	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	86218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr8	66742209	66742357	66742281	Y	NA	PDE7A	NA	NA	NA	NA	PDE7A	10200	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	66886157	66886548	66886214	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	PDE7A	133600	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	66934530	66934705	66934628	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	AC084082.3	88197	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr8	67434763	67435122	67434951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	89360	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr8	67694398	67694637	67694506	Y	VCPIP1,SGK3,SGK3	PTTG3P	NA	NA	NA	NA	PTTG3P	16158	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	68097028	68097398	68097213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	103010	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	69672075	69672426	69672227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-865I6.2	90572	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr8	70042378	70042779	70042585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-865I6.2	279380	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	70310732	70311124	70310931	Y	NA	NA	C8orf34	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-865I6.2	547734	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	70397333	70397695	70397418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-101P	590572	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	70982774	70982831	70982803	Y	PRDM14	RNU1-101P,RP11-152C15.1	NA	NA	NA	NA	RNU1-101P	5436	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	71129648	71130032	71129927	Y	NCOA2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152C15.1	115234	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	71303418	71303670	71303544	Y	NA	NCOA2,RP11-333A23.1	NA	NA	NA	NA	NCOA2	10370	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr8	71569342	71569635	71569535	Y	NA	LACTB2,XKR9	NA	NA	NA	NA	LACTB2	9774	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr8	72741414	72742172	72741688	Y	NA	MSC	NA	NA	NA	NA	MSC	12531	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr8	72743502	72744020	72743667	Y	NA	MSC	NA	NA	NA	NA	MSC	10683	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr8	73008234	73008433	73008334	Y	NA	NA	TRPA1,LOC100132891	IMR90	Hi-C	24141950	MSC	253531	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	73230861	73231003	73230932	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSC	476158	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	73559096	73559368	73559359	Y	KCNB2	NA	NA	NA	NA	NA	TERF1	359731	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	75221301	75221616	75221459	Y	NA	GDAP1,JPH1	NA	NA	NA	NA	GDAP1	9749	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	75515244	75515546	75515314	Y	NA	RP11-730G20.2	NA	NA	NA	NA	RP11-730G20.2	765	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	75576382	75576715	75576543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-730G20.2	61903	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	76316572	76316672	76316622	Y	HNF4G	HNF4G	NA	NA	NA	NA	HNF4G	1477	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	77515612	77515766	77515691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEX2	395514	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr8	79578942	79579038	79579012	Y	IL7,FAM164A	NA	NA	NA	NA	NA	IL7	136720	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	79674578	79674862	79674701	Y	NA	IL7	NA	NA	NA	NA	IL7	40896	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.334620114990879
chr8	80216218	80216356	80216290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STMN2	304693	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.189510083890358
chr8	80680806	80681178	80681064	Y	HEY1	HEY1	NA	NA	NA	NA	HEY1	2708	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr8	80696342	80696550	80696513	Y	HEY1	HEY1	MRPS28,HEY1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEY1	18244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.432565426089506
chr8	80697445	80697758	80697650	Y	NA	HEY1	HEY1,MRPS28	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEY1	19347	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	80701258	80701483	80701350	Y	HEY1	HEY1	HEY1,MRPS28	IMR90	Hi-C	24141950	HEY1	23160	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr8	80705910	80706255	80706054	Y	HEY1	HEY1	HEY1,MRPS28	IMR90	Hi-C	24141950	HEY1	27812	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.65856824407192
chr8	80996547	80996769	80996670	Y	TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	56023	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr8	81034251	81034528	81034390	Y	ZBTB10,TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	93727	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	81041762	81041917	81041834	Y	TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	TPD52	99550	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr8	81050951	81051119	81051010	Y	TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	TPD52	90348	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr8	81749885	81750162	81750025	Y	ZNF704	NA	NA	NA	NA	NA	PAG1	272141	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	82167350	82167604	82167486	Y	NA	FABP5,RP11-363E6.3	ZNF704,PAG1,FABP12	IMR90	Hi-C	24141950	FABP5	22994	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr8	82673208	82673424	82673316	Y	NA	CHMP4C,ZFAND1	NA	NA	NA	NA	ZFAND1	30070	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr8	82738373	82738533	82738453	Y	NA	SNX16	NA	NA	NA	NA	SNX16	14568	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	86090980	86091058	86091024	Y	E2F5,E2F5	E2F5,C8orf59,CA13	NA	NA	NA	NA	E2F5	3520	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	87014840	87015227	87015062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWP1	337740	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	87444767	87445117	87444942	Y	WWP1	CPNE3	NA	NA	NA	NA	CPNE3	49942	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	87484005	87484360	87484214	Y	NA	CPNE3,SLC2A3P4	NA	NA	NA	NA	CPNE3	10699	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr8	90556024	90556173	90556098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-37B2.1	211782	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	90741352	90741628	90741481	Y	OSGIN2,RIPK2	RP11-37B2.1,RIPK2	DECR1,RIPK2,NBN	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-37B2.1	26327	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	90899646	90899998	90899819	Y	RIPK2,OSGIN2	OSGIN2	OSGIN2,RIPK2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	OSGIN2	12089	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr8	90901747	90901955	90901807	Y	RIPK2,OSGIN2	OSGIN2	OSGIN2,RIPK2	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	OSGIN2	10132	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr8	90912887	90913271	90913166	Y	NA	OSGIN2	NA	NA	NA	NA	OSGIN2	800	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	91479231	91479432	91479327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM64	322428	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr8	91479808	91480381	91480048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM64	321479	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr8	92128196	92128480	92128215	Y	NA	GS1-251I9.4,OTUD6B	NA	NA	NA	NA	OTUD6B	47772	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	94950843	94950973	94950908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDP1	82808	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr8	95246535	95247070	95246768	Y	GEM	KB-1247B1.1	CDH17	IMR90	Hi-C	24141950	KB-1247B1.1	33255	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	95429933	95430227	95430143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD54B	55110	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	95896385	95896691	95896542	Y	NA	CCNE2	NA	NA	NA	NA	CCNE2	10215	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr8	95943173	95943450	95943312	Y	NA	CCNE2,TP53INP1,RP11-347C18.3	NA	NA	NA	NA	TP53INP1	16189	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	97319675	97319761	97319753	Y	NA	MTERFD1,PTDSS1	NA	NA	NA	NA	PTDSS1	47732	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	98795675	98796209	98795739	Y	NA	LAPTM4B	NA	NA	NA	NA	LAPTM4B	10390	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	98841899	98841938	98841919	Y	POP1	RPS23P1,MATN2	NA	NA	NA	NA	RPS23P1	33344	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	98843865	98843962	98843914	Y	NA	RPS23P1,MATN2	NA	NA	NA	NA	RPS23P1	31320	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	98865970	98866240	98866105	Y	NA	RPS23P1,MATN2	NA	NA	NA	NA	RPS23P1	9042	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	99637150	99637421	99637401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK3	315634	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	99643221	99643590	99643555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK3	309465	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	99953302	99954000	99953407	Y	STK3,OSR2	STK3,OSR2	NA	NA	NA	NA	STK3	247	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr8	101338082	101338542	101338349	Y	SPAG1,SPAG1,RNF19A	RNF19A,KB-1991G8.1	SPAG1,ANKRD46,RNF19A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19A	7904	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr8	101385316	101385524	101385421	Y	NA	RNF19A,KB-1991G8.1	MIR4471	IMR90	Hi-C	24141950	KB-1991G8.1	37493	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	101427912	101428321	101428112	Y	SPAG1,SPAG1,RNF19A,RNF19A	NA	SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KB-1615E4.2	57582	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.948507602721861
chr8	101428409	101428827	101428524	Y	RNF19A,RNF19A	NA	SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KB-1615E4.2	57076	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr8	101457496	101457930	101457593	Y	NA	KB-1615E4.2	SPAG1	IMR90	Hi-C	24141950	KB-1615E4.2	27973	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	101471062	101471309	101471191	Y	NA	KB-1615E4.2	SPAG1,RNF19A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KB-1615E4.2	14594	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	101679774	101679926	101679916	Y	NA	NA	FLJ42969,SNX31,PABPC1	IMR90	Hi-C	24141950	PABPC1	53111	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	101731045	101731633	101731441	Y	NA	PABPC1	NA	NA	NA	NA	PABPC1	1404	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	101773934	101774280	101774106	Y	NA	PABPC1	SNX31,PABPC1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PABPC1	40897	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr8	101774635	101775034	101774843	Y	RNF19A,YWHAZ	PABPC1	PABPC1,SNX31	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PABPC1	41598	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr8	101801288	101801504	101801352	Y	NA	NA	PABPC1,SNX31	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PABPC1	68251	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	101912406	101912993	101912785	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	RPS26P6	NA	NA	NA	NA	RPS26P6	6432	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr8	101920209	101920392	101920320	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	RPS26P6,YWHAZ	NA	NA	NA	NA	RPS26P6	14235	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	101920723	101921107	101920870	Y	NA	RPS26P6,YWHAZ	NA	NA	NA	NA	RPS26P6	14749	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.327318171481775
chr8	102038562	102039020	102038731	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	NA	ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	74946	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.4968010133171
chr8	102039589	102039925	102039833	Y	GRHL2	NA	ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	75973	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.947897605013039
chr8	102075998	102076526	102076187	Y	GRHL2	NA	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	112382	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.784986557496451
chr8	102092753	102093116	102092848	Y	GRHL2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF706	123305	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr8	102161878	102162231	102162054	Y	NA	NA	FLJ42969,YWHAZ,ZNF706	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	54190	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	102167003	102167377	102167334	Y	NA	ZNF706	FLJ42969,YWHAZ,ZNF706	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	49044	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	102171133	102171473	102171263	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	ZNF706	ZNF706,YWHAZ,FLJ42969	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	44948	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr8	102191448	102191797	102191796	Y	NA	ZNF706	NA	NA	NA	NA	ZNF706	24624	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	102373140	102373427	102373201	Y	NA	NACAP1	GRHL2,NACAP1,NCALD	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NACAP1	1118	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.125621682224015
chr8	102388506	102388737	102388522	Y	NA	NACAP1	NA	NA	NA	NA	NACAP1	16484	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	102516990	102517159	102517011	Y	GRHL2	NA	NA	NA	NA	NA	NACAP1	144968	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr8	103411260	103411483	103411351	Y	UBR5	UBR5	NA	NA	NA	NA	UBR5	11586	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	103543077	103543292	103543136	Y	NCALD,UBR5	NA	UBR5,ODF1	IMR90	Hi-C	24141950	UBR5	120008	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	103549220	103549421	103549330	Y	NA	NA	UBR5,ODF1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF10	116709	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.643180086786515
chr8	103549503	103549899	103549700	Y	NA	NA	UBR5,ODF1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF10	116231	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr8	103613012	103613469	103613324	Y	KLF10,KLF10	NA	UBR5,KLF10,ODF1,AZIN1,RRM2B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF10	52661	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201540559708349
chr8	103669513	103669869	103669680	Y	AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10	KLF10	NA	NA	NA	NA	KLF10	3383	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.661591100911403
chr8	103669922	103670289	103670129	Y	ATP6V1C1,KLF10,KLF10	KLF10	NA	NA	NA	NA	KLF10	3792	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	103740665	103741062	103740742	Y	NA	NA	KLF10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF10	74535	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr8	103741796	103742226	103742065	Y	NA	NA	KLF10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KB-1732A1.1	73519	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	103743323	103743460	103743418	Y	NA	NA	KLF10	IMR90	Hi-C	24141950	KB-1732A1.1	72285	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.31986029842326
chr8	103795045	103795342	103795198	Y	NA	KB-1732A1.1	UBR5,KLF10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KB-1732A1.1	20403	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.149994492958819
chr8	103801151	103801773	103801337	Y	NA	KB-1732A1.1	KLF10,UBR5,ODF1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1732A1.1	13972	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.3386184981094
chr8	103803215	103803631	103803453	Y	AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10	KB-1732A1.1	KLF10,UBR5,ODF1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1732A1.1	12114	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.515942176632355
chr8	103806867	103807011	103806958	Y	NA	KB-1732A1.1	KLF10,UBR5,ODF1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1732A1.1	8734	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.412694113583884
chr8	103822630	103823284	103823186	Y	NA	KB-1732A1.1	NA	NA	NA	NA	KB-1732A1.1	6885	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.173481224953846
chr8	103825525	103825897	103825586	Y	NA	KB-1732A1.1,KB-1507C5.2	NA	NA	NA	NA	KB-1732A1.1	9780	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	103910563	103910945	103910847	Y	NA	KB-1507C5.2,AZIN1	ATP6V1C1,AZIN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AZIN1	6471	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	104043647	104043928	104043793	Y	KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1	ATP6V1C1,KB-1639H6.2	NA	NA	NA	NA	KB-1639H6.2	11991	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	104059632	104059708	104059689	Y	NA	ATP6V1C1,KB-1639H6.2	NA	NA	NA	NA	KB-1639H6.2	27976	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr8	104331705	104332089	104331783	Y	RIMS2	FZD6,RP11-318M2.2	NA	NA	NA	NA	RP11-318M2.2	22705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chr8	104406173	104406574	104406390	Y	NA	DCAF13,SLC25A32	NA	NA	NA	NA	DCAF13	18368	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	105523001	105523289	105523222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP12	75963	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	105598029	105598284	105598149	Y	TM7SF4,LRP12	LRP12	NA	NA	NA	NA	LRP12	968	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	109222483	109222836	109222544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	222726	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	109230729	109230920	109230833	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	214642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	110248064	110248088	110248074	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENY2	96465	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr8	110589431	110589605	110589518	Y	NA	EBAG9	NA	NA	NA	NA	EBAG9	39491	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	114058689	114058941	114058782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	327957	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	5.20110529564171
chr8	115322659	115322858	115322759	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	935761	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	115707569	115707650	115707588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	1112249	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	116660380	116660747	116660648	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	159152	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	117476077	117476257	117476175	Y	C8orf85	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	300485	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	117484091	117484236	117484201	Y	C8orf85	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	292506	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	117664096	117664364	117664167	Y	RAD21	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	112378	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	117883999	117884137	117884073	Y	UTP23,RAD21	MIR3610,RAD21	NA	NA	NA	NA	MIR3610	902	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr8	117889939	117890223	117890034	Y	RAD21	MIR3610,RAD21	NA	NA	NA	NA	RAD21	4834	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr8	117891197	117891487	117891378	Y	UTP23,RAD21	MIR3610,RAD21	NA	NA	NA	NA	RAD21	6092	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr8	117892449	117892609	117892487	Y	NA	MIR3610,RAD21	NA	NA	NA	NA	RAD21	7344	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	119013126	119013396	119013387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	108696	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	119317381	119317491	119317437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	195289	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr8	119443463	119443781	119443622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	188453	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	119536200	119536581	119536442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	95653	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr8	119808728	119809168	119808881	Y	TNFRSF11B	RPS26P35	TNFRSF11B	IMR90	Hi-C	24141950	RPS26P35	36288	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr8	119856012	119856178	119856095	Y	NA	NA	TNFRSF11B	IMR90	Hi-C	24141950	RPS26P35	83572	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	119862438	119862804	119862573	Y	NA	NA	TNFRSF11B	IMR90	Hi-C	24141950	RPS26P35	89998	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.5175584045625
chr8	119917519	119917835	119917587	Y	NA	TNFRSF11B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF11B	44604	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr8	120063756	120064086	120063927	Y	NA	NA	SAMD12,SAMD12-AS1,TNFRSF11B	IMR90	Hi-C	24141950	COLEC10	58065	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.343347030418287
chr8	120066342	120066835	120066563	Y	NA	NA	SAMD12,SAMD12-AS1,TNFRSF11B	IMR90	Hi-C	24141950	COLEC10	60651	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.202809602077243
chr8	120995010	120995163	120995088	Y	DEPTOR	NA	NA	NA	NA	NA	DEPTOR	111053	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	121092888	121093091	121092967	Y	DEPTOR	NA	DEPTOR,DSCC1,COL14A1,TAF2,MRPL13	IMR90	Hi-C	24141950	DEPTOR	208931	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	121442839	121443137	121442988	Y	NA	MTBP,MRPL13	NA	NA	NA	NA	MTBP	12503	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr8	121456351	121456697	121456524	Y	SNTB1,MTBP,MRPL13	MTBP,MRPL13	NA	NA	NA	NA	MRPL13	709	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr8	121839869	121840146	121840008	Y	NA	SNTB1	SNTB1	IMR90	Hi-C	24141950	SNTB1	16356	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	122176324	122176668	122176537	Y	NA	NA	HAS2	IMR90	Hi-C	24141950	SNTB1	352811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr8	123811167	123811696	123811506	Y	C8orf76,ZHX2	ZHX2	NA	NA	NA	NA	ZHX2	19534	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	123882951	123883328	123883140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX2	91318	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	124169504	124169661	124169520	Y	NA	FAM83A	NA	NA	NA	NA	FAM83A	19539	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.436910994769278
chr8	124179869	124179997	124179932	Y	NA	FAM83A	NA	NA	NA	NA	FAM83A	9203	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.41691953078211
chr8	124207430	124207528	124207479	Y	NA	FAM83A,C8orf76	NA	NA	NA	NA	FAM83A	18230	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr8	124248679	124249062	124248866	Y	NA	C8orf76,ZHX1	NA	NA	NA	NA	C8orf76	2576	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr8	124301303	124301534	124301414	Y	NA	C8orf76,ZHX1	ATAD2,ZHX1-C8ORF76	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZHX1	15522	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr8	124337288	124337362	124337325	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX1	51507	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	124363606	124363931	124363783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD2	62659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr8	124407044	124407322	124407183	Y	NA	ATAD2,WDYHV1	NA	NA	NA	NA	ATAD2	19268	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	124407455	124407786	124407574	Y	FAM91A1,C8orf76,ZHX1,ATAD2	ATAD2,WDYHV1	NA	NA	NA	NA	ATAD2	18804	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr8	124478396	124478824	124478461	Y	NA	NA	FBXO32,ANXA13,FAM91A1	IMR90	Hi-C	24141950	WDYHV1	51431	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	124934433	124934622	124934528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM91A1	155737	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	125193673	125194016	125193878	Y	NA	ARF1P3	TMEM65,FER1L6,FER1L6-AS1,FAM91A1,TRMT12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARF1P3	31509	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	125249599	125249607	125249603	Y	NA	RP11-383J24.1	TMEM65,FER1L6	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-383J24.1	32317	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	125273752	125273910	125273831	Y	NA	RP11-383J24.1	FER1L6,FER1L6-AS1,TMEM65,FAM91A1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-383J24.1	8014	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	125302460	125302812	125302637	Y	TMEM65,RNF139	RP11-383J24.1	NA	NA	NA	NA	RP11-383J24.1	20536	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr8	125341304	125341312	125341308	Y	NA	TMEM65	NA	NA	NA	NA	TMEM65	41621	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	125367728	125368050	125367886	Y	TRMT12,TATDN1,NDUFB9	TMEM65	NA	NA	NA	NA	TMEM65	14883	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.124891533033648
chr8	125382714	125382961	125382953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM65	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	125638890	125639286	125639200	Y	NSMCE2	NA	NA	NA	NA	NA	TATDN1	89191	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.692882891526195
chr8	125641743	125642346	125642067	Y	ZNF572,NSMCE2,KIAA0196,RNF139,MTSS1	NA	NA	NA	NA	NA	TATDN1	92044	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr8	125642565	125642695	125642641	Y	NSMCE2,KIAA0196,RNF139,MTSS1	NA	NA	NA	NA	NA	TATDN1	92866	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	126195292	126195668	126195512	Y	TRIB1,KIAA0196,NSMCE2	NA	TRIB1	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0196	93210	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	126232781	126233016	126232896	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	130699	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	126238973	126239274	126239019	Y	NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	136891	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr8	126245115	126245425	126245196	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	143033	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	126283499	126283849	126283769	Y	NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	156714	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	126285545	126285900	126285649	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	154663	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr8	126286229	126286368	126286299	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	154195	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr8	126290719	126290948	126290836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	149615	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.299833056368228
chr8	126346161	126346547	126346354	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	94016	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	126398156	126398380	126398244	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	42183	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	126399072	126399443	126399281	Y	NA	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	41120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr8	126441416	126441734	126441625	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	853	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chr8	126525260	126525748	126525427	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIB1	84697	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	126541064	126541373	126541286	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NSMCE2,TRIB1,KIAA0196	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIB1	100501	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	127445901	127446376	127445998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	122262	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	127447013	127447387	127447083	Y	FAM84B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	121251	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	128099457	128099542	128099514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	129791	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr8	128134721	128135121	128135085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	94212	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr8	128167127	128167527	128167484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	61806	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.60493353822387
chr8	128171088	128171312	128171255	Y	NA	NA	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	58021	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.650482030295618
chr8	128176067	128176333	128176204	Y	NA	NA	PCAT1,POU5F1B,LOC727677,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCAT1	53000	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208998432766864
chr8	128179610	128179821	128179807	Y	NA	CCAT1	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	49512	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.45945843489776
chr8	128180134	128180587	128180334	Y	NA	CCAT1	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	48746	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.56901638806745
chr8	128182261	128182424	128182343	Y	NA	CCAT1	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	46909	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr8	128182729	128182789	128182759	Y	NA	CCAT1	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	46544	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208998432766864
chr8	128185119	128185731	128185383	Y	NA	CCAT1	NA	NA	NA	NA	CCAT1	43602	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.554691840305662
chr8	128193341	128193750	128193748	Y	NA	CCAT1	MYC	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCAT1	35583	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182052210831843
chr8	128196669	128197128	128196955	Y	NA	CCAT1	NA	NA	NA	NA	CCAT1	32205	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.657209754163766
chr8	128203137	128203490	128203390	Y	NA	CCAT1	NA	NA	NA	NA	CCAT1	25843	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.192239424639985
chr8	128208934	128209645	128209301	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	19688	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.457668386014678
chr8	128218099	128218752	128218687	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	10581	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	17.7665759311639
chr8	128219153	128219489	128219426	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCAT1	9844	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.22118529447889
chr8	128222835	128223182	128223058	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCAT1	6151	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.474427394141556
chr8	128227053	128227754	128227491	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCAT1	1579	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.28470907552508
chr8	128227982	128228299	128228180	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCAT1	1034	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.30560405331093
chr8	128231853	128232218	128232163	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	2520	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	8.16225427984044
chr8	128237300	128237732	128237515	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC,PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	7967	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.3407915106216
chr8	128239593	128240207	128240123	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC,PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	10260	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208268283576497
chr8	128260594	128261000	128260832	Y	NA	CCAT1	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	31261	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	128264964	128265070	128265034	Y	NA	CCAT1	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	35631	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	128277603	128277799	128277701	Y	MYC	CCAT1	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	48270	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	128305149	128305567	128305521	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	75816	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	128306934	128307283	128307196	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	77601	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr8	128309901	128310145	128310009	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	80568	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr8	128311072	128311242	128311156	Y	MYC	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	81739	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr8	128352367	128352670	128352528	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	123034	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.354647357045912
chr8	128403573	128403875	128403698	Y	MYC	NA	NA	NA	NA	NA	CASC8	88509	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr8	128412842	128413241	128413043	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CASC8	79143	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	128519696	128520090	128519909	Y	NA	CASC8	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CASC8	27312	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.611505332542607
chr8	128678694	128678799	128678726	Y	MYC	NA	MYC,PVT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	66881	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	128680448	128680536	128680487	Y	MYC	NA	MYC,PVT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	65144	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr8	128680816	128681380	128681307	Y	MYC	NA	MYC,PVT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	64300	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.354647357045912
chr8	128684085	128684435	128684260	Y	NA	NA	MYC,PVT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	61245	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	128768623	128768723	128768690	Y	NA	MYC,PVT1	NA	NA	NA	NA	MYC	22943	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr8	128772812	128773062	128772941	Y	NA	MYC,PVT1	NA	NA	NA	NA	MYC	27132	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.139807279150677
chr8	128811691	128811973	128811933	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	6912	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr8	128821272	128821652	128821500	Y	MYC	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	16493	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	128822019	128822203	128822035	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	17240	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.302945360746971
chr8	128822251	128823013	128822500	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	17472	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr8	128825013	128825274	128825028	Y	MYC	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	20234	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr8	128865187	128865467	128865327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	60408	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	128871975	128872421	128872033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	67196	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr8	128879185	128879808	128879466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	74406	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr8	128883085	128883449	128883196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	78306	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	128888391	128888698	128888485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	83612	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.140537428341044
chr8	128910613	128910985	128910818	Y	MYC	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	105834	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr8	128919831	128920544	128920233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	100313	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	128923296	128923609	128923453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	97248	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	128944008	128944415	128944139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	76442	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	128948050	128948240	128948055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	72617	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	128961875	128962320	128962073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	58537	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	129002909	129003328	129003001	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	17529	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr8	129047466	129047656	129047576	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	26609	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	129076309	129076777	129076518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	55452	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	129114844	129115073	129114937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	93987	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	129180743	129180870	129180780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	159886	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	129262418	129262536	129262473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	241561	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	130876466	130876830	130876577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSDMC	79332	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	130897837	130898360	130898140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSDMC	100703	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr8	130907129	130907396	130907263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSDMC	109995	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	130975001	130975392	130975263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	51983	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	130983929	130984348	130984047	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	43027	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr8	131024148	131024528	131024501	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	2847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr8	131027030	131027189	131027125	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	186	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	131054431	131054834	131054758	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	27056	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.268158302124319
chr8	131114299	131114376	131114317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	86924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	131134027	131134054	131134041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	106652	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr8	131218440	131218995	131218822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	191065	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr8	131291188	131291588	131291505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	162318	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr8	131296023	131296343	131296248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	157563	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr8	131354482	131354860	131354810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	99046	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	131454495	131454885	131454765	Y	NA	ASAP1	NA	NA	NA	NA	ASAP1	589	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.258857167055955
chr8	132868655	132869774	132869195	Y	EFR3A	EFR3A	ADCY8	IMR90	Hi-C	24141950	EFR3A	44561	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	133331938	133332036	133331987	Y	HHLA1,KCNQ3,KCNQ3	NA	NA	NA	NA	NA	EFR3A	417603	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	133847494	133847990	133847686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF20L1	61876	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	134368494	134368766	134368633	Y	NDRG1	CTC-458A3.1,ST13P6	WISP1,NDRG1,TG,ST3GAL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTC-458A3.1	32254	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.185511700771837
chr8	134387761	134388081	134387916	Y	NA	ST13P6	TG,WISP1,NDRG1,PHF20L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ST13P6	30168	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.190240233080725
chr8	134412460	134412634	134412546	Y	ST3GAL1	ST13P6	TG,PHF20L1,NDRG1,WISP1,ST3GAL1	IMR90	Hi-C	24141950	ST13P6	5615	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	134552406	134552812	134552641	Y	ST3GAL1	ST3GAL1	NA	NA	NA	NA	ST3GAL1	29371	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr8	135566081	135566154	135566118	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAT	157138	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	135635794	135636288	135636020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAT	87004	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	135843585	135843751	135843688	Y	ZFAT	MIR30D	ZFAT,MIR30D,MIR30B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIR30D	28397	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr8	136587606	136587905	136587756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHDRBS3	119906	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	138127767	138128050	138127889	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-35P	1375029	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	140843827	140843872	140843850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNK9	130528	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	141108529	141108796	141108710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	357882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	141190446	141190798	141190723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	275880	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	141454964	141454973	141454969	Y	NA	TRAPPC9	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	11705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	141474376	141475403	141474918	Y	NA	TRAPPC9,CHRAC1	TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TRAPPC9	7698	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.575449231551062
chr8	141475903	141476104	141476028	Y	NA	TRAPPC9,CHRAC1	TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TRAPPC9	9225	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chr8	141479707	141479835	141479741	Y	NA	TRAPPC9,CHRAC1	EIF2C2,CHRAC1,TRAPPC9,PTK2	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TRAPPC9	13029	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	141598802	141599709	141599120	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	79405	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.483154309568965
chr8	141604721	141605198	141605144	Y	EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	85324	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	141707505	141707982	141707957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	188108	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr8	141800912	141801386	141801027	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	208929	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	141804565	141804680	141804623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	205635	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	141849368	141849592	141849371	Y	TRAPPC9	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	160723	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	141886994	141887102	141887066	Y	PTK2	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	123213	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.145265960649932
chr8	142047873	142048201	142048171	Y	PTK2	PTK2	PTK2,DENND3,SLC45A4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTK2	37558	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr8	142082969	142083325	142083150	Y	NA	DENND3	PTK2,DENND3,EIF2C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND3	42052	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	142084181	142084412	142084295	Y	PTK2	DENND3	PTK2,DENND3,EIF2C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND3	40965	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr8	142103714	142103901	142103823	Y	EIF2C2,SLC45A4,GPR20,DENND3	DENND3	PTK2,DENND3	IMR90	Hi-C	24141950	DENND3	21476	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	142128241	142128488	142128412	Y	NA	DENND3	PTK2,DENND3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND3	2864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr8	142131175	142131642	142131531	Y	EIF2C2,SLC45A4,DENND3	DENND3	PTK2,DENND3,SLC45A4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND3	5798	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr8	142163740	142163864	142163753	Y	NA	DENND3	NA	NA	NA	NA	DENND3	38363	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.196967956948873
chr8	142244468	142244827	142244553	Y	DENND3,PTP4A3,SLC45A4	NA	SLC45A4	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC45A4	71577	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	142550661	142551112	142550824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P38	83486	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	143049473	143049646	143049554	Y	NA	NA	TSNARE1	IMR90	Hi-C	24141950	TSNARE1	432955	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	143353648	143353818	143353814	Y	TSNARE1,BAI1	NA	NA	NA	NA	NA	TSNARE1	128783	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr8	143532398	143532722	143532656	Y	LYNX1,LYNX1,LYNX1,LYNX1,TSNARE1,BAI1	TSNARE1	NA	NA	NA	NA	TSNARE1	49797	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	143696778	143697162	143696893	Y	NA	ARC	NA	NA	NA	NA	ARC	1945	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	143757526	143757895	143757616	Y	NA	PSCA,JRK,LY6K	NA	NA	NA	NA	JRK	3491	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.395396212278479
chr8	143758809	143759081	143758941	Y	NA	PSCA,JRK,LY6K	NA	NA	NA	NA	JRK	2305	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr8	143809767	143809928	143809818	Y	C8orf55	JRK,LY6K,LYPD2	NA	NA	NA	NA	LYPD2	22024	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.162024968776811
chr8	143813380	143813410	143813405	Y	GPIHBP1	LY6K,LYPD2	NA	NA	NA	NA	LYPD2	18542	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr8	144189739	144190110	144189925	Y	GML	NA	ZFP41	IMR90	Hi-C	24141950	C8orf31	71113	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	144300737	144301128	144300944	Y	GPIHBP1	ZFP41,GLI4	NA	NA	NA	NA	ZFP41	26152	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr8	144301806	144302247	144302025	Y	MAFA	ZFP41,GLI4	NA	NA	NA	NA	ZFP41	25033	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	144302525	144302816	144302585	Y	LY6H,LY6H,LY6H	ZFP41,GLI4	NA	NA	NA	NA	ZFP41	24464	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	144327724	144327894	144327814	Y	NA	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	ZFP41	444	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	144360422	144361034	144360946	Y	ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	RP13-582O9.5	826	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.450210512956163
chr8	144601495	144601753	144601594	Y	NA	ZC3H3,GSDMD	NA	NA	NA	NA	ZC3H3	19870	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr8	144684263	144684410	144684337	Y	NA	NAPRT1,TIGD5,EEF1D,PYCRL,TSTA3,ZNF623	NA	NA	NA	NA	EEF1D	4552	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr8	144785317	144785390	144785376	Y	NA	ZNF707,FAM83H,FAM83H-AS1	NA	NA	NA	NA	ZNF707	20695	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	144799188	144799437	144799334	Y	MAPK15	ZNF707,FAM83H,FAM83H-AS1	NA	NA	NA	NA	FAM83H	14534	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr8	144820199	144820570	144820386	Y	RHPN1,C8orf73,FAM83H	FAM83H,FAM83H-AS1	NA	NA	NA	NA	FAM83H-AS1	5889	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr8	144948428	144948782	144948624	Y	EPPK1	PUF60,NRBP2,EPPK1	NRBP2	IMR90	Hi-C	24141950	EPPK1	1850	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.196967956948873
chr8	144950990	144951185	144951055	Y	C8orf73,NAPRT1,FAM83H,EXOSC4,CYC1,SCRIB,PUF60,PUF60,EPPK1	PUF60,NRBP2,EPPK1	NRBP2,PLEC,LOC100128338,FAM83H	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPPK1	358	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.292375183309713
chr8	145015768	145015971	145015849	Y	FAM83H,EPPK1,PLEC,PLEC,PLEC	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	32931	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr8	145022492	145023108	145022824	Y	PLEC,PLEC,PLEC,SPATC1,PLEC,GRINA	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	25794	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.399394595396999
chr8	145025737	145026802	145026365	Y	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	22100	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.91956218922758
chr8	145257344	145257608	145257476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHARPIN	96317	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	145549095	145549459	145549304	Y	NA	BOP1,HSF1,DGAT1,FBXL6,ADCK5	NA	NA	NA	NA	DGAT1	522	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	145558616	145559185	145558966	Y	ZNF517,ZNF34,LRRC24,KIFC2,CYHR1,SCRT1	BOP1,HSF1,DGAT1,FBXL6,ADCK5	NA	NA	NA	NA	DGAT1	10043	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	145887419	145887725	145887588	Y	NA	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,RECQL4,LRRC24,LRRC14,MFSD3,PPP1R16A,GPT,RPL8,ZNF34,ZNF517,ZNF250,TMED10P1,ZNF252,COMMD5	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP39	21469	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr8	145909879	145909957	145909931	Y	SCRT1,KIFC2,LRRC24,ARHGAP39,ZNF517,ZNF34	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	685	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr8	145911932	145912089	145912059	Y	SCRT1,KIFC2,LRRC24,ZNF34	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,ZNF34	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	2738	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.228642711192781
chr8	146058579	146058595	146058588	Y	ARHGAP39	ZNF34,RPL8,ZNF7,COMMD5	NA	NA	NA	NA	ZNF7	7730	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr8	146125688	146125902	146125777	Y	ZNF250	COMMD5,ZNF250,ZNF16	NA	NA	NA	NA	ZNF250	135	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	545729	545758	545741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	77438	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr9	616775	617021	616903	Y	DOCK8,C9orf66,KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	148484	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	642151	642448	642253	Y	DOCK8,C9orf66,KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	173860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	1930236	1930651	1930578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA2	82691	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr9	2018914	2019279	2019030	Y	NA	SMARCA2	NA	NA	NA	NA	SMARCA2	5572	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	2839342	2839735	2839533	Y	NA	KIAA0020	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	2506	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	2875811	2876206	2875956	Y	NA	KIAA0020	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	33570	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.351690982216579
chr9	3450123	3450354	3450276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX3	73650	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	3507863	3508210	3507917	Y	RFX3	RFX3,RP11-509J21.1	NA	NA	NA	NA	RFX3	15794	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	3971837	3971870	3971849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-509J21.1	447114	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	4174938	4175110	4175024	Y	GLIS3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC1A1	313334	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.315131766114373
chr9	4293316	4293716	4293485	Y	GLIS3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC1A1	194728	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.196967956948873
chr9	4296901	4297617	4297146	Y	GLIS3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC1A1	190827	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.282187969501571
chr9	4715214	4715412	4715290	Y	AK3	CDC37L1,AK3	NA	NA	NA	NA	AK3	24631	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr9	4738592	4738723	4738708	Y	NA	AK3	NA	NA	NA	NA	AK3	1320	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr9	4829866	4830028	4829909	Y	NA	RCL1,MIR101-2	NA	NA	NA	NA	MIR101-2	18263	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	4835219	4835506	4835309	Y	CDC37L1,RCL1	RCL1,MIR101-2	NA	NA	NA	NA	MIR101-2	12785	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.108862674097136
chr9	5086081	5086478	5086137	Y	CD274,CDC37L1,INSL6,JAK2	NA	NA	NA	NA	NA	JAK2	103048	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr9	5460253	5460626	5460389	Y	JAK2,KIAA1432,C9orf46,CD274	CD274,PDCD1LG2	PDCD1LG2	IMR90	Hi-C	24141950	CD274	11750	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	5488554	5488907	5488829	Y	NA	CD274,PDCD1LG2	NA	NA	NA	NA	PDCD1LG2	19638	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	5499914	5500215	5500099	Y	NA	PDCD1LG2	NA	NA	NA	NA	PDCD1LG2	8330	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	5777401	5777564	5777483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERMP1	53553	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr9	5843832	5844207	5843936	Y	NA	ERMP1	ERMP1	IMR90	Hi-C	24141950	ERMP1	12715	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.242672378570032
chr9	5851473	5851729	5851648	Y	C9orf46,CD274,KIAA1432	ERMP1	ERMP1	IMR90	Hi-C	24141950	ERMP1	20356	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr9	5879621	5879741	5879699	Y	NA	ERMP1	ERMP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	ERMP1	48504	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr9	6485944	6485989	6485946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UHRF2	74793	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr9	6488249	6488567	6488283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UHRF2	77098	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,RP11-390F4.6,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.57503139780414
chr9	6788210	6788382	6788241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4C	69347	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	10509839	10510073	10509956	Y	PTPRD	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P3	1420963	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	11018357	11018684	11018521	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	1793660	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	11065025	11065362	11065124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	1746982	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	9.24893087620378
chr9	12784417	12784967	12784682	Y	C9orf150	RP11-3L8.3	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	27377	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr9	14096603	14096776	14096679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	300206	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	14316018	14316353	14316263	Y	NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	80629	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.220454688943899
chr9	14320331	14320603	14320385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	76379	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.258354051945294
chr9	14322295	14322910	14322674	Y	ZDHHC21,NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	74072	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.85421394552513
chr9	14347993	14348154	14348106	Y	NFIB	NFIB	NA	NA	NA	NA	NFIB	48828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.148378265028675
chr9	14427879	14427964	14427922	Y	NFIB	NFIB	LURAP1L,NFIB,MPDZ,FLJ41200	IMR90	Hi-C	24141950	NFIB	30897	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	15477137	15477463	15477300	Y	NA	PSIP1,FTH1P12	NA	NA	NA	NA	PSIP1	31554	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	16103638	16104031	16103786	Y	NA	NA	BNC2,C9orf93	IMR90	Hi-C	24141950	FTH1P12	577957	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	16508530	16508711	16508621	Y	BNC2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	216101	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	17798214	17798411	17798313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3GL2	221134	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	18437501	18437903	18437771	Y	NA	ADAMTSL1	FAM154A,ADAMTSL1	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTSL1	33989	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr9	18718417	18718817	18718751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTSL1	246525	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.268158302124319
chr9	19154059	19154539	19154234	Y	PLIN2	PLIN2	HAUS6,PLIN2,DENND4C	IMR90	Hi-C	24141950	PLIN2	6771	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	19184256	19184894	19184463	Y	PLIN2	PLIN2	HAUS6,ACER2,DENND4C,PLIN2	IMR90	Hi-C	24141950	PLIN2	36968	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr9	20356496	20357005	20356641	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	263537	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr9	20484725	20484943	20484834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	135599	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	20532398	20532530	20532463	Y	MLLT3	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	88012	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr9	20793724	20794222	20793867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	173182	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	21096394	21096639	21096525	Y	KIAA1797	NA	MLLT3,KIAA1797	IMR90	Hi-C	24141950	KLHL9	236740	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	21576231	21576644	21576439	Y	NA	MIR31HG	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR31HG	18563	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.239212888630038
chr9	21677834	21678156	21678014	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR31HG	120166	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr9	21681581	21681928	21681849	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	118614	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.155836138087189
chr9	21689993	21690108	21690051	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	110434	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	21695810	21696232	21696052	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	104310	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr9	21696521	21696698	21696606	Y	IFNA6,IFNA1	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	103844	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr9	21836477	21836868	21836612	Y	NA	MTAP	NA	NA	NA	NA	MTAP	35935	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	21984231	21984381	21984318	Y	NA	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	CDKN2A	8919	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr9	21996110	21996456	21996153	Y	NA	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	CDKN2A	2810	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.24940010243818
chr9	21996542	21996712	21996656	Y	MTAP,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2B	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	CDKN2A	3242	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.459667577573938
chr9	22012524	22012846	22012594	Y	NA	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	2370	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr9	22040932	22041035	22040938	Y	NA	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	30778	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	22080061	22080293	22080228	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	69907	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	22083926	22084220	22084073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	73772	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr9	22103396	22103678	22103511	Y	MTAP,CDKN2A,CDKN2B	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	93242	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.393049835157968
chr9	22117547	22117648	22117588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	107393	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	22148170	22148538	22148388	Y	NA	NA	MTAP,CDKN2B-AS1,CDKN2B,CDKN2A	IMR90	Hi-C	24141950	UBA52P6	138016	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151837754968669
chr9	22216803	22217265	22216812	Y	NA	NA	CDKN2B,CDKN2B-AS1,MTAP,MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	UBA52P6	206649	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr9	22310596	22310829	22310637	Y	NA	NA	MTAP,DMRTA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DMRTA1	134011	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	22482961	22483350	22483156	Y	NA	DMRTA1	NA	NA	NA	NA	DMRTA1	38121	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	23452489	23452846	23452665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMRTA1	1007649	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.117433659975133
chr9	26243860	26243998	26243927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC1	567004	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208268283576497
chr9	26260192	26260607	26260418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC1	583336	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.479155926450444
chr9	26265141	26265461	26265258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC1	588285	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	26946072	26946289	26946254	Y	PLAA,IFT74,IFT74	IFT74,PLAA	NA	NA	NA	NA	PLAA	611	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr9	27365157	27365383	27365271	Y	MOBKL2B	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	162396	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104864290978615
chr9	27434079	27434197	27434145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	93582	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	27518919	27519184	27519052	Y	NA	MOB3B	NA	NA	NA	NA	MOB3B	8595	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	28813062	28813251	28813159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf72	1241198	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr9	28932604	28932646	28932625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf72	1360740	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr9	29211344	29211542	29211410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMXP2	1475561	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chr9	29213900	29214394	29214154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMXP2	1472709	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	29825337	29825639	29825488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMXP2	861464	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	29826048	29826378	29826215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMXP2	860725	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	29826427	29826586	29826507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMXP2	860517	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	32004800	32005157	32005020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACO1	377461	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	32453982	32454272	32454141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX58	70050	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	32461734	32461764	32461747	Y	DDX58	NA	NA	NA	NA	NA	DDX58	62558	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	33023891	33023961	33023926	Y	NA	APTX,DNAJA1	NA	NA	NA	NA	DNAJA1	682	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr9	33151008	33151398	33151341	Y	NA	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	13956	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	33158582	33158891	33158872	Y	NA	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	6463	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr9	33159013	33159478	33159222	Y	DNAJA1,NFX1,CHMP5,B4GALT1,SMU1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	5876	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr9	33159697	33160189	33160012	Y	NA	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	5165	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr9	33160944	33161390	33161236	Y	DNAJA1,SMU1,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	3964	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.77280015212905
chr9	33162668	33163130	33162954	Y	DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	2224	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.573833003620917
chr9	33165457	33166051	33165900	Y	DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	103	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.17351745936633
chr9	33229414	33229715	33229547	Y	NA	SPINK4,BAG1,CHMP5	NFX1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPINK4	13051	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.307290929426742
chr9	33229811	33230012	33229910	Y	NA	SPINK4,BAG1,CHMP5	NFX1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPINK4	13448	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.421995248652249
chr9	33231410	33231538	33231469	Y	NA	SPINK4,BAG1,CHMP5	NA	NA	NA	NA	SPINK4	15047	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.377751125411822
chr9	33233885	33234477	33234128	Y	NA	SPINK4,BAG1,CHMP5	NA	NA	NA	NA	SPINK4	17522	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.510100531503985
chr9	33329062	33329543	33329355	Y	NA	NFX1	NA	NA	NA	NA	NFX1	40553	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.601318118734465
chr9	33350411	33350624	33350531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFX1	61902	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr9	33375284	33375639	33375462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQP3	69970	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	33436336	33436688	33436507	Y	NA	AQP3,NOL6	NA	NA	NA	NA	AQP3	8921	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr9	33445339	33445789	33445589	Y	AQP3	NOL6	NA	NA	NA	NA	AQP3	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr9	33446270	33446740	33446527	Y	SMU1,BAG1,NFX1,AQP3	AQP3,NOL6	NA	NA	NA	NA	AQP3	661	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	33458514	33458840	33458724	Y	NA	AQP3,NOL6	NA	NA	NA	NA	AQP3	12905	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr9	33770440	33770694	33770558	Y	NA	UBE2R2	NA	NA	NA	NA	UBE2R2	44871	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.265428961374692
chr9	33814905	33815171	33814978	Y	UBE2R2,UBAP1	UBE2R2	NA	NA	NA	NA	UBE2R2	394	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr9	33931170	33931493	33931332	Y	UBAP1,UBE2R2	NA	NA	NA	NA	NA	UBAP2	115454	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	33942829	33943199	33943013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBAP2	103748	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr9	33953868	33954185	33954034	Y	UBE2R2,UBAP1	NA	NA	NA	NA	NA	UBAP2	92762	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	34016159	34016420	34016379	Y	NA	UBAP2	NA	NA	NA	NA	UBAP2	30527	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr9	34158490	34158839	34158617	Y	NA	DCAF12,UBAP1	DCAF12,UBAP1,KIF24,NUDT2,PRSS3,UBAP2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBAP1	18164	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr9	34179799	34180083	34180009	Y	UBE2R2,UBAP1	UBAP1,RP11-571F15.3	NA	NA	NA	NA	UBAP1	2796	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	34233080	34233513	34233116	Y	NA	RP11-571F15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-571F15.3	10454	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	34332110	34332236	34332173	Y	NA	SERPINH1P1,KIF24,NUDT2,KIAA1161	NA	NA	NA	NA	NUDT2	4606	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	34375136	34375287	34375212	Y	NA	KIF24,NUDT2,KIAA1161	NA	NA	NA	NA	KIAA1161	285	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	35114116	35114547	35114222	Y	DNAJB5,KIAA1539	VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B	NA	NA	NA	NA	FAM214B	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr9	35116905	35117142	35117025	Y	NA	VCP,FANCG,PIGO,STOML2,FAM214B,UNC13B	NA	NA	NA	NA	FAM214B	2567	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr9	35232989	35233276	35233133	Y	DNAJB5	NA	NA	NA	NA	NA	UNC13B	72990	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	35603992	35604628	35604112	Y	TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2	TESK1	NA	NA	NA	NA	TESK1	625	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18478155158147
chr9	35726275	35726587	35726326	Y	NA	TPM2,CREB3,TLN1,RGP1,GBA2	NA	NA	NA	NA	CREB3	3745	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	35769980	35770349	35770169	Y	NA	CREB3,TLN1,RGP1,GBA2,TMEM8B,HINT2	NA	NA	NA	NA	GBA2	21997	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	35907858	35908401	35908282	Y	OR2S2,OR13J1,HRCT1	NDUFA5P4,HRCT1	NA	NA	NA	NA	HRCT1	3669	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.235214505511518
chr9	35914292	35914707	35914657	Y	NA	NDUFA5P4,HRCT1	NA	NA	NA	NA	HRCT1	10103	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.212996815885384
chr9	35924004	35924206	35924105	Y	NA	HRCT1,YBX1P10	NA	NA	NA	NA	HRCT1	19815	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	35971862	35972364	35972237	Y	NA	YBX1P10	C9orf128,HRCT1,LOC158376,FP588,RECK	IMR90	Hi-C	24141950	YBX1P10	1547	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr9	36040345	36040403	36040371	Y	NA	RECK	NA	NA	NA	NA	RECK	5915	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	36213348	36213502	36213445	Y	SPAG8,C9orf128,CCIN,RNF38,RNF38	CLTA	NA	NA	NA	NA	CLTA	24495	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	36232002	36232125	36232063	Y	GNE	CLTA,RNU4-53P,GNE	NA	NA	NA	NA	RNU4-53P	33655	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	36232965	36233105	36233040	Y	NA	CLTA,RNU4-53P,GNE	NA	NA	NA	NA	RNU4-53P	32675	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr9	36621370	36621719	36621545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELK	50511	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr9	36764220	36764685	36764538	Y	NA	NA	MELK	IMR90	Hi-C	24141950	MELK	193361	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	36924974	36925090	36925030	Y	MELK	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	193446	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chr9	37036641	37037011	37036829	Y	ZCCHC7,ZBTB5,PAX5	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	81525	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.27015749368358
chr9	37197498	37198123	37197885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	78962	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	37198449	37198887	37198604	Y	ZBTB5,ZCCHC7	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	79913	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr9	37295997	37296383	37296038	Y	PAX5,ZCCHC7,FRMPD1	NA	NA	NA	NA	NA	GRHPR	124280	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	37771609	37771892	37771762	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	26607	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr9	37773119	37773290	37773253	Y	FRMPD1	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	25209	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.177323678522956
chr9	37835930	37836292	37836154	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	36496	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.275616175182834
chr9	37859471	37859543	37859507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	60037	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	37914600	37914735	37914730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	115166	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	37924173	37924321	37924247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	124739	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr9	37925048	37925073	37925061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	125614	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	37938183	37938323	37938277	Y	SHB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	128361	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	37963992	37964293	37964120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	102391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	38017265	38017614	38017440	Y	SHB	RP11-613M10.9,SHB	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	49070	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	38066980	38067628	38067261	Y	SHB	RP11-613M10.9	NA	NA	NA	NA	SHB	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr9	68417391	68418146	68417579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM122A	2974818	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr9	71728196	71728449	71728285	Y	NA	TJP2	NA	NA	NA	NA	TJP2	5760	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr9	71784003	71784073	71784064	Y	TJP2	TJP2	NA	NA	NA	NA	TJP2	49794	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	71791709	71792066	71791753	Y	TJP2	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	57500	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr9	71795556	71796114	71795819	Y	TJP2	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	61347	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr9	72923580	72923722	72923651	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	51643	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.76760473912199
chr9	73035561	73035945	73035863	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8021	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.683964720086947
chr9	74293239	74293379	74293310	Y	TMEM2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL35AP21	90722	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr9	74849498	74849569	74849533	Y	GDA,GDA,TMC1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-63P12.6	68777	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr9	75201715	75201894	75201832	Y	ZFAND5	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND5	223552	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	75731054	75731296	75731180	Y	ANXA1	ANXA1	ANXA1	IMR90	Hi-C	24141950	ANXA1	33377	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	75747117	75747734	75747349	Y	ANXA1	ANXA1	ANXA1	IMR90	Hi-C	24141950	ANXA1	16939	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.350804903476802
chr9	75791521	75791823	75791639	Y	NA	ANXA1	NA	NA	NA	NA	ANXA1	26848	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	76052668	76053000	76052847	Y	ANXA1	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA1	287995	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	77588894	77589149	77589022	Y	NA	RP11-197P3.1,C9orf40	NA	NA	NA	NA	C9orf40	23092	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	79018113	79018533	79018297	Y	NA	RFK,GCNT1	NA	NA	NA	NA	RFK	10680	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	80354506	80354684	80354595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAQ	289690	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	80559906	80560072	80560021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAQ	84302	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	80763064	80763187	80763126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP78	85791	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	80911003	80911373	80911119	Y	PSAT1	PSAT1	NA	NA	NA	NA	PSAT1	944	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.329317363041035
chr9	81486579	81486867	81486725	Y	NA	NA	TLE4	IMR90	Hi-C	24141950	CHCHD2P9	517352	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.092833815160624
chr9	81641483	81641834	81641545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2P9	362385	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	81780001	81780184	81780092	Y	TLE4	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2P9	224035	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chr9	86051693	86051979	86051837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD3	99482	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	86238855	86239256	86239056	Y	UBQLN1,GKAP1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-522I20.3	81253	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr9	86239584	86239974	86239757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-522I20.3	80535	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	86271805	86271878	86271876	Y	NA	RP11-522I20.3,UBQLN1	NA	NA	NA	NA	RP11-522I20.3	48631	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	88264467	88264715	88264594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	90229	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr9	88294983	88295025	88294997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	59919	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr9	88298792	88299000	88298900	Y	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	55944	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr9	88357534	88357780	88357692	Y	AGTPBP1	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	2590	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr9	88358353	88358730	88358394	Y	AGTPBP1	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	3409	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.229025674821897
chr9	88935508	88935794	88935577	Y	NA	ISCA1,ZCCHC6	NA	NA	NA	NA	ZCCHC6	31575	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr9	89381829	89382120	89381981	Y	ZCCHC6	NA	ZCCHC6,GAS1	IMR90	Hi-C	24141950	GAS1	177984	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	89626902	89626982	89626949	Y	NA	CDC20P1	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	2335	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210997624326124
chr9	89627893	89628105	89627999	Y	NA	CDC20P1	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	3326	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr9	89699545	89699882	89699714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	74978	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	89990510	89990850	89990781	Y	NA	NA	DAPK1	IMR90	Hi-C	24141950	DAPK1	119293	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210997624326124
chr9	90328172	90328868	90328486	Y	DAPK1,CTSL1	NA	CTSL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-40C6.2	189955	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200810410517982
chr9	90357872	90358073	90357970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	219655	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	90407699	90408115	90407854	Y	DAPK1,CTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	CDK20	179553	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	90408310	90408593	90408480	Y	DAPK1,CTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	CDK20	179075	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	91022048	91022386	91022218	Y	NA	SPIN1	NA	NA	NA	NA	SPIN1	20714	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	91140669	91140820	91140815	Y	NA	NXNL2	SPIN1,SHC3,SECISBP2,CKS2,CDK20,NXNL2,S1PR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NXNL2	7196	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	91146731	91147178	91146985	Y	NA	NXNL2	NA	NA	NA	NA	NXNL2	838	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.332776852981029
chr9	91147328	91147523	91147436	Y	NXNL2	NXNL2	NA	NA	NA	NA	NXNL2	493	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.339504576849177
chr9	91148176	91148373	91148274	Y	NA	NXNL2	NA	NA	NA	NA	NXNL2	160	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	91150927	91151269	91151097	Y	NA	NXNL2	NA	NA	NA	NA	NXNL2	2911	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	91381840	91381977	91381906	Y	NA	NA	SHC3,MIR4289,LOC286238,SPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	S1PR3	222385	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	91795136	91795669	91795494	Y	C9orf47,SHC3	NA	NA	NA	NA	NA	CKS2	128444	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.89298104425734
chr9	92050487	92050811	92050719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA4D	60234	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	93823339	93823577	93823437	Y	SYK,SYK,NFIL3	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	298618	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	93833669	93833838	93833696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	288357	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr9	93862627	93863018	93862659	Y	SYK,SYK,NFIL3	NA	AUH,ROR2,LOC100129316,NFIL3,MIR3910-1,MIR3910-2	IMR90	Hi-C	24141950	AUH	259177	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	93892173	93892363	93892269	Y	NA	NA	LOC100129316,AUH	IMR90	Hi-C	24141950	AUH	229832	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr9	93954665	93954922	93954788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	167273	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	93955243	93955725	93955362	Y	SYK,SYK,NFIL3	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	166470	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	93955991	93956732	93956142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	165463	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.288915693369719
chr9	93957941	93958089	93958015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	164106	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	93959484	93959867	93959681	Y	SYK,SYK,NFIL3	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	162328	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	94181531	94181930	94181720	Y	NFIL3	NFIL3	NA	NA	NA	NA	NFIL3	2214	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr9	94834730	94835154	94834963	Y	OGN	SPTLC1	NA	NA	NA	NA	SPTLC1	40512	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr9	94872861	94873095	94872978	Y	NA	SPTLC1	NA	NA	NA	NA	SPTLC1	2571	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr9	94993084	94993195	94993158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IARS	60843	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	95055002	95055331	95055316	Y	IPPK	IARS,CENPP,NOL8	NA	NA	NA	NA	IARS	964	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chr9	95288173	95288480	95288343	Y	NA	RP11-19J3.5	NA	NA	NA	NA	RP11-19J3.5	10986	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr9	95383874	95384172	95384023	Y	NA	IPPK	NA	NA	NA	NA	IPPK	46375	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr9	95388417	95388814	95388616	Y	FGD3,CENPP	IPPK	NA	NA	NA	NA	IPPK	41733	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	95878204	95878686	95878424	Y	IPPK,PHF2,FAM120A,C9orf89,NINJ1	C9orf89,NINJ1	NA	NA	NA	NA	NINJ1	15884	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr9	95880555	95880921	95880640	Y	NA	C9orf89,NINJ1	NA	NA	NA	NA	NINJ1	13649	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	95882095	95882646	95882428	Y	IPPK,PHF2,C9orf89,NINJ1	C9orf89,NINJ1	NA	NA	NA	NA	NINJ1	11924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr9	95911038	95911510	95911220	Y	IPPK,C9orf89,NINJ1	NINJ1	WNK2,NINJ1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NINJ1	16468	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	96044305	96044695	96044445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NINJ1	149735	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	96057493	96057765	96057581	Y	ZNF484,ZNF484,C9orf129,WNK2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM120A	154239	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	96335202	96335517	96335360	Y	NA	PHF2	NA	NA	NA	NA	PHF2	1172	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chr9	96377714	96377795	96377762	Y	PHF2	PHF2	NA	NA	NA	NA	PHF2	41025	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	96434811	96435085	96434948	Y	PHF2	NA	NA	NA	NA	NA	PHF2	98122	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr9	96901972	96902054	96902023	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	37062	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	10486	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.50796375340428
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	9706	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.71730937173239
chr9	97273853	97274253	97274073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIATL1	139020	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr9	97393129	97393529	97393332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	93454	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	97411409	97411895	97411585	Y	ZNF169,HIATL1,FBP1,C9orf3	NA	FBP1,FANCC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C9orf3	75088	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.533587263499012
chr9	97520794	97521111	97520953	Y	C9orf3	C9orf3	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf3	33811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	97590305	97590486	97590422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	103322	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	97629577	97629759	97629671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	142594	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr9	97630074	97630491	97630387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	143091	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.18478155158147
chr9	97631649	97631973	97631839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	144666	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.20553894282687
chr9	97633078	97633398	97633277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	146095	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.344807328799021
chr9	97685167	97685467	97685319	Y	NA	NA	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf3	198184	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	97688379	97688667	97688436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	201396	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	97699905	97700054	97699963	Y	NA	NA	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf3	212922	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr9	97770536	97771110	97770577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	283553	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr9	97839686	97839862	97839737	Y	PTCH1	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	238129	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	97881296	97881429	97881363	Y	FBP1	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	196562	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	97895370	97895760	97895554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	182231	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	97966859	97967268	97967183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	110723	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr9	97968410	97968794	97968763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	109197	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	98054647	98055067	98054952	Y	NA	FANCC	NA	NA	NA	NA	FANCC	22924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr9	98075518	98075673	98075591	Y	NA	FANCC	NA	NA	NA	NA	FANCC	2318	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	98273012	98273438	98273114	Y	C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1	PTCH1	NA	NA	NA	NA	PTCH1	3901	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.241942229379666
chr9	98273818	98274186	98273872	Y	NA	PTCH1	NA	NA	NA	NA	PTCH1	3153	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.27399994725269
chr9	98583076	98583344	98583210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00476	52915	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr9	98768233	98768612	98768423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00476	131974	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr9	98813738	98814016	98813856	Y	HSD17B3	NA	PTCH1,FANCC,C9orf102,LOC158434,LINC00092,LOC158435	IMR90	Hi-C	24141950	EIF4BP3	92273	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	99106686	99107122	99106995	Y	NA	SLC35D2	NA	NA	NA	NA	SLC35D2	36870	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr9	99171138	99171308	99171256	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	RP11-172F4.2	3572	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr9	99181547	99181719	99181643	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	2936	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.516828255372133
chr9	99774924	99775195	99775041	Y	C9orf21,TDRD7	HIATL2	NA	NA	NA	NA	HIATL2	1062	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	100432763	100433089	100432926	Y	TSTD2,XPA	NCBP1,TSTD2,XPA	NA	NA	NA	NA	XPA	24550	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	100455337	100455352	100455343	Y	NA	XPA	NA	NA	NA	NA	XPA	2287	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr9	100565577	100566264	100565821	Y	CORO2A,FOXE1	NA	FOXE1,C9orf156	IMR90	Hi-C	24141950	XPA	107938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.697611423835083
chr9	100696898	100697242	100697085	Y	NA	C9orf156,ANP32B	NA	NA	NA	NA	C9orf156	14046	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr9	100743401	100743685	100743451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANP32B	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	100747732	100748046	100747912	Y	NA	ANP32B	NA	NA	NA	NA	ANP32B	4089	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210997624326124
chr9	100772550	100772875	100772560	Y	NA	ANP32B,NANS	NANS,TRIM14	IMR90	Hi-C	24141950	ANP32B	28907	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.169865805464441
chr9	100788386	100788828	100788550	Y	NA	ANP32B,NANS	NA	NA	NA	NA	NANS	28193	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr9	100841115	100841498	100841123	Y	C9orf156	NANS,TRIM14	NA	NA	NA	NA	NANS	24094	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	100880203	100880431	100880317	Y	C9orf156,HEMGN,TRIM14,TRIM14	TRIM14	NA	NA	NA	NA	TRIM14	709	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr9	100908591	100908763	100908677	Y	NA	TRIM14,CORO2A	TRIM14	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM14	29097	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr9	100969722	100969939	100969831	Y	NA	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	CORO2A	16800	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	100985595	100985973	100985751	Y	TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	29942	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr9	101002580	101002910	101002849	Y	C9orf156,NANS,TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	13005	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr9	101010652	101010785	101010720	Y	C9orf156,NANS,TBC1D2	TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	5130	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr9	101011075	101011589	101011252	Y	C9orf156,NANS,TBC1D2	TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	4326	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr9	101013285	101013628	101013443	Y	C9orf156,NANS,TBC1D2	TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	2287	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	101016338	101016489	101016414	Y	NA	TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	423	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	101554135	101554384	101554323	Y	NA	ANKS6	NA	NA	NA	NA	ANKS6	2863	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	101557390	101557800	101557457	Y	NA	ANKS6	NA	NA	NA	NA	ANKS6	143	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	101624578	101624871	101624742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKS6	67331	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	101630117	101630425	101630271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKS6	72870	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr9	101836611	101836660	101836639	Y	NA	TGFBR1	NA	NA	NA	NA	TGFBR1	27660	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	101871896	101872113	101872024	Y	TGFBR1	TGFBR1	NA	NA	NA	NA	TGFBR1	7576	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr9	102580616	102580992	102580865	Y	NA	RP11-554F20.1,NR4A3	NA	NA	NA	NA	RP11-554F20.1	445	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.187510892331098
chr9	102585833	102586368	102586147	Y	ERP44,NR4A3	RP11-554F20.1,NR4A3	NA	NA	NA	NA	NR4A3	3696	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr9	102621794	102622137	102621866	Y	NA	RP11-554F20.1,NR4A3,STX17	NA	NA	NA	NA	NR4A3	39657	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	102767343	102767551	102767505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERP44	91771	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	102908427	102908826	102908633	Y	NA	ERP44,INVS	NA	NA	NA	NA	INVS	48889	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	103173830	103174136	103174107	Y	NA	NA	C9orf30-TMEFF1,TEX10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TEX10	60609	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.299102907177861
chr9	103192373	103192745	103192675	Y	C9orf30	NA	C9orf30-TMEFF1	IMR90	Hi-C	24141950	TEX10	79152	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	104248590	104248780	104248669	Y	C9orf125	RNF20	NA	NA	NA	NA	RNF20	45353	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr9	105248809	105248820	105248818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF20	954676	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.162024968776811
chr9	107730510	107730878	107730708	Y	SLC44A1,FSD1L,FSD1L,ABCA1	ABCA1,RP11-217B7.3	ABCA1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-217B7.3	21184	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.883889051865151
chr9	108058871	108059613	108059363	Y	ABCA1,TMEM38B,FSD1L,FSD1L	NA	NA	NA	NA	NA	SLC44A1	53968	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	108220808	108221168	108220887	Y	NA	FSD1L	NA	NA	NA	NA	FSD1L	12731	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr9	108266303	108266427	108266370	Y	FSD1L,FSD1L,TMEM38B	NA	NA	NA	NA	NA	FKTN	51984	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	108284643	108284789	108284719	Y	NA	FKTN	NA	NA	NA	NA	FKTN	33622	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	108474101	108474491	108474408	Y	TMEM38B	TMEM38B	NA	NA	NA	NA	TMEM38B	19276	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	108621964	108622364	108622354	Y	NA	NA	MIR548Q,ZNF462	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM38B	167139	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	109626456	109627144	109627032	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	3078	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	109647843	109648061	109647872	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	24465	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	109933165	109933377	109933258	Y	KLF4	NA	ZNF462,MIR548Q,RAD23B	IMR90	Hi-C	24141950	RAD23B	110041	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	110266981	110267369	110267173	Y	NA	KLF4,RP11-438P9.1	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLF4	16218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr9	110310627	110311050	110310826	Y	KLF4	RP11-438P9.1	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-438P9.1	15956	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.167136464714814
chr9	110502996	110503145	110503135	Y	NA	NA	KLF4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-438P9.1	208325	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	110512153	110512586	110512216	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-438P9.1	217482	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.36402050459463
chr9	110514044	110514454	110514287	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-438P9.1	219373	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.132349406092163
chr9	110517575	110517896	110517754	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-438P9.1	222904	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr9	110582969	110583172	110583071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-438P9.1	288298	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	110811401	110811623	110811540	Y	NA	NA	KLF4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-438P9.1	516730	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	111034300	111034792	111034481	Y	NA	NA	KLF4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-220D10.1	352321	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	111313727	111314112	111313882	Y	NA	NA	KLF4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-220D10.1	73001	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	111759404	111759745	111759575	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	14064	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	111773643	111773659	111773652	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	150	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr9	111774521	111775173	111774726	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	712	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.213726965075751
chr9	111872786	111872983	111872905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	98977	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr9	112091755	112092133	112091802	Y	PTPN3	EPB41L4B	EPB41L4B	MCF7	ChIA-PET	22265404	EPB41L4B	10511	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	112905689	112906067	112905829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	110853	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	112919210	112919591	112919336	Y	AKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	97329	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	113020211	113020679	113020386	Y	AKAP2	TXN	NA	NA	NA	NA	TXN	3291	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr9	113113544	113113865	113113705	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	96624	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr9	114364049	114364191	114364143	Y	KIAA0368,GNG10	PTGR1,DNAJC25,DNAJC25-GNG10	NA	NA	NA	NA	PTGR1	3914	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr9	114723325	114723781	114723480	Y	NA	NA	C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UGCG	66279	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	114745717	114746328	114746073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	88671	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	114774761	114774976	114774762	Y	UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	117715	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	114792518	114792641	114792625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	135472	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	114808602	114808743	114808666	Y	PTGR1,PTGR1,UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	126945	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr9	114828005	114828556	114828288	Y	UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	107132	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.171864997023702
chr9	114831912	114832228	114831995	Y	GNG10,SUSD1	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	103460	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr9	114836654	114837091	114837061	Y	PTGR1,PTGR1,UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	98597	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	114960117	114960327	114960222	Y	NA	SUSD1	NA	NA	NA	NA	SUSD1	24429	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	115470219	115470249	115470232	Y	ROD1,HSDL2,C9orf80	RP11-276E15.4,SNX30	NA	NA	NA	NA	RP11-276E15.4	40487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr9	115605913	115605928	115605920	Y	ZFP37	NA	NA	NA	NA	NA	SNX30	94795	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	115757286	115757809	115757590	Y	NA	ZNF883	NA	NA	NA	NA	ZNF883	14698	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	115914968	115915416	115915186	Y	SNX30,SLC46A2,RGS3,SLC31A2,FKBP15	SLC31A2	NA	NA	NA	NA	SLC31A2	3746	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	115981344	115981857	115981657	Y	SNX30,SLC46A2,RGS3,SLC31A2,FKBP15	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP15,SLC31A1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	116011576	116011925	116011593	Y	NA	FKBP15,SLC31A1,PRPF4,CDC26	NA	NA	NA	NA	PRPF4	23698	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	116036635	116036980	116036798	Y	SLC31A2,FKBP15,RGS3	PRPF4,CDC26	NA	NA	NA	NA	CDC26	766	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	116281787	116282895	116282664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLE3	110835	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.218455497384639
chr9	116728685	116728905	116728795	Y	AMBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF618	92123	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr9	116918999	116919461	116919193	Y	NA	COL27A1	NA	NA	NA	NA	COL27A1	3159	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	117040965	117041219	117041139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL27A1	125125	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	117080236	117080340	117080297	Y	TNFSF15,ATP6V1G1,ORM1	NA	NA	NA	NA	NA	COL27A1	164396	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	117249092	117249487	117249472	Y	NA	DFNB31	NA	NA	NA	NA	DFNB31	16243	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr9	117314293	117314590	117314355	Y	TNFSF8,TNFSF15,DFNB31,ATP6V1G1	DFNB31,ATP6V1G1	DFNB31,ATP6V1G1,C9orf91	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP6V1G1	33436	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.174594337773329
chr9	117351016	117351370	117351316	Y	TNFSF8,AKNA,DFNB31,DFNB31,ATP6V1G1	ATP6V1G1,C9orf91	NA	NA	NA	NA	ATP6V1G1	2990	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr9	117657108	117657611	117657338	Y	DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF15,TNFSF8	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf91	285622	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	117671276	117671580	117671329	Y	DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF15,TNFSF8	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf91	299790	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	117716098	117716662	117716365	Y	DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8	NA	LOC100505478,AKNA,DFNB31,ATP6V1G1,C9orf91,TNC,TNFSF15,TNFSF8	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf91	344612	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr9	117720208	117721654	117720651	Y	DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8	NA	LOC100505478,DFNB31,C9orf91,TNFSF15,TNFSF8,TNC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf91	348722	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr9	117751312	117751579	117751418	Y	DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8	NA	TNFSF8,TNFSF15	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf91	379826	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	118353952	118354125	118354022	Y	TNC	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf91	982466	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	118378080	118378500	118378342	Y	NA	NA	PAPPA,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf91	1006594	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	118430899	118431573	118430988	Y	NA	NA	PAPPA,ASTN2,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM32	1016008	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr9	118434933	118435213	118435118	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM32	1012368	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr9	118435271	118435690	118435488	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM32	1011891	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	118496415	118496674	118496563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	950907	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr9	118701397	118701694	118701515	Y	NA	NA	ASTN2,LINC00474,PAPPA	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM32	745887	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	118706424	118707025	118706637	Y	NA	NA	ASTN2,LINC00474,PAPPA	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM32	740556	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr9	118849643	118849804	118849724	Y	NA	NA	PAPPA	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM32	597777	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	118914445	118914679	118914506	Y	PAPPA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	532902	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	118919313	118920155	118919798	Y	PAPPA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	527426	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr9	119084686	119084813	119084781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	362768	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	119329308	119329509	119329406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	118072	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	120523356	120523735	120523438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLR4	58746	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	122678487	122678506	122678497	Y	NA	NA	DBC1,SKAP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,19890323	CDK5RAP2	661942	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	122914670	122914945	122914761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	425503	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	122984020	122984078	122984028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	356370	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	123237192	123237494	123237347	Y	MEGF9,FBXW2	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	102954	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	123243513	123243809	123243661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	96639	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	123251976	123252022	123252001	Y	CDK5RAP2	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	88426	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr9	123283577	123283819	123283724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	56629	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	123446824	123446976	123446902	Y	TRAF1,TRAF1	MEGF9	NA	NA	NA	NA	MEGF9	27772	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr9	123455501	123455738	123455670	Y	NA	MEGF9	NA	NA	NA	NA	MEGF9	19010	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	123478444	123478636	123478538	Y	NA	MEGF9	NA	NA	NA	NA	MEGF9	3696	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	123635278	123635355	123635317	Y	NA	PSMD5,PHF19	NA	NA	NA	NA	PHF19	2251	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr9	123834049	123834395	123834258	Y	TRAF1,TRAF1,CNTRL	CNTRL	CNTRL,TRAF1	IMR90	Hi-C	24141950	CNTRL	746	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	123868146	123868159	123868153	Y	NA	CNTRL	NA	NA	NA	NA	CNTRL	33005	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	123878647	123878673	123878659	Y	NA	CNTRL	NA	NA	NA	NA	CNTRL	43506	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	124035384	124035709	124035520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB14	52092	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	124040831	124041134	124040970	Y	GSN	NA	NA	NA	NA	NA	RAB14	57539	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr9	124121200	124121289	124121241	Y	NA	STOM	GSN	IMR90	Hi-C	24141950	STOM	9242	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	124134922	124135274	124134953	Y	NA	STOM	GSN	MCF7	ChIA-PET	22265404	STOM	4391	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr9	124361597	124361984	124361689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STOM	231066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.58601940898832
chr9	124363625	124363839	124363710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STOM	233094	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	124498744	124498978	124498839	Y	GSN	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL11	354907	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.510830680694352
chr9	124499221	124499709	124499392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL11	354176	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	10.2242283197058
chr9	124664946	124665174	124665060	Y	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL11	188711	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	124704763	124705076	124704868	Y	TTLL11,MRRF,DAB2IP	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL11	148809	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	125109314	125109437	125109338	Y	NA	PTGS1	TTLL11,MIR4478,MORN5,NDUFA8,LHX6,RBM18,MRRF,PTGS1,OR1K1,PDCL	IMR90	Hi-C	24141950	PTGS1	21387	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	125138740	125138980	125138872	Y	OR1L3	PTGS1	NA	NA	NA	NA	PTGS1	7916	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr9	125654025	125654372	125654281	Y	NA	RC3H2,ZBTB6,ZBTB26,RABGAP1	NA	NA	NA	NA	RC3H2	11248	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr9	126002195	126002288	126002252	Y	OR1L6,RC3H2,ZBTB6,ZBTB26,GPR21,STRBP,STRBP	STRBP	NA	NA	NA	NA	STRBP	26567	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	126003896	126004111	126004004	Y	NA	STRBP	NA	NA	NA	NA	STRBP	24744	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	126028834	126029635	126029406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr9	126029655	126030141	126030108	Y	NA	STRBP	NA	NA	NA	NA	STRBP	800	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr9	126116431	126116619	126116525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	87576	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	126200869	126200875	126200873	Y	RABGAP1,GPR21,DENND1A	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	172014	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	126237774	126237937	126237796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	208919	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	126297071	126297260	126297221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	268216	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chr9	126597388	126597650	126597587	Y	DENND1A	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	92781	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr9	126632279	126632299	126632291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	58132	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.244671570129293
chr9	126644407	126644614	126644564	Y	LHX2	DENND1A	NA	NA	NA	NA	DENND1A	45817	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	126690123	126690365	126690192	Y	DENND1A	DENND1A	NA	NA	NA	NA	DENND1A	66	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr9	126695812	126695993	126695905	Y	PSMB7	DENND1A	NA	NA	NA	NA	DENND1A	5381	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.616233864851494
chr9	127165878	127166187	127166033	Y	NA	PSMB7	NA	NA	NA	NA	PSMB7	9536	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	127424345	127424738	127424542	Y	NA	MIR181A2HG	NA	NA	NA	NA	MIR181A2HG	5599	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr9	127433186	127433516	127433351	Y	NR6A1	MIR181A2HG	NA	NA	NA	NA	MIR181A2HG	14440	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr9	127458498	127458770	127458741	Y	NA	MIR181A2HG	NA	NA	NA	NA	MIR181A2HG	39752	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	127475055	127475439	127475319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR6A1	56150	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	127519728	127520109	127519909	Y	NA	NR6A1,OLFML2A	NA	NA	NA	NA	NR6A1	11480	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr9	127943373	127943395	127943384	Y	NA	SCAI,PPP6C,RABEPK	NA	NA	NA	NA	PPP6C	6823	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr9	127944437	127944756	127944696	Y	NR6A1,GOLGA1,PPP6C,GAPVD1	SCAI,PPP6C,RABEPK	NA	NA	NA	NA	PPP6C	5462	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chr9	127947242	127947259	127947251	Y	NA	SCAI,PPP6C,RABEPK	NA	NA	NA	NA	PPP6C	2959	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr9	128172483	128172773	128172647	Y	NA	NA	PBX3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GAPVD1	150410	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr9	128275898	128276280	128276126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	191233	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	128298527	128298744	128298662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	168769	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	128395270	128395491	128395304	Y	PPP6C,HSPA5,GAPVD1	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	72022	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	128395677	128395921	128395842	Y	HSPA5	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	71592	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	128396600	128396979	128396804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	70534	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	128408655	128409172	128408692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	58341	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chr9	128422195	128422516	128422378	Y	HSPA5	MAPKAP1	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	44997	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	128592115	128592428	128592308	Y	PBX3	NA	NA	NA	NA	NA	PBX3	84491	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	129263295	129263658	129263477	Y	FAM125B,RALGPS1,RALGPS1,LMX1B	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	301627	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	129481833	129482256	129482109	Y	ZBTB43,ZBTB34	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	83029	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	129484571	129485188	129484881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	80097	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr9	129495309	129495335	129495322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	69950	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	129590383	129590427	129590410	Y	ZBTB43	ZBTB43,ZBTB34	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	25098	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	129929259	129929425	129929350	Y	LRSAM1,RALGPS1	NA	NA	NA	NA	NA	GARNL3	55119	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	130281582	130281994	130281773	Y	TOR2A,SH2D3C,FAM129B,CDK9	NA	NA	NA	NA	NA	FAM129B	57274	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	130304237	130304411	130304308	Y	FAM129B,FAM129B	FAM129B	NA	NA	NA	NA	FAM129B	34857	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	130307843	130308200	130307973	Y	SLC2A8,FAM129B	FAM129B	NA	NA	NA	NA	FAM129B	31068	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	130319753	130319894	130319823	Y	ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,FPGS,FPGS,FAM129B	FAM129B	NA	NA	NA	NA	FAM129B	19374	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chr9	130328926	130329278	130329070	Y	FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	9990	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.285073239800609
chr9	130329548	130329691	130329605	Y	PTRH1,FPGS,FPGS,ENG,CDK9,FAM129B,FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	9577	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.460397726764304
chr9	130335827	130336224	130335842	Y	TOR2A,CDK9,FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	3044	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr9	130336494	130336746	130336628	Y	TOR2A,FPGS,FPGS,CDK9,FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	2522	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.911494318460245
chr9	130341922	130342377	130342071	Y	NA	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	2654	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr9	130342769	130343108	130342811	Y	NA	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	3501	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	130373507	130373780	130373645	Y	GARNL3,SLC25A25,FAM102A,STXBP1	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	STXBP1	963	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr9	130526190	130526474	130526312	Y	FPGS,FPGS,ENG,CDK9,SH2D3C,SH2D3C,SH2D3C	PTRH1,TOR2A,SH2D3C,CDK9,FPGS	NA	NA	NA	NA	SH2D3C	12546	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	130597952	130598640	130598378	Y	FAM129B,TOR2A,SH2D3C,CDK9,FPGS,FPGS	FPGS,ENG,AK1	NA	NA	NA	NA	ENG	16395	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	130600573	130601245	130600861	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS,FPGS	FPGS,ENG,AK1	NA	NA	NA	NA	ENG	13790	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.153836946527929
chr9	130627836	130628198	130628079	Y	NA	ENG,AK1,ST6GALNAC6,ST6GALNAC4	NA	NA	NA	NA	AK1	9824	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr9	130675929	130676130	130676030	Y	NA	AK1,ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,PIP5KL1,DPM2	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC4	1187	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr9	130681632	130682091	130681875	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9	AK1,ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,PIP5KL1,DPM2	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC4	4315	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chr9	130718218	130718307	130718248	Y	NA	ST6GALNAC4,PIP5KL1,DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	DPM2	19455	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr9	130743802	130743907	130743855	Y	FAM102A	DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	FAM102A	3010	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	130764123	130764312	130764223	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS	FAM102A	FAM102A,DPM2,PIP5KL1,SLC25A25,NAIF1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM102A	23331	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.168752692644958
chr9	130834459	130834744	130834726	Y	NA	SLC25A25,NAIF1	NA	NA	NA	NA	NAIF1	5974	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	130834970	130835273	130835056	Y	FAM129B,TOR2A,SH2D3C,CDK9,SLC25A25	SLC25A25,NAIF1	NA	NA	NA	NA	NAIF1	6485	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	131316865	131317367	131316977	Y	NA	RP11-216B9.6,SPTAN1	NA	NA	NA	NA	SPTAN1	3999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	131545917	131546049	131545985	Y	NA	ZER1,TBC1D13,ENDOG,C9orf114	NA	NA	NA	NA	TBC1D13	1434	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	131637939	131638335	131638137	Y	NA	C9orf114,LRRC8A,CCBL1	C9orf114,ENDOG	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC8A	4056	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	131645612	131645749	131645679	Y	NA	LRRC8A,CCBL1	NA	NA	NA	NA	CCBL1	2839	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	131788763	131789149	131789046	Y	SH3GLB2	SH3GLB2,FAM73B	NA	NA	NA	NA	SH3GLB2	181	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	131908135	131908616	131908494	Y	METTL11A	PPP2R4,CRAT,IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	29924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr9	131929415	131929566	131929473	Y	METTL11A,C9orf106	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8974	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.852334449102789
chr9	131930457	131930532	131930510	Y	PRRX2	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8008	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.460397726764304
chr9	131936354	131936600	131936398	Y	METTL11A,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1940	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.31986029842326
chr9	131937094	131937487	131937262	Y	PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1053	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.81648794713204
chr9	131988173	131988389	131988342	Y	NA	IER5L	LOC100506190,IER5L,METTL11A,PPP2R4,ASB6,SH3GLB2,CRAT,C9orf106,C9orf50	IMR90,K562,HELA	Hi-C,5C	24141950,22955621	IER5L	49633	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.29510452405934
chr9	132168772	132168919	132168823	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	74811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.84091442733824
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.71742997955856
chr9	132176730	132177172	132176936	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	66558	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chr9	132241150	132241608	132241414	Y	NA	LINC00963	PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,LOC100506190,C9orf50,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	2122	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.119049887905278
chr9	132244062	132244824	132244277	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	332	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.12563957362754
chr9	132247452	132247693	132247545	Y	C9orf106	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	3722	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.149108414219042
chr9	132249112	132249430	132249268	Y	CRAT,IER5L,PRRX2	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	5382	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.3251456153142
chr9	132249735	132250094	132249903	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	6005	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.267428152933953
chr9	132257886	132258547	132258348	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	14156	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.56545418170482
chr9	132312044	132312247	132312152	Y	NA	RP11-492E3.2	DOLPP1,LOC100506190,FAM73B,IER5L,CRAT,PPP2R4,C9orf106,C9orf50,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-492E3.2	23441	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	132319720	132320056	132319894	Y	DOLPP1	RP11-492E3.2	FAM73B,DOLPP1,IER5L,LOC100506190,METTL11A,PPP2R4,C9orf106,C9orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-492E3.2	15632	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.437641143959645
chr9	132330057	132330508	132330201	Y	NA	RP11-492E3.2	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-492E3.2	5180	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.780258025187565
chr9	132330921	132331424	132331168	Y	IER5L,C9orf50	RP11-492E3.2	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-492E3.2	4264	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.548503009616041
chr9	132331590	132331738	132331651	Y	CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	RP11-492E3.2	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-492E3.2	3950	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr9	132369856	132370376	132370136	Y	CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107	RP11-492E3.2,ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	32068	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.53908217941076
chr9	132372165	132372686	132372524	Y	NA	RP11-492E3.2,ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	29758	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.346076371167914
chr9	132373475	132373922	132373518	Y	NA	RP11-492E3.2,ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	28522	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chr9	132385793	132386123	132385875	Y	C9orf106,TOR1B,PRRX2	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	16321	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	132429420	132429769	132429595	Y	C9orf50,PRRX2	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	26976	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	132459422	132459648	132459595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTGES	53678	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13507874684179
chr9	132460473	132461091	132460806	Y	ASB6,PRRX2	NA	NA	NA	NA	NA	PTGES	52235	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	132464908	132465166	132465090	Y	C9orf50,PRRX2	PTGES	NA	NA	NA	NA	PTGES	48160	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	132488074	132488402	132488238	Y	C9orf50,PRRX2	PTGES	NA	NA	NA	NA	PTGES	24924	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	132494076	132494377	132494232	Y	NA	PTGES	NA	NA	NA	NA	PTGES	18949	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.186780743140731
chr9	132505331	132505539	132505390	Y	PTGES	PTGES	NA	NA	NA	NA	PTGES	7787	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	132508719	132508991	132508915	Y	NA	PTGES	NA	NA	NA	NA	PTGES	4335	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	132512351	132512751	132512561	Y	PTGES	PTGES	NA	NA	NA	NA	PTGES	575	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chr9	132514052	132514155	132514104	Y	NA	PTGES,TOR1B	NA	NA	NA	NA	PTGES	726	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr9	132535885	132536300	132536143	Y	FNBP1,USP20,USP20,TOR1B	PTGES,TOR1B,TOR1A	PRRX2,TOR1A,TOR1B,PPP2R4,PTGES,CRAT,IER5L,C9orf50,ASB6,METTL11A,C9orf78,USP20	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTGES	22559	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr9	132539303	132540203	132539702	Y	C9orf106,FNBP1,TOR1B	PTGES,TOR1B,TOR1A	PPP2R4,PRRX2,PTGES,CRAT,IER5L,C9orf50,ASB6,METTL11A,C9orf78,USP20,TOR1B,TOR1A,FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,GPR107	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOR1B	23229	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.259970279875438
chr9	132579299	132579626	132579554	Y	ASB6,USP20,USP20,C9orf78	TOR1B,TOR1A,USP20,C9orf78	NA	NA	NA	NA	TOR1A	4787	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	132646480	132646964	132646831	Y	ASB6,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf78	50338	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.336619306550139
chr9	132648080	132648314	132648193	Y	ASB6,TOR1B,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf78	51938	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.164024160336071
chr9	132728744	132729115	132728930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1	74358	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	132802902	132803300	132803100	Y	ASB6,USP20,USP20,FNBP1	FNBP1,GPR107	NA	NA	NA	NA	FNBP1	173	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr9	132807262	132807460	132807345	Y	USP20,USP20	FNBP1,GPR107	NA	NA	NA	NA	FNBP1	3789	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	132949592	132949704	132949653	Y	C9orf78	NCS1	NA	NA	NA	NA	NCS1	16735	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr9	132963704	132964128	132963904	Y	NCS1	NCS1	NA	NA	NA	NA	NCS1	30847	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr9	133001906	133002144	133002026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCS1	69049	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	133240367	133240618	133240493	Y	NA	NA	NCS1,ASS1,FUBP3	IMR90	Hi-C	24141950	ASS1	77698	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	133321021	133321306	133321114	Y	ASS1	ASS1	NA	NA	NA	NA	ASS1	2705	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.526129390440497
chr9	133342925	133343088	133343007	Y	PRDM12	ASS1	NA	NA	NA	NA	ASS1	24609	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr9	133565449	133565699	133565571	Y	NA	RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1	NA	NA	NA	NA	EXOSC2	1409	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.73608591442749
chr9	133711348	133711666	133711497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIBCD1	101007	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.111592014846763
chr9	133721311	133721454	133721341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIBCD1	91219	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	133721974	133722320	133722184	Y	NA	NA	QRFP,FIBCD1	IMR90	Hi-C	24141950	FIBCD1	90353	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr9	133722867	133723250	133723071	Y	NA	NA	QRFP,FIBCD1	IMR90	Hi-C	24141950	FIBCD1	89423	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr9	134114047	134114338	134114158	Y	NA	PPAPDC3	NA	NA	NA	NA	PPAPDC3	48743	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	134131602	134132161	134131829	Y	RAPGEF1,PRRC2B,QRFP,NUP214,FAM78A	PPAPDC3	NA	NA	NA	NA	PPAPDC3	30920	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.23069557222343
chr9	134157961	134158264	134158112	Y	NA	PPAPDC3	NUP214,FAM78A,PPAPDC3,PRRC2B	IMR90	Hi-C	24141950	PPAPDC3	4817	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr9	134158436	134158891	134158763	Y	NA	PPAPDC3	NUP214,FAM78A,PPAPDC3,PRRC2B	IMR90	Hi-C	24141950	PPAPDC3	4190	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.70906859270137
chr9	134258707	134258891	134258799	Y	NA	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	8589	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr9	134278219	134278688	134278276	Y	NA	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A,PPAPDC3	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	10739	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	134316967	134317380	134317020	Y	NA	PRRC2B	NA	NA	NA	NA	PRRC2B	49487	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr9	134460892	134461019	134460973	Y	FAM78A,RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	UCK1	56237	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	134510539	134511032	134510903	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	102429	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	134537317	134537597	134537547	Y	FAM78A,PRRC2B,RAPGEF1,RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	75864	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	134553923	134554245	134554041	Y	FAM78A,PRRC2B,RAPGEF1,MED27,RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	59216	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr9	134577502	134577617	134577602	Y	NA	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	35844	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	134582403	134582762	134582583	Y	NA	RAPGEF1	PRRC2B,UCK1,POMT1	IMR90	Hi-C	24141950	RAPGEF1	30699	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	134583176	134583545	134583248	Y	RAPGEF1	RAPGEF1	PRRC2B,UCK1,POMT1	IMR90	Hi-C	24141950	RAPGEF1	29916	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	134600757	134600889	134600837	Y	RAPGEF1,NTNG2	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	12572	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	134603973	134604163	134604103	Y	FAM78A,RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	9298	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	134609553	134609906	134609765	Y	FAM78A,PRRC2B,RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	3555	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	134613837	134614689	134614350	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	376	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chr9	134714946	134715332	134715277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	101485	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr9	135197315	135197652	135197484	Y	NA	SETX	NA	NA	NA	NA	SETX	30720	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	135226317	135226646	135226576	Y	NA	SETX	NA	NA	NA	NA	SETX	1726	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	135257633	135257732	135257683	Y	SETX	SETX,TTF1,RNU5D-2P	NA	NA	NA	NA	TTF1	22477	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	135279793	135280144	135280078	Y	TTF1	TTF1,RNU5D-2P	NA	NA	NA	NA	TTF1	65	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chr9	135335367	135335561	135335464	Y	NA	RNU5D-2P	NA	NA	NA	NA	RNU5D-2P	40339	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	135818615	135818626	135818622	Y	RALGDS,C9orf96	TSC1	NA	NA	NA	NA	TSC1	595	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	136001171	136001330	136001249	Y	SLC2A6,RALGDS,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	35971	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	136009131	136009458	136009277	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	27843	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.281457820311205
chr9	136010510	136011124	136011032	Y	RPL7A,RALGDS,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	26177	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.11432135559639
chr9	136012982	136013095	136013034	Y	RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	24206	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	136019465	136020353	136020023	Y	NA	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	16948	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	136022907	136023306	136022967	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	13995	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr9	136226163	136226469	136226316	Y	NA	SURF6,MED22,RPL7A,SNORD36A,SNORD36C,SURF2,SURF1,SURF4,C9orf96	NA	NA	NA	NA	SURF1	4611	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	136235762	136236074	136236007	Y	NA	SURF6,MED22,RPL7A,SNORD36A,SNORD36C,SURF2,SURF1,SURF4,C9orf96,REXO4	NA	NA	NA	NA	SURF4	4896	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	136282042	136282102	136282072	Y	NA	SURF4,C9orf96,REXO4	NA	NA	NA	NA	REXO4	878	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.109592823287503
chr9	136284309	136284583	136284382	Y	C9orf96	SURF4,C9orf96,REXO4	NA	NA	NA	NA	REXO4	3145	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	136292897	136293168	136293034	Y	SLC2A6,RALGDS	REXO4,SLC2A6	NA	NA	NA	NA	REXO4	11733	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	136695399	136695776	136695532	Y	RPL7A,SLC2A6	NA	NA	NA	NA	NA	SARDH	92322	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	136710457	136710861	136710661	Y	RPL7A,SLC2A6	NA	NA	NA	NA	NA	SARDH	107380	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	136720858	136721171	136721081	Y	SLC2A6,RXRA	NA	NA	NA	NA	NA	SARDH	117781	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.265428961374692
chr9	136738611	136738757	136738701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	116969	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	136739075	136739598	136739373	Y	VAV2	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	116128	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.343347030418287
chr9	136779643	136779949	136779796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	75777	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr9	136856624	136856782	136856656	Y	VAV2	VAV2,LINC00094	NA	NA	NA	NA	VAV2	898	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr9	136996268	136996567	136996488	Y	NA	WDR5,RNU6ATAC	WDR5	K562	ChIA-PET	22265404	WDR5	1920	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chr9	136999790	136999893	136999856	Y	NA	WDR5,RNU6ATAC	NA	NA	NA	NA	WDR5	1303	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.106863482537876
chr9	137030495	137030803	137030732	Y	NA	WDR5,RNU6ATAC	NA	NA	NA	NA	RNU6ATAC	2809	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	137220336	137220598	137220352	Y	NA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	13392	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	137257724	137257990	137257923	Y	RXRA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	50780	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chr9	137264490	137265116	137264820	Y	RXRA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	57546	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.94190003033526
chr9	137268826	137268961	137268858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	61882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	137285570	137286195	137285918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	78626	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chr9	137305745	137306050	137305907	Y	RXRA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	98801	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chr9	137348030	137348540	137348200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	141086	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.18003558421368
chr9	137367331	137367474	137367390	Y	COL5A1	NA	COL5A1	IMR90	Hi-C	24141950	RXRA	160387	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chr9	137394714	137394986	137394879	Y	NA	NA	COL5A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL5A1	136634	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104134141788249
chr9	137483960	137484781	137484422	Y	NA	COL5A1	RXRA,COL5A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL5A1	46839	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr9	137494646	137494892	137494734	Y	NA	COL5A1	RXRA,COL5A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL5A1	36728	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr9	137535299	137535511	137535433	Y	COL5A1	COL5A1	NA	NA	NA	NA	COL5A1	3679	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chr9	137536549	137536868	137536739	Y	COL5A1	COL5A1	NA	NA	NA	NA	COL5A1	4929	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.506641041563991
chr9	137667512	137667789	137667676	Y	OLFM1,OLFM1	NA	NA	NA	NA	NA	COL5A1	135892	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	137717068	137717259	137717190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL5A1	185448	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	137718262	137718824	137718799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL5A1	186642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	137788032	137788280	137788155	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OLFM1	176988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chr9	138016639	138016801	138016720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OLFM1	51371	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	138021937	138022314	138022177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OLFM1	56669	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.41759646684571
chr9	138348639	138348707	138348673	Y	NA	PPP1R26,MRPS2,C9orf116	NA	NA	NA	NA	PPP1R26	20218	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.101404801038621
chr9	138370318	138370583	138370451	Y	NA	PPP1R26,MRPS2,C9orf116	NA	NA	NA	NA	PPP1R26	1393	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	138808024	138808108	138808066	Y	GLT6D1	CAMSAP1,RP11-432J22.2,UBAC1	NA	NA	NA	NA	RP11-432J22.2	10366	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chr9	138818727	138819161	138818918	Y	CAMSAP1,CARD9	CAMSAP1,RP11-432J22.2,UBAC1	NA	NA	NA	NA	RP11-432J22.2	21069	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.256857975496695
chr9	138884665	138885093	138884961	Y	NA	UBAC1	NA	NA	NA	NA	UBAC1	33439	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	138915703	138915918	138915811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBAC1	64477	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	138986008	138986159	138986118	Y	NACC2	NACC2,C9orf69	NA	NA	NA	NA	NACC2	877	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.01747172225834
chr9	139081356	139081856	139081614	Y	CAMSAP1,LHX3,LHX3,QSOX2	NA	NA	NA	NA	NA	QSOX2	53831	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr9	139136338	139136616	139136467	Y	QSOX2	QSOX2	NA	NA	NA	NA	QSOX2	651	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	139223291	139223329	139223306	Y	NA	GPSM1,DNLZ	NA	NA	NA	NA	GPSM1	3359	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr9	139237317	139237472	139237398	Y	GPSM1	GPSM1,DNLZ	NA	NA	NA	NA	GPSM1	17385	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr9	139294189	139294305	139294248	Y	TRAF2,FAM69B,INPP5E	DNLZ,SDCCAG3,PMPCA,INPP5E	NA	NA	NA	NA	SDCCAG3	8756	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chr9	139444945	139445101	139445057	Y	TMEM141,SDCCAG3	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-611D20.2	6281	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	139445894	139446087	139445949	Y	SEC16A,NOTCH1	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-611D20.2	7230	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.139807279150677
chr9	139446698	139446837	139446768	Y	NA	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-611D20.2	8034	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	139459100	139459353	139459254	Y	FUT7,NACC2,SEC16A,NOTCH1	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-611D20.2	20436	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chr9	139462526	139462651	139462613	Y	C9orf69	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-611D20.2	23862	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.755885214452761
chr9	139613892	139613944	139613895	Y	NA	AGPAT2,SNHG7	NA	NA	NA	NA	SNHG7	6692	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr9	139737773	139737949	139737875	Y	NA	PHPT1,EDF1,TRAF2,MIR4479	NA	NA	NA	NA	PHPT1	3227	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	139826661	139826850	139826762	Y	NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2	MIR4479,FBXW5,C8G,PTGDS	NA	NA	NA	NA	FBXW5	10298	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.367719841153091
chr9	139858882	139858961	139858922	Y	NA	FBXW5,C8G,PTGDS,C9orf142,CLIC3	NA	NA	NA	NA	PTGDS	10995	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.257971088316178
chr9	139919787	139920355	139920165	Y	NA	PTGDS,C9orf142,CLIC3,ABCA2,NPDC1,UAP1L1	NA	NA	NA	NA	C9orf139	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	140022067	140022152	140022137	Y	EHMT1,WDR85,NDOR1,ANAPC2	MAN1B1,DPP7,MIR3621	NA	NA	NA	NA	DPP7	14438	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chr9	140023271	140023604	140023504	Y	EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2	MAN1B1,DPP7,MIR3621	NA	NA	NA	NA	DPP7	15642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.208268283576497
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7,MIR3621	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	12.3864812305124
chr9	140101916	140102100	140102008	Y	C9orf172,FUT7	MIR3621,ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	NDOR1	3769	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.228642711192781
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	C9orf169	501	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.3007728045794
chr9	140132594	140132714	140132654	Y	LCN15,NPDC1,PNPLA7,ENTPD8	TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	951	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	140134697	140134985	140134927	Y	C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3	TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	1032	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.12523917493952
chr9	140190695	140190800	140190760	Y	NA	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	3903	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	140199547	140199668	140199608	Y	NA	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	4844	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chr9	140274735	140275080	140274933	Y	CACNA1B,PTGDS,ABCA2,GRIN1,RNF208,PNPLA7	EXD3,NOXA1	NA	NA	NA	NA	EXD3	40634	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chr9	140306093	140306345	140306289	Y	NRARP	EXD3,NOXA1,ENTPD8	NA	NA	NA	NA	EXD3	9369	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.910452310171055
chr9	140388730	140388770	140388753	Y	FUT7,C9orf140,UAP1L1,DPP7,NDOR1,NOXA1	NA	NA	NA	NA	NA	PNPLA7	54216	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chr9	140463644	140464019	140463889	Y	FAM166A,C9orf173	PNPLA7,MRPL41,ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1	NA	NA	NA	NA	ZMYND19	18923	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr9	140487255	140487495	140487481	Y	CACNA1B,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7	PNPLA7,MRPL41,ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1	NA	NA	NA	NA	ZMYND19	4313	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chr9	140523205	140523460	140523276	Y	ANAPC2,NDOR1,EHMT1	ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1	NA	NA	NA	NA	EHMT1	11761	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chr9	140689053	140689448	140689207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHMT1	177609	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chrX	1358576	1358902	1358788	Y	P2RY8,IL3RA,ASMTL,ASMT,AKAP17A,SLC25A6,ASMTL,CRLF2,CRLF2,CSF2RA,CSF2RA	CRLF2,CSF2RA	NA	NA	NA	NA	CSF2RA	26791	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	1367285	1367756	1367429	Y	P2RY8,IL3RA,ASMTL,ASMT,AKAP17A,SLC25A6,ASMTL,CRLF2,CRLF2,CSF2RA,CSF2RA	CRLF2,CSF2RA	NA	NA	NA	NA	CSF2RA	17937	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.1984108202707
chrX	1368332	1368760	1368586	Y	P2RY8,IL3RA,ASMTL,ASMT,AKAP17A,SLC25A6,ASMTL,CRLF2,CRLF2,CSF2RA,CSF2RA	CRLF2,CSF2RA	NA	NA	NA	NA	CSF2RA	16933	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.220454688943899
chrX	1479744	1480128	1479953	Y	NA	IL3RA,SLC25A6	NA	NA	NA	NA	IL3RA	26235	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chrX	1480354	1481325	1480771	Y	NA	IL3RA,SLC25A6	NA	NA	NA	NA	IL3RA	26845	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chrX	1513605	1514177	1513885	Y	NA	SLC25A6	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	3988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chrX	1514556	1514901	1514870	Y	ASMTL,ASMT,AKAP17A,SLC25A6,ASMTL	SLC25A6	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	4939	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.159295628027183
chrX	1524384	1524716	1524554	Y	CRLF2,CRLF2,CSF2RA,CSF2RA,P2RY8,ASMTL,ASMT,AKAP17A,IL3RA,SLC25A6,ASMTL	SLC25A6,ASMTL	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	14767	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.194968765389612
chrX	1600679	1600951	1600851	Y	CSF2RA,CSF2RA,IL3RA,SLC25A6,ASMTL,ASMTL,ASMT,AKAP17A,P2RY8	ASMTL	NA	NA	NA	NA	ASMTL	30024	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	2067813	2068091	2068086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBED1	348917	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	2348297	2348573	2348428	Y	ZBED1,ZBED1,DHRSX	NA	NA	NA	NA	NA	ZBED1	68435	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chrX	2626302	2626463	2626390	Y	ZBED1,ZBED1,DHRSX	CD99	NA	NA	NA	NA	CD99	19082	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	3437014	3437322	3437139	Y	ARSF,MXRA5	NA	ARSF	IMR90	Hi-C	24141950	PRKX	192327	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.30292792568807
chrX	3870962	3871082	3871022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	241313	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	7033628	7033911	7033770	Y	NA	MIR4767,HDHD1	NA	NA	NA	NA	MIR4767	29990	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	9309120	9309320	9309226	Y	TBL1X,TBL1X	NA	TBL1X	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1X	120015	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	9320763	9320959	9320875	Y	TBL1X,TBL1X	NA	TBL1X	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1X	108376	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	9433838	9434425	9434365	Y	TBL1X	TBL1X	NA	NA	NA	NA	TBL1X	4503	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.903880515852319
chrX	9477403	9477544	9477474	Y	FAM9B,TBL1X,LOC100288814	TBL1X	NA	NA	NA	NA	TBL1X	48068	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	9536624	9537203	9536862	Y	TBL1X,TBL1X	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1X	107289	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.139807279150677
chrX	9701264	9701389	9701313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-98L4.1	84120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	9948395	9948719	9948558	Y	NA	WWC3	NA	NA	NA	NA	WWC3	32883	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	9978783	9979047	9978917	Y	NA	WWC3	SHROOM2,WWC3	IMR90	Hi-C	24141950	WWC3	2555	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	10051581	10051674	10051600	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC3	69979	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	10161663	10162021	10162010	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC3	180061	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	10547215	10547494	10547354	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MID1	302279	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.122892341474388
chrX	10587173	10587276	10587225	Y	MID1	NA	NA	NA	NA	NA	MID1	262497	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chrX	11460430	11460509	11460495	Y	AMELX	NA	NA	NA	NA	NA	MSL3	313769	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	12965371	12965491	12965432	Y	NA	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	25736	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	12972600	12972806	12972677	Y	NA	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	18421	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	12973794	12974181	12973922	Y	ATXN3L,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	17046	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	12974184	12974672	12974538	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	16555	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.531971035568867
chrX	12974854	12975280	12975169	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	15947	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chrX	12976159	12976277	12976218	Y	TLR7,TLR8,TMSB4X	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	14950	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	12991564	12992257	12991938	Y	NA	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	337	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	12996273	12996492	12996427	Y	NA	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	5046	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	12996986	12997135	12997061	Y	TLR8,TMSB4X	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	5759	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	13106166	13106719	13106370	Y	TLR7,TLR8,TMSB4X	NA	FAM9C	IMR90	Hi-C	24141950	TMSB4X	114939	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	13108770	13109761	13109358	Y	TLR8,TMSB4X	NA	TMSB4X	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB4X	117543	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	13128879	13129151	13129129	Y	NA	NA	TMSB4X	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB4X	137652	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chrX	13138325	13138351	13138340	Y	NA	NA	FAM9C,LOC100133123,TMSB4X	IMR90	Hi-C	24141950	TMSB4X	147098	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chrX	13677260	13677535	13677469	Y	RAB9A	TCEANC,RAB9A	NA	NA	NA	NA	TCEANC	8035	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chrX	13687345	13687715	13687534	Y	TCEANC,RAB9A	TCEANC,RAB9A	NA	NA	NA	NA	RAB9A	17529	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chrX	13709946	13709989	13709968	Y	RAB9A	TCEANC,RAB9A,TRAPPC2,OFD1	NA	NA	NA	NA	RAB9A	4702	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chrX	13711501	13711681	13711616	Y	ATXN3L,RAB9A	TCEANC,RAB9A,TRAPPC2,OFD1	NA	NA	NA	NA	RAB9A	6257	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chrX	14262210	14262757	14262259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8	216198	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	15354246	15354416	15354344	Y	ZRSR2,CA5B,MOSPD2,PIGA	PIGA	NA	NA	NA	NA	PIGA	2570	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chrX	15383040	15383106	15383043	Y	NA	PIGA	NA	NA	NA	NA	PIGA	31364	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	15469517	15469528	15469523	Y	NA	PIR	NA	NA	NA	NA	PIR	40159	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	15713039	15713439	15713221	Y	NA	CA5BP1,CA5B	NA	NA	NA	NA	CA5B	8086	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	15852343	15852548	15852528	Y	NA	ZRSR2,AP1S2	NA	NA	NA	NA	AP1S2	18506	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	15868286	15868660	15868596	Y	BMX	AP1S2	NA	NA	NA	NA	AP1S2	2394	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	16671538	16671979	16671762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTPS2	57080	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	16805192	16805460	16805250	Y	TXLNG	TXLNG	NA	NA	NA	NA	TXLNG	2642	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.302562397117855
chrX	16900871	16900973	16900947	Y	TXLNG	RBBP7,RNU4-6P	RBBP7,TXLNG	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNU4-6P	9481	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chrX	17395556	17395647	17395622	Y	NHS	NHS	NA	NA	NA	NA	NHS	4013	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.284187161060831
chrX	17415371	17415448	17415410	Y	NA	NHS	NA	NA	NA	NA	NHS	23828	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	18445170	18445478	18445437	Y	NA	CDKL5	NA	NA	NA	NA	CDKL5	3467	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chrX	18693104	18693424	18693141	Y	PHKA2,CDKL5	NA	NA	NA	NA	NA	CDKL5	251401	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.913337580470093
chrX	18904504	18904672	18904535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHKA2	96044	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.171482033394586
chrX	18904688	18905149	18904995	Y	PHKA2	NA	NA	NA	NA	NA	PHKA2	95567	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200810410517982
chrX	19701008	19701387	19701257	Y	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K15	169629	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chrX	19768658	19769006	19768788	Y	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	134713	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	19893071	19893438	19893374	Y	NA	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	10281	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chrX	20154251	20154286	20154269	Y	NA	EIF1AX	NA	NA	NA	NA	EIF1AX	3676	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	20283183	20283718	20283506	Y	SH3KBP1,RPS6KA3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA3	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chrX	20628422	20628647	20628433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA3	344899	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	21945015	21945333	21945248	Y	NA	SMS	SMS,MBTPS2	IMR90	Hi-C	24141950	SMS	11358	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chrX	23799321	23799855	23799568	Y	ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,ACOT9,SAT1	ACOT9,SAT1	NA	NA	NA	NA	SAT1	31	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chrX	23800091	23800377	23800148	Y	NA	ACOT9,SAT1	NA	NA	NA	NA	SAT1	801	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	24027801	24028121	24027962	Y	NA	EIF2S3	NA	NA	NA	NA	EIF2S3	42712	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	24044003	24044417	24044292	Y	ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,PDK3,ACOT9,SAT1	EIF2S3	NA	NA	NA	NA	EIF2S3	26416	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chrX	24187705	24188069	24187889	Y	NA	ZFX,ZFX-AS1	NA	NA	NA	NA	ZFX-AS1	21934	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chrX	25664451	25664736	25664645	Y	MAGEB18	NA	NA	NA	NA	NA	POLA1	954415	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chrX	29496854	29497166	29496936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTLP2	1149249	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	30679380	30679764	30679404	Y	NA	FTLP2,GK	NA	NA	NA	NA	GK	9904	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	30717069	30717144	30717107	Y	CXorf21,GK	GK	NA	NA	NA	NA	GK	47593	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	30744406	30744763	30744585	Y	CXorf21,GK	NA	NA	NA	NA	NA	GK	74930	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	37613614	37613928	37613771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XK	70602	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	38130522	38130869	38130628	Y	CYBB,RPGR	NA	NA	NA	NA	NA	RPGR	53948	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	38338792	38338989	38338897	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPGR	153975	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chrX	38738910	38739411	38739092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MID1IP1	80225	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chrX	38742577	38742732	38742665	Y	MID1IP1	NA	MID1IP1	IMR90	Hi-C	24141950	MID1IP1	83892	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	39612631	39612800	39612742	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	32590	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.190240233080725
chrX	39614973	39615267	39615108	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	30123	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.229025674821897
chrX	39619041	39619197	39619186	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	26193	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chrX	39646201	39646652	39646229	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	811	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.30181481286859
chrX	39664181	39664495	39664338	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	18791	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	39719139	39719410	39719301	Y	BCOR	NA	BCOR	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP1	73749	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	39729530	39729742	39729629	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	84140	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.159295628027183
chrX	39767458	39767957	39767519	Y	NA	NA	BCOR	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP1	122068	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.823389035608508
chrX	39865489	39865898	39865566	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	168684	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	39871700	39871985	39871950	Y	BCOR,BCOR	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	162597	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.538315795807899
chrX	39872499	39873023	39872596	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	161559	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.24867040959244
chrX	39873339	39874259	39873676	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	160323	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.20354020761223
chrX	39953251	39953461	39953335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	81121	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	39958407	39958722	39958627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	75860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	39963931	39964200	39963990	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	70382	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chrX	39964528	39964690	39964611	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	69892	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.562915640622409
chrX	39964938	39965503	39965246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	69079	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chrX	39965558	39965902	39965820	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	68680	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.1496651988011
chrX	39966584	39967157	39966963	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	67425	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.299102907177861
chrX	39968308	39968728	39968376	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65854	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.874204953167672
chrX	39968932	39969265	39969200	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65317	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chrX	40011614	40011816	40011787	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	22766	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chrX	40012729	40012965	40012840	Y	BCOR,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	21617	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.743698809085358
chrX	40013089	40013254	40013186	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	21328	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.422725397842615
chrX	40014046	40014813	40014331	Y	BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	19769	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chrX	40032962	40033837	40033453	Y	BCOR,CXorf38,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	745	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.248669953247813
chrX	40034377	40034649	40034428	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chrX	40034694	40035505	40035056	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	112	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.917024104489794
chrX	40595684	40595958	40595896	Y	USP9X,MED14	MED14-AS1,MED14	NA	NA	NA	NA	MED14	2574	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	40691770	40692090	40691930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-77G22.2	73147	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	40726668	40726852	40726751	Y	ATP6AP2,MED14	RP11-77G22.2	USP9X,CXorf38,MED14,LOC100132831	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-77G22.2	38385	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	40749971	40750359	40750172	Y	USP9X,ATP6AP2,CXorf38,MED14	RP11-77G22.2	USP9X,MED14	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-77G22.2	14878	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	40792948	40793319	40793225	Y	ATP6AP2	RP11-77G22.2	USP9X,MED14	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-77G22.2	27711	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chrX	40869399	40869667	40869505	Y	USP9X,ATP6AP2,CXorf38,MED14	NA	MED14,USP9X	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP9X	73221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.169865805464441
chrX	40869896	40870061	40869955	Y	ATP6AP2	NA	MED14,USP9X	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP9X	72827	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.399238665847589
chrX	40943673	40944218	40943773	Y	CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X	USP9X	NA	NA	NA	NA	USP9X	785	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.45878149883416
chrX	41058503	41058566	41058535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP9X	115615	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	41182589	41182765	41182693	Y	NA	DDX3X	DDX3X	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DDX3X	7886	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227756632453003
chrX	41190836	41191010	41190932	Y	NA	DDX3X	NA	NA	NA	NA	DDX3X	185	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	41192009	41192079	41192030	Y	NA	DDX3X	NA	NA	NA	NA	DDX3X	1358	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chrX	41242516	41242827	41242698	Y	DDX3X	NA	DDX3X,USP9X	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DDX3X	51865	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.756268178081876
chrX	41308972	41309137	41309059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX3X	118321	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	41480372	41480697	41480463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX3X	289721	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.11739878985733
chrX	41547328	41547693	41547479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASK	233023	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	41759638	41759871	41759773	Y	NA	CASK	NA	NA	NA	NA	CASK	20845	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.083376750542849
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAOB	148897	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.559073187053299
chrX	44168721	44168911	44168853	Y	NA	EFHC2	NA	NA	NA	NA	EFHC2	32007	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.294374374868973
chrX	44173548	44173763	44173665	Y	NA	EFHC2	NA	NA	NA	NA	EFHC2	27155	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	44733657	44734406	44734027	Y	KDM6A	KDM6A	NA	NA	NA	NA	KDM6A	2900	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chrX	44877456	44877597	44877527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM6A	146699	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.13307955528253
chrX	45241202	45241396	45241250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-245M24.1	121237	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.104864290978615
chrX	45338516	45338773	45338583	Y	NA	RP11-245M24.1	MIR221,MIR222	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-245M24.1	23860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chrX	45374628	45375077	45374937	Y	NA	RP11-245M24.1	MIR221,MIR222	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-245M24.1	11995	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	45376807	45376988	45376867	Y	NA	RP11-245M24.1	MIR221,MIR222	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-245M24.1	14174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	45493055	45493058	45493057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR221	110636	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0786482182339617
chrX	45631125	45631239	45631172	Y	NA	MIR221,MIR222	NA	NA	NA	NA	MIR222	26595	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	45702877	45703292	45703236	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	5628	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.102134950228988
chrX	46148096	46148185	46148140	Y	NA	RP1-30G7.2	NA	NA	NA	NA	RP1-30G7.2	36895	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chrX	46316161	46316444	46316394	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18012	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	46316672	46316948	46316811	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18523	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	46338861	46339028	46338937	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	40712	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	46509009	46509283	46509068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST7	77790	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	46651969	46652131	46652053	Y	ZNF674,CHST7,RP2	SLC9A7,RP2	CHST7,ZNF674,LOC401588,SLC9A7,RP2,PHF16	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC9A7	35479	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	46697676	46697837	46697692	Y	ZNF674,CHST7,CDK16,RP2	RP2	CXorf31	IMR90	Hi-C	24141950	RP2	3301	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	46773328	46773680	46773526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP2	78953	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.130350214532902
chrX	46989082	46989431	46989227	Y	NA	RBM10,NDUFB11	NA	NA	NA	NA	RBM10	12837	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.161294819586444
chrX	47016809	47017199	47017004	Y	NA	RBM10,NDUFB11,UBA1	NA	NA	NA	NA	NDUFB11	13906	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0806474097932219
chrX	47221089	47221361	47221213	Y	NA	NA	USP11,ZNF157,UBA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF41	118984	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	47221453	47221809	47221639	Y	USP11,ZNF81,SYN1	NA	UBA1,USP11	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF41	118536	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chrX	47360973	47361468	47361218	Y	CFP,CFP,ARAF	ZNF41,NUS1P1	ZNF41,ARAF,SYN1,TIMP1,MIR4769	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NUS1P1	9414	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.906262671040695
chrX	47374044	47374207	47374095	Y	CFP,CFP,ARAF	ZNF41,NUS1P1,ARAF	UBA1,ZNF41	IMR90	Hi-C	24141950	NUS1P1	3162	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.05810042600936
chrX	47382833	47383145	47382966	Y	SYN1,SPACA5,CFP,CFP	ZNF41,NUS1P1,ARAF	UBA1,ZNF41,USP11,CDK16	IMR90	Hi-C	24141950	NUS1P1	11951	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172595146214068
chrX	47423323	47423681	47423373	Y	CDK16,CFP,CFP,ARAF	ARAF,TIMP1	NA	NA	NA	NA	ARAF	4807	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chrX	47492098	47492440	47492261	Y	ARAF,CFP,CFP	SYN1,ELK1,UXT	NA	NA	NA	NA	SYN1	14846	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	47701110	47701161	47701136	Y	NA	ZNF81	NA	NA	NA	NA	ZNF81	6809	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chrX	48350817	48351213	48350906	Y	WAS,RBM3,PORCN,OTUD5	SLC38A5,FTSJ1,PORCN,EBP,TBC1D25	NA	NA	NA	NA	PORCN	14137	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	48390158	48390246	48390210	Y	NA	PORCN,EBP,TBC1D25,RBM3	NA	NA	NA	NA	TBC1D25	5599	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.156566287277556
chrX	48643715	48644055	48643827	Y	NA	HDAC6	NA	NA	NA	NA	HDAC6	13729	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	48748167	48748450	48748403	Y	NA	PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2	NA	NA	NA	NA	PQBP1	4745	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chrX	48748801	48749222	48749175	Y	NA	PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2	NA	NA	NA	NA	PQBP1	3973	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chrX	48794332	48794681	48794452	Y	PORCN,TBC1D25,WAS,PQBP1,TFE3,PPP1R3F,FOXP3,PIM2,OTUD5,OTUD5,GRIPAP1	PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2,OTUD5	NA	NA	NA	NA	OTUD5	18967	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	48938465	48938570	48938518	Y	NA	TFE3,CCDC120,PRAF2,WDR45,GPKOW	NA	NA	NA	NA	PRAF2	8735	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chrX	49011448	49011844	49011738	Y	GATA1,HDAC6,MAGIX	GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	14429	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chrX	49012442	49012818	49012676	Y	NA	GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	13455	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.656635534522809
chrX	49108550	49108714	49108667	Y	PIM2,PPP1R3F,FOXP3	HSPB1P2,CCDC22,PPP1R3F	NA	NA	NA	NA	PPP1R3F	15592	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chrX	52004971	52005124	52005057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGED1	460868	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chrX	52949996	52950343	52950129	Y	TSPYL2,KDM5C,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	31660	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.939397723665338
chrX	52964244	52964539	52964367	Y	TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	45908	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.93392160710718
chrX	53155305	53155690	53155322	Y	XAGE5,FAM156A,FAM156B,FAM156A,GPR173,IQSEC2,TSPYL2	TSPYL2,LINC01155	KDM5C	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01155	33978	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.180053019272583
chrX	53292881	53293274	53292937	Y	NA	KDM5C	NA	NA	NA	NA	KDM5C	40277	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chrX	53428419	53428681	53428625	Y	NA	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	RIBC1	18958	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.299102907177861
chrX	53467837	53468052	53468003	Y	KDM5C	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	HSD17B10	8517	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.301102098737121
chrX	53468564	53468782	53468716	Y	IQSEC2	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	HSD17B10	9244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.389937530779224
chrX	53741584	53742291	53741941	Y	KDM5C,SMC1A,HUWE1,PHF8	HUWE1	HUWE1	MCF7	ChIA-PET	22265404	HUWE1	29911	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	54207248	54207470	54207359	Y	NA	FAM120C	NA	NA	NA	NA	FAM120C	244	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chrX	54207583	54207867	54207725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM120C	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	54665732	54666388	54666226	Y	NA	NA	ITIH6,MAGED2	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNL3L	111088	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chrX	54668047	54668238	54668126	Y	NA	NA	ITIH6,MAGED2	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNL3L	113403	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	56269843	56269989	56269918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBQLN2	318037	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151837754968669
chrX	56791132	56791384	56791234	Y	NA	RP11-622K12.1,UQCRBP1	NA	NA	NA	NA	UQCRBP1	29122	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chrX	57420009	57420263	57420031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAAH2	108870	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chrX	62772082	62772285	62772184	Y	NA	RP11-357C3.3	NA	NA	NA	NA	RP11-357C3.3	6666	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	64815346	64815780	64815481	Y	MSN	MSN	MSN	IMR90	Hi-C	24141950	MSN	9089	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	64821176	64821755	64821551	Y	MSN	MSN	MSN	IMR90	Hi-C	24141950	MSN	14919	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0731895367347072
chrX	64855278	64855519	64855399	Y	NA	MSN	MSN	IMR90	Hi-C	24141950	MSN	49021	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	64888338	64888720	64888577	Y	MSN	NA	NA	NA	NA	NA	MSN	82081	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.164024160336071
chrX	65233150	65233304	65233208	Y	MSN	NA	NA	NA	NA	NA	MSN	426893	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	67291116	67291490	67291298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPHN1	360265	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chrX	67724193	67724408	67724299	Y	NA	YIPF6	NA	NA	NA	NA	YIPF6	8028	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	67728770	67728923	67728861	Y	NA	YIPF6	NA	NA	NA	NA	YIPF6	12605	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chrX	67870380	67870574	67870477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERBP1P1	130741	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	68004355	68004677	68004478	Y	NA	SERBP1P1,EFNB1	NA	NA	NA	NA	SERBP1P1	3040	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.931209701416455
chrX	68776201	68776510	68776416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PJA1	392565	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	69386644	69386665	69386655	Y	NA	IGBP1	NA	NA	NA	NA	IGBP1	35345	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.137808087591417
chrX	69653784	69653948	69653832	Y	NA	DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8763	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.588401564176696
chrX	69654278	69654566	69654417	Y	DLG3	DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8145	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.3386184981094
chrX	70275409	70275661	70275633	Y	NA	RNU1-56P,SNX12,FOXO4	NA	NA	NA	NA	SNX12	10612	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.147265152209192
chrX	70401853	70402134	70401993	Y	IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO	NA	NA	NA	NA	NA	MED12	65447	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.867477229299524
chrX	70640504	70640913	70640718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF1	56390	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.142536619900305
chrX	71402877	71403170	71402921	Y	NA	PIN4	NA	NA	NA	NA	PIN4	3674	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.277615366742094
chrX	71635914	71636037	71635976	Y	HDAC8	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4X	140764	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.149994492958819
chrX	71761722	71762003	71761864	Y	NA	HDAC8	NA	NA	NA	NA	HDAC8	28950	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chrX	71785357	71785413	71785385	Y	NA	HDAC8	NA	NA	NA	NA	HDAC8	5540	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	72786594	72786762	72786676	Y	NAP1L2,CDX4,CHIC1	CHIC1	NA	NA	NA	NA	CHIC1	5558	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chrX	73228588	73229157	73228689	Y	CHIC1	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-36G14.3	54761	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	73236075	73236382	73236224	Y	CHIC1	RP13-36G14.3	NA	NA	NA	NA	RP13-36G14.3	47536	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chrX	73237406	73237798	73237506	Y	CHIC1	RP13-36G14.3	NA	NA	NA	NA	RP13-36G14.3	46120	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	73250242	73250558	73250399	Y	NA	RP13-36G14.3	NA	NA	NA	NA	RP13-36G14.3	33360	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chrX	73338544	73338621	73338582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USMG5P1	53104	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.223184029693526
chrX	73507125	73507445	73507287	Y	NA	FTX	NA	NA	NA	NA	FTX	3964	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.364834570854054
chrX	73510244	73510542	73510484	Y	RLIM	FTX	NA	NA	NA	NA	FTX	867	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chrX	73833460	73833840	73833652	Y	NA	RLIM	NA	NA	NA	NA	RLIM	1008	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chrX	74259170	74259182	74259176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCB7	115385	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chrX	74266683	74266817	74266750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCB7	107750	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chrX	74370869	74370931	74370900	Y	NA	ABCB7	NA	NA	NA	NA	ABCB7	3636	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	74960822	74961039	74960972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UPRT	468902	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.176210565703473
chrX	75368142	75368530	75368366	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDHBP2	185714	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	77226253	77226302	77226278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP7A	62059	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	77357639	77357943	77357791	Y	NA	PGK1,TAF9B	NA	NA	NA	NA	TAF9B	35260	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	79827525	79827860	79827693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRWD3	235327	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	79828855	79829064	79828956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRWD3	234123	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	79830053	79830147	79830110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRWD3	233040	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chrX	79965324	79965547	79965436	Y	BRWD3	NA	NA	NA	NA	NA	BRWD3	97640	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	82766187	82766665	82766395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATG4AP1	514480	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	85278748	85279124	85278988	Y	CHM	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	21442	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	85280770	85281145	85280958	Y	CHM	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	19421	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	85294512	85294785	85294645	Y	CHM	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	5781	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.170751884204219
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.47510433020515
chrX	87351155	87351521	87351339	Y	NA	RP3-452M16.1	NA	NA	NA	NA	RP3-452M16.1	929	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.099405609479361
chrX	87351546	87351899	87351791	Y	NA	RP3-452M16.1	NA	NA	NA	NA	RP3-452M16.1	1320	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chrX	95940743	95941133	95941025	Y	DIAPH2	DIAPH2	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	3081	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chrX	96641794	96641810	96641802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	704132	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	96701855	96702106	96701982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	764193	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	99913933	99914424	99914133	Y	SYTL4,SYTL4	TSPAN6,SRPX2	NA	NA	NA	NA	SRPX2	16718	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	100001357	100001522	100001440	Y	NA	SYTL4	SRPX2,SYTL4	IMR90	Hi-C	24141950	SYTL4	16247	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chrX	100111421	100111452	100111441	Y	NA	CSTF2,NOX1	NA	NA	NA	NA	NOX1	15882	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	100664036	100664412	100664274	Y	NA	BTK,RPL36A,GLA,HNRNPH2	NA	NA	NA	NA	HNRNPH2	2753	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chrX	100792680	100793554	100793013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARMCX6	77437	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chrX	102063503	102063615	102063509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARMCX5	211407	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chrX	103382264	103382489	103382378	Y	NA	FAM199X	NA	NA	NA	NA	FAM199X	26812	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	104559193	104559437	104559342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM199X	1149892	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.151107605778302
chrX	105809036	105809195	105809116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D8B	234715	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	106595212	106595632	106595477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	147542	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0881052828517365
chrX	106595667	106595822	106595802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	147997	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.578178572300689
chrX	106693156	106693529	106693316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPS1	176208	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chrX	106917022	106917635	106917444	Y	NA	PRPS1	TSC22D3,PRPS1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	47285	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chrX	106919078	106919623	106919349	Y	TSC22D3,TSC22D3	PRPS1	TSC22D3,PRPS1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	49341	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chrX	106920003	106920801	106920325	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	TSC22D3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	50266	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.52939808071328
chrX	106955673	106955985	106955878	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	NA	NA	NA	NA	TSC22D3	62587	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	106979997	106980351	106980180	Y	NA	TSC22D3	NA	NA	NA	NA	TSC22D3	38221	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.41691953078211
chrX	106984124	106984148	106984136	Y	TSC22D3,TSC22D3	TSC22D3	NA	NA	NA	NA	TSC22D3	34424	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	106985108	106985412	106985307	Y	TSC22D3,TSC22D3,TSC22D3	TSC22D3	NA	NA	NA	NA	TSC22D3	33160	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0939469279801067
chrX	107441665	107441898	107441782	Y	COL4A5	NA	NA	NA	NA	NA	ATG4A	108767	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	107461084	107461446	107461149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATG4A	128186	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	107552407	107552661	107552546	Y	COL4A6,COL4A6,COL4A5	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A6	128066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.206269092017237
chrX	107639720	107640073	107639886	Y	COL4A6	COL4A6,COL4A5	NA	NA	NA	NA	COL4A6	40654	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.256857975496695
chrX	108883543	108883897	108883721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL4	90735	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chrX	109003262	109003404	109003333	Y	ACSL4	ACSL4	NA	NA	NA	NA	ACSL4	28630	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	109016670	109016888	109016809	Y	ACSL4	ACSL4	NA	NA	NA	NA	ACSL4	42038	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	109083708	109084134	109083977	Y	NXT2,NXT2,ACSL4	NA	ACSL4	IMR90	Hi-C	24141950	ACSL4	109076	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	109091814	109092062	109091940	Y	NA	NA	ACSL4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACSL4	117182	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chrX	109330355	109330526	109330451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM164	86496	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	109429267	109429621	109429491	Y	AMMECR1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM164	185408	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chrX	109487499	109487581	109487556	Y	AMMECR1	NA	NA	NA	NA	NA	AMMECR1	193880	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127620873783275
chrX	109645744	109645944	109645869	Y	NA	AMMECR1	TMEM164	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AMMECR1	35517	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.054431337048568
chrX	110566693	110566855	110566742	Y	PAK3,DCX,DCX,DCX	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4BP7	295862	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	110863259	110863845	110863518	Y	NA	EIF4BP7,ALG13	NA	NA	NA	NA	EIF4BP7	542	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	114819160	114819326	114819285	Y	NA	PLS3	NA	NA	NA	NA	PLS3	25659	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	114849502	114849636	114849587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLS3	56001	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	115083189	115083554	115083375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761E20.1	0	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.218455497384639
chrX	115238483	115238690	115238635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761E20.1	155061	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chrX	115239457	115239782	115239623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761E20.1	156035	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chrX	115364202	115364338	115364320	Y	NA	NA	SLC6A14	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-761E20.1	280780	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	115415637	115415812	115415646	Y	NA	NA	SLC6A14	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-761E20.1	332215	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0779180690435947
chrX	117374682	117375070	117374690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR44	102966	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	117499894	117500112	117500003	Y	NA	WDR44	NA	NA	NA	NA	WDR44	21858	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	117896439	117896822	117896632	Y	NA	IL13RA1	NA	NA	NA	NA	IL13RA1	36904	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	118788207	118788334	118788273	Y	NA	SEPT6	NA	NA	NA	NA	SEPT6	36999	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	118819274	118819809	118819515	Y	UBE2A,UBE2A,SEPT6	SEPT6	NA	NA	NA	NA	SEPT6	5524	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	119076607	119076872	119076702	Y	NKRF	NKAP	NA	NA	NA	NA	NKAP	872	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.07046019598508
chrX	119385485	119385791	119385733	Y	NA	NKAPP1,ZBTB33	NA	NA	NA	NA	ZBTB33	2878	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.164024160336071
chrX	119619289	119619732	119619620	Y	ZBTB33,ZBTB33	LAMP2	LAMP2	K562	ChIA-PET	22265404	LAMP2	18069	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.166023351895331
chrX	119619980	119620335	119620161	Y	NA	LAMP2	LAMP2	K562	ChIA-PET	22265404	LAMP2	18760	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chrX	120331489	120331718	120331553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	569484	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	120337126	120337342	120337247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	575121	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chrX	122898767	122899176	122898998	Y	NA	THOC2	NA	NA	NA	NA	THOC2	33861	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.470584940572446
chrX	122943908	122944167	122944003	Y	NA	XIAP	STAG2	K562	5C	22955621	XIAP	47407	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.2703501139901
chrX	128656237	128656454	128656444	Y	NA	OCRL	NA	NA	NA	NA	OCRL	15372	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.158565478836816
chrX	129066097	129066492	129066260	Y	NA	UTP14A,BCORL1	NA	NA	NA	NA	UTP14A	28000	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0759188774843344
chrX	129118011	129118370	129118054	Y	NA	BCORL1	BCORL1,UTP14A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCORL1	4928	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	129219006	129219116	129219059	Y	SASH3,ELF4,ELF4	ELF4	NA	NA	NA	NA	ELF4	23575	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	129245756	129246153	129246006	Y	NA	ELF4	NA	NA	NA	NA	ELF4	3065	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chrX	129255072	129255259	129255158	Y	SASH3,ELF4,ELF4	ELF4,AIFM1	ELF4	K562	ChIA-PET	22265404	ELF4	12381	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chrX	129307329	129307713	129307433	Y	NA	AIFM1	NA	NA	NA	NA	AIFM1	9468	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chrX	129400519	129400680	129400638	Y	NA	ZNF280C	NA	NA	NA	NA	ZNF280C	193	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.215726156635012
chrX	129982936	129983220	129983074	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENOX2	51988	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	130751126	130751587	130751253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MST4	403706	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	130880517	130880959	130880705	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MST4	274334	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	130942336	130942500	130942419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MST4	212793	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	131615038	131615178	131615106	Y	MST4,MST4,MBNL3	MBNL3	NA	NA	NA	NA	MBNL3	6818	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chrX	131625337	131625543	131625484	Y	MBNL3	MBNL3	NA	NA	NA	NA	MBNL3	3341	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0853759421021094
chrX	132089755	132090160	132089782	Y	NA	HS6ST2	NA	NA	NA	NA	HS6ST2	3263	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	133509019	133509280	133509152	Y	PHF6	PHF6	NA	NA	NA	NA	PHF6	3736	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	134048475	134048529	134048502	Y	MOSPD1	MOSPD1	NA	NA	NA	NA	MOSPD1	1178	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0469734639900533
chrX	134138094	134138444	134138243	Y	NA	FAM127C,FAM127A,FAM127B	NA	NA	NA	NA	FAM127C	16115	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.257971088316178
chrX	134485580	134485626	134485601	Y	ZNF449,CT45A6	ZNF75D,ZNF449	NA	NA	NA	NA	ZNF449	8859	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	134567184	134567298	134567231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF449	90463	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	134718222	134718415	134718313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF449	241501	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	135252733	135252893	135252813	Y	FHL1,FHL1	NA	NA	NA	NA	NA	MAP7D3	83748	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0262160727446538
chrX	135275239	135275595	135275317	Y	CT45A6,MMGT1,FHL1,FHL1	NA	NA	NA	NA	NA	MAP7D3	61046	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0524321454893077
chrX	135285010	135285467	135285237	Y	FHL1,FHL1,FHL1,FHL1	NA	NA	NA	NA	NA	MAP7D3	51174	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.116320547155651
chrX	138007531	138007947	138007713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11C	1017488	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	144930014	144930037	144930026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-150K15.1	220278	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805
chrX	149084401	149084780	149084588	Y	NA	LINC00894,CXorf40B	NA	NA	NA	NA	LINC00894	20066	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	149533685	149533896	149533780	Y	MAMLD1	MAMLD1	NA	NA	NA	NA	MAMLD1	5996	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	149650965	149651327	149651137	Y	MAMLD1	NA	NA	NA	NA	NA	MTM1	83742	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	149863588	149863865	149863755	Y	MTM1,MTMR1	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	4153	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	150038626	150039000	150038814	Y	NA	CD99L2	NA	NA	NA	NA	CD99L2	26289	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	150047001	150047063	150047035	Y	NA	CD99L2	NA	NA	NA	NA	CD99L2	18226	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.34863234730923
chrX	152065195	152065303	152065205	Y	NA	NA	CETN2,NSDHL	MCF7	ChIA-PET	22265404	NSDHL	67684	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0966762687297338
chrX	152127371	152127756	152127434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSDHL	129860	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	152980497	152980777	152980637	Y	NA	SLC6A8,BCAP31,ABCD1,PLXNB3	NA	NA	NA	NA	BCAP31	7375	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0234867319950267
chrX	153084450	153084610	153084498	Y	NA	SSR4,IDH3G,PDZD4,CYCSP45	NA	NA	NA	NA	PDZD4	9410	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	153144826	153145116	153145102	Y	NA	CYCSP45,L1CAM	NA	NA	NA	NA	L1CAM	27561	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	153166203	153166850	153166548	Y	ABCD1,PLXNB3,MECP2,ATP6AP1,RENBP	L1CAM,ARHGAP4,NAA10,RENBP	NA	NA	NA	NA	L1CAM	5827	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.336619306550139
chrX	153233137	153233308	153233234	Y	ABCD1,ARHGAP4,RENBP,TAZ,MECP2,DNASE1L1,TMEM187	ARHGAP4,NAA10,RENBP,HCFC1,TMEM187	NA	NA	NA	NA	HCFC1	1950	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	153359354	153359823	153359622	Y	NA	MECP2	NA	NA	NA	NA	MECP2	1389	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0618892101070827
chrX	153596671	153598676	153598064	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1	NA	NA	NA	NA	FLNA	2330	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.221184838134266
chrX	153755432	153755621	153755566	Y	NA	LAGE3,UBL4A,SLC10A3,FAM3A,IKBKG,G6PD	FAM3A	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	IKBKG	11793	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	153771070	153771275	153771201	Y	IRAK1,MECP2,TEX28,TEX28,EMD,DNASE1L1,TAZ,ATP6AP1,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1,GAB3,IKBKG,IKBKG,IKBKG	FAM3A,IKBKG,G6PD	NA	NA	NA	NA	G6PD	2512	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.278345515932461
chrX	153771434	153771677	153771549	Y	IRAK1,MECP2,TEX28,TEX28,EMD,DNASE1L1,TAZ,ATP6AP1,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1,GAB3,IKBKG,IKBKG,IKBKG	FAM3A,IKBKG,G6PD	NA	NA	NA	NA	G6PD	2110	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0571606777981952
chrX	153828728	153829141	153828914	Y	NA	AF277315.19	NA	NA	NA	NA	AF277315.19	2970	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.169865805464441
chrX	153829365	153829583	153829391	Y	NA	AF277315.19	NA	NA	NA	NA	AF277315.19	2528	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.3386184981094
chrX	154256125	154256514	154256179	Y	IKBKG,IKBKG,IKBKG,GAB3,MPP1,LOC100132963,F8A1,F8A2	FUNDC2,BRCC3	NA	NA	NA	NA	FUNDC2	3870	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	154365480	154365529	154365504	Y	NA	MTCP1	NA	NA	NA	NA	MTCP1	8683	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0309446050535413
chrX	155157070	155157446	155157240	Y	NA	VAMP7	NA	NA	NA	NA	VAMP7	48114	CAGE	HelaS3 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0497028047396805